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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES IZTACALA BIOMEDICINA IDENTIFICACIÓN DE MUTACIONES EN BRCA1 Y BRCA2 MEDIANTE SECUENCIACIÓN MASIVA EN PACIENTES MEXICANOS CON SÍNDROME DE CÁNCER DE MAMA-‐OVARIO HEREDITARIO TESIS QUE PARA OPTAR POR EL GRADO DE: MAESTRA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGÍA EXPERIMENTAL) PRESENTA: ROSA MARÍA ALVAREZ GÓMEZ TUTOR PRINCIPAL DE TESIS: DR. CARLOS GUADALUPE PÉREZ PLASENCIA FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES IZTACALA COMITÉ TUTOR: DRA. SARA FRÍAS VÁZQUEZ POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS DR. LUIS ALONSO HERRRERA MONTALVO INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS MÉXICO, D.F. JUNIO, 2014 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. Dr. 1I;dn> A_ lllartincz DiNctl>r GeMnI do .... ,.""'-1> .. i060, _'o uru.M P ' .. . n'. p , . . .... DAA.. ....... .-PATRlCIAO!>TROSlC"o"S>IEJU yO<#. llAA.CL\UtIIA._~ClHJ.AA s.u_"" DAA.. ....... FRIAs vÁlfUa. Su,ol ,le. DR._~CIM'OS ~ DR.lUSAUlNSO_"""' .... "" AT E II T ... IIIEN T1': ' POR .. AAZA HAIILARA El. ~ Cd. ~ O.F .• • 17 do jurjo do 20" <.c.p. F,,*, I • oIoi (lo) ¡".. ': (o) COO¡OJ«,ClON AGRADECIMIENTOS AL POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS, DE LA UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO. AL APOYO RECIBIDO POR EL CONSEJO NACIONAL DE CIENCIA Y TECNOLOGÍA (CONACYT), MEDIANTE LA BECA DE MAESTRÍA OTORGADA, CON NÚMERO DE BECARIO 269958 (NÚMERO DE CVU 432029) A LOS MIEMBROS DEL COMITÉ TUTOR, ENCABEZADOS POR EL DR. CARLOS GUADALUPE PÉREZ PLASENCIA UNIDAD DE INVESTIGACIÓN EN BIOMEDICINA, FES IZTACALA DRA. SARA FRÍAS VÁZQUEZ INSTITUTO NACIONAL DE PEDIATRÍA, SSA, MÉXICO DR. LUIS ALONSO HERRRERA MONTALVO INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS, UNAM AGRADECIMIENTOS A TÍTULO PERSONAL A cada uno de los integrantes del Laboratorio de Oncogenómica, del Instituto Nacional de Cancerología, por todo el trabajo invertido en este trabajo de tesis. A todos mis profesores del Posgrado de Ciencias biológicas. Mil gracias por todo su esmero y excelencia. Un agradecimiento especial a la Dra. Sara Frías, por su confianza plena y retroalimentación y al Dr. Luis A. Herrera, por su confianza y enseñanzas en la labor institucional. A mis queridas compañeras de Maestría: Marcela y Montserrat, gracias por brindarme su amistad, fue un privilegio compartir con ustedes este trayecto. A mis padres, Leonor y T. Rolando, por ser mi pilar y fuerza. Por practicar con el ejemplo y ser congruentes en cada uno de sus pasos. Gracias por soportar mis malos ratos y mis humores; por siempre dar y por siempre estar. A Rolando, mi hermano, con todo lo que la palabra significa; te he aprendido mucho y lo agradezco. A mi familia, por brindarme la confianza y el amor para emprender cualquier camino. Son mi sitio seguro y a donde siempre puedo volver. A mis tíos Mary, Pepe y Ramón (ϯ), por llenar mi vida de hermosos recuerdos. Gracias A ti, David, mi ayer y mí hoy. Nuestros pasos son paralelos y el camino es prometedor. Somos cómplices y hombro a hombro andamos. Gracias por construir conmigo... No lo olvides, soy en ti. A Santiago, mi motor y mi todo. Mi niño adorado y mi razón de ser. DEDICATORIA A LA UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO, POR MI RAZA HABLARÁ EL ESPÍRITU. AL INSTITUTO NACIONAL DE CANCEROLOGÍA Y CADA PACIENTE QUE FORMA PARTE DE ESTE TRABAJO DE TESIS. ÍNDICE SECCIÓN PÁGINA RESUMEN EN ESPAÑOL……………………………… 1 ABSTRACT…………………………………………………. 3 INTRODUCCIÓN………………………………………… 4 OBJETIVOS………………………………………………… 26 ANTECEDENTES…………………………………………. 28 METODOLOGÍA………………………………………….. 30 RESULTADOS……………………………………………… 43 DISCUSIÓN…………………………………………………. 62 CONCLUSIONES………………………………………….. 72 LITERATURA CITADA…………………………………… 75 LISTA DE FIGURAS Y TABLAS FIGURAS: FIGURA 1. …………………………………………………………… 4 FIGURA 2. …………………………………………………………… 5 FIGURA 3. …………………………………………………………… 6 FIGURA 4. …………………………………………………………… 9 FIGURA 5. …………………………………………………………… 40 FIGURA 6. …………………………………………………………… 43 FIGURA 7. …………………………………………………………… 47 FIGURA 8. …………………………………………………………… 48 FIGURA 9. …………………………………………………………… 50 FIGURA 10. ………………………………………………………… 51 FIGURA 11. ………………………………………………………… 54 FIGURA 12. ………………………………………………………… 55 FIGURA 13. ………………………………………………………… 61 TABLAS: TABLA 1. ……………………………………………………………… 7 TABLA 2. ……………………………………………………………… 19 TABLA 3. ……………………………………………………………… 21 TABLA 4. ……………………………………………………………… 25 TABLA 5. ……………………………………………………………… 34 TABLA 6. ……………………………………………………………… 35 TABLA 7.……………………………………………………………… 45 TABLA 8. ……………………………………………………………… 49 TABLA 9. ……………………………………………………………… 52 TABLA 10. …………………………………………………………… 53 TABLA 11. …………………………………………………………… 57 TABLA 12. …………………………………………………………… 58 TABLA 13. …………………………………………………………… 59 TABLA 14. …………………………………………………………… 60 RESÚMEN EN ESPAÑOL El cáncer de mama constituye la primera causa de muerte por cáncer en mujeres a nivel mundial y en México. En la literatura se refiere que hasta el 10% de los tumores malignos de mama se deben a síndromes de cáncer hereditario, principalmente atribuibles a mutaciones en BRCA1 y BRCA2. En México, se desconoce la frecuencia relativa de mutaciones de estos genes en pacientes con síndrome de cáncer de mama-‐ ovario hereditario. El diagnóstico molecular es de gran importancia ya que permite orientar el tratamiento, seguimiento, pronóstico así como extender el estudio a los familiares en riesgo, brindando medidas de prevención primaria y secundaria. Así mismo, permite conocer las bases moleculares implicadas en la patología. Se estudiaron a 237 pacientes con sospecha clínica de síndrome de cáncer de mama-‐ ovario hereditario, con la finalidad de realizar la secuenciación masiva en paralelo de los genes BRCA1 y BRCA2. De esta forma, se identificaron 39 mutaciones germinales puntuales (deleciones, inserciones; transcisiones y tranversiones con generación de codón de paro; alteración de los sitios donadores/aceptores de corte y empalme intrón-‐exón) consideradas deletéreas al impactar en la funcionalidad proteica. Lo anterior representa una frecuencial mutacional del 16% en la población estudiada. Del total de las mutaciones encontradas, seis no habían sido previamente