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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS BIOLOGÍA EXPERIMENTAL METABOLISMO DE ALBENDAZOL Y POLIMORFISMO MOLÉCULAR DEL CITOCROMO P4503A4 TESIS QUE PARA OPTAR POR EL GRADO DE: MAESTRO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGÍA EXPERIMENTAL) PRESENTA: JUAN CARLOS VELÁZQUEZ CASTRO TUTOR PRINCIPAL DE TESIS: DOCTOR RAFAEL CAMACHO CARRANZA INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS, UNAM COMITÉ TUTOR: DOCTOR JESUS JAVIER ESPINOSA AGUIRRE INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS, UNAM DOCTORA. PATRICIA RAMOS MORALES FACULTAD DE CIENCIAS, UNAM MÉXICO, D.F. MAYO, 2015 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS BIOLOGÍA EXPERIMENTAL METABOLISMO DE ALBENDAZOL Y POLIMORFISMO MOLÉCULAR DEL CITOCROMO P4503A4 TESIS QUE PARA OPTAR POR EL GRADO DE: MAESTRO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGÍA EXPERIMENTAL) PRESENTA: JUAN CARLOS VELÁZQUEZ CASTRO TUTOR PRINCIPAL DE TESIS: DOCTOR RAFAEL CAMACHO CARRANZA INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS, UNAM COMITÉ TUTOR: DOCTOR JESUS JAVIER ESPINOSA AGUIRRE INSTITUTO DE INVESTIGACIONES BIOMÉDICAS, UNAM DOCTORA. PATRICIA RAMOS MORALES FACULTAD DE CIENCIAS, UNAM MÉXICO, D.F. MAYO, 2015 PO Dr. Isidro Ávila Martínaz Director General de Administración Escolar, UNAM. Pr ese nt e COORDINACiÓN Me permito informar a usted que en la reunión ordinaria del Comité Académico del Posgrado en Ciencias Biológicas, celebrada el dia 17 de febrero de 2014, se aprobó el siguiente jurado para el examen de grado de MAESTRO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGIA EXPERIMENTAL) del alumno VELÁZQUEZ CASTRO JUAN CARLOS con número de cuenta 505013729 con la tesis titulada " METABOLISMO DE ALBENOAZOL y POLIMORFISMOS MOLECULAR DEL CITOCROMO P450 3A4", realizada bajo la direcci6n del DR. RAFAEL CAMACHO CARRANZA: Presidente: Vocal: Secretario: Suplente: Suplente: DRA. REGINA DORI NDA MONTERO MONTOYA DR. ARTURO CARLOS 11 BECERRA BRACHO DR. JESÚS JAVIER ESPINOSAAGUIRRE DRA. MARIA EUGENIA GONSEBATI BONAPARTE ORA. PATRICIA RAMOS MORALES Sin otro particular, me es grato enviarle un cordial saludo. A T E N T A M E N TE " CI EN C/4.s " POR MI RAZA HABLARA EL ESPIRITU" ,,,o ~ Ó'-q. Cd. Universitaria, D.F., a 26 de febrero del 2015. ~ \~ j{:&.t! ~ al .lJ)' ~ É DRA. MARiA DEL CORO ARIZ~ ARRIAGA COORDINADORA DEL PROGRAMA COORDINACiÓN Unidad de Posgrado ' Coordinación del Posgrado en Ciencias Biológicas Edificio n, ler. Piso, Circuito de Posgrados Cd. Universitaria Delegación Coyoacán c.P. 045 10 México, O.F. Tel. 5623 7002 hup:/lpcbiol.posgrado.unam.mx AGRADECIMIENTOS Quiero externar mi agradecimiento al Posgrado en Ciencias Biológicas, UNAM, por su apoyo para realizar el trabajo de investigación tanto por los recursos humanos como materiales, los cuales fueron indispensables para la culminación del mismo. De la misma forma agradezco el apoyo otorgado (beca) por Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT) el cual fue crucial para poder permanecer el programa de posgrado así como la culminación del mismo. Mi más profundo agradecimiento los miembros del comité tutor integrado por: Dr. JESUS JAVIER ESPINOZA, Dra. PATRICIA RAMOS MORALES, por el interés mostrado por mi trabajo y las valiosas sugerencias recibidas, en especial a mi tutor el Dr. Rafael Camacho Carranza por la paciencia, motivación y entusiasmo además de proporcionar los recursos materiales necesarios y su imprescindible guía. AGRADECIMIENTOS Agradezco a la Dra. Julieta Rubio Lightbourn por todo su apoyo y proporcionar su laboratorio ensayar técnicas de biología molecular y al Instituto de Investigaciones Biomédicas, Instituto de Nacional de P ediatría y al Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias por las instalaciones proporcionadas. A todos mis amigos que c olaboraron de al guna manera y la realización del proyecto en especial a Blanca Gutiérrez Guadarrama por su apoyo y colaboración. Espero no olvidar a nadie, pero de todas maneras agradezco a todos y cada una de las personas que contribuyeron en alguna etapa de este trabajo lo cual sin duda fue importante. DEDICATORIA Dedico este trabajo a m is padres que c on su amor y enseñanza han sembrado la necesidad de aprender a cada momento, de l uchar por los sueños perseguidos, por su amor y apoyo recibido los cuales fueron imprescindibles para lograr este objetivo. Agradezco al amor de mi vida, Alejandra Rodríguez que ha sido el impulso y pilar principal de este trabajo para la culminación del mismo, que con su apoyo incondicional y motivación en cada momento fue una pieza clave, fuente de sabiduría, calma y consejo en todo momento. ÍNDICE 1. Variabilidad metabólica .............................................................................................. 1 1.1.- Citocromo p450 (CYP450) ...................................................................................... 7 1.2 El citocromo P450 3A ............................................................................................. 13 1.3 Polimorfismo genético de CYP3A ......................................................................... 16 1.4 Polimorfismos de CYP 3A5 .................................................................................... 21 2.1Planteamiento del problema ................................................................................... 24 2.2 Justificación ............................................................................................................ 24 2.3 Hipótesis .................................................................................................................. 24 2.4 Objetivo general ...................................................................................................... 25 2.4.1Objetivos particulares .......................................................................................... 25 2.5 Antecedentes ........................................................................................................... 26 Material y Método .......................................................................................................... 34 3.1 Diseño experimental ................................................................................................... 34 3.2 Selección de la población ...................................................................................... 35 3.3 Extracción de DNA .................................................................................................. 35 3.4 Cuantificación del DNA aislado. ............................................................................ 36 3.5 Calidad e integridad del DNA ................................................................................. 36 3.6 Procedimiento de amplificación de CYP3A4*2 por ensayos de PCR-RFLP´S .. 37 3.6.1Condiciones de amplificación .............................................................................37 3.7 Identificación del alelo CYP3A4*1B, por ensayos de PCR-RFLP´S ................... 41 3.7.1 Condiciones de amplificación ............................................................................ 42 3.8 Optimización de las condiciones para cuantificar metabolitos de Albendazol por HPLC ........................................................................................................................ 45 3.8.1 Método de calibración ......................................................................................... 47 3.8.2 La fase móvil utilizada para análisis de las muestras problema tomadas de once personas ............................................................................................................... 48 3.8.3. Procedimiento de Extracción de albendazol y de sus metabolitos ............... 48 3.8.4 Administración de albendazol y recolección de muestras .............................. 48 Resultados ........................................................................................................................ 50 4.1 Frecuencia de las variantes alélicas CYP3A4 *1B y CYP3A4*2 .......................... 50 4.1.1 Frecuencias de la variante alélica CYP3A4 *1B ................................................ 50 4.1.2 Frecuencias de la variante alélica CYP3A4 *2 ................................................... 51 4.1.4 Cuantificación de Sulfóxido de albendazol ....................................................... 53 4.1.5 Cuantificación de sulfona de albendazol ........................................................... 54 4.2 Genotipo y fenotipo de CYP3A4*1B y CYP3A4*2 ................................................. 54 Discusión de resultados .................................................................................................. 55 5.1 Frecuencias de CYP4A4*2 y CYP4A4*1B en la población Mexicana ................. 55 5.2 Cuantificación de sulfóxido de albendazol y sulfona de albendazol ................. 57 Conclusiones ................................................................................................................. 58 Anexos ........................................................................................................................... 59 6 carta de consentimiento para estudios de investigación ...................................... 59 6.1 Actividad catalítica de MNLI con DNA sintético ................................................... 62 6.2 Estrategia que se siguió para confirmar la presencia de homocigoto y heterocigoto del CYP3A4*2 .......................................................................................... 