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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS Facultad de Medicina IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES EN LOS RECEPTORES DE HORMONAS ESTEROIDES Y EL RECLUTAMIENTO DE COACTIVADORES POR EL RECEPTOR DE ESTRÓGENOS ALFA, INDUCIDO POR ESTEROIDES NATURALES Y SINTÉTICOS TESIS QUE PARA OBTENER EL GRADO ACADÉMICO DE MAESTRA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGÍA EXPERIMENTAL) P R E S E N T A BIOL. ELIZABETH BORJA CACHO DIRECTORA DE TESIS: M. EN C. ROCÍO ÁNGELES GARCÍA BECERRA MÉXICO, D.F. ENERO, 2006 UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO POSGRADO EN CIENCIAS BIOLÓGICAS Facultad de Medicina IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN DE LOS CAMBIOS CONFORMACIONALES EN LOS RECEPTORES DE HORMONAS ESTEROIDES Y EL RECLUTAMIENTO DE COACTIVADORES POR EL RECEPTOR DE ESTRÓGENOS ALFA, INDUCIDO POR ESTEROIDES NATURALES Y SINTÉTICOS TESIS QUE PARA OBTENER EL GRADO ACADÉMICO DE MAESTRA EN CIENCIAS BIOLÓGICAS (BIOLOGÍA EXPERIMENTAL) P R E S E N T A BIOL. ELIZABETH BORJA CACHO DIRECTORA DE TESIS: M. EN C. ROCÍO ÁNGELES GARCÍA BECERRA MÉXICO, D.F. ENERO, 2006 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. Al Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología por la beca otorgada durante el período de septiembre del 2003 al junio del 2005, para la realizar los estudios de Maestría en la Facultad de Medicina de la UNAM. AGRADECIMIENTOS A Rocío García, por los cinco años que trabajamos juntas, por la confianza que depositó en mí durante todos estos años y por que gran parte de mi formación profesional dentro de la investigación básica la aprendí de ella. Al Dr. Fernando Larrea, por haberme permitido trabajar en el Departamento de Biología de la Reproducción y por el apoyo brindado durante cinco años. DEDICATORIA A mis padres: Por que nunca han dejado de apoyarme y por que esta es una de las maneras de devolverles todo lo que me han dado. A mi hermano: Por los veintiséis años de convivencia en los que siempre nos hemos ayudado. A Rodrigo: Por todo el apoyo que me brindó durante estos dos años de la maestría y por todo su cariño. A mis amigos del Departamento de Biología de la Reproducción: Por todos los momentos buenos y malos que pasamos juntos, por sus consejos, por el apoyo pero más que nada por su amistad ÍNDICE ABREVIATURAS______________________________________________________ 3 RESUMEN____________________________________________________________ 4 ABSTRACT____________________________________________________________6 INTRODUCCIÓN _____________________________________________________ 8 Los Receptores Nucleares. _______________________________________________ 8 Mecanismo de acción de los receptores a hormonas esteroides.________________ 10 El receptor de progesterona. ____________________________________________ 12 Isoformas A y B del receptor de progesterona.______________________________ 13 El receptor de andrógenos.______________________________________________ 16 El receptor de estrógenos. ______________________________________________ 18 Los subtipos α y β del receptor de estrógenos.______________________________ 19 Ligandos selectivos para los subtipos del receptor de estrógenos. ______________ 21 La interacción de los coactivadores con el receptor de estrógenos. _____________ 24 Estructura de la familia p160/SRC. ______________________________________ 25 Base estructural para las proteínas p160/SRC y su interacción con AF-2._________ 29 El amino terminal AF-1 y su interacción con los coactivadores. ________________ 29 Estructura de la familia CBP/ p300. ______________________________________ 30 Mecanismo de acción de las proteínas correguladoras. ______________________ 32 ANTECEDENTES ____________________________________________________ 36 HIPÓTESIS__________________________________________________________ 40 OBJETIVOS _________________________________________________________ 41 Objetivos particulares ___________________________________________________ 41 1 MATERIALES Y MÉTODOS __________________________________________ 42 Reactivos. ____________________________________________________________ 42 Plásmidos. ___________________________________________________________ 42 Construcción de los vectores para el sistema de los dos híbridos. ______________ 45 Preparación de bacterias competentes.____________________________________ 46 Transformación de bacterias competentes. ________________________________ 46 Purificación y verificación de los plásmidos. _______________________________ 47 Maxi preparación._____________________________________________________ 48 Cultivo Celular._______________________________________________________ 49 Transcripción y traducción acopladas in vitro y la digestión parcial por proteasas. 49 Sistema de los dos híbridos en células de mamífero. _________________________ 50 Transfecciones y análisis del reportero del sistema de los dos híbridos. _________ 54 RESULTADOS _______________________________________________________ 56 1. Efectos de los derivados sintéticos de la 19-nortestosterona sobre la conformación de los RPB y RA. __________________________________________ 55 2. Efectos de los derivados sintéticos de la 19-nortestosterona sobre la conformación de los REα y REβ. ________________________________________ 64 3. Reclutamiento de proteínas coactivadoras por el REα. __________________ 72 DISCUSIÓN _________________________________________________________ 77 CONCLUSIONES_____________________________________________________ 84 APÉNDICE __________________________________________________________ 85 REFERENCIAS ______________________________________________________ 88 2 ABREVIATURAS AF función de activación AMPc adenosín monofosfato cíclico CBP proteína de unión a CREB CREB proteína asociada a elementos de respuesta a AMPc DBD dominio de unión al DNA E2 estradiol GSD gestodeno hsp proteínas de choque térmico LBD domonio de unión al ligando LNG levonorgestrel LUC enzima luciferasa NET norestisterona NR receptor nuclear P4 progesterona RA receptor de andrógenos RE receptor de estrógenos REα receptor de estrógenos α REβ receptor de estrógenos β RP receptor de progesterona RPA receptor de progesterona A RPB receptor de progesterona B SRC-1 coactivador de receptores esteroides-1 3 RESUMEN La norestisterona (NET), el levonorgestrel (LNG) y el gestodeno (GSD) son progestinas sintéticas derivadas de la 19-nortestosterona las cuales son metabolizadas a compuestos dihidro y tetrahidroreducidos. Para investigar los mecanismos moleculares mediante los cuales las 19-nor progestinas así como sus correspondientes derivados reducidos en el anillo A, presentan diferentes efectos hormonales, se evaluaron los cambios conformacionales inducidos en los diferentes receptores de hormonas esteroides como: el receptor de progesterona-B (RPB),el receptor de andrógenos (RA) y a los receptores de estrógenos α (REα) y β (REβ), a través de un sistema basado en digestiones parciales del receptor. Además, se evaluó la habilidad de estos ligandos para promover el reclutamiento de proteínas coactivadoras como las p160/SRC o CBP/p300 por el REα utilizando el sistema de los dos híbridos en células de mamífero. Los resultados obtenidos demuestran que el patrón de fragmentación proteolítico inducido por los ligandos de tipo agonista, difiere de aquel obtenido de la digestión del receptor en presencia de compuestos antagonistas y que este análisis al igual que el del reclutamiento de coactivadores, son herramientas útiles para indicar y determinar la naturaleza agonista/antagonista de diversos ligandos. Para el RPB y el RA se observó que las moléculas sin reducir y sus derivados 5α-reducidos tenían la capacidad de inducir patrones de fragmentación proteolítcos en sus receptores similares a los obtenidos por la P4 y DHT respectivamente, estos resultados confirman la actividad progestacional y androgénica de los derivados sintéticos de la serie 19 nor. De manera interesante, se observó que únicamente los derivados tetrahidro reducidos de la NET, el LNG y el GSD inducían un cambio conformacional en el REα similar al inducido por el E2, sin efecto alguno a través del REβ, confirmando estudios previos realizados en nuestro laboratorio en donde se demostró que los derivados tetrahidro reducidos son selectivos para activar la transcripción de genes responsivos a estrógenos únicamente a través del REα. Por otra parte, estos compuestos presentaron la habilidad de inducir el reclutamiento de los coactivadores SRC-1 y CBP por el REα, de manera similar a como lo hace el E2 natural. La caracterización de los cambios conformacionales inducidos en ambos subtipos del RE, 4 así como en el RP y RA por éstos ligandos nos permiten entender el mecanismo molecular del receptor ya sea en presencia de un compuesto agonista o de uno antagonista y por lo tanto su capacidad de activar la trancripción. Los ligandos que tienen la capacidad de unirse al receptor de estrógenos (RE) y activar selectivamente al subtipo α o al subtipo β, serán de gran utilidad para determinar la biología de ambos receptores y para el desarrollo de nuevas terapias basadas en las acciones hormonales. 