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Di r ecci ó n:Di r ecci ó n: Biblioteca Central Dr. Luis F. Leloir, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales, Universidad de Buenos Aires. Intendente Güiraldes 2160 - C1428EGA - Tel. (++54 +11) 4789-9293 Co nta cto :Co nta cto : digital@bl.fcen.uba.ar Tesis Doctoral Identificación de la proteína quinasaIdentificación de la proteína quinasa dependiente de calcio isoforma 3 dedependiente de calcio isoforma 3 de Solanum tuberosum (StCDPK3):Solanum tuberosum (StCDPK3): estudio genómico, transcripcional yestudio genómico, transcripcional y bioquímicobioquímico Grandellis, Carolina 2011 Este documento forma parte de la colección de tesis doctorales y de maestría de la Biblioteca Central Dr. Luis Federico Leloir, disponible en digital.bl.fcen.uba.ar. Su utilización debe ser acompañada por la cita bibliográfica con reconocimiento de la fuente. This document is part of the doctoral theses collection of the Central Library Dr. Luis Federico Leloir, available in digital.bl.fcen.uba.ar. It should be used accompanied by the corresponding citation acknowledging the source. Cita tipo APA: Grandellis, Carolina. (2011). Identificación de la proteína quinasa dependiente de calcio isoforma 3 de Solanum tuberosum (StCDPK3): estudio genómico, transcripcional y bioquímico. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Cita tipo Chicago: Grandellis, Carolina. "Identificación de la proteína quinasa dependiente de calcio isoforma 3 de Solanum tuberosum (StCDPK3): estudio genómico, transcripcional y bioquímico". Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. 2011. http://digital.bl.fcen.uba.ar http://digital.bl.fcen.uba.ar mailto:digital@bl.fcen.uba.ar UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES Facultad de Ciencias Exactas y Naturales Identificación de la proteína quinasa dependiente de calcio isoforma 3 de Solanum tuberosum (StCDPK3): estudio genómico, transcripcional y bioquímico Tesis presentada para optar al título de Doctor de la Universidad de Buenos Aires en el área: CIENCIAS BIOLOGICAS Autor: Lic. Carolina Grandellis Directora de tesis: Dra. Rita M Ulloa. Consejera de estudios: Dra. Sara Maldonado Lugar de trabajo: Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular (INGEBI - CONICET) Lugar y fecha Buenos Aires, 2011 Serendipity Agradecimientos Blanca y Jorge Grandellis Ceci Chapi CONICET Danita Dari Grandellis David Hannapel el Doc Euge Eze Fede Fer Bravo Francisca Gaby Soto Gladis Gusty Grandellis Ignacio INGEBI Irma Jorge Muschietti José Chema José Gerde Laurita Grandellis Leti Llera Andrea Lu López Lula M. Laura Magalí Mari Marianas Marina Marina A Mary Matías Mauro Mercedes Rivero Mirtha Flawia Naty Noe Noé Durán Norma Norma Paulis Rita Romi Fox Romi Rebozzio Ruben Ruben Sabi Salito Sandra Sara Maldonado Sergio Feingold Susana Alvarado Tere Tía Monona Tian Lin Tim Vero Vilma Virginia H Resumen Identificación de Solanum tuberosum proteína quinasa dependiente de calcio 3 (StCDPK3): estudio genómico, transcripcional y bioquímico Las CDPKs acoplan un sensor de calcio a un dominio quinasa y coordinan respuestas fisiológicas frente a estímulos. StCDPK3 codifica una CDPK funcional homóloga a isoformas de tomate y tabaco. Se amplificó el gen StCDPK3 (11366 pb), se generó y purificó la proteína recombinante y se determinaron sus parámetros cinéticos. Antagonistas de calmodulina disminuyen la actividad de 6xHisStCDPK3. La proteína recombinante se autofosforila y fosforila histonas. Se generó un anticuerpo policlonal que detecta a StCDPK3 en extractos particulados de hojas. StCDPK3 se expresa en respuesta a PGA y ABA, pero disminuye en respuesta a GA. Líneas transgénicas de fusión del promotor a GUS indican que es activo en hojas, raíces, ojos y brotes de minitubérculos y en estolones elongantes. La actividad GUS disminuye tras la elongación del estolón previo al inicio del crecimiento radial y aumenta en tubérculos tempranos. El factor de transcripción NtRSG es fosforilado por NtCDPK1. Se subclonó su homólogo en papa que es fosforilado in vitro por 6xHisStCDPK3. Además, StCDPK3 fosforila a StABF1. StCDPK3 podría participar en la transducción de señales asociada a procesos de crecimiento y elongación durante el desarrollo del tubérculo (modelo I), el desarrollo de raíces y brotes (modelo II) y como quinasa específica del FT StRSG (modelo III). Palabras clave: StCDPK – transducción de señales – autofosforilación –fitohormonas - proliferación Abstract Identification of Solanum tuberosum calcium dependent protein kinase 3 (StCDPK3): genomic, transcriptional and biochemical studies. CDPKs couple calcium sensors to a kinase domain, and coordinate physiological responses to stimuli. StCDPK3 encodes an active CDPK homologous to tobacco and tomato isoforms. The gene was amplified (11366 bp), the recombinant protein was produced and kinetic parameters were evaluated. Calmodulin antagonists, CPZ and 48/80 reduce 6xHisStCDPK3 activity. The recombinant protein autophosphorylates and is able to phosphorylate histones. A policlonal antibody was produced that detected StCDPK3 in particulate extracts from leaves. StCDPK3 is induced in response to PGA and ABA, but is reduced after GA treatment. Transgenic lines carrying the StCDPK3promotor fused to GUS displayed GUS activity in leaves, roots, minitubers eyes, sprouts and in elongating stolons. When stolon elongation ceases before the onset of radial growth, GUS activity was downregulated to be later detected in early tubers. NtRSG is a transcription factor (TF) phosphorylated by NtCDPK1. The potato homologue, StRSG, was subcloned. In vitro, 6xHisStCDPK3 could phosphorylate NtRSG and StRSG, and an ABA transcription factor, StABF1, suggesting that these TFs could be endogenous targets of the kinase. StCDPK3 could play a role in elongation and proliferation events associated to tuber development (model I), root and sprout growth (model II) and as a specific kinase for StRSG (model III). Keywords: StCDPK – plant signaling – autophosphorylation- phytohormones – proliferation Índice Introducción general 1 Introducción 1 Objetivo general: 1 Objetivo específico e Hipótesis 1 Transducción de señales 1 Transducción de señales en vegetales 2 Mecanismos de fosforilación en vías de transducción de señalización 3 El calcio como segundo mensajero en organismos vegetales 4 Regulación del catión calcio en plantas 4 Superfamilia de las Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio y Quinasas relacionadas a SNF1 6 Subfamilia de las Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio (CDPKs) 7 Regulación de las CDPKs mediada por calcio, fosforilación reversible y autofosforilación, fosfolípidos y proteínas 14-3-3 7 Regulación por iones calcio 8 Regulación por fosforilación reversible y autofosforilación 9 Regulación por fosfolípidos 9 Regulación por proteínas 14-3-3 10 Funciones de las CDPKs durante el crecimiento, desarrollo y diferenciación, en respuesta a hormonas 10 Funciones de las CDPKs durante el crecimiento, desarrollo y diferenciación 10 Funciones en respuesta a hormonas 11 Identificación de sustratos de CDPKs y sistemas de señalización 12 Modelo de trabajo: el cultivo Solanum tuberosum 14 Brotación del tubérculo de Solanum tuberosum 16 Formación del tubérculo en Solanum tuberosum 17 Los fitocromos sensan la longitud del día 18 Las giberelinas demoran la tuberizacion 19 Síntesis de GAs en tejidos aéreos 20 Las giberelinas poseen un efecto local en el estolón 21 Efecto del ABA sobre la tuberización 22 Efecto de sacarosa sobre la tuberización 22 Familia de factores de transcripción de tipo BEL1 enSolanum tuberosum: un modelo para el transporte del RNA 22 La familia de los factores de transcripción BEL1 y KNOX de Solanum tuberosum 22 Resultados 24 Capítulo 1 24 Objetivo 24 Antecedentes de la línea de investigación 24 Obtención de la secuencia codificante completa del gen StCDPK3 a partir de una biblioteca de cDNA 24 Alineamiento entre secuencias codificantes de StCDPKs1-5 26 Obtención de anticuerpos específicos anti-StCDPK3 28 Análisis de la secuencia aminoacídica de StCDPK3 28 Resumen capítulo 1 29 Capítulo 2 30 Objetivo 30 Consorcio de Secuenciación del Genoma de papa (PGSC: Potato Genome 30 Sequencing Consortium) Análisis del gen StCDPK3 32 Estrategias de subclonado de StCDPK3 32 Screening de una biblioteca genómica de papa construida en vectores BACs (Bacterial Artificial Chromosome) 32 Identificación y confirmación por PCR de los BACs 33 Amplificación de intrones de StCDPK3 33 Análisis de intrones, sitios de splicing y señal de poliadenilación 36 Análisis del contenido GC de CDPKs 37 Resumen capítulo 2 37 Capítulo 3 38 Objetivo 38 Caracterización bioquímica de StCDPK3 38 Obtención de la proteína recombinante 6xHisStCDPK3 38 Ensayos de Western blot con anticuerpos anti-StCDPK3 y anti-His 39 Caracterización Bioquímica de 6xHisStCDPK3 40 Actividad enzimática in vitro de 6xHisStCDPK3 40 Análisis de la dependencia de calcio sobre la actividad CDPK en sobrenadantes de cultivos 40 Efecto de diferentes Inhibidores o antagonistas de calmodulina sobre la actividad de 6xHisStCDPK3. 41 Ensayos de fosforilación de diferentes sustratos e inhibidores 41 Determinación de Parámetros cinéticos 42 Determinación de concentración de calcio suficiente para obtener actividad enzimática de 6xHisStCDPK3 44 Ensayos de Fosforilación de Histona y auto-fosforilación en gel de StCDPK3 His6x: 45 Predicción de sitios de fosforilación in silico 46 Ensayo de autofosforilación de 6xHisStCDPK3 mediante electroforesis de geles bidimensionales (2D) 47 Evaluación del anticuerpo en extractos proteicos de plantas 50 Resumen capítulo 3 53 Capítulo 4 54 Objetivo 54 Estudios de expresión de la isoforma StCDPK3 54 Expresión tisular de StCDPK3 en plantas de papa Solanum tuberosum y en diferentes estadios de desarrollo de una planta\ 54 Ensayo de RT-PCR semicuantitativa 54 Ensayo de Northen Blot 55 Expresión de StCDPK3 en condiciones de estreses bióticos y abióticos 56 Fitohormonas 56 Giberelinas (GA), Acido Indol Acético (AIA), Ácido Absícico (ABA 56 Estrés biótico 58 Ácido poligalacturónido (PGA) 58 Estrés abiotico 59 Híper-osmótico (NaCl), bajas temperaturas y oscuridad 59 Expresión de StCDPK3 durante la brotación de la papa 59 Resumen capítulo 4 60 Capitulo 5 62 Objetivo 62 Estrategias utilizadas para identificar la región promotora de StCDPK3 62 Amplificación de región promotora de StCDPK3 62 Ensayo de RACE 5´para determinar el sitio +1 de transcripción 64 Análisis in sílico de la región promotora de StCDPK3 64 Amplificación del promotor de StCDPK1 66 Generación de líneas transgénicas de papa fusionando promotor a gen reportero 67 Construcción del plásmido binario 67 Transformación mediada por A. tumefaciens 69 Chequeo de líneas transgénicas mediante PCR 71 Ensayo histoquímico de GUS y ensayo fluorométrico de actividad beta- glucuronidasa 72 Ensayo de actividad beta-glucuronidasa fluorométrico 72 Ensayo de actividad beta-glucuronidasa histoquímico 73 Ensayo histoquímico en plantas propagadas in vitro 73 Ensayo histoquímico en minitubérculos obtenidos in vitro y en plantas de invernadero: 74 Rusticación y fenotípico de las plantas transgénicas 75 Resumen capítulo 5 76 Capítulo 6 78 Objetivo 78 Ensayos de actividad quinasa in vitro con posibles sustratos de CDPKs 78 Homología de secuencia y posibles sustratos 79 Sustratos de CDPKs 81 Nicotiana tabacum REPRESSION OF SHOOT GROWTH (RSG): Factores de transcripción de la familia bZIP de plantas 81 Ensayos de fosforilación para determinar si StCDPK3 es capaz de fosforilar a NtRSG 82 Amplificación de Solanum tuberosum RSG (StRSG) 83 Subclonado y expresión de la proteína recombinante StRSG 85 Análisis de la Estructura Genómica de StRSG 85 Fosforilación de StRSG mediado por StCDPK3 in vitro 86 El factor de transcripción ABF (Factor de unión a ABRE: elemento de respuesta a ABA) es fosforilado por CDPKs de Arabidopsis. 87 Ensayos de fosforilación de StABF1 mediado por 6xHisStCDPK3 88 Ensayo de movilidad electroforética en gel (EMSA) con StABF1 y 6xHisStABF1 89 Resumen capítulo 6 90 Capítulo 7 92 Introducción 92 Familia de factores de transcripción de tipo BEL1: un modelo para el transporte del ARN 92 La familia de los factores de transcripción BEL1 de Solanum tuberosum 92 Identificación de nuevas isoformas BELs 93 Objetivos 93 Resultados 93 Nuevos miembros de la familia BEL1 de Factores de Transcripción 93 Amplificación nuevos miembros de la familia BELs 94 Alineamiento entre StBEL5 y las nuevas isoformas stBEL6 y StBEL33 95 Análisis de RT-PCR de los nuevos genes BELs 97 Estudio de interacción ente miembros de la familia BELs y proteínas KNOX 98 Evaluación de interacción de los nuevos genes StBELs con proteínas Knox. 99 Ensayo de actividad beta-galactosidasa cuantitativo 101 Interacción de las nuevas isoformas BELs con proteínas Knox de tabaco 102 Resumen capítulo 7 102 Conclusiones 104 Materiales y Métodos 110 1. Cepas bacterianas 106 Escherichia coli 106 Condiciones de cultivo 106 Transformación de células competentes de E. coli por shock térmico. 