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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE QUÍMICA CARACTERIZACIÓN BIOQUÍMICA DE UNA BETALACTAMASA PRODUCIDA POR Klebsiella pneumoniae CAUSANTE DE INFECCIONES NOSOCOMIALES EN MÉXICO. T E S I S QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE QUÍMICA FARMACÉUTICA BIÓLOGA P R E S E N T A : JOANNA MARÍA ORTIZ ALCÁNTARA MÉXICO, D. F. 2006 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. 2 Jurado Asignado: Presidente Prof. Luz del Carmen Castellanos Román Vocal Prof. Norma Angélica Castellanos Chávez Secretario Prof. Celia Mercedes Alpuche Aranda 1er. Suplente Prof. María de los Ángeles Granados Silvestre 2° Suplente Prof. María del Carmen Urzua Hernández Sitio donde se desarrolló el tema: Laboratorio de Infectología, Microbiología e Inmunología Clínica, Unidad de Medicina Experimental, Facultad de Medicina UNAM, Hospital General de México. ______________________________ Dra. Celia Mercedes Alpuche Aranda Asesora del tema ______________________________ Dra. María Dolores Alcántar Curiel Supervisora técnica ______________________________ Joanna María Ortiz Alcántara Sustentante 3 A las personas más importantes en mi vida: Cecilia y Bernardo Ivette y Nelly Héctor 4 Mil gracias a: Mis padres Cecilia y Bernardo por la vida, por su amor y sus sabias palabras. Mis hermanitas Ivette y Nelly por ser mis amigas y hacerme siempre sonreír. Héctor por hacerme tan feliz. Atziri, Verónica y Julissa por ser mis súper amigas. Las familias Ortiz y Alcántara por siempre apoyarme y creer en mi. Agradezco especialmente a: La Dra. Celia Mercedes Alpuche Aranda, mi primera mentora en la ciencia, por la oportunidad de acercarme a la investigación en el laboratorio a su cargo, por ser un ejemplo a seguir. La Dra. María Dolores Alcántar Curiel por todas sus enseñanzas. La QFB Catalina Gayosso Vázquez por su valioso apoyo para realizar este trabajo, y sobretodo por su amistad. Todos mis compañeros de laboratorio, principalmente a Marcia, Araceli y Roberto, por tenderme siempre la mano. Dr. Guillermo Mendoza por su invaluable ayuda en la purificación de la betalactamasa, por su tiempo y su paciencia. 5 ÍNDICE GENERAL Página ABREVIATURAS..........................................................................................7 1. INTRODUCCIÓN.........................................................................................9 1.1. Infecciones nosocomiales..................................................................9 1.2. Klebsiella pneumoniae.....................................................................12 1.3. Antibióticos.......................................................................................14 1.4. Resistencia a los antibióticos...........................................................20 1.5. Las betalactamasas como base molecular de la resistencia a los antibióticos betalactámicos...................................................................21 1.6. Características moleculares y bioquímicas de las betalactamasas de espectro extendido (BLEEs)............................................................27 2. ANTECEDENTES.......................................................................................36 3. JUSTIFICACIÓN.........................................................................................40 4. OBJETIVOS................................................................................................41 4.1. Objetivo general...............................................................................41 4.2. Objetivos particulares.......................................................................41 5. MATERIALES Y MÉTODOS.......................................................................42 5.1. Diseño experimental.........................................................................42 5.2. Cepas bacterianas...........................................................................44 5.3. Punto isoeléctrico.............................................................................44 5.4. Prueba biológica de hidrólisis de CAZ..............................................45 5.5. Obtención del extracto crudo...........................................................45 5.6. Purificación de la betalactamasa con pI 6.0.....................................46 5.7. Determinación de la masa molecular relativa...................................47 5.8. Determinación de proteínas.............................................................47 5.9. Electroforesis en dos dimensiones...................................................47 5.10. Evaluación de la hidrólisis enzimática y determinación de párame- tros cinéticos.........................................................................................49 5.11. Extracción de ADN plasmídico por el método de lisis alcalina.........49 6 5.12. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación del producto de PCR...................................................................................50 6. RESULTADOS............................................................................................ 52 6.1. Caracterización bioquímica de la betalactamasa con pI 6.0.............52 6.2. Caracterización molecular de la betalactamasa con pI 6.0...............53 7. DISCUSIÓN DE RESULTADOS..................................................................55 8. CONCLUSIONES........................................................................................58 9. APÉNDICE I. TABLAS Y FIGURAS............................................................59 9.1. Geles de pI y prueba biológica de hidrólisis de CAZ.........................59 9.2. Determinación de la masa molecular relativa de la betalactamasa con pI 6.0 semipurificada.......................................................................62 9.3. Determinación de proteínas..............................................................64 9.4. Constantes cinéticas.........................................................................65 9.5. Geles del producto de PCR y cuantificación de ADN en el producto purificado...............................................................................................66 9.6. Secuencia de nucleótidos de la región codificante del gen blaTEM ...67 10. APÉNDICE II. CALIBRACIÓN DE LA COLUMNA SUPERDEX 75............68 11. REFERENCIAS...........................................................................................69 7 ABREVIATURAS ADN Ácido desoxirribonucleico AMK Amikacina AMP Ampicilina ASB Albúmina sérica bovina ATCC Colección Americana de Cultivos Tipo AZM AztreonamBHI Infusión cerebro corazón BLEE Betalactamasa de espectro extendido CAZ Ceftazidima CAZR Resistente a Ceftazidima CDC Centro de Control de Enfermedades CMN Centro Médico Nacional CTX Cefotaxima Da Dalton EDTA Ácido etilendiaminotetraacético IEF Isoelectroenfoque IN Infecciones nosocomiales kDa Kilodalton LB Medio Luria Bertani MIC Concentración Mínima Inhibitoria Mr Masa molecular relativa MRHA Hemaglutinina manosa resistente MSHA Hemaglutinina manosa sensible PAGE Electroforesis en gel de poliacrilamida PBP Proteína de unión a la penicilina PBS Solución amortiguadora de fosfatos pCMB p-cloromercuribenzoato PCR Reacción en cadena de la polimerasa 8 PFGE Electroforesis por campos pulsados pI Punto isoeléctrico RHOVE Red Hospitalaria de Vigilancia Epidemiológica RIF Rifampicina RIFR Resistente a rifampicina SDS Dodecil sulfato de sodio TBE Solución amortiguadora con Tris, boratos y EDTA TR Transconjugante UCI Unidad de Cuidados Intensivos UCIN Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales Ve Volumen de elusión 9 1. INTRODUCCIÓN 1.1 Infecciones nosocomiales Las infecciones nosocomiales pueden definirse como aquellas que se adquieren durante la hospitalización y que no están presentes, en el periodo de incubación, en el momento del ingreso del paciente al hospital. Se manifiestan durante la misma o en ocasiones tras el alta del paciente30, 38. Constituyen un problema importante de salud pública ya que condicionan altas tasas de morbilidad y mortalidad, así como un incremento en el tiempo de estancia hospitalaria y en los costos de atención22. En los Estados Unidos de América se estima que hay 5.7 infecciones nosocomiales (IN) por cada 100 admisiones, ya que de los 35 millones de pacientes que son hospitalizados, al menos 2.5 millones desarrollan una infección de este tipo. En ese país en promedio la tasa de infecciones intrahospitalarias va de 3 a 5 por ciento64. En México, se asume una tasa de IN de entre el 10 y 15 por ciento, de acuerdo a estudios realizados en hospitales de referencia y de segundo nivel, con una tasa de mortalidad asociada a las mismas del 5 %, lo que ubica a las IN como la séptima causa de muerte62, 63, 64, 65, 78. La frecuencia con que se presentan IN depende del tipo de hospital y las condiciones del paciente, de manera que las tasas reportadas en diferentes hospitales de México varían entre 2.5 a 18.9 infecciones por cada 100 ingresos38. En hospitales pediátricos las tasas son más elevadas, principalmente en recién nacidos y pacientes que se encuentran en unidades de cuidados intensivos (UCI) con una tasa de mortalidad de 10.5 a 11.7 por cada 100 infecciones 4, 5, 25, 57. Las infecciones nosocomiales no representan un problema nuevo. En el siglo XVIII en París, se les identificó por primera vez como un factor asociado con la mortalidad, al