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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE QUÍMICA RESTAURANDO LA AUTOINCOMPATIBILIDAD SEXUAL EN HÍBRIDOS AUTOCOMPATIBLES DE NICOTIANA A TRAVÉS DE LA FUNCIÓN DE NASTEP TESIS QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE QUÍMICA FARMACÉUTICA BIÓLOGA PRESENTA JIMENA BELLIDO MORA MÉXICO, Ciudad de México 2018 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. 2 JURADO ASIGNADO: PRESIDENTE: Profesor: J. Eleazar Martínez Barajas VOCAL: Profesor: Sobeida Sánchez Nieto SECRETARIO: Profesor: Felipe Cruz García 1er. SUPLENTE: Profesor: Euclides Ávila Chávez 2° SUPLENTE: Profesor: Francisca Morayna Gutiérrez Luna SITIO DONDE SE DESARROLLÓ EL TEMA: Laboratorio 104, Departamento de Bioquímica, Edificio E, Conjunto D-E. Facultad de Química. Universidad Nacional Autónoma de México. asesor del tema: __________________________ Dr. Felipe Cruz García supervisor técnico: ________________________ M. en C. Yuridia Cruz González Zamora SUSTENTANTE: _________________________ Jimena Bellido Mora 3 Agradecimientos El proyecto fue financiado por el proyecto CONACyT 236602, DGAPA IN217816 y PAIP 5000-9128. A la Facultad de Química de la UNAM por el apoyo para realizar mi tesis a través del Subprograma 127 “Formación Básica en Investigación”. 4 Dedicatorias 5 Índice Agradecimientos ....................................................................................................................... 3 Dedicatorias .............................................................................................................................. 4 Índice de figuras ....................................................................................................................... 6 Índice de tablas ........................................................................................................................ 7 Resumen ................................................................................................................................... 8 Antecedentes .......................................................................................................................... 10 Estructura de la flor .......................................................................................................................... 10 Polinización ...................................................................................................................................... 11 Autoincompatibilidad sexual............................................................................................................ 12 AI esporofítica ............................................................................................................................................ 14 AI gametofítica ........................................................................................................................................... 15 Justificación ............................................................................................................................ 28 Hipótesis.................................................................................................................................. 28 Objetivos ................................................................................................................................. 28 Metodología ............................................................................................................................ 29 Purificación de NaStEP nativa de pistilos de N. alata .................................................................. 29 Monitoreo de la purificación de NaStEP .................................................................................................. 30 Inmunodetección de NaStEP .................................................................................................................... 30 Actividad de NaStEP como inhibidor de subtilisina ...................................................................... 31 Inmunolocalización de NaStEP y calosa. ...................................................................................... 32 Squash de estilos polinizados y tinción con azul de anilina de tubos polínicos ......................... 34 Resultados .............................................................................................................................. 35 Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata. ................................................................ 35 NaStEP inhibe a la subtilisina ......................................................................................................... 39 NaStEP aplicada de manera exógena ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles.................................................................................................................................... 41 Restableciendo la autoincompatibilidad de híbridos de Nicotiana autocompatibles mediante la función de NaStEP ........................................................................................................................... 45 Discusión ................................................................................................................................. 50 Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata. ................................................................ 50 6 NaStEP inhibe a la subtilisina ......................................................................................................... 51 NaStEP aplicada de manera exógena ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles.................................................................................................................................... 52 Restableciendo la autoincompatibilidad de híbridos de Nicotiana autocompatibles mediante la función de NaStEP ........................................................................................................................... 53 Conclusiones .......................................................................................................................... 55 Perspectivas ........................................................................................................................... 55 Referencias ............................................................................................................................. 56 Índice de figuras Figura 1. Estructura de la flor hermafrodita.………………………………………………...11 Figura 2. AI esporofítica……………….………………………………………………………14 Figura 3. AI gametofítica…………………………………..…………………………………..16 Figura 4. NaStEP se incorpora a los tubos polínicos compatibles e incompatibles………………………..………………………………………………………….20 Figura 5. La supresión de NaStEP resulta en la pérdida del rechazo S- específico………………………………………………………..………………………………21 Figura 6. Los niveles de HT-B disminuyen en una planta con NaStEP suprimida………………………………………………………………………………………..21 Figura7. Modelo de la estructura tridimensional de NaStEP………………………………………………………………………………………….22 Figura 8. NaStEP es un inhibidor de subtilisina…………………………………………….23 Figura 9. NaStEP inhibe diferentes tipos de proteasas...................................................24 Figura 10. La interacción entre NaStEP y NaSIPP ocurre en la mitocondria de los tubos polínicos..........................................................................................................................24 Figura 11. Modelo de AI en Solanaceae…………………………………….………………27 Figura 12. Cromatograma del intercambio catiónico débil DEAE………………………...35 Figura 13. Cromatograma de la filtración molecular Hi-Trap Desalting….………………36 Figura 14. Cromatograma del intercambio catiónico fuerte Hi-Trap Capto S…….……..36 7 Figura 15. Acercamiento de la figura 14 en la fase de elución…………………….….….37 Figura 16. Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata…………….……….....38 Figura 17. Actividad proteolítica de la subtilisina………………………………..………....39 Figura 18. Inhibición de la actividad proteolítica de la subtilisina…………………….…..40 Figura 19. Inmunolocalización de NaStEP en estigmas de híbridos autocompatibles de Nicotiana con NaStEP silenciado……….……………………………………………………42 Figura 20. Inmunolocalización de NaStEP en estigmas de N. alata……………….…….43 Figura 21. NaStEP aplicada de manera exógena ingresa a los tubos polínicos compatibles e incompatibles………………………………………………………………….44 Figura 22. Evaluación del restablecimiento de la autoincompatibilidad de los híbridos N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0………………………………....…46 Figura 23. Histograma del conteo de tubos polínicos……………………………..…….....48 Figura 24. Porcentaje de TPs en la base del estilo entre los que germinaron……….....49 Índice de tablas Tabla 1. Cuantificación de tubos polínicos a las 72 h post-polinización agregando NaStEP nativa y polen incompatible (SC10)………………..