5 ABSTRACT Norethisterone (NET), levonorgestrel (LNG) and gestodene (GSD) are 19- nortestosterone progestins that can be biotransformed to dyhydro and tetrahydro-reduced compounds. In order to investigate the molecular mechanisms in which 19 nor progestins and their corresponding A ring reduced derivatives, show different hormonal effects, we investigated the structural conformation induced in the progesterone receptor-B (PRB), the androgen receptor (AR) and both estrogen receptor alpha (ERα) and estrogen receptor beta (ERβ) using a limited trypsinization assay. We also evaluated the ability of these compounds to induce recruitment of steroid receptor coactivator-1 (SRC-1) and CBP (CREB binding protein) coactivator to ERα with mammalian two hybrid system. The results demonstrated that trypsin digestion pattern induced by agonist ligands are different from that generated by antihormone ligands. These assays have proven to be a reliable method to analyze the ligand-induced conformation of both ER subtypes and their agonist vs antagonist bond conformations. For PRB and AR, we found that the original molecule as well as their 5α-reduced derivatives induced a similar ligand- receptor trypsin digestion pattern to that of P4 and DHT respectively. These results confirm the progestational and androgenic activites of 19-nor progestins. Interestingly, incubations in the presence of 3β,5α-NET, -LNG or -GSD produced a proteolytic fragment pattern virtually identical to that obtained with E2, without effects upon ERβ, confirming data from previous studies perfomed in our laboratory where we showed that non-phenolic tetrahydro reduced metabolites behave as full selective ERα agonists by activating ER-dependent gene transcription. On the other hand, the same compounds showed the ability to recruit SRC-1 and CBP to the ERα with an efficiency close to E2, suggesting that these 19-nortestosterone synthetic derivatives were able to induce similar agonist conformational changes in ERα structure than natural E2. The application of these methods to characterize different conformations induced in both ER subtypes, as well as in PR and AR by these compounds, will be useful to get understanding on how steroid receptors behave in presence of agonist/antagonist ligands and so their ability for gene transcription activation induction. The selectivity of these compounds for an ER subtype 6 may provide additional structural basis for the development of new therapeutic and/or contraceptive formulations with disease-prevention benefits. 7 INTRODUCCIÓN Los Receptores Nucleares Los receptores nucleares pertenecen a la familia de factores de transcripción, que son activados por moléculas o ligandos pequeños y específicos como son; las hormonas esteroides, las hormonas tiroideas, los ácidos retinóicos, la vitamina D, los ácidos grasos y eicosanoides los cuales, juegan un papel importante en la expresión génica [1]. Los genes regulados por los receptores nucleares están involucrados en una gran variedad de procesos celulares como el metabolismo, el desarrollo, el crecimiento, la diferenciación y señalización endócrina entre otros [1, 2] . Los receptores nucleares tienen tres dominios funcionales importantes: un dominio amino terminal variable (N-terminal) conteniendo funciones de activación, un dominio de unión al DNA altamente conservado (DBD) y hacia el extremo carboxilo terminal (C-terminal) se encuentra el dominio de unión al ligando (LBD) [3-5]. El dominio de unión al DNA contiene dos dedos de zinc asimétricos cada uno de los cuales está coordinado por 4 residuos de cisteína conservados [6]. El dominio de unión al ligando presenta una estructura conservada consistiendo de 10 a 12 hélices que se pliegan formando 3 capas. La hélice alfa localizada más hacia el extremo carboxilo terminal (H12), se extiende afuera del centro del LBD en ausencia del ligando, la cual toma otra posición en respuesta a la unión de la hormona plegandose hacia el centro del dominio. Esta posición sella el sitio de entrada de la cavidad de unión y crea una superficie hidrofóbica en el LBD que es reconocida por los coactivadores [7]. El LBD contiene sitios para la unión a proteínas de choque térmico (hsps) e inmunofilinas [8], para la dimerización del receptor, sitios de localización nuclear (SLN) y un dominio de activación transcripcional dependiente del ligando, denominado función de activación-2 (AF-2) [9, 10]. El DBD contiene un segundo dominio de dimerización que depende de la unión al DNA. La dimerización del receptor juega un papel doble al 8 estabilizar al complejo receptor-DNA y actuar como una molécula que orienta de manera apropiada al receptor dimerizado con respecto a los elementos de respuesta en el DNA [11-13]. El extremo amino terminal es el más variable en cuanto a longitud y secuencia de aminoácidos. Algunos receptores nucleares, en particular los de hormonas esteroides, tienen un extremo N-terminal que contiene un segundo dominio de activación transcripcional denominada AF-1 (Fig. 1) [14, 15]. DBD LBD/AF-2H COOH-N+H3 • Dominio de unión al ligando • SLN • Dimerización • Unión al DNA • SLN • Dimerización AF-1 DBD LBD/AF-2H COOH-N+H3 • Dominio de unión al ligando • SLN • Dimerización • Unión al DNA • SLN • Dimerización AF-1 Figura 1. Dominios funcionales de los receptores nucleares. Los receptores nucleares cuentan con un extremo amino terminal variable el cual contiene la función de activacióntranscripcional-1 (AF-1), un dominio de unión al DNA altamente conservado (DBD), la región bisagra (H) y hacia el extremo carboxilo terminal el dominio de unión al ligando (LBD), el cual contiene la función de activación-2 (AF-2). Los sitios de localización nuclear (SLN) y los dominios de dimerización también son mostrados en la figura [1]. 9 Mecanismo de acción de los receptores a hormonas esteroides El mecanismo de acción general de los receptores para hormonas esteroides es similar al de otros miembros de la famila de los receptores nucleares [16]. En ausencia del ligando, el receptor es transcripcionalmente inactivo y se localiza en el núcleo de las células blanco, unido a un complejo de proteínas de choque térmico (hsps: hsp-90, hsp-70, y p59) [17-21]. Una vez que el ligando se une al receptor, este sufre cambios en su conformación que resultan en la disociación del receptor monomérico del complejo de proteínas de choque térmico y posteriormente el receptor se fosforila [16, 22]. La activación de los receptores de estrógenos (RE), de progesterona (RP), andrógenos (RA) y otros receptores se acompaña de un incremento en la fosforilación del receptor y se asocia con un incremento en la actividad transcripcional del mismo [23-25]. El mecanismo de acción molecular a través del cual los cambios en la fosforilación del receptor alteran la expresión de genes aún no se conocen. Por ejemplo, el receptor de estrógenos alfa (REα) es fosforilado en respuesta al tratamiento con estrógenos en células en cultivo así como a la estimulación con factores de crecimiento, esta fosforilación se asocia con un incremento en la actividad transcripcional [23, 26]. Finalmente, los receptores unidos al ligando se dimerizan e interaccionan con los elementos de respuesta hormonal en el DNA dentro de la región reguladora de genes blanco (Fig. 2) [17]. Cuando el complejo hormona-receptor se une al DNA puede tener un efecto positivo o negativo sobre la transcripción del gen blanco, según el contexto celular o del promotor. La transducción de señal mediada por los receptores de hormonas esteroides tiene al menos dos mecanismos por los cuales se induce la transcripción de genes. En el primer mecanismo, el receptor activado por el ligando se une a secuencias específicas en el DNA de forma directa. En el segundo caso, el receptor activado se une a los componentes de la maquinaria general de transcripción (MGT) a través de proteínas correguladoras [27-31]. Estas dos vías de activación transcripcional son utilizadas diferencialmente por los receptores nucleares en distintas células. 10 Adaptador MGT TATA P P R P P R Adaptador MGT TATATATA P P R P P R Adaptador ERH P P R P P R ERH P P R P P R HH hsp 90 hsp 90 hsp 70 p59 R hsp 90 hsp 90 hsp 70 p59 R hsp 90 HH hsp 90 hsp 90 hsp 70 p59 R hsp 90 hsp 90 hsp 70 p59 R hsp 90 Figura 2. Mecanismo de acción de los receptores de hormonas esteroides. Después de la unión del ligando, el receptor sufre un cambio conformacional debido a la liberación de proteínas de choque térmico seguido de la fosforilación y dimerización del receptor. Una vez en el núcleo, el receptor dimerizado se une a su respectivo elemento de respuesta en el DNA, donde se aumenta el grado de fosforilación. El dímero del receptor unido al DNA recluta las proteínas correguladoras que unen a la maquinaria general de transcripción (MGT). La interacción con la MGT modula la actividad de la RNA polimerasa II generando un receptor transcripcionalmente activo [32]. 11 El receptor de progesterona. La progesterona (P4) es una hormona esteroide, encargada de la regulación del desarrollo y mantenimiento del sistema reproductivo [33]. El uso adecuado de antiprogestinas como son el RU486 en el tratamiento de enfermedades tales como meningiomas cerebrales, endometriosis, y fibrosis uterinas han implicado a la P4 como una hormona reguladora de un amplio rango de procesos biológicos adicionales [34]. Es por esta razón que existe un gran interés en definir el mecanismo de acción molecular del RP, así como del desarrollo de nuevos fármacos que puedan presentar una actividad ya sea progestacional o antiprogestacional. Como se menionó anteriormente, el RP es un factor de transcripción dependiente del ligando que comparte la estructura con el resto de la familia de los receptores nucleares (Fig. 3) [5]. AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD COOH- Dominio de unión al ligando SLN Unión HSP Dimerización Funciones de transactivación N+H3 AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBDAF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD COOH - Dominio de unión al ligando SLN Unión HSP Dimerización Funciones de transactivación N+H3 Figura 3. Receptor de progesterona. El receptor de progesterona está compuesto por un dominio de unión al DNA altamente conservado (DBD), un dominio de unión al ligando (LBD), una región de bisagra localizada entre el DBD y el LBD, un dominio carboxilo terminal y otro amino terminal. Dentro del LBD hay regiones responsables de la dimerización del receptor, interacción con las proteínas de choque térmico (hsps), localización nuclear (SLN), y activación dependiente del ligando (AF-2) y dos funciones de activación adicional (AF-1 y AF-3) localizados dentro de la región amino terminal. [32]. 