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1 FACULTAD DE MEDICINA DIVISIÓN DE ESTUDIOS DE POSGRADO INSTITUTO DE OFTALMOLOGÍA FUNDACIÓN CONDE DE VALENCIANA TESIS DE POSGRADO Para obtener el título de especialidad en OFTALMOLOGÍA Presenta Rodrigo Matsui Serrano Directores de Tesis Dr. Juan Carlos Zenteno Ruiz M. en. Biol. Exp. Beatriz Buentello Volante México D.F. 2011 UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO DETECCIÓN DE REGIONES GENÓMICAS CANDIDATAS POR MAPEO DE HOMOCIGOCIDAD EN FAMILIAS CON ENFERMEDAD DE BARDET-BIEDL UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. 2 Dr. Enrique Graue Wiechers Profesor de curso Dr. Juan Carlos Zenteno Ruiz Director de tesis Dr. José Luis Rodríguez Loaiza Jefe de enseñanza 3 ÍNDICE I. INTRODUCCIÓN……………………………………………………….…...5 Retinosis pigmentaria………..……...……………………………...5 Síndrome de Bardet-Biedl………………………...………………..7 II. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA………..….………………..…….20 III. JUSTIFICACIÓN…………………………………..…………………..…..21 IV. OBJETIVOS………………………………………….……………….……22 V. DISEÑO DEL ESTUDIO………………………………..………….……..23 VI. MATERIAL Y MÉTODOS………………………………………………...23 Criterios de inclusión……………………………………...………23 Criterios de exclusión………………………………………….….23 Criterios de eliminación…………………………………………..24 Tamaño de la muestra………………………………………...…24 Metodología……………………………………………………….24 VII. ÉTICA……………………….……………………………………………..28 VIII. RESULTADOS………………………………………………………..….29 Descripción de los pacientes……………………………………29 Análisis de homocigocidad……………………………………...46 IX. DISCUSIÓN………………………………………………………………50 X. CONCLUSIONES…………………………………………………….….54 XI. REFERENCIAS…………………………………………………….……55 4 I INTRODUCCIÓN RETINOSIS PIGMENTARIA El término retinosis pigmentaria engloba una diversidad de enfermedades hereditarias que afectan a los fotorreceptores (conos y bastones) y al epitelio pigmentario de la retina de forma difusa a través de todo el polo posterior lo cual origina una pérdida progresiva de la visión 1 Se estima que la prevalencia de este grupo de enfermedades es de aproximadamente 1/3500 nacidos vivos. 2 La forma de manifestación más común de la retinitis pigmentosa es la distrofia bastón-cono en la cual el síntoma primordial es la ceguera nocturna (nictalopía) seguida de una pérdida progresiva en la visión periférica y eventualmente el desarrollo de ceguera después de varios años. En otras ocasiones la forma de manifestación de la retinitis pigmentosa es como distrofia cono-bastón en la cual predomina la disminución de la agudeza visual sobre la pérdida de campo visual periférico. 3 5 Otra forma de clasificar a la retinosis pigmentaria es de acuerdo a la forma de herencia: autosómica dominante, autosómica recesiva, ligada a X o mitocondrial. Los casos en los que no se encuentra historia familiar se pueden englobar como aislados, esporádicos o simples. 2 Hasta el día de hoy se han identificado 45 genes causantes de retinosis pigmentaria con los distintos tipos de herencia mencionados anteriormente.4 Sin embargo, se ha estimado que el 50% de todos los casos de retinosis pigmentaria se deben a mutaciones en genes aún desconocidos, por lo que el estudio de sujetos con la enfermedad continúa siendo fundamental para identificar nuevos factores genéticos en la enfermedad. De estos 45 genes implicados 15 corresponden a la forma autosómica dominantes, 24 a formas autosómicas recesivas y 5 son genes ligados al cromosoma X. 3 Aunque la función de las proteínas codificadas por estos 45 genes es sorprendentemente variada, el mecanismo común de este grupo de enfermedades está dado por la muerte celular de los fotorreceptores retinianos. 5 Los hallazgos clínicos típicos son la presencia de ceguera nocturna progresiva, alteraciones en la respuesta de los fotorreceptores medidas con electrorretinograma y electroculograma, disminución en el campo visual y una pérdida de visión central importante. Los hallazgos oculares que frecuentemente se presentan son depósitos de pigmento difusos en la retina, la atenuación vascular retiniana y la palidez del nervio óptico. 6 6 El diagnóstico clínico se basa en la presencia de ceguera nocturna y en la pérdida del campo visual periférico acompañado de las lesiones pigmentadas en periferia. Estos datos se confirman con estudios de electrorretinograma los cuales presentan trazos de voltaje disminuidos que a su vez muestran datos de progresión con el tiempo. Las complicaciones a largo plazo comprenden el desarrollo de catarata subcapsular posterior y edema macular cistoideo 3 Existen formas sindrómicas sistémicas que además de presentar retinosis pigmentaria se acompañan de otras manifestaciones sistémicas. Un ejemplo de esto es el síndrome de Bardet-Biedl. SÍNDROME DE BARDET-BIEDL El síndrome de Bardet-Biedl es una enfermedad autosómica recesiva con penetrancia variable cuyas manifestaciones clínicas más comunes son la ceguera a edades tempranas secundaria a una degeneración pigmentaria retiniana y diversas alteraciones sistémicas entre las que se incluyen obesidad, polidactlia, discapacidad intelectual e hipogonadismo. HISTORIA En 1920 Georges Bardet describió un paciente con retinosis pigmentaria, polidactilia y obesidad congénita. Más tarde Arthur Biedl, en 1922, añadió dos características más al cuadro clínico: retraso mental e hipogonadismo, a esta entidad se le conoció como enfermedad de Bardet-Biedl. Éste no debe confundirse con el Síndrome Lawrence-Moon, descrito en 1866, que se caracteriza por 7 presentar además paraplegia, pero sin polidactilia ni obesidad; En 1970, Amman los separa ylos reconoce como dos síndromes distintos. INCIDENCIA La prevalencia reportada para esta enfermedad en algunas poblaciones Europeas y de Norteamérica van de 1:140,000 a 1:160,000 nacimientos. 7 HETEROGENEIDAD DE LOCUS El síndrome de Bardet-Biedl es una enfermedad con heterogeneidad de locus ya que se ha reconocido a la fecha que mutaciones en alguno de 15 genes distintos pueden originar la enfermedad. A estos genes se les conoce con la nomenclatura de BBS1 a BBS15. Esto indica que existe una considerable variabilidad intrafamiliar e interfamiliar en el fenotipo de la enfermedad. 8 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 1 es causado por la mutación del gen BBS1 localizado en el cromosoma 11q13 el cual codifica para la proteína del mismo nombre cuya función es la promoción de la ciliogénesis al formar un complejo proteico con otras 6 proteínas con función similar.13 Esta proteína se expresa de forma ubicua en el organismo incluyendo los tejidos fetales, testículos, el tejido adiposo y la retina. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 2 se origina por una mutación del gen BBS2 el cual codifica para la proteína del mismo nombre. Este complejo 8 conocido como complejo Bb se une a los satélites centriolares no membranosos en el citoplasma.BBS2 tiene una amplia expresión en diversos tejidos tales como sistema nervioso central, riñón, glándula adrenal y tiroides y se localiza en el cromosoma 16q21, este gen contiene 17 exones15. