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Virologia Animal 2015 -Organización de la cursada/contenidos/PPs -Bibliografia (libros on line/cedidos) IVIS -Horarios de consulta -Inicio de la clase, parciales/finales, ortografia (primer lugar: encima vs enzima!!!!) -Horarios de consulta -Promocion -Otros: Promed,NCBI -Comentarios sobre la materia/sugerencias/ Dr Ana Bratanich abratanich@fvet.uba.ar Dr Danilo Bucafusco Leandro Diaz Sabrina Galdo Novo √ Marcelo Gonzalez Carina Guaragna MS Miguel Huguet √ Carlos Palacios √ Conicet: Carolina Silvestro √ Conicet: Dr Fiorella Kotsias Múltiples razones para entender más de virus -Siguen siendo noticia: polio,HIV,influenza,rabia,norovirus -Muchos virus animales sirven de modelo para enfermedades humanas. FIV vs HIV -Muchas enfermedades virales humanas tienen su origen en virus animales (y de plantas??) -Su simplicidad genomica permite estudiar más facilmente la regulación de la expresión de genes y su interacción con la célula. -Esto lleva a entender mejor los mecanismos de patogénesis. -Hoy tal conocimiento se aprovecha para utilizar los virus como vectores con fines terapéuticos y vacunales. Este es un conocimiento dinamico ya que consistentemente nuevos virus son identificados (y nuestras conclusiones cambian) Como me entero de lo que pasa o paso en el mundo con respecto a infecciones virales? Highlights del 2015 -Ebola -Vacuna de influenza no anduvo bien -Sarampion: muchos casos por falta de vacunacion!!! -Enterovirus 68 asociado a paralisis flaccida -Encefalitis asociada a bornavirus en individuos criadores de ardillas Donde encuentro informacion sobre trabajos cientificos, secuencias,etc, de los distintos virus? Anatomia viral http://www.microbiologybook.org/mhunt/intro-vir.htm Componentes de un virion Otras proteínas de la envoltura, participan en la fusión de la misma con la membrana celular o los endosomas, durante la entrada viral. La envoltura se adquiere durante el budding (gemación) de las particulas virales desde la membrana plasmática, nuclear, Golgi o el retículo endoplásmico. Componentes del virión Envoltura Bicapa de lípidos (de la célula) y proteínas (virales: general- mente glicoproteinas). Exteriormente combinadas a oligosacá- ridos que reconocen receptores celulares y son el target de la respuesta inmune. Componentes del virion Cápside: Cubierta formada de pocas moléculas de proteinas repetidas (capsómeras). En virus desnudos es la que contiene los sitios que reconocen receptores celulares. Se repiten una o varias proteinas distintas, en cada unidad estructural: protómero. Dos tipos de simetrías: helicoidal e icosaédrica. Proteinas estructurales y no estructurales. Se llama virión a la nucleocápside junto con su envoltura (si la tiene). Entre envoltura y cápside a veces se encuentra el tegumento (herpes) Icosadédrico Helicoidal Como se clasifican los virus y donde encuentro informacion sobre el tema? Clasificación de virus: sistema clásico 1-Ordenes/flias: basado en tres principios: a- Solo el virus, no el huésped. b- El tipo de ácido nucléico. c- Las características físicas del virión: simetría de cápside, dimensiones, envoltura lipídica. 2-Subflias/géneros:basado en otras características antes biológicas, ahora basadas en secuencias. 3-Especies/virus: una especie de virus se define como “una clase politética (esto es, definida por más de una propiedad) de virus que constituye un linaje replicativo y ocupa un nicho ecológico particular”. Ejemplo: BoHV-1/BoHV-5 Diferencias biologicas en las subfamilias de herpesvirus Alphaherpesvirinae •Rango de huesped variable (cruza especies) •Ciclo reproductivo corto •Destruccion de la celula infectada/dispersion rapida en cultivo •Latencia en ganglios sensoriales Betaherpesvirinae •Rango de huesped mas restringido •Ciclo reproductivo largo •Citomegalia/dispersion mas lenta en cultivo •Latencia en muchos tejidos: glandulas secretorias, rinon,linfocitos en el caso de HHV-6 y 7 Gammaherpesvirinae •Rango de huesped muy restringido •Infecta prinicpalmente linfocitos y celulas epiteliales •Poca produccion de