12 Isoformas A y B del receptor de progesterona El receptor de progesterona humano existe en dos isoformas: el hRPA (94 kDa) y el hRPB (114 kDa) (Fig. 4) [35]. El hRPA es una forma truncada del hRPB debido a que carece de los primeros 164 aminoácidos del extremo N-terminal. Ambas isoformas han sido identificadas en la mayoría de las especies, con excepción del conejo, donde solo se identificó el hRPB [36]. En los humanos existe una sola copia del gen para el RP y ambas isoformas son transcritas por iniciación alternativa a partir de dos promotores diferentes estrógeno-inducibles [37]. Se han observado diferencias en el nivel relativo de expresión de ambas isoformas del RP [35]. Específicamente en el útero, las cantidades de hRPA:hRPB son desde 50:1 a 2:1 durante el ciclo menstrual, debido principalmente al incremento en el nivel de expresión del hRPB [38], mientras que niveles bajos del hRPB han sido detectados sobre todo en tumores primarios de mama y de endometrio [39, 40]. Se ha observado que cuando el RP se dimeriza pueden formarse 3 combinaciones distintas debido a la presencia de 2 isoformas por ejemplo; homodímeros A:A y B:B y heterodímeros A:B [41, 42]. Las isoformas A y B del hRP no son funcionalmente iguales y es posible que las tres formas diméricas del receptor activado no sean funcionalmente idénticas, de tal manera que las diferencias en la expresión de los receptores podrían influir en la respuesta celular por progestinas y antiprogestinas. 13 AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD AF-1 DBD AF-2 LBD Pm1I Pm1I Región variable hRPB hRPA AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBDAF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD AF-1 DBD AF-2 LBD Pm1I Pm1I Región variable hRPB hRPA 5’ 3’ 5’ 3’ AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD AF-1 DBD AF-2 LBD Pm1I Pm1I Región variable hRPB hRPA AF-3 AF-1 DBD AF-2 LBDAF-3 AF-1 DBD AF-2 LBD AF-1 DBD AF-2 LBD Pm1I Pm1I Región variable hRPB hRPA 5’ 3’ 5’ 3’ Figura 4. Estructura de las isoformas del RP. Las regiones de menor homología entre los RPs están localizadas hacia la región 5’ del sitio único de restricción Pm1I presente en ambos receptores (55% de similitud, 30% de identidad). Las regiones de alta homología se encuentran hacia la región 3’ del sitio de restricción Pm1I (90% similitud, >72% identidad) hRPB.- receptor de progesterona humano-B; hRPA.-receptor de progesteona humano-A; LBD.- dominio de unión al ligando; AF-2.- función de activación-2; DBD.- dominio de unión al DNA; AF-1.- función de activación –1; AF-3.- función de activación –3 [32].14 Ambas isoformas del RP humano tienen capacidad de unirse al ligando y al DNA [43]. Sin embargo, en estudios utilizando células de mamífero y sistemas de transcripción dependientes de progesterona, se demostró que el hRPA y hRPB tienen afinidad por promotores diferentes [44]. Además, las actividades transcripcionales de estas isoformas varian dependiendo del tipo de célula y del promotor [16, 44-47]. Los estudios realizados con ambas isoformas del RP, demostraron que el hRPB funcionó como un activador de la transcripción de construcciones conteniendo los clásicos elementos de respuesta a progesterona (ERP), mientras que el hRPA no, concluyendo que este receptor podría funcionar como un transrepresor dominante dependiente del ligando [44]. Una de las características más importantes de la familia de los receptores esteroides, es que cada uno es responsable de una vía reguladora y responde a hormonas estructuralmente distintas, y que existen varios puntos de convergencia o intercomunicación entre las vías de señalización. Por ejemplo, el hRPA además de modular la actividad transcripcional del hRPB funciona como un transrepresor dominante de la actividad transcripcional de otros receptores de esteroides tales como el receptor de glucocorticoides (RG), el RA, el receptor de mineralocorticoides (RM) y el RE. Esta característica no se ha identificado en otros miembros de la familia de los receptores nucleares [45, 47, 48]. 15 El receptor de andrógenos El RA es miembro de la familia de los receptores nucleares [5, 49] y regula la respuesta a hormonas masculinas como la testosterona (T) y la 5α dihidrotestosterona (DHT) en los tejidos. La proteína del RA está formada aproximadamente de 917 aminoácidos de longitud que conforman al dominio de unión al DNA, el dominio de unión al ligando y la región amino terminal [50-53]. En estudios realizados con pacientes que presentaban el síndrome de feminización testicular completo, se identificó una forma más pequeña del RA humano [54]. Observaciones subsecuentes, revelaron que esta isoforma del receptor de andrógenos, denominada RAA debido a su similitud con la estructura del RPA, difería de la estructura determinada para la forma B del RA ya que carecía completamente del extremo N- terminal, pero tanto el dominio de unión al DNA como el dominio de unión al ligando se encontraban intactos. Algunos análisis demostraron que esta isoforma del RA se expresa en una gran variedad de tejidos aunque con bajos niveles, es decir el RA está presente en varias células de dos formas [55]. Mientras la isoforma B migra con un aparente peso molecular de 110 kDa y constituye más del 80% del receptor inmunoreactivo en la mayoría de las células, la forma A migra con un peso aproximado de 87 kDa, el cual parece derivar de una iniciación de la traducción alterna y que constituye 20% o menos del RA inmunreactivo (Fig. 5) [55]. Como en el caso del RP, la expresión de diferentes isoformas del RA se ha detectado en diversos tejidos. A diferencia del RPA, el RAA, se ha detectado en concentraciones relativamente bajas y no se han identificado hasta la fecha tejidos donde únicamente se exprese el RAA como forma predominante [56, 57]. A pesar de esto, la similitud entre las estructuras de las isoformas A y B para el RA y el RP sugieren que la isoforma A del receptor de andrógenos puede jugar distintos papeles en la regulación de los genes que responden a andrógenos. 16 AF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RAB AF-1 DBD LBD/AF-2 RAA AF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RABAF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RAB AF-1 DBD LBD/AF-2 RAAAF-1 DBD LBD/AF-2 RAA 5’ 3’ 5’ 3’ AF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RAB AF-1 DBD LBD/AF-2 RAA AF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RABAF-3 AF-1 DBD LBD/AF-2 RAB AF-1 DBD LBD/AF-2 RAAAF-1 DBD LBD/AF-2 RAA 5’ 3’ 5’ 3’ Figura 5. Receptor de andrógenos humano. Las regiones de menor homología entre los RAs están localizadas hacia la región 5’ y las regiones de alta homología se encuentran hacia la región 3’ del receptor. RAB.- receptor de andrógenos -B; RAA..-receptor de andrógenos-A; LBD.- dominio de unión al ligando; AF-2.- función de activación-2; DBD.- dominio de unión al DNA; AF-1.- función de activación –1; AF-3.- función de activación –3 [55]. 17 El receptor de estrógenos. Los estrógenos juegan un papel importante en el crecimiento, desarrollo y mantenimiento de una gran variedad de tejidos. Estos ejercen sus efectos fisiológicos a través del RE, que funciona como un regulador transcripcional ligando activado [3]. El receptor de estrógenos es miembro de la superfamilia de los receptores nucleares, es un factor de transcripción con secuencias específicas que al igual que algunos otros factores de transcripción ha conservado los dominios de unión al DNA y de transactivación [3, 58, 59]. En ausencia del ligando, el RE presenta poca actividad transcripcional pero, la unión de un ligando agonista resulta en un aumento de la actividad transcripcional [60-62]. En un principio se creía que los efectos de los estrógenos eran mediados únicamente a través de un RE, pero posteriormente se descubrió una segunda forma del mismo al cual se le denominó REβ [63, 64]. Ambos subtipos del receptor de estrógenos (REα y REβ) exhiben la organización característica de los dominios de los receptores nucleares que incluyen un dominio variable de transactivación N-terminal (AF-1), una región para la unión al DNA altamente conservada con dedos de zinc y un dominio de unión a la hormona C-terminal. El LBD es multifuncional y además tiene un sitio de reconocimiento al ligando conteniendo las regiones para la dimerización del receptor y transactivación dependiente del ligando (AF-2). A pesar de que el mecanismo preciso por el cual el RE modula la actividad de la RNA polimerasa no se sabe con exactitud, recientemente se ha demostrado que el receptor unido a ligandos agonistas tiene la capacidad del reclutar a algunos adaptadores transcripcionales o proteínas que permiten al receptor transmitir su información reguladora al aparato celular transcripcional [65, 66]. 