reportadas. Se identificó un 18% de variantes consideradas de significado clínico incierto. Se brindó asesoramiento genético a las pacientes con identificación de mutaciones germinales y se extendió el estudio molecular a 55 familiares en riesgo que aceptaron el estudio, identificando a 11 portadores asintomáticos de mutaciones germinales. La identificación de la frecuencia de mutaciones germinales en BRCA1 y BRCA2 en población mexicana con síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario permitirá conocer el impacto real del diagnóstico molecular en este grupo de pacientes, al orientar el tratamiento, seguimiento y pronóstico, lo cual repercute en una mejor calidad de vida así como en una atención integral, con un claro enfoque un preventivo y de medicina translacional. ABSTRACT Breast cancer is the leading cause of death in women. Scientific reports suggest that about 10% of breast cancers are due to hereditary cancer syndromes, mainly attributable to mutations in BRCA1 and BRCA2 genes. In Mexico, it is unknown the frequency of mutations in these genes in patients with hereditary breast and ovarian cancer . Molecular diagnosis is of great importance as it allows guiding treatment, monitoring and prognosis in cancer patients, as well as providing extension study to relatives at risk, with consequent measures of primary and secondary prevention. It also allows to know the molecular basis of pathology. We studied 237 patients with clinical suspicion of hereditary breast-‐ovarian cancer, in order to perform massively parallel sequencing of the BRCA1 and BRCA2 genes. We identified 39 germline puntual mutations (deletions, insertions; nucleotide change with generation of a stop codon; mutations in the splice-‐site regions) considered deleterious because of the impact on the protein functionality. This represents a relative frequency of 16%. Of all the mutations, six had not been previously reported. We identified 18% of variants of uncertain clinical significance. Genetic counseling was provided to all the patients and molecular study was extended to 55 families at risk, identifying eleven asymptomatic carriers of germline mutations. Knowledge of the frequency of germline mutations in BRCA1 and BRCA2 genes in mexican population allow know the real impact of molecular diagnosis in this group of patients, for guide treatment, monitoring and prognosis. This is reflected in a better quality of life as well as comprehensive care, with a clear focus on a personalized, preventative and translational medicine. INTRODUCCIÓN El cáncer de mama es la primera causa de muerte por neoplasia en la mujer en el mundo, con más de 520,000 muertes cada año, de las cuales 70% ocurren en países en desarrollo (WHO, 2011). En el último reporte la Agencia Internacional para la Investigación en Cáncer del 2012, el cáncer de mama presentaba una incidencia de 1,676,633 casos y una prevalencia a cinco años de 6,255,391 casos (GLOBOCAN, 2012). FIGURA 1. Incidencia y mortalidad estimada por los principales 15 diagnósticos oncológicos nivel mundial en mujeres,. Se aprecia en primer lugar, al cáncer de mama. Los datos están basados en un rango por 100,000 mujeres. (Modificado Reporte GLOBOCAN, 2012) En México, el cáncer de mama ocupa el primer lugar como tumor maligno y como causa demuerte por cáncer en la mujer, desplazando de este sitio al cáncer cérvico-‐ uterino desde el 2006 (Knaul F et al.,2009; Chavarri–Guerra Y et al., 2012). En el año 2009, el número de defunciones registradas por cáncer de mama fue de 4,964, con una tasa de mortalidad de 17.0 por 100 mil mujeres de 25 y más años, lo que representa un incremento de 30% en los últimos 20 años (DGIS, 2009). En cuanto a la etiología de los tumores malignos de la glándula mamaria, en su mayoría se consideran multifactoriales y esporádicos (Nathanson et al., 2001). Sin embargo, el 10% forma parte de un síndrome de cáncer hereditario (Ellsworth et al., FIGURA 2. Mortalidad en mujeres, ajustada a la edad, por cáncer de mama (línea con triángulos en rojo) y cáncer cervico-‐uterino (línea con cuadrados en azul). en el período comprendido entre 1955 a 2005 en México. (Figura modificada de Chavarri Y et al., 2012). 2010). El principal se denomina Síndrome de Cáncer de Mama y/u Ovario Hereditario (Lynch, 1994). Se ha encontrado que las mutaciones germinales en dos genes supresores de tumor considerados de alta susceptibilidad, BRCA1 y BRCA2, son la causa directa de hasta el 60% del cáncer de mama hereditario (Miki et al., 1994; Wooster et al., 1994; Narod et al., 1995). Otros genes considerados de alta susceptibilidad para el cáncer de mama son RAD51, p53, PTEN y STK11/LKB11 (Robson et al., 2007). En la Tabla 1. se enmarcan las principales características clínicas así como el porcentaje de riesgo para padecer cáncer de mama, de los síndromes de cáncer hereditario que conforma el grupo de alta susceptibilidad ó de alto riesgo. FIGURA 3. Clasificación de los principales genes asociados a la susceptibilidad para padecer cáncer, de acuerdo a la alta, moderada y baja susceptibiidad que confieren. El grupo de alto riesgo se encuentra encabezado por BRCA1 y BRCA2. El gen BRCA1 (Breast cancer 1, early onset) fue clonado en 1994 tras estudios de ligamiento que permitieron su ubicación en el brazo largo del cromosoma 17 (17q21). Se compone de 24 exones, de los cuáles el exón 1 y 4 no forman parte del transcrito. Codifica para una proteína de 1863 aminoácidos, que se compone de 5 dominios (Miki et al., 1994). En tanto, BRCA2 (Breast cancer 2, early onset) se localiza en el brazo largo del cromosoma 13 (13q12.3). Su estructura génica la conforman 27 exones, de los cuales el exón 1 no es codificante. La proteína BRCA2 esta integrada por 3418 aminoácidos, organizados en dos dominios relacionados estrechamente a la reparación por recombinación homóloga (Wooster et al., 1995). Tabla 1. Principales síndromes de cáncer de mama hereditario cuya etiología se encuentra comprendida en el grupo de genes de alta susceptibilidad SÍNDROME DE CÁNCER HEREDITARIO GEN PRINCIPALES TUMORES ASOCIADOS RIESGO DE CÁNCER A LO LARGO DE LA VIDA (%) Síndrome de Cáncer de Mama-‐Ovario Hereditario BRCA1 BRCA2 Cáncer de mama, ovario Cáncer de mama en mujer y hombre; ovario; próstata; páncreas 40 a 80% 20 a 85% Síndrome de Li-‐ Fraumeni TP53 Cáncer de mama; sarcomas y osteosarcomas; tumores cerebrales; tumor plexos coroideos; carcinomas adrenocorticales; leucemia 60 a 90% Síndrome de Cowden PTEN Cáncer de mama; tiroides; endometrial. Hamartomas benignos. Fenotipo: macrocefalia 25-‐50% Síndrome de Cáncer Gástrico Hereditario CDH1 Cáncer de mama (lobulillar); cáncer gástrico difuso; cáncer colorectal. 