relacionarse con la fiebre pútrida, causante del 80% de las muertes en pacientes amputados. En 1847, el médico húngaro Ignaz Semmelweis realizó el primer estudio en la materia, en una clínica de 10 maternidad en Viena en la que había una elevada mortalidad debida a fiebre puerperal; Semmelweis observó que la mortalidad entre las madres atendidas en el parto por médicos y estudiantes de medicina era más alta comparada con la de aquellas atendidas por parteras y atribuyó este hecho a que las manos de los médicos y estudiantes se encontraban contaminadas con restos de las necropsias realizadas, algunas de las cuales correspondían a pacientes que habían muerto a causa de la fiebre puerperal. El número de casos de esta enfermedad, así como la mortalidad asociada, disminuyeron significativamente al instituirse la medida del estricto lavado de manos con una solución de hipoclorito de calcio. Un siglo después, en 1968 el único escrito autorizado acerca de las IN era el manual Infection Control in the Hospital publicado por la Asociación Americana de Hospitales. A partir de 1970, el Centro de Control de Enfermedades (CDC) realiza cada 10 años una conferencia internacional de infecciones nosocomiales en Atlanta Georgia como un esfuerzo promotor de la investigación y el control de tales infecciones38. Las infecciones nosocomiales, pueden ser causadas por diversos microorganismos. Se estima que el 95% de éstas son causadas por bacterias. Dos tercios por bacilos gram-negativos, los más frecuentes Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter spp. Pseudomonas spp., Serratia spp., Proteus vulgaris, Escherichia coli, Citrobacter freundii, Providencia spp. y un tercio por cocos gram-positivos como Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus coagulasa negativa y Enterococcus spp. Otros microorganismos, como agentes virales (rotavirus), hongos (Candida spp.) y parásitos como Pneumocystis han sido implicados también en la aparición de infecciones nosocomiales, principalmente en pacientes inmunosuprimidos38, 44. Las enterobacterias como E. coli y particularmente K. pneumoniae son responsables de gran cantidad de IN particularmente en las salas de cuidados intensivos (UCIs) en la mayoría de los hospitales 27, 44, 56, 58. El uso inapropiado de antimicrobianos ha promovido el desarrollo de cepas bacterianas resistentes a los antibióticos de uso común. Cepas 11 multirresistentes que incluyen a Staphylococcus spp. resistente a meticilina, Enterococcus spp. resistente a vancomicina y Klebsiella pneumoniae resistente a antibióticos de amplio espectro como cefalosporinas de tercera y cuarta generación son causantes de infecciones nosocomiales21, 33. Especies como K. pneumoniae, K. ozaenae y Serratia marcescens, a partir de 1983 se han reportado con una creciente resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación debido a la producción de enzimas capaces de inactivar a los diferentes tipos de antibióticos betalactámicos como las penicilinas, las cefalosporinas, los inhibidores de betalactamasas, los carbapenémicos y monobactámicos44, 52. De acuerdo a su fuente, las infecciones nosocomiales pueden ser autógenas (endógenas), si los microorganismos causantes de la infección forman parte de la biota normal del paciente o éste es un portador sano; o bien, exógenas si el agente causal de la infección es transferido desde otro paciente, del personal o del ambiente38. Los factores de riesgo relacionados con el desarrollo de infecciones intrahospitalarias son diversos; Incluyen la edad y el sexo del paciente, servicio, tiempo de internación, presencia de infecciones anteriores, enfermedades subyacentes, tipo y duración de la cirugía, catéteres, apoyo ventilatorio continuo, terapia inmunosupresora, estado nutricional, respuesta inmune, factores genéticos y factores relacionados con resistencia alterada38. Las infecciones intrahospitalarias más frecuentes son la infección respiratoria, principalmente la neumonía nosocomial, la infección asociada a dispositivos intravasculares, la infección urinaria nosocomial, y la infección de herida quirúrgica38. Los factores de riesgo que se conjugan para dar lugar a IN, en su mayoría son susceptibles de prevención y control; en este sentido, el inicio de operación de la Red Hospitalaria de Vigilancia Epidemiológica (RHOVE) en México, es una de las estrategias nacionales de fortalecimiento de la práctica médica y la vigilancia epidemiológica, herramienta útil para la identificación temprana y estudio de las infecciones nosocomiales22. 12 1.2 Klebsiella pneumoniae Klebsiella es un género de la familia Enterobacteriaceae constituido por bacilos gram-negativos, no móviles, encapsulados. El género fue establecido en 1885 y actualmente contiene 5 especies: K. pneumoniae, K. oxytoca, K. terrígena, K. planticola y K. ornitholytica,que pueden diferenciarse de acuerdo a ciertas características bioquímicas señaladas en la Tabla A. En Klebsiella pneumoniae se reconocen tres subespecies (pneumoniae, ozaenae y rhinoscleromatis) las cuales no pueden ser separadas por hibridación de ADN, aunque presentan algunas diferencias bioquímicas (Tabla A)80. Tabla A. Características bioquímicas del género Klebsiella Característica K. pneumoniae subsp. pneumoniae K. pneumoniae subsp. ozaenae K. pneumoniae subsp. rhinoscleromatis K. oxytoca K. terrigena K.planticola K. ornitholytica Producción de indol - - - + - reacción variable + Ornitina descarboxilasa - - - - - - + lisina descarboxilasa + reacción variable - + + + + crecimiento a 10 °C - - - + + + + prueba de rojo de metilo - + + - + reacción variable + prueba de Voges Proskauer + - - + + + + Tomado de West, P. W. Extended-spectrum β-lactamase-producing Klebsiella spp. British J. Biomed. Science. 57, 226-233 (2000). Klebsiella pneumoniae es la especie médicamente más importante del género. En los seres humanos, se encuentra como biota normal de la nasofaringe y el tracto intestinal. Es un patógeno oportunista que afecta principalmente a individuos inmunocomprometidos que se encuentran hospitalizados y padecen de enfermedades como diabetes mellitus u obstrucción pulmonar crónica. Es responsable de infecciones del tracto urinario, septicemia y neumonia. 13 Los mecanismos de patogenicidad de Klebsiella son: la presencia de cápsula, las adhesinas, la resistencia al efecto bactericida del suero y los sideróforos. Klebsiella desarrolla cápsulas prominentes compuestas por polisacáridos que forman densas estructuras fibrosas sobre la superficie de la bacteria, protegiéndola por un lado de la fagocitosis por granulocitos polimorfonucleares y por otro de los factores bactericidas del suero. Existen 77 distintos tipos capsulares con virulencia variable. Los que presentan los antígenos capsulares K1, K2, K4 y K5 son los más importantes. El pili o fimbria es una proyección filamentosa no flagelar de la superficie de la bacteria que media generalmente las propiedades de adherencia en la familia Enterobacteriaceae. Estas estructuras tienen hasta 10 µm de longitud y un diámetro de 1 a 11 nm. Consisten de proteínas globulares poliméricas (pilinas) con una masa molecular de 15 a 26 kDa. Los pili son capaces de aglutinar eritrocitos de distintas especies animales; dependiendo de si la reacción es inhibida por D-manosa, estas adhesinas se designan como hemaglutininas manosa sensibles o manosa resistentes (MSHA y MRHA por sus siglas en inglés) respectivamente. Hay dos tipos predominantes de pili en Klebsiella, el tipo 1 y el tipo 3. Los pili de tipo 1 son MSHA que aglutinan eritrocitos de cobayo; su proteína de adhesión se localiza en el cuerpo fimbrial y es capaz de unirse a trisacáridos de las glicoproteínas del hospedero, que contengan manosa; este tipo de pili permite que la bacteria se adhiera a células epiteliales de los tractos urogenital, respiratorio e intestinal. Los pili de tipo 3 aglutinan solo eritrocitos tratados con ácido tánico, son MRHA y permiten la adhesión a células endoteliales, epitelio del tracto respiratorio, células uroepiteliales, y en los riñones a membrana basal tubular, a las cápsulas de Bowman y a los vasos renales. La actividad bactericida del suero es mediada primariamente por proteínas del complemento. Éstas, después de su activación en cascada se acumulan como un complejo de ataque a la membrana, en la superficie del microorganismo. Los microorganismos patógenos han desarrollado 14 estrategias para contrarrestar el efecto bactericida del suero; en el caso de Klebsiella, uno de los mecanismos propuestos es que los polisacáridos de la cápsula podrían cubrir y enmascarar a los lipopolisacáridos y exhibir una estructura de superficie que no active al complemento. Finalmente, otro mecanismo de patogenicidad de Klebsiella es la producción de sideróforos, que son agentes quelantes de hierro (factor de crecimiento bacteriano esencial) que tienen bajo peso molecular y alta afinidad y son capaces de unir competitivamente hierro unido a proteínas del hospedero, asegurando el suministro de dicho metal para la bacteria; los sideróforos producidos por las enterobacterias pertenecen a dos grupos químicos distintos; uno consiste en sideróforos de tipo fenolato y otro de tipo hidroxamato, siendo el primero el grupo más común60. 