18 Los subtipos α y β del receptor de estrógenos El primer RE fue clonado hace más de diez años (REα) del cual, se creía era el único y a través del cual los estrógenos mediaban sus efectos [67, 68]. El segundo RE, denominado REβ, fue identificado y clonado a partir de próstata de rata [63]. Este hallazgo fue seguido por la clonación de diferentes formas de REβ del testículo humano [69, 70] y del ovario de ratón [64, 71]. La presencia de dos REs indicó que el mecanismo de acción biológico de los estrógenos así como de algunas drogas sintéticas y naturales relacionadas, era más complejo de lo que se había pensado. Más complejo fue: 1) la identificación de varias isoformas para el REβ, algunos con un N-terminal prolongado [64] y otros con una inserción de 18 aminoácidos en el LBD [72, 73] y 2) que el REα y el REβ pueden formar heterodímeros [64, 74]. El REβ es codificado por un gen diferente del que codifica al REα [63, 69]. Ambos receptores comparten únicamente el 47% en su secuencia de aminoácidos, con un 18% de homología en el extremo N-terminal A/B hacia donde se localiza la AF-1 y el 56% de homología en su secuencia de aminoácidos en el LBD incluyendo a la AF-2. El DBD se encuentra altamente conservado (Fig. 6). Como se mencionó anteriormente, los subtipos α y β del RE muestran diferencias entre los dominios AF-1 sugierendo que la activación transcripcional de genes responsivos a estrogenos deben mostrar patrones diferentes, de tal forma que las diferencias en la activación del gen además de estar influenciadas por factores promotor y célula específicos [60, 75-77] también se deben a la interacción sinergística entre los dominios de activación N-terminal y C-terminal del receptor [48].19 A/B C D E F 191 461 1990 AF-1 DBD H LBD AF-2 COOH-N+H3 RNAm REα RNAm REβ 12 1456 AF-1 DBD H LBD AF-2 COOH-N+H3 Proteína Proteína A/B C D E F 191 461 1990 AF-1 DBD H LBD AF-2 COOH-N+H3 RNAm REα RNAm REβ 12 1456 AF-1 DBD H LBD AF-2 COOH-N+H3 Proteína Proteína Figura 6. Esquema de los RNAm y las proteínas que codifican para el REα y REβ. Se muestran las estructuras de los receptores de estrógenos α y β de ratón, así como las localizaciones aproximadas de aquellos dominios modulares específicos del receptor. Se indican los dominios estructurales de estos receptores (A/B, C, D, E y F), así como los dominios de unión a la hormona, unión al DNA y funciones de transactivación (AF-1 y AF-2) [78]. 20 Ligandos selectivos para los subtipos del receptor de estrógenos. Debido a que el REα y el REβ tienen secuencias primarias significativamente diferentes en sus LBDs, es razonable que estos subtipos del RE se unan a algunos ligandos con diferente afinidad y que estos ligandos tengan también diferentes caracteres de agonismo o antagonismo mediado por los dos receptores. Además, ambos receptores presentan coincidencias pero también difieren en su distribución tisular [63, 69, 79], lo cual se traduce en diferencias importantes en sus acciones biológicas a nivel del tejido. Para identificar compuestos con actividad selectiva por los subtipos del RE, se examinaron algunos ligandos para los REs, de los que se identificaron varios ligandos no esteroidales que muestran diferencias pronunciadas subtipo-selectiva en la unión al ligando y en la potencia transcripcional o eficacia del REα y el REβ. A este respecto, el compuesto pirazol activó la transcripción de genes reporteros a través de su interacción con el REα, mostró ser 120 veces más potente en estimular al REα comparado con el REβ [80, 81]. Posteriormente, se sintetizaron una serie de análogos con sustituciones de varios grupos a la molécula original del pirazol [82, 83]. Los análogos evaluados fueron agonistas del REα, pero los compuestos BSC-pirazol (adición de una cadena básica lateral al corazón del pirazol) [84] y MPP metil-piperidino-pirazol [82], resultaron antagonistas selectivos para el REα (Tabla 1). Por otra parte, otros compuestos no esteroidales, el tetrahidrocriseno (THC) [85] y el THC, rac-2b [82] son compuestos agonistas para el REα y antagonistas selectivos para el REβ [80]. Investigaciones al respecto han revelado que el carácter antagonista en los ligandos THC para el REβ depende del tamaño y disposición geométrica de los grupos que se adicionan a la molécula original [85]. Además, los antagonistas que son selectivamente efectivos en el REβ pueden tener estructuras que son muy diferentes de los antiestrógenos típicos (tamoxifeno, raloxifeno, ICI 182, 780). Se han identificado otros compuestos que son potencialmente más selectivos por el REα que el pirazol, mientras otros son agonistas selectivos para el REβ (Tabla 1). Algunos fitoestrógenos 21 como la genisteína, la daidzeína y el equol, así como algunos androstanedioles, activan a ambos REs α y β pero muestran selectividad hacia el REβ. En nuestro laboratorio se han descrito otros ligandos esteroidales con actividad agonista selectiva para el REα en la unión al ligando y potencia transcripcional [86, 87]: la noretisterona (NET), el levonorgestrel (LNG) y el gestodeno (GSD) las cuales son progestinas sintéticas derivadas de la 19-nortestosterona, ampliamente utilizadas en formulaciones anticonceptivas. Las progestinas no se unen al RE, pero muestran efectos estrogénicos en condiciones in vivo e in vitro [88, 89]. Los efectos estrogénicos son atribuídos a sus metabolitos no fenólicos resultado de la doble reducción en el anillo A de la molécula; generando así compuestos 5α-dihidro y 3β,5α-tetrahidro reducidos [90, 91]. La capacidad de los metabolitos reducidos para activar la transcripción vía un mecanismo de acción estrogénico, incluyendo las diferencias selectivas entre los subtipos del RE α y β fue atribuída solamente para los compuestos 3β,5α-tetrahidro reducidos de NET, el LNG y el GSD. La identificación de compuestos selectivos para los subtipos del RE será de valiosa ayuda para el desarrollo de nuevos acercamientos terapéuticos basados en las acciones hormonales y proveé una herramienta importante para examinar las funciones moleculares y celulares específicas dependientes del REα y del REβ. 22 Tabla 1. Interacción de diferentes compuestos esteroidales y no esteroidales con los subtipos del receptor de estrógenos. Compuesto Actividad Receptor Referencia Pirazol (miembro de la familia Diazol) Agonista selectivo REα [81] PPT, propilpirazoltriol Agonista selectivo REα [80, 82] FPPT, fluoropropilpirazoltriol Agonista selectivo REα [83] BSC-pirazol, cadena básica lateral Antagonista selectivo REα [84] MPP, metilpiperidinopirazol Antagonista selectivo REα [82] Pirazolopirimidina Antagonista selectivo REβ [92] DPN, diarilpropionitrilo Agonista selctivo REβ [82] R,R-THC, R,R-tetrahidrocriseno (cromóforo estilbeno) Agonista Antagonista selectivo REα REβ [80, 82] THC, rac-2b Agonista Antagonista selectivo REα REβ [85] SKF-82958 (agonista del receptor de dopamina D1) Agonista selectivo REα [93] Benzoxatinas Agonista selectivo REα [94] Fitoestrógenos: genisteína, daidzeína y S-equol Agonistas REβ [95, 96] Benzofurano Agonista selectivo REα [97] Progestinas sintéticas 19-nortestosterona: 3β,5α-NET, 3β,5α-LNG 3β,5α-GSD Agonistas selectivos REα [86, 87] 23 La interacción de los coactivadores con el receptor de estrógenos. A pesar de que todos los ligandos del RE se unen exclusivamente al LBD, la unión de un agonista causa actividad en la AF-2, pero la unión de un antagonista no. Análisis realizados sobre la estructura del RE unido al estradiol (E2) o al raloxifeno/tamoxifeno mostraron que cada clase de ligando induce una conformación diferente en el LBD y que este arreglo estructural es crítico para la regulación transcripcional inducida por el ligando, debido a que expone la superficie del receptor que recluta a los coactivadores y otras proteínas correguladoras [65]. La familia p160, llamada coactivador de receptores esteroides (SRC) p160/SRC, está constituída por tres miembros: 1) SRC-1 o NCoA-1, fue la primera molécula coactivadora p160 identificada como una proteína que interacciona con la AF-2 del RP o el RE y se demostró que su interacción era promovida por agonistas e inhibida por antagonistas [65], 2) SRC-2 o factor intermediario transcripcional 2 (TIF2)/NCoA-2 proteína 1 relacionada a GR (GRIP-1) y 3) SRC-3 o ACTR/pCIP/coactivador asociado al receptor (RAC3)/TRAM-1/ amplificada en cáncer de mama 1 (AIB1) [30, 98-104]. Una región importante de estos coactivadores es el dominio de interacción con el receptor nuclear que consiste de tres secuencias de leucina separadas entre sí por cualquier otro aminoácido (aa) LXXLL (L= leucina, XX= a cualquier aa) denominada caja NR. Todos los p160 tienen un dominio de interacción nuclear que a su vez contiene tres de estas cajas arregladas en tandem. Una cuarta y única caja NR se localiza hacia el extremo C-terminal en una variante del SRC-1 y al cual se le ha denominado SRC-1a [31]. Estas secuencias representan los sitios de ensamble al dominio AF-2 del receptor nuclear [103, 105]. Las cajas NR también han sido identificadas en otro tipo de moléculas coactivadoras que incluyen a los p300/CBP o proteínas de unión a elementos de respuesta a AMPc (CREB), TRAP 220/DRIP 205/PBP, PGC-1 y TRBP/ASC-2/RAP250 [106- 108].Los coactivadores no son capaces de unirse al DNA por sí solos si no que son reclutados por los promotores de algunos genes responsivos a esteroides a través de la interacción proteína-proteína con los receptores nucleares. Estos se unen directamente con los 24 receptores de hormonas esteroides principalmente en el dominio AF-2 del receptor de manera hormono-dependiente y básicamente por hormonas de tipo agonistas. Cuando se realizaron