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 3 se origina por una mutación en el gen del factor de ADP de ribosilación tipo 6 (ARL6) localizado en el cromosoma 3p13-p12 que codifica para la proteína del mismo nombre. Esta proteína interviene en la regulación del transporte intracelular. La proteína ARL6 se une a un complejo proteico de la membrana ciliar el cual contiene 7 proteínas BBS y BBIP10. Una falla de expresión de ARL6 bloquea la adecuada localización de este complejo proteico a nivel de la membrana ciliar. 16 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 4 es causado por la mutación en el gen BBS4 localizado en el cromosoma 15q22 el cual codifica para la proteína del mismo nombre. Se ha demostrado la similitud entre la proteína BBS4 y la N-acetilglucosamina-O-transferasa, esta proteína interviene en el desarrollo de resistencia a la insulina en seres humanos y se ha identificado como una de las causas de obesidad en pacientes con síndrome de Bardet- Biedl. 17 BBS4 se localiza en los satélites centriolares a nivel de los centrosomas y en los cuerpos basales del cilio primario donde funciona como un adaptador de p150 la cual es una subunidad de la maquinaria de transporte de dineína. La función de este complejo es la recrutación de la 9 proteína pericentriolar material tipo 1 (PCM1) a los centrosomas. Una falla en BBS4 induce una mala localización de PCM1 y con ello una pérdida de enlaces de los microtúbulos centrosomales con la consecuente falla en la división celular y muerte celular por apoptosis. 18 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 5 se origina por una mutación del gen BBS5 localizado en el cromosoma 2q31 el cual codifica para la proteína del mismo nombre. BBS5 forma parte de un complejo proteico que interviene en la ciliogénesis. 9 Esta proteína forma un complejo con otras 6 proteínas (BBS1 BBS2, BBS4, BBS7, BBS8 y BBS9) y PCM1. Este complejo conocido como complejo Bb se une a los satélites centriolares no membranosos en el citoplasma. BBS9 es la molécula organizadora del complejo. BBS5 interviene en los enlaces fosfolipídicos, predominantemente fosfatidilinositol 3-fosfato y BBS1 regula la interacción con RAB8. La proteína RAB8 promueve el crecimiento de la membrana ciliar al fusionar las vesículas exocíticas con la base de la membrana ciliar. Las proteínas BBS intervienen en el transporte membranoso de los cilios primarios.13 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 6 se origina por una mutación en el gen MKKS localizado en el cromosoma 20p12 y que también está mutada en enfermedad relacionada y conocida como síndrome de McKusick- Kaufman. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 7 se origina por una mutación del gen BBS7 localizado en el cromosoma 4q27. Este gen codifica para la proteína 10 del mismo nombre la cual interviene en la promoción de la ciliogénesis. 9 Esta proteína forma un complejo con otras 6 proteínas (BBS1 BBS2, BBS4, BBS5, BBS8 y BBS9) y PCM1. Este complejo conocido como complejo Bb se une a los satélites centriolares no membranosos en el citoplasma celular. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 8 se origina por una mutación en el gen de proteína de repetición tetratricopéptida (TTC8) localizado en el cromosoma 14q31.2. TTC8 se colocaliza con gama-tubulina, BBS4 y PCM1 en el centrosoma.12 PCM1 interviene en la replicación centriolar durante la ciliogénesis. Por medio de técnicas de inmunoprecipitación se ha identificado que TTC8 se une a PCM1 y se ha demostrado la presencia de TTC8 en las células epiteliales bronquiolares y el cilio conector de la retina. 19Se han identificado mutaciones en el exón 2A de TTC8 relacionado con la presencia de retinitis pigmentosa sin manifestaciones sistémicas de síndrome de Bardet-Biedl. 19 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 9 se origina por una mutación en el gen respondedor a hormona paratiroidea B1 localizado en el cromosoma 7p14 la cual codifica para la proteína BBS9.13 Esta proteína forma un complejo con otras 6 proteínas (BBS1, BBS2, BBS4, BBS7, BBS8 y BBS5) y PCM1. Este complejo conocido como complejo Bb se une a los satélites centriolares no membranosos en el citoplasma celular. BBS9 es la molécula organizadora del complejo. BBS5 interviene en los enlaces fosfolipídicos, predominantemente fosfatidilinositol 3-fosfato y BBS1 regula la interacción con RAB8. La proteína RAB8 promueve el crecimiento de la membrana ciliar 11 al fusionar las vesículas exocíticas con la base de la membrana ciliar. Las proteínas BBS intervienen en el transporte membranoso de los cilios primarios.13 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 10 se origina por una mutación en el gen C12ORF58 localizado en el cromosoma 12q21.2. Este gen codifica para una proteína de 723 aminoácidos perteneciente a una subfamilia de chaperoninas20. Esta proteína se localiza en el cuerpo basal ciliar de los adipocitos. Una falta de esta proteína reduce la cantidad de células ciliadas y secundariamente produce un aumento de la proteína GSK3 cuya función primaria es la promoción de la adipogénesis. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 11 se origina por una mutación en el gen TRIM-32 localizado en el cromosoma 9q33.1. Este gen se expresa ampliamente en el organismo como una ligasa de ubiquitina en la línea Z del músculo esquelético. TRIM32 es un regulador de la ubiquitinización para la proteína disbindina. Una falta de expresión de TRIM32 tiene como consecuencia un aumento en los niveles de disbindina a nivel del músculo esquelético. 22 El síndrome de Bardet-Bield tipo 12 se origina por una mutación en el gen C4ORF24 localizado en el cromosoma 4q27. Este gen codifica para una proteína de 710 aminoácidos perteneciente a una subfamilia de chaperoninas20 también conformada por BBS6 y BBS10. BBS12 se localiza en el cuerpo basal ciliar de los adipocitos. Una falta de esta proteína reduce 12 la cantidad de células ciliadas y secundariamente produce un aumento de la proteína GSK3 cuya función primaria es la promoción de la adipogénesis. 20 El síndrome de Bardet-Biedl tipo 13 se origina por una mutación en el gen MKS1 localizado en el cromosoma 17q22. La proteína MKS1 pertenece a una familia de proteinas de contenido de dominio B9 que también incluye a las proteínas B9D1 y B9D2. Estas 3 proteínas se encuentran localizadas en los cuerpos basales y cilios primarios. La proteína MKS1 y MKS3 funcionan como mediadoras de la migración centriolar a la membrana apical y con ello la formación del cilio primario. Se ha establecido la función de estas proteínas en la ciliogénesis y la tubulogénesis renal.23 Las alteraciones en estos genes se han asociado a los síndromes de Meckel y Bardet-Biedl tipo 13. El síndrome de Bardet-Biedl tipo 14 se origina por una mutación en el gen CEP290 el cual codifica para nefrocistina-6 localizado en el cromosoma 12q21.32. Una falta de esta proteína suprime la ciliogénesis en el epitelio pigmentario retiniano e interfiere con la unión entre RAB8A GTPasa y los centrosomas del cilio.24 El síndrome de Bardet-Biedl tipo15 se origina por una mutación en el gen C2ORF86 localizado en el cromosoma 2p15. Este gen codifica para una proteína citoplasmática con dominio tipo WD40 “Fritz” que controla la polaridad planar celular. Esta proteína interviene en la ciliogénesis y el movimiento colectivo celular. 