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INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL CENTRO DE INVESTIGACIÓN EN BIOTECNOLOGÍA APLICADA DESARROLLO DE UN BIOFERTILIZANTE DE RIZOBACTERIAS TOLERANTES A AGROQUÍMICOS Y SU EVALUACIÓN EN INVERNADERO TESIS QUE PARA OPTENER EL GRADO DE MAESTRO EN CIENCIAS EN BIOTECNOLOGÍA APLICADA PRESENTA ALVARO RICARDO ESCALANTE SANSORES TEPETITLA DE LARDIZABAL, TLAXCALA, ENERO, 2018 AGRADECIMIENTOS AGRADECIMIENTOS A la M.C. Lilia Tapia, al Dr. Erik Ocaranza, y a la Dra. Myrna Solís, por permitirme ser parte del presente proyecto, así como de sus enseñanzas, y el apoyo que me brindaron durante toda la maestría. A los miembros de mi comité revisor, la Dra. Flor de Fátima Rosas, y al Dr. Eric López, por su tiempo y ayuda durante la realización del proyecto. A mis compañeros de laboratorio por su apoyo y ayuda brindada dentro del laboratorio. Al consejo nacional de ciencia y tecnología (CONACyT) por la beca otorgada para la realización de mis estudios de maestría. Al programa institucional de formación de investigadores (PIFI) del Instituto Politécnico Nacional, por el apoyo económico brindado a lo largo de la maestría. A Rita Karen, por su incondicional ayuda y por compartir esta experiencia juntos. A mi madre y hermana por su apoyo y confianza en mí. A la memoria de mi Padre. RESUMEN ........................................................................................................................................................................... 8 ABSTRACT ......................................................................................................................................................................... 9 1. INTRODUCCIÓN ..................................................................................................................................................... 10 2. MARCO TEÓRICO .................................................................................................................................................. 11 2.1. BIOESTIMULANTES VEGETALES ........................................................................................................ 11 2.2. RIZOBACTERIAS PROMOTORAS DE CRECIMIENTO VEGETAL .................................................. 13 2.1.1. Mecanismos de acción de las PGPR ............................................................................................ 15 2.3. BIOFERTILIZANTES ................................................................................................................................. 20 3 JUSTIFICACIÓN ...................................................................................................................................................... 24 4 OBJETIVOS ............................................................................................................................................................ 25 4.1 OBJETIVO GENERAL .............................................................................................................................. 25 4.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS .................................................................................................................... 25 5 METODOLOGÍA ...................................................................................................................................................... 26 5.1 MEDIOS DE CULTIVO ............................................................................................................................. 26 5.2 CONSERVACIÓN DE CEPAS BACTERIANAS .................................................................................... 26 5.3 ENSAYO DE GERMINACIÓN ................................................................................................................. 27 5.4 SOLUBILIZACIÓN DE FOSFATOS ........................................................................................................ 28 5.5 DETERMINACIÓN DE FITORREGULADORES ................................................................................... 29 5.6 EVALUACION DE LA TOLERANCIA A AGROQUÍMICOS ................................................................. 30 5.7 ACTIVIDAD ANTAGONISTA CONTRA Streptomyces sp ................................................................... 31 5.8 EVALUACIÓN DE LAS BACTERIAS EN INVERNADERO ................................................................. 33 5.8.1 Cultivo de Papa (Solanum tuberosum) ......................................................................................... 33 5.8.2 Cultivo de Jitomate (Solanum lycopersicum) ............................................................................... 35 5.9 EVALUACIÓN DE CRECIMIENTO BACTERIANO EN DIFERENTES MEDIOS DE CULTIVO .... 36 5.10 EVALUACIÓN DE DIFERENTES SOPORTES Y SU VIABILIDAD EN ALMACENAMIENTO ....... 37 5.11 ANÁLISIS ESTADÍSTICOS ...................................................................................................................... 38 6 RESULTADOS ........................................................................................................................................................ 39 6.1 ENSAYO DE GERMINACIÓN ................................................................................................................. 39 6.2 SOLUBILIZACIÓN DE FOSFATOS ........................................................................................................ 40 6.3 DETERMINACIÓN DE FITORREGULADORES ................................................................................... 43 6.4 EVALUACION DE LA TOLERANCIA A AGROQUÍMICOS ................................................................. 47 6.5 ACTIVIDAD ANTAGONISTA CONTRA Streptomyces sp ................................................................... 48 6.6 EVALUACIÓN DE LAS BACTERIAS EN INVERNADERO ................................................................. 49 6.6.1 Papa (Solanum tuberosum) ................................................................................................................. 49 6.6.2 Cultivo de Jitomate (Solanum lycopersicum) .................................................................................... 56 6.7 EVALUACIÓN DE CRECIMIENTO BACTERIANO EN DIFERENTES MEDIOS DE CULTIVO .... 59 6.8 EVALUACIÓN DE DIFERENTES SOPORTES Y SU VIABILIDAD EN ALMACENAMIENTO ................................. 62 7 CONCLUSIONES .................................................................................................................................................... 65 8 REFERENCIAS ....................................................................................................................................................... 66 ÍNDICE DE TABLAS Tabla 1. Dosis recomendada por los fabricantes de los siete agroquímicos empleados en la evaluación in vitro de la resistencia a agroquímicos ............................................................................................................. 31 Tabla 2. Notación de los tratamientos en el cultivo de papa ........................................................................... 34 Tabla 3. Resultados de ensayo de germinación (Índice de vigor relativo) ...................................................... 39 Tabla 4. Índice de solubilización de fosfatos (PSI) .......................................................................................... 41 Tabla 5. Cuantificación de fitohormonas por HPLC ........................................................................................ 45 Tabla 6. Tolerancia a agroquímicos de las cepas aisladas ............................................................................. 47 Tabla 7. Inhibición de Streptomyces ............................................................................................................... 48 Tabla 8. Resultados al día 15 del experimentoen Papa ................................................................................. 50 Tabla 9. Resultados al día 50 del experimento en Papa ................................................................................. 51 Tabla 10. Resultados al día 70 del experimento en Papa ............................................................................... 53 Tabla 11. Resultados del muestro al día 45. ................................................................................................... 56 Tabla 12. Resultados del muestro al día 90 .................................................................................................... 57 Tabla 13. Crecimiento bacteriano en medio con digestato ............................................................................. 60 Tabla 14. Crecimiento bacteriano en medio con lixiviado ............................................................................... 60 Tabla 15. Composición elemental del lixiviado y digestato ............................................................................. 61 Tabla 16. Crecimiento bacteriano en la suspensión inicial .............................................................................. 62 Tabla 17. Supervivencia después del secado ................................................................................................. 62 ÍNDICE DE FIGURAS Figura 1. Ensayo de antagonismo contra Streptomyces sp ............................................................................ 32 Figura 2. Distribución de los tratamientos aplicados en el experimento en papa ............................................ 34 Figura 3. Ensayo de germinación de semillas de jitomate inoculadas con rizobacterias in vitro ..................... 40 Figura 4. Solubilización de fósforo inorgánico en medio NBRIP ..................................................................... 