1.3 Antibióticos Los antibióticos son compuestos de bajo peso molecular que inactivan a las bacterias (bactericidas), o inhiben su crecimiento (bacteriostáticos). Muchos antibióticos son producidos por microorganismos como bacterias y hongos. Algunos de éstos han sido modificados por un proceso químico para hacerlos más activos o menos sensibles a los mecanismos de resistencia de las bacterias (antibióticos semisintéticos); y otros antibióticos son totalmente sintéticos. Entre las características deseables en un antibiótico se encuentran: pocos o ningún efecto secundario, amplio espectro de actividad contra distintos tipos de bacteria, buena distribución en el cuerpo, y mínimo efecto en la microbiota47, 81. El intervalo de microorganismos susceptibles a cierto antibiótico se expresa como su espectro de acción . Los antibióticos efectivos contra bacterias tanto gram-positivas como gram-negativas se denominan de amplio espectro; si el antibiótico es efectivo principalmente contra bacterias gram- positivas o gram- negativas, es de espectro restringido47, 79. 15 Clasificación de antibióticos I. Betalactámicos: Los antibióticos de este tipo se denominan así ya que contienen un anillo de 4 miembros llamado betalactámico. Su mecanismo de acción consiste en inhibir el último paso en la síntesis del peptidoglicano de la pared celular. En este paso se unen, mediante enlaces transversales, dos cadenas de peptidoglicano por medio de una reacción de transpeptidación mediada por transpeptidasas; a estas últimas se unen las penicilinas y otros antibióticos betalactámicos, por lo que reciben el nombre de proteínas de unión a las penicilinas (PBPs por sus siglas en inglés). Aunque la pared celular continua sintetizándose, la falta de enlaces transversales la debilita. Las carboxipeptidasas, también consideradas PBPs posiblemente son importantes para la modificación del peptidoglicano. Por otro lado, el complejo antibiótico-PBP estimula la liberación de autolisinas que digieren la pared celular existente dando como resultado la lisis de la célula bacteriana15, 47, 81. Los antibióticos betalactámicos se agrupan a su vez en: a) Penicilinas: La estructura básica de las penicilinas es un núcleo que consiste de anillo tiazólico-anillo betalactámico-cadena lateral. El anillo betalactámico es esencial para la actividad antibacteriana, mientras que la cadena lateral determina en gran parte el espectro de acción y las propiedades farmacológicas de una penicilina en particular. Las penicilinas pueden dividirse en penicilinas de origen natural, como la penicilina G o la penicilina V, que son producidas por Penicillium chrysogenum y son efectivas contra bacterias gram-positivas no productoras de betalactamasas, anaerobias y cocos gram-negativos selectos, como Neisseria; penicilinas resistentes a penicilinasas (semisintéticas) como la meticilina, nafcilina e isoxasolil penicilinas, antibióticos de elección contra S. aureus y Staphylococcus epidermidis resistentes a penicilina, y activas contra algunos estreptococos; aminopenicilinas como ampicilina y amoxicilina, con el mismo espectro que la penicilina G, pero más activas contra cocos gram-negativos y miembros de la familia Enterobacteriaceae; 16 carboxipenicilinas como carbenicilinay ticarcilina; y ureidopenicilinas como azlocilina, mezlocilina y piperacilina, activas contra estreptococos, Haemophilus spp., y bacilos aerobios gram-negativos resistentes a ampicilina como P. aeruginosa15, 40. b) Cefalosporinas: Son antibióticos producidos por el hongo Cephalosporium acremonium, (actualmente llamado Acremonium chrysogenum). Su modo de acción es similar al de las penicilinas. Difieren de estas últimas porque en lugar del anillo tiazólico de cinco miembros tienen un anillo de dihidrotiacina de seis miembros. Se clasifican de acuerdo a su actividad antibacteriana como cefalosporinas de primera generación (cefalotina, cefazolina, cefapirina, cefadroxil) actúan contra bacterias gram-positivas y poco contra gram- negativas; cefalosporinas de segunda generación (cefamandol, cefonicida, cefuroxima, cefoxitina, cefotetan, cefmetazol) actúan contra gram-positivos y algunos gram- negativos; cefalosporinas de tercera generación (ceftizoxima, cefotaxima, ceftriazona, cefoperazona, ceftazidima) actúan contra gram- positivos y marcadamente contra gram-negativos; y cefalosporinas de cuarta generación (cefpirome y cefepime) que actúan contra gram-positivos y gram- negativos, incluyendo a P. aeruginosa y miembros de la familia Enterobacteriaceae con betalactamasas cromosomales e inducibles40, 43, 47, 81. c) Carbapenémicos: Son antibióticos derivados de la tienamicina, compuesto producido por Streptomyces cattleya. Se diferencian de la penicilinas y cefalosporinas por el reemplazo de un sulfuro por metileno en el anillo de 5 miembros, el cual como en el caso de las cefalosporinas, posee un doble enlace. El imipenem se une con alta afinidad a PBPs de bacterias tanto gram- positivas como gram-negativas y no es hidrolizado por la mayoría de las betalactamasas cromosomales o plasmídicas de S. aureus, Escherichia coli, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii, Proteus rettgeri, Serratia marcescens, Proteus vulgaris, Klebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa, B. Cepacia, y B. Fragilis, pero si lo hidrolizan 17 las betalactamasas de S. maltophilia, y algunas enzimas de Bacillus y Bacteroides. El meropenem se caracteriza por una excelente penetración en la bacteria, alta afinidad por PBPs y estabilidad a betalactamasas. Es ligeramente más activo que el imipenem contra organismos gram- negativos. d) Monobactámicos: A partir de Chromobacterium violaceum se aisló un compuesto monocíclico con actividad antibacteriana, éste fue posteriormente modificado para dar lugar al aztreonam. El aztreonam es un antibiótico betalactámico monocíclico cuya actividad contra bacterias gram-positivas o anaerobias no es apreciable, debido a que no se une a PBPs en estas especies. El aztreonam se une principalmente a PBP3 en Enterobacteriaceae, Pseudomonas y otras bacterias aerobias gram- negativas. No es hidrolizado por la mayoría de las betalactamasas cromosomales o plasmídicas, aunque si por K. oxytoca y B. cepacia y por enzimas plasmídicas que hidrolizan a cefotaxima. e) Inhibidores de betalactamasas: Estos compuestos tienen poca actividad antimicrobiana, pero inhiben potentemente a las betalactamasas. Clínicamente se emplean 3 antibióticos de este tipo, el ácido clavulánico, el sulbactam y el tazobactam. Pueden restablecer la actividad antibacteriana de amoxicilina, ampicilina, piperacilina, mezlocilina y cefoperazona, susceptibles de hidrólisis por betalactamasas. Hay diferencias menores en potencia, actividad y farmacología entre los inhibidores de betalactamasas, y clínicamente se consideran terapéuticamente equivalentes, excepto para Klebsiella spp., caso en el que el ácido clavulánico es efectivo en cepas resistentes a sulbactam y tazobactam. Este tipo de antibióticos son más efectivos contra betalactamasas producidas por S. aureus, H. influenzae, Branhamella catarrhalis, Bacteroides spp., y algunas enterobacteriaceas. No son inhibidas las betalactamasas cromosomales de Serratia spp., C. freundii, Enterobacter spp., P. aeruginosa, y de algunas enterobacteriaceas14, 40. 18 II. Glucopéptidos: En este grupo se incluye a la vancomicina y a la teicoplanina. Su mecanismo de acción consiste en inhibir la síntesis de peptidoglicano en los pasos de transglucosilación y transpeptidación uniéndose a la porción D-ala-D-Ala del UDP-muramil-pentapéptido. Son efectivos contra bacterias gram-positivas. III. Aminoglucósidos: Son trisacáridos con grupos amino cuyo blanco es la subunidad 30S del ribosoma bacteriano; al unirse a dicha subunidad, impiden su unión con la subunidad 50S para formar el ribosoma activo, inhibiendo así la síntesis de proteínas. Son activos contra numerosas bacterias patógenas, pero debido a sus efectos secundarios como el daño renal y la pérdida de la audición, se ha limitado su uso. Son aminoglucósidos: kanamicina, gentamicina y estreptomicina. IV. Tetraciclinas: Son compuestos de 4 anillos fusionados, de 6 miembros. Se unen a la subunidad 30S del ribosoma bacteriano, interfiriendo con la síntesis de proteínas. Generalmente son bacteriostáticos. V. Macrólidos y lincosaminas: Inhiben la síntesis de proteínas uniéndose a la subunidad 50S del ribosoma, inhibiendo la translocación. Son bacteriostáticos para muchas bacterias, pero bactericidas para algunas gram- positivas. La eritromicina es un ejemplo de macrólido. Las lincosaminas difieren de los macrólidos estructuralmente, pero tienen el mismo mecanismo de acción. La clindamicina, es la lincosamina más empleada, y es efectiva contra bacterias anaerobias estrictas como Bacteroides. VI. Quinolonas: Interfieren con la replicación del ADN al unirse a la ADN girasa e inhibiendo su actividad, previniendo el superenrollamiento del ADN. Las fluoroquinolonas pueden penetrar a macrófagos y polimorfonucleares por lo que pueden actuar contra bacterias que sobreviven dentro de los fagocitos. Son activas contra bacterias gram-negativas, gram- positivas y Mycoplasma .Algunos ejemplos son: Ciprofloxacina y norfloxacina. VII. Rifamicinas: Estos antibióticos inhiben a la ARN polimerasa, interfiriendo con la transcripción del ADN. Son activas contra bacterias gram- 19 positivas y micobacterias. La rifampicina y el rifabuten pertenecen a éste grupo. VIII. Trimetropima/sulfonamidas: Son inhibidores de enzimas en la vía de producción del ácido tetrahidrofólico, cofactor esencial para las reacciones de transferencia de carbono que ocurren en vías para la síntesis de ácidos nucleicos y formilmetionina. Son activas principalmente contra gram-negativos y se emplean para tratar infecciones de vías urinarias bajas no complicadas y nocardiosis. En este grupo se encuentran el sulfametoxazol , sulfisoxazol y trimetoprima-sulfametoxazol. IX. Metronidazol: Interfiere con la síntesis de ADN. Es activo contra bacterias anaerobias, Gardnerella vaginalis, Trichomonas vaginalis y C. difficile. X. Cloranfenicol: Interfiere con la unión del mARN a los ribosomas, es activo contra gram-positivos y gram-negativos, así como anaerobios. XI. Estreptograminas: Se unen a la subunidad 50S del ribosoma, impidiendo la elongación de la cadena peptídica . El dalfopristin y quinupristin pertenecen a éste grupo, individualmente son bacteriostáticos y mezclados bactericidas ( Synercid)40, 47, 81. XII. Fosfonomicina y bacitracina: Inhiben la síntesis del peptidoglicano. La fosfonomicina inhibe la conversión de UDP-NAG a UDP-NAM y se emplea para tratar infecciones ocasionadas por S. aureus meticilina resistente. La bacitracina interfiere con el reciclamiento del bactoprenol, y se emplea para prevenir infecciones en heridas superficiales ya que es muy tóxica para uso interno47, 81. XIII. Polimixinas: Ocasionan disrupción de la membrana celular, son activas principalmente contra gram-negativos, algunos ejemplos son: polimixina B y colistina40,47, 81. 