25 13 En la tabla 1 se presentan los genes y su localización en la enfermedad de Bardet-Biedl. TABLA 1. Relación fenotípica-genotípica de Enfermedad de Bardet-Biedl y su localización GEN FENOTIPO LOCALIZACIÓN BBS1 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 1 11q13 BBS2 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 2 16q21 ARL6 Síndrome de Bardet- Biedl tipo3 3q11.2 ARL6 Síndrome de Bardet Biedl 1, modificador 3q11.2 BBS4 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 4 15q22.3-q23 BBS5 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 5 2q31.1 MKKS2 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 6 20p12 BBS7 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 7 4q27 TTC8 Síndrome de Bardet- Biedl 8 14q31.2 PTHB1 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 9 7p14 BBS10 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 10 12q21.2 TRIM32 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 11 9q33.1 BBS12 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 12 4q27 MKS1 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 13 17q22 CEP290 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 14 12q21.32 TMEM67 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 14, modificador 8q22.1 C2ORF86 Síndrome de Bardet- Biedl tipo 15 2p15 14 El análisis de mutaciones en los 15 genes asociados al síndrome de Bardet-Biedl han permitido identificar sólo mutaciones en el 70% de las familias, lo que indica que existen genes relacionados a esta enfermedad pendientes por identificar.8 PATOGENIA Las proteínas codificadas por BBS1, BBS2, BBS4, BBS5, BBS7, BBS8, BBS9 y BBS10 forman parte de un complejo proteico que se encuentran primordialmente en los cilios primarios, el cuerpo basal de los cilios primarios y la región pericentriolar. Esto sugiere que la ciliogénesis y el transporte intraflagelar están involucrados en la patogenia del síndrome de Bardet-Biedl. 9 Un ejemplo de esto es el gen TTC8 ( gen responsable del fenotipo tipo 8), el cual codifica para una proteína con dominio procariota, pilF, la cual interviene en la formación y movilidad ciliar. 12 Se ha demostrado el papel de los genes BBS6, BBS10 y BBS12 en la codificación para proteínas conocidas como chaperoninas y su papel en la enfermedad de Bardet-Biedl. Las chaperoninas son proteínas que promueven el doblamiento de las cadenas polipeptídicas permitiendo a la molecula adquirir una forma tridimensional y con ello su función biológica. 9. En un estudio que incluyó a 93 pacientes obtenidos de 74 familias con diferentes razas se demostró el papel de los genes relacionados a Chaperonina BBS6, BBS10 y BBD12. En el 36.5% de las familias se encontraron mutaciones bialélicas de estos 3 genes: 4 pacientes con 15 mutación en BBS6, 19 pacientes con mutación en BBS10 y 10 pacientes con mutación en BBS12.9 El fenotipo de estos pacientes fue diferente al fenotipo clásico descrito para el síndrome de Bardet-Biedl e incluso con algunas características clínicas tales como defectos cardiacos congénitos, atresia vaginal, hidrometrocolpos y criptorquidismo que también están presentes en el síndrome de McKusick-Kaufman. En otro grupo de pacientes se encontraron características clínicas que también están presentes en el síndrome de Alstrom tales como diabetes, sordera, miocardiopatía, alteraciones hepáticas y endocrinas. MANIFESTACIONES CLÍNICAS DEL SÍNDROME DE BARDET-BIEDL Las manifestaciones clínicas frecuentes incluyen degeneración retiniana pigmentaria, obesidad, displasia renal, alteraciones cognitivas, polidactilia post-axial e hipogonadismo. 7 Otras manifestaciones menos comunes son la fibrosis hepática, diabetes mellitus, anormalidades reproductivas, alteraciones endocrinológicas, talla baja, retraso en el desarrollo y alteraciones en el lenguaje. La expresión clínica intrafamiliar e interfamiliar es variable. La edad diagnóstico promedio es de 9 años y la degeneración retiniana pigmentaria es la manifestación clínica más común en estos pacientes. Algunas series la reportan en el 100% de los casos con penetrancia dependiente de la edad.10- 11 16 La forma más común de degeneración pigmentaria retiniana es en la forma bastón-cono con involucro macular temprano. La aparición de ceguera nocturna se manifiesta de forma temprana con un promedio de edad de 15.5 años. Klein y Amman reportan que 73% de los pacientes presentan ceguera antes de los 20 años y 86% a los 30 años de edad.11 La fundoscópia a menudo muestra espículas óseas periféricas acompañadas de lesiones granulares a nivel de epitelio pigmentario . Otras manifestaciones oftalmológicas presentes en estos pacientes son astigmatismo, estrabismo, catarata, edema macular y atrofia del nervio óptico. 11 DIAGNÓSTICO Existen criterios diagnósticos clínicos para el síndrome de Bardet-Biedl propuestos por Beales (Anexo 1) ANEXO 1 CRITERIOS DIAGNÓSTICOS PROPUESTOS POR BEALES CRITERIOS PRIMARIOS CRITERIOS SECUNDARIOS Distrofia cono-bastón Alteraciones/retraso de lenguaje Polidactilia Estrabismo/catarata/astigmatismo Obesidad Braquidactilia/Sindactilia Alteraciones en aprendizaje Retraso en el desarrollo Hipogonadismo en hombres Poliuria/Polidipsia Alteraciones renales Ataxia/Mala coordinación Espasticidad leve de miembros pélvicos Diabetes mellitus Alteraciones dentales Hipertrofia ventricular izquierda Fibrosis hepática El diagnóstico clínico se realiza con la presencia de al menos 4 criterios primarios o 3 criterios primarios más 2 criterios secundarios. 11 17 Beales reporta que la mayoría de los pacientes con síndrome de Bardet-Biedl presentan estudios de electrofisiología (electrorretinograma y potenciales visuales evocados) normales a los 5 años de edad. Sin embargo, el 90% de los pacientes a los 10 años presentan respuestas atenuadas en el electrorretinograma. 11 Las alteraciones renales más frecuentes son la enfermedad quística tubular, la glomerulonefritis crónica, las malformaciones de tracto urinario y la incapacidad para la concentración de orina a nivel tubular. Estas alteraciones llevan al desarrollo de insuficiencia renal crónica la cual representa la principal causa de mortalidad en estos pacientes. 11 DIAGNÓSTICO GENÉTICO DEL SÍNDROME DE BARDET-BIEDL A pesar que todos los casos del síndrome de Bardet-Biedl se heredan de forma autosómica recesiva, el hecho de que existan 15 genes asociados a la enfermedad origina una dificultad enorme para su diagnóstico molecular. La secuenciación nucleotídica de los 15 genes es costosa y toma un tiempo considerable, por lo que se han desarrollado algunos métodos para identificar la región genómica que pudiera contener el gen responsable en casos particulares. El mapeo de homocigocidad es uno de estos métodos. 18 MAPEO DE HOMOCIGOCIDAD El fundamento del mapeo de homocigocidad radica en la identificación de bloques genómicos que han sido heredados por un ancestro común. Mientras que este concepto ha resultado muy útil en el análisis genético de familias consanguíneas con múltiples familiares afectados, también se puede llevar cabo un análisis genético de enfermedades autosómicas recesivas incluso en casos esporádicos. 