106 Preparación de células termo-competentes de E. coli. 106 Transformación de células termo-competentes de E. coli. 106 Agrobacterium tumefaciens 106 Cepas y condiciones de cultivo. 110 Transformación de células competentes de A. tumefaciens 111 Preparación de células competentes de Agrobacterium tumefaciens 111 Transformación de células competentes de A. tumefaciens 111 2. Material vegetal 111 Medio de multiplicación 111 Sistema de tuberización in vitro 112 Plantas en invernadero 112 Micropropagación de plantas in vitro 112 Generación de Líneas de plantas de papa transgénicas 112 Tratamientos estreses abióticos y bióticos 112 3. Metodología del ADN recombinante 112 Plásmidos 112 Oligonucleótidos iniciadores 113 Mini preparación de ADN plasmídico 115 Purificación de ADN plasmídico utilizando kits comerciales: 115 Purificación de fragmentos de ADN a partir de geles de Agarosa. 115 Amplificación de insertos por PCR 115 Digestiones con enzimas de restricción 115 Reacciones de ligación 115 Cuantificación del ADN y ARN 116 4. Localización cromosómica de StCDPK3 116 5. Extracción de proteínas 116 Extracción de proteínas para western blot 116 Extracción de proteínas para ensayo fluorométrico de GUS 116 Cuantificación de proteínas totales 117 6. Generación de plantas transgénicas por transformación de plantas mediante Agrobacterium tumefaciens 117 Transformación mediada por Agrobacterium tumefaciens 117 Reactivos utilizados para la transformación 117 Extracción de ADN genómico de plantas transgénicas 118 PCR para chequeo de plantas transgénicas. 118 Rusticación 118 7. Expresión y purificación de proteínas recombinantes 118 Purificación de proteínas recombinantes de fusión a GST: 119 Purificación de proteínas recombinantes de fusión a His: 119 8. Producción de anticuerpos anti-NTV-StCDPK3 119 9. Southern, Northern y Western Blots 120 Ensayos de Southern blot 120 Ensayo de Northern Blot 120 Marcado radiactivo de las sondas 121 Ensayo de Western blot 121 10. Metodología del ARN 121 Extracción de ARN mediante RNeasy Plant Mini Kit y RT-PCR mediante kit SuperScript® III One-Step RT-PCR 121 Extracción de ARN mediante TRizol 122 Determinación de la calidad del ARN 122Tratamiento con DNAsa 122 Síntesis de cDNA 122 11. Ensayos de actividad CDPK 123 Ensayos de Fosforilación de StRSG in vitro 123 Ensayo de movilidad electroforética en gel (EMSA) 124 12. Ensayos con levaduras 124 Medios de Levaduras 125 125 Transformación de levaduras 125 Determinación de actividad enzimática de beta-galactosidasa 125 Ensayo de tinción GUS (actividad β-glucuronidasa) 125 Ensayo fluorométrico de actividad β-glucuronidasa. 125 13. Electroforesis Geles 2D 126 Ensayos de autofosforilación y fosforilación 126 14. Bioinformática 127 Bibliografía 128 ANEXO I 133 ANEXO II 137 ANEXO III 139 ANEXO IV 143 1 Introducción general Introducción Objetivo general: Estudiar procesos de transducción de señales durante el desarrollo de la planta de papa Solanum tuberosum y en respuesta a diferentes estímulos. El proceso de conversión de señales o estímulos en respuestas específicas permite descifrar el comportamiento biológico de los organismos y ampliar el conocimiento sobre ellos. Objetivo específico: Estudiar a nivel génico, bioquímico y proteico a StCDPK3 (Solanum tuberosum Proteína Quinasa dependiente de calcio 3). El calcio es un segundo mensajero importante en plantas implicado en procesos de transducción de señales. Las proteínas quinasas dependientes de calcio (CDPKs) sensan las elevaciones transitorias del catión y generan respuestas especificas en diferentes células y frente a distintas señales. Los objetivos particulares se detallan a continuación: Identificar y amplificar la secuencia codificante completa del gen StCDPK3 a partir de una biblioteca de cDNAs Expresar y purificar la proteína recombinante en bacterias Caracterizar enzimáticamente a StCDPK3 Identificar y analizar la secuencia genómica del gen StCDPK3 y determinar su localización cromosómica. Analizar las secuencias intrónicas y exónicas Amplificar las secuencias promotoras de StCDPK3 y construcción de un plásmido de fusión al gen reportero GUS. Ensayo de RACE 5’ para determinar sitio de inicio de transcripción. Obtener un anticuerpo policlonal especifico contra StCDPK3 Determinar la expresión del gen en tejidos, estadios de desarrollo y en respuesta a diversas señales o estímulos mediante tinción de GUS, Northen blot y RT-PCR Búsqueda de posibles sustratos de StCDPK3 basada en reportes previos para CDPKs homólogas Identificar y amplificar al factor de transcripción REPRESSION OF SHOOT GROWTH (RSG). Expresar el factor de transcripción recombinante en sistema bacteriano. Inducción y expresión de la proteína recombinante Evaluar de la capacidad de StCDPK3 recombinante de fosforilar a los sustratos StRSG y StABF. Hipótesis El gen StCDPK3 se expresa diferencialmente durante el ciclo de vida de la planta de papa y responde a estímulos bióticos y abióticos. Codifica para una proteína CDPK activa que participa en procesos de transducción de señales Transducción de señales La capacidad que poseen las células para percibir y actuar frente a señales a través de su membrana es fundamental para la vida. En organismos multicelulares, células que poseen diferentes funciones intercambian una gran variedad de señales. Las células vegetales responden a hormonas de crecimiento y a variaciones de la intensidad lumínica, por ejemplo. En células animales, las células intercambian información sobre las concentraciones iónicas y de glucosa en fluidos extracelulares, o también sobre la distribución celular correcta durante el desarrollo embrionario. En todos los casos, la señal representa información que es detectada por receptores específicos y son convertidos a una respuesta celular, que siempre involucra un proceso químico. Esta conversión de la información en un proceso químico, se denomina transducción de la señal y es una propiedad universal de las células. A menudo el resultado 2 final de una vía de señalización es la fosforilación de unas pocas proteínas blanco, que modifican su actividad y como consecuencia, la actividad de la célula (Lehninger, Cap. 12, 3 Ed. 2002) Transducción de señales en vegetales Las plantas