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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE QUÍMICA TÍTULO DEL TEMA ESCRITO PERFIL DE EXPRESIÓN DE SEIS TRANSPORTADORES DE AZÚCARES TIPO SWEET EN DIFERENTES ETAPAS DEL DESARROLLO DE LAS HOJAS DE MAÍZ TESIS QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE QUÍMICO EN ALIMENTOS PRESENTA NESTOR ELISEO DELGADO RUBIO CIUDAD UNIVERSITARIA, CD. MX., MARZO 2017 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. JURADO ASIGNADO: PRESIDENTE: JESUS FERNANDO MONTIEL AGUIRRE VOCAL: SOBEIDA SANCHEZ NIETO SECRETARIO: RUTH EDITH MARTIN FUENTES 1er. SUPLENTE: FRANCISCO JAVIER PLASENCIA DE LA PARRA 2° SUPLENTE: CARMINA MONTIEL PACHECO SITIO DONDE SE DESARROLLÓ EL TEMA: DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA, FACULTAD DE QUÍMICA. ASESOR DEL TEMA: Dra. Sobeida Sánchez Nieto SUSTENTANTE: Nestor Eliseo Delgado Rubio 1 Agradecimientos El trabajo de tesis “Perfil de expresión de seis transportadores de azúcares tipo SWEET en diferentes etapas del desarrollo de las hojas de maíz” realizado por Nestor Eliseo Delgado Rubio fue desarrollado bajo la dirección de la Dra. Sobeida Sánchez Nieto en el laboratorio 102 del Departamento de Bioquímica, del Conjunto E de la Facultad de Química de la Universidad Nacional Autónoma de México. A la M. en C. Beatriz King Díaz se le agradece su apoyo técnico en el mantenimiento de las condiciones de trabajo y manejo de recursos para el desarrollo del trabajo. A la M. en C. Manuela Nájera Martínez se le agradece su apoyo técnico en la optimización del método de obtención de RNA. A la Q. Laurel E. Fabila Ibarra se agradece su apoyo técnico en el mantenimiento de los equipos que se usaron en la realización del proyecto. El trabajo de tesis recibió financiamiento a través de: DGAPA-PAPIIT proyecto PAPIIT IN217214. Facultad de Química de la UNAM, PAIP 5000-9125. 2 Índice general Agradecimientos _______________________________________________________ 1 Índice general __________________________________________________________ 2 Índice de figuras _______________________________________________________ 4 Índice de tablas ________________________________________________________ 5 Abreviaturas: __________________________________________________________ 6 RESUMEN _____________________________________________________________ 7 INTRODUCCIÓN ________________________________________________________ 8 Las hojas y la fotosíntesis ___________________________________________________ 8 Transporte membranal de solutos ___________________________________________ 14 Transportadores SWEET en plantas _________________________________________ 17 La importancia de los SWEETs en la carga apoplástica o exportación de azúcares de las células fotosintéticas. ________________________________________________ 20 JUSTIFICACIÓN _______________________________________________________ 23 HIPÓTESIS ____________________________________________________________ 25 OBJETIVO GENERAL __________________________________________________ 25 OBJETIVOS PARTÍCULARES ________________________________________________ 25 MATERIALES Y MÉTODOS _____________________________________________ 26 Desarrollo experimental ____________________________________________________ 26 Obtención del material vegetal. ______________________________________________ 27 Extracción de RNA. _________________________________________________________ 28 Cuantificación, análisis de la integridad y calibración del RNA. ________________ 29 Reacción de retrotranscripción reversa o RT _________________________________ 30 Análisis de la expresión de los SWEETs _____________________________________ 31 Análisis in silico para la obtención de los oligonucleótidos para amplificar a los SWEETs. ________________________________________________________________________ 31 Reacción en cadena de la polimerasa o PCR _________________________________ 32 Análisis densitométrico de las bandas amplificadas. __________________________ 33 RESULTADOS _________________________________________________________ 35 Optimización de las condiciones de PCR para la amplificación de los SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a y 17 de maíz. _______________________________________________ 35 3 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en los coleoptilos de plántulas de 72 h de germinación. _______________________________________________________ 36 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en tres zonas diferentes de las hojas maduras de maíz. _____________________________________________________ 38 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en la hoja envolvente de la mazorca del maíz. __________________________________________________________ 40 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas de 1 mes a lo largo del día. ____________________________________________________________________ 41 Análisis comparado de la expresión deSWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en los coleoptilos, las hojas de 1 mes, 3 meses y envolventes del maíz. ______________ 43 DISCUSIÓN ___________________________________________________________ 45 Dos grupos de SWEETs se expresan en las hojas del maíz: Transportadores putativos de sacarosa y hexosas. ___________________________________________ 45 Relación entre el tipo de hoja y la expresión de los SWEETs ___________________ 49 CONCLUSIONES ______________________________________________________ 56 PERSPECTIVAS _______________________________________________________ 57 REFERENCIAS ___________________________________________________________ 58 ANEXOS ______________________________________________________________ 65 Anexo 1. Preparación del material para extracción y visualización del RNA _____ 65 Anexo 2. Secuencias de los posibles transportadores SWEETs de hojas. _______ 67 4 Índice de figuras Figura 1 Corte transversal de una hoja mostrando las células que la conforman............................. 9 Figura 2 Progreso de las diferentes etapas de la planta del maíz. ............................................... 100 Figura 3 Síntesis de sacarosa, metabolismo y transporte ............................................................ 133 Figura 4Transportadores de membrana involucrados en el transporte de azúcares en la planta. 166 Figura 5Transporte de Glc por el transportador AtSWEET1.. ......................................................... 18 Figura 6 Ruta de cargado de azúcares al floema en una planta C4. ............................................. 211 Figura 7 Esquema de la estrategia experimental para determinar el perfil de expresión de los SWEETs en hojas de maíz. . ........................................................................................................ 266 Figura 8 Condiciones óptimas de PCR para la amplificación de los SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 de maíz.. .................................................................................................................................... 355 Figura 9 Gel de agarosa donde se muestra el RNA ribosomal de las muestras de hojas................. 36 Figura 10 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17. .........................................................377 Figura 11 . Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en tres zonas distintas de hojas maduras de maíz. . ..................................................................................................................................... 39 Figura 12 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas envolventes de la mazorca del maíz.. ................................................................................................................................... 400 Figura 13. Perfiles de expresión de los SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas envolventes del maíz. .................................................................................................................................... 411 Figura 14. Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en hojas de plantas de 1 mes.. .......... 422 Figura 15 . Perfiles de expresión de los SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 a lo largo del día en hojas de plantas de maíz con 1 mes de desarrollo. . ............................................................................ 433 Figura 16. Comparación de los niveles de expresión de los SWEETs en diferentes hojas de plantas de maíz. ....................................................................................................................................... 44 5 Índice de tablas Tabla 1 Función propuesta y localización en tejidos de SWEET en diferentes plantas. Tomado de Eom et al., 2015 ........................................................................................................................... 20 Tabla 2 Medio de reacción para la producción de cDNA. .............................................................. 31 Tabla 3 Oligonucleótidos diseñados para amplificar a los posibles transportadores SWEET localizados en hojas. .................................................................................................................... 31 Tabla 4 Mezcla de reacción para la PCR de cada uno de los SWEETs de tejido aéreo. La solución stock de cada oligonucleótido fue de 20 mM. .............................................................................. 33 Tabla 5 Porcentaje de identidad entre los SWEETs de hojas de Arabidopsis con los de maíz. Utilizando la página de Aramemnon basado en el programa FASTA_v3 SSEARCH. ........................ 