62 6.3 Cromatografía de líquidos de alta resolución (HPLC) ......................................... 63 6.4 Resultados de HPLC (cromatografía de líquidos de alta resolución) ................ 63 6.5 Otro equipo de HPLC ............................................................................................. 64 6.6 Equipo proporcionado por el INER ....................................................................... 66 6.7 Abreviaturas y conceptos ...................................................................................... 68 7. Bibliografía ................................................................................................................ 70 ÍNDICE DE FIGURAS FIGURA 1 ................................................................................................................ 4 FIGURA 2 ................................................................................................................ 8 FIGURA 3 ................................................................................................................ 9 FIGURA 4 .............................................................................................................. 11 FIGURA 5. ............................................................................................................. 40 FIGURA 6. ............................................................................................................. 40 FIGURA 7. ............................................................................................................. 41 FIGURA 8. ............................................................................................................. 44 FIGURA 9. ............................................................................................................. 50 FIGURA 10 ............................................................................................................ 51 FIGURA 11 ............................................................................................................ 52 FIGURA 12 ............................................................................................................ 52 FIGURA 13.. .......................................................................................................... 62 FIGURA 14 ............................................................................................................ 62 ÍNDICE DE CROMATOGRAMAS CROMATOGRAMA 1 ........................................................................................... 63 CROMATOGRAMA 2 ........................................................................................... 64 CROMATOGRAMA 3. .......................................................................................... 65 CROMATOGRAMA 4 ........................................................................................... 66 CROMATOGRAMA 5 ........................................................................................... 66 CROMATOGRAMA 6 ........................................................................................... 66 CROMATOGRAMA 7 ........................................................................................... 67 ÍNDICE DE TABLAS TABLA 1 ................................................................................................................. 12 TABLA 2 ................................................................................................................. 17 TABLA 3 ................................................................................................................. 20 TABLA 4 ................................................................................................................. 20 TABLA 5 ................................................................................................................. 23 TABLA 6 ................................................................................................................. 27 TABLA 7 ................................................................................................................. 37 TABLA 8 ................................................................................................................. 42 TABLA 9 ................................................................................................................. 51 TABLA 10 ............................................................................................................... 51 TABLA 11 ............................................................................................................... 53 TABLA 12 ............................................................................................................... 54 RESUMEN METABOLISMO DE ALBENDAZOL Y POLIMORFISMO MOLECULAR DEL CITOCROMO P4503A4 El polimorfismo genético juega un papel crítico en la variabilidad interindividual de la expresión del citocromo P4503A4 (CYP3A4), enzima involucrada en el metabolismo de al bendazol, la cual podría estar asociada a l as diferencias individuales reportadas en la biodisponibilidad de dicho fármaco; por tal motivo es de mi interés detectar el polimorfismo genético en la población mexicana, y evaluar si el polimorfismo está asociado a l a variabilidadinterindividual del metabolismo del albendazol. Para alcanzar mi objetivo se realizó el proyecto en dos etapas, en la primera se determinó el genotipo de dos variantes alélicas, una de la región reguladora (CYP3A4*1B) y la otra de l a región codificadora (CYP3A4*2) respectivamente. Para CYP3A4*1B se genotipifico 158 individuos y para CYP3A4*2 153 individuos. De las 158 muestras genotipificadas por RFLP’s para CYP3A4*1B, 132 resultaron ser homocigotos (A/A), dos homocigotos para otro alelo (G/G), y 24 heterocigotos (A/G), los cuales presentan una frecuencia del 9 %. De las 153 m uestras analizadas para CYP3A4*2, 78 resultaron homocigotos (T/T), y 75 heterocigotos (T/C), lo que representa una frecuencia del 25%. En una segunda etapa se determinó parámetros farmacocinéticos del albendazol en el que se cuantificaron los metabolitos de albendazol por medio de cromatografía de líquidos de alta resolución (HPLC), para ésta etapa se contó con la colaboración de once voluntarios sanos, los cuales tomaron una dos is de 400 mg de albendazol con objeto de desparasitarse. La cuantificación de metabolitos de albendazol se realizó por medio de HPLC, determinando la concentración plasmática de sulfóxido de albendazol y sulfona de albendazol no determinando albendazol. Se encontró una variabilidad metabólica de sulfóxido de al bendazol, ya que l a concentración máxima se presentó en un rango de 80 a 400 ng /ml, aún cuando se suministró la misma dosis de albendazol cada uno de los once individuos; una variación similar se observó en un estudio realizado por Helgi Jung 1992. El individuo que presentó una concentración máxima de 400ng/ml de sulfóxido de albendazol tiene un genotipo heterocigoto para CYP3A4*1B y CYP3A4*2, cabe resaltar que otro individuo presenta la mínima concentración encontrada del mismo metabolito es 80ng/ml también presento la misma estructura heterocigoto, un individuo mas presento la misma concentración resulto homocigoto para CYP3A4*1B y heterocigoto para CYP3A4*2 otro individuo más con el mismo genotipo anterior presento una concentración intermedia de 180 ng/ml. Por lo tanto de lo anterior se infiere que estos polimorfismos no explican la variación encontrada en e l metabolismo de albendazol, como alternativa se propone a los polimorfismos de CYP1A1 como candidato para explicar la variación de metabolismo de a lbendazol, así como determinar si el albendazol es sustrato de CYP3A5. ABSTRACT albendazole metabolism and molecular cytochrome P450 3A4 polymorphism Genetic polymorphism plays a c ritical role in the interindividual variability of expression of cytochrome P450 3A4 (CYP3A4), an enz yme involved in the metabolism of albendazole, which could be r elated to individual differences reported in the bioavailability of said drug; for this reason is my interest to detect genetic polymorphism in Mexican population, and to assess whether the polymorphism is associated with interindividual variability of the metabolism of albendazole. To reach my goal the project was conducted in two stages, the first two allelic genotype variants, one of the regulatory region (CYP3A4 * 1B) and the other of the coding region (CYP3A4 * 2) respectively were determined. To CYP3A4 * 1B and CYP3A4 158 individuals * 2153 individuals were genotyped. Of the 158 samples genotyped by RFLP's for CYP3A4 * 1B, 132 were found to be homozygous (A / A), two homozygous for the other allele (G / G), 24 heterozygous (A / G), which have a frequency of 9%. Of the 153 samples analyzed for CYP3A4 * 2, 78 were homozygotic (T / T), and 75 heterozygous (T / C), which represents a frequency of 25%. In a s econd step pharmacokinetics of albendazole in which the metabolites of albendazole were quantified by liquid chromatography (HPLC) for this stage he was assisted eleven healthy volunteers was determined, which took a dose 400 mg of albendazole in order to worming. Metabolite quantification was performed albendazole by HPLC, determining plasma concentrations of albendazole sulfoxide and s ulfone albendazole albendazole not determining. Metabolic variability found albendazole sulfoxide, since the maximum concentration was in a range of 80 to 400 ng / ml, even when the same dose of albendazole each eleven individuals was supplied; A s imilar variation was observed in a study by Helgi Jung 1992. The individual who filed a m aximum concentration of 400ng / ml albendazole sulfoxide has a het erozygous genotype for CYP3A4 * 1B and CYP3A4 * 2, it should be not ed that another individual has found a high concentration of the metabolite is 80ng / ml also presented the same structure heterozygote, an individual more I present the same concentration resulted homozygous for CYP3A4 * 1B and CYP3A4 * 2 heterozygous for another individual's genotype with the same above I present an intermediate concentration of 180 ng / ml. Therefore from the above it follows that these polymorphisms do not explain the variation found in the metabolism of albendazole as an alternative is proposed CYP1A1 polymorphisms as candidate to explain the variation in metabolism of albendazole and albendazole is whether the substrate of CYP3A5. 