10 La poca correlación del genotipo-fenotipo en enfermedades genéticas, como el síndrome de Bardet-Biedl, dificulta la predicción de los genes causantes de la enfermedad basado en criterios clínicos; por ello, la técnica del mapeo de homocigocidad adquiere una mayor importancia. 10 Harville y colaboradores concluyeron que la aplicación del mapeo de homocigocidad del genoma completo seguido de una técnica de secuenciación representa una alternativa efectiva en la detección de mutaciones en enfermedades con heterogeneidad genética tales como la enfermedad de Bardet-Biedl. 19 II PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA El síndrome de Bardet-Biedl es una enfermedad autosómica recesiva con una alta heterogeneidad genética cuya principal manifestación clínica es la ceguera a edades tempranas. Resulta complicado realizar un diagnóstico genético e identificación de los genes causales de esta enfermedad por medio de técnicas tradicionales de análisis genético. El mapeo de homocogocidad es una técnica novedosa que puede facilitar el diagnóstico molecular del síndrome de Bardet- Biedl.20 III JUSTIFICACIÓN La técnicas de microarreglos de DNA para mapeo de homocigocidad representan una herramienta útil para el diagnóstico genético de aquellas enfermedades que poseen una alta heterogeneidad genética, como es el caso del síndrome de Bardet-Biedl. 21 IV OBJETIVOS OBJETIVO GENERAL 1) Identificar la región cromosómica asociada en 3 casos familiares con enfermedad de Bardet-Biedl utilizando mapeo de homocigocidad del genoma completo con microarreglos de DNA. OBJETIVOS ESPECÍFICOS 1) Proponer el gen candidato responsable de 3 casos familiares de enfermedad de Bardet-Biedl. 2) Establecer la utilidad de mapeo de homocigocidad para identificar el locus responsable de una enfermedad con heterogeneidad de locus como el síndrome de Bardet-Biedl. 22 V DISEÑO DEL ESTUDIO Estudio descriptivo, observacional y transversal. VI MATERIAL Y MÉTODOS CRITERIOS DE INCLUSIÓN 1) Pacientes que cumplan los criterios diagnósticos de síndrome de Bardet-Biedl propuestos por Beales (anexo 1 ) y que tengan al menos 2 familiares afectados dentro de la misma familia. 2) Pacientes con síndrome de Bardet-Biedl que tengan antecedente de consanguinidad entre sus padres. CRITERIOS DE EXCLUSIÓN Pacientes en los que no sea posible colectar muestra de DNA de al menos otro familiar afectado. 23 CRITERIOS DE ELIMINACIÓN 1) Aquellos pacientes con diagnóstico clínico de síndrome de Bardet-Biedl propuesto por Beales en los cuales no se logren identificar regiones homocigotas en el mapeo de homocigocidad. TAMAÑO DE LA MUESTRA Se realizó el estudio de 3 casos familiares METODOLOGÍA 1) Se determinó árbol genealógico de los pacientes con enfermedad de Bardet- Biedl estudiados. 2) Se realizó historia clínica completa incluyendo exploración oftalmológica (determinación de capacidad visual, biomicroscopía y fundoscopía) en todos los pacientes con enfermedad de Bardet-Biedl estudiados. 3) Se realizaron estudios de electrofisiología (electrorretinograma) en todos los pacientes con enfermedad de Bardet-Biedl estudiados. 4) Se tomaron fotos clínicas fundoscópicas de polo posterior, ecuador y periferia de los pacientes con enfermedad de Bardet-Biedl estudiados. 5) Se obtuvieron muestras de DNA según los estándares internacionales en los pacientes con síndrome de Bardet-Biedl estudiados. 24 6) Se realizaron técnicas de microarreglos y mapeo de homocigocidad en todos los pacientes con diagnóstico clínico de síndrome de Bardet-Biedl. ANÁLISIS MOLECULAR Previo consentimiento informado, se extrajeron 2 ml de sangre por punción venosa en cada sujeto a partir de la cual se aisló el DNA genómico mediante el kit QUICKGENE DNA WHOLE BLOOD (DB-S, FujiFilm Co.) Se colocaron 30 microlitros de solución EDB (proteasa) en un microtubo eppendorf de 1.5 ml. Posteriormente se agregaron 250 microlitros de sangre total (se usó sangre total colectada en EDTA-2Na o EDTA-2K) y 250 microlitros de solución LDB (buffer de lisis). Inmediatamente se mezcló el tubo 5 veces invirtiéndolo de arriba hacia abajo, se agitó con vórtex a máxima velocidad durante 15 segundos y se centrifugó durante unos segundos. La muestra se incubó a 56°C durante 2 minutos y posteriormente se agregaron 250 microlitros de etanol al 99%. Se repitió la agitación con vórtex durante 15 segundos y la muestra se centrifugó unos segundos. Dentro de los siguientes 30 minutos se realizó el aislamiento de DNA. Se transfirió el lisado dentro del “cartucho” del sistema automático de aislamiento de ácidos nucleicos QuickGene-810 (se transfiere todo el contenido del microtubos en el cartucho) y se procedió a la extracción automatizada. El DNA genómico obtenido se resuspendió en un volumen aproximado de 200 microlitros. Se almacenó la muestra a una temperatura de -20°C hasta su utilización. 25 DETERMINACION DE LA CONCENTRACION Y PUREZA DEL DNA OBTENIDO Se determinó la concentración y pureza del DNA extraído por medio de un análisis de absorbancia de la muestra a 260/280 nm de longitud de onda en un espectrofotómetro. La relación 260/280 permite evaluar la pureza de la muestra, considerando que la lectura a 280 nm corresponde a la fracción proteica. Se consideran adecuadas para el análisis genético las muestras con relaciones entre 1.6 y 2. Además, se realizaron electroforesis en geles de agarosa de cada muestra de DNA obtenida para verificar que no exista degradación de este ácido nucleico. La concentración de DNA obtenida se determinó por la lectura a 260 nm considerando obtener concentraciones promedio de 50 ng/microlitro. IDENTIFICACIÓN DE REGIONES DE HOMOCIGOCIDAD EN GENOMA COMPLETO La identificación de las regiones de homocigocidad genómicas en DNA de los afectados se realizó mediante ensayos con microarreglos de DNA Affymetrix de 250 K Nsp y utilizando el kit de reactivos Genechip (Affymetrix, Santa Clara, CA, USA). Brevemente, se fragmentaron 250 ngs de DNA genómico con la enzima NspI (Affymetrix) y los fragmentos se ligaron a adaptadores específicos necesarios para efectuar una PCR de enriquecimiento de fragmentos de aproximadamente 400 pares de bases, con la enzima AmpliTaq Platinum (Clontech Laboratories, CA, USA) y un oligonucleótido especifico para los adaptadores ligados. Posteriormente, los productos se purificaron y se sometieron a una nueva fragmentación para generar productos menores a 80 pares de bases que se marcaron e hibridizaron al microarreglo en un horno de hibridación. Después, el microarreglo se lavó en una estación de fluidos GeneChip 450 (Affymetrix) y posteriormente se analizó en un escáner de microarreglos 3000 7G para generar el archivo con los genotipos de 26 262,264 polimorfismos de base única (SNPs) distribuidos en todo el genoma. Se analizaron solamente las muestras con un índice de identificación (call rate) igual o mayor a 95%. La identificación de regiones en las que los SNPs fueron homocigotos en DNA de los afectados de cada familia se realizó con el programa HomozygosityMapper (www.homozygositymapper.org) que permite la comparación simultánea de los 260,000 SNPs e identifica regiones cromosómicas homocigotas mayores de 3 megabases.29 Una vez identificadas las regiones homocigotas, se realizó un análisis manual para reconocer si alguno de los 15 genes asociados al síndrome de Bardet-Biedl se localizaba dentro de una de las regiones de homocigosidad reconocidas. Se dio prioridad a las regiones homocigotas de mayor extensión. De manera alternativa, se utilizó el programa computacional GeneDistiller (www.genedistiller.org) para identificar genes candidatos dentro de las regiones de homocigosidad que sean expresados en retina o se hayan asociado previamente a un fenotipo ocular. 