………………………………..47 Tabla 2. Porcentaje de TPs que alcanzaron la base del estilo entre los que germinaron………………………………………………………………………………………48 8 Resumen Los angiospermas muestran diversas estrategias reproductivas para generar y mantener la diversidad genética, una de ellas son los sistemas de autoincompatibilidad sexual (AI). Este mecanismo les permite a las plantas discriminar entre su propio polen y el polen de otra planta. En la familia Solanaceae, la AI está controlada por un solo locus altamente polimórfico, el locus S. En este locus se encuentran codificadas las determinantes esenciales para que se lleve a cabo la respuesta de AI: la S-RNasa y SLF/SFB. La S-RNasa es una ribonucleasa que se expresa en el estigma y estilo, mientras que SLF/SFB es una proteína de caja F expresada exclusivamente en el polen. La interacción de estas dos proteínas, determina si el polen es compatible o incompatible. En Nicotiana alata, hay otros genes no ligados al locus S que participan en el mecanismo de la AI; estos genes son denominados genes modificadores (GM). Hasta la fecha se han descrito tres GM que se expresan en el pistilo (120K, HT-B y NaStEP) y un GM expresado en polen (NaSIPP). Durante la polinización en N. alata, las S-RNasas ingresan al tubo polínico y se almacenan en vacuolas. En una cruza compatible, estas vacuolas permanecen intactas mientras que en una cruza incompatible, las vacuolas se rompen liberando a las S- RNasas al citoplasma del tubo polínico donde degradan el RNA siendo éste un evento irreversible. En nuestro grupo de investigación se describió al GM NaStEP (Nicotiana alata Stigma- Expressed Protein), el cual es un inhibidor de proteasas que se expresa de forma abundante en estigmas de especies incompatibles del género Nicotiana. Su participación en la respuesta de AI fue determinada por ensayos de pérdida de función utilizando RNA interferente en plantas transgénicas de Nicotiana. La supresión de esta proteína, dio como resultado que las plantas transgénicas aceptaran su propio polen. También se observó que durante la polinización, NaStEP se relocaliza e ingresa al tubo polínico sin importar el genotipo de la cruza. Asimismo, se propone que NaStEP participa en la estabilidad de HT-B (una proteína producto de un GM que se localiza en la periferia de las vacuolas que contienen a las S-RNasas) ya que en las líneas donde NaStEP está suprimida, HT-B se degrada tanto en una cruza compatible como en una 9 incompatible, no así, en N. alata silvestre, donde en una cruza incompatible HT-B permanece estable mientras que en una cruza compatible, se degrada. En la actualidad no se sabe si NaStEP en una cruza compatible también se degrada como HT-B pero se hipotetiza que sí, y para probarlo, en este trabajo se comenzó con el establecimiento de las condiciones y parámetros para determinar si la aplicación exógena de NaStEP nativa y funcional en plantas silenciadas con RNAi:NaStEP, restablece la AI. Con este sistema bien establecido se podrá evaluar la degradación de NaStEP en los tubos polínicos en una cruza compatible. Para realizar este proyecto se purificó NaStEP nativa de pistilos de N. alata y se aplicó de manera exógena a plantas silenciadas RNAi:NaStEP, en las que mediante inmunolocalización se observó su ingreso a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles. Además, para determinar si su aplicación exógena restablece la AI, se agregó NaStEP a estigmas de plantas silenciadas RNAi:NaStEP y se polinizó con polen compatible e incompatible. Aquí mediante aplastados de estilos polinizados y tinción con azul de anilina se hicieron observaciones de los tubos polínicos que alcanzaban la base del estilo. Se observó el rechazo de la mayoría de los tubos polínicos incompatibles, con lo cual se concluye que la aplicación exógena de NaStEP en plantas silenciadas RNAi:NaStEP resulta en un restablecimiento de la autoincompatibilidad sexual. 10 Antecedentes Estructura de la flor La flor es la unidad estructural y funcional que caracteriza a los angiospermas, y se especializa en la reproducción sexual. Está involucrada en los procesos de polinización y fecundación, que lleva a la formación de semillas y frutos maduros (Cruz Durán y Rosas López, 2013). En una flor hermafrodita, cuatro verticilos de órganos pueden distinguirse. El verticilo más externo y basal consiste en sépalos (llamados en conjunto cáliz). Cuando se forma la flor, estos son los primeros órganos en aparecer y permanecen cerrados durante el desarrollo de la misma. Por lo tanto, el botón es la flor que se está desarrollando envuelta en un verticilo de sépalos (generalmente verdes). Adentro de los sépalos, están los pétalos, y el verticilo completo se llama corola. Los pétalos generalmente son más delicados que los sépalos y su superficie es suave al tacto. Esto se debe a la presencia de células con forma de domo, llamadas células papilares, las cuales incrementan la reflexión de color y también pueden secretar quimioatrayentes. La función principal de los colores llamativos de los pétalos es atraer polinizadores. Los verticilos más externos descritos previamente son los componentes estériles de la flor, aunque juegan un papel importante en la función floral (Hodson y Bryant, 2012). Los otros dos verticilos internos son los órganos reproductivos en los que se forman los gametos. El más externo de los dos es la parte masculina llamada androceo, que se compone de estambres. El número de estambres varía entre especies. El verticilo más interno de los órganos florales son los carpelos, las estructuras reproductivas femeninas que en conjunto se llaman gineceo. El carpelo consiste en tres regiones: la basal es el ovario, donde los óvulos se desarrollan y se almacenan. La parte más externa del carpelo es el estigma, donde el polen aterriza. Entre el estigma y el ovario, la mayoría de las plantaspresenta una estructura en forma de tallo, donde los tubos polínicos (TPs) crecen para fecundar los óvulos y se llama estilo (Hodson y Bryant, 2012). 11 Figura 1. Estructura de la flor hermafrodita. El gineceo (parte femenina) se compone de estigma, estilo y ovario, el androceo (parte masculina) se compone de los estambres (antera y filamento). Se ilustra el crecimiento de los tubos polínicos a lo largo del estilo hasta llegar a fecundar los óvulos (García-Valencia et al., 2013). Polinización La polinización es un proceso fundamental en la reproducción sexual de las plantas. Esta inicia con la liberación del polen de la antera y su transporte al estigma por factores bióticos o abióticos. Los granos de polen maduro se liberan de la antera y son transportados por el viento o por vectores animales y algunos llegan al estigma receptivo. Cuando se liberan los granos de polen, generalmente están deshidratados, y se rehidratan cuando llegan al estigma receptivo. Los gametos masculinos son inmóviles, lo cual es una ventaja para las plantas terrestres, ya que no necesitan al agua como medio para alcanzar a los óvulos (Hodson y Bryant, 2012). La interacción inicial entre el polen y el estigma, de adhesión y rehidratación, depende de las propiedades de la cubierta del polen (exina) y de la superficie estigmática (ya sea húmeda o seca). En estigmas secos, como en el género Lilium la adhesión del polen es específica mediada por receptores (Swanson et al., 2004). En el género Nicotiana, 12 donde el estigma es húmedo, se hidrata el grano de polen por el exudado estigmático (Cruz-García y Cruz González-Zamora, 2013). Mutaciones que eliminan el exudado estigmático de Nicotiana tabacum causan esterilidad femenina y se revierte el fenotipo agregando lípidos de manera exógena (Goldman et al., 1994; Wolters-Arts et al., 1998). Una rehidratación exitosa lleva a la germinación de polen, en donde la célula vegetativa se elonga a través uno de los poros en la exina formando el tubo polínico (TP), el cual es una estructura altamente polarizada, con un crecimiento regulado por gradiente de iones calcio (Franklin-Tong et al., 1995). La pared del tubo polínico se compone de una capa externa que contiene pectina y una interna que contiene calosa y microfibras de tipo celulosa. La punta del tubo polínico no tiene la capa interna de calosa (Steer y Steer, 1988). Las actividades de fosfatasa, esterasa, amilasa y proteasa cruciales en los tubos polínicos para invadir el estigma (Knox y Heslop-Harrison, 1970). El tubo polínico crece a través del tejido de transmisión del estilo (figura 1) y se mantiene en constante comunicación con las células del estilo, lo cual en algunas especies es un punto de control crítico para que la fecundación sea exitosa. El crecimiento del tubo polínico culmina con la descarga de las células espermáticas en el saco embrionario, lo que provoca la doble fecundación, que resulta en la formación del cigoto y del endospermo (Cruz-García y Cruz González-Zamora, 2013). La polinización puede llevarse a cabo con polen de la misma flor o flores del mismo individuo, lo que se denomina autopolinización; o también puede ocurrir con polen de otro individuo de la misma especie, denominada polinización cruzada. Autoincompatibilidad sexual Las flores hermafroditas, al tener sus órganos sexuales masculinos y femeninos muy cercanos, tienen una alta probabilidad de autopolinizarse. Charles Darwin en su libro The Effect of Cross and Self Fertilization in the Plant Kingdom (1876), observó que unas especies de plantas eran completamente estériles con su propio polen, pero fértiles con el polen de otros individuos de la misma especie. El estudio de Darwin tenía como objetivo dilucidar por qué la reproducción cruzada prevalece en la naturaleza, y sus 13 experimentos con 57 especies de plantas respaldaron la hipótesis de que la endogamia es perjudicial para la progenie producida, ya que disminuye el vigor y la fertilidad en la mayoría de las especies estudiadas. Estudios de genética clásica y enfoques moleculares sugieren que la depresión por endogamia es causada predominantemente por aumento de mutaciones deletéreas recesivas en las poblaciones (Charlesworth y Willis, 2009). Como consecuencia, algunas especies desarrollaron