experimentos en los que la AF-2 era mutada, se observó una disminución en la unión de las proteínas p160 lo cual correlacionaba con la disminución en la actividad de la AF-2. Por otro lado, se observó que cuando los REs y RPs eran incubados en presencia de esteroides de tipo antagónico, estos inactivaban a la AF-2 y en consecuencia no era posible la unión de los p160, indicando que estos coactivadores eran necesarios para el funcionamiento adecuado de la AF-2. Estructura de la familia p160/SRC A pesar de que los diferentes miembros de la familia de los SRC comparten únicamente el 40% de homología en su secuencia, son proteínas moduladoras con regiones o secuencias conservadas que funcionan como dominios funcionales distintos. La región más conservada se localiza hacia el extremo N-terminal en donde se encuentra un dominio de interacción que a su vez contiene el motivo básico hélice-asa-hélice (bHLH) y un dominio de asociación denominado PAS. El bHLH es un motivo de unión al DNA presente de varias familias de factores de transcripción eucarióticos y PAS funciona como un dominio de interacción con otras proteínas similares. El dominio N-terminal bHLH/PAS es indispensable para la unión de las proteínas p160/SRC con los receptores nucleares y para la función de coactivación, lo cual sugiere que esta región juega un papel muy importante que aún no se conoce del todo [109-111]. Un dominio de interacción nuclear (DIN) se encuentra en la región central de las tres diferentes clases de coactivadores SRC. Este dominio contiene a su vez tres regiones o motivos LXXLL altamente conservados denominados cajas NR como ya se mencionó anteriormente, y que son responsables de reconocer a la AF-2 [105, 112-114]. Estos motivos forman una α-hélice anfipática con el aminoácido leucina alineados hacia un extremo de la hélice H12 del LBD del receptor [115]. Una interacción eficiente del coactivador depende tanto de los motivos LXXLL como de las secuencias que se encuentran hacia los extremos de las proteínas p160/SRC. Estas secuencias no son 25 capaces de unirse a la AF-2 por sí solas si no que requieren ser estabilizadas mediante la interacción con las cajas NR [114, 115]. En el caso del RE, se han identificado una gran variedad de ligandos que inducen una serie de cambios conformacionales en su LBD [116-119], de igual manera se observó la habilidad que tenía el RE para reconocer específicamente una o más cajas NR una vez unido a estos ligandos, necesitando de al menos dos de ellas para una unión eficiente con el LBD. Utilizando al REα y al REβ, se evaluó la selectividad de ambos en términos de su habilidad para unirse a las cajas NR de la familia p160/SRC, los resultados mostraron que los dos receptores exhibían diferencias significativas en la selectividad por las cajas. Para las cajas NR del SRC-1, el REα mostró una clara preferencia por la caja NR II con poco reclutamiento por la caja NR IV. No se observó reclutamiento a través de la caja NR I y III del SRC-1 a través del REα. El REβ tuvo un patrón de selectividad diferente, en donde el reclutamiento fue a través de la caja NR IV del SRC-1, seguido de la caja II con un reclutamiento mínimo a través de la I y III del SRC-1. La selectividad de ambos subtipos del receptor de estrógenos por la caja IV del SRC-1 puede ser significativa ya que la cuarta caja es expresada unicamente en una variante alternativa del SRC-1 denominada SRC-1a. También se observaron diferencias en la selectividad de las cajas NR del SRC-2 entre el receptor de estrógenos α y β, el REα mostró una clara preferencia por la caja II seguida de la I sin unión alguna por la III. En cuanto al REβ, éste reclutó a las tres cajas NR del SRC-2 con la misma eficacia. Finalmente para el SRC-3 el reclutamiento fue idéntico para ambos receptores (NR I>II> III) con la única diferencia de que el REβ tiene mayor uníon a través de la caja III mientras que el REα no [71, 120]. Cada uno de los tres miembros de la familia p160/SRC contiene al menos dos dominos de activación transcripcional autónomos (AD1 y AD2) (Fig.7). El DIN y los dos dominios de activación transcripcional son modulos funcionales distintos. El DIN puede unirse al receptor nuclear de manera eficiente pero no es capáz de mediar la activación transcripcional, mientras que el AD1 y AD2 no se unen a los receptores nucleares pero sí son capaces de mediar la activación de la transcripción. Los dos dominios de activación 26 transcripcional median la respuesta a través de su interacción con diferentes proteínas blanco y vías de señalización. El AD1 coincide con el sitio de unión para otro coactivador transcripcional denominado CBP y las proteínas relacionadas p300 [114, 121]. La observación de que la actividad funcional del AD1 correlaciona con la unión al CBP/p300 sugiere que este es un blanco localizado hacia la región 3’ del coactivador p160/SRC que regula la actividad del AD1. En contraste, el AD2, no es un sitio de unión para p300/CBP. Una proteína determinada CARM1 (coactivador asociado a arginina metiltransferasa) es la responsable de la interacción con el AD1 de los tres miembros de la familia SRC [122]. El SRC-1 y el SRC-3 poseen actividad de histona aceltil transferasa (HAT), la cual no ha sido detectada para el SRC-2. En el SRC-1a, el dominio catalítico HAT se ha encontrado entre los aa 1029-1292 [101, 123]. 27 SRC-1a SRC-2 SRC-3 1 300 634 780 1441 DIN DINAF-1 AD1 AD2I II III IV 624 775 14641 AD1 AD2I II III 621 821 14121 AD1 AD2I II III Dominio interacción LXXLL CBP CARM1 L: Leucina X: cualquier aa SRC-1a SRC-2 SRC-3 1 300 634 780 1441 DIN DINAF-1 AD1 AD2I II III IV 624 775 14641 AD1 AD2I II III 621 821 14121 AD1 AD2I II III Dominio interacción LXXLL CBP CARM1 L: Leucina X: cualquier aa 1 300 634 780 1441 DIN DINAF-1 AD1 AD2I II III IV 1 300 634 780 1441 DIN DINAF-1 AD1 AD2I II III IV 624 775 14641 AD1 AD2I II III 624 775 14641 AD1 AD2I II III 621 821 14121 AD1 AD2I II III 621 821 14121 AD1 AD2I II III Dominio interacción LXXLL CBP CARM1 L: Leucina X: cualquier aa Figura 7. Familia p160/SRC de los coactivadores para los receptores de hormonas esteroides. Los tres miembros de la familia p160/SRC son: SRC-1a, SRC-2 y SRC-3. En el dominio de interacción se encuentran los dominios hélice-asa-hélice básica y de interacción PAS. En el centro se encuentra localizado el dominio de interacción nuclear (DIN). El DIN contiene tres motivos LXXLL o cajas NR que reconocen a la región AF-2 a través de un sitio hidrofóbico en la superficie del LBD del receptor. Una variante del SRC-1 (SRC1a) contiene una cuarta caja NR en el extremo C-terminal. El dominio AD1 funciona como sitio de unión para los coactivadores generales p300/CBP y en el dominio AD2 se encuentra la proteína metilasa denominada coactivador asociado a arginina metiltransferasa-1 (CARM1). Tanto p300/CBP como CARM1, sirven como coactivadores secundarios que median las respuestas de señalización transcripcional de AD1 y AD2 respectivamente. Un segundo dominio de interacción nuclear (DIN/AF-1) representa el sitio al cual se une la AF-1 del extremo N-terminal del receptor esteroide localizado entre AD1 y AD2. La actividad de histona acetil transferasa se localiza en el segmento C-terminal del SRC-1a y SRC-3 [1]. 28 Base estructural para las proteínas p160/SRC y su interaccióncon AF-2. Los estudios realizados con los receptores de hormonas esteroides, particularmente con el dominio de unión al ligando, demostraron que a pesar de que la hélice α 12 anfipática (H12) del extremo C-terminal del LBD se une con las p160/SRC, esta interacción no era suficiente para la unión de estas proteínas o para la función de la AF-2. Un mapa detallado de la superficie del LBD mediante mutagénesis, reveló que los residuos en las regiones del LBD localizadas por fuera de la H12 están también involucrados y que forman una superficie hidrofóbica que a su vez está compuesta por algunos residuos de las hélices 3 y 5 así como de una porción movible de la hélice 12 que se reposiciona contra sitios estacionarios en respuesta a la unión de la hormona [124, 125]. En estudios de cristalografía, se demostró que el LBD del RT (receptor de hormona tiroidea) y del RE forman complejos con la caja NR IV del SRC-1 y se confirmó que la superficie hidrofóbica interacciona con una hélice α complementaria formada por el motivo LXXLL de las proteínas p160/SRC. Estos análisis revelaron que dos motivos LXXLL del mismo péptido p160/SRC hacen contactos idénticos con cada subunidad del receptor dimérico. En resumen, el mecanismo general por el cual los coactivadores p160/SRC reconocen el LBD de los receptores nucleares es el mismo. El LBD actúa como una región dependiente del ligando que prende al receptor completo como resultado del reposicionamiento del la hélice 12 para crear un sitio de unión a los p160/SRC en la superficie del dominio de unión al ligando. El amino terminal AF-1 y su interacción con los coactivadores. La AF-1 es una estructura importante del receptor que regula las respuestas de tipo celular, promotor y tejido específico [14, 15, 114, 126]. La región AF-1 puede funcionar independientemente de la AF-2 o bien sinergizar con ella para generar una actividad transcripcional completa de los receptores a esteroides. A pesar de que los coactivadores p160/SRC fueron identificados originalmente como proteínas que se unen a la AF-2, hay evidencias que muestran que también interaccionan y aumentan la actividad de la AF-1 de los receptores [127-130]. La interacción de los coactivadores p160/SRC con la AF-1 29 del RE y del RP es considerablemente más débil que su unión