46 Tabla 6 Posible localización de los SWEETs de maíz por comparación con sus homólogos en A. thaliana. ...................................................................................................................................... 47 Tabla 7 Relación de las características de la hoja con la expresión de los SWEETs. ........................ 51 6 Abreviaturas: cDNA DNA complementario DEPC Dietil pirocarbonato DNA Acido desoxirribonucleico dNTP Desoxinucleótidos trifosfato EDTA Ácido etilendiamina tetraacético PCR Reacción en cadena de la polimerasa RNA Ácido ribonucleico RT Transcriptasa reversa SUT Transportador de sacarosa/H+ SWEET Transportador difusional de azucares V Crecimiento vegetativo. R Desarrollo reproductivo VE Vegetativo de emergencia, Coleoptilo VT Etapa final de crecimiento vegetativo Sac Sacarosa ATP Trifosfato de adenosina STP Transportador de hexosas /H+ HECK Células de riñón de embrión humano FRET Transferencia de energía de resonancia de fluorescencia. CC Células acompañantes SE Elementos amorfos de la savia GUS gen reportero de la β-glucuronidasa. rRNA RNA ribosomal NCBI Centro Nacional para la Información Biotecnológica 7 RESUMEN Los SWEETs son transportadores difusionales de sacarosa, glucosa o fructosa. En Arabidopsis SWEET11 y 12 se expresan principalmente en las hojas, funcionalmente contribuyen al llenado del tejido vascular el floema, de azúcares, función necesaria para la nutrición de los tejidos no fotosintéticos. Las hojas tienen una capacidad fotosintética distinta dependiendo de su edad por lo que es posible que la expresión de los SWEETs tenga relación con su actividad fotosintética. En maíz solo se ha caracterizado un SWEET. Por lo que en este trabajo se estudió la expresión de seis SWEETs en hojas de diferentes estados del desarrollo del maíz. Se obtuvo el RNA de hojas de plántulas de 72 h de germinación, hojas de 1 y 3 meses de desarrollo y las hojas envolventes de la mazorca. En la base d datos del Maize GDB hay seis SWEETs que se expresaron más en hojas por lo que en este trabajo fueron analizados mediante RT-PCR: ZmSWEET1b (NM_001154214.1, GRMZM2G153358), ZmSWEET4a (NM_001175008.1, GRMZM2G000812), ZmSWEET13a (NM_001155615.1, GRMZM2G173669), ZmSWEET13b (NM_001148182.1, GRMZM2G021706), ZmSWEET15a (NM_001155556.1, GRMZM2G168365) y ZmSWEET17 (DAA54392.1, GRMZM2G106462). Se encontró que SWEET17 y 15a se expresaron de manera similar independientemente del tipo de hoja, SWEET15a con baja expresión y SWEET17 con expresión intermedia. Mientras que otros SWEETs sí cambiaron su expresión:SWEET1b se expreso de manera alta en las hojas de 1 y 3 meses. SWEET4a se expreso más en la hoja envolvente. SWEET13a y 13b tuvieron una expresión similar e intermedia en los coleoptilos, alta pero similar en la base (zona joven) y la punta (zona senescente) de hojas de 3 meses. Pero SWEET13a se expresa 2 veces más que SWEET13b en la hoja envolvente y en la parte media de la hoja de 3 meses. La hora del día no afecto la expresión de los SWEETs en las hojas de 1 mes. Es probable que las partes de la hoja que tuvieron mayor expresión de SWEET13b son las zonas con mayor actividad fotosintética, mientras que SWEET4a y 13a se expresan en tejidos jóvenes o con baja actividad fotosintética. 8 INTRODUCCIÓN Las hojas y la fotosíntesis Las plantas son capaces de sintetizar azúcares por lo que son denominados organismos autótrofos, sin embargo, no todos los tejidos tienen esa capacidad, solo las hojas y tallos, los que además sintetizan más azúcares de los que requieren, por ello son denominados tejidos fuente. Por otra parte, la mayor parte de los tejidos en una planta carecen de actividad fotosintética y dependen del carbono que los tejidos fuente sintetizan, por lo que son llamados tejidos demanda (Lemoine et al., 2013). Las hojas consisten de la lámina de la hoja, la nervadura, el cuello de la hoja y la envoltura de la hoja. La lámina de la hoja es la parte plana donde ocurre el proceso de la fotosíntesis. La nervadura de la hoja se extiende por todo lo largo de la parte media de la hoja, desde la base hasta la punta y le proporciona una estructura de soporte. El collar o cuello es la zona donde la lámina de la hoja se une con la parte que se desenvuelve del tallo, denominada envoltura de la hoja. Si bien las hojas son los apéndices, u órganos laterales, más importantes del tallo, la hoja y el tallo son partes de una unidad, el brote. Las hojas normalmente tienen los mismos tejidos que el tallo, aunque su estructura es especializada de acuerdo a su función. En el tallo la forma de columna, la orientación vertical del sistema vascular y la abundancia de elementos mecánicos y parénquima de reserva llevan a una alta eficiencia en la conducción vertical de nutrimentos y no solo como sostén de la planta. Mientras que las hojas al tener una superficie externa relativamente grande, el extenso sistema de espacios aéreos, la abundancia de cloroplastos, la estrecha relación espacial entre los tejidos vasculares y los fundamentales y la presencia de estomas, por donde se incorpora el CO2, sugieren una especialización relacionada con la fotosíntesis (Fig. 1). Estas características facilitan la exposición de cloroplastos a la luz y favorecen el acceso 9 del agua y gases a las células encargadas de la fotosíntesis (Esau, 1985; Azcón- Bieto, 2008). Figura 1 Corte transversal de una hoja mostrando las células que la conforman. Lashojas presentan un sistema vascular formado por el xilema y el floema, tienen abundantes estomas y espacio de aire atrás de estos, el CO2 y el O2 pueden encontrarse disponibles para el proceso fotosintético. En este caso se muestra una hoja de una planta C4, por lo que tiene células del mesófilo en donde el CO2 se fija a una molécula de 4 carbonos (oxalacetato que posteriormente se convierte a malato), pero también tiene células del haz de la vaina las cuales presentan numerosos cloroplastos, donde se lleva a cabo el ciclo de Calvin para la producción de azúcares. La estructura típica del maíz en donde las células del mesófilo y las del haz de la vaina rodean a las células vasculares es llamada anatomía tipo Kranz, las cuales están acomodadas de manera longitudinal en toda la hoja (Fukaya et al.,2012). Adaptado de http://www.doctortee.com/dsu/tiftickjian/cse- img/botany/plant-anat/leaf/zea-leaf-xs.jpg En cada etapa de la vida de una planta se presentan hojas con características anatómicas y funcionales distintas, que también depende de la especie. Durante el desarrollo del maíz por ejemplo, se pueden encontrar el coleoptilo, diferente número de hojas con edades distintas y las hojas envolventes de la mazorca. El sistema más utilizado para identificar las etapas de crecimiento del maíz y por tanto de las hojas se divide en dos partes: crecimiento vegetativo o V y desarrollo reproductivo o R (Fig. 2). El crecimiento vegetativo comienza con la salida del primer brote que despunta en la tierra, el coleoptilo, estadio denominado VE, que sería el estado vegetativo de emergencia o vegetativo juvenil (O'Keeffe, 2009).El 10 coleoptilo es una hoja puntiaguda modificada que rodea y protege a la plúmula - cuatro o cinco hojas enrolladas, una dentro de la otra- durante la germinación. Esta protección es valiosa puesto que al momento de emerger de la semilla, el coleoptilo se alarga empujando la cubierta de la semilla (pericarpio). Las hojas embrionarias se extienden y comienzan a madurar, es decir comienza la biogénesis de los cloroplastos y por tanto la actividad fotosintética apenas inicia, sin embargo, al parecer no desarrolla la anatomía típica de una planta C4, por lo que el proceso fotosintético es deficiente (Fukaya et al., 2012).En el maíz, las hojas embrionarias mueren antes de la emergencia de la espiga (Silvester et al., 2001). Figura 2 Progreso de las diferentes etapas de la planta del maíz. La etapa vegetativa está representada con V y los números junto a la V corresponden al número de hojas; la etapa reproductiva se representa como R y los números corresponden a la madurez de la espiga. Tomado de O'Keeffe, 2009. En las etapas posteriores del desarrollo vegetativo se forma el tallo, en el maíz es un tipo de caña, hecho de nodos e internodos. La unión entre el tallo y la hoja es el nodo. El tallo provee de soporte estructural para las hojas, las cuáles se desenvuelven de este de manera alternada y opuesta entre ellas. La edad de la planta se nombra de acuerdo al número de nodos, por ejemplo, una planta con 7 nodos y por tanto hojas se nombraría “V7”. Se prefiere utilizar el conteo de nodos 11 en lugar de hojas ya que entre la etapa V4 y V5 algunas hojas comienzan a caerse debido a la expansión del tallo y su envejecimiento (Fig. 2). La etapa final se le llama VT, y esta se alcanza poco antes de que aparezca la parte reproductiva masculina, la espiga, la cual se encuentra en el extremo superior del tallo. No todas las hojas en la etapa vegetativa son maduras, a partir de la etapa V8 las hojas juveniles son morfológicamente distintas a las hojas maduras, las primeras incrementan la longitud de la hoja uniformemente con la base de la hoja, mientras que en las hojas adultas en su base tienen un crecimiento lento o nulo en relación al crecimiento de la hoja (Silvester et al., 2001; O'Keeffe, 2009). En relación a la actividad fotosintética las hojas del maíz tienen un correlación negativa con la edad, esto quiere decir que conforme van envejeciendo la actividad fotosintética disminuye, aunque en las hojas juveniles como V4 la actividad fotosintética se incrementa hasta que la hoja se expande