30 http://www.homozygositymapper.org/ http://www.genedistiller.org/ 27 VII ÉTICA 1) Se informó a todos los pacientes así como a sus tutores los objetivos generales del estudio. 2) Se informó a todos los familiares sanos, a los pacientes con diagnóstico clínico de síndrome de Bardet-Biedl así como a sus tutores, que la muestra sanguínea será utilizada exclusivamente para fines de análisis de DNA y mapeo de la enfermedad en estudio. 3) Los pacientes previa información del protocolo de investigación firmaron la declaración de Helsinki. 28 VIII RESULTADOS DESCRIPCIÓN DE PACIENTES FAMILIA 1 Paciente 1A Femenino 33 años que inicia su padecimiento a los 4 años al presentar mala visión en ambos ojos la cual ha sido progresiva. Presenta obesidad desde los 5 años de edad. Antecedentede cirugía por polidactilia en miembro torácico izquierdo y ambos miembros pélvicos. Cuenta con antecedente heredofamiliar 2 hermanas menores con diagnóstico de enfermedad de Bardet-Biedl. A la exploración física se encuentra una paciente de edad aparente similar a la cronológica orientada en persona, tiempo y espacio. Presenta obesidad de distribución centrípetra. A la exploración oftalmológica presenta nistagmus horizontal con componente rápido hacia la derecha. Ortoposición. Agudeza visual de movimiento de manos en ambos ojos. Segmento anterior sin alteraciones. A la fundoscopía se encuentra retina aplicada, papila pálida, excavación del 40%, anillo neurorretiniano 29 conservado, atenuación vascular difusa, màcula con cambios pigmentarios y regiòn ecuatorial y periférica con dispersión de pigmento en forma de espículas óseas. Estudios de Gabinete La fluoroangiografía muestra múltiples zonas de hiperfluorescencia por transmisión coroidea correspondientes a defectos en el epitelio pigmentario retiniano que involucran a la màcula. Electrorretinograma demostró respuesta abolida en ambos ojos. Paciente 1B Femenino 29 años que inicia su padecimiento a los 5 años de edad al presentar mala visión nocturna y fotofobia acompañada de aumento de peso excesivo. Cuenta con antecedente de cirugìa por polidactilia en ambos miembros torácicos y miembro pélvico derecho. Antecedente heredofamiliar de enfermedad de Bardet-Biedl en 2 hermanas directas. A la exploración física se encuentra a paciente de edad aparente similar a la cronológica orientada en persona, tiemp y espacio con lenguaje no claro. Presenta cicatriz quirúrgica en ambos miembros torácicos así como obesidad de distribución centrípeta. 30 A la exploración oftalmológica ambos ojos se encuentran en ortoposición. Agudeza visual de ojo derecho de 20/200 con capacidad visual de 20/70 con refracción de -1.00/-2.00 x180º y ojo izquierdo con visión de 20/100 con capacidad visual de 20/80 con refracción de -0.25/-2.00x180º. Segmento anterior sin alteraciones. A la fundoscopía presenta retina aplicada, papila pálida con excavación del 30%, anillo neurorretiniano conservado, emergencia central de vasos, atenuación difusa vascular, mácula con cambios pigmentarios, zona ecuatorial y periférica con dispersión de pigmento en forma de espículas oseas. Estudios de Gabinete La fluoroangiografía muestra múltiples zonas de hiperfluorescencia por transmisión coroidea correspondientes a defectos en el epitelio pigmentario retiniano que involucran a la màcula. Electrorretinograma con respuesta abolida en ambos ojos. Paciente 1C Femenino 27 años inicia su padecimiento a los 6 años al presentar mala visión nocturna y fotofobia. Antecedente de cirugía por polidactilia en mano izquierda. Antecedente heredofamiliar de síndrome de Bardet-Biedl en 2 hermanas directas. A la exploración física se encuentra paciente femenino de edad aparente similar a la cronológica orientada en persona, tiempo y espacio. Presenta cicatriz quirúrgica por polidactilia en mano izquierda. 31 A la exploración oftalmológica presenta agudeza visual de 2/200 en ambos ojos que no mejora con refracción de +3.25/-2.00 x 180º y +3.50/-2.00 x180º en ojo derecho e izquierdo respectivamente. Segmento anterior, sin alteraciones. A la fundoscopía presenta retina aplicada, papila pálida con excavación del 30%, anillo neurorretiniano conservado, emergencia central de vasos, atenuación difusa vascular, mácula con cambios pigmentarios, zona ecuatorial y periférica con dispersión de pigmento en forma de espículas oseas. Estudios de Gabinete La fluoroangiografía muestra múltiples zonas de hiperfluorescencia por transmisión coroidea correspondientes a defectos en el epitelio pigmentario retiniano que involucran a la màcula. Electrorretinograma con respuesta abolida en ambos ojos. FAMILIA 2 Paciente 2A Masculino de 8 años que inicia su padecimiento a los 3 años al presentar hiperactividad, déficit de atención y alteraciones en el lenguaje (no comprensible) acompañado de incremento de peso excesivo. A los 6 años presentó fotofobia y nictalopia. Se le realizó cirugía de polidactilia en ambos miembros torácicos y pélvicos a los 8 meses de edad sin complicaciones. Como antecedentes heredofamiliares tiene una hermana con diagnóstico de enfermedad de Bardet-Biedl. 32 A la exploración física es un paciente de edad aparente similar a la cronológica, orientado en persona tiempo y espacio. Dificultad para lograr la atención y lenguaje poco claro. Talla y peso por arriba del percentil 95 con obesidad de distribución central (figura 1). En ambos miembros torácicos presenta braquidactilia y clinodactilia de quinto dedo bilateral, presenta cicatriz de resección de polidactilia bilateral (figura 2) dorso íntegro. Miembros pélvicos presenta laxitud articular bilateral, pies cortos pequeños con braquidactilia y cicatriz de resección de polidactilia bilateral. A la exploración oftalmológica ambos ojos se encuentran en ortoposición. Agudeza visual de 20/200 con capacidad visual de 20/40 en ambos ojos con refracción de +0.25/-5.00x180º en ojo derecho y -1.50/-5.00x180º en ojo izquierdo. A la biomicroscopía segmento anterior sin alteraciones. A la exploración fundoscópica se encuentra fondo coroideo, retina aplicada, papila naranja con excavación del 30%. Anillo neurorretiniano conservado. Emergencia central de vasos con relación arteria-vena conservada. Mácula con patrón en bronce martillado, sin brillo foveal. Zona ecuatorial y periférica con dispersión de pigmento en forma de espículas óseas. (figura 3). Estudios de gabinete La fluoroangiografía muestra zonas de hiperfluorescencia por transmisión coroidea y zonas de hipofluorescencia por bloqueo retiniano secundaria a dispersión de pigmento. (figura 4). Electrorretinograma presenta respuesta abolida en ambos ojos. 33 Ultrasonido abdominal no muestra alteraciones a nivel renal. FIGURA 1. Distribución de obesidad centrípeta 34 FIGURA 2. Cicatrices por cirugía de polidactilia en la zona lateral de ambos miembros torácicos en el paciente 2A. 35 Figura 3. Fundoscopía en paciente 2A. Mácula con patrón en bronce amartillado y dispersión de pigmento en ambos ojos. 36 Figura 4. Fluorangiografía en el paciente 2A, que muestra zonas de hiperfluorescencia por transmisión coroidea. Árbol Genealógico Arbol genealógico de la familia 2. 