superiores son organismos sésiles que perciben estímulos del ambiente como por ejemplo la luz y señales químicas, y responden a esos estímulos modificando su actividad celular. Las vías de señalización utilizan una red compleja de interacciones para coordinar respuestas bioquímicas y fisiológicas como la floración, maduración de frutos, germinación, regulación de la fotosíntesis y desarrollo de brotes y raíces, entre otros procesos. De esta forma, al detectar una señal o estímulo, éste es transmitido a través de una vía de transducción, luego genera cambios en la actividad de factores de transcripción, y coordina modificaciones en la expresión de genes. En la Fig. 1.1 se describen la mayoría de las señales con las cuales las plantas tienen que lidiar durante su ciclo de vida, y antes las cuales deben generar respuestas que le permitan sobrevivir. Fig 1.1. Listado de señales endógenas y exógenas que funcionan como estímulos en plantas y generan una vía de transducción de señales que culmina con una respuesta específica (Gilroy y Trewavas, 2001) Como los animales, las plantas vasculares poseen mecanismos de comunicación entre tejidos que coordinan y dirigen el crecimiento y desarrollo, para adaptarse a las condiciones de oxígeno, nutrientes, luz, temperatura y para advertir la presencia de químicos nocivos y patógenos. Algunos mecanismos de señalización en plantas son conservados entre animales, como por ejemplo proteínas quinasas, proteínas de andamiaje, nucleótidos cíclicos, bombas iónicas electrogénicas, y canales iónicos regulados por voltaje. Algunos otros mecanismos, son similares a los sistemas bacterianos de dos componentes, y otros son únicos en plantas, como 3 aquellos para sensar las condiciones lumínicas, quinasas que fosforilan residuos serina o treonina, fosfatasas, proteínas de andamiaje que coordinan la formación de complejos proteicos, enzimas para la síntesis y degradación de nucleótidos cíclicos, y 100 o más canales iónicos (aproximadamente 20 son activados por nucleótidos cíclicos). También se encuentran en plantas fosfolípidos inositoles, y quinasas que interconvierten estos lípidos por fosforilación. Por otro lado, las proteínas G heterotriméricas y proteínas tirosina quinasas son mucho menos predominantes en los genomas de plantas, como también los receptores esteroides nucleares, de unión a DNA, que probablemente están ausentes en vegetales. A pesar de que las plantas carecen del sistema de rodopsina, que posee retinal como pigmento para sensar las luz, tienen una colección de otros mecanismos sensores de la luz que no se encuentran en los genomas animales, como los fitocromos y los criptocromos. Por otro lado, poseen otros compuestos que generan respuestas específicas y son similares a algunos compuestos animales: en vez de prostaglandinas, poseen jasmonatos; y en vez de hormonas esteroides, poseen brasinosteroides. Los brasinosteroides inactivan a la quinasa CTR-1, que a su vez activa una cascada de MAPK que conduce a la activación del factor de transcripción EIN3 (Insensible a Etileno 3). Este factor de transcripción induce la síntesis de ERF1 (Factor de Respuesta a Etileno), que activa genes de respuesta a etileno. Durante el curso de la evolución, el receptor de etileno de las plantas vasculares derivó de una cianobacteria endosimbionte, y la proteína quinasa de histidina bacteriana, se transformó en la proteína serina/treonina quinasa de plantas. Mecanismos de fosforilación en vías de transducción de señalización La condición de sésiles ha impedido que los organismos vegetales puedan escapar de condiciones ambientales cambiantes de forma repentina, y en consecuencia han desarrollado mecanismos para sensar estos cambiosy adaptar su fisiología, crecimiento y desarrollo a tales condiciones. Estas adaptaciones, involucran reacciones que deben ser rápidas y dinámicas, es decir, las actividades enzimáticas y modificaciones en los programas de expresión génica deben ser adecuados temporalmente para permitirle sobrevivir a condiciones adversas o cambios ambientales. Los procesos post-traduccionales de fosforilación y desfosforilación de proteínas son un mecanismo común en todos los organismos, que ha sido exitoso por su rápidez de acción. La fosforilación se realiza a través de la actividad de enzimas quinasas que típicamente están integradas a una cascada de señalización. Se estima que un 30% de las proteínas de una célula eucariota es fosforilado y el 5% del genoma de las plantas codifica para proteínas quinasas, indicando la importancia de esta modificación a nivel celular (Colcombet y Hirt, 2008). Las interacciones proteína-proteína tienen roles fundamentales en procesos celulares, como por ejemplo procesos de transducción de señales, ciclo celular, regulación metabólica, conformación proteica, etc. Además, la regulación de estas interacciones en tiempo y espacio definido es esencial para que el organismo sobreviva. Una de las vías más importantes que permiten regular estas interacciones proteína-proteína es a través de modificaciones post- traduccionales, entre ellas, la fosforilación resulta un mecanismo primordial. La fosforilación reversible de residuos amino acídicos específicos puede generar cambios en la conformación y en la carga de las moléculas. Estos cambios pueden conducir a la generación de sitios activos de acoplamiento de otras moléculas, o a la activación o inactivación de enzimas (Tufan et al, 2010). La fosforilación de proteínas es entonces un mecanismo conservado y básico en los organismos vivos que les permite sobrevivir a lo largo de su ciclo de vida. El calcio como segundo mensajero en organismos vegetales 4 El calcio representa el ion más versátil en organismos eucariotas. Está involucrado en casi todos los aspectos del desarrollo de una planta y participa en muchos procesos regulatorios. Debido a su flexibilidad para presentar diferentes números de coordinaciones y geometrías complejas, el calcio fácilmente forma complejos con proteínas, membranas y ácidos orgánicos. Además, esta característica le confiere al catión toxicidad celular a concentraciones elevadas, debido a que rápidamente formaría complejos insolubles con los grupos fosfatos de la célula. Por otro lado, el hecho de que la concentración de calcio espacial y temporal sea altamente coordinada y regulada, quizás ha concretado el camino evolutivo hacia la emergente señalización mediada por este catión cuya concentración