42 Figura 5. TLC de los extractos bacterianos en luz UV de onda corta (254 nm) .............................................. 43 Figura 6. Revelado de TLC con ácido sulfúrico 5% y luz UV de onda larga (365 nm) .................................... 44 Figura 7. Curvas de calibración y cromatogramas de AIA, GA y Kinetina ...................................................... 45 Figura 8. Streptomyces sp. aislado de papa ................................................................................................... 48 Figura 9. Peso y longitud de plantas al día 15 ................................................................................................ 50 Figura 10. Peso y longitud de plantas al día 50 .............................................................................................. 52 Figura 11.Peso y longitud de plantas al día 70 ............................................................................................... 53 Figura 12. Rendimiento de papa por planta en invernadero ........................................................................... 54 Figura 13. Cinética de crecimiento de experimento en papa .......................................................................... 55 Figura 14. Peso fresco y seco de frutos .......................................................................................................... 58 Figura 15. Gráfica de vida de anaquel ............................................................................................................ 64 RESUMEN Como resultado de uso de agroquímicos, en partículas plaguicidas, la contaminación actual del suelo es un problema de gran preocupación. Una cantidad considerable de los plaguicidas terminan en el suelo, lo que resulta en efectos dañinos a otros organismos no blanco, incluyendo a los microrganismos del suelo. Los plaguicidas que permanecen afectan de manera adversa la estructura composición, y actividades metabólicas de las comunidades microbianas, estos cambios conllevan a la pérdida de fertilidad y sustentabilidad de los campos agrícolas. Una alternativa ha sido el uso de rizobacterias benéficas conocidas como PGPR, por sus siglas en inglés (Plant growth promoting rhizobacteria), como inoculantes. Las PGPR’s pueden facilitar el crecimiento vegetal a través de diversos mecanismos; fijación de nitrógeno, solubilización de fósforo, producción de diversos compuestos como sideróforos, fitohormonas y antibióticos. Las rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal resistentes o tolerantes a agroquímicos podrían ser integradas a las prácticas agrícolas convencionales, manteniendo su efecto en el incremento del rendimiento de los cultivos. En este trabajo se aislaron 118 rizobacterias que crecieron en presencia plaguicidas a diferentes concentraciones. Posteriormente se evaluó su efecto en semillas de jitomate y se observó que 4 rizobacterias promovían el crecimiento, los cuales fueron seleccionadas. A continuación, se evaluó en los microrganismos la capacidad de solubilizar fósforo inorgánico, producir ácido indol acético, ácido giberélico y kinetina, además se evaluó su capacidad antagonista contra Streptomyces in vitro. Con la finalidad de evaluar el efecto de las rizobacterias en las plantas se efectuaron dos experimentos en invernadero. En uno de ellos se inocularon papas y se observó que la cepa 3 y 4 incrementaban el rendimiento de papa. En el segundo experimento se inocularon semillas de jitomate y después de 70 días se registró un incremento en el peso seco de los frutos de las plantas inoculadas con la cepa 1. Se desarrollaron tres presentaciones diferentes (líquido, soporte sólido y encapsulado), y se evaluó su vida de anaquel, probando que las presentaciones líquidas y el soporte sólido fue capaz de mantener las células viables a concentraciones mayores a 8 log durante 90 días. ABSTRACT Because of the use of agrochemicals, particularly pesticides, the current contamination of the soil is a problem of great concern. A considerable amount of the pesticides ends up in the soil, which results in harmful effects to other non- target organisms, including soil microorganisms. The pesticides that remain, adversely affect the composition, structure and metabolic activities of the microbial communities, these changes lead to the loss of fertility and sustainability of agricultural fields. A recent alternative is the use of beneficial rhizobacteria known as PGPR (Plant growth promoting rhizobacteria), as inoculants. PGPR's can facilitate plant growth through various mechanisms; nitrogen fixation, phosphorus solubilization, production of various compounds such as siderophores, phytohormones and antibiotics. The pesticide resistant or tolerant PGPR could be integrated into conventional agricultural practices, maintaining its effect on increasing crop yields. In this work, 118 rhizobacteria that grew in the presence of pesticides at different concentrations were isolated. Subsequently, its effect on tomato seeds was evaluated and it was observed that 4 rhizobacteria promoted growth, which were selected. Next, the ability to solubilize inorganic phosphorus, produce indole acetic acid, gibberellic acid and kinetin was evaluated in the microorganisms, and its antagonistic use against Streptomyces in vitro was evaluated. In order to evaluate the effect of rhizobacteria on the plants, two greenhouse experiments were carried out. In one of them potatoes were inoculated, and it was observed that strain 3 and 4 increased potato yield. In the second experiment, tomato seeds were inoculated and after 70 days an increase in the dry weight of the fruits of the plants inoculated with strain 1 was registered. Three different presentations were developed (liquid, solid support and encapsulation), and their shelf life was evaluated, proving that liquid presentations and solid support was able to keep viable cells at concentrations greater than 8 logs for 90 days.1. INTRODUCCIÓN En las últimas décadas el aumento sostenido de la población mundial ha llevado a la búsqueda de nuevas tecnologías capaces de incrementar el rendimiento de los cultivos vegetales. El uso de fertilizantes químicos ha mejorado la producción, sin embargo, su uso desmedido ha generado daños ambientales y a la salud (Pérez- Montaño et al., 2014) Debido a esta problemática, investigadores a nivel mundial se han enfocado a encontrar alternativas a la fertilización química, que sean rentables y sustentables. Una tecnología alternativa ha sido el uso y producción de biofertilizantes. Los biofertilizantes son productos que contienen microrganismos vivos y que, al ser aplicados en plantas, promueven el crecimiento de la misma (Vessey, 2003). Muchos biofertilizantes están formulados con rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal, PGPR por sus siglas en inglés. Estos microrganismos colonizan la rizósfera de las plantas y mediante diversos mecanismos facilitan nutrientes a la planta, o disminuyen el efecto nocivo de otros agentes bióticos o abióticos (Ahemad & Kibret, 2013). A pesar de que la investigación sobre biofertilizantes ha ido en aumento en los últimos años, aún es una tecnología que no ha sido aceptada ampliamente para su uso, una razón es que algunos biofertilizantes no suelen tener el efecto deseado en todos los suelos, debido a condiciones prexistentes del mismo suelo, como puede ser, características del suelo, competencia directa por otros microrganismos, contaminación (fertilizantes, pesticidas) (Ahemad & Khan, 2012). Debido a esto, es importante la búsqueda de microrganismos adaptados a estas condiciones, para maximizar los efectos benéficos bajo condiciones adversas. Este trabajo de tesis se desarrolla en el marco del proyecto del Fondo Nacional del Emprendedor 2015, programas de desarrollo empresarial modalidad fomento a las iniciativas de innovación en vinculación con la empresa Agroquímicos El Trébol SA de CV. La problemática que presenta la empresa es que, debido al uso de agroquímicos, en particular plaguicidas, en los campos de cultivo e invernaderos de la región, afecta de manera negativa los biofertilizantes usados, por lo que el efecto esperado no se obtiene. Por lo que en este proyecto se contempló el desarrollo de un biofertilizante formulado con rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal que sean tolerantes a los pesticidas usados frecuentemente en la región central de la República Mexicana. 