20 1.4 Resistencia a los antibióticos La resistencia a los antibióticos puede ser una propiedad inherente o adquirida por un organismo para resistir los efectos de un antibiótico47, 81. En las bacterias, la capacidad de desarrollar resistencia a cualquier antimicrobiano puede estar mediada por mecanismos de variabilidad genética. La variabilidad genética es fundamental para que ocurra la evolución de los organismos. En las bacterias, puede ocurrir por medio de mutaciones puntuales (cambio micro evolucionario); rearreglos de segmentos largos de ADN que incluyen inversiones, duplicaciones, inserciones, deleciones o transposiciones de largas secuencias de ADN de un sitio del cromosoma o plásmido bacteriano a otro (cambio macroevolucionario); adquisición de ADN contenido en plásmidos, bacteriófagos, secuencias desnudas de ADN o elementos genéticos transponibles. Los mecanismos anteriores, permiten a la bacteria desarrollar resistencia a agentes antimicrobianos, la cual, una vez presente puede transferirse a otras bacterias en forma horizontal o vertical. Esto ocurre mediante procesos como transformación, transducción, conjugación o transposición. El amplio uso de los antibióticos, favorece la expansión de cepas resistentes, que proliferan y transfieren a otras cepas susceptibles los genes de resistencia55. Existen distintos mecanismos mediante los cuales los microorganismos son resistentes a los antibióticos: a) El organismo carece de la estructura blanco del antibiótico. Un ejemplo son las micobacterias, que al carecer de una pared celular típica son resistentes a los betalactámicos. b) El organismo puede restringir la entrada del antibiótico. Como es el caso de las bacterias gram-negativas, cuya membrana externa impide el paso de las penicilinas naturales. c) La pérdida acelerada del antibiótico, debida al bombeo hacia fuera del mismo por medio de bombas de flujo, es otro mecanismo de resistencia a tetraciclinas y cloramfenicol, presente en bacterias entéricas, S. aureus y B. subtilis. 21 d) El organismo puede poseer enzimas que inactivan al antibiótico mediante hidrólisis, como es el caso de las betalactamasas o bien enzimas que modifican al antibiótico añadiéndole grupos químicos, como las enzimas modificadoras de aminoglucósidos presentes en bacterias gram-negativas, o las acetiladoras de cloranfenicol en S. aureus. e) Otro mecanismo es la modificación o protección del blanco del antibiótico, como ocurre entre las bacterias gram-positivas, en las que se altera la especificidad de unión de las PBPs de manera que el antibiótico betalactámico ya no puede unirse. Otro ejemplo es el de la proteína citoplasmática protectora del ribosoma, que impide la unión de la tetraciclina al ribosoma en bacterias gram-positivas, Micoplasma, Neisseria, Haemophilus y Bacteroides. f) También, puede tener lugar que la alteración de una vía metabólica bloquee al antibiótico, como es el caso de las sulfonamidas cuya resistencia se presenta en bacterias entéricas y S. aureus23, 47, 81. 1.5 Las betalactamasas como base molecular de la resistencia a los antibióticos betalactámicos Las betalactamasas son enzimas que hidrolizan el anillo betalactámico, inactivando a los antibióticos denominados betalactámicos, como las penicilinas, cefalosporinas, carbapenémicos, monobactámicos e inhibidores de betalactamasas. Estas enzimas son la principal causa de resistencia bacteriana a dichos antibióticos37, 44. El nivel de resistencia a antibiótico mediada por una betalactamasa particular en una población bacteriana está determinada por diversas variables como su localización, cinética, cantidad y condiciones fisicoquímicas. La eficiencia de la enzima en la hidrólisis de un antibiótico depende tanto de la tasa de hidrólisis (Vmáx), como de su afinidad por el antibiótico (Km). Otras variables son la cantidad de betalactamasa producida 22 por la célula bacteriana, la susceptibilidad de la proteína blanco (PBP) al antibiótico y la tasa de difusión del antibiótico al espacio periplásmico de la célula44. Entre las bacterias gram-positivas, lo estafilococos son los principales productores de betalactamasas, la mayoría inducibles y excretadas extracelularmente . Los genes que codifican para la producción de éstas enzimas generalmente se encuentran en pequeños plásmidos o transposones. Plásmidos grandes que codifican para éste tipo y otros de resistencia también existen y pueden transferirse por conjugación entre cepas de S. aureus y entre S. aureus y Staphylococcus epidermidis. En las bacterias gram-negativas, las betalactamasas se encuentran en el espacio periplásmico. En éste caso, la gran variedad de betalactamasas producidas ha conducido al desarrollo de varios esquemas de clasificación, de los que se hablará más adelante55. Mecanismo de acción de las betalactamasas Un gran número de betalactamasas actúan mediante un mecanismo en el que se forma un éster de serina. Dicho mecanismo, consiste primeramente en la asociación no covalente de la enzima con el antibiótico, formándose el complejo no covalente de Michaelis; posteriormente, el anillo betalactámico es atacado por el grupo hidroxilo libre de la cadena lateral de un residuo de serina en el sitio activo de la enzima, formando un enlace covalente éster acil. La hidrólisis del éster finalmente libera al sitio activo de la enzima, así como al fármaco hidrolizado e inactivo (Figura A). Este mecanismo es seguido por betalactamasas de las clases moleculares A, C y D, mientras que las enzimas de clase B utilizan iones zinc para romper el anillo betalactámico 44. 23 Figura A. Mecanismo de acción de las serin-betalactamasas. Tomado de Livermore, D. M. β-Lactamases in Laboratory and Clinical Resistance. Clin. Microbiol. Rev. 8, 557-584 (1995). 24 Clasificación de betalactamasas La primera clasificación de las betalactamasas fue realizada por Sawai y col. en 1968, y en ésta se describían penicilinasas y cefalosporinasas, empleando la respuesta a antisuero como un factor de discriminación adicional. Posteriormente, Richmond y Sykes proponen otro esquema en 1973, el cual incluía a todas las betalactamasas de bacterias gram-negativas descritas hasta entonces, clasificándolas en 5 grupos de acuerdo a su afinidad al sustrato. Sykes y Matthew, amplían el esquema anterior en 1976, enfatizando la diferenciación de las betalactamasas mediadas por plásmidos de acuerdo a su punto isoeléctrico (pI). La primera clasificación basada en la estructura molecular fue propuesta por Ambler en 1980; dentro de este esquema, las betalactamasas son clasificadas de acuerdo a su secuencia en 4 clases, designadas de la A a la D. Las clases A, C y D comprenden distintos grupos de serinenzimas, y la clase B a las que contienen zinc. En el esquema propuesto por Mitsuhashi e Inoue en 1981, se añade la categoría de betalactamasas que hidrolizan cefuroxime a la clasificación “penicilinasas y cefalosporinasas”. En 1989, Bush propone el primer esquema en el cual se correlacionan las propiedades del sustrato e inhibitorias con la estructura molecular, el cual fue actualizado en 1995 por Bush, Jacoby y Medeiros. En el sistema de 1995, como en el de 1989, se designan 4 grupos de betalactamasas: grupo 1 cefalosporinasas que no son inhibidas por ácido clavulánico, grupo 2 betalactamasas que son generalmente inhibidas por inhibidores de betalactamasas dirigidos al sitio activo y que pertenecen a las clases moleculares A ó D, grupo 3 metalo- betalactamasas pobremente inhibidas por todos los inhibidores de betalactamasas clásicos, excepto EDTA y p-cloromercuribenzoato (pCMB) y grupo 4 penicilinasas que no son inhibidas por ácidoclavulánico. Sin embargo, se hicieron 3 cambios. Dado que el número de betalactamasas TEM- (que proviene de Temoniera, nombre de la paciente de quién se aisló una cepa de E. coli productora de una enzima de ésta familia en Grecia en 1965) y SHV- (contracción de sulphydril variable, 25 que denota una respuesta variable a sulfidril inhibidores) continuaba incrementándose, se decidió clasificar a las derivadas de éstas enzimas en grupos con el prefijo 2b; las betalactamasas de espectro extendido (ESBLs por sus siglas en inglés “Extended Spectrum Beta Lactamases”, BLEEs en español) fueron colocadas en un grupo 2be en lugar de la designación de grupo anterior 2b’, similarmente, las betalactamasas estructuralmente derivadas del grupo 2b con afinidad reducida hacia inhibidores de betalactamasas, se colocaron en el grupo 2br; el tercer grupo de enzimas añadido al esquema es el 2f, que incluye a la enzimas que hidrolizan al carbapenem, que son débilmente inhibidas por ácido clavulánico y que se sabe poseen serina en su sitio activo12, 44. En la tabla B, se resumen los esquemas de clasificación de las betalactamasas. 