es tan variable. El primer reporte acerca de la importancia del calcio en plantas se realizó en el alga verde de género Chara, y demostró que existen cambios en la concentración citosólica de calcio, que indican una función como segundo mensajero. A partir de ese reporte, numerosos artículos han demostrado que aumentos transientes de la concentración citosólica del catión están involucrados en una amplia gama de procesos fisiológicos, que incluyen respuesta a estreses abióticos, hormonas, y patógenos. Varios grupos además han reportado que cambios concretos en la concentración de calcio citosólica se disparan ante otros segundos mensajeros como ácido nicotínico dinucleótido fosfato (NAADP), Inositol trifosfato (IP3), Inositol hexafosfato (IP6), Esfingosina-1-fosfato, y ADP ribosa cíclica (cADPR). También se verificó que la identidad y la intensidad de un impulso específico del estímulo, resulta en una alteración de la concentración de calcio que es específica de ese estímulo y dinámica. La heterogeneidad de aumentos en la concentración citosólica de calcio libre en términos de duración de la señal, amplitud y frecuencia, han llevado a A.M. Hetherington a formular el IoミIepto de さCalcium signaturesざ o さsellosざ, Iu┞a defiミiIióミ es さcarácter peculiar o especial de algo, que lo hace diferente de los demásざ. Estos さsellosざ, Hasados eミ las difeヴeミtes aマplitudes, frecuencia y concentración, resultan en una respuesta específica para un estímulo. Las investigaciones surgidas posteriormente sugieren que aunque la distribución en forma y espacio de los aumentos de la concentración de calcio son críticos e importantes para la respuesta al estímulo, un nivel de regulación adicional y también importante lo constituyen las proteínas de unión a calcio, que funcionan como proteínas sensoras de calcio. Estas proteínas son capaces de decodificar y liberar la información codificada en las さsignatures” o さsellosざ, y la liberan en forma de interacciones proteína-proteína, cascadas de fosforilación definidas o respuestas transcripcionales (Kudla et al, 2010) Brevemente, la información procesada por las células de los organismos consiste en la percepción de un estímulo y continúa con una respuesta fisiológica apropiada. La propagación y amplificación de estas señales incluye la generación de cambios rápidos en los niveles subcelulares de segundos mensajeros. Los segundos mensajeros, como el Ca2+, los nucleótidos monofosfato cíclicos, los inositoles polifosfato, y otras moléculas pequeñas, transmiten la señal alterando el comportamiento de proteínas celulares específicas. Estos segundos mensajeros entonces transducen el estímulo a efectores río abajo que pueden ser enzimas, proteínas del citoesqueleto, factores de transcripción, etc. Estos efectores son los responsables de los cambios en la expresión de genes y de expresión de proteínas, cambios en la actividad metabólica y en el patrón de desarrollo (Defalco et al, 2010) Regulación del catión calcio en plantas La concentración de calcio se encuentra fuertemente regulada por transportadores (Fig 1.2). En condiciones normales la concentración citosólica de calcio se mantiene baja (100-200 nM) debido a que a elevadas concentraciones resulta tóxico. Como consecuencia, se establece un 5 gradiente de concentración considerablemente alto entre el citosol y los reservorios del catión. En células vegetales, la vacuola central es el principal reservorio intracelular. La hipótesis sobre la señalización de calcio sugiere que existe un patrón de influjo del catión espacial y temporal, y que este influjo codifica información que coordina una adecuada respuesta celular. La señal de calcio se define como el balance entre la activación de su canales en diferentes membranas celulares, que se sigue de la inactivación de esos canales y la activación de transportadores para finalizar el influjo de calcio y rebalancear la homeostasis celular, ambos procesos están regulados estrictamente (Kudla et al, 2010). En la Tabla 1.1 se detallan los canales y transportadores que generan el influjo y la salida (efflux) de calcio. Influjo de calcio Salida de calcio Canales dependientes de voltaje en la membrana plasmática Canales gatillados por ligando en la membrana plasmática Canales dependientes de voltaje en la membrana vacuolar Canales gatillados por ligando en membranas vacuolares y del retículo endoplasmatico Antiporters calcio-proton ATPasas-P Tabla 1.1. Canales y transportadores que median la liberación y captura de calcio en las células vegetales Las señales de calcio son parte de un lenguaje intracelular que permite la comunicación entre células. Estas señales necesitan esencialmente decodificadores que traduzcan la información que contienen. Para lograr esta necesidad, las plantas utilizan una batería de CBPs (Calcium Binding Proteins o Proteínas de Unión a Calcio) que sensan las señales, sufren cambios conformacionales y permiten la interacción río abajo con los demás efectores de la cascada de señalización. El motivo estructural de unión a calcio más común encontrado en proteínas se denomina EF-hand. Este motivo, altamente conservado, consiste en29 aminoácidos con una estructura hélice-giro-hélice. Se asemeja a una mano con el dedo índice y el pulgar extendido en ángulos rectos al resto de los dedos, enroscada hacia la palma formando la curvatura o loop. La curvatura (loop) consiste en 12 aminoácidos con residuos que coordinan al calcio. La unión de calcio genera cambios conformacionales que exponen bolsillos hidrofóbicos. A su vez estos sitios facilitan la interacción con otras proteínas. Estos motivos ocurren típicamente en pares y facilitan la unión a calcio de alta afinidad de forma cooperativa. Fig 1.2 Esquema de los sistemas transportadores de calcio en una célula de Arabidopsis thaliana. Las vías de flujo del catión Ca2+ que han sido identificadas a nivel molecular son: canales activados por 6 nucleótidos cíclicos (CNGC), Receptores de Glutamato (GLR), canales de dos poros 1 (TPC1), Receptor sensor de Ca2+ (CAS), ATPasa autoinhibida por calcio, ATPasa de calcio tipo ER (ECA), ATPasa de metales pesados 1 (HMA1), y el intercambiador catiónico (CAX). (Kudla et al, 2010). Superfamilia de las Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio y Quinasas relacionadas a SNF1 La superfamilia de las CDPK-SnRK consiste en 7 tipos de proteínas quinasas serina/treonina: Proteinas Quinasas dependientes de Calcio (CDPK) Quinasas relacionadas con CDPK (CRKs) Quinasas fosfoenolpiruvato carboxilasas (PPCKs) Quinasas relacionadas a quinasas PEP carboxilasa (PEPRKs) Proteinas Quinasas dependientes de calmodulina (CaMKs) Proteinas quinasas dependientes de calcio y calmodulina (CCaMKs) SnRKs Dentro de esta superfamilia, las isoformas individuales contienen dominios regulatorios característicos, localizaciones subcelulares y especificidad de sustratos. Las CDPKs y al menos una SnRK en Arabidopsis han sido implicadas en decodificar senales de calcio (Hrabak, 2003). Las señales de calcio generan respuestas fisiológicas a traves de las interacciones con proteínas blancos, muchas de las cuales contienen motivos EF-hand. En plantas, al menos hay 5 clases o subfamilias de proteínas quinasas, pertenecientes a la familia CDPK/SnRK, que contienen EF- hands en su estructura o interaccionan con proteínas con este motivo. Las CDPKs y las CCaMKs contienen motivos EF-hands en sus dominios C-terminales. Las SnRK3s (grupo 3 de las quinasas relacionadas a SNF-1) unen proteínas que contienen 3 EF-hands, y algunas son activadas por calcio directamente. Algunos miembros de las clases de quinasas CaMK y CRK, unen calmodulina pero se desconoce si su actividad esta modulada por calcio/calmodulina (Harmon, 2003). Las 5 subfamilias representadas en el diagrama (Fig 1.3 y 1.4) son reguladas por calcio directa o indirectamente. Dos subfamilias unen calcio (CDPK y CCaMK) y tres (CCaMK, CaMK and CRK) unen calmodulina. Una subfamilia, (SnRK3) une calcineurina y proteínas tipo-B (CBL). Fig 1.3 Superfamilia de las CDPKs y SnRK (Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio y Quinasas relacionadas a SNF1): se detallan en el diagrama las 5 subfamilias pertenecientes a esta superfamilia de proteínas: CDPK (Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio), CCaMK (Quinasas reguladas por Calcio o Calcio/Calmodulina), CaMK (Quinasa dependiente de Calcio/Calmodulina), CRK (Quinasas dependientes de CDPK) y SnRK3 (Quinasas relacionadas a SNF1 tipo III) (Hrabak et al., 2003) Superfamilia de las CDPK/SnRK CDPK Proteínas Quinasas dependientes de Calcio CCaMK Quinasas reguladas por Calcio o Calcio- Calmodulina CaMK Quinasas dependientes de Calcio/Calmodulina CRK Quinasas relacionadas con CDPK- SnRK3 Quinasa relacionada con SNF1 Tipo 3 7 Fig 1.4. Diagrama de las 5 subfamilias quinasas. En violeta se representó el dominio amino terminal (NTV); en rosa el dominio quinasa; en negro el dominio autoinhibitorio, que posee sitios de unión para interaccionar con calmodulina (CCaMKs y algunas CRKs) o con el dominio regulatorio (CDPKs), en celeste el dominio regulatorio que puede ser: tipo visinina, con 3 motivos EF-hands (CCaMKs) o CBL binding (SnRK3) o similar a calmodulina (CDPKs). Las CRKs presentan sitios EF-hands degenerados o no funcionales; y en rojo el dominio C terminal variable. Subfamilia de las Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio (CDPKs) Dentro de la superfamilia de las CDPKs/SnRK se encuentran las Proteínas Quinasas Dependientes de Calcio, o CDPKs. Las CDPKs son proteínas monoméricas, con un peso molecular que oscila entre 40-90 KDa. Consisten en 5 dominios, un dominio amino terminal variable (NTV), un dominio quinasa, un dominio autoinhibitorio, un dominio regulatorio (tipo calmodulina: CaM-LD) y un dominio carboxilo terminal de longitud variable (Harmon, 2003). Las CDPKs presentan la característica única de acoplar el sensor de calcio directamente a una respuesta. Las CDPKs están presentes en plantas, ciliados, y algunos parásitos del género Apicomplexa (Wurzinger et al, 2011) Regulación de las CDPKs mediada por calcio, fosforilación reversible y autofosforilación, fosfolípidos y proteínas 14-3-3 Regulación por iones calcio Motivo EF-hand degenerados Tipo visinina Motivo Asociado Dominio de uniὀn a CBL Motivo EF-hand Dominio Quinasa Dominio Regulatorio Dominio Bisagra (Autoinhibitorio) CDPK CRK CCaMK CaMK SnRK3 8 El calcio es la principal molécula reguladora de las CDPKs. Los motivos EF-hand presentan diferencias en el número y en la secuencia de aminoácidos, generando que distintas isoformas de CDPKs presenten diferentes afinidades por el catión. Las isoformas de CDPK de soja denominadas α ┞ γ poseeミ uマHヴales de aItivaIióミ poヴ IalIio ケue difieren en más de 10 veces ふla isofoヴマa α pヴeseミta uミ uマHヴal de aItivaIióミ マu┞ Hajo de apヴo┝iマadaマeミte ヶヰマM de calcio). En la actualidad co-existen dos modelos (KliマeIka ┞ Musz┞ムska, ヲヰヰΑ) que explican la activación de las CDPKs por calcio (Fig 1.5): Fig 1.5. Mecanismo propuesto de activación de CDPKs. 1- El primer modelo propone que el dominio tipo calmodulina (CaM-LD), que contiene dos lóbulos (N y C terminales) cada uno conteniendo dos motivos EF-hand, se une al dominio quinasa a través de una cadena (tether) flexible. Si se genera una señal de calcio, el CaM-LD se una al dominio bisagra liberando el autoinhibidor y activando la quinasa. 2- El segundo modelo propone que el dominio CaM-LD se encuentra unido previamente al dominio bisagra cuando los niveles de calcio en la célula son basales. El lóbulo C- terminal del dominio regulatorio posee dos iones Ca2+unidos. Cuando el lóbulo N- terminal une otros dos iones Ca2+ se produce la activación. Este modelo se encuentra respaldado por las evidencias más actuales. El Kd propuesto para el lóbulo N-terminal es de 1 M, consistente con este modelo. Se propone que la conformación del lóbulo N-terminal se modifica cuando une calcio e induce un cambio conformacional en la interacción del dominio autoinhibitorio con el dominio quinasa. Fig 1.6. Mecanismo propuesto para la activación y representación esquemática. La medialuna azul representa el dominio quinasa inactivo. La medialuna con un ángulo representa el dominio quinasa activo. Los pequeños círculos representan los lóbulos N y C terminales del CAD (Dominio de Activación por Calcio). Las líneas magenta y celeste representan CH1 y CH2 (hélice 1 y 2). Por otro lado, recientemente se ha determinado la primera estructura de CDPKs activada por calcio e inactivada de Apicomplexa, un protista. La unión del calcio dispara un cambio 9 conformacional extenso que constituye un nuevo mecanismo de plegamiento del motivo EF- hand. El CAD (CDPK activated domain o dominio activado por CDPK), contiene 4 motivos EF- hand y el dominio bisagra (junction). En la forma inactiva, cada par de motivos EF-hands forma un lóbulo, y los dos lóbulos se