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CAP 15 – PROCESAMIENTO DEL ARN Los ARN son procesados en el núcleo El conjunto de modificaciones que experimentan los transcriptos primarios para convertirse en ARN funcionales. Recibe el nombre de procesamiento del ARN Vimos que algunos transcriptos primarios contienen tramos de ARN sin significado funcional aparente, como los intrones en el ARNm y los espaciadores en el ARNr 45S. Un episodio saliente del procesamiento del ARN es Ia remoción de esos segmentos no utilizables. Pero los transcriptos primarios experimentan otros cambios. Dado que son diferentes en los distintos tipos de ARN. los estudiaremos separadamente en el ARNm, en los ARNr 45S y 5S, en los ARNt y en los ARN pequeños. PROCESAMIENTO DE LOS ARN MENSAJEROS El procesamiento de los ARNm comprende varios cambios El procesamiento del ARNm comprende Ia remoción de los intrones y el agregado de dos estructuras, Ilamadas cap y poli A, Ia primera en el extremo 5' y Ia segunda en el extremo 3’ de Ia molécula. También se metiIan algunas de sus adeninas. Estas modificaciones son necesarias para que los ARNm puedan Salir del núcleo y funcionar en el citosol. En el extremo 5' del ARNm se agrega un nucleótido metilado Ilamado cap AI nucleósido trifosfato situado en el extremo 5' del ARNm naciente se le une un nucleótido metilado, Ia 7- metilguanosina. Recibe el nombre de cap (por capuchón) y se agrega al extremo 5' mediante los siguientes pasos: El extremo 3' del ARNm se poliadenila Lleva el nombre de poliadenilación el agregado de una secuencia de aproximadamente 250 adeninas —Ilamada poli A— en el extremo 3' del ARNm. Dado que en el extremo Y de los genes que codifican ARNm no exis- te una secuencia de terminación de 250 timinas seguidas que genere Ia poli A, ésta se suma al ARNm de Ia siguiente manera: Antes que Ia ARN polimerasa II alcance Ia secuencia de terminación del gen, varios factores específicos reconocen en el transcripto primario una secuencia Ilamada señal de poliadenilación, formada por los nucleótidos AAUAAA, Los factores se Ilaman CPSF (por cleavage and polyadenylarion specificity factor) , CSTF (por cleavage stimulationfactor), CFI y CFII (por cleavage factor). Uno de ellos no se sabe cuál corta el ARNm unos 20 nucleótidos después de Ia señal de poliadenilación, y el transcripto primario se desconecta del ADN. El tramo adicional de ARNm que resulta de Ia continuación de Ia transcripción no tarda en ser degradado por fosfatasas y nucleasas pues su extremo 5' carece de cap. En cambio, desarrolla una estructura que también protege a Ia molécula, consistente en uma secuencia corta de nucleótidos que se pliega y forma un bucle. La molécula de los ARNm experimenta cortes y empalmes La remoción de los intrones del transcripto primario se cumple en dos pasos: en el primero, el ARNm es cortado entre los intrones y los exones; en el segundo, los intrones son expulsados y los exones se empalman entre sí. Antes de analizar estos pasos haremos una breve descripción de los agentes responsables de su ejecución y de Ias señales que deben reconocer en el transcripto primario. Los agentes responsables de los cortes y empalmes en el ARNm son Ias RNPpn. Cada una de estas ribonucleoproteínas nucleares posee un ARNpn rico en uridinas —de 250 nucleótidos o menos— y diversas proteínas. Debe señalarse que 1a actividad enzimática de Ias RNPpn depende del ARNpn , no de Ias proteínas (como se vio en el capítulo 2-12, los ARN con propiedades catalíticas se Ilaman ribozimas). Repaso de Genética Página 1 Video com o passo-a-passo de los cortes y empalmes en el ARNm Existen varias RNPpn. Son diferentes no Sólo en su compo- sición sino también en sus funciones, algunas ajenas a los cortes y los empalmes de los transcriptos primarios. Las RNPpn que participan en esos cortes y empalmes son Ias Ilamadas U1, U2, U4, U5 y U6 (V por ser ricas en uridinas), Ias cuales concurrem al sector del transcripto primario que va a ser procesado y forman un complejo macro- molecular denominado espliceosoma (por splicing, empalme). El transcripto primario contiene una serie de señales que marcan dónde debe cortarse su molécula: Así, en el límite entre el extre- mo 3' de los exones y el extremo 5' de los intrones aparece Ia secuencia GIGU , en Ia que el dinucleótido GU señala el comienzo del intrón. En el otro limite, es decir, entre el extremo 3' de los intrones y el extremo 5' de los exones, aparece Ia secuencia AGIG, en Ia que el dinucleótido AG marca Ia terminación del intrón. La U y Ia A se presentan en forma constante. Esta A se Ilama punto de ramificación y, como se verá, desempeña