60% Síndrome de Peutz-‐ Jeghers STK11 Cáncer de mama; ovario; cervico-‐uterino; testicular; intestino delgado y colón 25-‐50% Las funciones de BRCA1 y BRCA2 como supresores de tumores son esenciales para la reparación exitosa de lesiones de doble cadena al DNA, por recombinación homóloga (Narod et al., 2004). Sin embargo BRCA1 también participa en funciones celulares importantes para el mantenimiento de la integridad genómica como el ensamblaje del huso mitótico, la duplicación de los centrosomas, el control del ciclo celular, la ubiquitinización de proteínas y la remodelación de la cromatina en el sito de las rupturas de doble cadena del DNA (Bertwistle et al., 1996; Scully et al., 1999; Wang et al., 2000; Hartman et al., 2002). Se ha demostrado que se requiere de BRCA1 para la activación en las fases S y G2/M después del arresto celular por daño al DNA. Así mismo, BRCA1 interactúa con múltiples proteínas de reparación y recombinación, incluyendo a RAD51; el complejo RAD50/MRE11/Nibrina; la helicasa asociada al síndrome de Bloom, y la proteína de la vía de Fanconi, D2 (Yun et al., 2009). El papel de BRCA1 en la regulación transcripcional y proliferación esta mediado por la asociación con CTIP, ZBRK, P300, el receptor de estrógenos, HDAC, Rb, p53, la RNA pol II, ciclina D1, c-‐myc y por lo menos un miembro del complejo SWI/SNF (Narod et al., 2011). La proteína BRCA1 también se ha implicado en el silenciamiento del cromosoma X por medio de la unión directa de BRCA1 a XIST, transcrito específico de la inactivación del cromosoma X (Scully et al., 2000). Esta unión podría ser partede la función reguladora de BRCA1 sobre la heterocromatina, lo cuál resulta fundamental para la reparación (Pageau et al., 2007; Zhu et al., 2011). El rol de BRCA2 es el de ser un regulador primario en la formación del filamento de RAD51, paso crítico para catalizar la invasión de cadena y la iniciación de la recombinación homóloga (Patel et al., 1998; Gretarsdottir et al., 1998; Verkitaraman et al 2002). Las células deficientes en BRCA1 ó BRCA2 son incapaces de reparar las lesiones de doble cadena por recombinación homóloga, lo que deriva a vías de reparación propensas a error, como la recombinación no homóloga. Estas células son susceptibles a mutaciones durante la reparación así como a acumular rearreglos cromosómicos durante las rondas sucesivas de división celular. Aunque la mayoría de estos rearreglos resultan en muerte celular, en algunos casos las células con mutaciones dan lugar a líneas celulares dominantes con autonomía para la división celular y potencial metastásico, dos datos característicos del cáncer. Aunque no existe un consenso de los mecanismos precisos, la pérdida de las funciones de BRCA1 ó BRCA2 constituye un FIGURA 4. Esquema donde se emnumeran las principales funciones conocidas de los genes BRCA1 y BRCA2. Destaca la reparación de rupturas de doble cadena. paso crítico en la carcinogénesis del cáncer de mama en personas que portan mutaciones deletéreas (Narod et al., 2011) Las mutaciones germinales identificadas hasta en el 80% de los pacientes son mutaciones puntuales en estado heterocigoto que introducen codones de paro prematuro ó afectan la estabilidad e integridad del RNA mensajero, como deleciones ó inserciones y mutaciones sin sentido que condicionan proteínas de funcionalidad comprometida (Ford et al., 1995; Yang et al., 1999; Perrin-‐Vidoz et al., 2002). En un 15% se encuentran mutaciones de sentido erróneo, clasificadas como variantes de significado clínico incierto (VUS) ya que se necesitan estudios funcionales proteicos para saber su impacto sobre el transcrito del alelo mutante (Ford et al., 1995; Yang et al., 1999; Goldgar et al., 2004; Radice et al, 2011). Los rearreglos genómicos complejos, como las deleciones ó duplicaciones de exones completos, conforman entre el 5 y 10% de las mutaciones reportadas en la mayoría de las poblaciones estudiadas (Bunyan et al, 2004; Petroni et al., 2009); la mayoría de los rearreglos genómicos reportados se encuentran en BRCA1. Sin embargo, en el norte de Italia y Holanda se ha reportado una frecuencia de hasta el 40%, constituyendo mutaciones fundadoras (Petrij-‐Bosch et al., 1997; Hogervorst et al., 2003; Montagna et al., 2003). Las mutaciones en BRCA1 y BRCA2 se encuentran distribuidas a lo largo de la secuencia génica de ambos genes, sin reportarse sitios calientes de recombinación que favorezcan la agrupación de mutaciones en alguna región en particular ó que permitan la correlación genotipo-‐fenotipo (Yang et al., 1999; Narod et al., 2004). El gen BRCA1 tiene de forma característica un alto contenido de secuencias Alu así como una región del promotor duplicada, lo cual favorece eventos de recombinación homóloga inequitativos, explicando la mayor presencia de rearreglos genómicos en BRCA1 (Smith et al., 1996; Puget et al., 2002) . El estudio de los genes BRCA1 y BRCA2 implica una importante inversión de tiempo y recursos económicos atribuible al gran tamaño de ambos genes, la distribución aleatoria de mutaciones en la secuencia de ambos genes y la presencia de distintos tipos de mutaciones (Sevilla et al., 2003). La metodología considerada como estándar de oro es la secuenciación directa (Strachan et al., 2010). Sin embargo, la complejidad técnica de estudiar de la totalidad de las regiones codificantes, se han empleado otras metodologías de primera línea ó tamizaje. Las mas usadas son el SSCP (Single Strand Conformation Polymorfism); el DGGE (Denaturing gradient gel electrophoresis); el PTT (Protein truncation test) y el DHPLC (Denaturing High Performance Liquid Chromatography). Los primeros tres métodos tienen su fundamento de detección en la migración diferencial de un fragmento de DNA que contiene una mutación versus un control sin alteración. El DHPLC usa la