37 Paciente 2B Femenino 6 años inicia su padecimiento a los 4 años al presentar hiperactividad, déficit de atención y alteraciones en el lenguaje (no comprensible) acompañados de aumento de peso excesivo. Presenta fotofobia y nictalopia desde los 5 años. Como antecedente heredofamiliar cuenta con un hermano con enfermedad de Batdet-Biedl. Se le realizó cirugía de polidactilia en miembro torácico izquierdo y ambos miembros pévicos a los 7 meses de nacimiento. A la exploración física es una paciente de edad aparente similar a la cronológica orientada en persona, tiempo y espacio. Dificultad para lograr la atención y lenguaje poco claro. Presenta obesidad de distribución centrípetra además de acantosis nigricans en región de cuello (figura 5). Presenta cicatriz en la parte lateral del miembro torácico izquierdo y en la parte lateral de ambos miembros pélvicos (figura 6). A la exploración oftalmológica presenta endotropia de 30 dioptrías prismàticas. (figura 7). Capacidad visual de 20/60 en ojo derecho con refracción de -3.50/-4.25 x 160º y 20/50en ojo izquierdo con refracción de -3.50/-5.00x5º. A la biomicroscopía el segmento anterior se encuentra sin alteraciones. A la exploración fundoscópica se encuentra fondo coroideo, retina aplicada, papila naranja con excavación del 30%. Anillo neurorretiniano conservado. Emergencia central de vasos con relación arteria-vena conservada. Mácula con patrón en bronce 38 martillado, sin brillo foveal. Zona ecuatorial y periférica con dispersión de pigmento en forma de espículas óseas. (figuras 8A y 8B). Estudios de gabinete En el electrorretinograma presenta respuesta abolida en ambos ojos. El ultrasonido abdominal no reveló alteraciones urinarias. Figura 5. Fotografia clínica de la paciente 2B. Se observa obesidad de distribución centrípeta 39 Figura 6. Cicatrices por cirugía de polidactilia en miembro torácico izquierdo en la paciente 2B. 40 Figura 7. Paciente 2B. Endotropia de 30 DP Figura 8A. Fluorangiografía en paciente 2B. Se observan cambios pigmentarios en mácula y dispersión de pigmento en forma de espículas óseas en periferia. 41 Figura 8B. Fluorangiografía en paciente 2B. Se observan cambios pigmentarios en mácula y dispersión de pigmento en forma de espículas óseas en periferia. Árbol Genealógico Árbol Genealógico de la familia 2. 42 FAMILIA 3 Paciente 3A Paciente masculino de 25 años el cual presenta mala visión desde los 6 años de edad. Al nacimiento presentó polidactilia en ambos pies y mano izquierda tratados con cirugía sin complicaciones. Tiene un primo hermano el cual padece la misma enfermedad. A la exploración física se trata de un paciente masculino de edad aparente similar a la cronólogica, orientado en persona, tiempo y espacio. Tiene un índice de masa corporal de 35 kg/m2 con obesidad de distribución centrípeta. Presenta cicatrices quirúrgicas en la parte lateral de ambos pies y de mano izquierda. A la exploración oftalmológica presenta nistagmus horizontal y exotropia de 50 DP (figura 9). Agudeza visual de ojo derecho cuenta dedos a 30 centímetros y ojo izquierdo movimiento de manos. Segmento anterior de ambos ojos con Hippus. Presión intraocular de 18 mmHg en ambos ojos. A la fundoscopía de ambos ojos presenta retina aplicada, papila naranja, excavación del 30%, atrofia peripapilar, mácula con coloración bronce en patrón martillado, dispersión de pigmento en patrón de espículas óseas en periferia (figura 10). Estudios de gabinete La fluoroangiografía muestra hiperfluorescencia por transmisión coroidea por atrofia del epitelio pigmentario retiniano en ambos ojos. (Figura 11). El electrorretinograma presenta una respuesta abolida. 43 Los campos visuales de Goldman muestran pequeños islotes de visión central conservada. Se descartaron anomalías renales por medio de ultrasonografía abdominal. Árbol Genealógico Arbol genealógico de la familia 3. 44 Figura 9. Exotropia de ojo derecho de 50 DP en paciente 3A. Figura 10. Fondo de ojo del paciente 3A, demostrando mácula con coloración bronce martillado. Dispersión de pigmento en patrón de espículas óseas 45 Figura 11. Fluorangiografia del paciente 3A, mostrando hiperfluorescencia por transmisión coroidea por atrofia del epitelio pigmentario retiniano RESULTADOS DEL ANÁLISIS DE HOMOCIGOCIDAD CON EL PROGRAMA HOMOZYGOSITYMAPPER El análisis de en DNA de los afectados de la familia 1 permitió la identificación de 3 regiones de homocigocidad en los cromosomas 1, 6 y 20 (Figura 12). Dentro de la región homocigota de 20p12 se sitúa el gen MKKS, responsable del síndrome de Bardet-Biedl tipo 6 (figura 13). No existen genes conocidos para la enfermedad dentro de las regiones identificadas en los cromosomas 1 y 6. 46 FAMILIA 1 Figura 12. Se observan 3 regiones de homocigocidad (barras rojas) en los cromosomas 1, 6 y 20. En la región del cromosoma 20 identificada (20p12) se localiza el gen MKKS asociado a enfermedad de Bardet-Biedl tipo 6. Figura 13. Región cromosómica de homocigocidad en 20p12 identificada en la familia 1 y que incluye el gen MKKS asociado a enfermedad de Bardet-Biedl tipo 6. 47 El análisis de homocigocidad en la familia 2 permitió la identificación de 2 regiones homocigotas en los cromosomas 11 y 16 de los pacientes con el síndrome de Bardet-Biedl (figura 14). No se han identificado genes asociados a la enfermedad en esas regiones cromosómicas. FAMILIA 2 Figura 14. Se muestran las regiones de homocigocidad en el cromosoma 11 y 16 identificadas en los sujetos con síndrome de Bardet-Biedl de la familia 2. En estas regiones no existen genes descrito para la enfermedad. En la familia 3, el análisis por Homozygositymapper permitió la identificación de diversas regiones homocigotas en el DNA estudiado (Figura 15). La región más extensa correspondió al cromosoma 3q11.2, dentro de la cual se sitúa el gen ARL6 (figura 16), responsable del síndrome de Bardet-Biedl tipo 3. En ninguna de las 48 otras regiones de homocigocidad significativa identificadas (barras rojas en cromosomas 1, 4, 8, 9 y 14) se conocen genes asociados a la enfermedad. FAMILIA 3 Figura 15. Regiones de homocigocidad en el cromosoma 1, 3, 4, 8, 9, 11, 14 y 15 identificadas en DNA de la familia 3. La región más extensa corresponde al cromosoma 3q11.2 que contiene al gen ARL6, asociado a enfermedad de Bardet- Biedl tipo 3. Figura 16. Región cromosómica 3q11.2 dentro de la que se sitúa el gen candidato ARL6 asociado a enfermedad de Bardet-Biedl tipo 3. 