26 Tabla B. Esquemas de clasificación de betalactamasas bacterianas Perfil de inhibición Grupo de Bush, Jacoby y Medeiros Grupo de Bush (1989) Clase de Richmond- Sykes Tipo de Mitsuhashi- Inoue a Clase molecular Preferencia al sustrato Ácido clavulánico EDTA Enzimas representativas 1 1 Ia,Ib,Id CSasa C Cefalosporinas - - Amp C; MIR-1 2a 2a No incluido PCasa V A Penicilinas + - Penicilinasas de bacterias gram- positivas 2b 2b III PCasa I A Penicilinas, cefalosporinas + - TEM-1, TEM-2, SHV-1 2be 2b’ No incluido, excepto K1 en clase IV CXasa A Penicilinas, cefalosporinas de corto y amplio espectro, monobactámicos + - TEM-3 a TEM- 26, SHV-2 a SHV-6, K1 2br No incluido No incluida No incluido A Penicilinas ± - TEM-30 a TEM- 36, TRC-1 2c 2c II, V PCasa IV A Penicilinas, carbenicilina + - PSE-1, PSE-3, PSE-4 2d 2d V PCasa II, PCasaIII D Penicilinas, cloxacilina ± - OXA-1 a OXA –11, PSE-2 (OXA-10) 2e 2e Ic CXasa A Cefalosporinas + - Cefalosporinasas inducibles de Proteus vulgaris 2f No incluido No incluido No incluido A Penicilinas, cefalosporinas, carbapenémicos + - NMC-A de Enterobacter cloacae, Sme-1 de Serratia marcescens 3 3 No incluido No incluido B Mayor parte de betalactámicos, incluyendo carbapenémicos - + L1 de Xanthomonas maltophilia, CcrA de Bacteroides fragilis 4 4 No incluido No incluido No determinada Penicilinas - ¿? Penicilinasa de Pseudomonas cepacia a CSasa, cefalosporinasa; PCasa, penicilinasa; CXasa, betalactamasa que hidroliza cefuroxima. Tomado de Bush, K. , Jacoby G. A. & Medeiros A. A . A Functional Classification Squeme for β-lactamases and its correlation with molecular structure . Antimicrob. Agents Chemother. 39, 1211-1233 (1995). 27 1.6 Características moleculares y bioquímicas de las betalactamasas de espectro extendido (BLEEs). Las betalactamasas de espectro extendido (BLEEs) son enzimas mediadas por plásmidos que confieren resistencia a antibióticos oxiimino- betalactámicos tales como cefotaxima, ceftazidima así como a aztreonam, los cuales fueron diseñados para ser efectivos contra las cepas productoras de betalactamasas determinadas por plásmidos conocidas41. La mayoría de las BLEEs pertenecen a la clase molecular de Ambler A; las enzimas de clase A se caracterizan por poseer un sitio activo que contiene serina y una masa molecular de aproximadamente 29 kDa9. Una forma analítica para identificar a las BLEEs, se basa en conocer su punto isoeléctrico (pI), que corresponde al pH en el cual la proteína, que posee cargas positivas y negativas, presenta una carga neta de cero50. Las BLEEs fueron primeramente encontradas en Europa, donde han incrementado su prevalencia, y actualmente se reportan en todo el mundo18. La predilección de las BLEEs por Klebsiella es parcialmente explicada por la infección cruzada, con la diseminación clonal de cepas productoras, lo cual es facilitado por el hecho de que Klebsiella sobrevive más tiempo de otros bacilos gram-negativos en la piel. Sin embargo, la infección cruzada no explica por qué tantos distintos tipos de enzimas han sido encontrados en Klebsiella comparada con otros géneros o por qué algunos hospitales han presentado diseminación de algún tipo en especial de BLEEs entre Klebsiella de diversos serotipos. Probablemente, Klebsiella es particularmente un buen vector para plásmidos o permite la evolución de los genes que codifican BLEEs más rápidamente que otras enterobacterias. En este sentido, es notable que muchos genes que codifican para BLEEs se encuentran en plásmidos grandes con bajo número de copias y que plásmidos grandes que confieren multirresistencia han sido por mucho tiempo más comunes en Klebsiella que en E. coli, aunque con el paso del tiempo las BLEEs se han diseminado a otros géneros de la familia Enterobacteriaceae. 28 La mayor parte de las BLEEs son mutantes de TEM-1, TEM-2 y SHV-1, con 1 a 4 sustituciones de aminoácidos en su secuencia. Estos cambios, que representan menos del 2 % de la secuencia proteica, remodelan de manera suficiente el sitio activo de la enzima para permitir el ataque a la mayoría de las cefalosporinas aminotiazólicas44. Existen actualmente más de 130 betalactamasas de tipo TEM ( pI 5.2-6.5) y más de 50 de tipo SHV (pI 7.0- 8.2). TEM-10, TEM-12 y TEM-26 se encuentran entre las más comunes en Norte y Sur América, mientras que SHV-5 y SHV-12 son los miembros más comunes de la familia SHV9, 42, 55. Las BLEEs de tipo TEM y SHV son más frecuentemente encontradas en E. coli y K. pneumoniae, aunque también se han encontrado en Proteus spp., Providencia spp. y otros géneros de la familia Enterobacteriaceae9, 49, 51. Las BLEEs tipo SHV se observaron por primera vez en K. pneumoniae en los años 80 , SHV-1 fue la primera betalactamasa codificada en el cromosoma del género Klebsiella y es la más frecuentemente encontrada en K. pneumoniae9, 19, 37, 45. En muchas cepas de K. pneumoniae bla SHV-1 o un gen relacionado está integrado en el cromosoma bacteriano.3 Posteriormente se demostró que SHV-1 es idéntica a la enzima PIT-2, descrita por Pitton en 1972, que es codificada por un transposón y encontrada en plásmidos, sugiriendo la naturaleza móvil de los genes que confieren resistencia a los antibióticos betalactámicos. LEN-1 descrita por Arakawa en 1986 es una betalactamasa cromosomal encontrada en cepas de K. pneumoniae; el análisis de la secuencia nucleotídica demuestra que los genes de LEN-1 están muy relacionados con la secuencia del gen bla SHV-136, 37. Otra enzima que presenta un perfil bioquímico similar es OHIO-1 que demostró tener 91.8 % de homología en la secuencia de aminoácidos con SHV-1 y LEN-1 y sólo un 63.7% de homología entre SHV-1 y TEM-1. En 1983 se describe por primera vez la transferencia de resistencia en aislados de K. pneumoniae y Serratia marcescens generando la producción de una nueva betalactamasa denominada SHV-2, originada por una mutación en el gen de la enzima SHV- 29 1, en la posición 238, que corresponde a una glicina que fue sustituida por una serina9, 37. La mayoría de las variantes de SHV que poseen un fenotipo de BLEE se caracterizan por poseer la mutación anterior. Un número de variantes relacionadas a SHV-5 (pI 8.2, codificada por un plásmido de 150 kb) tienen además una sustitución en la posición 240, que corresponde a glutamato que es sustituido por lisina. El residuo de serina en la posición 238 es crítico para la eficiente hidrólisis de ceftazidima y el residuo de lisina es crítico para la eficiente hidrólisis de cefotaxima. SHV-5 difiere de SHV-3 en dosposiciones, una arginina en lugar de una leucina en la posición 205 y una lisina en lugar de glutamato en la posición 240. También se encontró que SHV-5 difiere de SHV-4 por el aminoácido leucina en la posición 205. (numeración de aminoácidos de acuerdo al esquema de Ambler)7, 9. TEM-1 es la betalactamasa más comúnmente encontrada en bacterias gram-negativas; esta enzima es capaz de hidrolizar penicilinas y algunas cefalosporinas como cefalotina y cefaloridina. TEM-2, la primera enzima derivada de TEM-1 posee una sola sustitución de aminoácido de la enzima original ( glutamina es sustituida por lisina en la posición 39 ), esto causó un salto del pI de 5.4 a 5.6, pero no alteró su preferencia por el sustrato. TEM-3, originalmente reportada en 1989 fue la primera betalactamasa de tipo TEM que presentó el fenotipo BLEE9, 41. TEM-3 es codificada por el gen bla T-3 y mediante la secuenciación del mismo se encontró que ésta enzima difiere de TEM-2 en 2 posiciones: lisina (TEM-3) por glutamato (TEM-2) en el residuo 104 y serina (TEM-3) por glicina (TEM-2) en la posición 238 (numeración de aminoácidos de acuerdo al esquema de Ambler)9. Algunos residuos de aminoácidos son importantes para la producción del fenotipo BLEE cuando las sustituciones ocurren en esa posición. Éstas incluyen glutamato a lisina en la posición 104, arginina a serina o histidina en la posición 164, glicina a serina en la posición 238 y glutamato a lisina en la posición 240 (numeración de aminoácidos de acuerdo al esquema de Ambler)9, 71, 76. 