2. MARCO TEÓRICO 2.1. BIOESTIMULANTES VEGETALES Actualmente no existe una definición regulatoria del término bioestimulante en ninguna parte del mundo, sin embargo, la comunidad científica ha reconocido como tal una amplia serie de sustancias y microrganismos benéficos, entre ellos encontramos los ácidos húmicos y fúlvicos, hidrolizados de proteína y otros compuestos nitrogenados, extractos botánicos, biopolímeros, algunos compuestos inorgánicos, bacterias y hongos benéficos (Halpern et al., 2015). Las sustancias húmicas son constituyentes naturales de la materia orgánica del suelo, resultantes de la descomposición de residuos animales, vegetales y microbianos. Originalmente categorizadas como ácidos húmicos y fúlvicos por su peso molecular y solubilidad. (Rose et al., 2014). Aunque el uso de estas sustancias promueve el crecimiento vegetal, sus resultados son muy variables, debido a la fuente de las sustancias húmicas, la dosis y la forma de aplicación (Rose et al., 2014). Los efectos bioestimulantes de las sustancias húmicas (SH) han sido atribuidos a diferentes mecanismos, como es la alta capacidad de intercambio catiónico de las sustancias polianiónicas (SH), el aumento de la disponibilidad de fósforo, o debido a la estimulación de la ATPasa de la membrana vegetal (Jindo et al., 2012). Los hidrolizados de proteína son obtenidos de hidrólisis enzimática o química de residuos agroindustriales, tanto como de residuos animales o vegetales (Halpern et al., 2015). Estos compuestos han tenido cierto éxito como bioestimulantes al aumentar directamente la asimilación de nitrógeno, también se ha reportado el efecto quelante de ciertos aminoácidos como la prolina, el cual puede actuar protegiendo a la planta de metales pesados, o contribuyendo a la solubilización de algunos micronutrientes. Otros efectos indirectos reportados han sido el aumento en la biomasa microbiana, así como su actividad en el suelo (Calvo et al., 2014). El uso de extractos de algas marinas ha sido usado recientemente como bioestimulante, algunos de los componentes que se atribuyen al afecto son polisacáridos como la laminarina, alginatos y carragenanos; esteroles, y otros compuestos nitrogenados. Muchos de los extractos provienen de algas marrones y rojas (Khan et al., 2009). El uso de extractos botánicos es menos usado como bioestimulante, su uso se ha enfocado principalmente a las propiedades plaguicidas que posee. (du Jardin, 2015). Algunos biopolímeros han sido usados como bioestimulante, el quitosan ha sido usado como un potenciador de la resistencia sistémica de las plantas, al unirse en receptores específicos, similares a bacterias patógenas (Katiyar et al., 2015). Los hongos micorrizas son un grupo heterogéneo de diversos taxones, los cuales establecen simbiosis con alrededor del 90% de las especies vegetales. Los hongos micorrizas arbusculares, son el tipo de endomicorrizas encontrados en la mayoría de los cultivos y hortalizas, donde la hifa fúngica penetra dentro de la pared celular de las raíces vegetales, formando estructuras ramificadas llamadas arbúsculos (du Jardin, 2015). Existen ciertos beneficios aceptados por el uso agrícola de micorrizas, entre ellos proporcionar micro y macronutrientes, esencialmente fósforo, un mejor balance acuoso y protección contra estrés biótico y abiótico, sin embargo, la mayor limitación actual es la dificultad de propagar las micorrizas arbusculares a gran escala (Gianinazzi et al., 2010). Por otra parte, el uso de bacterias benéficas ha venido aumentando en los últimos años. Podemos distinguir dos tipos principales: 1) endosimbiontes mutualistas del género Rhizobium y 2) mutualistas rizosféricas como las PGPR’s (rizobacterias promotoras de crecimiento vegetal). Las bacterias del género Rhizobium han sido comercializadas ampliamente como biofertilizantes (facilitando la nutrición vegetal), mientras que las PGPR’s son multifuncionales e influencian muchos aspectos de la vida vegetal, entre ellos, la nutrición y el crecimiento, morfogénesis y desarrollo, así como la respuesta a factores bióticos y abióticos (Bhattacharyya & Jha, 2012). Sin embargo, debido a la complejidad de estas interacciones, así como las respuestas variables en diferentes cultivares y ambientes, muchas veces se traducen en resultados inconsistentes en la práctica (Arora, et al., 2011). 2.2. RIZOBACTERIAS PROMOTORAS DE CRECIMIENTO VEGETAL La rizósfera es la zona del suelo que está rodeando directamente el sistema radicular de las plantas (Walker et al., 2003), por lo tanto, las rizobacterias son el grupo de bacterias competentes en colonizar la raíz (Kloepper et al., 1991). Las raíces, además de proporcionar el sustento mecánico y facilitar la toma de agua y nutrientes, también sintetizan, acumulan y secretan una gran cantidad de diversos compuestos (Walker et al., 2003). Estos compuestos actúan como atrayentes químicos para un vasto número de diversas comunidades microbianas. Estas sustancias secretadas por las raíces son llamadas exudados radiculares y modifican las propiedades físicas y químicas el suelo y por lo tanto regulan la estructura de las comunidades microbianas en la proximidad de la superficie radicular (Dakora & Phillips, 2002). Algunos de estos exudados actúan como repelentes contra algunos microrganismos, mientas que otros actúan como atrayentes.La composición de los exudados dependerá del estado fisiológico y de la especie de planta, así como de los microrganismos presentes. (Kang et al., 2010). Por lo tanto, la rizósfera puede ser definida como el volumen de suelo específicamente influenciado por las raíces y sus exudados (Dessaux et al., 2009). Específicamente se reconocen tres componentes separados pero que interactúan dentro de la rizósfera: a) El suelo rizosférico, b) El rizoplano, y c) la raíz. El rizoplano es la superficie de la raíz y las partículas de suelo adheridas fuertemente a ella (Barea et al., 2005). La colonización del rizoplano y otros tejidos de la raíz es conocido como colonización radicular, mientas que la colonización del volumen de suelo adyacente, bajo la influencia de la raíz, es conocida como colonización rizosférica (Kloepper, 1994). Muchos géneros diferentes de bacterias son componentes vitales del suelo. Están involucradas en varias actividades bióticas del suelo, como la transformación de nutrientes (Ahemad, et al., 2009). Sin embargo, las bacterias que viven alrededor o sobre las raíces vegetales (rizobacterias) son las más versátiles transformando, movilizando y solubilizando los nutrientes, comparadas con las que viven en el suelo como tal (Hynes et al., 2008). Las rizobacterias son las dominantes en procesos de reciclado de nutrientes y, en consecuencia, son cruciales para la fertilidad del suelo (Glick, 2012). Actualmente los productos de origen biológico, como los biofertilizantes y bioestimulantes, para mejorar los cultivos están ganando importancia entre los agrónomos y productores, en este contexto la investigación mundial se está enfocando a explorar un gran intervalo de rizobacterias con características deseables para ser usadas como bioinoculantes o biofertilizantes para promover el crecimiento y desarrollo vegetal (Ahemad & Kibret, 2014). Las rizobacterias benéficas se conocen como PGPR, acrónimo del inglés “Plant growth-promoting rhizobacteria”, este término fue usado por primera vez por Kloepper (Kloepper & Schroth, 1978). En general las PGPR deben cumplir tres criterios: ser capaces de colonizar la raíz o la zona de influencia, sobrevivir y multiplicarse en el microhábitat asociados a la raíz y estimular el crecimiento vegetal (Kloepper, 1994). Las PGPR, representan una gran variedad de bacterias del suelo, que cuando crecen en asociación con una planta hospedadora, resulta en una estimulación de su crecimiento (Vessey, 2003). Son de los microorganismos de importancia agronómica más usados y estudiados recientemente. Se ha reportado que las PGPR están asociadas a muchos tipos de plantas y se encuentran presentes en una gran variedad de ambientes. Para que exista este efecto benéfico en el crecimiento de la planta, se necesita que ambos organismos estén relacionados estrechamente. Algunas bacterias colonizan la superficie de la raíz el rizoplano, otras pueden ser capaces de tener comportamiento endofítico, colonizando el interior de raíces, tallos, hojas, etc. (Compant, et al, 2005). Durante el proceso de colonización, las bacterias son atraídas por los exudados radiculares, ricos en carbohidratos y aminoácidos, necesarios para el crecimiento bacteriano (Ahemad & Kibret, 2014). Algunos géneros que se han reportado tener actividad PGPR son: Pseudomonas, Serratia, Azospirillium, Azotobacter, Bacillus, Burkholderia, Enterobacter, Rhizobium, Erwinia, Acinetobacter, Alcaligenes, Arthrobacter y Flavobacterium (Armada, et al., 2015, Luna, et al., 2012, Menamo & Wolde, 2015, Çakmakçi, et al., 2006, Kumar et al., 2014, Vessey, 2003, Kloepper, & Schroth, 1978, Kloepper, 1991, Zaidi, 2015, Compant, et, al, 2005) 2.1.1. Mecanismos de acción de las PGPR La promoción del crecimiento vegetal ocurre por la alteración de la comunidad microbiana en la rizósfera, mediante la producción de varias sustancias (Kloepper & Schorth, 1978). Generalmente las PGPR actúan directamente, al facilitar la adquisición de recursos (nitrógeno, fósforo y otros minerales esenciales) o modulando el nivel de hormonas de la planta. Indirectamente actúan al reducir efectos inhibitorios de patógenos o el ambiente (Glick, 2012). Mecanismos directos Fijación de nitrógeno El nitrógeno es el nutriente más importante para el crecimiento y la productividad de las plantas. A pesar de que la atmósfera está compuesta aproximadamente del 78% de N2 es inaccesible para las plantas. El nitrógeno atmosférico es convertido en formas asimilables para la planta mediante la “Fijación Biológica de Nitrógeno” (BNF), el cual transforma el Nitrógeno gaseoso en amoniaco por microrganismos que portan un sistema enzimático conocido como Nitrogenasa (Kim & Rees, 1994). Los organismos fijadores de Nitrógeno son categorizados como: a) simbióticos, que incluye miembros de la familia Rhizobiaceae los cuales forman simbiosis con leguminosas, y b) no simbióticos o de vida libre, como las cianobacterias, y miembros de géneros como: Azospirillum, Azotobacter, Azocarus, etc (Bhattacharyya & Jha, 2012). Solubilización de fosfatos El fósforo (P), es el segundo nutriente más importante y limitante del crecimiento de la planta, después del nitrógeno, es abundante en el suelo tanto en forma orgánica como inorgánica (Khan et al., 2009). A pesar de que el suelo es un gran reservorio de P, la cantidad biodisponible para las plantas es baja. Esto es debido a que la mayor parte del fósforo del suelo se encuentra en formas insolubles, mientras que las plantas solamente pueden absorberlo en dos formas solubles: monobásico (H2PO4-) y dibásico (HPO42-). El fósforo en el suelo se encuentra en formas insolubles como la apatita, fitato, fosfomonoésteres y fosfodiésteres (Glick, 2012). Microrganismos con actividad solubilizadora de fosfatos (PSM) pueden proveer formas asimilables de