cromatografía para separar heteroduplex de homoduplex, bajo condiciones de alta presión y temperaturas parcialmente desnaturalizantes. La sensibilidad de los métodos descritos varía del 50 al 100%, mientras la especificidad de todos ellos es prácticamente del 100% (Gerhardus et al., 2007). El advenimiento de otras tecnologías como el HRM (High Resolution Melting) y las plataformas de secuenciación masiva han abierto la posibilidad de su aplicación en el estudio molecular de los genes BRCA. Sin embargo, aún no se han implementado en el diagnóstico mutacional rutinario (Takano et al., 2008; Zhang et al., 2009; Walsh et al., 2010; Hondow et al., 2011; De Leeneer et al., 2011; Walsh et al ., 2011 ). En particular, la aplicación de la plataforma de secuenciación masiva basada en pirosecuenciación cuenta con tres reportes de su uso en el estudio de BRCA1 y BRCA2 a gran escala: como metodologíadiagnóstica de mutaciones fundadoras en tejidos embebidos en parafina (Zhang et al., 2009 ), como diseño y validación de un modelo aplicable al diagnóstico (De Leeneer et al., 2011) y directamente aplicado al estudio mutacional de un grupo de pacientes en el Instituto Nacional de Cancerología, México (Vaca-‐Paniagua F et al, 2012). Es importante resaltar que este trabajo es el primero de su tipo en México y se realizó enteramente en el Instituto Nacional de Cancerología. La ventaja del uso de esta plataforma, sobre otras existentes, recae en la capacidad de lecturas de fragmentos grandes (hasta 400 pb), el estudio simultáneo de varios genes, menor tiempo de realización y costo, lo cuál lo vuelve accesible para un mayor número de pacientes en riesgo. Tan solo en el costo, la prueba completa, a nivel comercial en Estados Unidos tiene un valor de $3990 dólares (Myriad Genetics, 2011). Una muestra procesada por la tecnología de secuenciación masiva tiene un costo aproximado de $1500 dólares (Kesselheim et al., 2010; Walsh et al., 2010; Vaca-‐ Paniagua et al., 2012 ). En poblaciones donde se han identificado mutaciones fundadoras el diagnóstico molecular es sencillo y no implica costos elevados, ya que un número relativamente pequeño de mutaciones constituye la mayoría de las mutaciones a identificar. Un ejemplo es la población de judíos Ashkenazi, en donde el estudio de dos mutaciones en BRCA1 (185delAG y 5382insC) y una mutación en BRCA2 (6714delT), constituye el 90% de las mutaciones presentes en esta población (Phelan et al., 2002). Se ha reportado que en mujeres judías hasta el 12% de los tumores de mama y el 35% de los cáncer de ovario son debido a mutaciones fundadoras (Warner et al., 1999; Moslehi et al., 2000) En otras poblaciones también se han reportado mutaciones fundadoras, como en Islandia (Tulinius et al., 2002), Groelandia (Harboe et al., 2009), Chipre (Loizidou et al., 2007), Alemania (Verhoog et al., 2001), los franco-‐canadienses (Ghadirian et al., 2009), en las Bahamas (Donenberg et al., 2011) y países del este de Europa como Polonia (Górski et al., 2000), Rusia (Sokolenko et al., 2007), Belorusia (Uglanitsa et al., 2010) y los estados Bálticos (Elsakov et al., 2010; Tikhomrva et al., 2005) Existen poblaciones que debido a composición étnica heterogénea presentan mutaciones fundadoras en una pequeña proporción. Tal es el caso de Canadá, en donde se han identificado mutaciones fundadoras en 1% de las mujeres con cáncer de mama (Ghadirian et al., 2009). En poblaciones latinoamericanas, a pesar de la mezcla étnica presente, se han identificado mutaciones fundadoras en una baja frecuencia en Brasil (Gomes et al., 2007; Esteves et al., 2009), Colombia (Torres et al., 2007), Cuba (Rodríguez et al.,) y en familias hispanas residentes en Estados Unidos (Weitzel et al., 2005; Weitzel et al., 2007; Weitzel et al., 2013). En países donde existen mutaciones fundadoras se ha propuesto la búsqueda dirigida e intencionada de las mutaciones a todos los pacientes con cáncer de mama, independientemente de su historia personal ó familiar de cáncer como una estrategia integral de atención y prevención (Metcalfe et al., 2010) . Continuamente se producen reportes sobre mutaciones en BRCA1 y 2 fundadoras en poblaciones definidas; la importancia de estos reportes es caracterizar las mutaciones con mayor prevalencia en poblaciones de riesgo y emplearlas como pruebas genéticas dirigidas, con la subsecuente disminicón en el costo y en el tiempo en el que se producen los reslutados. La controversia persiste en los sujetos de las pruebas genéticas de los genes BRCA. En la literatura se refieren diversos parámetros clínicos a considerar, resaltando la historia familiar. Sin embargo, hasta el 50% de las/los pacientes con cáncer de mama por mutaciones heredadas en BRCA1 ó BRCA2, no cuentan con familiares cercanos (1er ó 2º grado) con antecedentes de cancer porque la mutación se heredo por rama paterna, la familia esta conformada por pocos integrantes, y por la posibilidad de que la mayoría de los integrantes de la familia no hayan heredado la mutación (King et al., 2003). La USPSTF (The United States Preventative Services Task Force) ha emitido guías clínicas que resultan amplias en su consideración de diversas características de las pacientes con síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario, así como de sus familias. Así, la USPSTF considera como pacientes de alto riesgo y candidatos a estudio molecular a aquellas mujeres que al no ser de origen judío Ashkenazi, tengan el antecedente de dos ó mas familiares de primer grado (padres, hermanos e hijos) con cáncer de mama, uno de los cuales por lo menos haya recibido el diagnóstico de cáncer de mama antes de los 50 años; ó el antecedente de 3 ó mas familiares, tanto de primer como de segundo grado, con cáncer de mama, independientemente de la edad; si existe el antecedente de un familiar ó mas afectados, en primer ó segundo grado, de cáncer de mama ó cancer de ovario; un familiar de primer grado con cáncer de mama bilateral; la combinación de 2 ó mas familiares de primer ó segundo gradocon cáncer de ovario, independientemente de la edad; un familiar de primer grado que haya padecido tanto cáncer de mama como de ovario, y la historia de cáncer de mama en cualquier familiar varón. El fenotipo tumoral triple negativo (ausencia