30 El grupo más común de BLEEs aparte de las familias TEM y SHV es el denominado CTX-M que también pertenece a la clase molecular A y se caracteriza por una marcada actividad hidrolítica contra cefotaxima. Actualmente se conocen más de 40 enzimas CTX-M, siendo CTX-M-14, CTX- M-3 y CTX-M-2 las más encontradas8, 42. Otras BLEEs de clase A son menos comunes que las anteriores y se han encontrado principalmente en Pseudomonas aeruginosa aunque también en enterobacterias, en regiones geográficas limitadas. Algunos ejemplos son PER-1 encontrada en Turkia, Francia, e Italia; VEB-1 y VEB-2 en el sureste de Asia, y GES-1, GES-2 e IBC-2 en el sur de África, Francia y Grecia. BLEEs aisladas únicamente en enterobacterias y también poco comunes son BES-1, IBC-1, SFO-1 y TLA-1. Por su parte, las BLEEs de tipo OXA, pertenecen a la clase molecular D, son relativamente resistentes a la inhibición por ácido clavulánico y confieren resistencia a ceftazidima, aunque OXA-17 confiere mayor resistencia a cefotaxima y cefepima. Se encuentran principalmente en Pseudomonas aeruginosa2, 42. Las betalactamasas denominadas AmpC, forman parte de la clase molecular C, se caracterizan por ser inducibles por betalactámicos, resistentes a la inhibición por ácido clavulánico y por conferir resistencia a cefamicinas y oxiimino-betalactámicos. Están codificadas en genes cromosómicos en muchos bacilos gram-negativos y aunque el gen AmpC no se encuentra en el cromosoma de especies de Klebsiella y Salmonella enzimas AmpC se han encontrado mediadas por plásmidos42, 59. Las carbapenemasas, son betalactamasas que hidrolizan significativamente al menos imipenem y/o meropenem además de oxiimino- cefalosporinas y cefamicinas y pueden pertenecer a las clases moleculares A (NMC-A, Sme-1 a Sme-3, IMI-1, en Enterobacter cloacae y Serratia marcescens; KPC-1 en Klebsiella pneumoniae; GES-2 en Pseudomonas aeruginosa), B (familia IMP, encontradas en gram-negativos, y especies de Pseudomonas y Acinetobacter y VIM son las carbapenemasas más 31 significativas en la clínica) y D (oxacilinasas con propiedades de carbapenemasa, aisladas en Acinetobacter baumannii). Actualmente son poco comunes pero su capacidad de hidrolizar antibióticos carbapenémicos, a los cuales son sensibles otras betalactamasas, causa especial preocupación42, 53. En México se han llevado a cabo pocos estudios enfocados a la caracterización de BLEEs . Silva y col. en 1999 en un estudio llevado a cabo con Enterobacterias encontraron que cepas de K. pneumoniae, E. coli y Enterobacter cloacae presentaron resistencia a oxiimino cefalosporinas. Además observaron que solo las cepas de K. pneumoniae tenían la capacidad de transferir su resistencia por conjugación. De acuerdo al punto isoeléctrico y la hibridación de ADN tanto de las cepas aisladas como de las transconjugantes, se observó que las betalactamasas más frecuentes fueron derivadas de SHV74. En otro reporte realizado por Silva y col. en el 2000, se encontró que una cepa de E. coli la cual fue llamada R70 presentó resistencia a cefalosporinas de espectro extendido; esta E. coli posee tres plásmidos diferentes de 150 kb, 120 kb y 77 kb, los cuales codifican 2 betalactamasas con pI de 7.0 y 9.0. Sólo el plásmido de 150 kb fue transferido por conjugación y codifica una betalactamasa con pI de 9.0, la cual se denominó TLA-1 y no está relacionada con las enzimas TEM y SHV. En el 2001, Silva y col. encontraron en cepas de K. pneumoniae aisladas de un brote por IN en un hospital de Morelos, que los plásmidos que codifican la resistencia son de 135 kb , 105 kb y 80 kb. Mediante reacción encadena de la polimerasa (PCR por sus siglas en inglés) se obtuvo un fragmento de 900 pb que corresponde a SHV y otro fragmento de 503 pb correspondiente a TEM. Mediante la secuenciación del gen completo para SHV se observó una doble mutación: en la posición 238 glicina es sustituida por serina y glutamina es sustituida por lisina en la posición 240, en comparación con la secuencia de la betalactamasa SHV-175. En un estudio realizado en el Hospital General de México, por González- Vertiz y col., en el 2001 encontraron que cepas de K. pneumoniae multirresistentes aisladas de casos de bacteremia y productoras de BLEEs 32 estaban asociadas a un brote de IN en el área de neonatos de dicho hospital. Las cepas de K. pneumoniae identificadas, pertenecían a una misma clona, y eran resistentes a amikacina, gentamicina, ampicilina, cefotaxima y ceftazidima. Esta clona de K. pneumoniae era productora de dos betalactamasas con pI de 5.4 y 8.2, correspondiendo a ésta última la actividad de BLEE33. En otro estudio realizado por Martínez -Aguilar y col., en el 2001, sobre BLEEs producidas por aislados de K. pneumoniae multirresistentes, causantes de sepsis y neumonía en la unidad de cuidados intensivos de neonatos (UCIN) del Hospital General de Durango, se encontró por electroforesis de campos pulsados (PFGE por sus siglas en inglés) que siete aislados de K. pneumoniae resistentes a ceftazidima y cefotaxima correspondían a la misma clona, productora de dos betalactamasas con un pI de 5.4 y 9.0, correspondiendo a la última la actividad de ESBL. Los perfiles de plásmidos fueron idénticos, además de que el plásmido de 56.7 kb transfirió a E. coli la resistencia a ceftazidima por conjugación. En este estudio se apreció un elevado impacto en la mortalidad debido a la diseminación de las cepas multirresistentes de K. pneumoniae en la UCIN48. En el estudio de Alcántar-Curiel y col. de 2004 se analizaron 82 casos de bacteremia e infección del tracto urinario (60 y 40 % de los casos respectivamente) causados por K. pneumoniae en el Hospital General de Durango, en un periodo de 23 meses. El 49% de los episodios correspondía a la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales (UCIN). Se encontró que todos los aislados eran susceptibles a imipenem; 62.2% era resistente a ceftazidima, cefotaxima, y aztreonam; 69.5% era resistente a amikacina; 58.5% era resistente a gentamicina; y 7.3 % a ciprofloxacina. Los 82 aislados se asociaron a 28 patrones distintos por PFGE y la diseminación de 2 clonas resistentes a ceftazidima ocasionó el 44% de los casos. El fenotipo de BLEE en estas clonas fue transferido por megaplásmidos idénticos o altamenterelacionados. La actividad de BLEE correspondió a SHV-5 y TLA-1. La alta prevalencia del fenotipo BLEE en estas infecciones fue atribuida a la 33 transmisión cruzada de las dos clonas resistentes a ceftazidima y la diseminación horizontal de los megaplásmidos idénticos o altamente relacionados1. En la Tabla C se enlistan algunas BLEEs inhibidas por ácido clavulánico producidas por Klebsiella pneumoniae. 34 Tabla C. BLEEs inhibidas por ácido clavulánico producidas por K. pneumoniae Tasa relativa de hidrólisis a, b Enzima Producción Cepa PEN AMP CARB CLOX OXA LOR LOT FOX NCF TAX TAZ ATM IMP TEM-3 (CTX-1) pCFF04 CF104 100 110 35 0.97 5 120 31, 110c < 1 NDd 170,450c 8.3 0.36 0.01 TEM-5 (CAZ-1) pCFF14 CF504 100c 78 e 60 ND ND ND 380 ND ND 150 490 120 <0.1 TEM-8 (CAZ-2) pCFF34 CF704 100c 240e 75 ND ND ND 170 ND ND 640 260 210 <0.1 TEM-9 pMG228 2639Ef 100 51 19 8.7 ND 67 33 <0.05 ND 12 35 40 1.2 TEM-10 (MGH-1) pJPQ100 KC2 100 130 36 16 ND 77 18 <0.05 ND 1.6 68 10 <0.02 TEM-11 (CAZ-lo) P 2326 ND ND ND ND ND 100g,h ND <0.5 ND 2.5 0.9 <0.5 ND TEM-16 (CAZ-7) pCFF84 CF1304 100c ND ND ND ND ND ND ND ND 9.8 98 28 ND TEM-20 pUD30 A268 100c 150 12 i 2 ND 150 ND ND ND 250 <1 <1 <1 TEM-21 pUD22 D660 100c 66 13 i 1 ND 290 ND ND ND 493 57 <1 <1 TEM-22 pSLH52 SLK52 100c 97 e 16 1 2 410 ND <0.5 ND 130 10 <0.05 <0.5 TEM-24 (CAZ-6) pCFF74 CF1104 100c ND ND ND ND ND ND ND ND 208 848 134 ND TEM-26 (YOU-1) pJPQ101 KPS1 100 ND 32 18 ND 120 ND ND ND 7.5 170 49 ND SHV-3 pUD21 86-4 100c 153 21 <1 ND 250 ND ND ND 37 <1 <1 <1 SHV-4 (CAZ-5) p210-2 Kp210-2 100c 195 35 i ND ND 320c 200 ND ND 115 52 4 <1 SHV-5 (CAZ-4) pAFF1,pCFF54 160(CF3104) 100 242 31c 9 c 10g 140g 180c ,43g ND ND 134c,25g 49c,11g 2 <1 SHV-6 pSLH47 SLK-47 100c 52 8 i <1 ND 80 ND ND ND 1 0.09 0.3 ND a Abreviaturas: LOR, cefaloridina; LOT, cefalotina; PEN, bencilpenicilina; AMP, ampicilina; CARB, carbenicilina; CLOX, cloxacilina; OXA, oxacilina; FOX, cefoxitina; NCF, nitrocefina; TAX, cefotaxima; TAZ, ceftazidima; ATM, aztreonam; IMP, imipenem; CA, ácido clavulánico; SUL, sulbactam; TZI, tazobactam; pCMB, p- cloromercuribenzoato ; P, plásmido; IC50 concentración inhibitoria 50. b Los ensayos se llevaron a cabo espectrofotométricamente y los datos son reportados como Vmáx relativa a menos que se señale lo contrario. c Ensayo microacidimétrico d No determinado e Amoxicilina f La enzima para la hidrólisis fue purificada de la transconjugante E. coli 2639E g concentración de sustrato 100 µM h El sustrato de referencia fue cefaloridina i Ticarcilina 35 Tabla C. continuación IC50 para inhibición (µM) Inhibida por Enzima Producción Cepa CA SUL TZB ATM CLOX pCMB EDTA Peso molecular (kDa) pI Clase molecular TEM-3 (CTX-1) pCFF04 CF104 0.03 0.03 0.01 18j < 100 - ND 29 6.3 A TEM-5 (CAZ-1) pCFF14 CF504 0.03 1.2 0.28 100j ND + - 29 5.55 A TEM-8 (CAZ-2) pCFF34 CF704 + k + k + k 62j ND ND ND 29 6.0 A TEM-9 pMG228 2639Ef 0.29 0.90 0.34 ND ND + - 29 5.59 A TEM-10 (MGH-1) pJPQ100 KC2 0.03 0.34 0.08 30j ND + - 29 5.57 A TEM-11 (CAZ-lo) P 2326 + k + k ND ND ND ND ND 29 5.6 Al TEM-16 (CAZ-7) pCFF84 CF1304 + + + 31j ND ND ND ND 6.3 A TEM-20 pUD30 A268 < 5 + ND ND <1000 ND ND ND 5.4 Al TEM-21 pUD22 D660 < 50 + ND ND <1000 ND ND ND 6.4 Al TEM-22 pSLH52 SLK52 <0.05 >1 ND 38 <100 ND ND 29 6.3 A TEM-24 (CAZ-6) pCFF74 CF1104 + + + 29j ND ND ND 29 6.50 A TEM-26 (YOU-1) pJPQ101 KPS1 0.01 0.35 0.08 89j 30j ND ND 29 5.58 A SHV-3 pUD21 86-4 0.04 2.7 0.10 ND >1000 ND ND 29 7.0 A SHV-4 (CAZ-5) p210-2 Kp210-2 0.03m 0.14m + k 1.1j ND ND ND 29 7.8 A SHV-5 (CAZ-4) pAFF1,pCFF54 160(CF3104) 0.01 0.63 0.08 0.02m ND ND ND ND 8.2 A SHV-6 pSLH47 SLK-47 <1 1 ND ND >1000 ND ND ND 7.6 ND j Km k El inhibidor restauró la actividad de la cefalosporina o penicilina en ensayos microbiológicos l Clase molecular identificada por oligotipificación m Ki Tomado de Bush K., Jacoby G.A. & Medeiros A.A . (1995) A Functional Classification Squeme for β-lactamases and its correlation with molecular structure .Antimicrob. Agents Chemother. 