fósforo para la planta. Los géneros como: Azotobacter, Bacillus, Beijerinckia, Burkholderia, Enterobacter, Erwinia, Flavobacterium, Microbacterium, Pseudomonas, Rhizobium y Serratia han sido reportados como las bacterias solubilizadoras de fosfatos (PSB) más relevantes (Bhattacharyya & Jha, 2012). La solubilización de fósforo inorgánico ocurre como consecuencia de la acción de algunos ácidos orgánicos de bajo peso molecular, los cuales son sintetizados por varias rizobacterias (Zaidi, et al., 2009). Por otra parte, la solubilización de fósforo orgánico (mineralización) ocurre a través de la síntesis de una variedad de diferentes fosfatasas, las cuales catalizan la hidrólisis de ésteres fosfóricos. Ambos mecanismos son posibles en una misma bacteria (Glick, 2012). Producción de sideróforos El Hierro (Fe), es un nutriente vital para la mayoría de las formas de vida. En ambientes aeróbicos el hierro está presente principalmente como Fe3+ y es común que forme hidróxidos y oxihidróxidos insolubles, haciéndolo generalmente inaccesible para plantas y microrganismos (Rajkumar et al., 2010). Comúnmente, las bacterias adquieren hierro mediante la secreción de quelantes de bajo peso molecular llamados sideróforos. La mayoría de los sideróforos son solubles en agua y pueden ser intra o extra celulares. Algunas rizobacterias tienen la habilidad de usar sideróforos de otros géneros (heterólogos), mientras que otros solamente pueden utilizar los sideróforos de la misma especie (Khan et al., 2009). En las rizobacterias, el hierro (Fe3+) en el complejo Fe3+ - sideróforo en la membrana bacteriana es reducido a Fe2+, el cual es después liberado dentro de la célula por medio de un mecanismo de transporte. Durante este proceso de reducción el sideróforo puede ser destruido o reciclado (Neilands, 1995). Además de hierro, algunos sideróforos pueden formar complejos estables con otros metales pesados como Al, Cd, Cu, Ga, In, Pb y Zn, al igual que algunos radionúcleos como U y Np (Neubauer et al., 2000). Porlo tanto, los sideróforos bacterianos pueden aliviar el estrés causado a las plantas por altos niveles de metales pesados en el suelo. Las plantas asimilan el hierro bacteriano por diferentes mecanismos como: a) directamente del complejo sideróforo-Fe, o por medio de reacciones de intercambio iónico (Schmidt, 1999). PRODUCCIÓN DE FITOHORMONAS Ácido indol acético (AIA) La síntesis microbiana de la fitohormona auxina ácido indol-3-acético (AIA), ha sido conocida por bastante tiempo. Generalmente AIA secretado por las rizobacterias interfiere con muchos procesos de desarrollo de las plantas, debido a que la cantidad de AIA de la planta puede verse alterada por la adquisición de AIA bacteriano (Spaepen et al., 2007). Generalmente el AIA afecta la división, extensión y diferenciación celular, estimula la germinación de semillas, incrementa el desarrollo de xilema y la raíz, inicia la formación de raíces laterales y adventicias, controla la respuesta a luz y gravedad, afecta la fotosíntesis, formación de pigmentos, la biosíntesis de varios metabolitos y resistencia a condiciones de estrés. De igual manera AIA “afloja” la pared celular vegetal, lo que resulta en el incremento de los exudados de la raíz, lo que provee de nutrientes adicionales a las bacterias de la rizósfera. Por lo que el AIA de las rizobacterias se ha identificado como una molécula efectora en las interacciones planta-microrganismo, tanto en patogénesis como en fitoestimulación (Spaepen & Vanderleyden, 2011). La biosíntesis de AIA comienza con el aminoácido triptófano en la mayoría de las bacterias y plantas. La síntesis de AIA vía ácido indol-3-pirúvico y aldehído indol- 3-acético es presentada por la mayoría de las bacterias como Erwinia, Agrobacterium, Pseudomonas, Bradyrhizobium, Rhizobium, Azospirillum, Klebsiella, y Enterobacter (Patten & Glick, 1996). Ácido giberélico El ácido giberélico (GA) pertenece a un gran grupo de moléculas (Giberelinas), químicamente son diterpenos tetracíclicos, y regulan diversos procesos biolgócos en las plantas, incluyendo la germinación, la elongación del tallo, la floración y la producción de frutos (Ahemad & Kribet, 2014). Azospirillum sp. fue la primera bacteria en ser reportada como productora de giberelinas, mediante la hidroxilación de precursores (GA3 o GA5), sin embargo, el precursor inicial es el isoprenil pirofosfato (IPP) (Cassan, et al., 2013). Otros géneros de bacterias en los que se ha reportado la producción de giberelinas son: Rhizobium, Acetobacter, Herbaspirillum y Bacillus (Bottini et al., 2004). Citoquininas Las citoquininas son un grupo de compuestos naturales que regulan la división celular y procesos de diferenciación celular en tejidos meristemáticos, en plantas superiores. (Ahemad & Kribet, 2014). Existen dos grupos principales de citoquininas: Las derivadas de adenina, tales como la Kinetina y la Zeatina; y las moléculas derivadas de fenilurea, como el thiadiazuron. (Cassan et al., 2013) Estos fitorreguladores han sido asociados con muchos procesos fisiológicos y celulares, incluyendo la senescencia, la acumulación de clorofila, la formación de órganos, el desarrollo de la raíz, la elongación radicular, el desarrollo del tallo y la expansión de hojas (Cassan et al., 2013). Gran parte de las bacterias aisladas de la rizósfera son capaces de producir compuestos de la familia de las citoquininas, en el medio de cultivo (Bashan & de Bashan, 2010). En los géneros de bacterias productoras de citoquininas encontramos: Serratia, Pseudomonas, Burkholderia, Agrobacterium, Erwinia, Xanthomonas, Arthrobacter, y Bacillus (Garcia de Salamone et al., 2006). Reducción en los niveles de etileno El etileno es un metabolito esencial para el crecimiento y desarrollo normal de las plantas (Khalid et al., 2006). Esta hormona vegetal es producida endógenamente por casi todas las plantas, sin embargo, puede ser producido por otros factores bióticos y abióticos en los suelos. Además de ser un regulador de crecimiento en plantas, el etileno también es una hormona de estrés. Bajo condiciones de estrés como los generados por: salinidad, sequía, inundación, metales pesados y patogenicidad, los niveles endógenos de etileno incrementan significativamente, lo cual afecta negativamente el crecimiento general de la planta. Altas concentraciones de etileno inducen defoliación y otros procesos celulares que pueden reducir el rendimiento de ciertos cultivos (Saleem et al., 2007). PGPR’s que poseen la enzima 1-aminociclopropano-1-carboxilato (ACC) desaminasa, facilita el crecimiento y desarrollo de las plantas al reducir los niveles de etileno, induciendo tolerancia o reduciendo el estrés (Nadeem et al., 2007). Las rizobacterias toman el precursor del etileno, ACC, y lo convierten en 2- oxobutanoato y amonia (Arshad et al., 2007). MECANISMOS INDIRECTOS El principal mecanismo indirecto de las PGPR es a través del biocontrol de microrganismos patógenos (Glick, 2012). Los principales modos de biocontrol son: la competencia directa de nutrientes, desplazamiento de nicho, resistencia sistémica inducida, y la producción de ciertos metabolitos (Lugtenberg & Kamilova, 2009). Entre las bacterias que presentan actividad de biocontrol, se ha reportado la producción de compuestos tales como: sideróforos, antibióticos, compuestos volátiles, enzimas líticas y enzimas detoxificantes (Compant et al., 2005). Algunos de los antibióticos que se han reportado se encuentra: cianuro de hidrógeno, oomicina, fenazina, oligomicina, kanosamina y zwitermicina, así como algunos lipopeptidos cíclicos (Compant et al., 2005). Las enzimas líticas juegan un papel importante en contra de los organismos patógenos, principalmente atacan la pared celular, como son: las quitinasas, celulasas, glucanasas. (Compant et al., 2005). 2.3. BIOFERTILIZANTES Durante los últimos años la agricultura se ha caracterizado por el uso intensivo de fertilizantes químicos y plaguicidas, esto para mantener altas producciones, sin tener en cuenta lo que esto ocasiona, como el deterioro y/o destrucción de los agroecosistemas, evidenciado principalmente en la pérdida de productividad de los suelos, alteración en la calidad de los productos agrícolas, contaminación del ambiente y problemas de salud a la población en general (Higa & Parr, 1994). En el 2012 se reportó el uso de más de 156 millones de toneladas de fertilizantes químicos a nivel mundial, lo cual deja de ser viable debido al agotamiento de recursos y a los altos costos (Naveed et al., 2015). Este impacto negativo, ha generado el desarrollo de tecnologías sustentables y de origen biológico. Recientemente, el uso de biofertilizantes ha sido una de las herramientas más importantes para la agricultura sustentable para incrementar la fertilidad del suelo, utilizando fuentes renovables, capaces de maximizar los beneficios ecológicos y minimizar los daños ambientales, así como los costos (Kizilkaya, 2008). Vessey, (2003) define los biofertilizantes como “una substancia que contiene microorganismos vivos, que cuando es aplicada a semillas, superficie foliar o al suelo, coloniza la rizósfera o el interior de la planta y promueve el crecimiento, incrementando la cantidad o disponibilidad de nutrientes primarios a la planta hospedadora”. A diferencia de los fertilizantes químicos, los biofertilizantes no son usados para proveer los nutrientes como tal. Generalmente, los biofertilizantes pueden ser clasificados en cuatro categorías: a) Biofertilizantes fijadores de N2, los cuales contienen bacterias con actividad Nitrogenasa; b) Biofertilizantes solubilizadores de P, contienen microrganismos solubilizadores de fosfatos; c) Aceleradores de la descomposición, contienen ciertas bacterias ligninolíticas y celulolíticas y d) PGPR, los cuales promueven el crecimiento por una gran variedad de mecanismos.