de la expresión de receptores de estrógeno, progesterona y del receptor Her2Neu, a nivel tumoral -‐demostrado generalmente por inmunohistoquímica-‐), también es un criterio para considerar a pacientes de alto riesgo y susceptibles del estudio molecular, ya que se ha reportado una frecuencia de hasta 20% de mutaciones en BRCA1 en poblaciones caucásicas y hasta el 40% de mutaciones en población hispana (Breast Cancer Linkage Consortium, 1997; Foulkes et al., 2003; Atchley et al., 2008). De forma análoga y resaltando la importancia de incluir como candidatas a estudio molecular a las pacientes con fenotipo tumoral triple negativo, el 50% de las pacientes con mutaciones en BRCA1 presentan este fenotipo, por lo que también ha de considerarse como parte de los criterios clínicos para el perfil de alto riesgo (Lee et al., 2011). El diagnóstico molecular de mutaciones en BRCA1 y BRCA2 se ha convertido en parte integral de la práctica clínica en la atención a pacientes con historia familiar de cáncer de mama u ovario, dentro de los grandes centros oncológicos de los países desarrollados. Existen modelos empíricos para estimar el riesgo de cualquier mujer respecto al cáncer de mama. La historia familiar es el principal determinante de riesgo, aunque algunos modelos también incorporan factores de riesgo personales como la historia reproductiva. La mayoría de los modelos no han sido completamente validados y su utilidad en particular en población no caucásica, es particularmente incierta (Gail et al., 1989; Claus et al., 1994; Tyrer et al., 2004) La implicación de las mutaciones germinales en estado heterocigoto en BRCA1 y BRCA2 recae en los riesgos para el desarrollo de cáncer. El riesgo acumulado de desarrollar cáncer de mama en una mujer con mutación en BRCA1 a los 70 años varía del 65%-‐85%. Para BRCA2, se ubica dentro del 45% al 80%; para desarrollar cáncer de ovario es riesgo es de 39%-‐44% y 11%-‐27%, respectivamente (Risch et al., 2001) Adicionalmente, las mutaciones germinales en BRCA1/2 predisponen a otros tipos de cáncer como el carcinoma de trompas de Falopio; carcinoma seroso papilar del peritoneo (relacionados con mayor frecuencia a mutaciones en BRCA1); cáncer de mama en varones; cáncer de páncreas, próstata; vejiga, conductos biliares, estómago y melanoma , mas relacionados a mutaciones en BRCA2 (Thompson et al., 2001; Edwards et al., 2003). Tras la identificación de mutaciones en los genes BRCA, existen perspectivas de tratamiento, seguimiento y prevención para los portadores asintomáticos, con la finalidad de brindar una atención personalizada e integral. La elección de tratamiento implica la consideración de varios factores, como el riesgo de recurrencia, el desarrollo de cáncer de mama contralateral y el riesgo de cáncer de ovario. Los modelos preclínicos de los tumores de mama asociados a deficiencia de la función de BRCA1, sugieren la sensibilidad a agentes como la mitomicina C y el cisplatino (Michalak et al., 2011). Hasta el momento, los estudios clínicos parecen corroborarlo, aunque por el número limitado de pacientes, es necesario mayor evidencia para constituir una afirmación inequívoca (Rennert et al., 2007; Byrski et al., 2010; Silver et al., 2010). Los portadores de mutaciones en BRCA2 parecen no diferir en la respuesta clínica a tratamientos convencionales, respecto a pacientes sin mutaciones (Arun et al., 2010). El Proyecto del Genoma del Cáncer ha permitido conocer los estudios de genómica integrada en cáncer de mama, que sustentan las bases biológicas para encontrar el fenotipo tumoral triple negativo con características que lo asemejan mas al cáncer de ovario, que a cualquier subtipo mamario (Burgess et al., 2014). Es así, que el tratamiento con cisplatino ha proporcionado un oportunidad única de terapia tumor-‐específica. Dentro de las mutaciones “driver” –esenciales para la promoción de el proceso oncogénico-‐ en los tumores mamarios triples negativos y los tumores ováricos ,se encuentran las mutaciones en los genes BRCA1 y BRCA2. Es importante remarcar que a nivel somático (tumoral) se pueden encontrar, sin que necesariamente representen lo que ocurre a nivel germinal. Por tanto, el tratamiento con platinos y terapias sistémicas específicas con los inhibidores de PARP1 se consideran una posibilidad tanto en pacientes con cáncer de mama/ovario hereditario como en pacientes con cáncer de mama y ovario esporádico, en cuyos tumores se evidencien la presencia de mutaciones. Los taxanos (paclitaxel y docetaxel) se utilizan de forma rutinaria en el tratamiento de pacientes con cáncer de mama, como aquellas con enfermedad metastásica, al inhibir la proliferación celular en la fase S estabilizando a los microtúbulos e induciendo apoptosis. Estudios in vitro han demostrado que los tumores con células deficientes en BRCA, son resistentes al tratamiento con taxanos. Lo anterior se ha refrendadocon estudios clínicos donde pacientes con mutaciones en BRCA1 de forma germinal, tienen menor propabilidad de responder al tratamiento neo-‐adyuvante con docetaxel, cuando se comparan con mujeres no portadoras (Chalasani et al, 2013). Los agentes citotóxicos basados en complejos coordinados de platino (cisplatino y carboplatino), son conocidos como una línea de quimioterapia efectiva en cáncer de ovario, en particular en pacientes con mutaciones en BRCA1 y BRCA2. Con el panorama genómico integral en cáncer de mama, en donde los tumores se clasifican en subtipos de acuerdo a distintos fenotipos moleculares delineados por plataformas genómicas, proteómicas y de expresión (Cancer Genome Atlas Network, 2012), la perspectiva de su uso en pacientes con cáncer de mama triple negativo, portadoras ó no de mutaciones germinales en BRCA, se vislumbra como una opción factible. Sin embargo, los resultados de estudios clínicos tomarán tiempo en confirmar ó no esta opción, de forma sólida. Los primeros estudios clínicos donde se evalúa el uso de cisplatino y carboplatino como adyuvante en el tratamiento de cáncer de mama asociado a BRCA, han resultado en tasas altas de respuesta, abriendo un espacio esperanzador para mayores estudios, en búsqueda de evidencia consistente (Narod, 2010). Los alquilantes bifuncionales como las mostazas nitrogenadas, como la