encuentran separados entre sí por dos hélices largas, denominadas CH1 y CH2. Esta área ocluidadel sitio activo es el dominio quinasa (KD: Kinase Domain). La unión de calcio dispara entonces una reorganización del dominio de unión a calcio hacia un plegamiento altamente intrincado, que lo aleja del sitio catalítico (Fig 1.6). Los autores sugieren que este mecanismo puede ser común a las CDPKs de diferentes especies, pero las estructuras deben des descriptas en cada caso particular para comprobar tal afirmación (Wernimont et al, 2011). Además, quisieron determinar si el mismo mecanismo es común a otras CDPKs, y para esto resolvieron otras estructuras de CDPKs, incluyendo una de la especie Plasmodium. Las proteínas CpCDPK3-CAD (Cryptosporidium parvum, un protista) y PfCDPK-CAD (Plasmodium falciparum, también protista) fueron capturadas en un posible intermediario conformacional, que aporta información sobre el orden de los pasos de activación. PfCDPK3- CAD adopta un plegamiento activado, a pesar de contener una secuencia EF-hand inactiva en su lóbulo amino terminal. En este trabajo proponen que las CDPKs de Apicomplexa poseen un modo de activación similar (Wernimont et al, 2011). Regulación por fosforilación reversible y autofosforilación Las proteínas CDPKs pueden regularse por fosforilación, ya sea mediada por quinasas río arriba de una vía de señalización, o por autofosforilación. Por ejemplo, en la proteína NtCDPK2 (tabaco), la serina 40 y la treonina 65 son fosforiladas en respuesta a estrés. Esta fosforilación resulta en un incremento de su actividad en 10-200 veces. La treonina 65 sufre autofosforilación in vivo intra-molecular, y la serina 40 es blanco de una proteína quinasa río arriba. Además se requiere que NtCDPK2 localice en membrana para que sea fosforilada, indicando otro nivel de regulación. NtCDPK3 es fosforilada al menos en 2 sitios en el dominio NTV por quinasas río arriba, primero en la serina 54 y en otro sitio aún no identificado (Witte et al, 2010). Se ha observado autofosforilación de CDPKs tanto nativas como recombinantes. Se han definido algunos sitios de autofosforilación de CDPKs pero se desconoce su función fisiológica. Por ejemplo, la autofosforilación in vitro de una CDPK de maní (Arachis hipogea) es necesaria para su activación, sin embargo, la autofosforilación de WbCDPK (Psophocarpus tetragonolobus) la transforma en una CDPK inactiva. También, cuando WbCDPK se incuba con una fosfatasa activa in vitro, la CDPK recupera su actividad (KliマeIka ┞ Musz┞ムska, 2007). Regulación por fosfolípidos Además del calcio, cuando determinados fosfolípidos se encuentran en el citosol, hay un aumento de la fosforilación mediada por CDPKs in vitro. Esto se ha demostrado para avena en CDPKs parcialmente purificadas (Schaller et al, 1992), AtCPK1 de Arabidopsis (Harper et al, 1993), DcCPK1 de zanahoria (Daucus carota,) (Farmer & Choi, 1999) y ZmCPK11 de maíz (Zea mays) (Szczegielniak et al., 2000; 2005). La estimulación de la actividad CDPK mediada por fosfolípidos sugiere que la asociación con las membranas celulares podría modificar su actividad. Debido a que diferentes CDPKs específicamente son estimuladas por diferentes fosfolípidos, se considera que estos efectos tienen una relevancia fisiológica. Existe evidencia que muestra que estos fosfolípidos actúan como segundos mensajeros en transducción de señales y podrían ser moléculas efectoras. http://www.thesgc.org/structures/2QG5/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Witte%20CP%22%5BAuthor%5D 10 Regulación por proteínas 14-3-3 En muchos casos se ha observado que las proteínas blanco fosforiladas deben asociarse a una proteína adaptadora especializada, también denominadas proteínas de andamiaje (scaffold), para completar la transmisión de la señal. La proteína adaptadora más conocida es la proteína 14-3-3. Existen en A. thaliana 12 isoformas de 14-3-3, 3 de ellas son capaces de unir y activar a AtCPK1 in vitro y en presencia de calcio. AtCPK1 contiene un sitio en el dominio N-terminal que es similar al motivo consenso de unión de las proteínas 14-3-3. Este sitio consenso consiste en R-S/T-X-S-X-P (Arg-Ser/Thr-X-Ser-X-Pro, donde X es cualquier aminoácido), y la Serina resultaría fosforilada. Además, otras dos CDPKs de Arabidopsis, AtCPK24 y AtCPk28 también poseen esos sitios Ioミseミso ふKliマeIka ┞ Musz┞ムska, ヲヰヰΑぶ. Funciones de las CDPKs durante el crecimiento, desarrollo y diferenciación, en respuesta a hormonas Funciones de las CDPKs durante el crecimiento, desarrollo y diferenciación Muchos procesos de desarrollo y crecimiento en plantas son regulados por influjos de calcio. Algunos estreses abióticos como estrés oxidativo e hiposmótico aumentan la concentración citosólica de calcio en la línea de células de tabaco BY-2, lo cual retrasa el progreso del ciclo celular. Un estudio realizado en zanahoria demuestras que el calcio aumenta la frecuencia embriogénica y su privación detiene la formación de embriones somáticos. Además, se detectó la acumulación de una CDPK soluble de 55 KDa solamente en embriones somáticos, cigotos, endosperma y plántulas de sándalo (Santalum album). Esta CDPK, al poseer una expresión tejido específica y regulada durante el desarrollo, podría estar involucrada en procesos como la embriogénesis, el desarrollo de las semillas y la germinación. Otro ejemplo sucede en arroz, donde una CDPK denominada SPK se expresa de forma exclusiva en el endosperma de las semillas inmaduras, sugiriendo que están involucradas en las vías biosintéticas de productos de almacenamiento. Esta hipótesis se confirmó utilizando SPK antisentido, y se observó que no acumulaban productos de almacenamiento, como por ejemplo almidón y en cambio, estas líneas de plantas antisentido para SPK producían semillas con gran concentración de sacarosa. Esto demuestra que SPK es una quinasa de la enzima sacarosa sintasa que podría ser importante para la biosíntesis de productos de almacenamiento (Asano et al, 2002) Por otro lado, la germinación y crecimiento del tubo polínico requiere una reorganización intensa del citoplasma y del citoesqueleto. Se cree que estos procesos son dependientes de calcio. Al estudiar células del tubo polínico de Agapanthus umbellatus, esta hipótesis fue confirmada. Para ello, se demostró una elevada actividad de proteína quinasas en la región apical del tubo, mientras que el resto de las células del tubo, que no presentaban crecimiento