con la AF-2. Sin embargo, con el RA difiere en que la actividad de la AF-2 es más débil ya que la afinidad de éste por los coactivadores de tipo p160/SRC-1 es baja, mientras que la activación transcripcional por la AF-1 es predominante. Se ha determinado que la interacción de la AF-1 con p160/SRC se lleva a cabo en el segmento C-terminal entre AD1 y AD2. Este sitio ha sido llamado dominio de interacción nuclear AF-1 (DINAF-1) [127, 129]. Mutaciones por deleción en las cajas NR permitieron la interacción y aumento de la actividad de la AF-1 pero falló para aumentar la actividad de la AF-2. En contraste mutaciones en el DINAF-1 no mostraron aumento en la actividad de la AF-1 pero mantuvieron su habilidad para aumentar la actividad de la AF-2. Estos resultados indicaron que la AF-1 y la AF-2 interaccionan simultáneamente con al menos dos determinantes separados en el mismo coactivador SRC, sugiriendo que un simple polipéptido p160/SRC se puede unir cooperativamente a los receptores nucleares. Estructura de la familia CBP/ p300 Las proteínas CBP/p300 fueron originalmente identificadas asociadas a la proteína de unión a los elementos de respuesta a AMPc (CREB). Algunos estudios, demostraron que CBP/p300 interacciona con una gran variedad de factores de transcripción como son: Jun, Fos, NF-kB, Pit-1 y STATs que potencían la actividad transcripcional de CBP/p300. La interacción de CBP con los receptores se da en el extremo N-terminal del coactivador. Las proteínas CBP/p300 tienen en su estructura los siguientes dominios funcionales: el sitio de interacción con las proteínas CREB, tres dedos de zinc (H1, H2 y H3) en los cuales se pueden unir otros factores de transcripción y la acetilasa pCAF que se asocia en el dedo de zinc H3. Los coactivadores CBP/p300 además de unirse directamente a los receptores nucleares, también se asocian a otros coactivadores como los de la famila p160/SRC en el extremo C-terminal. Esta interacción ha sido identificada en estudios tanto in vivo como in vitro permitiendo a los receptores nucleares unirse a las proteínas CBP/p300 de dos diferentes maneras; una de ellas mediante su interacción con el extremo N-terminal y otro a través de su interacción con las proteínas p160/SRC (Fig.8) [131]. 30 DIN I H1 H2 H3 Sitio de interacción con CREB HAT pCAF SRC-1 Caja NR NH2 COOH DIN I H1 H2 H3 Sitio de interacción con CREB HAT pCAF SRC-1 Caja NR NH2 COOH Fig. 8. Estructura de las proteínas coactivadoras CBP/p300. El dominio de interacción nuclear (DIN), localizado hacia el extremo N-terminal, tiene una única caja NR a diferencia de las proteínas coactivadoas p160/SRC. Los coactivadores CBP/p300 contienen un dominio de interacción con las proteínas CREB y tres dedos de zinc denominados H1, H2 y H3 respectivamente, los cuales sirven para la interacción con otros factores de transcripción de la maquinaria general de transcripción, en el caso del H3 se une la acetilasa pCAF. En el extremo C- terminal se localiza la región con la cual los coactivadores CBP interaccionan con las proteínas corregularas SRC [131]. 31 Mecanismo de acción de las proteínas correguladoras La cromatina tiene un efecto represivo en la transcripción debido a que limita la accesibilidad de la maquinaria general de transcripción (RNA polimerasa y factores generales asociados a la transcripción) al DNA. El remodelamiento de la estructura de la cromatina se puede dar por dos vías: a) la acetilación de las histonas centrales y b) el remodelamiento dependiente de ATP por medio del complejo de proteínas de la levadura SWI-SNF. Muchos coactivadores transcripcionales en los vertebrados poseen actividad de histona acetil transferasa (HAT). Esta actividad HAT provee un mecanismo potencial en las células para dirigir a algunas enzimas hacia promotores específicos vía interacción proteína-proteína con activadores transcripcionales dentro de secuencias específicas en el DNA [132]. Los receptores nucleares son capaces de reclutar por lo menos tres clases diferentes de coactivadores que poseen actividad HAT como los p160 (SRC-1 y SRC-2), el CBP/ p300 y el factor asociado pCAF [101]. Tanto el CBP como el pCAF son coactivadores generales que se asocian con una gran variedad de activadores transcripcionales, mientras que las proteínas p160/SRC son relativamente específicas para los receptores nucleares. A pesar de que el CBP y el pCAF pueden unirse independientemente a los receptores nucleares y aumentan la transactivación, el principal modo de interacción con los receptores nucleares parece ser indirectamente a través de la asociación con p160/SRC. La unión directa del CBP y del pCAF a receptores nucleares no es dependiente de la hormona a través de la AF-2 [133, 134]. El CBP es un coactivador secundario que require la presencia de p160 para efectos de coactivación en receptores nucleares presumiblemente interaccionando con el AD1 de los coactivadores p160/SRC [112-114]. Los coactivadores de tipo SRC-2 de la familia p160/SRC no presentan actividad HAT, mientras que algunas formas truncadas de SRC-1 y SRC-3 que carecen del dominio para la acetilación de las histonas, no pueden funcionar como coactivadores. La función principal de p160/SRC es servir como un componente directo de unión al receptor nuclear que a su vez se le unen otras proteínas coactivadoras con actividad HAT como el CBP y el pCAF que facilitan el reclutamiento del complejo de iniciación de la transcripción al promotor. Se ha encontradoque p300/CBP se une directamente a la RNA 32 polimerasa II [135]. Por otro lado se observado que el pCAF existe como un complejo multiprotéico con componentes en común y factores asociados a TBP (TAFs) sugiriendo que el contacto con la RNA polimerasa tambien es parte importante del mecanismo por el cual el pCAF funciona como coactivador de receptores nucleares [136]. En resumen, los coactivadores actúan en dos pasos: el primero es promover el remodelamiento local de la estructura de la cromatina facilitando el acceso de los factores de transcripción generales al DNA. El segundo es el reclutamiento y estabilización de la maquinaria basal de transcripción por medio de una interacción proteína-proteína directa o indirecta con factores de transcripción asociados con la RNA polimerasa II (Fig. 9). 33 SMRT/ NCoR HDAC Sin3 SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF AF-1 LBD (AF-2) DBD E AF-1 DBD LBD (AF-2) SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF AF-1 DBD LBD (AF-2) E TRAP/ DRIP AF-1 DBD LBD (AF-2) E E6-AP Ub Ub Ub AF-1 DBD LBD (AF-2) E SWI/SNF BRG-1/ BAF57 ATP ADP Pi T AF-1 LBD (AF-2) DBD SMRT/ NCoR HDAC Sin3 A) B) C) D) E) F) SMRT/ NCoR HDAC Sin3 SMRT/ NCoR HDAC Sin3 SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF AF-1 LBD (AF-2) DBD AF-1 LBD (AF-2) DBD E AF-1 DBD LBD (AF-2) SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF AF-1 DBD LBD (AF-2) SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF SRC CBP/ p300 CARM-1 PCAF AF-1 DBD LBD (AF-2) E TRAP/ DRIP AF-1 DBD LBD (AF-2) E LBD (AF-2) E TRAP/ DRIP TRAP/ DRIP AF-1 DBD LBD (AF-2) E LBD (AF-2) E E6-AP Ub Ub Ub AF-1 DBD LBD (AF-2) E SWI/SNF BRG-1/ BAF57 ATP ADP Pi AF-1 DBD LBD (AF-2) E LBD (AF-2) E SWI/SNF BRG-1/ BAF57 ATP ADP Pi SWI/SNF BRG-1/ BAF57 ATP ADP Pi T AF-1 LBD (AF-2) DBD SMRT/ NCoR HDAC Sin3 A) T AF-1 LBD (AF-2) DBD SMRT/ NCoR HDAC Sin3 AF-1 LBD (AF-2) DBD SMRT/ NCoR HDAC Sin3 SMRT/ NCoR HDAC Sin3 A) B) C) D) E) F) Figura 9. Mecanismo de acción de las proteínas correguladoras. La figura representa un esquema del intercambio de correguladores implicados en la activación del gen por el REα. En términos generales, los coactivadores y corepresores se encuentran en un complejo de proteínas dentro de las células. A) En presencia de un antiestrógeno, como el tamoxifeno (T), el receptor interacciona con un complejo de proteínas corepresoras incluyendo SMRT y/o NCoR, que mantiene al receptor en estado inactivo. B) En el estado no ligado, el REα puede unir a un complejo corepresor o coactivador. C, D y E) Cuando el estrógeno activa al receptor, una serie de coactivadores se unen e intercambian en una secuencia programada para llevar a cabo las funciones necesarias para activar el gen. Esto implica la acetilación de las histonas (actividad HAT) mediante la unión de las acetilasas p300/CBP y SRCs, posteriormente se une el complejo SWI/SNF, BRG-1/BAF57, el cual desenrrolla al DNA y remodela a la cromatina, seguido por un complejo involucrado en la iniciación de la transcripción. Este complejo puede incluir al SRC-1 o alguno de los miembros de la familia p160/SRC. El mantenimiento y reinicio de la transcripción se realiza por TRAP220 y el complejo de proteínas TRAP/DRIP, que sucesivamente unen a la 34 RNA polimerasa e inician la transcripción. Finalmente el complejo de proteínas con ubiquitinas, como: E6-AP y MDM2, ubiquitinan a las proteínas para la degradación del receptor por el proteosoma 26S. La transferencia del receptor permite la regulación de los niveles de receptor/coactivador, pero esta regulación también es requerida para continuar eficientemente la transcripción del gen. Tamoxifeno (T), Estradiol (E2), proteínas corepresoras, SMRT y NCoR, histonas acetilasas (p300/CBP y SRCs), proteínas que desenrrollan al DNA BRG-1/BAF57; metiltransferasas CARM1 y PRMT-1/2, histona diacetilasa HDAC, Ub, ubiquitina [137]. 