adaptaciones para mantener la diversidad genética en las generaciones siguientes, estas adaptaciones son de tipo morfológico, fisiológico y genético (de Nettancourt, 2001). La hercogamia es una estrategia morfológica de separación espacial de estambres y pistilo. La dicogamia, es una estrategia fisiológica, en la que la maduración de los órganos reproductivos ocurre de manera diferencial en el tiempo (Cruz-García y Cruz González-Zamora, 2013). Por ejemplo, las anteras pueden madurar y liberar el polen antes o después de que el estigma esté receptivo, lo que reduce considerablemente la probabilidad de autopolinización (Hodson y Bryant, 2012). Las estrategias antes descritas no son del todo eficientes. La autoincompatibilidad (AI) sexual es un mecanismo genético-bioquímico que ha evolucionado para promover la polinización cruzada en los angiospermas y se define como la incapacidad de una planta hermafrodita fértil de producir cigotos después de la autopolinización. La AI promueve un aumento en la diversidad genética, evita la depresión por endogamia y restringe las cruzas con padres y otros individuos de la progenie (de Nettancourt, 2001). Se propone que uno de los factores más importantes que han contribuido al éxito evolutivo de los angiospermas es la AI (Whitehouse, 1950). La AI se clasifica a nivel genético en esporofítica y gametofítica. La AI esporofítica está determinada por el genoma diploide del polen, mientras que la AI gametofítica por el genoma haploide del polen (de Nettancourt, 2001). East y Magelsdorf (1925) encontraron que la compatibilidad está controlada por un solo locus altamente polimórfico, el locus S (Sterility). Este locus multialélico tiene dos genes fuertemente 14 ligados, la determinante femenina que se expresa en pistilo y la determinante masculina que se expresa en polen. El locus S se encuentra cerca del centrómero (heterocromatina) en Lycopersicon peruvianum y Petunia hybrida, en los cromosomas I y III respectivamente (Tanksley y Loaiza-Figueroa, 1985; Entani et al., 1999). Además, las secuencias de ambas determinantes están muy cercanas entre sí, lo que provoca que no haya recombinación entre ambos genes y que se hereden como una sola unidad mendeliana llamada haplotipo (Cruz-García y McClure, 2001). AI esporofítica En los sistemas de AI esporofítica, que se han estudiado principalmente en Brassicaceae, las determinantes de compatibilidad se producen en el tapete de la antera, un tejido esporofítico y se depositan en la cubierta del polen. La respuesta de rechazo del polen se manifiesta en la superficie del estigma, condicionando si el polen germina o no (Takayama e Isogai, 2005). En la figura 2 se ejemplifica como una planta S1S2 producirá granos de polen con las proteínas S1 y S2 en su superficie, y si polinizan la misma planta, estos no germinarán (García-Valencia et al., 2013). Figura 2. La AI esporofítica está determinada por el haplotipo S del genotipo diploide del polen. Si alguna de las dos proteínas S del polen coinciden con una de las expresadas en el pistilo S1S2, el polen será rechazado (en este caso S1S2, S2S3 y S1S4). Si no hay coincidencia alélica, el polen podrá germinar y crecer hasta fecundar el óvulo (en este caso S3S4) (García-Valencia et al., 2013). 15 El locus S en Brassica alberga tres genes, SRK, SP11 y SLG. La determinante femenina SRK es un receptor de cinasa que se extiende en la membrana plasmática de la célula papilar estigmática. SP11 es la determinante masculina, que se expresapredominantemente en el tapete de la antera y se acumula en la cubierta del polen durante su maduración. Después de la polinización, SP11 penetra la pared celular de la célula papilar y se une con SRK, de manera S-específica. Esta unión induce la autofosforilación de SRK y una cascada que termina en el rechazo del polen propio. SLG no es esencial para el mecanismo de AI esporofítica pero aumenta la respuesta de rechazo en algunos haplotipos S (Takayama e Isogai, 2005). AI gametofítica Las familias Solanaceae, Rosaceae y Plantaginaceae, presentan AI gametofítica, que también está controlada por el locus S. En el locus S, se encuentran ligados dos genes: la determinante femenina que codifica a una ribonucleasa (S-RNasa) y se expresa en pistilo, y la determinante masculina que es una proteína de caja F (SLF/SFB) y se expresa en el polen. La interacción entre la S-RNasa y SLF/SFB determina si el polen es compatible o incompatible (De Nettancourt, 2001). Por ejemplo, (ver figura 3) en una planta con genotipo S1S2 se producirán unos granos de polen S1 y otros S2, y el genotipo del pistilo diploide será S1S2. Si llega polen S1 o S2 al estigma de esta planta, sí podrá germinar, pero se verá inhibido el crecimiento del tubo polínico a nivel del estilo. En cambio, si llega un grano de polen con un haplotipo S diferente, este podrá crecer hasta alcanzar el ovario (García-Valencia et al., 2013). Papaver rhoeas también presenta AI gametofítica, pero el mecanismo es diferente, la determinante femenina (proteína S) induce una cascada de señalización dependiente de calcio que resulta en la muerte del tubo polínico incompatible, por lo que es independiente de S-RNasa (Wheeler et al., 2009). 16 Los productos del alelo S en Solanaceae Las proteínas S presentes en pistilo en la familia Solanaceae tienen actividad de ribonucleasa, por lo que se conocen como S-RNasas. Las células del estigma, estilo y ovario secretan S-RNasa a la matriz extracelular, que guía el tubo polínico hacia el óvulo (Anderson et al., 1989; Cornish et al., 1987). Son glicoproteínas básicas de 30-35 kDa que se pueden acumular en altas concentraciones (Jahnen et al., 1989). La actividad de ribonucleasa es necesaria para el rechazo del polen (Huang et al., 1994) y se encontró que el RNA del polen es degradado en polinizaciones incompatibles, lo que no ocurre en compatibles (McClure et al., 1990). Las S-RNasas son altamente polimórficas, aunque tienen 5 regiones conservadas. Por cristalización de dos diferentes S-RNasas, se encontraron regiones conservadas en el centro hidrofóbico de la proteína y en el sitio activo (Ida et al., 2001; Igik y Kohn, 2001). Las regiones variables se encuentran en la superficie donde se da la interacción con factores del polen o del pistilo (Cruz-García et al., 2005). Las S-RNasas entran al tubo polínico en cruzas compatibles e incompatibles y son almacenadas en una vacuola. En cruzas incompatibles, se observa la ruptura de la vacuola liberando a las S-RNasas al citoplasma del tubo polínico, donde se degrada su RNA e inhiben su crecimiento. En cambio, en una cruza compatible la vacuola se mantiene estable y el tubo polínico crece hasta el ovario (Goldraij et al., 2006). Figura 3. La AI gametofítica está determinada por el haplotipo S del genotipo haploide del polen. El polen que tenga el mismo haplotipo S que pistilo S1S2, será rechazado (en este caso polen S1 y S2). Si no hay coincidencia alélica, el polen podrá germinar y crecer hasta fecundar el óvulo (en este caso S3) (García- Valencia et al., 2013). 17 El primer antecedente para encontrar a la determinante masculina se obtuvo al analizar la secuencia del locus S de Antirrhinum hispanicum, de la familia Scrophulariaceae (Takayama e Isonagai, 2005). La región analizada contenía un gen que codificaba para una proteína de caja F, que se expresa de manera específica en antera y polen. Se localizaba a 9 kb río abajo del gen de la S2-RNasa y codificaba un polipéptido de 376 aminoácidos con un dominio conservado de caja F cerca del amino terminal (Lai et al., 2002). Posteriormente, se encontró en Prunus mume un candidato del gen de la determinante S en polen, llamado SLF (S-locus F-box) con los siguientes criterios: 1) se encontraba en una región altamente divergente del locus S, 2) presentaba diversidad haplotipo S específica dentro de los haplotipos S analizados, y 3) se expresaba específicamente en polen y no en pistilo (Entani et al., 2003). Finalmente, la evidencia contundente de que SLF codificaba la determinante masculina en polen, fue que al transformar granos de polen con el mismo haplotipo S del pistilo, estos eran rechazados (Sijacic et al., 2004). Genes modificadores Aunque la especificidad del rechazo del polen en la autoincompatibilidad sexual está determinada por la interacción entre la S-RNasa y SLF, no son suficientes para causar la respuesta de rechazo. Otros genes no ligados al locus S, son esenciales para el mecanismo de la AI, y son denominados genes modificadores (GM). Los genes modificadores se pueden clasificar en tres grupos (McClure et al., 2000): los factores del grupo I afectan de manera directa la expresión de los genes que determinan la especificidad (SLF y S-RNasa), por ejemplo, el locus MDF en Petunia axillaries, suprime la expresión de la S13-RNasa lo que resulta en un fenotipo de autocompatibilidad (Tsukamoto et al., 1999; 2003). El grupo II se compone por factores que interaccionan genética o bioquímicamente con las determinantes de especificidad sin afectar su expresión, por lo que su función radica en la respuesta de autoincompatibilidad. Los factores del grupo II identificados a la fecha son 120K (Hancock et al., 2005), HT-B (Goldraij et al., 2006), MdABCF (Meng, D 18 et al., 2014), NaStEP (Jiménez-Durán et al., 2013) y NaSIPP (Garcia-Valencia et al., 2017), los cuales se describen posteriormente. Los factores del grupo III incluyen genes que se involucran en el mecanismo de rechazo del polen y también en otras interacciones de polen-pistilo. Algunas proteínas que podrían clasificar dentro de este grupo son: TTS (Trasmitting Tissue Specific), una proteína que atrae a los tubos polínicos en N. tabacum y N. alata (Cheung et al., 1995; Wu et al., 2000), PELPIII (class III Pistil-specific Extensin-like Protein), una proteína tipo extensina (de Graaf et al., 2003), SBP1 (S-RNase Binding Protein 1) que interacciona con dominios conservados de la S-RNasa (O’Brien et al., 2004), y NaTrxh, una tiorredoxina h que se secreta a la matriz extracelular del tejido de transmisión de N. alata y que reduce específicamente a las S-RNasas in vitro (Juárez-Díaz et al., 2006). 