completamente (es decir alcanza su extensión máxima) para después reducir su capacidad fotosintética. Adicionalmente, el crecimiento de las hojas del maíz es basipétalo, esto quiere decir que las diferentes secciones de la hoja no tienen la misma edad, lo cual puede ser un factor que contribuye a una variación en la fotosíntesis, en donde la parte de la punta es la de mayor edad. En el caso del maíz B6, se ha observado que la base de la hoja 7 tiene un aumento en su capacidad fotosintética conforme se van desarrollando (aproximadamente a los 20 días), después alcanza el estado estacionario a partir de los 40 días para después de 80 días reducir su actividad fotosintética, mientras que la punta tiende a reducir de manera casi lineal su actividad fotosintética con respecto al tiempo (Banerjee, 2014). Durante la fase reproductiva o “R1” que inicia con la etapa de floración, la cual comprende desde la aparición del estigma del maíz (la parte superficial de los llamados “pelos del elote”) hasta la aparición de la punta de la mazorca, las hojas se tornan pardas y son senescentes. Aunque la mazorca en esta etapa se encuentra envuelta por una hoja distinta, denominada envolvente. En las etapas R se produce el desarrollo del grano de la mazorca (O'Keeffe, 2009). A pesar de que 12 la hoja envolvente es morfológicamente distinta a las otras hojas, es decir tiene un sistema de nervadura mayor, su capacidad fotosintética parece ser muy similar a la de las hojas próximas (Pengelli et al., 2011). La fotosíntesis se lleva a cabo principalmente en las células del mesófilo de las hojas, si es una planta C3, denominada así porque al fijarse el carbono se producen dos moléculas de triosas fosfato en el ciclo de Calvin. Mientras que en las plantas C4, como el maíz, las células del mesófilo fijan el carbono en una molécula de 4 carbonos, el malato, por lo que este es transportado a las células del haz de la vaina, en donde se descarboxila, para producir piruvato y CO2, este último usado para la producción de triosas fosfato en el ciclo de Calvin en los cloroplastos. A partir de las triosas-P se pueden llevar a cabo la biosíntesis de otros compuestos carbonados como la sacarosa (Sac), la pared celular, el almidón o se utiliza para la producción de energía y el exceso de carbono se exporta en forma de Sac. (Fig. 3). La exportación representa al menos el 80 % de los azúcares sintetizados en la hoja. Mientras que los tejidos demandantes que van apareciendo a lo largo de la vida de la planta solicitan el carbono a través de establecer un gradiente de Sac, ya sea por déficit real o bien porque convirtió al disacárido en algo distinto, como almidón en los amiloplastos o bien por el secuestro del azúcar en organelos como las vacuolas. Sea como fuere la Sac se mueve desde el tejido fuente hacia el demanda a través del sistema vascular, el floema, en un gradiente de concentración de mayor a menor concentración hasta llegar a las raíces, meristemos, flores y frutos (Lemoine et al., 2013). Para entender como ocurre la distribución de azúcares se han determinado la actividad de enzimas clave en el metabolismo de la Sac., también se han buscado a las proteínas encargadas de su transporte ya que el transporte transmembranal es un importante regulador de la distribución de carbono en las plantas. Antes de describir el transporte de azúcares en plantas se describirá brevemente como ocurre el transporte membranal de solutos. 13 Figura 3 Síntesis de sacarosa, metabolismo y transporte. En el tejido fuente ocurre la fijación de CO2 y las triosas fosfato producidas se utilizan para la síntesis de almidón en el cloroplasto,o bien para la síntesis de sacarosa en el citoplasma. La sacarosa excedente se transporta por plasmodesmata (conexiones citoplasmáticas que comunican a dos células, PD) o por proteínas membranales hacia el floema (complejo SE/CC). En el tejido demanda, la sacarosa o las hexosas son importadas, para la nutrición de las células o su almacenamiento. Glucosa (Glc) ADP-Glc: ADP- Glc; Glc: Glc; triosa-P: triosa-fosfato; G6P: Glc-6-fosfato; G1P: Glc-1-fosfato; F6P: fructosa-6- fosfato; UDPG: uridine difosfato Glc; SE/CC: elemento de la savia/célula acompañante; Suc-P: Suc- fosfato; SPS: Suc-fosfato sintasa; SPP: Suc-fosfato fosfatasa; PGI: fosfoGlc isomerasa; NI: invertasa; SUSY: sacarosa sintasa; HK: hexocinasa; FK: fructocinasa; PGM: fosfoglucomutasa; UDPase: UDP- Glc pirofosforilasa; SS: sintasa de almidón; SBE: enzima ramificadora del almidón; SDE: enzima desramificante del almidón; AMY: amilasa; A: transportador de sacarosa; and B: transportador de hexosas; PD plasmodesmo. Modificado de Wang et al., 2016. 14 Transporte membranal de solutos Las células regulan su volumen, el pH interno y su composición iónica por medio de los sistemas de transporte a través de las membranas. De este modo concentran los metabolitos importantes para el metabolismo energético y para los procesos biosintéticos y eliminan sustancias toxicas. La membrana celular está formada por una doble capa de lípidos amfipáticos, en donde la porción hidrofílica de estos se encuentra expuesta al medio acuoso, mientras que la porción hidrofóbica de los lípidos se encuentra en el interior de la bicapa. Debido a esa doble polaridad la membrana tiende a ser impermeable a muchos solutos. Los solutos de tamaño pequeño sin carga, como CO2, O2, agua, amoniaco, glicerol y urea, pueden atravesar las membranas biológicas por libre difusión. A medida que aumenta el tamaño de las moléculas ya no pueden libremente atravesar las membranas, este es el caso de la glucosa (Glc) y otros azúcares. La polaridad de las moléculas también influye en la permeabilidad de la membrana. Las sustancias no polares como el benceno, el etanol, el éter dietílico y muchos narcóticos pueden pasar fácilmente. En cambio, las sustancias polares, especialmente los compuestos con carga eléctrica, no pueden pasar. Por eso, las membranas celulares disponen de mecanismos especializados como canales y transportadores para poder incorporar o liberar estos compuestos (Koolman et al., 2004). Una clasificación del tipo de transporte de solutos toma en cuenta el gasto de energía que debe aportarse para mover al soluto al otro lado de la membrana, diferenciándose dos tipos de transporte, el transporte pasivo y el activo. El movimiento de solutos de una solución concentrada de estos a una de menor concentración se le denomina transporte difusivo, y en está entran la difusión libre que es la forma más simple de transporte a través de una membrana y que depende del tamaño y polaridad de los solutos y de la permeabilidad de la membrana a estos. Cuando el soluto no puede libremente atravesar la membrana 15 entonces el transporte es por difusión facilitada, es decir hay proteínas que ayudan al transporte del soluto. Contrario a la difusión se encuentra el transporte activo o denominado “cuesta arriba”, es decir el soluto se mueve en dirección contraria al del gradiente de concentración o de cargas eléctricas. Esto exige una energía adicional que generalmente se obtiene de la hidrólisis del ATP. Hay dos tipos de transportadores que realizan ese proceso no espontáneo de mover solutos a través de las membranas, aquellos transportadores que directamente realizan la hidrólisis del ATP y los que no. En los primeros la hidrólisis de ATP favorece un cambio conformacional en la proteína para transportar generalmente un ion en contra de gradiente de concentración, estos transportadores son llamados de transporte activo primario. Mientras que aquellos que no usan directamente la energía en forma de ATP, denominado transportador activo secundario, usan el gradiente iónico que han generado los transportadores primarios, para mover un soluto en contra de gradiente de concentración (Fig. 4), en el balance mueven un soluto a favor de gradiente de concentración y otro en contra de gradiente de concentración (Koolman et al., 2004). Acarreadores, transportadores y canales son las proteínas involucradas en el transporte. Los canales proteicos tienen una abertura polar por la que pueden penetrar iones y otros compuestos hidrofílicos. Así, por ejemplo, existen canales por los que ciertos iones pueden pasar en forma selectiva y porinas que permiten el paso de moléculas por debajo de cierto tamaño. El transporte a través de canales siempre es difusivo. Los transportadores, acarreadores o permeasas reconocen a la molécula que deben transportar, se unen a ella y la ayudan con un cambio conformacional para que pueda atravesar la membrana. Por lo tanto estas proteínas pueden ser comparadas con las enzimas, aunque difieren en que en lugar de una reacción enzimática “catalizan” un transporte vectorial (Koolman et al., 2004). 16 Otra subdivisión de los procesos de transporte se basa en el número de partículas transportadas y en la dirección del transporte. Cuando el transportador transmembranal solo mueve un ion o una sola molécula a través de la membrana es un proceso uniporte, y al transportador se le reconoce como un uniportador. Mientras, que el transporte simultáneo de dos compuestos diferentes puede ser llevado a cabo por simporte o por antiporte (Fig. 4). Los iones o solutos suelen ser transportados a través de las membranas en antiporte con un soluto pero en dirección opuesta, así el transportador es un antiportador. Cuando el transporte de dos solutos ocurre en la misma dirección entonces la proteína es un simportador (Koolman et al., 2004). Figura 4 Transportadores de membrana involucrados en el transporte de azúcares en la planta. La ATPasa de H+ se encarga de bombear protones hacia el espacio extracelular concentrando de protones el apoplasto (transporte activo primario), mientras que los transportadores SUT y STP son simportadores que al mover a los protones a favor de gradiente de concentración se encargan de concentrar sacarosa y hexosas, respectivamente, en el interior celular (transporte activo secundario). Mientras que los transportadores SWEETs transportan difusionalmente en uniporte sacarosa y/o hexosas en la membrana plasmática o la vacuola. 