35 ANTECEDENTES Los estudios realizados en nuestro laboratorio, han demostrado que las progestinas sintéticas derivadas de la 19-nortestosterona, son metabolizadas tanto in vivo como in vitro a compuestos dihidro y tetrahidro reducidos que presentan una gran variedad de efetos hormonales. La reducción en el anillo A de las progestinas sintéticas de la serie 19- nor como son; la noretisterona (NET), el levonorgestrel (LNG) y el gestodeno (GSD), a sus correspondientes metabolitos 5α-dihidro y 3β,5α-tetrahidro reducidos resulta en la pérdida de su actividad progestacional. A pesar de que los derivados dihidro reducidos unen principalmente a los receptores de progesterona y andrógenos, los derivados tetrahidro reducidos pierden actividad progestacional y adquieren efectos de tipo estrogénico que son mediados por el receptor de estrógenos [88, 138, 139]. Utilizando un sistema de transactivación in vitro, mediante la transfección de células HeLa con genes progesterona y estrógeno dependientes, nuestro grupo demostró que, los derivados tetrahidro reducidos de NET, LNG y GSD perdían la capacidad de activar la transcripción a través de ambas isoformas del RP cuando se comparaba con P4 y la molécula original. En contraste, la actividad de los derivados 3β,5α-tetrahidro reducidos de las 19 nor progestinas, resultó en una activación de la transcripción significativa de los genes dependientes de estrógenos. Estos efectos fueron selectivos por el REα ya que no se observó actividad alguna a través de REβ [86, 87]. Estos resultados proveen evidencias que ayudan a entender la actividad estrógenica de los derivados sintéticos de la 19-nortestosterona así como los requerimientos de un ligando para ser reconocidos por el REα. Recientemente, nuestro grupo demostró que los derivados 5α-reducidos de NET, LNG y GSD así como las moléculas originales, tenían la capacidad de activar la transcripción de genes andrógeno dependientes cuando se comparaba con DHT [140], confirmando evidencias previas en las que se observó que estos compuestos presentaban efectos de tipo androgénico al lograr restablecer la conducta sexual masculina en ratas castradas [89]. Las hormonas esteroides como el estradiol y la progesterona activan a sus receptores a través de una serie de pasos secuenciales en donde, seguido de la unión del ligando, los receptores se disocian de un complejo heteromérico que contiene una gran variedad de 36 proteínas de choque térmico. La disociación es seguida de la dimerización de los receptores, evento que se lleva a cabo antes de su unión a los elementos de respuesta en el DNA [20]. Los primeros estudios acerca del cambio conformacional de los receptores se realizaron con el receptor de progesterona utilizando un sistema de transcripción y traducción in vitro dependiente del ligando, los resultados demostraron que con la simple remoción de las chaperonas hsp no se controlaba el proceso de activación del receptor y por lo tanto no había iniciación de la trancripción [20, 141]. Esto se detectó mediante el análisis de proteólisis parcial de los receptores transcritos in vitro en donde algunas progestinas indujeron un cambio conformacional drástico en el dominio de unión al ligando. Por otro lado, también se encontró que el RU486, un compuesto antiprogestacional, inducía cambios en la conformación del receptor que de igual manera afectaron la estructura del LBD sin embargo, el cambio fue claramente distinto al inducido por el compuesto agonista en el extremo C-terminal [22, 142]. Con estos resultados se confirmó que el cambio conformacional en el LBD, ya sea por la hormona o antihormona, era necesario al menos para inducir la disociación de las hsps y la unión del receptor al DNA, en el caso del complejo antihormona-receptor se provoca una inhibición de la activación de la transcripción debido a un cambio distinto e inapropiado en la estructura del LBD,principalmente en la región C-terminal. Con estos resultados se concluyó que, dependiendo de la naturaleza del ligando al cual se encuentre unido el receptor, se obtienían fragmentos polipeptídicos de diferentes tamaños cuando los complejos hormona-receptor o antihormona-receptor eran expuestos a la digestión limitada con enzimas como quimotripsina o tripsina, indicando que el cambio conformacional en el LBD del receptor es distinto para agonistas y antagonistas [119, 143, 144]. Estudios posteriores acerca de los cambios conformacionales en el RP mediante la digestion parcial del receptor con diferentes proteasas como la tripsina, quimotripsina y subtilisina, demostraron que los productos de la digestión analizados a través de geles desnaturalizantes se caracterizaban por la formación de dos fragmentos de distintos tamaños dependiendo del ligando. Para los tres tipos de proteasas se obtuvieron dos fragmentos. Un fragmento de 30 kDa que resultó ser más resistente a la digestión cuando el RP fue incubado en presencia de progesterona, mientras que un fragmento adicional de 37 27 kDa fue más resistente cuando el receptor fue tratado con RU486. Debido a que la digestión es progresiva, parece ser que el fragmento de 27 kDa se deriva del de 30 kDa, indicando esto, que los cambios en la estructura inducidos por los dos ligandos involucran la misma región [145]. Posteriormente, digestiones parciales del receptor de andrógenos transcrito in vitro, fueron realizadas con la finalidad de demostrar las diferentes conformaciones del receptor inducidas por algunos andrógenos y antiandrógenos. Los resultados mostraron cinco conformaciones distintas del receptor detectadas por la formación de diversos fragmentos resistentes a la acción de las proteasas; el primero de ellos una conformación inicial del receptor sin ocupar que no fue capáz de resistir a la proteólisis, el segundo, la formación de un fragmento resistente con un peso característico de 35 kDa que correspondía al dominio de unión al ligando y una parte de la región bisagra obtenida con la mayoría de los antagonistas; el tercero, la presencia de un fragmento de 29 kDa correspondiente al dominio de unión al ligando obtenido en presencia de un agonista después del proceso de activación, la cuarta y quinta conformación los fragmentos de 30 y 25 kDa derivados de los mencionados en segundo y tercer lugar, pero que les falta parte del carboxilo terminal obtenido con RU486, el cual tiene propiedades antiandrogénicas además de algunos efectos antiprogestacionales y antiglucocorticoides [146]. Los ensayos de sensibilidad a las proteasas para los receptores de hormonas esteroides, son un método confiable para caracterizar también los cambios conformacionales inducidos en la estructura del LBD del REα una vez que se ha unido a su ligando [119, 145, 147]. Kraichely y col. evaluáron la sensibilidad de ambos subtipos del receptor de estrógenos con algunos ligandos selectivos y se encontró que el REα completo con un peso de 66 kDa, incubado en presencia de E2, era rápidamente digerido por la tripsina dando lugar a la formación de un fragmento de 28 kDa. Cortes subsecuentes hasta fragmentos de 25 kDa ocurrieron cuando el REα está formando complejos con compuestos antagonistas. Los ligandos utilizados durante este estudio, el R,R- y S,S-THC y PPT, los cuales son ligandos agonistas selectivos para el REα, resultaron ser tan efectivos como el E2 para estabilizar la banda de 28 kDa, indicando que estos compuestos son capaces de inducir una conformación de tipo agonista. Lo más importante del estudio fue que, tanto el compuesto R,R-THC como el PPT, que son agonistas para el receptor de 38 estrógenos α pero antagónicos para el β, indujeron conformaciones agonistas para REα y conformaciones antagónicas para el REβ. Las actividades transcripcionales del REα y del REβ están influenciadas no sólo por el tipo de ligando si no por proteínas correguladoras con las cuales estos se asocian [60, 109, 111]. El reclutamiento de proteínas coactivadoras por el receptor de estrógenos y otros receptores de hormonas esteroides con sus respectivos ligandos parece ser un buen indicador de su actividad transcripcional y se cree refleja la conformación inducida en estos receptores por sus ligandos. Posteriormente, se realizaron estudios con la estructura cristalizada de los LBDs de varios receptores nucleares, incluyendo el REα y el REβ en complejo con ligandos agonistas o antagonistas [116-118]. Los resultados demostraron que ambos tenían una estructura similar a pesar de que la conformación de algunas porciones de este dominio cambia dependiendo de la naturaleza del ligando. Cuando el REα se une al agonista E2 o dietilestilbestrol, adopta una conformación que reposiciona a la hélice H12, formando una superficie hidrofóbica que resulta importante para la unión de la caja NR o motivo LXXLL de las proteínas coactivadoras p160 [114-116]. En contraste, cuando el REα se encuentra formando un complejo con compuestos antagonistas como el raloxifeno o bien el tamoxifeno, la hélice H12 se encuentra desplazada de su posición y ocupa la superficie hidrofóbica que necesita ocupar el coactivador. En el caso del REβ tiene conformaciones similares [117]. De esta forma, el reposicionamiento de la hélice H12 por medio de ligandos de tipo agonistas parece ser un indicador de la habilidad que tienen los receptores nucleares para unirse a proteínas coactivadoras además de ser un determinante importante de la magnitud de la actividad de transcripción del receptor. Estos hallazgos junto con el uso de fagos que expresan en su superficie péptidos correspondientes a regiones especificas de alguna proteína de interés, sugieren que varios ligandos para el RE inducen cambios conformacionales distintos en ambos subtipos del receptor de estrógenos que correlacionan con la habilidad de este receptor para unirse a la caja NR de las proteínas coactivadoras [148]. 