(Naveed et al., 2015) La finalidad del uso de biofertilizantes es la sustitución total o parcial de los fertilizantes minerales, disminuyendo así la contaminación generada por los mismos, así como los daños que provoca a la salud (Armenta-Bojórquez, 2010). Muchos autores han reportado el uso de biofertilizantes, afectando positivamente el crecimiento de muchas plantas de interés agrícola: hortalizas (Esitken, 2011), papa (Singh, 2013), tomate (Bernabeu et al., 2015), berenjena (Seymen et al., 2013), pepino (Gül et al., 2013), rabano (Yildirim et al., 2008), chille (Silva et al.,2014), lechuga (Chamangasht et al., 2012) y brócoli (Yildirim et al., 2011). En México el mayor impacto de los biofertilizantes fue en los años 70’s y 80’s con el descubrimiento de la fijación biológica de nitrógeno en leguminosas, sobre todo en soya y garbanzo (Armenta-Bojórquez, 2010). La utilización de inoculantes a base de Rhizobium fue una práctica generalizada en los productores (INIFAP, 1990). Recientemente, en los últimos años han aparecido preparaciones comerciales con PGPR que han sido utilizados mayormente en hortalizas (Armenta-Bojórquez, 2010). Sin embargo, no se ha tenido la aceptación esperada por parte los productores, debido a la desconfianza de reducir la fertilidad del suelo y con ello, sus ganancias. Esta desconfianza se basa principalmente en la respuesta variable de los biofertilizantes, debido al tipo de microrganismos, suelo, plantas y condiciones ambientales presentes (Armenta-Bojórquez, 2010). Debido a lo anterior se deben tomar las precauciones necesarias para seleccionar el microrganismo adecuado y que se favorezca con las condiciones presentes en el suelo, o proveerle las condiciones favorables. La utilización de cepas nativas de microorganismos en la elaboración de biofertilizantes, presentan mayores posibilidades de efectividad en el campo, por estar adaptados a las condiciones del suelo de cada región (Armenta Bojórquez et al., 2010). Otro aspecto importante en la formulación de biofertilizantes es la elección correcta de un material de soporte. Generalmente cuando el soporte es inadecuado, la población bacteriana se reduce rápidamente, por lo que la formulación y la elección del soporte correcto, deben proveer a las bacterias con un ambiente favorable que prolongue su viabilidad (Bashan et al., 2014). Los materiales elegidos como soporte deben poseer ciertas características para que sean considerados ideales, como son: la facilidad de uso, no fitotóxico, que mantenga o prolongue la supervivencia de las bacterias, así como una vida de almacenaje adecuada (Bashan et al., 2014). Los biofertilizantes líquidos fueron los primeros en ser usados, esencialmente son suspensiones bacterianas solas o suplementadas con algún aditivo que mejore la estabilización, como son espesantes o protectores. Su principal ventaja que son de fácil manejo, así como de formulación. (Bashan et al., 2014). Otro tipo de biofertilizantes son los que usan soportes orgánicos, siendo sin duda, el Peat moss el más utilizado a nivel mundial (Albareda et al., 2008). El paet moss tiene característica que lo hacen un buen soporte sólido, como son: tamaño de partícula controlable, pH neutro, buena retención de humedad y alto contenido de materia orgánica (Bashan et al., 2014). Actualmente, las formulaciones encapsuladas son prometedoras, sin embargo, aún se encuentran en etapa experimental para su aplicación en la agricultura. La encapsulación de microrganismos suele ser en una matriz polimérica natural o sintética. El objetivo de la encapsulación es mantener las células atrapadas en la matriz polimérica, a concentraciones altas y por un tiempo prolongado (Bashan et al., 2014). 3 JUSTIFICACIÓN Debido al incremento acelerado de la población mundial, la demanda de alimentos ha aumentado, lo que conlleva a la necesidad de mayores extensiones de cultivo. Adicionalmente las malas prácticas agrícolas han ido intensificando los problemas de producción, particularmente el uso intensivo de fertilizantes y agroquímicos en general conllevan a un deterioro tanto del suelo como del ambiente. Recientemente se están implementando técnicas agrícolas más sostenibles, como el uso de biofertilizantes, que, hacen uso de microorganismos que regularmente viven asociados a plantas, como alternativa al uso de fertilizantes químicos. Sin embargo, muchos biofertilizantes disponibles en el mercado se ven afectados por los agroquímicos que han sido aplicados en los suelos agrícolas, traduciéndose en una disminución de los efectos benéficos de los microrganismos que los conforman. El uso de bacterias promotoras de crecimiento vegetal (PGPR), se ha convertido en una buena alternativa a los fertilizantes químicos, al aumentar la calidad de los cultivos, adaptable a las prácticas de cultivo y reduciendo el impacto ambiental y a la salud de los agricultores. Sin embargo, muchas de estas rizobacterias se ven afectadas por los agroquímicos usados en la práctica agrícola. Si bien es muy importante que se formulen biofertilizantes que ayuden al desarrollo de las plantas mediante los mecanismos ya descritos, también es importante tomar en cuenta que los microorganismos seleccionados para formularlos deben tener resistencia a los agroquímicos. A pesar de que algunos productores agrícolas que han iniciado el desuso de fertilizantes químicos y están optando por los abonos orgánicos, la presencia de plagas los ha orillado a que todavía hacen uso de pesticidas para control de plagas o malezas y estos, también afectan a las bacterias benéficas del suelo. Por todo lo anterior se vislumbra la importancia de llevar a cabo estudios para formular biofertilizantes con microrganismos tolerantes a agroquímicos. 4 OBJETIVOS 4.1 OBJETIVO GENERAL Evaluar el efecto en el cultivo en invernadero de jitomate y papa, al aplicar un biofertilizante formulado con bacterias promotoras de crecimiento vegetal, tolerantes a agroquímicos. 4.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS Seleccionar in vitro cepas promotoras de crecimiento vegetal de una colección previa de bacterias tolerantes a agroquímicos. Evaluar en las rizobacterias la capacidad de solubilización de fósforo, la producción de fitorreguladores (ácido indol acético, ácido giberélico y citoquininas) y el efecto antagonista contra Streptomyces sp Evaluar el rendimiento de jitomate y papa inoculados con rizobacterias Evaluar diferentes medios de cultivo para elaborar un biofertilizante, su posible presentación comercial y así como su vida de anaquel 5 METODOLOGÍA 5.1 MEDIOS DE CULTIVO Caldo Nutritivo: Este medio se utilizó para propagar y conservar todos los cultivos bacterianos. Esta formulado con Peptona de carne 5g y Extracto de levadura 3g en un litro Medio LB suplementado con triptófano: Medio utilizado para la producción de fitohormonas. Formulado con Peptona de carne 10g, Extracto de levadura 5g, Cloruro de sodio 5g en un litro Medio mínimo de sales: Medio utilizado en la determinación de bacterias solubilizadoras de fosfato. Formulado con KH2PO410 5g, K2HPO4 4.5g, NH4SO4*2H20 1.0g MgCl2*7H2O0.2g, Glucosa 10g, Agar 15g en un litro Medio NBRIP: Medio utilizado para la determinación de bacterias solubilizadoras de fosfato con una fuente insoluble de fósforo. Formulado con: Glucosa 10g, Ca3(PO4)2 5g, MgCl2.6H2O 5g, MgSO4.7H2O 0.25, NaCl 0.2g, (NH4)2SO4 0.1g. Agar 15g en un litro 5.2 CONSERVACIÓN DE CEPAS BACTERIANAS Se partió de una colección de 118 bacterias previamente aisladas por otros miembros del grupo de trabajo, a partir de suelo rizosférico de maíz y papa. Las bacterias fueron previamente identificadas como tolerantes a agroquímicos. Para su propagación se utilizó caldo nutritivo (8 g/l), esterilizado en autoclave (1.1 atm, 121°C por 15 min). Las bacterias fueron propagadas en 25 mlde caldo nutritivo en tubos estériles tipo falcon de 50 ml estériles. Bajo condiciones estériles, se tomó una colonia aislada en las cajas Petri, y se transfirió a los tubos, fueron incubados a 30°C a 120 rpm durante 24 horas. La suspensión bacteriana se centrifugó a 10,000 rpm a 4°C durante 20 min, para separar las células. Las células se cosecharon y fueron resuspendidas en caldo nutritivo con glicerol al 20% y depositadas en crio-viales de 2 ml para su conservación a -80°C. 5.3 ENSAYO DE GERMINACIÓN Para la selección de las cepas que se utilizaron en este trabajo se planteó un ensayo de germinación in vitro, para seleccionar aquellas bacterias que, al ser inoculadas en semillas, reportaran los mejores valores de índice de vigor relativo. Se siguió la metodología propuesta por Mia et al., (2010). Las bacterias fueron propagadas en caldo nutritivo y su concentración se ajustó por turbidez a aproximadamente 108 UFC/ml. Se usaron semillas comerciales de tomate (Solanum lycopersicum), las cuales fueron desinfectadas superficialmente, con una solución de hipoclorito de sodio al 1%, por inmersión durante 2 minutos. Posteriormente fueron enjuagadas 5 veces con agua destilada estéril y se secaron a temperatura ambiente. Treinta semillas secas y desinfectadas fueron introducidas en cada tubo de la suspensión bacteriana durante 20 minutos. Posteriormente se colocaron 10 semillas en cada caja Petri, donde previamente se colocó papel filtro de poro mediano estéril. El papel filtro se humedeció con 2 ml de agua destilada estéril. Como control se colocaron las semillas en caldo nutritivo estéril. Las cajas fueron incubadas en oscuridad a 30°C durante 120 horas. Transcurrido el tiempo de incubación se registró el número de semillas germinadas y la longitud total de la plántula, para calcular el índice de vigor relativo (IVR) con la siguiente ecuación (Mia et al., 2010): % 𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺ó𝐺𝐺 𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟: 𝑆𝑆𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝑆𝑆 𝑔𝑔𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑔𝑔𝐺𝐺𝑆𝑆 𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟 𝑆𝑆𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝑆𝑆 𝑔𝑔𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑔𝑔𝐺𝐺𝑆𝑆 𝐺𝐺𝐺𝐺 𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟 𝑥𝑥 100 % 𝐸𝐸𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝑔𝑔𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺ó𝐺𝐺 𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟: 𝐸𝐸𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝑔𝑔𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺ó𝐺𝐺 𝑔𝑔𝐺𝐺 𝑟𝑟𝐺𝐺 𝑝𝑝𝑟𝑟á𝐺𝐺𝑟𝑟𝑛𝑛𝑟𝑟𝐺𝐺 𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟 (𝐺𝐺𝐺𝐺) 𝐸𝐸𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝑔𝑔𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺ó𝐺𝐺 𝑔𝑔𝐺𝐺 𝑟𝑟𝐺𝐺 𝑝𝑝𝑟𝑟á𝐺𝐺𝑟𝑟𝑛𝑛𝑟𝑟𝐺𝐺 𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟 (𝐺𝐺𝐺𝐺) 𝑥𝑥 100 𝐼𝐼𝐼𝐼𝐼𝐼: %𝐺𝐺𝐼𝐼 𝑥𝑥 %𝐸𝐸𝐼𝐼 100 Las bacterias seleccionadas de acuerdo con el IVR fueron las utilizadas en los demás ensayos y para la formulación del biofertilizante. 