17 Transportadores SWEET en plantas Como se mencionó anteriormente los azúcares son muy importantes en las plantas, en ellas se han descrito 3 familias de transportadores de azúcares, dos de ellos son simportadores con protón: la familia de transportadores de monosacáridos (siendo los STP la subfamilia más amplia) y la otra es la familia SUT, con transportadores específicos para sacarosa (Fig. 4). La tercera familia fue descrita en el 2010, y son los transportadores difusionales SWEET (Sugars Will Eventually be Exported Transporters), los cuales pueden transportar hexosas y sacarosa (Chen et al., 2010). Estructuralmente, los SWEETs son diferentes a los simportadores, estos últimos presentan doce cruces transmembrana con los dominios carboxilo y amino hacia el citosol, mientras que los SWEETs tienen 7 cruces transmembrana (Chen et al., 2015a). Hace poco más de 20 años, fue identificado el primer gen transportador responsable del llenado de sacarosa en el floema, el transportador SUT, el cual dio un paso significativo hacia la comprensión del movimiento de azúcares en plantas. La función de los transportadores de sacarosa es la de concentrar sacarosa en el tejido vascular, estos transportadores se localizan en las células que componen al floema (células acompañantes y elementos cribosos de la savia). Sin embargo, losazúcares antes de llegar al tejido vascular salen de las células hacia el apoplasto, la exportación de sacarosa tendría que ser difusional (Eom et al., 2015), función que no es cubierta por los SUTs. Los SWEETs fueron descubiertos por la expresión simultánea en células de riñón de embrión de humano (HECK) de proteínas de membrana que no se sabía cuál era su función con proteínas sensoras de azúcares, estas últimas presentan en sus extremos amino y carboxilo terminal proteínas fluorescentes, la presencia de azúcares puede detectarse mediante la técnica de FRET (Fluorescence Resonance Energy Transfer), los sensores de azúcares FLIP fueron construidos para detectar moléculas en diferentes concentraciones, los usados en el trabajo 18 que describió a los SWEETs, detectan Glc. El seguimiento del transporte se realizó a pH neutro, es decir independiente de la formación de un gradiente de pH, esperando encontrar a los transportadores difusionales de Glc(Fig. 5), mediante esta estrategia se identificaron y caracterizaron a varios miembros de la familia de SWEETs en Arabidopsis, la cual contiene 17 miembros agrupados en 4 clados con base en su porcentaje de similitud en la secuencia de nucleótidos. Los miembros descritos inicialmente pertenecían a los clados I y II (Chen et al., 2010; Eom et al., 2015). Figura 5 Transporte de Glc por el transportador AtSWEET1. A. Esquema de la estrategia de identificación de los transportadores de Glc en la célula de embrión de humano, HECK doble mutante, expresando en la membrana a un SWEET que transporta Glc hacia el interior celular, así como a una proteína sensora de Glc, FLIPglu600µ13V en el citoplasma. B. Trazos obtenidos de las concentraciones de Glc detectadas cuando se expresa el vector vacío (línea vertical roja) y con el SWEET1 (línea azul oscilante). A mayor concentración de Glc añadida en la solución que baña a las células HECK, mayor cantidad de Glc detectada en el citosol. Tomado de Chen et al., 2010. En un inicio se encontraron los SWEETs que transportaban Glc y posteriormente se llevó acabo la técnica antes descrita para diferentes proteínas desconocidas, entre ellas homólogos de los SWEETs, se identificó a los que transportaban sacarosa. La distribución en clados de los SWEETs de 15 diferentes organismos sugiere el tipo de azúcar que puede transportar el SWEET, aunque no su función fisiológica en la planta. Los miembros pertenecientes al clado I, homólogos a 19 SWEET1 y 2, son transportadores de hexosas; los miembros del clado II son SWEET3 al 8 y son transportadores de hexosas; en el clado III se encuentran losSWEET9-15 capaces de transportar sacarosa, en el clado IV los SWEET16 y 17 se encontraron en el tonoplasto y transportan fructosa. Se han encontrado de 15 a 25 genes de SWEET en las angiospermas con excepción de algunos genomas como Eucalyptus gradis con 47 y los metazoas como Chlamydomonas con un total de 5 miembros (Eom et al., 2015). La función fisiológica de los SWEETs se ha identificado mediante la producción de mutantes, ya sea por la inserción de un transposón en la secuencia del gen lo que impide la producción de proteína, o mediante el cambio de aminoácidos de manera puntual, o por la presencia de RNA de interferencia (Chen et al., 2015a). Se ha encontrado que los SWEETs están involucrados en la secreción del néctar (Eom et al., 2015), en el suministro de azúcares desde la cubierta de la semilla hacia el embrión en desarrollo (Chen et al., 2015b), en la exudación de azúcares de las células del tapete que están en contacto con las células que darán lugar al polen (Eom et al., 2015). También hay algunos SWEETs que son manipulados en cuanto a su expresión por microorganismos que interaccionan con la planta, el aumento en la expresión de los SWEET supone un aumento en la salida de azúcares de la planta, los cuales son aprovechados por los microorganismos para continuar su crecimiento y la invasión de la planta (Chen et al., 2010, 2015b; Eom et al., 2015) (Tabla 1). El aumento en la expresión de los SWEET por factores proteicos inyectados por microorganismos en la planta (Streubel et al., 2013; Cohn et al., 2014), permite sugerir que la manipulación de los transportadores es posible, sugerente de que se podría a través de ellos cambiar la distribución de nutrientes sin tener que producir plantas transgénicas. Por lo que el estudio del papel de los SWEET y su posible regulación es un área de interés para la mejora de la productividad de las plantas de interés agronómico o bien biotecnológico. 20 Tabla 1 Función propuesta y localización en tejidos de SWEET en diferentes plantas. Tomado de Eom et al., 2015 Función SWEET Clado Planta Nutrición del polen AtSWEET5,8, 13 OsSWEET5 II y III A. thaliana Oryza sativa Secreción del néctar AtSWEET9 III A. thaliana Cargado del floema AtSWEET11, 12 ,13 III A. thaliana Senescencia AtSWEET11, 12, 15 OsSWEET5 III, II A. thaliana O. sativa Llenado de la semilla AtSWEET11, 12, 15 ZmSWEET4c III I A. thaliana Zea mays Implicaciones de la interacción de la planta con microorganismos OsSWEET (11-15) MeSWEET 10, 15) VvSWEET 4 AtSWEET4 CsSWEET1 III O. sativa Manihot esculenta Vitis vinífera A. thaliana Citrus reticulate × Citrus aurantium Transporte de cobre OsSWEET11 III O. sativa Transporte vacuolar AtSWEET16, 17 IV A. thaliana La importancia de los SWEETs en la carga apoplástica o exportación de azúcares de las células fotosintéticas. En las plantas el reparto de azúcares es complejo, como ya se mencionó durante la fotosíntesis una parte del carbono fijado se almacena en la célula fotosintética como almidón en los cloroplastos, otra parte va como sacarosa a la vacuola, otra parte se utiliza para el metabolismo y el exceso de los fotoasimilados producidos en el día se exporta hacia el tejido vascular y de este llega a los tejidos demanda (Fig. 3). Para el estudio del transporte de azúcares en plantas se puede dividir el proceso en tres partes: El cargado de azúcares del floema, el movimiento difusional de azúcares en el floema y tercero la descarga de azúcares en el floema. Los SWEETs se han implicado en la carga apoplástica del floema y está es la que se describe a continuación (Lemoine et al., 2013). 21 Las células del mesófilo en las plantas C3 o las células de la vaina en las plantas C4 son las que tienen la capacidad fotosintética, ambas se encuentran conectadas a través de una serie de conductos denominados plasmodesmata, que les permite a las células intercambiar solutos de manera difusiva, al continuo de citoplasmas se le llama simplasto y la concentración de ciertos solutos como la sacarosa es similar en estas células. Seguido de estas células se encuentra el floema el cual está compuesto de tres tipos de células (Fig. 6): las más externas son las células del parénquima, le siguen las células acompañantes (CC) y las más internas son los elementos amorfos de la savia (SE). Las células del parénquima del floema están conectadas mediante plasmodesmata con las células fotosintéticas, sin embargo, la célula del parénquima del floema está aislada simplásticamente a la célula acompañante, lo cual supone una salida de azúcares a los apoplastos. Por su parte, la célula acompañante está conectada simplásticamente al SE, estás últimas células tienen pocos organelos, carecen de actividad de síntesis de proteínas y dependen de los nutrimentos que los CC les proporcionan a través de los plasmodesmata. Además los SE están conectados longitudinalmente a otros SE, haciendo un conducto o tubo que va de arriba a abajo en toda la planta, en el que se conecta a través de poros cribosos por donde se mueve el fluido de la savia acarreando azúcares y otros nutrientes, el transporte a través de los tubos cribosos espor difusión. Figura 6 Ruta de cargado de azúcares al floema en una planta C4.La