120K 120K es una glicoproteína que se encuentra en estilos de especies de Nicotiana y se une a la S-RNasa in vitro (Cruz-García et al., 2005). Tiene alto polimorfismo en tamaño entre diferentes especies de este género; un mayor tamaño de la proteína, correlaciona con que la especie presente rechazo S-específico. Usando RNA de interferencia (RNAi) se suprimió la expresión de 120K en híbridos de AC N. plumbaginifolia x AI N. alata, y se encontró que estas plantas transgénicas pierden la capacidad de rechazar el polen con el mismo haplotipo S, por lo que está participando en la AI. Sin embargo, conservan la capacidad de rechazar el polen de N. plumbaginifolia (rechazo interespecífico) (Hancock et al., 2005). Por inmunolocalización se determinó que 120K se incorpora a las vacuolas de los tubos polínicos en la que se encuentran las S-RNasas, en cruzas compatibles e incompatibles (Goldraij et al., 2006). HT-B El gen HT-B (High Top-Band) codifica para HT-B, una proteína pequeña (101 residuos) con una región rica en asparagina cerca del carboxilo terminal (Kondo y McClure, 2008). Se expresa en N. alata, una especie autoincompatible,y no en N. plumbaginifolia 19 (autocompatible) (McClure et al., 1999). Se ha descrito en diferentes géneros de Solanaceae: Petunia (Kondo et al., 2002b; Sassa e Hirano, 2006; Puerta et al., 2009), Solanum (O’Brien et al., 2002; Kondo et al., 2002a), y Nicotiana (McClure et al., 1999). El análisis de RNA-blot muestra que el transcrito de HT se acumula en el estigma y en el estilo antes de la antesis (apertura de la flor) y se correlaciona con el desencadenamiento del rechazo S-específico en el estilo. Con RNAi se suprimió la expresión de HT-B en plantas transgénicas de Nicotiana y se evaluó su capacidad de rechazar el polen propio. Se encontró que estas plantas pierden la capacidad de hacerlo, por lo que se concluyó que HT-B es un gen modificador de la AI (McClure et al., 1999). Lo mismo ocurre en Petunia y Solanum (Sassa e Hirano, 2006; Kondo et al., 2002a; O’Brien et al., 2002; Kondo et al., 2002b). Por inmunolocalización, se encontró que HT-B, al igual que las S-RNasas, entran a los tubos polínicos. Cuando el pistilo no expresa HT-B, en las plantas trangénicas RNAi:HT-B, la vacuola con las S-RNasas permanece estable, por lo que no hay rechazo del polen. Algo parecido ocurre en plantas de N. alata AI cuando la cruza es compatible, ya que se degrada HT-B y la vacuola con las S-RNasas permanece estable, por lo que el tubo polínico llega al ovario. Se propone que la estabilidad de HT-B es fundamental para el rechazo S- específico (Goldraij et al., 2006). MdABCF El gen MdABCF se encontró en manzana (Malus domestica), el cual codifica para un transportador del grupo F de la familia de transportadores ABC, que está involucrado en el transporte de la S-RNasa al tubo polínico y se localiza en la membrana del mismo. Cuando se silencia con RNAi el gen MdABCF, la S-RNasa no puede entrar al tubo polínico y se pierde la capacidad de rechazar el polen propio. Además, se encontró que MdABDF transporta a la S-RNasas independiente del genotipo de la cruza (compatible o incompatible) y que se coordina con el citoesqueleto para transportarla (Meng et al., 2014). 20 NaStEP NaStEP (Nicotiana alata Stigma Expressed Protein) es un homólogo de inhibidores de proteasas tipo Kunitz, que se expresa específicamente en estigmas maduros de Nicotiana alata AI y no en otras especies de Nicotiana compatibles (N. plumbaginifolia, N. tabacum, N. longiflora). Se localiza en vacuolas de las células estigmáticas y cuando el estigma es polinizado, se observa un aumento en su síntesis, y posteriormente su liberación al exudado estigmático involucrando rompimiento celular (Busot et al., 2008). Por inmunolocalización (figura 4) se observó que NaStEP ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles en etapas tempranas posteriores a la polinización (6-9 horas) (Jiménez-Durán et al., 2013). Figura 4. NaStEP se incorpora a los tubos polínicos compatibles e incompatibles, se muestran observaciones a las 6 y 9 horas post-polinización. PT, tubo polínico; STC célula estigmática. (Modificado de Jiménez-Durán et al., 2013). Para probar si NaStEP se requería para el rechazo S-específico, se silenció el gen con RNAi:NaStEP en híbridos de N. plumbaginifolia AC x N. alata AI (figura 5). Los híbridos transformados se polinizaron con polen compatible e incompatible, y se encontró que hay pérdida del rechazo S-específico del polen, por lo que es un gen modificador estigmático de la AI sexual (Jiménez-Durán et al., 2013). 21 Además, se observó que en estas plantas transgénicas con NaStEP suprimida, los niveles de HT-B están disminuidos cuando los pistilos son polinizados en cruzas tanto compatibles como incompatibles (figura 6), en contraste con N. alata AI, en que solamente en las cruzas compatibles HT-B es degradado (Goldraij et al., 2006). Esto indica que NaStEP es necesaria para la estabilidad de HT-B en la respuesta de rechazo S-específico del polen propio (Jiménez-Durán et al., 2013). Figura 6. Los niveles de HT-B disminuyen en una planta con NaStEP suprimida. A, pistilos del híbrido transformado con NaStEP suprimida se polinizaron con polen SC10 (incompatible) o S105 (compatible) y se evaluaron los niveles de HT-B y SC10-RNasa a las 16, 36 y 72 h después de la polinización. B, pistilos de N. alata con genotipo silvestre se polinizaron con polen SC10 (incompatible) o S105 (compatible) y se evaluaron los niveles de HT-B y SC10-RNasa a las 16, 36 y 72 h después de la polinización (modificado de Jiménez-Durán et al., 2013). NaStEP se compone de 243 residuos (Busot et al., 2008) y tiene un punto isoeléctrico teórico de 4.9 (Cruz González Zamora, no publicado). Se realizó un modelo tridimensional de NaStEP y se utilizó para compararla estructuralmente con otros inhibidores tipo Kunitz, con el fin de inferir su posible función. Por análisis Figura 5. La supresión de NaStEP resulta en la pérdida del rechazo S-específico del polen propio. Cuando se poliniza un híbrido sin transformar Nicotiana plumbaginifolia AC RNAiStEP x Nicotiana alata AI S105S105, sólo el polen SC10 (compatible) llega a la base del estilo. En contraste, en el híbrido transformado el polen S105 (incompatible) al igual que el SC10 (compatible) llegan a la base del estilo, lo que indica que se perdió el rechazo S-específico (modificado de Jiménez-Durán et al., 2013). 22 bioinformático, se encontró similitud con un inhibidor de subtilisina/amilasa de cebada (ver figura 7) (Jiménez-Durán et al., 2013). Figura 7. Modelo de la estructura tridimensional de NaStEP. A, Estructura muestra en amarillo las hebras β. El sitio reactivo de inhibidor de subtilisina se muestra en morado. Los puentes disulfuro se muestran según el esquema coloreado. B, topología del modelo en A, mostrando la conectividad clásica de la superfamilia Kunitz. C, comparación STAMP de la secuencia de aminoácidos con el inhibidor de subtilisina/α-amilasa de cebada. En la caja gris se marca el sitio reactivo de inhibidor de subtilisina (Jiménez-Durán et al., 2013). Para probar su actividad como inhibidor de subtilisina, se realizó un ensayo de zimograma reverso (ver figura 8). El ensayo consiste en separar las proteínas en un SDS-PAGE con gelatina añadida al gel y después incubarlo con subtilisina, la cual degrada a la gelatina por su actividad proteolítica. Si se presentan bandas donde no se 23 degrada la gelatina, corresponden a las proteínas que están inhibiendo a la subtilisina. La aprotinina se utiliza como control, ya que presenta alta actividad como inhibidor. Se encontró que NaStEP presentó bandas donde no hubo degradación, lo que confirmó su actividad como inhibidor de subtilisina (Jiménez-Durán et al., 2013). Figura 8. NaStEP es un inhibidor de subtilisina. A, tinción con azul de Coomassie de NaStEP purificada. B, zimograma reverso donde NaStEP inhibe la actividad proteolítica de la subtilisina. C, Inmunoblot anti-NaStEP después de zimograma. (Jiménez-Durán et al., 2013). NaStEP no sólo presenta actividad como inhibidor de subtilisina (serin-proteasa), sino que también inhibe otras proteasas (figura 9). Usando azocaseína como sustrato, NaStEP inhibe diferentes proteasas como tripsina (serin-proteasa), termolisina (metaloproteasa) y papaína (cisteín-proteasa) (Nájera-Torres, no publicado). Sin embargo, se desconoce si su función como inhibidor de proteasas se requiere para el mecanismo de rechazo del polen. 