1 INTRODUCCIÓN 1. VARIABILIDAD METABÓLICA El fundamento genético de l a variabilidad en la respuesta a l os medicamentos en l a especie humana, una de l as causas es el polimorfismo genético, definido como una variación en la secuencia del ADN que se encuentra en más del 1% de los individuos de una población (Relling MV, 2006). Dicha variación puede ser de varios tipos: a) Por la simple sustitución de una base, donde un solo nucleótido (A, C, G ó T) es reemplazado por otro (single nucleotide polymorphisms: SNPs). b) Por inserción o d eleción de una bas e en el ADN o de un conjunto de bases, en núm ero de c ientos a miles. (deletion insertion polymorphisms: DIPs). c) Inserción o deleción, repetidas veces, de una o más bases, constituyendo los denominados microsatélites. (short tandem repeats: STRs). En lo que respecta a los SNP, son ya alrededor de cuatro millones los registrados en las bases de datos, a las que se puede acudir en consulta para su actualización, suponen alrededor de 90% de la variación genética y se encuentran dispersos por todo el genoma humano. La consecuencia genotípica para un determinado individuo, dependerá de la localización en el gen de los citados SNP, que podremos resumirlos así: a) Que se sitúe en l a región codificadora del gen, con la consiguiente alteración de la secuencia de los aminoácidos de la proteína codificada, lo que puede afectar a su estructura y, por tanto, a su papel fisiológico en el 2 organismo humano; dando como resultado disminución, pérdida o incremento de s u función (por ejemplo, se modifica la afinidad de u n receptor o la actividad de una enzima por el fármaco). b) Que se sitúe el SNP en la región reguladora del gen, lo que puede conllevar que se vea afectada la capacidad de enlace de los factores de trascripción al gen y, en definitiva, que s e vean afectados los niveles normales de expresión del citado gen y la consiguiente cantidad de proteína expresada. c) Que se localicen en las regiones no-codificadoras del genoma, en c uyo caso está por conocer el impacto que pueden tener sobre el fenotipo de un individuo, aunque su estudio es del mayor interés como marcadores en la identificación forense y en determinados procesos patológicos de or igen genético. d) Se pierde el gen o, por el contrario, se producen varias copias de él, lo que se traduce en aus encia o excesivas cantidades de enz ima y, en consecuencia, el portador será un metabolizador lento o ultrarápido de los fármacos sustratos de la enzima (Relling MV, 2006). Este fenómeno es relativamente frecuente en los genes que expresan dianas farmacológicas (receptores,canales iónicos) y proteínas las cuales están involucradas en el metabolismo o transporte de los fármacos y metabolitos. Esto condiciona en parte, la aparición de respuestas diferentes al mismo fármaco como consecuencia de una alteración a nivel de la farmacodinámica y la farmacocinética que resulta de la expresión de un determinado polimorfismo genético en las enzimas que metabolizan los fármacos, transportadores de 3 membrana y/o en los receptores farmacológicos (Meyer & Zanger, 1997), (Ingelman-Sundberg, 2001). La genética molecular y la genómica han transformado la farmacogenética en la pasada década. Los dos alelos que porta un individuo para un gen determinado, hacen referencia al genotipo, el cual es caracterizado a nivel de DNA. La influencia que ejerce este genotipo sobre la cinética de un fármaco o la función de los receptores, es lo que se denomina fenotipo, el cual puede medirse mediante métodos analíticos para la detección de metabolitos o mediante sofisticadas investigaciones clínicas, por ejemplo estudios de densidad de u n receptor mediante tomografía de emisión de positrones. Los estudios moleculares en fármaco-genética comenzaron con la caracterización de CYP2D6, se han extendido a numerosos genes humanos, incluyendo más de 20 enzimas metabolizadoras de fármacos, receptores y varios sistemas transportadores de fármacos (Gonzalez et al., 1988), (Meyer & Zanger, 1997). Determinadas variantes alélicas pueden diferir en el gen (silvestre), en una o varias mutaciones, la pérdida de un fragmento de DNA en el gen (deleción) o duplicación. Las mutaciones pueden tener efecto sobre la actividad de una enzima o bien codificar enzimas con menor actividad o ausencia de la misma; las duplicaciones del gen conducen a un incremento en la actividad. También causas farmacocinéticas (absorción, distribución, metabolización y excreción que puede determinar diferentes intensidades y duraciones de l a respuesta) o bien a causas farmacodinamicas (en la interacción fármaco-receptor). Cada uno de estos factores farmacocinéticos y farmacodinámicos puede ser diferente de un individuo a otro a causa de determinantes genéticos, ambientales 4 o patológicos, y depende también de la gravedad o intensidad de la enfermedad o síntoma que se desea tratar. La farmacogenética constituye el estudio de las variaciones genéticamente determinadas en relación con la respuesta a los fármacos. Esta variabilidad puede influir en la respuesta farmacológica y en la susceptibilidad a sufrir efectos adversos e incluso en la capacidad de padecer enfermedades inducidas por medicinas, también algunos tipos de cáncer producidos por productos químicos. La capacidad de cada persona para metabolizar una sustancia está determinada fundamentalmente por la constitución genética individual y el medio ambiente (Fig. 1). Figura 1.- Factores que influyen en la respuesta farmacológica. FIGURA 1.- El medio ambiente, Factores fisiológicos, factores patológicos y la genética afectan la respuesta que un individúo tiene al ser tratado con un fármaco. FACTORES PATOLÓGICOS Hepatitis, cirrosis, cáncer hepático, enfermedad renal o tiroidea… GENÉTICA Control poligénico, Monogénico, enzimas, Receptores,… RESPUESTA FÁRMACO MEDIO AMBIENTE Tabaco, alcohol, nutrición, fármacos, agentes contaminantes... FACTORES FISIOLÓGICOS Sexo, edad, embarazo, ejercicio físico... 5 Por otro lado, se puede clasificar la variabilidad según concierna al propio individuo (intraindividual) o a su relación con el resto de la población (interindividual). Los individuos también se diferencian en cuanto a sus estilos de vida aparte de los factores mencionados anteriormente. Al mismo tiempo, las condiciones somáticas de un individuo pueden cambiar con el tiempo; los factores nutricionales, automedicación y ejercicio, v a r í a día a día, o incluso hora a hora. Los factores genéticos son importantes porque pueden causar cambios en la estructura y función de las diferentes dianas farmacológicas. Es claro que la acción de cada fármaco en cada individuo y en cada momento depende de un cúmulo de factores mutuamente interrelacionados y susceptible de s er modificados también por otros factores endo y exógenos implicados en l a fisiología y patología de cada individuo en d icho momento. Por ello, podemos afirmar que la respuesta farmacológica en un pac iente, es una respuesta de carácter poligénico con una modulación ambiental particular en cada individuo. Los i nd i v i du os p o r s u f o r m a d e m e t ab o l i z a r s e h an ag r u pa do c o m o : metabolizadores rápidos (individuos homocigotos o heterocigotos para el genotipo silvestre), los metabolizadores intermedios o metabolizadores lentos (son portadores de dos alelos con menor actividad o con pérdida de función respectivamente), y los metabolizadores ultra-rápidos (son portadores de genes activos duplicados) (Raimundo et al., 2000), (Ingelman- Sundberg M, 1999), (Meyer & Zanger, 1997). 