5.4 SOLUBILIZACIÓN DE FOSFATOS El fósforo es un elemento esencial en la nutrición vegetal, aunque es abundante en el suelo, se encuentra en formas insolubles e inaccesibles para las plantas (ésteres y anhídridos fosfóricos), las bacterias solubilizadoras de fosfatos juegan un rol importante en la mineralización del fósforo. Para evaluar la capacidad de las bacterias seleccionadas en el ensayo de germinación para solubilizar fósforo, se utilizó el medio NBRIP (Nautiyal, 1999), el cual está formulado con fosfato tricálcico como fuente de fósforo insoluble. Las bacterias seleccionadas en el experimento de germinación fueron inoculadas en cajas Petri con medio mínimo de sales y se incubaron por 3 días para obtener colonias aisladas y puras. Posteriormente cada colonia aislada se inoculó en el medio NBRIP cada colonia aislada, mediante un palillo estéril, picando una colonia, y luego picando una sola vez en el medio NBRIP, con un total de 4 picaduras por caja. El experimento fue realizado por triplicado. Las placas fueron incubadas por 14 días a 30°C. Finalmente se midió el diámetro de la colonia y del halo de solubilización, para calcular el índice de solubilización de fósforo (PSI) con la ecuación de Edi- Premono, 1996: 𝑃𝑃𝑆𝑆𝐼𝐼 = 𝐷𝐷í𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟 𝑔𝑔𝐺𝐺 𝑟𝑟𝐺𝐺 𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺 + 𝑔𝑔í𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟 𝑔𝑔𝐺𝐺𝑟𝑟 ℎ𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟 𝐷𝐷í𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝑟𝑟𝐺𝐺𝑟𝑟 𝑔𝑔𝐺𝐺 𝑟𝑟𝐺𝐺 𝐺𝐺𝑟𝑟𝑟𝑟𝑟𝑟𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺𝐺 5.5 DETERMINACIÓN DE FITORREGULADORES Para elaborar biofertilizantes se han seleccionados rizobacterias que tienen el potencial para producir AIA, GA y quinetinas, por ello se evaluó la producción de estos fitorreguladores. De acuerdo con las metodologías de Ullah et al., (2013) y Karadeniz et al., (2006): Las cepas seleccionadas previamente, se incubaron en caldo nutritivo durante 24 horas. La suspensión bacteriana se ajustó a una concentración aproximada de 108 UFC/ml y se inoculó 1 ml en 50 ml de medio LB adicionado con 0.2 g/L de L- triptófano (>99% Sigma). La suspensión se incubó a 30°C, 220 rpm durante 120 horas. Después del tiempo de incubación, se centrifugó a 10,000 rpm a 4°C por 20 min, se tomó el sobrenadante y se ajustó hasta un pH de 2.5-2.8 con HCL concentrado. Posteriormente se realizó 3 veces consecutivas la extracción de las fitohormonas, con un volumen de 20 ml de acetato de etilo. Se tomó la fase orgánica y se refrigeró a 4°C en un frasco ámbar. En la fase orgánica pueden encontrar el ácido indol acético (AIA) y el ácido giberélico (GA). Para obtener hormonas de la familia de citocininas, se tomó la fase acuosa descartada en el proceso de extracción anterior y se neutraliza a un pH de 7 con NaOH y se repitió el proceso de extracción con acetato de etilo (20 ml, 3 veces). Ambas fracciones orgánicas obtenidas se mezclaron y se llevó a sequedad en un evaporador rotatorio, el residuo fue resuspendido en Metanol. Para comprobar la presencia de los fitorreguladores en los extractos se realizó una cromatografía en capa fina, en placas de Sílica gel 60 F254. En cada carril se colocaron 20 μl de los extractos y como control negativo una extracción del medio de cultivo estéril, la fase móvil empleada fue una mezcla de acetato de etilo, cloroformo y ácido acético (60:35:5). Para identificación de los fitorreguladores se usaron estándares de AIA (>95% Sigma aldrich), GA3 (>90% Sigma aldrich) y Kinetina (>95% Caisson labs) Las placas fueron reveladas con luz UV de onda corta (254 nm) para AIA y Kinetina, además de una mezcla de etanol-ácido sulfúrico 95:5 para GA. Para la cuantificación de los fitorreguladores, los extractos fueron analizados en un sistema de HPLC con detector UV, bajos condiciones isocráticas, con una fase móvil de metanol 70%, una columna de fase reversa C18 250 x 4.6 mm, λ=254 nm y un flujo de 1ml/min. Se construyeron curvas de calibración de los estándares AIA, GA y Kinetina. La cuantificación se realizó relacionando el área bajo la curva con la concentración. 5.6 EVALUACION DE LA TOLERANCIA A AGROQUÍMICOS Los plaguicidas usados en los cultivos para combatir enfermedades en plantas causados por bacterias y hongos suelen dañar de igual manera la microbiota benéfica, disminuyendo así los posibles efectos positivos de éstas. Por ello se evaluó la resistencia de las bacterias seleccionadas a algunos agroquímicos usados frecuentemente en la zona centro de México. La evaluación in vitro de la resistencia de las cuatro rizobacterias a siete agroquímicos fue evaluada mediante el método de difusión en placa (Kirby-Bauer) usando la metodología propuesta por Drouin et al., (2010). Se prepararon soluciones acuosas de los siete agroquímicos con las dosis recomendadas por el fabricante (1 X) y también dosis 10X, 100 X y 1000 X (Tabla 1). Se aplicaron 20 µl de cada solución en un disco de papel filtro estéril de 12.5 mm de diámetro, y se dejaron secar a temperatura ambiente bajo condiciones asépticas. Por otro lado, las bacterias a evaluar se propagaron en caldo nutritivo hasta una concentración de 1 x 108 UFC/ml.Como control se usó un bioestimulante comercial cuyo ingrediente activo es Bacillus. subtilis con una concentración de 1X108 células/ml. A continuación, se inocularon por extensión en placa 100 µl de las suspensiones bacterianas en placas Petri con agar nutritivo. El área de la placa se dividió en cuatro cuadrantes y se colocó un disco con agroquímico en el centro de cada cuadrante, correspondiente a las cuatro concentraciones evaluadas. Las placas fueron refrigeradas a 4°C durante la noche para permitir la difusión del agroquímico, posteriormente se incubaron a 30°C durante 48 horas. Transcurrido el tiempo de incubación, se midió en diámetro de inhibición para cada tratamiento. Se consideró positiva la resistencia si el diámetro del halo fue menor a dos mm con respecto al diámetro del disco. Tabla 1. Dosis recomendada por los fabricantes de los siete agroquímicos empleados en la evaluación in vitro de la resistencia a agroquímicos NOMBRE ACTIVO ABREVIACIÓN USO DOSIS RECOMENDADA BACTROL ESTREPTOMICINA BACT BACTERICIDA 2 mg/ml PROMYL BENOMILO PROM FUNGICIDA 1 mg/ml RIZOLEX TOLCLOFOS RIZOL FUNGICIDA 1.25 mg/ml AGRY-GENT GENTAMICINA AGRY BACTERICIDA 0.8 g/ml PULSOR THIFLUZAMIDE PULS FUNGICIDA 1% BUCKMAN TIOCIANATOMETILO BUCK BACT/FUNG 6% CERCOBIN TIOFANATOMETILO CERCO FUNGICIDA 1 mg/ml 5.7 ACTIVIDAD ANTAGONISTA CONTRA Streptomyces sp La rolla (scab) de la papa es una enfermedad económicamente importante, debido a las serias pérdidas que produce, y es causada por actinomicetos del género Streptomyces, su control químico no es deseable debido a la gran cantidad de efectos colaterales causados por los agroquímicos (Chen et al., 2017), por lo tanto, la búsqueda de opciones para el biocontrol de Streptomyces es necesario. Para la prueba se aisló el actinomiceto de lesiones típicas en tubérculos de papa, y fue purificado por siembra continua en medio extracto de malta. Para el aislamiento de Streptomyces sp., se recolectaron tubérculos con lesiones típicas, y fueron desinfectados superficialmente con hipoclorito de sodio al 1.5%, las muestras de papa con lesiones fueron cortadas en cubos de aproximadamente 1 cm3 y fueron maceradas en mortero con agua destilada estéril. Se tomó 1 ml de la suspensión y se inoculó en placas Petri de agar agua al 2%. Se incubaron a 28°C durante 10 días. Para la purificación se tomaron colonias con morfología característica y fueron sembradas en medio extracto de malta (Faucher et al., 1992). Para evaluar la actividad antagonista, se siguió la metodología de Bensidhoum et al., (2016). En placas Petri con medio PDA, en el centro se inoculó el patógeno (Streptomyces sp.) mediante picadura. Las bacterias seleccionadas fueron inoculadas a 2 cm del centro y en líneas de 2 cm de longitud de la siguiente manera (ver figura 1) Todos los tratamientos se realizaron por triplicado. Como control se usó el crecimiento de Streptomyces sin adición de bacterias. Las placas fueron incubadas a 30°C durante 120 horas, transcurrido el tiempo se midió el diámetro de la colonia de Streptomyces y se calculó el porcentaje de inhibición: %𝐼𝐼 = 𝐷𝐷𝐷𝐷 − 𝐷𝐷𝐷𝐷 𝐷𝐷𝐷𝐷 𝑋𝑋 100 Donde DC: Diámetro Streptomyces en el Control, DT: Diámetro Streptomyces en el Tratamiento Figura 1. Ensayo de antagonismo contra Streptomyces sp 5.8 EVALUACIÓN DE LAS BACTERIAS EN INVERNADERO 5.8.1 Cultivo de Papa (Solanum tuberosum) Las cepas seleccionadas previamente fueron evaluadas como promotoras