acumulación de CO2 se inicia en la célula del mesófilo, mientras que la fijación de CO2y la síntesis de sacarosa se lleva a cabo en 22 los cloroplastos de la célula de la vaina, está exporta la sacarosa excedente a través de plasmodesmata a la célula de la vaina y de allí a la célula más externa del floema, la célula del parénquima, hasta aquí el transporte es simplástico. El camino posterior de la sacarosa debe ser a través de los apoplastos ya que la célula del parénquima y la célula acompañante se encuentran aisladas simplásticamente, es decir no tienen conexiones plasmodesmata, por lo que los transportadores membranales en ambas membranas deben funcionar para que la sacarosa se concentre en la célula acompañante, por lo que el transporte entre la célula del parénquima y la célula acompañantes es apoplástico. Mientras que la célula acompañante transporta la sacarosa al elemento amorfo de la savia con el cual está conectada simplásticamente. Por último el elemento amorfo distribuye los azúcares por toda la planta debido a que tiene los poros cribosos que le permiten mover los azúcares a través de sus células. Adaptado de Braun et al., 2013. El cargado de azúcares del floema comienza desde la síntesis de azúcares en las células del mesófilo y el movimiento de estos azúcares hacia el floema. La sacarosa es el principal azúcar transportado en las plantas, debido a su escasa reactividad y alta solubilidad. Entonces la sacarosa es transportada desde las células del mesófilo hacia las células de la vaina y las células del parénquima del floema a través del simplasto. Dependiendo de la planta puede haber cierto número de células conectadas simplásticamente a las células de la vaina y hasta antes de encontrarse con las células que conforman el floema. A partir de las células del parénquima el transporte es apoplástico y debe ser mediado por transportadores membranales. Se desconocía hasta el 2010 que transportadores tenían está función hasta que se describieron a los SWEETs. El análisis de la expresión del promotor de AtSWEET11 y AtSWEET12 con el gen reportero de la β-glucuronidasa (GUS) en plantas transgénicas de Arabidopsis indicaron que los genes se expresan preferentemente en las células del parénquima vascular. Además las dobles mutantes, atsweet11 / atsweet12 mostraron defectos en la carga del floema, acumulan sacarosa y almidón en las hojas y las plantas tienen un tamaño reducido. El almidón no se consume a pesar de que se coloquen las plantas en oscuridad, por lo que es requisito para la exportación de azúcares de la hoja de Arabidopsis que se encuentren los 23 transportadores difusionales SWEET11 y 12 (Chen et al, 2012). Ambos transportadores se demostró que preferencialmente transportan sacarosa (Chen et al., 2012), sin embargo también pueden transportar hexosas (Le-Hir et al., 2015). El camino posterior de la sacarosa se conoce bien, ya que se han encontrado transportadores SUT tanto en las células cribosas del floema como en los elementos amorfos de la savia (Gottwald et al., 2000), los SUTs concentran de azúcares en las células (Braun y Slewinski, 2009). La supresión por la expresión antisentido del StSUT1 provoca una disminución en el desarrollo de las hojas y los tubérculos de la papa (Riesmeier et al., 1994) y mutantes en sut 1 en maíz desarrollaron hojas cloróticas que acumulan altas concentraciones de azúcares en las hojas, llega a la madurez pero se reduce la altura de la planta, presenta menos hojas, hay retraso en la floración y envejecen prematuramente (Slewinski et al., 2009). Por lo tanto, en el maíz, la actividad de ZmSUT1 es esencial para la carga de sacarosa hacia el floema. La carga activa del floema permite que las plantas mantengan concentraciones bajas de fotoasimilados en el tejido fuente y evita la inhibición por retroalimentación de la fotosíntesis, así como para elevar la presión suficiente en el floema para permitir el transporte de larga distancia (Turgeon, 2010). JUSTIFICACIÓN La fotosíntesis es un proceso esencial para la sobrevivencia de las plantas, los azúcares producidos son la base estructural del crecimiento de las plantas y en consecuencia la producción primaria de los ecosistemas y la biosfera. El incremento en la productividad de los cultivos o de las comunidades vegetales, es útil para proveer con recursos suficientes para la alimentación, para la producción de textiles, maderas o etanol y ha motivado desde tiempos remotos la mejora en las prácticas agrícolas (Yadav et al., 2015). 24 La disponibilidad de los azúcares en los diferentes tejidos depende grandemente de los transportadores membranales, el estudio de su expresión y regulación ayudará a entender las posibilidades de manipularlos para aumentar la productividad de ciertos tejidos o de la planta. A pesar de que se ha estudiado que los SWEETs y los SUTs participan en el transporte de sacarosa para el llenado del floema en Arabidopsis (Eom et al., 2015) se desconoce si su expresión cambia dependiendo de la edad de la hoja, ya que la capacidad fotosintética de la hoja varía dependiendo de su edad, aumenta cuando las hojas son jóvenes, y disminuye en hojas maduras totalmente expandidas (Pengelli et al., 2011; Fukaya et al., 2012; Banerjee, 2014). Adicionalmente, en maíz solo se ha reportado la caracterización de un SWEETs, el 4c, que es importante en el llenado del grano (Sosso et al., 2015), por lo que la búsqueda de la expresión de los otros SWEETs en procesos fisiológicos importantes para la planta se hace necesario. 25 HIPÓTESIS Debido a que los SWEETs son importantes para el llenado del floema en los tejidos fotosintéticos y que las hojas tienen una capacidad fotosintética distinta a lo largo de su desarrollo entonces la expresión de los SWEETs cambiará dependiendo del estadio del desarrollo de las hojas del maíz. OBJETIVO GENERAL Obtener el perfil de expresión de los SWEETs que se expresan en hojas en diferentes estadios del desarrollo de la planta de maíz. OBJETIVOS PARTÍCULARES 1. Identificar a los SWEETs que se expresan más en hojas mediante análisis in silico. a. Diseñar oligonucleótidos para la determinación de la expresión de los SWEETs en hojas de maíz. 2. Obtener los coleoptilos de plántulas de 72 h de germinación, hojas maduras de maíz de 1 mes de crecimiento cosechadas a diferentes horas del día y hojas maduras de maíz de 3 meses de crecimiento y cortadas en tres secciones, base, media y punta. 3. Obtener, cuantificar y calibrar del RNA de las hojas . 4. Analizar la expresión de SWEET en las hojas a los diferentes estadios del desarrollo de la planta mediante RT-PCR. 26 MATERIALES Y MÉTODOS Desarrollo experimental Para cumplir con los objetivos del trabajo se planteó la estrategia experimental como se muestra en la Figura 7. Figura 7 Esquema de la estrategia experimental para determinar el perfil de expresión de los SWEETs en hojas de maíz. Los experimentos se realizaron en tres réplicas biológicas. Debido a que la expresión de los SWEETs en hojas podría ser distinta dependiendo del tipo de hoja, estadio de madurez de la planta o de la hoja, o bien a lo largo del día, entonces se obtuvo el tejido aéreo de plantas jóvenes o • Germinación de semillas por 72 h en agar • Lote 1. Plantas jóvenes de 72 h de germinación. Cosecha de la parte aérea. • Lote 2. Trasplante en sustrato e incubación por un total de 30 días. Cosecha de parte aérea de planta a diferentes horas del día. • Lote 3. Trasplante en sustrato e incubación hasta obtener plantas maduras aprox 3 meses. Cosecha de hojas maduras y hoja envolvente. Obtención del material vegetal • Extracción del RNA de las hojas. • Cuantificación de RNA. • Visualización de integridad delRNA. • Calibración del RNA de las diferentes muestras. Obtención, cuantificación y calibración del RNA • Diseño de oligonucleótidos para el análisis de 6 SWEETs específicos de hoja. • Obtención de las condiciones óptimas de PCR para los 6 SWEETs específicos de hojas. • Análisis de la expresión de los 6 SWEETs de maíz en las hojas de las tres réplicas biológicas. Análisis de la expresión de los SWEETs 27 maduras, o bien a diferentes tiempos en un día y de estas se extrajo RNA para determinar la expresión de los SWEETs mediante RT-PCR. Obtención del material vegetal. Se utilizaron semillas de maíz Chalqueño cosecha 2014. Antes de germinar a las semillas se les quitó el pedicelo, ya que está zona generalmente contiene microorganismos. Después se lavaron las semillas en un matraz con una solución de hipoclorito de sodio (2 % Cloralex) con agitación moderada por 5 min, se decantó la solución y después las semillas se lavaron con H2O estéril durante 2 min, este procedimiento se repitió otras 3 veces más o hasta que desapareciera el olor a hipoclorito. Después de la desinfección se germinaron las semillas en 1 % agar en cajas Petri de 10 cm de diámetro y se incubaron por 72 h a 29 °C. Al término de la incubación el lote de plántulas se dividió en tres. Del primer lote que contenía 20 plántulas se tomó la parte aérea y se envolvió en papel aluminio, se congeló con N2 líquido y al final se almacenó a -80 °C hasta su uso. El segundo lote de plantas se usó para determinar el efecto del ciclo circadiano1 en la expresión de los SWEETs, así que las plantas se trasplantaron en macetas de 1 kg de capacidad, que contenían Sunshine Mix-4, se regaron cada tercer día con agua, posteriormente se incubaron a 20-25 °C en condiciones controladas de intensidad luminosa con 12 h de luz y 12 h de oscuridad, pasado este tiempo se cosecharon las hojas a las 2 am, 6 am, 12 pm, 16 pm, 20 pm. Se envolvieron las hojas en papel aluminio, se congelaron con N2 líquido y posteriormente se almacenaron a -80 °C hasta su uso. El tercer lote de plantas se usó para determinar si los SWEETs que se expresaban en hojas maduras preferían hacerlo en la parte más joven de la hoja (la base) o la parte más madura (punta). Estas plantas se trasplantaron en macetas de 10 kg de capacidad, que contenían Sunshine Mix-4, se regaron cada 1 Ciclo circadiano es un ritmo diario de actividad biológica que es capaz de persistir en ausencia de señales externas y permite anticipar los cambios ambientales regulares, como las horas de luz oscuridad, a través de la modulación de la expresión génica (Dodd et al., 2015). 