un papel central en Ia remoción de los intrones. La eliminación de los intrones y el empalme de los exones se produce en dos etapas: En Ia primera, Ia UI se combina con el extremo 5' del intrón y Ia U2 con el tramo de ARN que contiene el punto de ramificación. Esta última combinación depende del tramo rico en pirimidinas y consume energía, que es tomada del ATP. La UI corta al ARN entre el extremo 3' del exón y el GU delextremo 5' del intrón. Después del corte, el intrón se dobla sobre sí mismo y forma un lazo. Una de Ias enfermedades autoinmunes que afectan al hombre —el lupas eritematoso— se genera por Ia producción de anticuerpos contra varias proteínas de Ias RNPpn del espliceosoma. REGULACION DEL PROCESAMIENTO DE tos ARN MENSAJEROSY DE SU SAUDA AL CITOSOL El procesamiento de los ARNm es regulado en varios niveles El control de Ia transcripción de los genes - operado a través del promotor y los reguladores— es el mecanismo más importante que utiliza Ia célula para determinar qué tipos de proteínas debe producir y en qué cantidades. No obstante. el control de Ia producción de 1a mayoría de Ias proteínas depende también de otros mecanismos —ahora postranscripcionales— de no menor importancia. Repaso de Genética Página 2 Corte y poliadenilación diferencial del extremo Y del transcripto primario. Algunos genes —por ejemplo, los que codifican anticuerpos en los linfocitos B — generan un transcripto primario que puede dar lugar a dos clases de proteínas, aunque éstas se diferencian Sólo por ser una más larga que Ia otra. EITO es porque un fator regulatorio determina que el corte del ARN en el extremo Y del transcripto primario —y por ende, el agregado de Ia poli A— se realice en puntos diferentes de Ia molécula, Io que posibi[ita Ia generación de dos ARNm de distinta longitud. Cortes y empalmes en lugares alternativos del transcripto primario. Los cortes en el transcripto primario deben efectuarse con absoluta precisión, pues bastaría que el punto de incisión se corriera un solo nucleótido para que se alterasen los codones del ARNrn y se inutilice su mensaje. Control de Ia salida de los ARNm al citosol. Se ha comprobado que ciertos ARNm no pasan al citoplasma porque son previamente degradados en el núcleo o porque es impedido su pasaje por los poros de Ia envoltura nuclear. Este mecanismo regulatorio se produce en Ias células que por causas funcionales deben prescindir de tales ARNm —y de Sus correspondientes proteínas— después de haberlos sintetizado. PROCESAMIENTO DEL ARN RIBOSOMICO 45S El procesamiento del transcripto primario del ARNr 45S es diferente del experimentado por los ARNm El transcripto primario del ARNr 45S no forma un cap en su extremo 5' ni poliadenila su extremo Y. Su procesamiento tiene lugar en el nucléolo y cornienza con una serie ordenada de cortes para eliminar Ias secuencias espaciadoras de cada ARNr 45S y hacer que los ARNr 28S, 18S y 5,8S queden como unidades independientes. El origen de estos ARNr a partir de un mismo transcripto primario asegura su producción equitativa.Las secuencias espaciadoras del transcripto primario di eridas Dor enzimas apenas se separan de Ias secuencias utilizables. Un grupo especial de RNPpno hace que algunas A, C, G y U se conviertan en nucleótidos inusuales. Así, varias A, C y G se metilan —es decir, se transforman en mA, mc y mG— y una parte de Ias U se convierten en seudouridinas. La síntesis y el procesamiento del ARNr 45S tienen lugar en el nucléolo Tanto Ia síntesis como el procesamiento del ARNr 45S se producen en el nucléolo. cuyo estudio ultramicroscópico muestra una estructura característica, con dos regiones perfectamente distinguibles: 1) La región fibrilar, ubicada en Ia parte central, donde se sintetiza el ARNr 45S y se producen los primeros pasos de su procesamiento. Contiene Ias 200 copias del gen del ARNr 45S, moléculas de este ARNr, los factores UBF y SLI , Ia ARN polimerasa I, parte de Ias RNPpno, etc. A veces muestra zonas aisladas más claras, que corresponden a Ias copias inactivas del gen. 2) La región granular, ubicada en Ia periferia, en Ia que se encuentran Ias subunidades de los ribosomas en distintos estadios de procesamiento. Esta región —y por Io tanto el nucléolo— no se halla envuelta por membrana alguna. PROCESAMIENTO DEL ARN RIBOSOMICO El ARNr 5S ingresa en el nucléolo Una vez sintetizado, el ARNr 5S ingresa en el nucléolo y se incorpora a Ia subunidad ribosómica mayor. No se sabe por qué este ARNr se sintetiza en un lugar distinto del de los restantes ARNr. Como los otros ARN ribosómicos , el ARNr 5S establece su configuración tridimensional merced a apareamientos