de crecimiento vegetal en un cultivo de papa en invernadero, se realizó bajo la siguiente metodología: El experimento se llevó a cabo en un invernadero localizado en el municipio de Villa Guerrero, en el Estado de México (18°57'36.0"N 99°37'48.0"W). Para la preparación de los inóculos se propagaron las bacterias seleccionadas en un volumen de 5 L cuya concentración final fue aproximadamente a 1.5 x 108 UFC/ml Se probaron 10 tratamientos (ver tabla 2 y figura 2) sobre plántulas de papa en cepellón en un arreglo completamente al azar. Cada tratamiento se aplicó en un total de 450 plántulas de aproximadamente 50 días de edad. Los tratamientos fueron aplicados, justo después del trasplante, directamente sobre la base de cada plántula, con la ayuda de una bomba aspersora manual. Se distribuyó homogéneamente los 5L en las 450 plántulas en una sola aplicación. Tabla 2. Notación de los tratamientos en el cultivo de papa Figura 2. Distribución de los tratamientos aplicados en el experimento en papa Entre cada tratamiento se dejó un área aproximada de 200 plántulas sin tratamiento, lo que fue tomado como control absoluto. Como control negativo fue el medio de cultivo estéril y como control positivo se utilizó un producto comercial (PROBACIL) formulado con B. subtilis. Se realizaron muestreos a los días 15, 50 No. Tratamiento 1 CEPA 1 2 CEPA 2 3 CEPA 3 4 CEPA 4 5 CEPA 1 + CEPA 2 6 CEPA 3 + CEPA 4 7 CEPA 1 + CEPA 3 8 CEPA 2 + CEPA 4 9 Probacil (CONTROL POSITIVO) CONTROL ABSOLUTO SUELO SIN TRATAMIENTO y 70 después de la inoculación. En cada muestreo se tomaron al azar 10 plántulas por tratamiento y se registró la longitud y el peso de tallos y raíces, para el día 70, se midió el peso del tubérculo. 5.8.2 Cultivo de Jitomate (Solanum lycopersicum) Las cepas seleccionadas previamente fueron evaluadas también como promotoras de crecimiento vegetal en un cultivo de jitomate en invernadero, se realizó bajo la siguiente metodología: Para la preparación de los inóculos se propagaron las bacterias seleccionadas en un volumen de 1 L cuya concentración final sea aproximada a 1.5 x 108 UFC/ml El experimento se llevó a cabo en un invernadero localizado en el municipio de Tonatico, en el Estado de México (18°48'15.9"N, 99°39'44.3"W). Se probaron 10 tratamientos, de manera similar al experimento anterior (ver tabla 2) en un arreglo completamente al azar, sobre plántulas de jitomate. Cada tratamiento tuvo un total de 100 plántulas de aproximadamente 30 días de edad. Los tratamientos fueron aplicados, justo después del trasplante, directamente sobre la base de cada plántula, con la ayuda de una bomba aspersora manual. Se distribuyó homogéneamente el inóculo sobre las 100 plántulas en una sola aplicación. Se llevaron a cabo muestreos al día 45 y 90 después del trasplante, con la finalidad de monitorear algunos parámetros indirectos de crecimiento, debido a la imposibilidad de sacrificar plantas para registrar su peso, ya que las plantas estaban destinadas a varios ciclos de cosecha. En los muestreos se registró el grosor del tallo, así como el número de frutos. Para el día 90 se recolectaron los frutos y se registró su peso fresco y seco. 5.9 EVALUACIÓN DE CRECIMIENTO BACTERIANO EN DIFERENTES MEDIOS DE CULTIVO Con la finalidad de proponer a la empresa un medio de cultivo para la formulación del biofertilizante, se evaluó el crecimiento de las cepas aisladas en dos medios de cultivo a diferentes porcentajes de concentración, con la finalidad de encontrar un medio que permita el crecimiento a concentraciones mayores 108 UFC/ml, como alternativa más rentable al caldo nutritivo. Se utilizó como materia prima lixiviado de vermicomposta y digestato de estiércol de vaca. El lixiviado se obtuvo de un productor local de vermicomposta, la vermicomposta fue producida usando lombriz roja californiana alimentadas con residuos vegetales. El digestato usado fue de estiércol de vaca, de 30 días de digestión y con un porcentaje de sólidos totales de 7%. Se probaron soluciones acuosas en concentraciones de 5%, 10%, 20% y 40% en ambos casos. Para cuantificar el crecimiento bacteriano, se propagaron las cepas purificadas en caldo nutritivo hasta alcanzar una concentración de 1 x 108 UFC/ml, luego los cultivos fueron centrifugados ylas células fueron cosechadas y enjuagadas en solución salina estéril, y resuspendidas en un volumen igual de solución salina. Fueron inoculados con 20 µl de las suspensiones bacterianas lavadas en tubos falcon con 20 ml de los medios de cultivo a probar y se incubaron a 30°C, 120 rpm durante 48 horas. Transcurrido el tiempo se cuantificó el crecimiento bacteriano mediante la técnica de extensión en placa con agar nutritivo, con la finalidad de seleccionar el medio que permita un mayor crecimiento celular. 5.10 EVALUACIÓN DE DIFERENTES SOPORTES Y SU VIABILIDAD EN ALMACENAMIENTO Para proponer a la empresa cómo elaborar el biofertilizante, es necesario indicarle el soporte, para ello se evaluaron diferentes soportes o “presentaciones” del biofertilizante, se utilizó la siguiente metodología. Las bacterias seleccionadas para el desarrollo del biofertilizante fueron propagadas en medio líquido de lixiviado de vermicomposta al 5% e incubadas por 48 horas. Esta suspensión fue utilizada para todas las presentaciones evaluadas (suspensión inicial). Pasado el tiempo de incubación se cuantifico el crecimiento bacteriano por medio de siembra en placa. La primera presentación fue adsorbiendo las bacterias en Peat Moss, siguiendo la metodología de Rose et al., (2010). La turba Peat Moss comercial (Premier) fue molida hasta un tamaño de partícula menor a malla 100, posteriormente fue secada a en un horno a 60° C durante 48 horas. Transcurrido el tiempo la turba fue esterilizada en autoclave 121°C 20 minutos, enfriada, e incubada por 24 horas a 30°C y luego esterilizada de nuevo bajo las mismas condiciones. Se colocaron 50 g de turba estéril en bolsas tipo Ziplock desinfectadas, y se agregaron 50 ml de la suspensión bacteriana inicial (humedad final de 50%) y se homogenizó la mezcla. Otra presentación evaluada fue un producto seco obtenido mediante secado por aspersión. Se siguió la metodología modificada de Ananta et al., (2005). Para la preparación del medio a secar, se tomaron 200 ml de la suspensión bacteriana inicial y se agregaron 20 gramos de Malto dextrina, para obtener un porcentaje de sólidos totales de aproximadamente 10%. Para el secado se utilizó un secador marca Prendo, con un flujo constante 4.5 ml/min y una temperatura de aire de entrada de 100°C y una temperatura de salida de 80°C. Los sólidos secos fueron recuperados con un separador ciclónico y envasados en frascos de vidrio. Se cuantificó el número de bacterias por siembra en placa para determinar el porcentaje de supervivencia al proceso de secado. La suspensión bacteriana restante fue dividida en dos volúmenes iguales, y almacenados en frascos separados de polipropileno previamente esterilizados. A un frasco se le adiciono glicerol (10 g/l) para obtener dos presentaciones, una presentación líquida compuesta únicamente por la suspensión bacteriana y otra adicionada con glicerol para prevenir la desecación de las células bacterianas. Todas las presentaciones fueron almacenadas a una temperatura promedio de 25°C. El conteo bacteriano se realizó cada 30 días durante un periodo de 3 meses. 5.11 ANÁLISIS ESTADÍSTICOS Todos los datos fueron analizados mediante un ANOVA de una vía y comparación de medias por el método HSD de Tukey con una confianza del 95%. Se utilizó el paquete estadístico MiniTab 17 para realizar los análisis. 6 RESULTADOS 6.1 ENSAYO DE GERMINACIÓN Al analizar los datos de germinación, se obtuvo que de las 118 aislados probados, 13 era fitopatógenas, es decir, redujeron el desarrollo vegetal, 101 aislados tuvieron un efecto estadísticamente similar al control y 4 cepas que tuvieron un índice de vigor estadísticamente diferente al control, es decir estas cepas promovieron tanto la germinación como la elongación de la plántula (figura 3), por lo que fueron seleccionadas. Los resultados evidenciaron que las bacterias influyeron en la germinación y elongación de las semillas probadas, siendo las cepas presentadas en la tabla 3, las que tuvieron un mayor efecto positivo y con una diferencia estadística significativa respecto al control. Estas cepas fueron seleccionadas para ser usadas en el desarrollo del biofertilizante, y por lo tanto en los experimentos posteriores. Tabla 3. Resultados de ensayo de germinación (Índice de vigor relativo) CLAVE AISLAMIENTO IVR (%) ERROR STD CONTROL - 100 8.9149 c CEPA 1 Maíz 388.152 27.3737 a CEPA 2 Papa 333.452 39.3841 ab CEPA 3 Papa 394.279 48.7351 a CEPA 4 Papa 342.642 65.5395 ab El experimento anterior reveló una mejora significativa en las plántulas inoculadas con las bacterias probadas, para mejorar el establecimiento de los cultivos es requisito que las plántulas tengan mayor vigor y viabilidad, esto puede influenciar en el crecimiento y la productividad del cultivo (McDonald & Copeland, 1997). El incremento de la germinación y la elongación de la plántula son considerados efectos típicos de la aplicación exógena de fitohormonas, en particular giberelinas y auxinas (Mia et al., 2012). Saxena et al., (2013) encontraron resultados similares en plántulas de mijo (Pennisetum glaucum), al ser inoculadas con suspensiones de B. subtilis por 1 h, resultando en el incremento significativo en el índice de vigor, mayor al 100% respecto al control. Por otra parte, Mangmang et al., (2015), reportaron un aumento de hasta 9% en germinación y 110% en el índice de vigor, respecto al control, al inocular semillas de pepino (Cucumis sativus), con cepas de A. brasilense atribuyéndoselo particularmente a la producción de ácido indol acético por parte de las cepas