virus •Asociado a tumores •Latencia en linfocitos Clasificación de Baltimore Virus DNA From Principles of Virology Flint et al ASM Press Virus RNA From Principles of Virology Flint et al ASM Press Donde encuentro informacion sobre las diferentes familias de virus? DNA viruses From Principles of Virology Flint et al ASM Press Eritrovirus (B19) Dependovirus Parvovirus Viralzone Conceptos -Poco genoma/muchas proteinas -Proteinas estructurales y no estructurales -Proteinas producidas en distintos tiempos -Proteinas virales multifuncionales -Intrones?? Atencion -el ADN viral es sintetizado por la maquinaria celular con la ayuda de Rep (via rolling hairpin/horquilla rodante) ver Viralzone -Sintesis de ADN viral ocurre entre sintesis no estructural y estructural El ciclo de replicacion de los parvovirus depende si es un Dependovirus o un Parvovirus autonomo (Eritrovirus, Parvovirus) Filogenia FPV-CPV >gi|411101517|gb|AFW04080.1| capsid protein 2 [Canine parvovirus] MSDGAVQPDGGQPAVRNERATGSGNGSGGGGGGGSGGVGISTGTFN NQTEFKFLENGWVEITANSSRLVHLNMPESENYRRVVVNNLDKTAVN GNMALDDTHAQIVTPWSLVDANAWGVWFNPGDWQLIVNTMSELHL VSFEQEIFNVVLKTVSESATQPPTKVYNNDLTASLMVALDSNNTMPFT PAAMRFETLGFYPWKPTIPTPWRYYFQWDRTLIPSHTGTSGTPTNIYH GTDPDDVQFYTIENSVPVHLLRTGDEFATGTFYFDCKPCRLTHTWQTN RALGLPPFLNSLPQAEGGTNFGYIGVQQDKRRGVTQMGNTNIITEATI MRPAEVGYSAPYYSFEASTQGPFKTPIAAGRGGAQTDENQAADGDPR YAFGRQHGQKTTTTGETERFTYIAHQDTGRYPEGDWIQNINFNLPVTN DNVLLPTDPIGGKAGINYTNIFNTYGPLTALNNVPPVYPNGQIWDKEF DTDLKPRLHVNAPFVCQNNCPGQLFVKVAPNLTNEYDPDASANMSRI VTYSDFWWKGKLVFKAKLRASHTWNPIQQMSINVDNQFN YVPSNIGGMKIVYEKSQLAPRKLY Polyomaviridae Papillomaviridae Ex Papovaviridae (Virus que manipulan el ciclo de replicación celular) Virus que manipulan el ciclo de replicacion celular Polyomaviridae SV40 , JC, BK virus) -Transcripcion en ambos sentidos (temprano/tardio). -Un solo promotor que hace todo (es ademas Ori) -Codifica para el LT, MUY relacionado a encogenesis Replicacion polyoma (SV40) Replicacion Polyomavirus Atencion -ADN viral es sintetizado por la celula -la sintesis de ADN viral se hace entre la sintesis temprana y tardia Papillomaviridae -Transcripcion en un solo sentido -Mucho splicing -Varios promotores -Codifica varios genes tambien asociados a oncogenesis The “early” proteins are regulatory infunction. For example, they play roles in HPV genome replication and transcription, cellcycle, cell signalling and apoptosis control, immune modulation and structural modification of the infected cell. Unscheduled division of infected cells in the differentiating epithelial layers gives rise to the physical manifestation of infection as a wart. Respuesta inmune inexistente en esta region Expresion de genes de papilomavirus en distintos niveles de diferenciacion celular El ciclo de replicacion de papilomavirus es dependiente del status de diferenciacion celular Although the differentiated host cells have completed S-phase, the virus induces or mimics a DNA damage response in the vicinity of the genome, resulting in a cascade of recombination and replicative factors being delivered to a nascent viral replication factory. Expresion de genes de papilomavirus en distintos niveles de diferenciacion celular Atencion -ADN viral es sintetizado por la maquinaria celular -ADN viral se sintetiza entre sintesis temprana y tardia -Rol importante de proteinas celulares activando/desreprimiendo promotores virales Interestingly, all integrated MCPyV genomes have mutations that inactivate the helicase activity of T-Ag, and this may prevent autoactivationof integrated virus replication, which could lead to unlicensed initiation of DNA synthesis and DNA damage detrimental to cell surviva Adenoviridae Utiliza splicing y diferentes Genero Mastadenovirus Especie Adenovirus Canino tipo 1 RNA asociado a virus: inhibe IFN, producido por pol III Inhibe expresion de MHC-1 Inhibe respuesta apoptotica capturando proteinas celulares Rol en la replicacion de DNA Pol III El plan de los adenovirus Atencion -Sintesis de ADN viral lo hace la polimerasa del virus -Transcripcion mas compleja y dividida en 3 etapas: inmediato temprano, temprano