39 HIPÓTESIS Las progestinas sintéticas de la serie 19 nor, al metabolizarse a compuestos dihidro y tetrahidro reducidos, inducirán cambios en la estructura del receptor de progesterona, andrógenos y los subtipos α y β del receptor de estrógenos, generando una conformación activa del receptor que lo protegerá contra la digestión parcial por proteasas. El cambio en la conformación adecuada del REα inducida por lo derivados 3β,5α-tetrahidro reducidos de las 19 nor progestinas, resultará en la habilidad del mismo para reclutar proteínas coactivadoras y así activar la transcripción de algunos genes reporteros. 40 OBJETIVOS Caracterizar los cambios conformacionales inducidos por las progestinas sintéticas derivadas de la 19-nortestosterona y sus metabolitos en los diferentes receptores de hormonas esteroides, así como el reclutamiento de proteínas coactivadoras a través del REα. Objetivos particulares • Analizar los cambios conformacionales en el receptor de progesterona y receptor de andrógenos inducidos por las progestinas sintéticas derivadas de la 19-nortestosterona y sus correspondientes metabolitos dihidro y tetrahidro reducidos a través de la digestión parcial por proteasas. • Establecer las propiedades agonistas de los compuestos 3β,5α-NET, 3β,5α-LNG y 3β,5α-GSD a través de estudiar los cambios conformacionales del RE. • Establecer las diferencias transcripcionales de los derivados sintéticos de la 19- nortestosterona y el estradiol natural, así como su habilidad para reclutar proteínas coactivadoras como el SRC-1 o CBP por el REα. 41 MATERIAL Y MÉTODOS Reactivos El estradiol no radiactivo: 1, 3, 5 (10)- estratien-3, 17β-diol fue obtenido de Sigma Chemical Co. (St. Louis, Mo). [2, 4, 6, 7- 3H] Estradiol. ([3H] E2; actividad específica 72 Ci/mmol), y el 3[H]Cloranfenicol(actividad específica 38.9 C1/mmol) se compró de DuPont NEN Research products (Boston, M.A). La radiactividad se determinó en un espectrofotómetro de centelleo líquido Beckman LS6500 (Beckman Instruments, CA). El medio de cultivo celular DMEM se compró de Life Technologies (Gibco). El suero bovino fetal (FBS) de Hyclone Laboratories, Gibco. (Logan, UT). Todos los solventes y reactivos utilizados fueron de grado analítico. La NET (17α-etinil-17β-hidroxi-4-estren- 3-ona) y el GSD (13β-etil-17α-etinil-17β-hidroxi-4,15-gonadien-3-ona), el LNG (13β- etinil-17α-etinil-17β-hidroxi-4-gonen-3-ona) y derivados reducidos fueron donados por Schering Mexicana, S.A. (México) y Schering AG (Berlin, Alemania) respectivamente. La síntesis de los correspondientes 5α-dihidro (5α-NET, 5α-LNG y 5α-GSD) y los tetrahidro reducidos (3α,5α-NET, 3α,5α-LNG y 3α,5α-GSD), y (3β,5α-NET, 3β,5α- LNG y 3β,5α-GSD), incluyendo la descripción de sus correspondientes constantes físicas o químicas fueron descritas previamente [138, 139]. Plásmidos Los vectores de expresión pCR3.1-hREα, pCR3.1-hREβ y el pCR3.1-hRPB utilizados en el sistema de transcripción y traducción in vitro, fueron generados en el plásmido pCR3.1®, usando el estuche comercial de clonación TA Cloning (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). La característica principal del vector pCR3.1 es que cuenta en su secuencia con una región que codifica para el promotor T7 entre las bases 638-657 el cual es indispensable para los sistemas de transcripción y traducción simultánea (Fig.10). 42 El vector pCR3.1-hREα fue generado de la siguiente manera: el DNA que codifica para el REα completo fue amplificado por PCR a partir del plásmido pCMV5hERα, el fragmento resultante fue subclonado en los sitios de restricción NheI y XmaI del vector pCR3.1 usando el estuche comercial TA Cloning (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA). Para generar el plásmido pCR3.1-hREβ, el DNA que codifica para el REβ fue amplificado por PCR obtenido a partir del plásmido pCMV5-hERβ y el fragmento resultante fue insertado en los sitios de restricción NheI y KpnI del vector pCR3.1 [149]. Para la construcción del pCR3.1RPB, el DNA que codifica para el RPB fue amplificado por PCR a partir del plásmido pLEN-hPRB, el fragmento resultante de la reacción fue subclonado en el vector pCR3.1. Para la expresión del RA, el producto de PCR correspondiente, fue subclonado en el vector pcDNAHis, en los sitos de restricción KpnI/SacII obteniendo el vector pcDNAHisARomcs. Los plásmidos arriba mencionados y utilizados para el sistema de transcripción y traducción in vitro, fueron proporcionados por los doctores Austin J. Cooney, Carolyn Smith y Nancy Weigel del Departamento de Biología Celular y Molecular del Colegio de Medicina de Baylor en Houston, Texas. 43 Promotor T7Promotor T7 Figura 10. Plásmido pCR3.1 utilizado para el sistema de transcripción y traducción in vitro. Este vector esta formado por 5066 nucleótidos. El promotor T7 requerido para la expresión de proteínas in vitro se encuentra localizado de las bases 638 a 657. En este vector fueron clonados los DNAs que codifican para el hREα, hREβ y RPB, amplificados por PCR respectivamente. 44 Construcción de los vectores para el sistema de los dos híbridos Los siguientes plásmidos fueron donados por la Doctora Carolyn Smith del Departamento de Biología Celular y Molecular del Colegio de Medicina de Baylor en Houston Texas, los cuales fueron construídos de la siguiente manera: El vector pBIND que codifica para el dominio de unión al DNA de GAL4 (aminoácidos 1-147) y el plásmido pACT el cual dirige la expresión del dominio de activación del virus del herpes simple VP16 (aminoácidos 411-456) fueron obtenidos de Promega Corporation (Madison, WI), así como el gen reportero pG5luc el cual contiene 5 dominios de unión para el DBD del GAL4 y un promotor TATA localizado hacia la región 3’ del gen de la enzima luciferasa. El vector de expresión GAL-SRC-1 fue construído substituyendo el fragmento BstZ17I- XbaI del pBIND-hSRC-1a [150] con el nucletótido 270 BstZ17I-SpeI fragmento del DNAc del SRC-1e el cual fue generado por la transcriptasa reversa SuperScript II ( Life Technologies, Grand Island, NY, USA), del RNA aislado de las células HeLa seguida de una amplificación por PCR usando los primers 5’-TGT GTT CAG TCA AGC TGT CC- 3’ y 5’-GAG CAT TCC ACT AGT CTG TAG-3’. El vector de expresión quimérico VP16-ERαLBD fue generado en el plásmido pACT de la siguiente manera: 882 pb del DNA que codifica para el LBD del REα que corresponde a los aminoácidos 302-595 fueron amplificados por PCR a partir del plásmido pCMV5hERα [151] utilizando los primers 5’-GGG ATC CGTA AGAA GAA CAG CTG GCC TTG TTC C-3’ y 5’-TCT AGA GAC TGT GGC AGG GAA ACC CTC TGCC-3’. Los fragmentos resultantes del PCR fueron subclonados en el vector pCR3.1 usando el estuche comercial de clonación TA Cloning (Invitrogen, Carlsbad, CA, USA), y posteriormente se volvió a aislar como un fragmento BamHI-XbaI y subclonado en el vector pACT en los sitios correspondientes para generar el VP16-ERα-LBD. 45 Preparación de bacterias competentes La preparación de las bacterias competentes se llevó a cabo con la finalidad de tener bacterias viables a las cuales se les puedan introducir fácilmente fragmentos del DNA de interés. Para este proceso se inoculó una colonia de bacterias de E. coli de la cepa DH5α en 10 ml de medio LB. El cultivo se dejó crecer toda la noche a 37°C a 200 revoluciones por minuto (rpm). Al día siguiente se inoculó 1 ml de este cultivo en 100 ml de LB. Se incubó a 37°C en agitación y cuando las células alcanzaron una densidad óptica a 590 nm (D.O590nm ) de 0.375, se tomaron 50 ml del cultivo en un tubo estéril frío y se dejó en hielo de 5 a 10 min. Posteriormente las células se centrifugaron a 3000 rpm por 7 min a 4°C, el precipitado se resuspendió suavemente en 10 ml de CaCl2 frío para lograr permeabilizar la pared celular de las bacterias DH5α. Las bacterias se centrifugaron 5 min a 2500 rpm a 4°C. El precipitado se resuspendió en 10 ml de CaCl2 frío y se dejó en hielo durante una hora. Las bacterias se alicuotaron y se congelaron a –70°C. Transformación de bacterias competentes La incorporación de DNA a bacterias competentes para su transformación, consistió en la adición de 10 ng del DNA de interés a 100 µl de bacterias DH5α, se mezcló suavemente y dejó en hielo durante 30 min. Posteriormente las bacterias se incubaron a 42°C por 45 seg e inmediatamente se pasaron a hielo por 5 min. Se adicionó 1 ml de medio LB y se agitó 1 h a 37°C. Para selecionar las bacterias transformadas se sembraron 20 µl del cultivo en cajas de LB-agar conteniendo antibiótico (50 µl/ml de ampicilina) y se incubaron 16 h a 37°C. Se picó una sola colonia del plato que contenía el DNA de interés y se creció en 5 ml de medio LB con antibiótico a 37°C por 8 h a 3000 rpm. Se adicionó glicerol al 15% utilizado como crioprotector. Se fraccionó el cultivo bacteriano en alicuotas de 1 ml y se congelaron a –70°C. 46 Purificación y verificación de los plásmidos La purificación de los DNAs de las bacterias de interés se realizó usando QIAprep Miniprep (QIAGEN Inc., Valencia, CA) de acuerdo al protocolo establecido por el fabricante. Para la purificación de los plásmidos se realizaron cultivos manteniendo una relación 1:1000 en medio LB (50 µg/ml ampicilina), y se crecieron a 37°C durante 17 h. Posteriormente el cultivo se centrifugó a 13,000 rpm y el precipitado bacteriano se resuspendió en 250 µl de la solución P1, seguido de la adición de 250 µl de la solución P2, se mezcló por inversión del tubo de 4 a 6 veces. Se adicionaron 350 µl de la solución N3 y se mezcló. Se centrifugó a 13,000 rpm por 10 min. El sobrenadante se adicionó
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