6 El fenotipo metabolizador lento para la mayoría de los genes polimórficos es tratados como autosómico recesivo, requiriendo la presencia de d os alelos mutantes. Cuando la respuesta a un tratamiento es monogénica (depende de un gen), el efecto fenotípico presentado, divide a la población en dos o tres grupos distintos. Sin embargo, la respuesta de la mayoría de los fármacos no es monogénicas, sino que implican múltiples genes. Un método sencillo para distinguir entre los componentes de la variabilidad hereditaria o ambiental es la comparación de monocigotos o dicigotos en gemelos, así como la repetición en la administración de fármacos y comparación de la variabilidad en la respuesta intra e interindividual (Kalow W, 1998). Las técnicas han revelado importantes factores genéticos en la farmacocinética de medicamentos tales como dicumarol, halotano, fenitoína, tolbutamida y midazolam. La capacidad de predecir las diferencias interindividuales en la eficacia de un fármaco o su toxicidad, basado en factores genéticos será una importante herramienta para tratamientos farmacológicos. Las reacciones que sufren los fármacos durante su metabolismo se encuentran divididas en dos fases: a) Las reacciones de l a fase I son aquellas en las cuales las enzimas que participan causan un c ambio en l a molécula del fármaco; por ejemplo reacciones de oxidación, reducción o hidrólisis. Estas incluyen a las reductasas, oxidasas e hidrolasas. Los citocromos P450 pertenecientes a las familias 1, 2 y 3 participan en el 70-80% de todas las reacciones metabólicas de fase I 7 relacionadas con la biotransformación de los fármacos, que se utilizan habitualmente en la práctica clínica. b) Las reacciones de la fase II, las cuales comprenden todas las enzimas que son transferasas ya que transfieren grupos como sulfatos, glutatión, aminoácidos y metilos a los fármacos que han sido metabolizados por enzimas de la fase I (Gonzalez & Gelboin, 1994). Estas enzimas llevan a cabo reacciones de conjugación, en las cuales hay formación de una combinación entre el fármaco y el metabolito producido en las reacciones de fase I. La mayoría de los fármacos son metabolizados por enzimas de Fase I de las cuales el Citocromo P450 es el más representativo. (Ball et al., 1999). 1.1.- CITOCROMO P450 (CYP450) Hay muchos mecanismos por los cuales un fármaco puede ser modificado en el organismo a través de procesos fármaco-cinéticos de absorción, distribución, metabolismo (hepático e intestinal fundamentalmente) y eliminación, con la correspondiente repercusión a nivel fármaco-dinámico, y en la respuesta farmacológica. Nuestro estudio se centra en el metabolismo de los medicamentos, fundamentalmente en el metabolismo hepático. El hígadoes el principal órgano relacionado con el metabolismo de los fármacos, los sustratos para las enzimas pueden tener alteraciones en actividad por inducción o inhibición de los sistemas enzimáticos microsomales hepáticos. Los sistemas enzimáticos promueven la eliminación de sustancias liposolubles al ser transformadas en compuestos más polares que son excretados 8 de forma sencilla del organismo a través de la orina o bilis (Caccia & G arattini, 1990) Los fármacos hidrosolubles se eliminan sin modificarse por la orina y permanecen poco tiempo en el organismo, sin embargo; los fármacos liposolubles no son metabolizados tan fácilmente y permanecen más tiempo en el organismo. Los principales citocromos P450 (CYP) relacionados con el metabolismo de medicamentos pertenecen a las familias CYP1, CYP2 y CYP3 (Brosen, 1995).Así la actividad de éstas enzimas varía entre los individuos y entre grupos étnicos. La deficiencia de un enzima metabolizadora de fármaco, conduce a un aumento en el riesgo de toxicidad farmacológica debido a una eliminación deficiente de dicho fármaco, como se muestra en la figura 2. FIGURA 2.-Papel de las enzimas metabolizadoras de fármaco, en la bioactivación y biodesactivación de fármacos en el metabolismo de fase I y fase II. (Pirmohamed M, 1996). Proceso de reparación Genotoxicidad Sensibilización Bioactivación Citotoxicidad Metabolito reactivo Bioinactivación Metabolitos estables Metabolismo de Fase II Metabolismo de Fase I (Citocromos) Fármaco Necrosis Carcinogenicidad Teratogenicidad Hipersensibilidad 9 En 1958, Klingenberg descubrió un pigmento al que más tarde se llamó CYP450, (Klingenberg, 1958). Omura y Sato (Omura & Sato, 1964b), ( O m u r a & S a t o , 1 9 6 4 a ) , demostraron que el pigmento era un citocromo y lo llamaron P450, ya que presentaba un pico espectral a 450 nm cuando se reducía y se enlazaba con el monóxido de carbono. Uno de los procesos más importantes en el metabolismo de fármacos es la oxidación, y el principal sistema enzimático que lleva a cabo esta función son las monoxigenasas de función mixta. Este sistema enzimático se encuentra localizado en los mamíferos en el retículo endoplásmico y las membranas mitocondriales. En general, las monoxigenasas de función mixta comprenden: una hemoproteína, denominada P450, un componente flavoprotéico (NADPH citocromo P450 reductasa) y un componente lipídico (Woolf & Jordan, 1987), (Fig.3). R: sustrato FIGURA 3.- Sistema monoxigenasa en el retículo endoplásmico. 10 Se han descrito 481 genes y 22 pseudogenes del citocromo P450, agrupándose en 74 familias (Nelson et al., 1996). Existe una clasificación sistemática que agrupa en familias y subfamilias. La secuencia proteínica dentro de una familia es idéntica al menos en un 40% (p.e. CYP2A6 y CYP2B6), y las secuencias proteínicas dentro de una misma subfamilia son similares aproximadamente en un 55% (p.e. CYP2A6 y CYP2A7), (Nelson et al., 1996). De estas familias, 16 se han encontrado en mamíferos, dividiéndose a su vez en 26 subfamilias, 23 de las cuales han sido localizadas en el genoma humano. Estas últimas se podrían dividir en dos clases: aquellas familias que participan en la síntesis de esteroides y ácidos biliares y las que metabolizan xenobióticos. En humanos, existen tres familias mayoritarias (>40% homología) de las enzimas, de las cuales 7 isoformas son las responsables de la mayor parte del metabolismo mediado por citocromos: CYP1A2, CYP2A6, CYP2C8/9/10, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E1 y CYP3A4. La fracción correspondiente a cada isoforma ha sido caracterizada en microsomas hepáticos por Shimada y cols 1994, (Shimada, Yamazaki, Mimura, Inui, & Guengerich, 1994). En la f igura 4 se representa la contribución de las enzimas CYP más importantes al metabolismo de fármacos con relevancia clínica .El citocromo P450 (CYP450) es, asimismo, responsable de convertir algunos profármacos en sus metabolitos farmacológicamente activos. 11 FIGURA 4- Adaptado de Rendic y Di Carlo, 1997, (Rendic & Di Carlo, 1997). Hay hipótesis que dicen las enzimas P450 que metabolizan xenobióticos probablemente evolucionaron de l as esteroidogénicas para degradar oxidativamente sustancias químicas de la dieta que no eran fácilmente eliminables, a menos que se transformaran en derivados más hidrofílicos , (Nebert, Nelson, & Feyereisen, 1989),(Gonzalez & Meyer, 1991). En humanos, se han des crito hasta el momento 50 genes de P450 funcionales. A pesar de esta multiplicidad, la mayor parte del metabolismo de fármacos es realizada por un número relativamente pequeño de enzimas P450, de las cuales las familias más representativas son la 1, 2 y 3. 12 En la Tabla 1 se muestran algunas de las enzimas metabolizadoras de fármacos, así como sus sustratos. (Roses, 2000), (Evans, 2003) AINEs: Antiinflamatorios no esteroideos. AOs: Antidiabéticos orales. ARA II: Antagonistas de los receptores de angiotensina tipo II. HIV: Virus de la inmunodeficiencia humana. ENZIMAS SUSTRATOS CYP1A2 Antidepresivos: amitriptilina, clomipramina, fluvoxamina, imipramina, mianserina, mirtazapina Antipsicóticos: clozapina, haloperidol, olanzapina, tioridazina, Metilxantinas: cafeína, teofilina, Miscelánea: fenacetina, paracetamol, propanolol, ropivacaína, tacrina, R-warfarina, zolmitriptán. CYP2C9 AINES: celecoxib, diclofenac, ibuprofen, meloxicam, S-naproxen, piroxicam, suprofen, AOs: glibornurida, glipizida, rosiglitazona, tolbutamida, ARA II: irbesartán, losartán, Miscelánea: amitriptilina, fenitoína (4-OH), fluoxetina, fluvastatina, tamoxifen, torasemida, (S)- warfarina. CYP2C19 Antidepresivos: amitriptilina, citalopram, clomipramina, fluoxetina, imipramina, moclobemida,Antiepilépticos: diazepam, fenitoína, fenobarbitona, S-mefenitoína, Inhibidores bomba protones: lansoprazol, omeprazol, pantoprazol Miscelánea: carisoprolol, ciclofosfamida, hexobarbital, indometacina, R-mefobarbital, nelfinavir, nilutamida, primidona, progesterona, proguanil, propanolol, tenipósido, (R)-warfarina. CYP2D6 Antiarrítmicos: diltiazem, encainida, esparteína, flecainida, lidocaína, mexiletina, propafenona Antidepresivos: amitriptilina, clomipramina, desipramina, fluoxetina, fluvoxamina, imipramina, maprotilina, mianserina, minaprina, nortriptilina, paroxetina, trazodona, venlafaxina, Antipsicóticos: clorpromazina, haloperidol, perfenazina, olanzapina, remoxiprida, risperidona, sertindol, tioridazina, zuclopentixol, Beta-bloqueantes: alprenolol, bufuralol, carvedilol, S-metoprolol, pindolol, propanolol, timolol, Miscelánea: anfetamina, clorfeniramina, codeína, debrisoquina, dexfenfluramina, dextrometorfán, fenacetina, fenformina, guanoxán, metoclopramida, metoxianfetamina, ondansetrón, perhexilina, tamoxifén, tramadol. CYP3A4 Antiarrítmicos: lidocaína, propanolol, quinidina, Antidepresivos: amitriptilina, clomipramina, imipramina, mirtazapina, nefazodona, sertralina, trazodona, Anti HIV: indinavir, nelfinavir, ritonavir, saquinavir, Antihistamínicos: ebastina, astemizol, clorfeniramina, terfenadina, Antipsicóticos: clozapina, haloperidol, pimozida, risperidona, sertindol, quetapina, ziprasidona, Benzodiazepinas: alprazolam, diazepam, midazolam, triazolam Bloqueantes canales calcio: amlodipino, diltiazem, felodipino, lercanidipino, nifedipino, nisoldipino, nitrendipino, verapamil, Estatinas: atorvastatina, cerivastatina, lovastatina, sinvastatina Esteroides: (6-beta-OH): cortisol, estradiol, progesterona, testosterona Inmunosupresores: ciclosporina, tacrólimo (FK506), Macrólidos: claritromicina Procinético: cisaprida, Miscelánea: alfentanil, cocaína, dapsona, codeína, dextrometorfano, finasterida, irinotecán, metadona, odansetrón, omeprazol, quinina, salmeterol,sildenafilo, sirolimo, tamoxifén, taxol, vincristina, zolpidem 13 1.2 EL CITOCROMO P450 3A Los miembros de la subfamilia CYP3A, representan el grupo de enzimas