28 tercer día con agua y al mes se les agregaron 5 g del fertilizante Triple 17. Las plantas llegaron a la madurez después de 3 meses en el invernadero con condiciones de luz natural y temperatura entre 20 a 25 °C, se consideró que llegaron a la madurez ya que la espiga y la mazorca ya habían brotado. Se cosecharon las hojas totalmente extendidas de 6 plantas. De acuerdo a Pick y colaboradores (2011), los mayores cambios a nivel de transcritos de las enzimas fotosintéticas se encuentran en los primeros 10 a 20 cm de la base y también los 10 a 20 cm finales o punta de la hoja, por lo que en este trabajo las hojas se dividieron en tres secciones base, media y punta, se tomaron como base los primeros 15 cm de la hoja, la punta los últimos 15 cm y la parte media alrededor de 100 cm. Las secciones de hoja se envolvieron en papel aluminio, se sumergieron los paquetes en N2 líquido y se almacenaron a -80 °C. Se realizaron tres réplicas biológicas de cada lote de plantas. Extracción de RNA. Fundamento de la técnica. Se realizó la extracción de RNA utilizando Trizol (Invitrogen), el cual contiene principalmente fenol y tiocianato de guanadina. La solución fenólica empleada en la extracción del RNA es ácida (pH 5 a 6), para favorecer la extracción del RNA sobre la del DNA, ya que a pH ácido, el DNA es retenido en la fase orgánica y en la interfase, dejando al RNA en la fase acuosa. La presencia del tiocianato de guanidina permite desnaturalizar a las proteínas lo que inhibe la actividad de las RNAsas. Además del fenol el procedimiento de extracción involucra la adición de cloroformo lo que permite la formación de fases orgánicas y acuosas y permite la separación el RNA que se encuentra en la fase acuosa. EL RNA se precipita posteriormente a baja temperatura con isopropanol o etanol que disminuyen la capas de solvatación de los grupos fosfatos, haciendo que los ácidos nucleicos se agreguen y precipiten (Herráez, 2012). Se lava con etanol al 70 % para eliminar todos las moléculas que no sean RNA y para finalizar se resuspende en agua libre de RNAsas (Barrón, 1997). 29 Procedimiento. Se preparó el material para la extracción según se describe en el anexo 1. Se molieron aproximadamente 10 g de tejido en un mortero libre de RNAsas y con N2 líquido hasta obtener un polvo fino, se almacenó el polvo en un tubo falcón estéril y se almacenó a -80 °C hasta su uso. Para la obtención del RNA se tomaron de 50-100 mg del pulverizado y se colocaron en un microtubo de 1.5 mL, se le agrego además 1 mL de Trizol se mezcló el contenido del tubo con un vortex hasta resuspender y se incubo por 5 min a temperatura ambiente, después se añadieron 200 µL de cloroformo y se agitó vigorosamente de forma manual durante 15 seg y después se incubó sin agitación nuevamente por 5 min a temperatura ambiente y se centrifugo por 15 min a 12000 x g a 4°C. La fase acuosa de color incoloro se separó de la fase orgánica de color rosa, y se transfirió a un microtubo nuevo evitando la interface. Se añadió a la fase acuosa 0.5 mL de isopropanol para precipitar el RNA y se mezcló por inversión, agitando los tubos 5 veces. Se incubaron las muestras a temperatura ambiente por 10 min y se centrifugó a 12000 x g durante 10 min a 4°C. El RNA se formó como un botón blanco o transparente en el fondo del tubo, el sobrenadante se descartó y al botón de RNA se le agregó 1 mL de etanol 70 % y se agitó con vortex por 15 seg, se centrifugó a 12000 x g por 5 min a 4°C y se repitió el lavado dos veces más. Se descartó el sobrenadante cuidadosamente con micropipeta y se dejó secar el botón por 5 min y luego se disolvió en 30-60 µL de agua libre de RNAsas. Por último se almaceno a -80°C. Cuantificación, análisis de la integridad y calibración del RNA. Procedimiento. El RNA se cuantifico en un espectrofotómetro Nanodrop. Las concentraciones que se obtenían variaban entre 0.050-1.500 g/l. Para evaluar la integridad del RNA se tomó el volumen de RNA necesario para tener 1 g y se le agregaron 2 µL de amortiguador de carga (Promega) y H2O-DEPC c.b.p 10 µL. Se cargó la mezcla en un gel de agarosa al 1 % disuelto en TAE 1x y con bromuro de etidio (ver Anexo 1). El gel se corrió en una cámara de electroforesis con TAE 1X frío a 85 mV por 45 min y se visualizó en un transiluminador UV. Se observaron 2 bandas características y bien definidas en todas las muestras, estas corresponden 30 a los RNA ribosomales (rRNA) 28S y 18S. Lo cual es indicativo de que el RNA obtenido estaba íntegro. Después se calibraron las muestras, esto es se cargaron geles de agarosa al 1 % con amortiguador TAE y bromuro de etidio con 1 µg de RNA para todas las muestras y se separaron con TAE 1X frío a 85 mV por 45 min y se visualizó en un transiluminador UV. Si la intensidad de la banda del ribosomal 28S de cada una de las muestras era diferente en alguna de las muestras se corría un volumen distinto para obtener una intensidad similar a la de las otras muestras. Para el cálculo de los volúmenes de ajuste se realizó la densitometría de cada una de las bandas de los rRNA obtenidos en los geles de agarosa. Una vez que los volúmenes de RNA de cada muestra daban unaintensidad similar del rRNA 28S en el gel entonces se utilizó este volumen para producir el cDNA. Reacción de retrotranscripción reversa o RT Fundamento. La transcriptasa reversa es una enzima que tiene como función sintetizar una molécula de doble cadena (DNA) a partir de una molécula de cadena sencilla como el RNA. El cDNA obtenido se utilizó en la reacción en cadena de la polimerasa o PCR (Rodríguez y Barrera, 2004). Procedimiento. Se añadió a un microtubo 1 µL de Oligo DT (60 µM), el volumen de RNA ajustado y se ajustó con H2O a 10 µL. El microtubo fue colocado en un bloque de calentamiento a 70°C por 5 minutos para la desnaturalizar al RNA, posteriormente se colocó en hielo por otros 5 min y se agregaron 10 µL de la mezcla de reacción para la producción de cDNA (Tabla 3). Posteriormente se calentó a 25 °C por 5 min para realizar el alineamiento, 42°C por 60 min para hacer la copia de DNA y por ultimo a 70°C por 15 min para inactivar la enzima. La reacción se realizó en un termociclador (Axygen® MaxyGene™ II ThermalCycler). El cDNA obtenido se almacenó a -20°C hasta su uso. 31 Tabla 2 Medio de reacción para la producción de cDNA. Reactivo Cantidad (l) Buffer ImProm 5X (PROMEGA) 4.0 MgCl2 (25mM) 2.4 dNTP´s (10mM) 1.0 RT (Transcriptasa reversa) 1.0 H2O-DEPC 1.6 Análisis de la expresión de los SWEETs Análisis in silico para la obtención de los oligonucleótidos para amplificar a los SWEETs. La búsqueda de las secuencia que codifican para los presuntos SWEETs se realizó en la base de datos del Maize genetics and genomics database o MaizeGDB (Tabla 2). Se obtuvo la secuencia de DNA complementaria y con esa secuencia se diseñaron los oligonucleótidos para la amplificación específica del SWEET con en el programa Primer Design de NCBI (National Center for Biotechnology information) y analizados con el programa Oligoanalyzer para evaluar la posibilidad de que los oligonucleótidos formaran dímeros o estructuras que evitaran la amplificación específica del gen (anexo 2 y Tabla 2). Se probaron varios juegos de oligonucleótidos, los que se muestran son los que dieron una sola banda de amplificación. Tabla 3 Oligonucleótidos diseñados para amplificar a los posibles transportadores SWEET localizados en hojas. SWEET Número de acceso Oligonucleótidos Peso molecular esperado Zm_SWEET1b NM_001154214.1 GRMZM2G153358 Sentido: TCCATATAAGCGCAAGCAGA 151 Antisentido: CAGAACGTAGGCACTGGGGA Zm_SWEET4a NM_001175008.1 GRMZM2G000812 Sentido: CAGCGTCGTCCTACCCATAT 177 Antisentido: CTTCCAGATGCGGATGAACG Zm_SWEET13a NM_001155615.1 GRMZM2G173669 Sentido: CGTGGAGTACATGCCCTTCT 151 Antisentido: CACGTAGAGCACCATCTGGA 32 Zm_SWEET13b NM_001148182.1 GRMZM2G021706 Sentido: ACAAATACGTCGCGCTACCA 361 Antisentido: GCTTGCTTGCGATGATGGAGA Zm_SWEET15a NM_001155556.1 GRMZM2G168365 Sentido: CCCTGGCCTCTTCTTCGTTC 107 Antisentido: CCTCGCTTACAGCCCTTCTC Zm_SWEET16 DAA54392.1 GRMZM2G106462 Sentido: TCATGCCGTTCTTCCTATCC 195 Antisentido: GAGGCGACGCTATTTCTTTG Reacción en cadena de la polimerasa o PCR Fundamento. La reacción de PCR es un método de síntesis in vitro de DNA con el que un segmento particular de este es específicamente amplificado al ser delimitado por un par de oligonucleótidos que lo flanquean. Su copiado se logra en forma exponencial a través de ciclos repetidos en presencia de una DNA polimerasa termoestable (Rodríguez y Barrera, 2004). Los pasos importantes a seguir son calentar a 95°C en el cual las moléculas de DNA se separan en las 2 cadenas componentes. A continuación la mezcla se enfría a unos 60°C para permitir que los oligonucleótidos se unan con las cadenas del DNA blanco y la temperatura se eleva de nuevo a 72°C para que la polimerasa termofílica agregue nucleótidos al extremo 3´ de los iniciadores. Conforme la polimerasa extiende el oligonucleótido, copia de manera selectiva el DNA blanco y forma nuevas cadenas de DNA complementario. La temperatura se eleva de nuevo, lo que hace que las cadenas de DNA recién formadas y las originales se separen. Enseguida se enfría la muestra para permitir que los oligonucleótidos sintéticos de la muestra se unan de nuevo con el DNA blanco, que ahora está presente en una cantidad dos veces mayor que la original. Este ciclo se repite una y otra vez, y en cada ronda se duplica la cantidad de la región específica del DNA que está flanqueado por los oligonucleótidos unidos. Pueden generarse miles de millones de copias de esta región específica en unas cuantas horas con un generador de ciclos térmicos que cambia la temperatura de la mezcla de reacción en forma automática para permitir que cada paso del ciclo ocurra (Karp, 2009). 