de secuencias complementarias de su propia molécula. Fibrilar Granular La flecha señala materiales que salen al citoplasma a través de un poro nuclear. Repaso de Genética Página 3 DE TRANSFERENCIA El procesamiento de IOS ARNt incluye modificaciones en algunos de sus nucleótidos Los ARNt contienen entre 74 y 95 nucleótidos. Su procesamiento incluye 1a remoción de un intrón. que se elimina por un mecanismo diferente del utilizado por los ARNm, pues prescinde del espliceosoma. Adernás, en cada tipo de ARNt un grupo determinado de nucleótidos experimentan cambios químicos. Así, algunas U son transformadas en seudouridinas (te) , otras metiladas a ribotimidinas (T) y otras reducidas a dihidrouridinas También es común que algunas A, C y G sean metiladas (mA, mc y mG) y que una o más A sean Convertidas en inosinas (I). Como muestran Ias figuras 16-3 y 164, los ARNt contienen secuencias de nucleótidos complementarios que se aparean entre sí, Io que hace que adquieran Ia forma de una haja de trébol y luego Ia forma de Ia letra L. El procesamiento culmina con el reemplazo del trinucleótido —presente en el extremo 3' de los transcriptos primarios de todos los ARNt— por el trinucleótido CCA. En el capítulo 16-6 se valorará Ia importancia de este reemplazo. PROCESAMIENTO DE LOS ARN PEQUENOS Los ARN pequeños se asocian con proteínas Una vez que los ARNpn terminan de sintetizarse, los nucleótidos complementarios de sus propias moléculas se aparean entre sí. PROCESAMIENTO DEL ARNxist, DEL ARNte Y DE LOS miARN El ARNxist y el ARNte permanecen en el núcleo y los miARN salen al citoplasma • El ARNxist permanece en el núcleo, se une al cromosoma X compactado de Ias células de Ia mujer (cuerpo de Barr). • El ARNte también permanece en el núcleo. Uno de los pasos salientes de su procesamiento Io asocia con el grupo de proteínas que participan en Ia formación de Ia telomerasa, • Los miARN salen al citosol y se unen con el complejo RISC La transcripción de los genes de los miARN origina transcriptos primarios de más de 100 nucleótidos que contienen dos secuencias complementarias e invertidas, derivadas de Ias repeticiones invertidas de los propios genes. Debido a que esas secuencias se aparean entre sí, los transcriptos primarios —o pri-miARN— adquieren Ia forma de una horquilla. El pri-miARN es procesado en el interior del núcleo por Ia ribonucleasa Drosha (por Drosophilo). Esta enzima cercena gran parte de los extremos de Ia horquilla y Ia convierte en pre-miARN, que sale del núcleo con Ia ayuda de una exportina y se instala en el citosol. El pre-miARN posee unos 70 nuclétidos y es procesado por Ia ribonucleasa Dicer (por el verbo inglês to dice). Esta enzima suprime partes del premiARN y genera un miARN doble que posee dos o tres nucléotidos libres en el extremo 3' de cada cadena. Por razones que Veremos a continuación, una de Ias cadenas se [lama guía y Ia otra, pasajera. El procesamiento se completa cuando el miARN doble se une al complejo proteico RISC (por RNA-induced silencing complex), que degrada a Ia cadena pasajera pero continúa unido a Ia cadena guia. Esta última —un ARN simple de 21 a 26 nucleótidos de largo - adquiere el nombre de miARN y con el RISC compone el complejo ribonucleoproteico miARN-RISC. Duas maravilhosas aulas da UBA Repaso de Genética Página 4 EXERCÍCIOS TRANSCRIÇÃO DOS RNAS 1. Que partes do DNA constituem uma unidade de transcrição? 2. O que é um bucle? 3. A seguinte sequência de nucleotídeos é encontrada em um molde de DNA unifilamentar: Suponha que a RNA polimerase percorra esse molde da esquerda para a direita. a. Qual a ponta do molde de DNA é 5´e qual a ponta é a 3´? b. Cite a sequência e marque as pontas 5´e 3´do RNA transcrito desse molde. OBS: o fita codificante é “debaixo”. 4. O processamento de RNAm compreende a remoção de Intrones ou exóns? 5. Quais são as RNPpn que participam dos cortes e ligações (empalmes)? 6. O que é o CAP 5´? Como o CAP 5´é adicionado ao pré-RNAm eucariótico? Qual a função do CAP 5´? 7. O que é a edição do RNA? Explique o papel dos RNAs guia na edição dos RNAs. 8. Qual a doença autoimune gerada pela produção de anticorpos contra várias proteínas da RNPpn do espliceosoma? 9. Quais adeninas aproximadamente tem uma Poli A? 10. Descreva os níveis de processamento do RNAm. __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ ____________________________________________________________________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ __________________________________________________________ _________________________________________________________
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