metabolizadoras de fármacos más importante en humanos. Debido a que constituyen el 30% aproximadamente del contenido enzimático en el hígado y el elevado número de sustratos que metaboliza, así como los diversos órganos en los que se localiza. He centrado mi interés en esta subfamilia especialmente en las isóformas CYP3A4, con el fin de poder clarificar algunos aspectos sobre variabilidad interindividual y sus posibles repercusiones clínicas. Las isoenzimas de la subfamilia P450 (CYP3A) son las enzimas que predominan en la fase I del metabolismo de fármacos en el hombre. Además estas isoenzimas metabolizan compuestos como hormonas esteroideas, toxinas y carcinógenos, dichas enzimas están presentes en hígado y en tejido extrahepático (tracto gastrointestinal, placenta, útero, riñón, pulmón o cerebro), (Maenpaa, Syngelma, Honkakoski, Lang, & Pelkonen, 1991),(Watkins, 1994), (Rendic & Di Carlo, 1997), (Farin & Omiecinski, 1993).Esta subfamilia se compone de al menos 3 genes diferentes: CYP3A4, CYP3A5 y CYP3A7, CYP3A43 también se ha identificado recientemente, aunque su importancia metabólica es, por ahora, más que discutible (Farin & Omiecinski, 1993). El CYP3A4 representa el 30% del total del citocromo P450 en el hígado (Wrighton & Stevens, 1992), CYP3A5, también está presente en el hígado, intestino, riñón (Haehner et al., 1996), (Schuetz et al., 1992), pulmón (Kivisto et al., 1996), próstata (Yamakoshi, Kishimoto, Sugimura, & Kawashima, 1999), mama (Huang, Fasco, Figge, Keyomarsi, & Kaminsky, 1996) y en leucocitos 14 polimorfonucleares (Janardan, Lown, Schmiedlin-Ren, Thummel, & Watkins, 1996), el CYP3A4 y el CYP3A5 t i e n e n una actividad catalítica muy similar, el CYP3A7 es la forma enzimática predominante en el hígado fetal humano, representando alrededor del 50% del CYP450 hepático fetal total (Wrighton & Stevens, 1992), (Nelson et al., 1993). A partir del primer año de edad CYP3A7 reduce sus niveles en el hígado hasta niveles mínimos (Tateishi et al., 1997). Debido a la gran similitud catalítica entre CYP3A4 y CYP3A5, así como a la casi exclusiva localización fetal de CYP3A7. Estas enzimas se suelen denominar conjuntamente como CYP3A. Hay una gran cantidad de fármacos metabolizados por esta enzima, la importancia clínica de este citocromo es obvia (tabla I). Por ejemplo, en la terapia farmacológica post-trasplante, muchos de los immunosupresores utilizados como tacrolimo o ciclosporina, son sustratos de CYP3A, y a menudo de la glicoproteína P (P-gp) en el tracto gastrointestinal, de manera que el uso de otros fármacos en dicha terapia, así como esteroides, que alteren la actividad de CYP3A y/o P-gp, pueden afectar a los niveles del inmunosupresor, demandando un ajuste de su dosis para alcanzar el efecto terapéutico o evitar efectos adversos (Anglicheau et al., 2003). La participación de CYP3A en el metabolismo de la mayor parte de las estatinas hace que la inhibición de la enzima sea clave en el aumento de los niveles plasmáticos de estos hipocolesterolemiantes provocando así un riesgo de miopatía que potencialmente puede llegar a ser fatal (Vlahakos, Manginas, Chilidou, Zamanika, & Alivizatos, 2002).Se han observado efectos adversos tras el aumento de los niveles plasmáticos de ciertos sustratos de CYP3A (ejemplo: 15 terfenadina, astemizol o cisaprida) debido a la administración de fármacos u otras sustancias inhibidoras de su metabolismo (Monahan et al., 1990), (Tsai, Tsai, & Chen, 1997). La alteración de la actividad enzimática de CYP3A, produce consecuencias clínicas beneficiosas, por ejemplo el aumento controlado de los niveles de ciclosporina mediante inhibición de su metabolismo reduce la dosis necesaria de inmunosupresor incrementando la eficacia, éste es el caso de la terapia combinada de los inhibidores de la proteasa ritonavir y saquinavir, la eficacia del tratamiento aumenta exponencialmente en comparación con la monoterapia, probablemente por la inhibición combinada de CYP3A4 y P-gp (First et al., 1993), (Merry et al., 1997). En la biodisponibilidad oral de varios sustratos de CYP3A como el midazolam, se observan grandes diferencias tanto inter como intraindividuales atribuibles a un metabolismo de primer paso. Este efecto de primer paso se atribuía en principio mayoritariamente al hígado, el descubrimiento de que CYP3A4 está presente en gran medida en el epitelio luminal del intestino delgado (Watkins, Wrighton, Schuetz, Molowa, & Guzelian, 1987), (Kolars, Schmiedlin-Ren, Schuetz, Fang, & Watkins, 1992), (Kolars et al., 1994) ha provocado que se reconozca también la contribución del intestino al metabolismo de primer paso. Este efecto de primer paso es de especial importancia, si el sustrato tiene un estrecho margen terapéutico, como por ejemplo es el caso de la ciclosporina (BD, 1985), (Ptachcinski, Venkataramanan, & Burckart, 1986). En resumen, el citocromo CYP3A comprende el grupo más importante de enzimas metabolizadoras de fármacos que existe. Descubrir las bases 16 de la gran variabilidad interindividual observada, ya sea por causas genéticas, ambientales, o c ausada por xenobióticos, puede ayudar a evitar numerosas interacciones de ef ectos adversos o fallos terapéuticos clínicamente importantes. 1.3 POLIMORFISMO GENÉTICO DE CYP3A El estudio del aclaramiento de fármacos mediado por CYP3A es extenso, debido a la importante contribución de CYP3A al metabolismo de primer paso y la baja biodisponibilidad sistémica de los fármacos administrados oralmente (Paine et al., 1997), y también como consecuencia de la susceptibilidad de CYP3A a los efectos de numerosos fármacos que pueden inducir como inhibir su actividad catalítica (Guengerich, 1997), (Thummel & Wilkinson, 1998). Para muchos fármacos la actividad del CYP3A contribuye a la mayor parte del aclaramiento total corporal. De acuerdo con esto, la variabilidad interindividual en el contenido de la enzima o su función tiene u n efecto sobre la exposición sistémica a un fármaco y, potencialmente sobre la eficacia y seguridad del mismo. En adultos el CYP3A4 es la enzima dominante en hígado e intestino delgado (aparte de otros órganos) pero su expresión es claramente polimórfica, lo cual hace que los individuos presenten unos niveles de proteína relativamente altos o bajos(Paine et al., 1997), (Wrighton SA, 1990). CYP3A5 se encuentra también polimórficamente expresado en hígado fetal (Hakkola et al., 2001). 17 Las variaciones genéticas encontradas en la región promotora, exones o intrones del gen pueden repercutir en el nivel de función de la proteína CYP3A4, aunque en todos los adultos estudiados se ha detectado la longitud completa del mRNA. Gonzalez et. al. identificaron hasta cinco polimorfismos diferentes de un solo nucleótido (SNPs) en la región reguladora-5’ de CYP3A4 (tabla 2), (Gonzalez et al., 1988),(Sata et al., 2000), (Kuehl P, Wrighton SA, & Strom S, 2001) a (Westlind- Johnsson A, 2003). Tabla 2. - Polimorfismos de CYP3A4 VARIENTE ALÉLICA CAMBIO DE NUCLEÓTIDO CAMBIO DE AMINOÁCIDO REFERENCIA CYP3A4*1A (Alelo silvestre) ----------------------- ------------------------ (Gonzalez et al ., 1988)Gonzalez et al, 1998 CYP3A4*1B -392 A>G ------------------------- Sata et al 2000 CYP3A4*1C -444 T>G ------------------------ Kuehl et al, 2001 CYP3A4*1D -62 C>A ------------------------- Kuehl et al, 2001 CYP3A4*1E -369 T>A ------------------------- Hamzeiy et al, 2002 CYP3A4*1F -747 C>G ------------------------- Hamzeiy et al, 2002 CYP3A4*1G 20230 G>A ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1H 20230 G>A 26206 C>A ------------------------- Fukushima-Uesakaet al, 2004 CYP3A4*1J 6077 A>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1K -655 A>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1L -630 A>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1M -156 C>A ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1N 14200 T>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1P 15727 G>A ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1Q 15809 T>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1R 16775 A>G ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 18 CYP3A4*1S 17816 A>T ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*1T 26013 T>C ------------------------- Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*2 15713 T>C S222P Sata et al, 2000 CYP3A4*3 T>C M445T Sata et al, 2000 CYP3A4*4 A>G I118V Hsieh et al,2001 CYP3A4*5 C>G P218R Hsieh et al,2001 CYP3A4*6 Ins A Corrimiento de lectura Hsieh et al,2001 CYP3A4*7 6004 G>A G56D Eiselt et al, 2001 CYP3A4*8 13908 G>A R130Q Eiselt et al, 2001 CYP3A4*9 14292 G>A V170I Eiselt et al, 2001 CYP3A4*10 14304 G >C D174H Eiselt et al, 2001 CYP3A4*11 21867 C>T T363M Eiselt et al, 2001 CYP3A4*12 C>T L373F Eiselt et al, 2001 CYP3A4*13 C>T P416L Eiselt et al, 2001 CYP3A4*14 T>C L15P Lamba et al, 2002 CYP3A4*15ª G>A R162Q Lamba et al, 2002 CYP3A4*15B A>G, R162Q Hamzeiy et al 2002 CYP3A4*16ª 15603 C>G T185S Lamba et al, 2002 CYP3A4*16B 20230 G>A T185S Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*17 T>C F189S Dai et al, 2001 CYP3A4*18ª 20070 T>C L239P Dai et al, 2001 CYP3A4*18B 20230 G>A L239P Fukushima-Uesaka et al, 2004 CYP3A4*19 C>T P467S Dai et al, 2001 CYP3A4*20 25889 ins A Frameshift Westlind-Johnsson et al 19 Son pocas las variantes que af ectan la transcripción o l a actividad catalítica del CYP3A4 comparados con el alelo silvestre CYP3A4*1A; las variantes CYP3A4*1B, CYP3A4*2, CYP3A4*4, CYP3A4*5 y CYP3A4*18, se han as ociado con una alteración en la actividad catalítica. La variante CYP3A4*1B presenta