ciclofosfamida e ifosfamida, y nitrosoureas constituyen un modelo in vitro de opción en el tratamiento en aquellas pacientes con tumores resistentes a los platinos. Existen reportes de su uso a nivel clínico en pacientes con cáncer de mama metastásico, portadoras de mutaciones en los genes BRCA (Holland et al, 1996; Mulligan et al, 2014), y en comparación con otros agentes como cisplatino e inhibidores de PARP (Vollebergh et al 2014). En los últimos diez años, un nuevo grupo de fármacos denominados inhibidores de la polimersa ADP-‐ribosa (PARP1) demostraron ser efectivos contra células tumorales deficientes en BRCA1 y BRCA2, tanto en modelos preclínicos como en estudios fase II (McCabe et al., 2006; Farmer et al., 2005). La polimerasa PARP1 esta involucrada en la reparación de rupturas de una cadena del DNA; la inhibición de la enzima resulta en una falla a la reparación de daños al DNA, lo que conlleva a la muerte celular en aquellas células deficientes BRCA1 o BRCA2. Los inhibidores de PARP1 han evidenciado su utilidad en cáncer de mama hereditario metastásico (Fong et al., 2009; Tutt et al. 2010) y se ha traspolado su posible utilidad al cáncer de mama y cáncer de ovario esporádico. Sin embargo, se espera que la repercusión de su uso se pueda potenciar en combinación con esquemas de quimioterapia, como los basados en platinos (Sun et al, 2013; Jonhson et al., 2013). Tabla 2. Ensayos Clínicos con Inhibidores de PARP en pacientes con Cáncer de Mama asociado a mutaciones en los genes BRCA Inhibidor de PARP Agentes en combinación Fase Clínica Referencias Olaparib Caboplatino Como monoterapia: En fase II, completa. En combinación con carboplatino: fase I y II, activo y en reclutamiento. Ratner et al., 2012 Marchetti et al., 2012 Leamon et al., 2013 Smith et al., 2014 Veliparib Temozolamida Ciclofosfamida En combinación con temozolamida: fase I, completa. En combinación con temozolamida: fase II, activa y sin reclutamiento. En combinación con ciclofosfamida: fase II, activa y sin reclutamiento. Burstein, 2011. Chen , 2011. Murai et al., 2014 Rucaparib Cisplatino Como monoterapia: Fase II, en reclutamiento. En combinación con cisplatino: Fase II, en reclutamiento. Ratner et al., 2012 Murai et al., 2014. BMN 673 No Fase I, en reclutamiento. Shen et al., 2013 El seguimiento para cáncer de mama en portadoras de mutaciones en BRCA1 y BRCA2 idealmente incluye el examen anual mamario mediante resonancia magnética, que ha demostrado tener mas sensibilidad diagnóstica que la mastografía (Kriege et al., 2004; Leach et al., 2005). A pesar de la amplia distribución de la utilización de la mastografía, no existe evidencia de que su uso rutinario reduzca la mortalidad en portadoras de mutaciones de BRCA1/BRCA2. La mayor parte de cáncer hereditario de mama ocurren en mujeres pre-‐menopausicas donde la reducción de riesgo de muerte con el seguimiento de mastografía es de solo 15% en mujeres entre los 40 a 49 años. Además, las portadores de mutaciones en los genes BRCA, son mas sensibles a la radiación ionizante, por lo que es importante racionalizar el uso de técnicas diagnósticas que la apliquen. De tal forma que el uso de la Imagen por Resonancia Magnética (IRM) de mama se ha convertido en la estrategia de imagen más sensible para un diagnóstico temprano en este grupo de pacientes, al evitar paralelamente, la radiación ionizante. Las desventajas de su uso recaen en su alto costo y su escasa disponibilidad en nuestro medio. La sensibilidad de la detección oscila entre el 60 al 100%, con lesiones inclusive menores a 5 mm, lo anterior dependiente también de la experiencia del radiólogo que interpreta. El inicio del seguimiento en personas asintomáticasen riesgo se recomienda a partir de los 20 años, si bien es importante considerar las edades de inicio ó al diagnóstico de los familiares con cáncer (Robson et al., 2007). Otros seguimientos para otros órganos no se realizan de manera sistematica a menos que la historia familiar así lo sugiera (por ejemplo, múltiples casos en la familia de cáncer de colón ameritaría colonoscopia periódica en el seguimiento) a excepción del ultrasonido transvaginal de ovario; el marcador tumoral Ca125 no tiene valor como medida predictiva en este grupo de pacientes (Narod et al., 2011). En el ámbito de la prevención, las medidas de intervención se dividen en aquellas que ofrecen protección transitoria y las que ofrecen protección a largo plazo. La mastectomía reductora de riesgo es una intervención que en un solo momento ofrece una reducción del riesgo de cáncer de mama, al riesgo equiparable a la población general (Vogel et al., 2010). En los últimos años se ha incentivado el uso del término mastectomía reductora de riesgo en lugar de mastectomía profiláctica, ya que en portadoras sanas de mutaciones de BRCA1/BRCA2 se ha demostrado que el riesgo para presentar cáncer de mama disminuye un 87%. Mientras, en quienes son portadoras y ya han padecido cáncer, la disminución del riesgo oscilar entre 96-‐97%. Por tanto, si bien no es una medida preventiva ó profiláctica en el sentido estricto de la palabra, es una medida avalada por la medicina basada en la evidencia en cuanto a reducción de riesgo. De acuerdo al Instituto Nacional del Cáncer de Estados Unidos (Tabla 3. ), la indicación con mayor solidez para la mastectomía reductora de riesgo, la constituyen aquellas pacientes de alto riesgo para cáncer de mama, con mutaciones en genes de alta susceptibilidad confirmadas, encabezadas por BRCA1/BRCA2 . Tabla 3. Indicaciones para Mastectomía Reductora de Riesgo (INC, 2013) 1. Pacientes con mutación deletérea en los genes BRCA1 ó BRCA2 2. Pacientes consideradas de alto riesgo para cáncer hereditario de mama (historia familiar) 3. Pacientes con carcinoma lobulillar in situ (LCIS) e historia familiar de cáncer de mama 4. Pacientes con carcinoma lobulillar in situ (LCIS) e historia familiar de cáncer de mama La remoción de tejido mamario con fines de reducción de riesgo, implica a nivel de técnica quirúrgica, la prioridad de constituir una medida efectiva a la par de contar con la perspectiva de una reconstrucción inmediata ó tardía. Así mismo, ha de contemplarse distintos escenarios, como la mastectomía bilateral en una mujer sana, intervención