33 Procedimiento. La PCR se llevó acabo para evaluar la presencia de transcritos para los diferentes posibles transportadores SWEETs (Tabla 4). Se tomaron 2 L del cDNA de coleoptilos se añadieron 12.5 L de la mezcla de reacción de Promega (Master Mix, MM), diferentes volúmenes de los oligonucleótidos para obtener las concentraciones a las cuáles estos amplificaran un producto de PCR (0.25, 0.5, 1 y 2 L) y agua libre de DNAasas (Promega) para aforar a 20 l. La reacción de amplificación incluyó 1 ciclo de desnaturalización a 94 °C por 5 min, 37 ciclos en los que cada ciclo incluyó la desnaturalización a 94°C por 40 seg, seguido de la hibridación a 57°C por 1 min y la extensión a 72°C por 40 seg. Por último 1 ciclo a 72°C por 7 min. Las condiciones óptimas obtenidas se muestran en la Tabla 4 y estas fueron usadas para determinar los niveles de expresión de los 6 posibles transportadores SWEET de hojas de maíz. La reacción se realizó en un termociclador (Axygen® MaxyGene™ II ThermalCycler). Tabla 4 Mezcla de reacción para la PCR de cada uno de los SWEETs de tejido aéreo. La solución stock de cada oligonucleótido fue de 20 mM. Análisis densitométrico de las bandas amplificadas. Para determinar si existían diferencias en la expresión de cada uno de los transportadores SWEETs en los diferentes tejidos examinados, se realizó el corrimiento electroforético de las muestras que salieron del PCR en geles 2 % SWEET Oligonucleótidos (L) cDNA (µL) PCR MM (µL) H2O Libre de DNAsas (µL) 1b 1 2 12.5 8.5 4ª 0.5 2 12.5 9.5 13ª 0.5 2 12.5 9.5 13b 0.25 2 12.5 10 15ª 1 2 12.5 8.5 16 0.5 2 12.5 9.5 34 agarosa disuelto en TAE y bromuro de etidio, se corrieron por 45 min en buffer TAE a 80 V. Se visualizaron las bandas en el aparato QUIMIDOC. El equipo usa un programa llamado Imagen lab 5.0 el cual permite la detección de los ácidos nucleicos mediante la radiación de luz emitida por el bromuro de etidio adherido en las cadenas al ser expuesto con luz UV. 35 RESULTADOS Optimización de las condiciones de PCR para la amplificación de los SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a y 17 de maíz. Para determinar los niveles de expresión de los SWEETs que se expresan en las diferentes hojas de plantas de maíz, se examinó la base de datos MaizeGDB, encontrando que aquellos que se expresaban más en hojas eran los SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17, por lo que se diseñaron varios oligonucleótidos para lograr determinar su expresión en los diferentes estadios del desarrollo de las hojas. En la Figura 8 se observan los productos de estos oligonucleótidos, en todos los casos se amplifico una banda del peso molecular esperado. Se escogieron las concentraciones de cDNA y de oligonucleótidos para la amplificación, es decir las condiciones en las que la intensidad de la banda no fuera excesivamente alta para diferenciar los niveles de expresión entre tratamientos o tejidos. pb Cantidad de oligonucleótidos (µL) 0.25 0.5 1.0 1.5 2.0 ZmSWEET Condiciones óptimas de amplificación 151 1b 1.0 µL Oligonucleótidos + 2 µL cDNA 177 4a 0.5 µL Oligonucleótidos+ 2 µL cDNA 151 13a 0.5 µL Oligonucleótidos + 2 µL cDNA 361 13b 2.0 µL Oligonucleótidos + 2 µL cDNA 107 15a 1.0 µL Oligonucleótidos + 1 µL cDNA 195 17 2.0 µL Oligonucleótidos + 2 µL cDNA Figura 8 Condiciones óptimas de PCR para la amplificación de los SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 de maíz. Se usó cDNA de coleoptilo de plántulas de maíz de 72 h de germinación. Los stocks de oligonucleótidos estaban a una concentración de 20 µM. Se indica el peso molecular de los productos amplificados. Adicionalmente, se obtuvo el RNA de coleoptilos, la hoja envolvente de la mazorca, tres zonas de una hoja totalmente extendida madura para examinar la 36 expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17. Por lo anterior se calibró el RNA de cada uno de los tejidos examinados para cada una de las tres réplicas biológicas utilizadas, en la Figura 9, se muestra una de las calibraciones. La intensidad de la banda del RNA ribosomal 28S fue el que sirvió de base para la calibración y se utilizó para normalizar los datos de expresión de los SWEETs en las diferentes hojas. Hoja madura Hoja Punta Media Base Coleptilo Envolvente RNA calibrado 28 S 18 S Figura 9 Gel de agarosa donde se muestra el RNA ribosomal de las muestras de hojas. El volumen de RNA que se corrió en el gel fue el mismo que fue usado para la obtención del cDNA que se usó para la amplificación de los SWEETs mediante PCR punto final. Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en los coleoptilos de plántulas de 72 h de germinación. El coleoptilo de maíz emerge después de la salida de la radícula y encierra cinco primordios de hoja (Fig. 10A). El coleoptilo tiene una morfología distinta a las hojas maduras y su capacidad fotosintética es limitada (Fukaya et al., 2012). Por lo anterior era posible que los SWEETs presentes en los coleoptilos fueran distintos a los que se expresan en las hojas maduras del maíz. Se encontraron a los seis SWEETs analizados en los coleoptilos, cinco de los SWEETs tienen niveles similares, el único con niveles muy bajos es ZmSWEET15 (Fig. 10B y C). ZmSWEET4a y 13b tuvieron ligeramente mayor expresión aunque no es significativo el cambio. 37 ZmSWEET 1b 4a 13a 13b 15a 17 Estándar B 1000 pb 500 pb 200 pb Figura 10 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en coleoptilos de plántulas de maíz de 72 h de germinación. A. Plántulas de maíz, se señala el coleoptilo. B. Amplicones de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 separados en geles de agarosa al 2 %. Se muestra una de las réplicas, en donde se encuentra el carril del estándar de peso molecular, la banda más intensa corresponda al peso molecular de 500 pb. C. Los niveles de expresión relativa se obtuvieron al obtener el índice de la intensidad de las bandas amplificadas y separadas por electroforesis en gel de agarosa al 2 % y de la intensidad del RNA ribosomal 28 S de cada tejido en las tres réplicas biológicas, tomando al SWEET17 como el 100 %. La barra representa el promedio con su desviación estándar. 0 50 100 150 200 250 1b 4a 13a 13b 15a 17 In ts e n si d ad S W EE T/ R N A SWEETS (Coleoptilo 72h) C A 38 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en tres zonas diferentes de las hojas maduras de maíz. En los cereales como en muchas otras plantas el desarrollo de la hoja es basipétalo, es decir de la punta a la base de la planta. Las células de la punta de la hoja son las más viejas y también las más maduras, mientras que las células de la base son las más jóvenes. El maíz es una planta C4, lo que la hace muy eficiente para la fijación de carbono, se ha encontrado que la cantidad de transcritos para las enzimas que intervienen en el metabolismo C4 como PEPC, NADP-ME, PEP-CK, AspAT, AlaAT son más altas en la base que en la punta, sugerente de que hay un gradiente de actividad fotosintética en la hoja (Pick et al., 2011). Por lo anterior en este trabajo se dividió a la hoja en tres partes, punta, media y base (Fig.11A) para determinar si los SWEETs tenían una distribución preferencial, en vista de que pueden ser importantes para el transporte de los fotosintatos hacia el floema (Chen et al., 2010). Los transcritos para SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 se encontraron en las tres zonas de las hojas, aunque difieren en intensidad (Fig.11B y C). Los perfiles de expresión de los 6 SWEETs se presentan en la Figura 11. En la punta de la hoja los SWEETs 1b, 13a y 13b se expresan ligeramente más que los otros SWEET, sin embargo las diferencias no son significativas entre los SWEET analizados, excepto que SWEET15 tiene una baja expresión (Fig. 11C). En la parte media de la hoja SWEET1b y 13a son significativamente mayores a la expresión de los otros SWEETs. Mientras que en la punta, la expresión de los SWEETs es similar a la base. 39 Punta Media Base ZmSWEET 1b 4a 13a 13b 15a 17 Estándar Punta Media Base Figura 11. Expresión de SWEET 1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en tres zonas distintas de hojas maduras de maíz. A. Las tres zonas de las hojas de maíz. B. Amplicones de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 separados en geles de agarosa al 2 %. Se muestra una imagen de una de las tres réplicas biológicas realizadas, el carril del estándar de peso molecular, la banda más intensa corresponda al peso molecular de 500 pb. C. Los niveles de expresión relativa de cada SWEET se obtuvieron al obtener el índice de la intensidad de las bandas amplificadas y separadas por electroforesis en gel de agarosa al 2 % y de la intensidad del RNA ribosomal 28 S de cada tejido en las tres réplicas biológicas. La barra representa el promedio con su desviación estándar. -50 0 50 100 150 200 250 300 350 400 450 punta