un cambio de A-392G (CYP3A4*1B) en la caja de nifedipina (NFSE) localizada en la región 5´ del gen CYP3A4 (Walker AH & Weber BL, 1998). Rodríguez et al. reportaron una disminución en la capacidad para hidroxilar quinina y en la afinidad de unión a factores de transcripción provocando una reducción en la actividad transcripcional (Rodríguez-Antona C, 2005). La variante alélica CYP3A4*2 consiste en una s ustitución de timina por citosina (T673C) en el exón 7, provocando un cambio de aminoácido de serina por prolina en el codón 222 (Ser222Pro). En un estudio in vitro, midiendo la actividad de oxidación de nifedipina, se encontró disminución en la actividad catalítica de la proteína variante CYP3A4*2 en comparación con la enzima silvestre CYP3A4*1A (Sata et al., 2000). La variante alélica CYP3A4*4 presenta una s ustitución de adenina por guanina en el codón 359 ( A359G en el exón 5), produciendo un cambio de Ile118Val. La variante CYP3A4*5 tiene un cambio de C653G en el exón 7, dando un c ambio de am inoácido de Pro218Arg (Hsieh KP, 2001), estas variantes tienen menor capacidad de biotransformar el cortisol a 6β-hidrocortisol. La variante CYP3A4*18 tiene una sustitución de T878C en el exón 10 provocando un cambio de Leu293Pro (leucina por prolina en el codón 293); en un estudio in vitro se demostró que la variante da l ugar a una pr oteína con mayor capacidad para metabolizar clorpirifos y la testosterona, comparándola con la variante silvestre CYP3A4*1A (Dai D, 2001). 20 La frecuencia de l as variantes CYP3A4*12 y CYP3A4*1B han sido determinadas en diferentes poblaciones en la tabla 3, se muestran las frecuencias de grupos raciales. Tabla 3.- Frecuencias de la variante CYP3A4*1B. (Tayeb MT & Ofori-Adjei D, 2000),(Ball et al., 1999),(Walker AH & Weber BL, 1998),(Paris et al., 1999),(Sata et al., 2000),(Cavaco I, 2003),(Reyes Hernández, 2004). POBLACIÓN No DE ALELOS ANALIZADOS FRECUENCIAS DE LA VARIANTE CYP3A4*1B REFERENCIA Ghaneses 200 69% Tayeb et al, 2000 Africanos-E.U. 372 55% Ball et al, 1999 Africanos-E.U. 180 67% Ball et al, 1999 Africanos-E.U. 140 53% Walker et al 1998 Africanos-E.U. 232 55% Paris et al, 1999 Africanos-E.U. 150 66% Sata et al, 2000 Escoceses 202 5% Tayeb et al, 2000 Caucásicos-E.U. 546 4% Ball et al, 1999 Caucásicos-E.U. 376 9% Ball et al, 1999 Caucásicos-E.U. 264 4% Walker et al 1998 Caucásicos-E.U. 234 9% Paris et al, 1999 Caucásicos-E.U. 118 4% Sata et al, 2000 Caucásicos-Portugal 100 4% Cavaco et al, 2003 Asiáticos-E.U. 154 0.0% Ball et al, 1999 Asiáticos-E.U. 156 0.0% Ball et al, 1999 Asiáticos-E.U. 160 0.0% Paris et al, 1999 Asiáticos-E.U. 118 0.0% Sata et al, 2000 Asiáticos-Taiwán 204 0.0% Hseih et al, 2001 Hispanos-E.U. 242 11% Paris et al, 1999 Mestizos Mexicanos 138 8.8% Octavio D. Reyes et al, 2004 Esta variante está asociada con la susceptibilidad a desarrollar cáncer de próstata en la población de r aza negra (Miller, 1996), los afro-americanos son quienes presentan la frecuencia más alta, en todo el mundo siendo los asiáticos los que tienen la menor frecuencia. Tabla 4 Frecuencias de la variante CYP3A4*2 (Sata et al., 2000),(Reyes Hernández O.D; Arteaga Illán, 2004). POBLACIÓN No DE ALELOS ANALIZADOS FRECUENCIA CYP3A4*2 (%) REFERENCIA Finlandesa 55 2.7 Sata et al, 2000 China 54 0 Sata et al, 2000 Negra 53 0 Sata et al, 2000 Mexicana 138 0 Reyes et al, 2004 21 1.4 POLIMORFISMOS DE CYP 3A5 El CYP3A5 pertenece a l a Familia 3A la cual comparte sustratos con CYP3A4 y también presenta polimorfismos. La secuencia de CYP3A5 fue descrita de forma independiente por Schuetz, (Aoyama et al., 1989), (Schuetz JD, 1989). El alelo correspondiente a este cADN y la correspondiente proteína expresada fueron designados como el genotipo silvestre, CYP3A5*1A. Las modificaciones encontradas en la región reguladora-5’ correspondientes a CYP3A5*1A, fueron notablemente menores comparadas con el gen CYP3A4 (Lamba JK, 2002).En el CYP3A5, se halla el polimorfismo de un único nucleótido (SNP) más frecuente y funcionalmente importante, el cual consiste en un cambio de base A6986G dentro del intrón 3, representado por CYP3A5*3 (Kuehl P et al., 2001). Según Hustert e t . a l . el genotipo CYP3A5*3/*3 es perfectamente concordante con niveles indetectables de proteína hepática CYP3A5 (Hustert E, 2001). Además, la homocigosis para el alelo CYP3A5*3 está fuertemente asociada con un bajo contenido proteico de CYP3A5 en hígado de afro- americanos y en la mucosa intestinal de caucásicos (Kuehl P et al., 2001). Como puede observarse en la tabla 4, la variante alélica CYP3A5*3 (G6986) es común a todos los grupos étnicos estudiados, aunque se encuentre presente en diferentes frecuencias alélicas. En este caso, la variante alélica es más prevalente que el alelo wild type para la mayoría de las poblaciones. Centrándonos en el alelo funcional CYP3A5*1 (A6986), la frecuencia en caucásicos es del 5-15% y en afro-americanos del 45-73% (Hustert E, 2001),(Kuehl P et al., 2001). 22 Los resultados de Hustert et. al. informaron acerca de la frecuencia alélica A6986 en un 27% en población china y un 30% en coreanos (Hustert E, 2001). Los datos disponibles sugieren la existencia de una gran diversidad genética étnica para el alelo CYP3A5*1, lo cual puede tener importantes consecuencias clínicas. Existen mutaciones en los intrones 4 y 5 del gen cyp3 a5 que crean sitios de corte pudiendo afectar a la producción de mRNA mensajero (Kuehl P et al., 2001). El alelo CYP3A5*5 fue descrito por vez primera en la población china (Chou FC, 2001), representa la mutación T12952C sobre la transcripción de RNAm y se traduce en un descenso en la expresión de la proteína CYP3A5. CYP3A5*7 que representa una base de inserción en el exón 11 (27131-32insertoT), dando como resultado una proteína truncada (Chou FC, 2001), (Hustert E, 2001). Las variantes alélicas CYP3A5*6 y CYP3A5*7 ocurren a una relativamente baja frecuencia en caucásicos y chinos, pero son relativamente comunes entre afro-americanos (10-13%). Otros polimorfismos de CYP3A5 han sido descritos (Hustert E, 2001), aunque el haplotipo de estas mutaciones no ha sido todavía determinado. Algunos substratos de CYP3A4 pueden ser metabolizados por otras enzimas 3A, entre las cuales se encuentra el CYP3A5 (Tabla 5) (Aoyama et al; 1989),(Chou FC, 2001; Hustert E, 2001; Kuehl P et al., 2001). 23 Tabla 5.- Variantes alélicas de CYP3A5 Alelos Localización del nucleótido Sustitución del amino ácido Caucásicos Afro- america nos Otros Refs. CYP3A5*1A (Aoyama et.al. 1989) CYP3A5*1B 5’ UTR G-86ª 3% 0% (Kuehl et al., 2001) CYP3A5*1C 5’UTR C-74T 3% 7% (Hustert et al., 2001, Kuehl et al., 2001) CYP3A5*1D 3’UTR C31611T Hustert et al., 2001, Jounaidi et al., 1996) CYP3A5*2 Exón 11 C27289A T398N 1.9-5% 0% (Hustert et al., 2001, Jounaidi et al., 1996) CYP3A5*3A Entrón 3 A6986G C31611T DEFECTO DE CORTE 70% 27-50% Japoneses 71- 85%, Chinos 65-73%, Coreanos 70%, Mexicanos 75%. (Hustert et al., 2001, Kuehl et al., 2001) CYP3A5*3B Intron 3 A6986G C3705T H30Y 95% 27% (Hustert et al., 2001) CYP3A5*3C Intron 3 A6986G DEFECTO DE CORTE Japoneses 71% Chinos 73% Coreanos 70% (Hustert et al., 2001) CYP3A5*4 Exón 7 A14665G Q200R Chinos 0.9% (Chou et al., 2001) CYP3A5*5 Intron 5 T12952C DEFECTO DE CORTE Chinos 0.9% (Chou et al., 2001) CYP3A5*6 Exón 7 G14690A DEFECTO DE CORTE 0% 13% 0% (Hustert et al., 2001, Kuehl et al., 2001) CYP3A5*7 Exón 11 27131 ins T STOP CODON A 348 0% 10% 0% (Hustert y et al., 2001) CYP3A5*3B Intron 3 A6986G C3705T H30Y 95% 27% (Hustert y et al., 2001) * URT: región no codificadora del gen 24 2.1PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA Se ha encontrado variabilidad en el metabolismo de albendazol, sustrato del citocromo P4503A4, el cual metaboliza a sulfóxido de albendazol, razón por la cual se puede sugerir que las isóformas CYP3A4*1B y CYP3A4*2 p udieran estar involucradas en dicha variabilidad. 2.2 JUSTIFICACIÓN Los polimorfismos genéticos tienen una frecuencia diferente en c ada población de ahí la importancia de determinar dichas frecuencias polimórficas del gen CYP3A4 y sus variantes como C YP3A4*1B y CYP3A4*2 en la población mexicana. El polimorfismo genético de las isoformas de c itocromo P450 es probablemente, la base en la explicación de la heterogeneidad en la eficacia de diversos fármacos de us o común y en el manejo seguridad de l os agentes terapéuticos empleados en la clínica. 2.3 HIPÓTESIS La variabilidad metabólica (VM) observada en la sulfoxidación de albendazol (ABZ) es explicada por el genotipo de las formas alélicas CYP3A4*1B y CYP3A4 *2. 25 2.4 OBJETIVO GENERAL Determinar las frecuencias alélicas del CYP3A4*1B y CYP3A4 *2 en la población mexicana. 2.4.1OBJETIVOS PARTICULARES 1. Implementar una t écnica que me permita medir el albendazol y sulfóxido de albendazol en plasma. 2. Determinar si existe una c orrelación entre la variabilidad m etabólica del albendazol y los polimorfismos CYP3A4*1B y CYP3A4 *2. 