24 NaSIPP NaSIPP (Nicotiana alata Self-Incompatibility Pollen Protein) es una proteína mitocondrial con actividad de acarreador de fosfatos que interacciona con NaStEP. Cuando se coexpresa NaStEP y NaSIPP en tubos polínicos de N. tabacum (figura 10), colocalizan en la mitocondria. Sin embargo, cuando sólo se expresa NaStEP, esta permanece en el citoplasma, lo que implica que es necesario la interaccióncon NaSIPP para que NaStEP se transloque a la mitocondria (García-Valencia et al., 2017). Figura 9. NaStEP inhibe diferentes tipos de proteasas. Se presenta la actividad total de diferentes proteasas en presencia y ausencia de NaStEP como inhibidor. (Nájera-Torres, no publicado). Figura 10. La interacción entre NaStEP y NaSIPP ocurre en la mitocondria de los tubos polínicos. A, Expresión de NaSIPP- Tomate (rojo) muestra un patrón punteado característico de mitocondrias. B, La expresión de NaStEP-GFP (verde) se observa en el citosol del tubo polínico. C, Coexpresión de NaSIPP-tomate con NaStEP-GFP en canal rojo. D, canal verde. E, solapamiento de canal rojo y verde muestra colocalización de NaStEP y NaSIPP en mitocondria (García-Valencia et al., 2017). 25 El transcrito de NaSIPP se acumula de manera específica en polen maduro de Nicotiana spp., y en especies compatibles, el gen ha acumulado mutaciones, por lo que difícilmente producen una proteína funcional. El que tenga actividad de acarreador de fosfatos mitocondrial y se exprese específicamente en polen maduro, sugiere que su función puede estar relacionada con los requerimientos energéticos del crecimiento del tubo polínico. La supresión de NaSIPP en tubos polínicos se realizó bombardeando polen de N. alata con RNAi:NaSIPP, y el fenotipo observado fue la incapacidad de rechazar el polen con el mismo haplotipo S que el pistilo receptor, demostrando que NaSIPP es esencial para la AI. Los resultados son consistentes con un modelo en que la interacción de NaStEP y NaSIPP en tubos polínicos incompatibles desestabilizan la mitocondria y contribuyen a la muerte del tubo polínico por un mecanismo de muerte celular programada (García-Valencia et al., 2017). Modelo de rechazo del polen en Solanaceae La figura 11 incorpora tanto los eventos conocidos (texto en recuadros) después de la polinización en Solanaceae, como las hipótesis (texto sin recuadros) relacionadas con la función de NaStEP en el sistema de rechazo del polen. Tanto en cruzas compatibles como incompatibles, el polen germina y NaStEP entra a los tubos polínicos en etapas tempranas (Jiménez-Durán et al., 2013). Las S-RNasas, HT-B y 120K también ingresan a los tubos polínicos sin importar el haplotipo S (Goldraij et al., 2006). Las S-RNasas ingresan mediante el transportador ABCF (Meng et al., 2014), y se compartamentalizan en una vacuola. Las proteínas 120K y HT-B se asocian al sistema endomembranoso (Goldraij et al., 2006). En una cruza compatible (parte superior del esquema), en la cual hay una interacción alelo S inespecífica entre S-RNasa y SLF (por ejemplo, SLF1-S2RNasa), resulta en la degradación de la proteína HT-B (Goldraij et al., 2006), por lo que la vacuola con las S- RNasas se mantiene intacta, se traduce el RNA y el TP crece hasta alcanzar el ovario. La estabilidad de HT-B es dependiente de NaStEP (Jiménez-Durán et al., 2013), por lo 26 que se hipotetiza que en una cruza compatible NaStEP también se degrada, dejando libre a una posible proteasa que degrada HT-B. En una cruza incompatible (parte inferior del esquema), al haber una interacción S alelo específica (por ejemplo, SLF1-S1RNasa), HT-B se mantiene estable dentro del TP, por lo que favorece el rompimiento de la vacuola y se liberan las S-RNasas al citoplasma, hay una degradación del RNA y se inhibe el crecimiento del tubo polínico (Goldraij et al., 2006). Como en una cruza incompatible HT-B se mantiene estable y depende de la presencia de NaStEP (Jiménez-Durán et al., 2013), se hipotetiza que el posible mecanismo consiste en que NaStEP inhibe a la proteasa de HT-B, ya que NaStEP presenta actividad de inhibidor de proteasas in vitro (Jiménez-Durán et al., 2013; Nájera-Torres, no publicado). Por otro lado, también se conoce que NaStEP interacciona con NaSIPP en mitocondria, lo cual ha llevado a proponer que en una cruza incompatible la interacción NaStEP-NaSIPP podría desestabilizar la mitocondria y contribuir a la muerte del TP por un mecanismo de muerte celular programada (García- Valencia et al., 2017). 27 NaStEP entra al TP S-RNasas entran al TP mediante ABCF S-RNasas se comparta- mentalizan en vacuolas 120K y HT-B entran al TP y se asocian al sistema endomem- branoso Interacción S-alelo inespecífica SLF1-S2RNasa HT-B se degrada Vacuolas con las S- RNasas se mantienen intactas Traducción del RNA TP crece hasta alcanzar el ovario NaStEP interacciona con NaSIPP en mitocondria de TP NaStEP entra al TP S-RNasas entran al TP mediante ABCF S-RNasas se comparta- mentalizan en vacuolas 120K y HT-B entran al TP y se asocian al sistema endomem- branoso Interacción S-alelo específica SLF1-S1RNasa HT-B se mantieneVacuolas con las S- RNasas se rompen Degradación del RNA Inhibición del crecimiento del TP NaStEP interacciona con NaSIPP en mitocondria de TP Cruza compatible Cruza incompatible ¿NaStEP se degrada? ¿Proteasa de HT-B activa? ¿NaStEP se mantiene? ¿NaStEP inhibe proteasa de HT-B? ¿Desestabilización mitocondrial que lleva a MCP? Figura 11. Modelo de AI en Solanaceae. Esquema que indica los eventos conocidos después de la polinización en Solanaceae (en recuadros) y los eventos que se hipotetizan (texto sin recuadros) con relación a la función de NaStEP en cruzas compatibles e incompatibles (modificado de Cruz-García, no publicado y García-Valencia, 2018). 28 Justificación En la actualidad se conoce que la estabilidad de la vacuola que contiene a las S- RNasas en una cruza compatible depende de que HT-B se degrade, y también se sabe que NaStEP es un regulador positivo de HT-B. Sin embargo, no se conoce si NaStEP en una cruza compatible también se degrada pero se hipotetiza que sí, y para probarlo, en este trabajo se comenzó con el establecimiento de las condiciones y parámetros para determinar si la aplicación exógena de NaStEP nativa y funcional en plantas silenciadas con RNAi:NaStEP, restablece la AI. Con este sistema establecido se podrá evaluar la degradación de NaStEP en los tubos polínicos en una cruza compatible. Hipótesis En una planta transgénica de Nicotiana con NaStEP suprimida, al aplicar la proteína nativa de manera exógena se debe restablecer la autoincompatibilidad. Objetivos • Purificar a NaStEP nativa de pistilos de N. alata. • Determinar si NaStEP nativa aplicada de manera exógena ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles. • Determinar si la aplicación exógena de NaStEP nativa restablece la autoincompatibilidad. 29 Metodología Purificación de NaStEP nativa de pistilos de N. alata 1. Pulverizar 2 g pistilos de N. alata con nitrógeno líquido y agregar solución amortiguadora de extracción (acetato de potasio 50 mM pH 5.5 + PMSF 2mM) en el mortero, revolver hasta obtener una consistencia de helado. 2. Pasar la muestra a tubo de teflón e incubar en hielo durante 20 minutos. 3. Centrifugar a 10,000 rpm por 20 minutos a 4ºC. Tomar sobrenadante sin la nata que se forma en la superficie. 4. Pasar la muestra por la columna de intercambio aniónico débil Hi-Trap Capto DEAE 1 mL (GE 17505501) previamente equilibrada con solución de acetato de potasio 50 mM pH 5.5 y colectar la fracción no unida. Después lavar con solución de acetato de potasio 50 mM pH 5.5 + NaCl 1M sin agradiente. 5. Precipitar la fracción no unida con sulfato de amonio al 60% O/N a 4ºC. 6. Centrifugar a 10,000 rpm a 4ºC por 20 minutos y resuspender botón con 1.5 mL de acetato de potasio 50 mM pH 4.0. 7. Desalar la muestra con Hi-Trap Desalting de 5 mL (GE17-1408-01 SIGMA), fraccionando de mL en mL. 8. Juntar las fracciones sin sulfato de amonio, con proteína. 9. Aplicar las fracciones a columna HiTrap Capto S 1 mL (GE 17371751) previamente equilibrada con acetato de potasio 50 mM pH 4.0. 10. Eluir con gradientede NaCl 1M de 0 al 100%, fraccionando cada 500 µL. 11. Precipitar las fracciones que tengan proteína con 4 volúmenes de acetona al 100% O/N a -20ºC. 12. Centrifugar a 10,000 rpm a 4ºC por 20 minutos y resuspender botón con 100 µL de acetato de potasio 50 mM pH 4.0. Cuantificar la cantidad de proteína en la muestra a 280 nm en BioDrop µLite Spectrophotometer (80-3006-51). Los pasos de cromatografía se realizaron en un equipo de FPLC Äkta Pure 25 L (GE 29018224). 30 Monitoreo de la purificación de NaStEP 1. Preparar las muestras de los pasos de purificación colocando por cada 5 µL de estas, 1 µL de amortiguador de carga (3.75% SDS, 0.05M DTT, 5 mM EDTA, 15% sacarosa, 0.0012% azul de bromofenol y 0.15M Tris-HCl pH 6.8). El extracto crudo y la fraccion no unida a DEAE hervirlas por 10 minutos. 2. Separar electroforéticamente 5 µL de extracto crudo, 5 µL de la fracción no unida a DEAE, 5 µL de filtración molecular y 10 µL de la fracción 7 de Capto S en un gel SDS-PAGE al 12%. Realizar por duplicado. 3. Teñir las proteínas de un gel con azul de Coomassie. Inmunodetección de NaStEP 1. Transferir el segundo gel a una membrana de Immobilon-P Transfer Membrane con un tamaño de poro de 0.45 µm (Millipore IPVH00010) 40 minutos a 80 mA. 2. Incubar con solución de bloqueo: 5% leche en PBS 1X (diluído de una solución 10X: 1.37 M NaCl, 27mM KCl, 43 mM Na2HPO4⋅7H2O, 14 mM NaH2PO4⋅H2O, pH 7.3 ajustado con NaOH y esterilizado en autoclave) durante 1 h a temperatura ambiente. 3. Desechar solución y agregar anticuerpo primario policlonal hecho en conejo anti- NaStEP (contra el péptido WEGSKDGMPVKFFT) dilución 1:10,000 en solución de bloqueo. Dejar toda la noche a 4ºC. 4. Guardar anticuerpo primario a -20ºC y lavar la membrana 2 veces con PBS 1x + 0.1% Tween-20 5 min y 10 min. 5. Agregar anticuerpo hecho en cabra anti-conejo conjugado con fosfatasa alcalina (invitrogen G21079) dilución 1:10,000 e incubar por 1 h a temperatura ambiente. 