que puede incluir ó no la preservación del pezón; la revisión detallada a nivel histopatológico para descartar la presencia microscópica de neoplasia y la posibilidad de una reconstrucción con implantes ó tejido autólogo . Otro posible escenario, la mastectomía contralateral, ha suscitado una serie de opiniones controversiales, ya que en gran número de ocasiones esta se realiza en una mujer diagnosticada recientemente con cáncer y en quién se ofrece como unmedida simultánea a la cirugía terapéutica, Sin embargo, en gran parte de las ocasiones se carece de la evidencia suficiente para confirmar que la paciente se considera de alto riesgo para padecer cáncer (carencia de estudios moleculares ó consejo genético). A pesar de que se considera la medida más efectiva en reducción de riesgo, tiene una tasa de aceptación que oscila entre el 40% en mujeres estadounidenses a cercana al 6% en algunas comunidades europeas. Lo anterior refleja la complejidad en la decisión hacia esta opción, en la cual influyen factores como la edad al diagnóstico, la historia familiar, el antecedente de cáncer, el transfondo cultural, entre otros . Por tanto, el abordaje multidisciplinario es el punto medular de la atención a las pacientes con indicación quirúrgica de reducción de riesgo. Cuando una mujer portadora pre-‐menopaúsica no contempla esta opción, la quimioprevención puede ser considerada. El tamoxifeno es el fármaco aprobado como quimioprofiláctico (Goss et al., 2011). Los datos proporcionados por distintos estudios clínicos con el uso de moduladores de los receptores de estrógeno (MRE) y los inhibidores de aromatasa (IA), han demostrado su efecto en la reducción de la incidencia de cáncer de mama en mujeres consideradas de alto riesgo. Dentro del grupo de los MRE, el tamoxifeno y raloxifeno han demostrado una disminución del riesgo en 50%. En tanto, estudios recientes con el uso de exemestano (AI) en mujeres postmenopáusicas, resultan prometedores en la tasa de prevención y en la seguridad de su uso . En el 2009, la Sociedad Americana de Oncología Clínica (ASCO) publico guías relacionadas a la quimioprevención. En ellas se señala que las mujeres posmenopáusicas de alto riesgo, pueden tomar tamoxifeno al menos 5 años para reducir el riesgo de cáncer de mama hormonosensible, al menos por 10 años. El tamoxifeno es preferido en mujeres premenopaúsicas así como mujeres postmenopáusicas con histerectomía. En tanto, el raloxifeno se prefiere en mujeres postmenopáusicas que preservan el útero y en aquellas con riesgo deosteoporosis. Debido al riesgo de cáncer uterino (riesgo absoluto de 0.37% vs 0.15% del uso de placebo), dentro del seguimiento a las mujeres que usan tamoxifeno se incluye una revisión ginecológica periódico. No se recomienda la realización de biopsias endometriales rutinarias, en ausencia de sangrado transvaginal . Los MRE están contraindicados en mujeres con historia de trombosis venosa profunda, tromboembolia pulmonar y eventos vasculares isquémicos . Otros potenciales agentes de quimioprevención incluye los inhibidores de PARP1, involucrado en los mecanismos de reparación al daño celular (Hay et al., 2009) y el inhibidor de RANKL, denusomab, el cuál es esencial en la regulación de la señalización por progesterona en las células mamarias (Body et al., 2006; Schramek et al., 2010), aunque los eventos adversos relacionados a su uso así como su utilidad se mantienen en investigación. La oforectomía se asocia tanto a la reducción de cáncer de ovario como el de mama (Eisen et al., 2005; Finch et al., 2006; Rebbeck et al., 2009). Las pacientes con mutaciones en BRCA1/BRCA2 se encuentran con un riesgo entre el 20 al 40% para padecer cáncer de ovario a lo largo de la vida. El riesgo es extensivo para las tubas uterinas y carcinomatosis peritoneal. La salpingo-‐ooforectomía es una medida efectiva simultánea para la reducción del riesgo tanto de cáncer de ovario, como de cáncer de mama en mujeres pre menopaúsicas. Se considera la medida que ha documentado un impacto real en el aumento en la sobrevida de las pacientes portadoras, con una reducción de riesgo de cáncer del 65% aproximadamente. Sin embargo, algunas mujeres no la aceptan por el deseo de fertilidad ó por lo efectos de una menopausia anticipada (Madalinska et al., 2006; Finch et al., 2011). Las medidas citadas resultan de particular relevancia en el contexto de los portadores asintomáticos de mutaciones en BRCA1 y BRCA2. Los familiares en riesgo para ser portadores de una mutación germinal en un gen de alta susceptibilidad para cáncer de mama se determinan mediante el análisis de la genealogía. En primera instancia se encuentran los familiares de primer grado de un portador con mutación ya identificada: sus padres, hermanos e hijos. El estudio a los padres permite a su vez, la identificación de la rama familiar afectada y la extensión a los familiares que en ella se encuentren. Los beneficios de realizar un diagnóstico en portadores asintomáticos se resumen en la Tabla 4. Tabla 4. Implicaciones del Diagnóstico Predictivo ó Presintomático en el Cáncer de mama Hereditario I. Perspectiva de opciones diversas de vigilancia y seguimiento para cáncer de mama, así como elección de edad de inicio óptima, de acuerdo a riesgo. II. Opciones de medidas de reducción de riesgo individualizadas (por ejemplo considerar salpingo-‐oforectomía después de cumplir paridad satisfecha) . III. Opción de consejo genético de riesgo de tipo de cáncer, de acuerdo al gen mutado y la historia familiar. IV. Ofrecer un tratamiento guiado en el riesgo para padecer cáncer (por ejemplo, evitar métodos diagnósticos/tratamientos basados en radiación, en individuos con mutación en TP53). V. Identificar a otros familiares en riesgo VI. Si existiera, proveer un tratamiento blanco, de acuerdo a la mutación de que se es portador (por ejemplo, inhibidores de PARP en pacientes con mutaciones en BRCA1/BRCA2). VII. Posibilidad de diagnóstico preimplantación ó prenatal. Un aspecto sobresaliente en el manejo de los portadores asintomáticos y el consejo genético es la consultoría psicológica ya que la integración multidisciplinaria es parte del entorno óptimo de soporte para las decisiones de los pacientes . En conclusión, las medidas de prevención