PGPR. 6.2 SOLUBILIZACIÓN DE FOSFATOS Se midió la actividad solubilizadora de fósforo en las 4 rizobacterias seleccionadas. Todas las cepas probadas tuvieron la capacidad de solubilizar fósforo inorgánico, indicado por la presencia de un halo traslúcido en las placas con medio NBRIP. Hubo diferencia significativa entre las bacterias probadas. Las cepas 1, 2, 3 y 4 tuvieron un índice de solubilización de 3.07, 2.41, 3.25 7 2.17 respectivamente. De Figura 3. Ensayo de germinación de semillas de jitomate inoculadas con rizobacterias in vitro acuerdo con el análisis estadístico hay diferencia significativa entre las rizobacterias probadas. Los resultados e presentan en la tabla 4. Tabla 4. Índice de solubilización de fosfatos (PSI) Letras iguales indican que no hay diferencia significativa Otros autores han reportado índices de solubilización (PSI) en aislados bacterianos rizosféricos, valores entre 1.0 – 6.0, siendo las últimas excelentes bacterias solubilizando fósforo inorgánico (Ahemad et al., 2012, Chang & Yang, 2009, Muleta et al., 2013). Por tanto, las bacterias seleccionadas tienen una capacidad solubilizadora moderada. El aislado con mayor PSI fue la cepa 3 con una media de 3.25, sin embargo, no tuvo una diferencia significativa con la cepa 1, con una media 3.07 (ver figura 4). CLAVE PSI CONTROL Sin crecimiento - CEPA 4 2.17±0.05 a CEPA 2 2.41±0.02 a CEPA 1 3.07±0.16 b CEPA 3 3.25±0.19 b Figura 4. Solubilización de fósforo inorgánico en medio NBRIP El fósforo es un macronutriente elemental para el crecimiento y desarrollo de cualquier forma de vida, en los cultivos el fósforo es añadido en forma de fertilizante, sin embargo, el 99% es rápidamente convertido a formas insolubles, que no son asimilables por las plantas (Fernández et al., 2007), debido a esto el uso de bacterias solubilizadoras de fósforo (BSF) es una técnica menos costosa y sustentable para la sustitución de los fertilizantes fosfóricos (Sharma et al., 2009). En un estudio previo, Mehta et al., (2015), analizaron la composición elemental de plántulas inoculadas con una cepa de Bacillus solubilizadora de fosfatos, y encontró quehabía un aumento significativo mayor al 2% en la asimilación de fósforo, respecto al control sin inocular, concluyendo que el uso de BSF puede mejorar la nutrición vegetal y por tanto promover el crecimiento. 6.3 DETERMINACIÓN DE FITORREGULADORES La identificación de fitorreguladores por cromatografía en capa fina (TLC)evidenció que las 4 cepas produjeron AIA, sin embargo, no fue concluyente respecto a los estándares de GA y Kinetina por esta metodología. En la figura 5 se muestra la placa revelada con UV de onda corta (254 nm). En los carriles de izquierda a derecha: Extractos de CEPA1, CEPA 2, CEPA 3, CEPA 4, estándar de AIA, GA y Kinetina, Control negativo. Con luz UV de onda corta se puede observar claramente el estándar de AIA con un factor de retención (Rf) de 0.86, así como el estándar de Kinetina con un Rf de 0.27. En los carriles de muestras se observa un compuesto con un Rf igual al estándar de AIA y otras bandas con un Rf de 0.21 que no corresponden al estándar de Kinetina. Figura 5. TLC de los extractos bacterianos en luz UV de onda corta (254 nm) En la figura 6, la placa fue tratada con revelador de ácido sulfúrico y visualizada a luz UV de onda larga (365 nm), y se observó el estándar de GA con un Rf de 0.41, en los carriles de muestra, se pudo observar un compuesto muy tenue con un Rf de 0.40 muy similar al del estándar de GA. Los resultados pudieron confirmar la capacidad de las bacterias seleccionadas de biosintetizar fitohormonas. La producción de fitohormonas ha sido un mecanismo de acción de las PGPR’s muy estudiado y al que le han atribuido gran parte del efecto benéfico hacia las plantas. Figura 6. Revelado de TLC con ácido sulfúrico 5% y luz UV de onda larga (365 nm) Para el análisis cuantitativo se utilizó un equipo de cromatografía de alta resolución (HPLC) se construyeron curvas de calibración de los estándares para relacionar el área bajo la curva con la absorbancia de soluciones de cantidades conocidas del estándar, (10 – 120 µg/ml) (ver figura 7). Los compuestos con tiempo de retención igual al estándar fueron cuantificados, los resultados obtenidos se muestran en la tabla 5. Tabla 5. Cuantificación de fitohormonas por HPLC Cepa AIA (µg/ml) GA (µg/ml) Kinetina (µg/ml) CEPA 1 47.84 ±1.86 99.19 ±33.62 0 0 CEPA 2 29.11 ±2.86 66.60 ±8.05 0 0 CEPA 3 28.11 ±10.09 0.00 0.00 0 0 CEPA 4 23.83 ±5.85 41.86 ±8.34 0 0 Los resultados cuantitativos obtenidos por HPLC confirman los resultados observados en la placa cromatográfica (TLC). Las cuatro cepas fueron capaces de biosintetizar AIA, así como tres fueron capaces de producir GA. Ambas 2000150010005000 140 120 100 80 60 40 20 0 R-cuad. 99.6% Área C o n ce n tr ac ió n Kinetina Concentración = - 2.471 + 0.06045 Área 9008007006005004003002001000 140 120 100 80 60 40 20 0 R-cuad. 99.5% Área C o n ce n tr ac ió n GA Concentración = - 1.193 + 0.1483 Área 8007006005004003002001000 140 120 100 80 60 40 20 0 R-cuad. 99.4% Área C o n ce n tr ac ió n IAA Concentración = 2.142 + 0.1570 Área Figura 7. Curvas de calibración y cromatogramas de AIA, GA y Kinetina fitohormonas están implicadas en muchos procesos de crecimiento y diferenciación celular en las plantas, como promover germinación y elongación de plántulas, elongación radicular y de tallo. Aunque se han descrito muchos mecanismos para explicar la promoción de crecimiento vegetal en las PGPR’s, el principal mecanismo para explicar este efecto ha sido la habilidad de las bacterias de producir o metabolizar fitohormonas (Bashan & de Bashan, 2010). Las cuatro bacterias seleccionadas en este trabajo fueron capaces de sintetizar ácido indol acético y tres fueron capaces de sintetizar ácido giberélico En leguminosas el ácido indol acético (AIA) actúa promoviendo la formación de nódulos y simbiosis con bacterias del género Rhizobium, en otras plantas no noduladas, el AIA ha promovido el establecimiento de raíces laterales, así como la elongación de raíces principales. El ácido giberélico, pertenece a la familia de las giberelinas, es una fitohormona que regula diversos procesos como la germinación, la elongación del tallo, floración y maduración del fruto (Cassán et al., 2013). Lim & Kim, (2009), realizaron un experimento para evaluar el efecto del ácido indol acético producido por diversas cepas de Bacillus, purificaron las auxinas producidas por las bacterias y plantas de tomate y chile fueron tratadas, mostrando un aumento mayor al 20% en peso seco de tallos y raíces, comprobando así el efecto únicamente de la fitohormona producida por las bacterias. En un trabajo previo de Khan et al., (2012), aislaron hongos endofíticos que secretaban giberelina, los cuales fueron probados como promotores de crecimiento en una variedad mutante de arroz deficiente en la producción de GA, resultando en un incremento del 22% en largo del tallo y del 50% en el peso de la plántula, concluyendo que el uso de microrganismos productores de GA puede mejorar la productividad de cultivos de importancia económica. 6.4 EVALUACION DE LA TOLERANCIA A AGROQUÍMICOS La evaluación in vitro de la resistencia de las rizobacterias a siete agroquímicos mostro que las cuatro bacterias evaluadas fueron capaces de crecer en presencia de los agroquímicos a concentraciones superiores a la dosis recomendada (tabla 6), en comparación con el control, que en la mayoría de casos donde su crecimiento fue inhibido por la acción de los plaguicidas. Estos resultados nos indican que la CEPA 1, CEPA 2 y CEPA 4 pueden ser utilizadas como inoculantes en suelos que contengan o utilicen los agroquímicos probados, y su crecimiento no será afectado negativamente. La CEPA 3 es sensible a dos agroquímicos usados, Rizolex y Promyl. Tabla 6. Tolerancia a agroquímicos de las cepas aisladas BACT PROM RIZOL AGRY PULS BUCK CERCO 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 1 2 3 4 CEPA1 - - - + + + + + + + + + - - - + - + + + - + + + - + + + CEPA2 - - + + + + + + + + + + - - - + - + + + - + + + - + + + CEPA3 - - + + - - - - - - - - - - + + - - + + - - + + + + + + CEPA4 - - + + + + + + + + + + - - - + - + + + - + + + - + + + CNTRL - - - - - - - - - - - + - - - - - - - + - - - + - - - + +: Crecimiento -: Inhibición 4:1X 3:10X 2:100X 1:1000X El uso extensivo de agroquímicos y la contaminación causada por estos afectan negativamente todo el ecosistema del suelo, reduciendo germinación de semillas, rendimiento de cultivos y alterando el metabolismo de plantas como de microrganismos, a su vez afectando las comunidades microbianas y el reciclado de nutrientes (Dimkpa et al., 2009). En un trabajo similar, Patil et al., (2017), reportaron una cepa silvestre de Pseudomonas, la cual es resistente a diversos plaguicidas, con diversas actividades PGPR, y que fue capaz de aumentar la germinación y altura de la planta en suelos contaminados con agroquímicos. Con esto se demuestra la utilidad de aislar microrganismos benéficos de suelos contaminados con diversos agroquímicos, debido a que las bacterias que no estén adaptadas a estas condiciones podrían limitar su crecimiento. 6.5 ACTIVIDAD ANTAGONISTA CONTRA Streptomyces sp El ensayo de antagonismo contra Streptomyces sp. (ver figura 8) mostró que tres cepas (CEPA 1, 2 y 4) fueron capaces de inhibir el crecimiento del patógeno en un porcentaje de reducción de crecimiento de 37%, 59% y 63% respectivamente, en cuanto a la CEPA 3, no fue capaz de inhibir el crecimiento del patógeno cuyo diámetro fue igual al control (tabla 7). Tabla 7. Inhibición de Streptomyces Tratamiento Diámetro (cm) % Inhibición Control 0.9 ± 0.1 a - CEPA 4 0.333 ± 0.05 c 63% CEPA 1 0.366 ± 0.05 c 59% CEPA 2 0.566 ± 0.05 b 37% CEPA
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