26 2.5 ANTECEDENTES Uno de los sustratos de CYP3A4 es el albendazol (ABZ), el cual es un antilhelmitico ampliamente usado en México, tiene un amplio margen de seguridad, y se le conocen pocos efectos adversos. El albendazol es un derivado carbamato del benzimidazol. Relacionado con el tiabendazol y el mebendazol, su actividad antihelmíntica es atribuida, al igual que para otros benzimidazoles a su unión especifica con la beta-tubulina libre, evitando la polimerización del micro túbulo, e i nhibiendo la incorporación de gl ucosa por los transportadores dependientes de microtúbulos. Los benzamidazoles se unen a la beta-tubulina de los parásitos con mayor afinidad que a la de los mamíferos, determinando su carácter selectivo (E., 1988, 1990). El ABZ es biotransformado principalmente en el hígado por el citocromo P450 3A4 (CYP3A4) y por la flavin monoxigenasa (FMO) a su derivado sulfóxido de albendazol (ABZSO), es la forma farmacológicamente activa y embriotóxica (Virkel, 1999). Posteriormente el ABZSO es nuevamente modificado por el citocromo P450 1A1 (CYP1A1) en una s egunda S-oxidación formando la sulfona de albendazol (ABZSO2), que adem ás de no s er tóxica, ni farmacológicamente activa (P. Delatour, Parish, R. C. y Gyurik, R. J. , 1981),(R. J. Gyurik, Chow, A. W., Zaber, B., Bruner, E. L., Miller, J. A., Villani, A. J., Petka, L. A. y Parish, R. C. , 1981). Excreta a través de la orina, ABZ y ABZSO en pequeñas cantidades. Diversos estudios farmacocinéticos del ABZ han descrito una amplia variabilidad interindividual, medida mediante la determinación de la concentración de ABZSO en el plasma sanguíneo. 27 Tabla 6.-Resultado de seis trabajos independientes en los que miden la concentración máxima de ABZSO en plasma sanguíneo, muestra la variabilidad interindividual con respecto al metabolismo del ABZ. Número de individuos Analizados Cmax µg/mL Cmax µg/mL Cmax µg/mL Referencia 10 0.55 (1) 0.3-0.1 (7) 0.06 (2) Marriner 1986 (Marriner, Morris, Dickson, & Bogan, 1986) 6 0.44 (2) 0.16 (4) Lange 1988 (Lange, 1988) 8 3-1 (2) 0.4 (6) Jung, H 1990 (H. Jung, Hurtado, M., Medina, M. T., Sanchez, M. y Sotelo, J. , 1990) 18 2.5 (2) 1.1. (7) 0.34 (9) Jung H 1990 (H. Jung, Hurtado, M., Sanchez, M., Medina, M. T. y Sotelo, J. , 1990) 8 3 (1) 1.4 (4) 0.6 (3) Jung H 1992 (H. Jung, Hurtado, M., Sanchez, M., Medina, M. T. y Sotelo, J. , 1992) 10 2-1.2 (2) 0.59 (8) Sánchez, M. 1993 (Sánchez, 1993) Tabla 7. En las columnas 2,3, y 4 se muestra la concentración máxima de sulfóxido de albendazol, entre paréntesis el número de personas que presentan la misma concentración de sulfóxido de albendazol. Los trabajos citados muestran la amplia variabilidad interindividual en el metabolismo del ABZ, esta variabilidad metabólica (VM) se ha tratado de explicar sobre la base de un a diferente absorción del fármaco en el intestino (H. Jung, Medina, Garcia, Fuentes, & Moreno-Esparza, 1998), sin embargo, la VM también puede ser interpretada en función de los diversos participantes del proceso de S-oxidación del ABZ; es decir algunas formas alélicas de CYP3A4 producen variaciones en la expresión y en la actividad catalítica lo que permitirían explicar la VM descrita. Incluso la absorción del ABZ puede estar afectada por el metabolismo del ABZ en el intestino, ya que la enzima CYP3A4 está presente en el intestino, factores como la dieta pueden afectar la actividad enzimática por ejemplo el jugo de toronja es un inhibidor de esta enzima. La enzima CYP3A4 es responsable de más del 70% de la S-oxidación que da como resultado la formación del ABZSO (Rawden, 2000). La enzima CYP3A4 está involucrada en el metabolismo del 50% de los fármacos de consumo humano; constituye más del 50% del contenido total del P450 en hígado; y se expresa en 28 diversos tejidos, incluido el intestinal (Kolars et al., 1994), (Mckinnon RA, 1995). Por otra parte, la expresión de CYP3A4 es modificada por diferentes compuestos, siendo capaces de influir en el metabolismo de segundos compuestos no relacionados entre sí. Tal es el caso del antipsicótico bromoperidol, el cual es metabolizado por la CYP3A4, que en presencia de la dexametazona (DEX), aumenta su biotransformación, mientras que en pr esencia del antibiótico eritromicina se disminuye. La DEX actúa como un inductor de CYP3A4,mientras que la eritromicina es un r epresor de l a expresión del CYP3A4 (Wrighton SA, 1990). Previamente se ha bu scado correlacionar los diferentes polimorfismos del gen CYP3A4 con variaciones metabólicas observadas entre la población caucásica y asiática en cuanto a la oxidación de l a nifedipina in vivo e in vitro (Ahsan, 1991), se ha logrado identificar un pol imorfismo específico del gen para las diferentes actividades catalíticas de la enzima, se propone que las isoformas CYP3A4*1B y CYP3A4*2 son responsables de la variabilidad metabólica observada con el albendazol, en la población mexicana se desconoce la frecuencia alélica de estas dos formas polimórficas, existen otros posibles candidatos, de los cuales revisamos a continuación su posible importancia en la explicación a la VM, y su relevancia para el presente proyecto: a) La VM del ABZ se presenta tanto en mujeres como en hombres, el CYP3A4 y CYP3A5 comparten substratos, sin embargo, con respecto al metabolismo del ABZ, se desconoce el comportamiento de CYP3A5. b) El 30% del ABZSO es producto de la actividad de la FMO (27). Esta enzima tiene cinco isoformas en el humano, los tres miembros funcionales más 29 estudiados: FMO1, que no s e expresa en el adulto, el FMO3 que es la forma principal para el metabolismo de N-oxidación del tamoxifen, así como la más abundante en hígado, y la FMO5 presente en el adulto pero que no metaboliza el tamoxifen (Hodgson, 2000). En Corea se ha c orrelacionado la distribución alélica de t res formas del FMO3 con diferentes velocidades de metabolización por N-oxidación de la ranitidina, siendo 44.3% de los sujetos de estudio metabolizadores rápidos, 49.5% intermedios, y 6.2% metabolizadores lentos, siendo los homócigos para el alelo silvestre los metabolizadores rápidos (Kang, 2000). En nuestro país se desconoce la distribución alélica de FMO por lo cual es importante tener en cuenta la posible participación de sus variantes alélicas. Siendo que 30 % la sulfonación del ABZ es producida por la FMO, la FMO no incrementa su actividad en presencia de dexametazona, por estos argumentos consideramos a la FMO en un s egundo plano en r elación con CYP3A4 en la interpretación de la VM del ABZ. c) El sistema transportador dependiente de la glicoproteína-P (P-gp) comparte varios de sus substratos con CYP3A4, y está sujeta a una compleja regulación en la que puede pa rticipar la proteín cinasa C mediante la activación de oncoproteínas de la familia Ras (Del Moral, 1998), el gen P-gp es inducido por DEX (Lin, 1999), Lin publicó un trabajo en el cual mediante el empleo de inhibidores específicos se demostró que el albendazol no es sustrato de la P- gp, por lo cual no consideramos importante este gen en la explicación de la VM del ABZ (Moroni, 1995). d) Un factor importante en el metabolismo del ABZ es CYP1A1, enzima que metaboliza al sulfóxido de albendazol (ABZSO) y forma sulfona de albendazol 30 (ABZSO2), el cual es excretado principalmente en l a orina (P, 1999). La hemoproteína CYP1A1 se ha asociado con el cáncer pulmonar, ya que metaboliza al benzopireno y otros hidrocarburos aromáticos. En particular, tres formas alélicas generan susceptibilidad al cáncer en f umadores (Hayashi, 1991). Así también, polimorfismos de CYP1A1 en sitios MspI, están correlacionados con el cáncer de mama (Taioli, 1999). Las formas alélicas de CYP1A1 responden de manera diferente ante la presencia del ABZ, es posible sugerir que aquella forma con menor actividad podría permitir que se acumule el ABZSO en plasma al no transformarlo a ABZSO2. Cada persona responde de diferentes maneras a la misma medicación, estas diferencias pueden ser mucho más marcadas entre distintas poblaciones, se estima que la genética es responsable de un 20 a un 95 % de la variabilidad en la farmacocinética de un f ármaco y sus efectos, muchos factores distintos a l os genéticos también pueden ser importantes, como la edad, la función orgánica, las terapias concomitantes y la naturaleza misma de una enf ermedad, actualmente existen numerosos ejemplos de casos en los que las diferencias interindividuales en la respuesta al tratamiento farmacológico, son debidas a secuencias que varían en los genes que codifican enzimas que participan en el proceso de metabolismo, transporte u otros blancos farmacológicos. (Evans & McLeod, 2003). Algunos de estos polimorfismos han sido asociados a cambios sustanciales en el metabolismo o en los efectos farmacológicos, actualmente se están usando para predecir la respuesta clínica. Por ejemplo, en el caso de l a familia de los citocromos, se puede observar un efecto multigénico que involucra a la familia CYP3A. 31 Aproximadamente tres cuartos de los individuos de raza blanca y la mitad de los de raza negra no expresan CYP3A5 funcional causado por un SNP en el intrón 3 que crea un sitio de empalme produciendo un codón de terminación que trunca prematuramente la proteína, ésta pérdida de funcionalidad no resulta evidente debido a que muchos fármacos que son metabolizados por el citocromo CYP3A5, también pueden seguir la vía metabólica del CYP3A4. Para aquellos fármacos que utilizan ambas vías, la velocidad de metabolismo resulta de la suma de la actividad de ambos citocromos etc. (Evans & McLeod, 2003) De ahí la importancia de l a isoforma de CYP3A4 pues se expresan en órganos que contribuyen a la disposición de fármacos, como el hígado, intestino y riñón (Aoyama et al., 1989), (Shimada et al., 1994); el CYP3A4 realiza el metabolismo de m ás de 50% de los medicamentos que s on empleados en la práctica médica, la heterogeneidad en respuesta al fármaco puede ser resultado de polimorfismos en e l gen CYP3A4. Al momento de iniciar el estudio se habían reportado tres formas polimórficas: CYP3A4*1A, CYP3A4*1B (Paris et al., 1999) y CYP3A4*2 (Sata et al., 2000). En la población mexicana se desconocen las frecuencias de es tos