que mayor impacto generan a los portadores asintomáticos son las cirugías reductoras de riesgo; un ejemplo claro es la mastectomía en este contexto, que reduce el riesgo de cáncer de mama en un 90% (Hartmann et al., 1999) Mas allá de las medidas descritas para el seguimiento, tratamiento y pronóstico de pacientes con mutaciones en BRCA, resalta la importancia del manejo multidisciplinario y coordinado del equipo que ha de tratarles. El conocimiento de la mayor parte de los aspectos implicados en la enfermedad resulta en una atención integral y en programas de salud encaminados a la misma. OBJETIVOS OBJETIVO GENERAL Identificar mutaciones germinales puntuales en los genes BRCA1 y BRCA2 en pacientes mexicanos con síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario, mediante secuenciación masiva en paralelo (pirosecuenciación). OBJETIVOS PARTICULARES • Extender el análisis molecular dirigido a los familiares en riesgo (de acuerdo a árbol genealógico) de los pacientes en quienes se identifiquen mutaciones germinales en BRCA1 ó BRCA2, para brindar un diagnóstico molecular presintomático. • Otorgar consejo genético tanto a los pacientes con mutaciones identificadas, como a los familiares en riesgo. • Calcular una frecuencia relativa de las mutaciones germinales en BRCA1 y BRCA2 en pacientes mexicanos con síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario que son atendidos en el Instituto Nacional deCancerología en el período comprendido del 1º de enero del 2012 al 31 de diciembre del 2013. • Describir las principales características clínicas de las y los pacientes en quienes se identifiquen mutaciones en BRCA1 y BRCA2. ANTECEDENTES En México, el estudio molecular de los genes BRCA1 y BRCA2 se ha dado de forma limitada. Se desconoce la frecuencia de mutaciones tanto en población general sin cáncer, como en población con los principales tipos de tumores relacionados (mama y ovario). De igual forma, se desconoce la prevalencia en pacientes con diagnóstico clínico de síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario. Por lo anterior, no ha sido posible establecer la existencia de mutaciones representativas de la población, como en otras poblaciones de importante heterogeneidad étnica, como Canadá (Ghadirian et al., 2009). En poblaciones latinoamericanas, a pesar de la mezcla étnica presente, se han identificado mutaciones fundadoras en una baja frecuencia en Brasil (Gomes et al., 2007; Esteves et al., 2009), Colombia (Torres et al., 2007), Cuba (Rodríguez et al.,) y en familias hispanas residentes en Estados Unidos (Weitzel et al., 2005; Weitzel et al., 2007; Weitzel et al., 2013). Lo anterior tiene como finalidad, el hacer de mayor accesibilidad el abordaje molecular a lo largo del territorio mexicano, compuesto por mas de 100 millones de habitantes y con importante centralización de los servicios de salud de alta especialidad. Dentro de los estudios reportados en México se encuentran el de Calderón-‐ Garcidueñas y cols., que en el 2005 publicaron el análisis de BRCA1 y BRCA2 realizado a 22 pacientes con cáncer de mama de inicio temprano (menores a 35 años) que fueron diagnosticadas consecutivamente en un período de un año en un hospital público del norte del país; reportaron una frecuencia mutacional del 9% para mutaciones deletéreas y del 18% para variantes de significado clínico incierto. En el 2009, Vidal y cols., estudiaron a 40 pacientes que acudieron al Instituto Nacional de Cancerología, 29 de ellos con síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario y 11 con cáncer de mama de inicio temprano (menores de 40 años). La frecuencia de mutaciones patogénicas que reportaron fue del 5%. En ambos reportes se ha resaltado la importancia de conocer la prevalencia de cáncer de mama y ovario atribuible a mutaciones en BRCA1 y 2 en la población mexicana (Calderón-‐Garcidueñas et al., 2005; Vidal et al., 2009). En el 2012 y como antecedente directo al presente trabajo de tesis, se publico el estudio molecular realizado en 39 pacientes con diagnóstico clínico de síndrome de cáncer de mama-‐ovario hereditario (Vaca Paniagua et al., 2012), implementando una estrategia de secuenciación masiva en paralelo mediante una plataforma de pirosecuenciación. En una primera fase, se realizó una validación de la metodología con la identificación de mutaciones ya conocidas, de forma ciega. Posteriormente, se analizaron los estudios METODOLOGÍA Cálculo del tamaño de la muestra para el estudio El cálculo del tamaño de la muestra se realizó en base a los datos estadísticos y epidemiológicos del cáncer de mama en México y la proporción reportada en la literatura de cáncer de mama atribuible directamente a mutaciones en BRCA1 y BRCA2 Se aplicó la siguiente fórmula: n= z2 – α/2 x P(1-‐ P) d2 Donde: n= tamaño de la muestra z2 – α/2 = Nivel de confianza (Del 100%; valor estándar 2.0) P= proporción, del rasgo, estimada en la población afectada d2= margen de error (del 1%, valor estandar 0.01) Se sustituyó la fórmula tomando en cuenta la prevalencia de cáncer de mama reportada (DGS, 2009) y la proporción reportada en la literatura de cáncer de mama de etiología hereditaria, 10% (Ellsworth., 2010), con intervalo de confianza al 99%. Además, el valor obtenido se corregió tomando en cuenta las posibles pérdidas (por ejemplo, pacientes que deciden no seguir en el estudio, entre otras) El tamaño muestral obtenido fue de 360 pacientes (n= 360). Al ajustarse, considerando que las mutaciones en BRCA1 y BRCA2 no representan el total del 10% del cáncer de mama hereditario, Para el cálculo de tamaño de muestra se asumió una frecuencia de síndrome de cáncer de mama y ovario hereditario atribuible a mutaciones en BRCA1 y BRCA2 del 3%, de acuerdo a estimaciones recientes (Narod et al., 2011; Ellsworth et al., 2010). Por lo tanto, de las mujeres con cáncer de mama hereditario que constituyen el universo de trabajo, el 30% tendrían síndrome de cáncer de mama-‐ovario por mutaciones en BRCA1 y BCRA2. Fue de sumo interés que la cifra sea precisa para que el tamaño de muestra sea suficiente para detectar una diferencia del 10%, es decir que la proporción de casos por mutaciones en los genes BRCA no será superior al
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