media base In te n si d ad S W EE T/ R N A Partes de hoja 1b 4a 13a 13b 15a 17 ZmSWEET A B C C 40 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en la hoja envolvente de la mazorca del maíz. Anatómicamente las hojas que envuelven a la mazorca (Fig. 12A) son distintas al resto de las hojas de la planta, sin embargo ambas llevan a cabo la fotosíntesis pese a que la primera tiene una menor capacidad de toma de CO2 así como baja actividad de rubisco (Pengelli et al., 2011). Por lo que resultaba interesante determinar si la expresión de los SWEET es diferente entre la hoja envolvente y las otras hojas. Se encontró que en las hojas envolventes los SWEET1b, 4a, 13 ay 17se expresan más (Fig.12B y 13), seguido de SWEET13b y como en las otras hojas SWEET15 tuvo baja expresión. Hay que hacer notar que en este caso en particular la amplificación del SWEET13a produjo dos bandas, de 232 y aproximadamente 290 pb. Se usó para la densitometría la banda de peso molecular 232 pb, que era el esperado. ZmSWEET 1b 4a 13a 13b 15a 17 Estándar Figura 12 Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas envolventes de la mazorca del maíz. A. Hojas envolventes del maíz. B. Amplicones de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 separados en geles de agarosa al 2 %. Se muestra una imagen de las tres réplicas biológicas realizadas, el carril del estándar de peso molecular, la banda más intensa corresponda al peso molecular de 500 pb. B A 41 Figura 13. Perfiles de expresión de los SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas envolventes del maíz. Los niveles de expresión relativa se obtuvieron al obtener el índice de la intensidad de las bandas amplificadas y separadas por electroforesis en gel de agarosa al 2% y de la intensidad del RNA ribosomal 28 S de cada tejido en las tres réplicasbiológicas. La barra representa el promedio con su desviación estándar. Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas de 1 mes a lo largo del día. Se evaluó el nivel de transcritos para los SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en las hojas de 1 mes a 5 tiempos distintos a lo largo del día. Con la finalidad de determinar si alguno de los SWEETs está involucrado en el llenado del floema que ocurre principalmente durante la etapa luminosa del día. Como se observa en la Figura 14a, la hoja usada es del tipo vegetativa de estado juvenil, por lo que probablemente su capacidad fotosintética no sea máxima. En estas hojas no hubo diferencia en la expresión de los SWEET entre las diferentes horas del día, tampoco hubo cambios respecto a la expresión de cada SWEETs (Fig. 14b y 15). Aunque el ZmSWEET13b es el que más varía en expresión entre réplicas, más a las 2 de la tarde. Nuevamente SWEET15a se expresa poco en las hojas de 1 mes. 0 50 100 150 200 250 300 1b 4a 13a 13b 15a 17 In te n si d ad S W EE T/ R N A SWEETS (Hoja envolvente) 42 A B Hora del día 5 am 10 am 2 pm 7 pm 12 pm ZmSWEET 1b ZmSWEET 4a ZmSWEET 13a ZmSWEET 13b ZmSWEET 15a ZmSWEET 17 RNA calibrado Figura 14. Expresión de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en hojas de plantas de 1 mes. A. Plantas de maíz con 1 mes de desarrollo. B. Amplicones de SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 separados en geles de agarosa al 2 %. Se muestra el carril del estándar de peso molecular, la banda más intensa corresponda al peso molecular de 500 pb. 43 Figura 15 . Perfiles de expresión de los SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 a lo largo del día en hojas de plantas de maíz con 1 mes de desarrollo. Los niveles de expresión relativa se obtuvieron al obtener el índice de la intensidad de las bandas amplificadas y separadas por electroforesis en gel de agarosa al 2% y de la intensidad del RNA ribosomal 28 S de cada tejido en las tres réplicas biológicas. La barra representa el promedio con su desviación estándar. Análisis comparado de la expresión deSWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15a, y 17 en los coleoptilos, las hojas de 1 mes, 3 meses y envolventes del maíz. Finalmente al comparar la expresión de los SWEETs en las diferentes hojas (Fig. 16), se encontraron que algunos SWEETs se expresan de manera similar independientemente del tipo de hoja como son SWEET17 y 15a, mientras que los otros si cambian: SWEET17 y SWEET15 se expresan de manera similar a lo largo del desarrollo de las hojas de maíz, siempre SWEET15a se expresó pobremente, mientras que SWEET17 lo hace de manera intermedia. SWEET1b se expresa de manera alta en las hojas de 1 y 3 meses. SWEET4a se expresa más en la hoja envolvente. 0 50 100 150 200 250 300 05:00 a. m. 10:00 a. m. 02:00 p. m. 07:00 p. m. 12:00 a. m. In te n si d ad S W EE T/ R N A Horas del día 1b 4a 13a 13b 15a 17 ZmSWEET 44 SWEET13a y 13b a pesar de ser muy similares en secuencia no tienen un nivel de expresión idéntico en todos las hojas examinadas, ambas tienen una expresión similar e intermedia en los coleoptilos, también similar pero alta en la base y la punta de las hojas de 3 meses. Difieren en que SWEET13a se expreso 2 veces más que SWEET13b en la hoja envolvente y en la parte media de la hoja de 3 meses. También se observa que la expresión de SWEET13b es muy variable, por lo que las desviaciones estándar entre cada réplica son grandes. Figura 16. Comparación de los niveles de expresión de los SWEETs en diferentes hojas de plantas de maíz. 0 100 200 300 400 500 coleoptilo 72 hrs 1 mes hoja envolvente base (3meses) media (3meses) punta (3meses) Expresión SWEET/RNA 17 15a 13b 13a 4a 1b SWEET 45 DISCUSIÓN Dos grupos de SWEETs se expresan en las hojas del maíz: Transportadores putativos de sacarosa y hexosas. Los SWEETs son transportadores difusionales de sacarosa y/o hexosas y son importantes en varios procesos fisiológicos de las plantas. En Arabidopsis mutantes en sweet11 y 12 acumulan grandes cantidades de almidón en las hojas, están localizados en la membrana plasmática de las células del parénquima del floema y ambos son transportadores de sacarosa, evidencia que demostró que estos SWEETs son necesarios para la salida de la sacarosa a los apoplastos y facilitan el cargado del floema con azúcares (Chen et al., 2010, 2012). Adicional a AtSWEET11 y AtSWEET12, en las hojas de Arabidopsis también se expresan AtSWEET13, AtSWEET2, AtSWEET16 y AtSWEET17, el primero es un transportador de sacarosa, aunque aún no se ha determinado en que membrana se localiza, mientras que los últimos tres se localizan en las membranas vacuolares con capacidad de transporte de hexosas, aunque AtSWEET16 también puede transportar sacarosa (Chardon et al., 2013; Guo et al, 2013; Klemens et al., 2013; Chen et al., 2015). En maíz hay 22 genes que probablemente codifican para SWEETs. Los genes y nombres que codifican para los SWEETs de maíz se encontraron en dos bases de datos Aramemnon (http://aramemnon.uni-koeln.de/) y MaizeGDB (https://www.maizegdb.org/), la primera agrupa a los genes de transportadores membranales, que se construyó a través de tomar los datos de las bases de datos de genomas y de artículos que reportan a las proteínas. Mientras que la segunda base de datos contiene el atlas de expresión de los genes de maíz, los datos de expresión de los SWEETs fueron obtenidos de los datos de microarreglos (Sekhon et al., 2011) que están representados en MaizeGDB en histogramas o diagramas de calor. Los SWEETs que se expresan en las hojas del maíz de acuerdo a los datos de MaizeGDB son SWEET1b, 4a, 13a, 13b, 15 y 17. En este trabajo se diseñaron http://aramemnon.uni-koeln.de/ https://www.maizegdb.org/ 46 oligonucleótidos para amplificar a los SWEET en las hojas en distintas etapas del desarrollo del maíz y se encontró que efectivamente el grupo de SWEETs seleccionados se expresa en todas las hojas del maíz Chalqueño, aunque en diferentes niveles. Cabe mencionar, que a pesar de que los datos de expresión que se obtuvieron en este trabajo fueron hechos en tres réplicas experimentales con un número de 6 a 12 miembros por lote, la expresión aunque confiable en este sentido, desconocemos si se traduce en un nivel de proteína comparable y que lleve a una actividad dada. Sin embargo, este trabajo es un punto de partida para identificar aquellos que pudieran ser necesarios para la función de transporte en las hojas, para posteriormente en otro trabajo realizar la caracterización de la actividad de transporte y localización de los SWEETs, ya que solo el transportador SWEET4c ha sido caracterizado en maíz (Sosso et al., 2015). Tabla 5 Porcentaje de identidad entre los SWEETs de hojas de Arabidopsis con los de maíz. Utilizando la página de Aramemnon basado en el programa FASTA_v3 SSEARCH. . ZmSWEET 1b 4ª 4c 13a 13b 15a 17a ZmSWEET 1b 100 41 38 32 32 32 41 4a 41 100 78 30 30 32 37 4c 38 78 100 28 27 27 33 13a 32 30 28 100 94 50 33 13b 32 30 27 94 100 45 33 15a 32 32 27 50 45 100 32 17a 41 37 33 33 33 32 100 AtSWEET 2 38 31 29 29 29 29 36 11 31 29 29 45 48 41 33 12 32 29 28 48 49 43 33 13 34 31 27 52 52 42 33 16 31 34 32 32 29 31 51 17 39 34 34 31 32 33 52 En rosa están sombreados los que tienen una identidad de más del 70 % y en verde aquellos que en Arabidopsis tienen una identidad de más del 40% con los de maíz. javascript:openRef('11'); 47 De acuerdo a su homología en secuencia de nucleótidos los SWEETs de plantas se distribuyen en cuatro clados y se sugiere que la distribución en clados está relacionada con la especificidad por el azúcar que transporta, aunque algunos SWEETs pueden transportar sacarosa y hexosas, su preferencia por alguno de estos es mayor (Chen et al.,
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