6. Lavar con PBS 1x + 0.1% Tween-20 3 veces 10 min cada uno. 7. Incubar membrana con amortiguador pH 9.5 (12.1 g/L tris-HCl, 5.8 g/L NaCl,1 g/L MgCl2) durante 10 minutos. 31 8. En 10 mL de amortiguador pH 9.5 agregar 100 µL de nBT (nBT 33 mg/mL en 70% DMSO) y 100 µL de BCIP (BCIP 17 mg/mL en 100% DMSO). Dejar revelar hasta la intensidad deseada. 9. Detener la acción de la fosfatasa alcalina con agua y 20 µL de EDTA 0.5 M. Actividad de NaStEP como inhibidor de subtilisina 1. Preparar lo siguiente en tubos de 600 µL por separado: • Blanco: 50 µL solución amortiguadora (acetato de potasio 50 mM pH 4.0, acetato de potasio 50 mM pH 5.5, fosfato de sodio 50 mM pH 6.0, y tris-HCl 50 mM pH 7.0, dependiendo del ensayo). • Proteasa: 20 mU subtilisina + solución amortiguadora para volumen final de 50 µL. • Proteasa + inhibidor: 20 mU subtilisina + 1 µg de NaStEP + solución amortiguadora para volumen final de 50 µL. 2. Incubar 15 minutos a 37ºC. 3. Agregar a cada tubo 50 µL de azocaseína al 1% en la solución amortiguadora con el pH correspondiente a cada ensayo. 4. Incubar 10 minutos a 37ºC. 5. Agregar 20 µL de TCA al 20% para detener la reacción y agitar con vortex. 6. Centrifugar a 14,000 rpm durante 10 minutos. 7. En una placa de 96 pozos Nunc MaxiSorp flat-bottom (Invitrogen 44-2404-21) colocar 20 µL de NaOH 2N por cada muestra. 8. Agregar al pozo 100 µL del sobrenadante de la reacción. 9. Agitar en agitador de placas IKA MS 3 digital (Z645044 ALDRICH) por 30 segundos. 10. Medir absorbancia a 450 nm en lector de placas Epoch (BioTek 1310301). 32 Inmunolocalización de NaStEP y calosa. Material vegetal: polen de N. alata SA2SA2 y de N. alata SC10SC10 , pistilos del híbrido transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 y de N. alata SC10SC10. 1. Emascular flores 48 h antes de antesis. 2. Después de 3 días, ya que los estigmas estén receptivos (húmedos), colocar en el estigma 1 µL de NaStEP (200 ng). 3. Esperar 1 hora a que se absorba y colectar una antera de una flor de N. alata SC10SC10 (incompatible) y otra de SA2SA2 (compatible). 4. Polinizar las flores emasculadas con el polen (compatible o incompatible) que corresponda, cubriendo toda la superficie del estigma. 5. Fijar el tejido en una solución de formaldehído al 4% en amortiguador de PBS 1X durante 2 h a temperatura ambiente. 6. Realizar 3 lavados con amortiguador PBS 1X durante 10 min cada uno. 7. Deshidratar el tejido en una serie gradual de etanoles (30, 50, 70, 85, 96, y 100%) por 30 min en cada uno y en hielo. 8. Colocar el tejido en etanol absoluto por 30 min a 37ºC (hacer lavados cada 30 min hasta que el color verde sea extraído completamente). 9. Infiltrar el tejido en una mezcla de EtOH absoluto - Steedman’s wax (Electron Mycroscopy Sciences 19312) 3:1, 1:1 y 1:3 por 12 h en cada uno a 37ºC. 10. Infiltrar en Steedman’s wax pura por 12h a 37ºC. Repetir cambiando la cera por cuatro veces. 11. Incluir el tejido en un molde de metal con Steedman’s wax líquida. Orientar el tejido con ayuda de una aguja de disección. 12. Obtener los bloques del tejido con ayuda de una navaja. 13. Montar los bloques en pedazos de madera. 14. Realizar cortes de 10 µm de grosor en un microtomo de rotación. 15. Colocar los cortes en un baño de flotación con agua destilada a temperatura ambiente y capturarlos en portaobjetos Poly-Prep Slides (SIGMA P0425-72EA). 33 16. Dejar secar los cortes perfectamente por dos días a temperatura ambiente y posteriormente guardarlos libres del polvo a 4ºC hasta su uso. 17. Eliminar la cera sumergiendo los cortes en EtOH absoluto por 10 min. Repetir tres veces. Nota: la primera vez a 37ºC. 18. Hidratar el tejido en una serie gradual de EtOH (75, 50, 25%) por 15 min en cada uno. 19. Colocar las preparaciones en PBS 1X por 15 min. 20. Secar las preparaciones con papel filtro o gasa y marcar alrededor de los cortes con un plumón Aqua-Hold Pap (Electron Microscopy Sciences 71311). 21. Colocar las preparaciones en una cámara húmeda y aplicar 100 µL de solución de bloqueo (10% BSA en amortiguador de PBS 1X) por cada preparación. Incubar por 1 h a temperatura ambiente con agitación. 22. Eliminar la solución de bloqueo y colocar los anticuerpos primarios (dilución 1:2,000 anti-NaStEP y anti-calosa). Incubar el anticuerpo primario por toda la noche a 4°C. 23. Guardar los anticuerpos primarios y lavar tres veces con PBS 1X por 10 min cada uno con agitación. 24. Aplicar los anticuerpos secundarios: goat a-rabbit Alexa 488 dilución 1:200 para anti-NaStEP y goat anti-mouse Alexa 568 1:200 para anti-calosa. Incubar por 4 h a temperatura ambiente con agitación. Mantener en obscuridad. 25. Lavar 3 veces con PBS 1X por 10 min cada uno y en obscuridad. 26. Agregar a las preparaciones medio de montaje Clarion Mounting Medium (C0487 SIGMA) y sellar con barniz de uñas transparente. 27. Guardar las preparaciones a 4ºC en obscuridad. 28. Las observaciones se realizan en un microscopio confocal de fluorescencia ZEISS LSM 510 META. 34 Squash de estilos polinizados y tinción con azul de anilina de tubos polínicos Material vegetal: polen de N. alata SA2SA2 y de N. alata SC10SC10 , pistilos del híbrido N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 y del híbrido no transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI SC10S0. 1. Emascular flores 48 h antes de antesis. 2. Después de 3 días, ya que los estigmas estén receptivos, colocar en el estigma 1 µL de NaStEP (200 ng). 3. Esperar 1 hora a que se absorba y mientras colectar una antera de una flor SC10SC10 (incompatible) y otra de SA2SA2 (compatible). 4. Polinizar las flores emasculadas con el polen (compatible o incompatible) que corresponda. 5. Colectar a las 72 h post-polinización y fijar en etanol-ácido acético 3:1 durante 1 día. 6. Transferirestilos a una solución de sulfito de sodio al 10% y meter en autoclave durante 5 minutos (comienza a contar cuando se llega a 121ºC). 7. Transferir estilos a solución de azul de anilina 0.1% por lo menos 12 h. 8. Montar estilos en portaobjetos adicionando azul de anilina y hacer el aplastado con un cubreobjetos. 9. Sellar con barniz de uñas transparente. 10. Observar en microscopio de epifluorescencia a 360 nm. Nota: siempre mantener las preparaciones en obscuridad y a 4ºC. 35 Resultados Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata. Se realizó un protocolo de purificación de NaStEP distinto al reportado por Busot et al. (2008) con el propósito de mejorar el rendimiento y simplificar los pasos de purificación. NaStEP es una proteína de aproximadamente 26 kDa y tiene un punto isoeléctrico teórico de 4.9 (Cruz González-Zamora, no publicado). Dado su carácter ácido, se utilizaron cromatografías de intercambio iónico para purificarla, modificando el protocolo reportado por Uchikoba et al., (1995). La primera cromatografía fue de intercambio aniónico débil DEAE GE 17505501 (figura 12). La fracción no unida se precipitó con sulfato de amonio al 60%. Posteriormente, la muestra se desaló utilizando una cromatografía de filtración molecular con la columna Hi-trap desalting GE17-1408-01 SIGMA (figura 13). Finalmente, se realizó una cromatografía de intercambio catiónico Hi-trap Capto S (GE 17371751), eluyendo con un gradiente de cloruro de sodio (figuras 14 y 15). Se precipitaron con acetona las fracciones resultantes y se resuspendieron con solución amortiguadora de acetatos 50 mM pH 4.0. Figura 12. Cromatograma del intercambio catiónico débil DEAE. Se colectó la fracción no unida que corresponde al pico de mayor absorbancia del minuto 19 al 26 (en azul). 36 Figura 13. Cromatograma de la filtración molecular con la columna Hi-Trap desalting. Se colectó el pico de mayor absorbancia a 280 nm del minuto 2 al 3 (pico azul), para descartar el sulfato de amonio (pico naranja de mayor conductividad). Figura 14. Cromatograma del intercambio catiónico fuerte Hi-Trap Capto S. Se colectaron las fracciones de la elución 7 a 15 de la fase de elución con gradiente de cloruro de sodio 1 M. Cond NaCl (1M) UV 37 Figura 15. Acercamiento de la figura 14 en la fase de elución con gradiente de cloruro de sodio 1M. Se colectaron las fracciones 7 a 15. En la figura 16 se muestra la separación por SDS-PAGE de las fracciones obtenidas en los diferentes pasos de la purificación y un ensayo tipo réplica de Western-blot con anticuerpo anti-NaStEP. El anticuerpo reconoció una banda de aproximadamente 26 kDa y en algunos pasos de purificación también reconoció una banda de menor peso molecular. UV Cond NaCl (1M) 38 Figura 16. Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata. A; 5 µL de Extracto Crudo, fracción No Unida a DEAE y de Filtración Molecular, 10 µL de fracción 7 unida a Capto S (Capto S 7) se separaron por SDS- PAGE con gel de poliacrilamida al 12% y se realizó una tinción con azul de Coomassie. B. Las proteínas se transfirieron a una membrana de nitrocelulosa y se inmunodetectaron con anticuerpo anti-NaStEP 1:10,000. NaStEP corresponde a la banda de aprox. 