39, 1211-1233. 36 2. ANTECEDENTES En trabajos previos realizados en el laboratorio donde se desarrolló la presente tesis, con el objetivo de asociar el impacto clínico y los datos epidemiológicos en relación a la prevalencia de la resistencia a cefalosporinas de tercera generación en K. pneumoniae asociada a infecciones nosocomiales, se analizaron aislados provenientes de tres centros hospitalarios: Hospital General de Durango, Hospital Civil de Guadalajara y Hospital de Pediatría del CMN Siglo XXI. Se estudiaron 82 aislamientos de K. pneumoniae causantes de IN provenientes del Hospital General de Durango obtenidos de abril de 2000 a febrero de 2002. El patrón de susceptibilidad encontrado fue 100% de resistencia a ampicilina (AMP), 69.5% a amikacina (AMK), 62.2% a aztreonam (AZM), ceftazidima (CAZ) y cefotaxima (CTX). Mediante electroforesis de campos pulsados (PFGE) se identificaron 28 clonas de K. pneumoniae. Las cepas resistentes a ceftazidima (CAZR) pertenecían a 17 clonas, todas productoras de BLEEs. Las clonas CAZR se identificaron predominantemente en las áreas pediátricas y particularmente en la Unidad de Cuidados Intensivos Neonatales (UCIN). El 60 % de los aislamientos se obtuvieron de hemocultivos y el 40% de urocultivos1. En el Hospital Civil de Guadalajara se llevó a cabo el mismo estudio; se aislaron 168 cepas de K. pneumoniae causantes de IN; éstas presentaron 100% de resistencia a AMP, 73.8% a AMK, 75.59% a CTX y 74.4% a CAZ. Mediante PFGE se encontraron 59 clonas de K. pneumoniae. Las cepas CAZR pertenecían a 25 clonas, con predominio de 3 clonas y provenían también principalmente de las áreas pediátricas, particularmente la UCINEX. La fuente de aislamiento fue hemocultivo en el 36.3% de los casos, el resto provenía de distintas fuentes. En el Hospital de Pediatría del CMN Siglo XXI fueron aisladas 80 cepas de K. pneumoniae en un periodo de 8 meses, con un patrón de susceptibilidad de 100% de resistencia a AMP, 69% a AMK, 56% a CTX y 76% a CAZ. Se 37 identificaron 49 clonas por PFGE de las cuales 22 correspondían a cepas CAZR. El 28.8% de los aislamientos provenía de hemocultivos. La UCIN y la sala de lactantes fueron las más afectadas por IN24. La gran diversidad clonal sugería la probabilidad de que el fenotipo de resistencia a cefalosporinas se hubiera diseminado de manera horizontal por plásmidos. En los hospitales de Guadalajara y Durango se observó variabilidad clonal de las K. pneumoniae CAZR causantes de IN, con predominio de diseminación clonal, implicando la necesidad de reforzar los programas de precauciones universales de contacto, y el establecimiento urgente de un programa de control de antibióticos. Por otro lado, en el Hospital de Pediatría del CMN Siglo XXI no hubo predominio de diseminación clonal, lo que sugiere infección endógena. Una vez demostrada la frecuencia de resistencia a CAZ en cepas de K. pneumoniae causantes de IN y su posible ruta de diseminación, se realizó un estudio con el objetivo de caracterizar molecularmente a las betalactamasas de espectro extendido producidas por las clonas de K. pneumoniae resistentes a CAZ aisladas con más frecuencia como causantes de infecciones nosocomiales (clonas tipo) en cada uno de los centros hospitalarios ya mencionados para poder asociar el mecanismo molecular de resistencia de las clonas CAZR a los datos clínicos y epidemiológicos. En este estudio, se encontró mediante la prueba de E-test (AB BIODISK) que todas las clonas tipo de los tres centros hospitalarios son productoras de BLEEs y que la resistencia a cefalosporinas de tercera generación (CAZ) era transferida a E. coli (ATCC J53-2 resistente a Rifampicina) por conjugación en un plásmido con un tamaño >50 kb y <100kb. Así mismo, se observó que todas las E. coli transconjugantes son productoras de BLEEs, y la actividad biológica de estas últimas se asocia al pI de 8.2 en los casos del Hospital Civil de Guadalajara y Hospital de Pediatría del CMN Siglo XXI y a los pI de 8.2 y 9.0 para el Hospital General de Durango. Los genes asociados en la producción de BLEEs son de tipo TEM, SHV-5 y probablemente TLA-1. Según se encontró mediante 38 reacción en cadena de la polimerasa, PCR por sus siglas en inglés (manuscrito en preparación). La cepa 468, identificada mediante pruebas bioquímicas como Klebsiella pneumoniae fue aislada de un caso de bacteremia nosocomial el 13 de julio de 2000 en el Hospital Civil de Guadalajara; pertenece a la clona G18 y es una de las clonas tipo empleadas en el estudio anterior. Los perfiles de susceptibilidad a antibióticos por el método de Kirby-Bauer tanto de la cepa original como de la transconjugante son los reportados en la tabla D. Tabla D. Perfil de susceptibilidad a antibióticos de la cepa 468 y su transconjugante . Antibiótico 468 (G18) 468 TR Kirby- Bauer (mm) Categoría MIC (µg/mL) Kirby- Bauer (mm) Categoría MIC (µg/mL) Ampicilina 8 R 37 6 R >46 Amikacina 20 S 5.1 24 S 1.5 Aztreonam 12 R >58 6 R >58 Ceftazidima 13 R 41 6 R >126 Ciprofloxacino 31 S <0.11 27 S 0.19 Cefotaxima 16 I 19 14 R 31 Cefuroxima 12 R >8.0 6 R >8.0 Cefepime 22 S 4.3 18 S 9.8 Cefoxitina 15 I 20 26 S 4.0 Gatifloxacino 10 R >6.0 27 S 0.25 Gentamicina 16 S 4.5 15 S 0.6 Imipenem 21 S 2.1 31 S <0.56 Levofloxacino 17 S 4.0 30 S 0.125 Tobramicina 6 R >48 13 I 10 Ofloxacino 11 R 6.0 25 S 0.25 Estreptomicina 6 R >96 16 S 10 Trimetoprim-sulfametoxazol 7 R >256 33 S <6.0 Ticarcilina-ácido clavulánico 18 I 32 15 I 58 Tetraciclina 7 R >48 22 S 4.0 Piperacilina-Tazobactam 17 R 64 21 S 16 De acuerdo a lo mencionado previamente, tanto la clona original G18 como su transconjugante son productoras de BLEEs cuya actividad biológica fue asociada al pI de 8.2 en ambos casos de acuerdo a bioensayo de hidrólisis de CAZ sobre el gel de isoelectroenfoque. En este último, también se observó la presencia de otras betalactamasas con pI 5.4, 6.0, y 7.5 en la clona original, y 39 pI 5.4 y 6.0 en la transconjugante. En la técnica de PCR tanto la clona original como la transconjugante amplificaron para los genes blaSHV , blaSHV-5 y blaTEM. La betalactamasa con pI 8.2 corresponde a SHV-5, mientras que la de 5.4 podría pertenecer al tipo TEM. Con los estudios realizados, no se puede precisar aún a que tipo de betalactamasas corresponden las enzimas con pI 6.0 y 7.5. 40 3. JUSTIFICACIÓN La incidencia de Klebsiella pneumoniae productora de BLEEs es un grave problema que afecta a muchos hospitales en todo el mundo incluido México, a partir de la década de los 80 y poco después de la introducción de las oxiimino cefalosporinas, que llegaron a ser ampliamente utilizadas. Desde entonces, el incremento en la resistencia a cefalosporinas de tercera y cuarta generación es un obstáculo para el control de las infecciones nosocomiales así como comunitarias causadas por Klebsiella pneumoniae productora de BLEEs. En México, se han realizado pocos estudios enfocados a la caracterización de estas enzimas. La determinación de las características bioquímicas y moleculares de una betalactamasa con pI 6.0 producida por Klebsiella pneumoniae, aislada en el Hospital Civil de Guadalajara y asociada a bacteremia nosocomial en dicho centro de salud, es una contribución que permitirá ampliar el conocimiento que se tiene acerca de la prevalencia y el tipo de betalactamasas en nuestro país; lo que permitirá establecer las opciones terapéuticas más viables de cara al grave problema de la resistencia a antimicrobianos, así como subrayar la necesidad de establecer programas de prevención y control de infecciones intrahospitalarias más eficientes. 41 4. OBJETIVOS 4.1 Objetivo general Caracterizar bioquímica y molecularmente una betalactamasa con pI 6.0 producida por una cepa de Klebsiella pneumoniae resistente a ceftazidima (CAZR) (cepa 468, clona G18), que fue aislada en el Hospital Civil de Guadalajara procedente de un caso de bacteremia nosocomial. 4.2 Objetivos particulares a) Confirmar el punto isoeléctrico (pI) de las betalactamasas producidas por la cepa de Klebsiella pneumoniae resistente a ceftazidima (CAZR), así como de aquellas presentes en la cepa de E. coli transconjugante (CAZR/RIFR). b) Purificar a la betalactamasa con pI 6.0 presente en la cepa transconjugante mediante técnicas de cromatografía de exclusión por tamaño y de intercambio iónico. c) Determinar el peso molecular de la betalactamasa con pI 6.0 purificada. d) Evaluar espectrofotométricamente la actividad hidrolítica de la betalactamasa purificada contra los antibióticos betalactámicos bencilpenicilina, ceftazidima, cefotaxima e imipenem. e) Determinar por PCR y secuenciación el tipo de betalactamasa al que corresponde la enzima purificada (pI 6.0). 42 5. MATERIALES Y MÉTODOS 5.1 Diseño experimental Escherichia coli ATCC J53-2 (CAZR/RIFR) transconjugante (468TR) de la cepa de K. pneumoniae resistente a ceftazidima (CAZR), (468, clona G18). Determinar el punto isoeléctrico de las betalactamasas presentes en la cepa 468, así como de las que se encuentren en la cepa transconjugante 468 TR; determinar por bioensayo de hidrólisis de CAZ la actividad de BLEEs de las enzimas. Aplicar el precipitado a una columna de cromatografía de exclusión por tamaño. Obtener el extracto crudo de la cepa transconjugante. Determinación de proteínas en el extracto crudo mediante el método de Bradford. Precipitación de proteínas en el extracto crudo con sulfato de amonio al 40 y 80%. Determinación de proteínas en el precipitado. Detección de la actividad de betalactamasa en las fracciones obtenidas empleando nitrocefina, mezclar todas aquellas fracciones con esta actividad. Concentración por ultrafiltración de la mezcla de fracciones con actividad de betalactamasa. Determinación de proteínas de la mezcla concentrada. Aplicar la mezcla concentrada a una columna de cromatografía de intercambio iónico. Detección de la actividad de betalactamasa en las fracciones obtenidas empleando nitrocefina. 