y tardio -Sintesis de ADN se realiza despues de la etapa temprana y antes de la tardia (….logicamente) Y llegamos a los Herpesviridae… BoHV-1,5,EHV-1-4, CMV de diferentes especies, OvHV-2 (FCM),herpes canino Atencion -Muchos genes con promotores independientes. -Poco splicing -Timing y programa~a adeno Ciclo de replicacion de los herpesvirus Atencion -Timing y programa~a adeno -Sintesis de ADN viral realizado por la Polimerasa viral con cierta dependencia de factores celulares (~ a adeno) Estado latente de los Herpesvirus Ocurre en neuronas, inicia como una infeccion productiva, la transcripcion es bloqueada (leaky) excepto por los latency-associated RNAs (LATs), spliceados, el LAT de 2kb LAT (estructura de lariat) es transportado al citoplasma (y traducido?) Science. 2000 Feb 25;287(5457):1500-3. Virus-induced neuronal apoptosis blocked by the herpes simplex virus latency-associated transcript. Perng GC, Jones C, Ciacci-Zanella J, Stone M, Henderson G, Yukht A, Slanina SM, Hofman FM, Ghiasi H, Nesburn AB, Wechsler SL. Source Ophthalmology Research Laboratories, Cedars-Sinai Medical Center Burns & Allen Research Institute, 8700 Beverly Boulevard, Los Angeles, CA 90048, USA. Abstract Latent infections with periodic reactivation are a common outcome after acute infection with many viruses. The latency-associated transcript (LAT) gene is required for wild-type reactivation of herpes simplex virus (HSV). However, the underlying mechanisms remain unclear. In rabbit trigeminal ganglia, extensive apoptosis occurred with LAT(-) virus but not with LAT(+) viruses. In addition, a plasmid expressing LAT blocked apoptosis in cultured cells. Thus, LAT promotes neuronal survival after HSV-1 infection by reducing apoptosis. Cual es la funcion del LAT? http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Perng%20GC%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Jones%20C%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Ciacci-Zanella%20J%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Stone%20M%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Henderson%20G%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Yukht%20A%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Slanina%20SM%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Hofman%20FM%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Ghiasi%20H%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Nesburn%20AB%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=Wechsler%20SL%5BAuthor%5D&cauthor=true&cauthor_uid=10688801 CICLO POXVIRUS Transcripcion en citoplasma, genes tempranos inducen un primer uncoating Algunos genes tempranos son homologos de factores de crecimiento/control inmune Sintesis de genoma viral/genes intermedios Gen celular esencial para el virus Genes tardios, estructurales y varias regulatorias Polimerizacion de actina • http://homepages.ucalgary.ca/~ceri/cmmb421prot/virusanimation/ • http://viralzone.expasy.org/ •http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/MicrobeWiki •Capitulo de replicacion viral subido a la web Biblio extra, peliculitas •http://darwin.bio.uci.edu/~faculty/wagner/moviei ndex.html •http://www.virology.ws/virology-course-2014/ Slide Number 1 Slide Number 2 Slide Number 3 Slide Number 4 Slide Number 5 Slide Number 6 Slide Number 7 Slide Number 8 Slide Number 9 Slide Number 10 Slide Number 11 Slide Number 12 Slide Number 13 Slide Number 14 Slide Number 15 Slide Number 16 Slide Number 17 Componentes del virion Slide Number 19 Clasificación de virus: sistema clásico Slide Number 21 Slide Number 22 Slide Number 23 Slide Number 24 Slide Number 25 Slide Number 26 Slide Number 27 DNA viruses� Slide Number 29 Slide Number 30 Slide Number 31 Slide Number 32 Slide Number 33 Slide Number 34 Slide Number 35 Slide Number 36 Slide Number 37 Slide Number 38 Slide Number 39 Slide Number 40 Slide Number 41 Slide Number 42 Slide Number 43 Estado latente de los Herpesvirus Slide Number 45 Slide Number 46 Slide Number 47 Slide Number 48 Slide Number 49
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