26 kDa y está presente en todas las fracciones. MP, marcador de peso molecular; EC, extracto crudo; NU DEAE, fracción no unida a columna de intercambio aniónico DEAE; FM, filtración molecular Hi-Trap desalting; CS 7. fracción 7 de la elución con gradiente de NaCl de cromatografía de intercambio catiónico fuerte Hi-Trap Capto S. 39 NaStEP inhibe a la subtilisina NaStEP es un inhibidor de proteasas tipo Kunitz e inhibe a la subtilisina (Jiménez-Durán et al., 2013). Con el fin de determinar si las fracciones obtenidas de la purificación inhibían a la subtilisina, se realizó un ensayo de actividad. Se utilizó azocaseína como el sustrato de degradación de la subtilisina, y la propiedad que se midió fue la absorbancia a 450 nm del colorante azoico liberado por la proteólisis. A mayor absorbancia, mayor actividad proteolítica de la subtilisina, y cuando se realiza el ensayo agregando NaStEP, se espera que la actividad proteolítica disminuya. Se hizo el ensayo sin agregar NaStEP (únicamente con subtilisina) a diferentes valores de pH (figura 17), y se observa que la actividad proteolítica aumenta al incrementar el pH, presentando su máxima actividad a pH 7. Como a pH 4 y 5.5 no presentó suficiente actividad como para medir su inhibición, el ensayo con NaStEP como inhibidor se realizó únicamente a pH 6.0 y 7.0, utilizando fracciones de NaStEP resuspendidas en solución amortiguadora de acetatos pH 4.0. En estos valores de pH, la actividad de subtilisina fue diferente estadísticamente en presencia y ausencia de NaStEP. Figura 17. Actividad proteolítica de la subtilisina. Se midió la actividad de 10 mU de subtilisina a pH 4.0, 5.5, 6.0 y 7.0, y se evalúa la actividad en presencia de 1 µg de NaStEP a pH 6.0 y 7.0. Letras diferentes indican diferencia significativa *p<0.05, n=3. 40 A partir de los datos de la gráfica anterior (figura 17), a pH 6.0 y 7.0 se calculó el porcentaje de inhibición que presentó NaStEP sobre la actividad proteolítica de la subtilisina (figura 18). Se utilizó la siguiente fórmula: % 𝑖𝑛ℎ𝑖𝑏𝑖𝑐𝑖ó𝑛 = 100 − .(012 345 657616849) (012;<= 657616849) 𝑥 100? Se encontró que presentó una inhibición de 78% y 85% (a pH 6.0 y 7.0) respectivamente, con lo que se concluyó que la proteína está activa y se podía utilizar para los experimentos subsecuentes. Figura 18. Porcentaje de inhibición de la actividad proteolítica de la subtilisina. Se muestran los porcentajes de inhibición de 10 mU de subtilisina en presencia de 1 µg de NaStEP a pH 6.0 y 7.0 respectivamente. Letras diferentes indican diferencia significativa con *p<0.05, n=3. b 41 NaStEP aplicada de manera exógena ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles Para evaluar si NaStEP aplicada de manera exógena a los híbridos de Nicotiana RNAi:NaStEP ingresa a los tubos polínicos en cruzas compatibles e incompatibles, se agregó NaStEP nativa a estigmas receptivos y posteriormente se polinizó con polen compatible e incompatible. Pasadas 6 horas, se colectaron los pistilos y se evaluó mediante ensayo de inmunolocalización su ingreso a los tubos polínicos. Se utilizaron como anticuerpos primarios anti-NaStEP y anti-calosa. Este último para delimitar los tubos polínicos porque inmunodetecta su pared celular de calosa. En la figura 19 panel A, los híbridos transformados N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 al polinizarlos con polen compatible e incompatible, crecieron los tubos polínicos y NaStEP (verde) no se observa, únicamente se detecta una señal roja que corresponde a la calosa de los tubos polínicos. En N. alata silvestre (figura 20, panel A) se observa que NaStEP es muy abundante en el estigma después de la polinización, y se incorpora a los tubos polínicos en cruzas compatibles como incompatibles, lo cual concuerda con lo reportado en Jiménez-Durán et al., (2013). Ahora, al agregar NaStEP pura en estigmas de las plantas silenciadas para NaStEP (N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0) y después de polinizar (figura 21, panel A), se observa su presencia en el estigma (aunque en menor abundancia que en N. alata silvestre) y se incorpora a los tubos polínicos en crecimiento, en cruzas tanto compatibles como incompatibles. En el panel B de las figuras 19, 20 y 21, se muestra un diagrama del pistilo con el área de observación de los tubos polínicos, la cual fue muy cercana a la superficie estigmática. 42 Fi gu ra 1 9. I nm un oloc al iza ci ón d e N aS tE P en e st ig m as d e hí br id os a ut oc om pa tib le s d e N ic ot ia na c on N aS tE P sil en ci ad o. A , e st ig m as d e N . p lu m ba gi ni fo lia A C X N . a la ta A I R N Ai :N aS tE P S C 10 S 0 f ue ro n po lin iza do s co n po le n S A 2 (c om pa tib le ) y S C 10 (i nc om pa tib le ). Se o bs er va n tu bo s po lín ic os ( ro jo ) y no s e ob se rv a N aS tE P (v er de ), ya q ue e st á sil en ci ad o el g en N aS tE P. S e se ña la c on fl ec ha s a la c al os a de lo s tu bo s po lín ic os (r oj o) . B ar ra s = 20 µ m . B , d ia gr am a de l p ist ilo m os tr an do e l á re a de o bs er va ci ón d e lo s t ub os p ol ín ic os e n cr ec im ie nt o. 43 Fig ur a 20 . In m un ol oc al iz ac ió n de N aS tE P en e st ig m as d e N . al at a. A , e st ig m as d e N . al at a AI S C1 0S C1 0 se p ol in iz ar on c on p ol en S A2 ( co m pa tib le ) y S C 10 (in co m pa tib le ), do nd e se o bs er va q ue N aS tE P in gr es a a lo s tu bo s po lín ic os c om pa tib le s e in co m pa tib le s. S e se ña la c on f le ch as a la c al os a de lo s tu bo s po lín ic os (r oj o) y N aS tE P (v er de ). Ba rr as = 2 0 µm . B , d ia gr am a de l p ist ilo m os tr an do e l á re a de o bs er va ci ón d e lo s t ub os p ol ín ic os e n cr ec im ie nt o. 44 Fi gu ra 2 1. N aS tE P ap lic ad a de m an er a ex óg en a in gr es a a lo s tu bo s po lín ic os c om pa tib le s e in co m pa tib le s.. A , s e a pl ic ó N aS tE P pu rif ic ad a a es tig m as d e lo s hí br id os N . p lu m ba gi ni fo lia A C X N . a la ta A I R N Ai :N aS tE P S C 10 S 0 y s e po lin iz ar on c on p ol en c om pa tib le e in co m pa tib le . S e ob se rv a la p re se nc ia d e N aS tE P ex óg en a de nt ro d el e st ig m a y su in gr es o a lo s tu bo s po lín ic os c om pa tib le s e in co m pa tib le s. S e se ña la c on fl ec ha s a la c al os a de lo s tu bo s po lín ic os (r oj o) y N aS tE P (v er de ). Ba rr as = 2 0 µm . B , d ia gr am a de l p ist ilo m os tr an do e l á re a de o bs er va ci ón d e lo s t ub os p ol ín ic os e n cr ec im ie nt o. 45 Restableciendo la autoincompatibilidad de híbridos de Nicotiana autocompatibles mediante la función de NaStEP Para determinar si la aplicación exógena de NaStEP restablece la respuesta de autoincompatibilidad en la línea de plantas silenciadas RNAi:NaStEP, se agregó NaStEP a estigmas receptivos y se polinizaron flores con polen incompatible y compatible. Se colectaron los pistilos a las 72 horas post-polinización y mediante tinción con azul de anilina (que tiñe la calosa de los tubos polínicos), se observó con el microscopio de fluorescencia si los tubos polínicos habían alcanzado la base del estilo, o si había ocurrido la respuesta de rechazo del polen (figura 22). En el híbrido no transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 (panel A), son numerosos los tubos polínicos compatibles (SA2) que alcanzan la base del estilo, mientras que no se observa ninguno incompatible (SC10). En contraste, en el híbrido transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 (panel B), tanto los tubos polínicos compatibles como incompatibles llegan a la base del estilo. Cuando se agregó de manera exógena NaStEP desnaturalizada por calor (panel C), los TPs que llegaron a la base del estilo en cruzas compatibles e incompatibles también fueron numerosos. Cuando se agregó de manera exógena NaStEP nativa a pistilos de N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0, los tubos polínicos compatibles son numerosos pero el número de tubos polínicos incompatibles es muy reducido (0 a 4). Se hicieron 20 repeticiones del ensayo con polen incompatible (tabla 1), y se cuantificaron tanto los tubos polínicos en la base del estilo (TP BE) y como los que habían germinado (TP G), para calcular un porcentaje. Se hizo un análisis de residuos utilizando la prueba de Grubbs con a=0.01 en el programa Prism 7 (tabla 1) para saber si algún dato se comportaba de manera aleatoria (outliers) y se eliminó el valor de 73.7%, obteniéndose así un porcentaje de tubos polínicos incompatibles que alcanzan la base del estilo agregando NaStEP de manera exógena en los híbridos silenciados RNAi:NaStEP de 20.5 ± 9.5 %, lo que en términos de inhibición del crecimiento corresponde a 79.5 ± 9.5 %. Se realizó un histograma del conteo de tubos polínicos en la base del estilo (figura 23), en el cual se observa que en la mayoría de las repeticiones del ensayo únicamente llegaron de 0 a 4 tubos polínicos incompatibles. 46 Pistilo A. híbrido no transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI SC10S0 B. híbrido transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 C. híbrido transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 + NaStEP desnaturalizada D. híbrido transformado N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 + NaStEP Polen compatible SA2 Polen incompatible SC10 E. Estigma Base del estilo EP EP EP EP EP EP TPs TPs TPs TPs TPs 0 a 4 TPs no hay TPs TPs Figura 22. Evaluación del restablecimiento de la autoincompatibilidad de los híbridos N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0. Aplastados de cruzas compatibles e incompatibles de 72 h pp (post polinización), teñidos con azul de anilina y observados por microscopia de fluorescencia. Los tubos polínicos (TPs) se distinguen por la presencia de tapones de calosa (se señalan con una flecha). Polinizando con polen compatible (SA2), los tubos polínicos en la base del estilo fueron numerosos en todos los ensayos (A-D). Polinizando con polen incompatible (SC10), no se observaron TPs en el híbrido no transformado (A), los TPs son numerosos en el híbrido RNAi:NaStEP (B) y en el híbrido RNAi:NaStEP agregando NaStEP desnaturalizada (C). Sin embargo, cuando se agregó NaStEP nativa (D), se observaron de 0 a 4 TPs incompatibles en la base del estilo, por lo que se restablece la AI. Barras = 50 µm. E, en todos los ensayos se verificó que el polen hubiera germinado a nivel del estigma. TPs, tubos polínicos; EP, epidermis. 