polimorfismos, por lo que s u determinación es de gran interés, más aún por el hecho de que el alelo CYP3A4*1A se ha asociado con una mayor probabilidad de presencia de l eucemias secundarias en tratamientos de cáncer, comparado con el alelo CYP3A4*1B, sin embargo este último, se ha asociado con la predisposición al cáncer de próstata (Felix et al., 1998); Por otra parte, el alelo CYP3A4*2 presenta una actividad enzimática menor en el metabolismo de l a nifedipina (Sata et al., 2000), aun c uando los tres alelos 32 presentan la misma actividad para el metabolismo de la testosterona (Sata et al., 2000). Los citocromos P450 (CYP), catalizan el metabolismo de una gran variedad de compuestos químicos, entre los que se incluyen fármacos (Nelson et al., 1996). La isóforma 3A4 metaboliza el 50-60 % de todos los fármacos empleados en l a práctica médica (Li, Kaminski, & Rasmussen, 1995), (Evans & Relling, 1999). Un fármaco de especial interés en México es Albendazol (ABZ), el cual es ampliamente utilizado en el tratamiento de par asitosis intestinales y en las neurocisticercosis. El ABZ es metabolizado por el CYP3A4 y por la flavin monoxigenasa (FMO) a s u forma farmacológica activa sulfóxido de albendazol (ABZSO), y posteriormente por CYP1A1 a sulfona de albendazol (ABZSO2), el cual carece de actividad farmacológica y es eliminada por vía renal (P. Delatour, Parish, & Gyurik, 1981), (R. J. Gyurik et al., 1981). Los estudios sobre la biotransformación del ABZ reportan que en pr omedio 1 de cada 6 personas presenta variabilidad interindividual, en la biodisponibilidad de éste fármaco (Marriner et al., 1986) a (H. Jung et al., 1998). En el Instituto de Neurología, Sotelo y Jung r eportan diferencias significativas en l a concentración de A BZSO en plasma de pacientes con neurocisticercosis, tratados con albendazol; E n los pacientes que presentaban concentracionesaltas de ABZSO en pl asma cuando se administra albendazol, no cambio esta concentración al administrar albendazol y dexametazona, sin embargo en pac ientes que tuvieron una concentración baja de sulfóxido de a lbendazol, cuando se administro solo el albendazol, esta concentración se incremento al administrar albendazol y dexametazona, excepto 33 en pacientes que inicialmente presentaban una concentración alta de sulfóxido de albendazol (H. Jung, Hurtado, Medina, Sanchez, & Sotelo, 1990). Esta variabilidad interindividual se ha t ratado de e xplicar con base en la absorción del fármaco en el tracto gastrointestinal, sin embargo también pued e ser interpretada en función del polimorfismo de las isoformas de c itocromo P450 que participan en el proceso de sulfoxidación del compuesto(Villaverde et al., 1995), (Steiger, Cotting, & Reichen, 1990). La variabilidad interindividual en la biotransformación de diferentes fármacos metabolizados por CYP3A4, resalta la relevancia del estudio ya que los polimorfismos alélicos de esta isoforma podrían afectar la biodisponibilidad y por ende la eficacia de los medicamentos así como el margen de seguridad del mismo. 34 MATERIAL Y MÉTODO 3.1 Diseño experimental En el siguiente diagrama se presenta el diseño experimental que s iguió el presente estudio. Correlación de los polimorfismos C YP3A4*1B y *2, con la variabilidad del metabolismo de albendazol Montaje de HPLC para cuantificación de albendazol y sus metabolitos Determinación de las frecuencias alélicas de CYP3A4*1B y *2 Determinación de genotipos de los individuos por PCR- RFLP Selección de la población Obtención de DNA 35 3.2 SELECCIÓN DE LA POBLACIÓN Las muestras de leucocitos se obtuvieron del laboratorio de la Dra. Julieta Rubio Lightbourn y del Dr. Rafael Camacho Carranza del Departamento de Medicina Genómica y Toxicología Ambiental del Instituto de I nvestigaciones Biomédicas, de la UNAM. El parámetro para la selección de la población fue la siguiente: Se aplicó una encuesta vía telefónica y se seleccionaron 158 muestras de aquellas personas que cumplían con las siguientes condiciones: personas sanas, con padres y abuelos nacidos en México. 3.3 EXTRACCIÓN DE DNA Se obtuvo el DNA por el método de fenol-cloroformo modificado (• Maniatis, 1989). La muestra de l eucocitos se suspendió con 500µL de b uffer TE10:20Mm (Tris 10mM y EDTA 20mM) inmediatamente después de sacarla del congelador (- 20°C). Después, se agregaron 2ml de buffer de extracción (Tris 10mM pH 8, EDTA 20mM pH 8, SDS 0.5%), agitando el tubo por inversión durante unos minutos y se dejó una noche en baño maría con agitación a 50°C. después, se adicionaron 2ml de fenol frío, agitando el tubo por inversión durante 5 minutos y posteriormente se agregaron 2ml de c loroformo con alcohol isoamílico (24:1) manteniendo la agitación por inversión durante 5 minutos. La fase acuosa se recuperó por centrifugación a -5°C y 3500 rpm durante 15 minutos y se agregó un volumen de acetato de potasio 1.5M pH 4 agitando por inversión. Adicionalmente se agrega un volumen de isopropanol o dos volúmenes de etanol absoluto frío. Se tomó la hebra de DNA mediante “spooling” usando una 36 pipeta Pasteur estéril, se lavó la muestra con 2 o 3m l de etanol al 70% frio y se decantó. Para evitar que el pellet tuviera residuos de etanol y que interfiriera con los ensayos de P CR, se secó a 50°C y se resuspendió en 5ml de buffer TE10:0.1mM (Tris 10mM, EDTA 0.1mM) dejando el tubo a baño maría a 50°C por 15 horas. Para fines experimentales se tomó una alícuota de 200µl y por último el tubo se almacenó a –20°C (• Maniatis, 1989). 3.4 CUANTIFICACIÓN DEL DNA AISLADO. Se diluyó la muestra de DNA con buffer TE10:0.1mM (Tris 10mM, EDTA 0.1mM) a una relación 1:40 y se realizaron dos mediciones con un espectrofotómetro de ul travioleta-visible modelo Camspec M350 de doble haz de luz a dos longitudes de onda, la primera a 260 y la segunda a 280nm. Tomadas las lecturas, se procedió a c alcular la concentración de la muestra y la determinación de pureza del DNA, estimadas mediante la relación OD260:OD280 (Maniatis, 1989). 3.5 CALIDAD E INTEGRIDAD DEL DNA El análisis de c alidad e integridad del DNA se hizo usando un gel de agarosa y utilizando como revelador bromuro de é tidio (0.5µg/ml); el límite de detección de DNA fue de 10ng, capacidad de r esolución inferior a l os 25 kpb (• Maniatis, 1989); La observación de una o varias bandas e inclusive un barrido de ellas es un indicativo de la presencia y del estado del material genético además de verificar que no estuviera contaminadas con el RNA ribosomal. 37 3.6 PROCEDIMIENTO DE AMPLIFICACIÓN DE CYP3A4*2 POR ENSAYOS DE PCR-RFLP´S Se diseñaron un par de oligonucleótidos mediante el análisis de l a secuencia del gen CYP3A4 que va desde el exón 1 (ATG codón de inicio) al exón 13, dando un t otal de 26, 502 pb, según la base de dat os del Gene Bank (AF209389). Para amplificar la región codificadora exón 7 de CYP3A (localizada en la posición 77607 a 77755 del LOCUS AF280107), se usaron los primers ORC37 y ORC38, de estos iniciadores se obtuvo un producto de amplificación de 451pb. Tabla 8.-Primer usados exón 7 de CYP3A4*2. Exón Oligonucleótido Secuencia Longitud del amplicón esperada Temperatura de alineamiento del fragmento 7 ORC 37 F (F) 5’-ATTTTCCACATCTTTCTCCACTCA-3’ 451 pb 52°C 7 ORC 38 R (R)5’-GAATAGGCAAATCCATAGAGGCA-3’ 451 pb 52°C (F): forward primer (R): reverse primer 3.6.1CONDICIONES DE AMPLIFICACIÓN La amplificación se realizó mediante las siguientes acciones: Las mezclas para PCR (20µl) se hicieron en una placa de 96 pozos, de fondo plano, con agua Milli Q (filtrada y esterilizada), 2mM de d NTP’s (USB®), buffer para PCR 10X (500mM Tris pH 8.3, 2.5mg/ml BSA, 20mM MgCl2, 5% ficol, 1mM rojo de cresol)*1(IT®), 5µM de oligonucleotidos (forward: ORC37 y reverse: ORC38, ver Tabla 1)*1 (Invitrogen ®), 5 U de Taq polimerasa*1 (Promega®) y DNA genómico (100-200ng). Cada una de las mezclas fue homogenizada en su respectivo pozo 38 con ayuda del microaspirador y dispensador. Posteriormente la muestra se deposita con un inserto en el centro de un capilar de vidrio (capacidad para 30µl), se sellan ambos extremos del capilar con el uso de un m echero y se colocan dentro de los módulos que se encuentran en la tapa del termociclador. Una vez colocadas las muestras dentro de la cámara del termociclador Rapid Cycler IT®, se programa con el Link 05 con la siguiente secuencia de instrucciones: Link 05 (H02-C07-C08-H03) Donde: a) H02: 94°C 30s b) C07: 94°C 5s – 52°C 0s – 72°C 1min – 5 ciclos, pendiente 9.9 °C/s c) 08: 94°C 0s – 52°C 0s – 72°C 1min – 35 ciclos, pendiente 9.9 °C/s Cuyas condiciones de reacción fueron las siguientes: temperatura inicial de desnaturalización a 94°C durante 30 s egundos, seguido por un et apa de desnaturalización a 9 4°C por 5 s egundos, una temperatura de alineamiento de 52°C por 0 segundos y una extensión a 72°C por 1 minuto durante 5 c iclos con una velocidad de cambio de temperatura de 9.9 °C/s. A continuación se adicionó un periodo similar al anterior pero disminuyendo el tiempo de desnaturalización a 0 segundos y aumentado a 35 Ciclos. El último ciclo fue seguido por un paso extra de extensión a 72°C por 5minutos. Una vez completado el ciclo, se removieron los capilares y se verificó que la muestra no se hubiera evaporado. Posteriormente se hizo una abertura en am bos extremos del capilar con un cortador de zafiro, se 39 introdujo el microaspirador/dispensador y la muestra fue depositada en un tubo eppendorf (nuevo y estéril). El análisis del producto de PCR de 451pb (5µl de la reacción),
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