49 IX DISCUSIÓN La enfermedad de Bardet-Biedl es una enfermedad autosómica recesiva con penetrancia variable y alta heterogeneidad genética.8 Las principales manifestaciones clínicas de esta enfermedad incluyen retinosis pigmentaria, obesidad, displasia renal, alteraciones cognitivas, polidactilia post-axial e hipogonadismo. La retinosis pigmentaria se manifiesta como ceguera a edades tempranas y es la principal causa de morbilidad ya que está presente en todos los pacientes con esta enfermedad. 11 Existen 15 genes descritos que pueden originar la enfermedad de Bardet- Biedl. La función biológica de estos genes puede subdivirse en 2 grandes grupos: 1) Genes que intervienen en la codificación de proteínas cuya acción específica es la formación y funcionamiento de los cilios celulares. 9 2) Genes implicados en la codificación de proteínas conocidas como chaperoninas cuya acción principal es la promoción del doblamiento de cadenas polipeptídicas para adquirir una forma tridimensional y con ello la función biológica de la proteína.9 50 El diagnóstico clínico se hace en aquellos pacientes que cumplen con los criterios clínicos propuestos por Beales 11 (anexo 1). Las técnicas de microarreglos y mapeo de homocigocidad representan dos herramientas útiles en el diagnóstico genético del síndrome de Bardet-Biedl ya que permiten identificar aquellas regiones cromosómicas que presenten un alto grado de homocigocidad para posteriormente secuenciar e identificar el gen causal específico por medio de la secuenciación genética. En la familia 1 se identificaron regiones de alta homocigocidad en los cromosomas 1, 6 y 20. Las regiones 1 y 6 no poseen ningún gen asociado a enfermedad de Bardet-Biedl, sin embargo, dentro de la región 20p12 se encuentra el gen MKKS asociado a enfermedad de Bardet-Biedl tipo 6. El gen MKKS está conformado por 6 exones con un codón de iniciación en el exón 3 y 2 exones alternativos 5 prima terminales no codificantes.26 La función del gen MKKS es la codificación de proteínas con función similar a chaperoninas las cuales promueven el plegamiento de cadenas polipeptídicas para adquirir una forma tridimensional y con ello su función biológica.26 Slavotinek y col. sugieren que las manifestaciones clínicas del síndrome de bardet-biedl se deben a la falta de expresión de este gen en tejidos tales como retina, cerebro, páncreas y otros órganos. 27 Otra enfermedad asociada a mutaciones en el gen MKKS es el síndrome de McKusick-Kaufman el cual se caracteriza por polidactilia postaxial, enfermedad cardiaca congénita e hidrometrocolpos en mujeres y criptorquidismo e hipospadia en hombres. 28 51 El gen MKKS localizado en la región 20p12 es el principal gen candidato a secuenciar para obtener el diagnóstico genético molecular en la familia 1. En la familia 2 se identificó una región de homocigocidad en la región 11p11.2. En esta región no se encuentran genes descritos para enfermedad de Bardet-Biedl, sin embargo, dentro de esta región se localiza el gen TRIM48 el cual comparte una gran homología con el gen TRIM32 (figura 17), localizado en la región 9q33.1 y responsable del síndrome de Bardet-Biedl tipo 11. El alto grado de homología que comparten TRIM32 y TRIM48 convierte a éste último en un fuerte candidato como gen causal del síndrome de Bardet-Biedl en la familia 2. Figura 17. Índice de homología entre el gen TRIM32 (asociado al síndrome de Bardet-Biedl) y los genes localizados en la región de homocigocidad en 11p11.2 identificada en la familia 2. El gen TRIM48 es el gen con mayor grado de homología, tiene un índice de 33.72 de acuerdo al programa computacional Genesuspects. 52 El gen TRIM32 se expresa ampliamente en el organismo como una ligasa de ubiquitina en la línea Z del músculo esquelético y funciona como un regulador de la ubiquitinización de la proteína disbindina22. Una falta de expresión de TRIM32 tiene como consecuencia un aumento en los niveles de disbindina a nivel del músculo esquelético. El grado de homología entre TRIM32 y TRIM48 puede explicarse en parte por sus funciones similares: ambos presentan dominios de unión al Zinc y promueven el proceso de ubiquitinización proteíca. Hasta el día de hoy no existe una asociación entre mutaciones de TRIM48 y alguna enfermedad en seres humanos. En la familia 3 se identificaron regiones de homocigocidad en los cromosomas 1, 3, 4, 8, 9, 11, 14 y 15. La región de mayor índice de homocigocidad se localizó en el cromosoma 3q11.2. Dentro de esta región se localiza el gen del factor ADP de ribosilación tipo 6 (ARL6). La función del gen ARL6 es regular el transporte intracelular y la migración adecuada de un complejo proteico a nivel de la membrana ciliar.16 Una mutación en ARL6 se ha asociado al síndrome de Bardet-Biedl tipo 3 por lo que este gen representa el principal gen candidato a estudio de secuenciación genética en la familia 3. 53 X CONCLUSIONES El diagnóstico genético de las enfermedades que poseen una alta heterogeneidad genética se dificulta con el uso de técnicas diagnósticas tradicionales como la secuenciación nucleotídica directa. En este estudio analizamos la utilidad de la técnica de microarreglos y mapeo de homocigocidad para diagnóstico genético de una enfermedad que posee una alta heterogeneidad de locus como el síndrome de Bardet-Biedl. Por otro lado proponemos un gen, TRIM48, como un fuerte candidato a ser un nuevo gen asociado al síndrome de Bardet-Biedl. 54 XI REFERENCIAS 1) Pagon RA, Daiger SP “Retinitis Pigmentosa Overview” Gene reviews University of Washington, Seattle; 2005 Sep16. 2) James K. Phelan, Dean Bok “A brief review of retinitis pigmentosa and the identified retinitis pigmentosa genes” Molecular vision 2000; 6:116-124. 3) Christian Hamel “Retinitis Pigmentosa” Orphanet J Rare Disease 2006 October 1:40. 4) Dikla Bandah-Rozenfeld, Liliana Mizrahi-Meissonnier, Chen Farhy, Alexey Obolensky, Itay Chowers, Jacob Peter, Saul Merin, Tamar Ben-Yosef, Ruth Ashery-Padan, Eyal Banin and Dror Sharon “Homozygosity Mapping Reveals Null Mutations in FAM161A as a Cause of Autosomal –Recessive Retinitis Pigmentosa” AJHG volume 87, Issue 3, 10 September 2010, Pages 382-291. 5) Gabriel H. Travis “Human genetics 98: Apoptosis mechanisms of Cell Death in the Inherited Retinal Degenerations” Am. J. Hum. Genet. 62: 503-508, 1998. 55 6) Simone Van Soest, PHD, Andries Westerveld, PHD, Paulus T.V.M.De jong, MD, PHD, FRCOPHTH, Elisabeth M. Bleeker-Wagemakers,MD,PHD, AND Arthur A. B. Bergen, PHD “Retinitis Pigmentosa: Defined from a molecular point of view” Survey of Ophthalmology volume 43, number 4, January-February 1999. 7) Dominic RA White, Anuradha Ganesh, Darryl Nishimura, Eleanor Ratenberry, Shakeel Ahmed, Ursula M Smith, Shanaz Pasha, Sandy Raeburn, Richard C Trembath, Anna Rajab, Fiona McDonald, Eyal Banin, Edwin M Stone, Colin A Johnson, Val C Sheffield and Eamon R Maher “Autozygosity mapping of Bardet-Biedl Syndrome to 12q21.2 and confirmation of FLJ23560 a BBS10” European Journal of Human Genetics (2007) 15, 173-178. 