47 Ensayo TP BE TP G X TP BE X TP G % (TP BE/TP G) An.R (Grubbs alfa=0.01) Datos ordenados % inhibición crecimiento 1 5 a 9 20-39 7 29.5 23.7 23.7 6.8 93.2 2 0 a 4 20-39 2 29.5 6.8 6.8 6.8 93.2 3 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 6.8 93.2 4 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 6.8 93.2 5 5 a 9 0 a 19 7 9.5 73.7 14.1 85.9 6 15 a 19 40 a 59 17 49.5 34.3 34.3 21.1 78.9 7 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 21.1 78.9 8 0 a 4 20-39 2 29.5 6.8 6.8 21.1 78.9 9 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 21.1 78.9 10 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 21.1 78.9 11 5 a 9 40 a 59 7 49.5 14.1 14.1 21.1 78.9 12 15 a 19 40 a 59 17 49.5 34.3 34.3 21.1 78.9 13 5 a 9 20 a 39 7 29.5 23.7 23.7 21.1 78.9 14 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 23.7 76.3 15 5 a 9 20 a 39 7 29.5 23.7 23.7 23.7 76.3 16 0 a 4 20 a 39 2 29.5 6.8 6.8 23.7 76.3 17 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 34.3 65.7 18 0 a 4 0 a 19 2 9.5 21.1 21.1 34.3 65.7 19 10 a 14 20 a 39 12 29.5 40.7 40.7 40.7 59.3 20 0 a 4 20 a 39 2 29.5 6.8 6.8 N 20.0 19.0 19.0 19.0 Promedio 23.0 20.5 20.5 79.5 Mediana 21.1 21.121.1 78.9 Moda 21.1 21.1 21.1 78.9 DE 15.0 9.5 9.5 9.5 CV(%) 65.4 46.2 46.2 11.9 0 5 10 15 2 7 12 17 Fr ec ue nc ia Número de TPs en la BE Histograma de TPs en la base del estilo Híbrido RNAi:NaStEP SC10S0 + NaStEP exógena + polen incompatible (SC10) Tabla 1. Cuantificación de tubos polínicos a las 72 h post-polinización que alcanzan la base del estilo en el híbrido N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 agregando NaStEP nativa y polen incompatible (SC10). TP BE: tubos polínicos en la base del estilo, TP G: tubos polínicos que germinaron, X TP BE: promedio de tubos polínicos en la base del estilo, X TP G: promedio de tubos polínicos que germinaron, % (TP BE/TP G): porcentaje de tubos polínicos que llegan a la base del estilo entre los que germinaron, An.R: análisis de residuos para identificar datos aleatorios (prueba de Grubbs con a=0.01) identifica 73.7% como dato aleatorio, una vez eliminado el dato aleatorio, se ordenaron los datos de menor a mayor y el promedio de TPs que llegaron a la base del estilo fue de 20.5%, % inhibición del crecimiento = 100 - %(TP BE/ TP G). 48 En la tabla 2 se muestran las polinizaciones compatibles (100%) y las incompatibles (0%) que se obtuvieron en los ensayos de la figura 22. En todas las polinizaciones compatibles los TPs en la base del estilo fueron incontables (se reporta como 100%). En el híbrido no transformado, ningún TP incompatible que germinó llegó a la base del estilo (0%). En el híbrido RNAi:NaStEP, todos los TPs incompatibles que germinaron llegaron a la base del estilo, lo cual sucedió de la misma manera al agregar a NaStEP desnaturalizada. Cuando se agregó de manera exógena NaStEP nativa y polen incompatible, el 20.5% de los tubos polínicos que germinaron llegaron a la base del estilo. En la figura 24, se presenta una gráfica de los resultados de la tabla 2. Tabla 2. Porcentaje de tubos polínicos que alcanzaron la base del estilo entre los que germinaron a las 72 h post-polinización en cruzas compatibles (polen SA2) e incompatibles (polen SC10) (100%) polinización compatible (TPs incontables que alcanzan la base del estilo), (0%) polinización incompatible (ningún TP que germinó creció hasta la base del estilo), (n) número de réplicas independientes en cada ensayo de polinización. Pistilo Hibrido No transformado SC10 S0 Híbrido SC10S0 RNAi: NaStEP Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP desnaturalizada Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP Polen compatible SA2 100 % (n=3) 100 % (n=3) 100 % (n=3) 100 % (n=3) Polen incompatible SC10 0 % (n=3) 100 % (n=3) 100 % (n=3) 20.5 ± 9.5 % (n=19) 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 Hibrido No transformado SC10 S0 Híbrido SC10S0 RNAi: NaStEP Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP desnaturalizada Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP % ( T P s b a se d e l e st ilo /T P s q u e g e rm in a ro n ) % TPs base del estilo/TPs que germinaron Polen compatible (SA2) Polen incompatible (SC10) Híbrido No transformado SC10S0 Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP desnaturalizada Híbrido SC10S0 RNAi:NaStEP + NaStEP Polen compatible SA2 Polen incompatible SC10 Figura 23. Histograma del conteo de tubos polínicos a las 72 h post-polinización que alcanzan la base del estilo en el híbrido N. plumbaginifolia AC X N. alata AI RNAi:NaStEP SC10S0 agregando NaStEP exógena y polen incompatible (SC10). En la mayoría de las repeticiones llegaron de 0 a 4 tubos polínicos a la base del estilo. 49 Figura 24. Gráfica de la tabla 2. Porcentaje de TPs en la base del estilo entre los que germinaron (% TPs BE/ TPs G). En todas las polinizaciones compatibles (color verde), los TPs en la base del estilo fueron incontables (100%). En el híbrido no transformado, ningún TP incompatible que germinó llegó a la base del estilo (0%). En el híbrido RNAi:NaStEP, todos los TPs incompatibles que germinaron llegaron a la base del estilo (100%), lo mismo sucedió al agregar a NaStEP desnaturalizada (100%). Cuando se agregó NaStEP nativa y polen incompatible, el 20.5% de los tubos polínicos que germinaron llegaron a la base del estilo. 50 Discusión En el modelo de rechazo del polen, en cruzas compatibles la vacuola que contiene las S-RNasas permanece estable y depende de la degradación de HT-B (Goldraij et al., 2006). La presencia de NaStEP es necesaria para la estabilidad de HT-B (Jiménez- Durán et al., 2013), por lo que en una cruza compatible se esperaría que NaStEP también se degradará. Con este trabajo se buscó determinar si la aplicación exógena de NaStEP en plantas silenciadas RNAi:NaStEP restablecía la AI, lo cual debería de ocurrir si NaStEP ingresa a los tubos polínicos. Si es así, más adelante se podría determinar si NaStEP aplicada de manera exógena se degrada en una cruza compatible. Purificación de NaStEP de pistilos de Nicotiana alata. Para la purificación de NaStEP, se modificó el protocolo de Uchikoba et al., 1995. Se utilizó primero una cromatografía de intercambio aniónico DEAE, el cual es un intercambiador débil ya que la muestra está muy saturada de componentes celulares, por lo que se considera una fase preparatoria. A pH 5.5, NaStEP se esperaría que estuviera cargada negativamente por desprotonación, ya que su punto isoeléctrico teórico es 4.9 (Cruz González Zamora, no publicado). Sin embargo, se podría estar comportando de manera anómala al tener aminoácidos básicos expuestos cargados positivamente o estar asociada a una proteína básica (Cruz García comunicación personal). Otra alternativa es que el punto isoeléctrico de la proteína sea mayor al valor teórico (Sánchez Nieto comunicación personal), por lo que a pH 5.5 NaStEP se encontraría cargada positivamente (por protonación) al igual que la resina, y por repulsión de cargas la encontramos en la fracción no unida (figura 12). Se precipita con 60% de sulfato de amonio y se pasa por una columna de filtración molecular. En el cromatograma (figura 13), las moléculas pequeñas se retienen en los poros de la resina, mientras que las moléculas grandes no entran en los poros, es por ello que en el primer pico (de mayor absorbancia a 280 nm color azul) eluyen las proteínas y después sale el sulfato de amonio (mayor conductividad pico naranja), así obtenemos las proteínas sin sulfato de amonio y en el mismo paso las cambiamos a solución amortiguadora a pH 4.0. 51 En la cromatografía de intercambio catiónico (figura 14), a pH 4.0, NaStEP está cargada positivamente por protonación y la resina está cargada negativamente. En consecuencia, por atracción de cargas NaStEP se une a la resina, mientras que las proteínas básicas se encuentran en la fracción no unida. Para obtener NaStEP se hace un gradiente de cloruro de sodio, rompiendo las interacciones electrostáticas entre la proteína y la matriz. Se obtuvo un pico de mayor absorbancia a 280 nm, y colectamos las fracciones 7 a 15 (ver figura 15). Para monitorear la purificación se realizó una separación por SDS-PAGE y su subsecuente inmunodetección con el anticuerpo anti-NaStEP, en la cual se puede observar que efectivamente se logró purificar a homogeneidad la proteína NaStEP de pistilos de Nicotiana alata (figura 16). Aunque la purificación se realizó en presencia del inhibidor de proteasas comercial PMSF, el anticuerpo reconoce también una banda de menor peso molecular, hecho que nos llevó a pensar que NaStEP podría estar siendo degradada. Para contestar esta pregunta, la banda correspondiente se secuenció por espectrometría de masas en la Unidad de Servicios de Apoyo a la Investigación y a la Industria (USAII) de la Facultad de Química UNAM. La secuencia obtenida muestra que sí es un producto de degradación de NaStEP (Cruz González-Zamora, no publicado). Esto significa que una proteasa degrada
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