43 Determinación del punto isoeléctrico de las betalactamasas purificadas. Evaluar espectrofotométricamente la hidrólisis de los sustratos: bencilpenicilina, ceftazidima, cefotaxima e imipenem, empleando las betalactamasas purificadas. Determinación de la masa molecular relativa de las betalactamasas purificadas mediante electroforesis en gel desnaturalizante. Mezclar las fracciones que contienen a la misma betalactamasa. Determinación de proteínas de la mezcla. Determinar mediante PCR y secuenciación el tipo de betalactamasa al que corresponde la enzima purificada con pI 6.0 Confirmación de punto isoeléctrico y masa molecular relativa en un gel de electroforesis en dos dimensiones. 44 5.2 Cepas Bacterianas Se utilizaron las siguientes cepas: K. pneumoniae resistente a ceftazidima (CAZR), aislada de un caso de bacteremia nosocomial en el Hospital Civil de Guadalajara (cepa 468, clona G18). Escherichia coli ATCC J53-2 resistente a ceftazidima y rifampicina (CAZR/RIFR) transconjugante de la cepa anterior (468 TR). Escherichia coli ATCC J53-2 resistente a rifampicina (RIFR). 5.3 Punto isoeléctrico El punto isoeléctrico fue determinado de acuerdo al método descrito por Matthew50, que consistió en crecer la cepas bacterianas (468y 468 TR) en 5 mL de caldo LB suplementado con CAZ 10 µg/mL o RIF 200 µg/mL /CAZ 10 µg/mL e incubar a 37 °C durante 16-18 horas; posteriormente se centrifugó a 13 000 rpm durante 2 minutos, se eliminó el sobrenadante y el paquete celular se resuspendió en 1 mL de solución amortiguadora de fosfatos (PBS) 0.1 M pH 7.4. Las células fueron lisadas mediante sonicación en hielo en un equipo Vibra cell Sonics aplicando 2 ciclos de 15 pulsos cada uno por 30 s hasta que el sobrenadante se aclaró centrifugándose nuevamente a 13 000 rpm por 30 minutos a 4 ° C. Una alícuota del sobrenadante anterior y los controles positivos TEM-1 (pI 5.4), SHV-3 (pI 7.0), SHV-4 (pI 7.8), SHV –5 (pI 8.2) , TLA- 1 (pI 9.0) así como un marcador preteñido con pI de 4.45-9.6 (IEF Standars BIO- RAD) se corrieron en geles de poliacrilamida (PhastGel TM IEF 3-9 de Amersham Pharmacia Biotech AB) impregnados de anfolinas con rangos de pH 3-9 en un equipo de PhastSystem (Pharmacia Biotech). También se determinó el punto isoeléctrico de las betalactamasas purificadas. Para determinar la actividad de betalactamasa de las proteínas se utilizó el antibiótico nitrocefina (500 µg/mL), el cual al ser hidrolizado por las 45 betalactamasas da una señal colorimétrica, por lo que se adicionó sobre el gel de IEF, revelando únicamente el pI de las proteínas con actividad de betalactamasa. Para revelar un gel se añadieron 500 µL de una mezcla nitrocefina (500 µg/mL)/ CAZ (5 µg/mL). El antibiótico, se agregó para llevar a cabo la prueba biológica señalada a continuación. 5.4 Prueba biológica de hidrólisis de CAZ. Se realizó una prueba biológica de hidrólisis de CAZ sobre los geles de IEF, que consistió en crecer a E. coli J53-2 RIFR en 4 mL de medio LB adicionado de rifampicina 200 µg/mL, se incubó a 37 ° C durante 2-4 h, para garantizar que se tenía esta cepa en fase de crecimiento logarítmico se realizaron lecturas de absorbencia en espectrofotómetro a 600 nm permitiéndose el crecimiento del cultivo hasta obtener una lectura de entre 0.40-0.45; posteriormente se tomaron 400 µL de este cultivo y se adicionaron a 3 mL agar LB suave mantenido líquido a 50 °C que se virtió sobre el gel de IEF. El gel se incubó a 37 °C durante 16-18 h. Un resultado positivo se interpretó a través del crecimiento de la cepa señalada sobre la superficie de agar de IEF, debido a la hidrólisis de CAZ, lo cual determinó si las betalactamasas en estudio presentaban actividad de BLEEs75. 5.5 Obtención del extracto crudo La cepa de Escherichia coli ATCC J53-2 resistente a ceftazidima y rifampicina (CAZR/RIFR) transconjugante (468 TR) se sembró en 3 L de medio BHI adicionado con CAZ (10 µg/mL ) y se incubó a 37 °C por 16-18 h. Posteriormente, la suspensión bacteriana se centrifugó a 5000 x g por 30 min, se eliminó el sobrenadante y el paquete celular fue lavado una vez con solución amortiguadora de fosfatos (PBS) 0.05 M pH 7.0, se centrifugó 46 nuevamente a 5000 x g por 30 min, y se resuspendió en ~20 mL de PBS 0.05 M pH 7.0, para después lisar las células empleando una prensa de French (SIM-AMINCO Spectronic Instruments) a 1500 psi; el extracto lisado fue centrifugado por 1 h a 48 000 x g a 4 ° C. Los ácidos nucleicos fueron removidos por precipitación con espermina (Sigma) 0.2 M (7% vol/vol) toda la noche a 4 °C y ultracentrifugación a 100 000 x g por 1 h a 4 ° C. El extracto obtenido fue conservado a –70 ° C para su utilización posterior29, 39, 61, 69. 5.6 Purificación de la betalactamasa con pI 6.0 El extracto crudo fue sometido a precipitación con sulfato de amonio al 40% en hielo, centrifugado a 10 000 rpm por 10 min a 4 ° C y el precipitado obtenido resuspendido en 0.5 mL de solución amortiguadora de fosfatos 0.05 M pH 7.0. Al sobrenadante, (en el cual se detectó la actividad de betalactamasa empleando una solución de nitrocefina 500 µg/mL )se le añadió la cantidad necesaria de sulfato de amonio para ir del 40 al 80% de saturación en hielo, se centrifugó a 10 000 rpm por 10 min a 4 ° C y el precipitado fue resuspendido en 1 mL de solución amortiguadora de fosfatos 0.05 M pH 7.0. El precipitado anterior, en el cual se detectó la actividad de betalactamasa empleando una solución de nitrocefina 500 µg/mL fue aplicado a una columna Superdex 75 (10 x 300 mm; Pharmacia Biotech) preequilibrada con solución amortiguadora de fosfatos 0.05 M pH 7.0. Las fracciones que presentaron actividad de betalactamasa, detectada con nitrocefina fueron mezcladas y concentradas por ultrafiltración con membranas Centriprep-10 (Amicon), para ser aplicadas posteriormente a una columna Mono-Q (0.5 x 5 cm; Pharmacia Biotech) preequilibrada con trietanolamina 0.02 M pH 7.7; las proteínas fueron eluidas con un gradiente lineal de NaCl (0-1 M). La detección de la actividad de betalactamasa en las fracciones obtenidas se llevó a cabo de la manera ya señalada72. 47 5.7 Determinación de la masa molecular relativa La masa molecular relativa de la betalactamasa con pI 6.0 fue estimada mediante electroforesis en gel de poliacrilamida 12% - dodecil sulfato de sodio (SDS-PAGE). Los extractos enzimáticos y las proteínas marcadoras fueron calentadas a 80 ° C durante 10 min en una solución 1% SDS – 3% beta- mercaptoetanol, sometidas a la electroforesis y reveladas posteriormente mediante tinción con azul de Coomasie61, 73. 5.8 Determinación de proteínas La determinación de proteínas en las muestras se llevó a cabo empleando el sistema Bio-Rad Protein Assay en microplaca que se basa en el método de Bradford, de acuerdo a las instrucciones del fabricante, por triplicado. Se realizó una curva patrón de albúmina sérica bovina (Sigma) a partir de una solución de 1 mg/mL, incluyendo las siguientes concentraciones: 0.05, 0.1, 0.2, 0.25 y 0.3 mg/mL. Las lecturas de absorbencia se efectuaron con un equipo Microplate reader Thermo max, Molecular Devices a una longitud de onda de 595 nm. 5.9 Electroforesis en dos dimensiones Esta técnica fue realizada de acuerdo a lo reportado por O’Farrell54. Inicialmente se llevó a cabo el corrimiento en una primera dimensión, para lo cual se preparó un gel de isoelectroenfoque en un tubo de vidrio de 130 x 2.5 mm de diámetro interno sellado en la parte inferior con parafilm. Para preparar 10 mL de gel se mezclaron 5.5 g de urea, 1.33 mL de solución de acrilamida 30 % (28.38% (m/v) acrilamida y 1.62% bis-acrilamida), 2 mL de solución de NP-40 al 10% m/v en agua, 1.97 mL de agua + 0.4 mL de anfolinas con un 48 rango de pH de 5-7 + 0.1 mL de anfolinas de pH 3-10. Se agitó hasta disolver la urea, entonces se añadieron 10 µL de persulfato de amonio al 10% y 7 µL de TEMED. Inmediatamente el tubo fue llenado 11 cm con la mezcla anterior, empleando una jeringa. En la parte superior del gel se agregó solución de urea 8 M, dejándose de 1 a 2 h, después esta solución se removió y se reemplazó con 20 µL de solución amortiguadora de lisis, que contiene urea 9.5 M, 2% (m/v) NP-40 y 2% de una mezcla de anfolinas (1.6% rango de pH 5 a 7 y 0.4% rango de pH 3-10) y encima de ésta una pequeña cantidad de agua. Se dejó reposar de 1-2 h más. Posteriormente el parafilm fue removido, así como el agua y la solución de lisis, añadiéndose 20 µL de esta última fresca y NaOH 0.02 M hasta formar un menisco invertido. A continuación el gel fue colocado en una cámara de electroforesis cuyo reservorio inferior fue llenado con H3PO4 0.01 M, y el superior con NaOH 0.02 M. El gel fue precorrido a 200 V por 15 min, a 300 V por 30 min y a 400 V durante 30 min. Después, tanto la solución amortiguadora de lisis como el NaOH fueron removidos de la superficie del gel y reemplazados primero con solución amortiguadora de lisis, después 50 µL de la solución de enzima purificada y 2 µL de solución de
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