8) Ines Pereiro, Diana Valverde, Teresa Piñeiro-Gallego, Montserrat Baiget, Salud Borrego, Carmen Ayuso, Charles Searby, Darryl Nishimura “New mutations in BBS genes in small consanguineous families with Bardet-Biedl Syndrome: Detection of candidate regions by homozygosity Mapping” Molecular Vision 2010; 16:137-143. 9) Gail Billingley, Jenea Bin, Karen J Fieggen, Jacque L Duncan, Christina Gerth, koji Ogata, Shoshana S Wodak, Elias I Traboulsi, Gerald A Fishman, Andrew Paterson, David Chitayat, Tanja Knueppel, Jose M Millan, Grant A Mitchel, Catherine Deveault, Elise Heon. “Mutations in chaperonin-like BBS genes are a major contributor to disease development in a multiethnic Bardet- Biedl syndrome patient population” J Med Genet 2010 47:453-463. 56 10) L Abu Safieh, M A Aldahmesh, H Shamseldin, M Hashem, R Shaheen, H Alkuraya, S A F Al Hazzaa, A Al-Rajhi, F S Alkuraya “Clinical and molecular characterisation of Bardet-Biedl syndrome in consanguineous populations: the power of homozygosity mapping” J Med genet 2010 47:236-241. 11) P L Beales, N Elcioglu, A S Woolf, D Parker, F A Flinter “New Criteria for improved diagnosis of Bardet-Biedl Syndrome: results of a population survey” J Med Genet 1999; 36:437-446. 12) Ansley, S. J., Badano, J. L., Blacque, O. E., Hill, J., Hoskins, B. E., Leitch, C. C., Kim, J. C., Ross, A. J., Eichers, E. R., Teslovich, T. M., Mah, A. K., Johnsen, R. C., Cavender, J. C., Lewis, R. A., Leroux, M. R., Beales, P. L., Katsanis, N. Basal body dysfunction is a likely cause of pleiotropic Bardet-Biedl syndrome. Nature 425: 628-633, 2003. 13) Nachury, M. V., Loktev, A. V., Zhang, Q., Westlake, C. J., Peranen, J., Merdes, A., Slusarski, D. C., Scheller, R. H., Bazan, J. F., Sheffield, V. C., Jackson, P. K. A core complex of BBS proteins cooperates with the GTPase Rab8 to promote ciliary membrane biogenesis. Cell 129: 1201-1213, 2007. 14) Mykytyn, K., Nishimura, D. Y., Searby, C. C., Shastri, M., Yen, H., Beck, J. S., Braun, T., Streb, L. M., Cornier, A. S., Cox, G. F., Fulton, A. B., Carmi, R., Luleci, G., Chandrasekharappa, S. C., Collins, F. S., Jacobson, S. G., Heckenlively, J. R., Weleber, R. G., Stone, E. M., Sheffield, V. C. Identification 57 of the gene (BBS1) most commonly involved in Bardet-Biedl syndrome, a complex human obesity syndrome. Nature Genet. 31: 435-438, 2002. 15) Nishimura, D. Y., Searby, C. C., Carmi, R., Elbedour, K., Van Maldergem, L., Fulton, A. B., Lam, B. L., Powell, B. R., Swiderski, R. E., Bugge, K. E., Haider, N. B., Kwitek-Black, A. E., Ying, L., Duhl, D. M., Gorman,S. W., Heon, E., Iannaccone, A., Bonneau, D., Biesecker, L. G., Jacobson, S. G., Stone, E. M., Sheffield, V. C. Positional cloning of a novel gene on chromosome 16q causing Bardet-Biedl syndrome (BBS2). Hum. Molec. Genet. 10: 865-874, 2001. 16) Jin, H., White, S. R., Shida, T., Schulz, S., Aguiar, M., Gygi, S. P., Bazan, J. F., Nachury, M. V. The conserved Bardet-Biedl syndrome proteins assemble a coat that traffics membrane proteins to cilia. Cell 141: 1208-1219, 2010. 17) Mykytyn, K., Braun, T., Carmi, R., Haider, N. B., Searsby, C. C., Shastri, M., Beck, G., Wright, A. F., Iannaccone, A., Elbedour, K., Riise, R., Baldi, A., Raas- Rothschild, A., Gorman, S. W., Duhl, D. M., Jacobson, S. G., Casavant, T., Stone, E. M., Sheffield, V. C. Identification of the gene that, when mutated, causes the human obesity syndrome BBS4. Nature Genet. 28: 188-191, 2001. 18) Kim, J. C., Badano, J. L., Sibold, S., Esmail, M. A., Hill, J., Hoskins, B. E., Leitch, C. C., Venner, K., Ansley, S. J., Ross, A. J., Leroux, M. R., Katsanis, N., Beales, P. L. The Bardet-Biedl protein BBS4 targets cargo to the pericentriolar 58 region and is required for microtubule anchoring and cell cycle progression. Nature Genet. 36: 462-470, 2004. 19) Riazuddin, S. A., Iqbal, M., Wang, Y., Masuda, T., Chen, Y., Bowne, S., Sullivan, L. S., Waseem, N. H., Bhattacharya, S., Daiger, S. P., Zhang, K., Khan, S. N., Riazuddin, S., Hejtmancik, J. F., Sieving, P. A., Zack, D. J., Katsanis, N. A splice-site mutation in a retina-specific exon of BBS8 causes nonsyndromic retinitis pigmentosa. Am. J. Hum. Genet. 86: 805-812, 2010. 20) Stoetzel, C., Laurier, V., Davis, E. E., Muller, J., Rix, S., Badano, J. L., Leitch, C. C., Salem, N., Chouery, E., Corbani, S., Jalk, N., Vicaire, S., and 23 others. BBS10 encodes a vertebrate-specific chaperonin-like protein and is a major BBS locus. Nature Genet. 38: 521-524, 2006. Note; Erratum: Nature Genet. 38: 727 only, 2006. 21) Marion, V., Stoetzel, C., Schlicht, D., Messaddeq, N., Koch, M., Flori, E., Danse, J. M., Mandel, J.-L., Dollfus, H. Transient ciliogenesis involving Bardet-Biedl syndrome proteins is a fundamental characteristic of adipogenic differentiation. Proc. Nat. Acad. Sci. 106: 1820-1825, 2009. 22) Locke, M., Tinsley, C. L., Benson, M. A., Blake, D. J. TRIM32 is an E3 ubiquitin ligase for dysbindin. Hum. Molec. Genet. 18: 2344-2358, 2009. 59 23) Dawe, H. R., Smith, U. M., Cullinane, A. R., Gerrelli, D., Cox, P., Badano, J. L., Blair-Reid, S., Sriram, N., Katsanis, N., Attie-Bitach, T., Afford, S. C., Copp, A. J., Kelly, D. A., Gull, K., Johnson, C. A. The Meckel-Gruber syndrome proteins MKS1 and meckelin interact and are required for primary cilium formation. Hum. Molec. Genet. 16: 173-186, 2007. 24) Tsang, W. Y., Bossard, C., Khanna, H., Peranen, J., Swaroop, A., Malhotra, V., Dynlacht, B. D. CP110 suppresses primary cilia formation through its interaction with CEP290, a protein deficiency in human ciliary disease. Dev. Cell 15: 187-197, 2008. 25) Kim, S. K., Shindo, A., Park, T. J., Oh, E. C., Ghosh, S., Gray, R. S., Lewis, R. A., Johnson, C. A., Attie-Bittach, T., Katsanis, N., Wallingford, J. B. Planar cell polarity acts through septins to control collective cell movement and ciliogenesis. Science 329: 1337-1340, 2010. 26) Stone, D. L., Slavotinek, A., Bouffard, G. G., Banerjee-Basu, S., Baxevanis, A. D., Barr, M., Biesecker, L. G. Mutation of a gene encoding a putative chaperonin causes McKusick-Kaufman syndrome. Nature Genet. 25: 79-82, 2000. 27) Slavotinek, A. M., Searby, C., Al-Gazali, L., Hennekam, R. C. M., Schrander- Stumpel, C., Orcana-Losa, M., Pardo-Reoyo, S., Cantani, A., Kumar, D., Capellini, Q., Neri, G., Zackai, E., Biesecker, L. G. Mutation analysis of the 60 MKKS gene in McKusick-Kaufman syndrome and selected Bardet-Biedl syndrome patients. Hum. Genet. 110: 561-567, 2002. 28) David A, Bitoun P, Lacombe D, Lambert JC, Nivelon A, Vigneron J, Verloes A. Hydrometrocolpos and polydactyly: a common neonatal presentation of Bardet-Biedl and McKusick-Kaufman syndromes. J Med Genet. 1999;36:599–603. 29) Seelow D, Schuelke M, Hildebrandt F, Nürnberg P Homozygosity Mapper an interactive approach to homozygosity mapping. Nucleic Acids Res. 2009 Jul 1;37(Web Server issue):W593-9. 30) Seelow D, Schwarz JM, Schuelke M. GeneDistiller--distilling candidate genes from linkage intervals. PLoS One. 2008;3(12):e3874. Portada Índice I. Introducción II. Planteamiento del Problema III. Justificación IV. Objetivos V. Diseño del Estudio VI. Material y Métodos VII. Ética VIII. Resultados IX. Discusión X. Conclusiones XI. Referencias
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