activo, mostraban una actividad quinasa uniforme (Moutinho et al., 1998). En Solanum tuberosum, la tuberización es un proceso de desarrollo complejo que resulta en la diferenciación de un tallo especializado, el estolón; en un órgano de almacenamiento: el tubérculo. Estímulos hormonales y ambientales están involucrados en la inducción de la tuberización. Además, es necesaria la presencia de calcio intracelular para este proceso, ya que antagonistas de calmodulina lo inhiben. Se han estudiado isoformas de CDPKs durante la tuberización. Dos actividades CDPKs, StCDPK1 y StCDPk3 poseen diferente distribución celular y se encontraron asociadas con estadios de desarrollo distintos, StCDPK3 se expresa en estolones tempranos en elongación, y StCDPK1 se expresa durante el desarrollo del ápice del estolón (Raíces y col, 2003). Estos datos sugieren la activación secuencial de CDPKs específicas con diferentes propiedades bioquímicas, coordinando las múltiples señales de calcio que se disparan al inicio del proceso de tuberización (Raíces y col, 2003) 11 Funciones en respuesta a hormonas Las CDPKs modulan las respuestas generadas por fitohormonas, generalmente por giberelinas (GAs), citoquininas y auxinas. Uno de los primeros ejemplos y mejor documentado lo constituye la influencia de las giberelinas sobre la actividad CDPK en semillas de arroz tratadas con esta hormona. La actividad quinasa de la CDPK de arroz parcialmente purificada, resultó ser 10 veces mayor que en las plantas control. Además, el tratamiento con la fitohormona generó un aumento delARNm de otra isoforma de CDPK presente en plántulas de arroz, denominada OsCDPK13 (Abbasi et al, 2004). Por otro lado, en tabaco, se observó una acumulación del ARNm de NtCDPK4 luego del tratamiento con GA. Esta acumulación de los niveles del transcripto alcanzó un máximo a los 60 minutos y luego retornó a sus niveles iniciales en un lapso posterior de 2 hs. También en células de aleurona de cebada, las GAs influyen sobre la expresión de HvCDPK1 (Hordeum vulgare). En plantas que expresaban una forma inactiva de HvCDPK1, resultó inhibida la secreción, la vacuolación celular y la acidificación vacuolar. Se postuló en dicho estudio que HvCDPK1 podría funcionar como regulador de eventos post-transcipcionales asociados con la secreción celular (McCubbin et al, 2004). Un sistema de regulación diferente se observó en raíces de arroz: las raíces fueron tratadas con bajas temperaturas y se detectó una disminución en la actividad de una CDPK de peso molecular aproximado de 45 KDa. Esta disminución en la actividad no se detectaba frente al tratamiento exógeno de la fitohormona ácido abscísico (ABA). Estos datos sugieren que la actividad de esta proteína quinasa de 45 KDa es regulada por ABA y está involucrada en la respuesta a estrés por bajas temperaturas en arroz (Komatsu, 2001). Otro ejemplo lo aportan estudios realizados en ACPK1 (Proteína Quinasa estimulada por ABA 1) del mesocarpio de la uva (Vitis vinifera x V. labrusca), donde ABA estimuló la actividad quinasa y aumentó los niveles del ARNm, aunque no simultáneamente. La estimulación de la actividad CDPK fue rápida (luego de 15 minutos de tratamiento con ABA) y sugiere que esta enzima medía la respuesta temprana. Se postula que ABA está asociada a modificaciones post- traduccionales de la CDPK. Además, el tratamiento provocó un aumento en los niveles del ARNm. Los autores sostienen que ACPK1 podría poseer un rol en la vía de señalización mediada por ABA pero asociada al desarrollo de la planta. En tabaco, también se encontró que GA y ABA generan una acumulación del ARNm de NtCDPK1 luego de 12 hs de tratamiento con cada fitohormona. Las auxinas también regulan la expresión y la actividad de las CDPKs. En hojas de tabaco tratadas con ácido indol acético (AIA), se corroboró un leve aumento en los niveles del transcripto de NtCDPK1, mientras que el tratamiento de plantas de mung bean (Vigna radiate) con esta auxina generó una disminución en los niveles del ARNm, alcanzando un máximo a las 6 hs de tratamiento. A su vez, en suspensiones de microcallos de alfalfa (Medicago sativa), tratadas con la auxina sintética ácido 2,4-dichlorofenoxiacético, se observó la acumulación de un transcripto de CDPK. El nivel máximo del ARNm de MsCPK3 se encontró luego de 2 hs del comienzo del tratamiento. En hipocotilos de pepino, se detectó actividad de una CDPK de 50 KDa luego del tratamiento con AIA. Las citoquininas también modifican los niveles del transcripto CsCDPK3 de pepino, y este efecto es diferente en distintos órganos vegetales. El tratamiento con bencil-adenina (una citoquinina sintética) regula positivamente a los niveles del ARNm de esta quinasa en cotiledones en oposición a un efecto inhibitorio (regulación negativa) en raíces. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Abbasi%20F%22%5BAuthor%5D http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22McCubbin%20AG%22%5BAuthor%5D http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Komatsu%20S%22%5BAuthor%5D 12 Una observación importante se realizó en arroz, donde se estudió un receptor de brasinosteroides, denominado BRI1 y su influencia sobre la actividad CDPK y MAPK. La aplicación exógena de brasinosteroide aumentó la actividad de MAPK y CDPKs. En plantas control y líneas de plantas transgénicas antisentido para OsBRI1 sólo se evidenció un aumento en la actividad CDPK, pero no en la actividad MAPK. Esto sugiere que los brasinosteroides pueden activar una CDPK a través de un receptor diferente de BRI1. Por último, la fosforilación de proteínas dependiente de calcio está involucrada en la respuesta a etileno. La hormona etileno está involucrada en varios procesos fisiológicos como maduración del fruto, abscisión de las hojas y senescencia, y también en respuesta a estreses ambientales como daño e invasión por patógeno (KlimeIka ┞ Musz┞ムska, ヲヰヰΑぶ. Identificación de sustratos de CDPKs y sistemas de señalización Las células deben tener mecanismos que mantengan la especificidad de la señalización mediada por calcio y de esa forma evitar entrecruzamientos (crosstalks) con diferentes vías. La especificidad individual de cada CDPK puede estar determinada por calcio, sensibilidad a lípidos, patrón de expresión, regulación post-transcipcional y secuencias amino acídicas. Además, varios motivos proteicos en los sustratos pueden aumentar la selectividad de las quinasas. Sin embargo los motivos encontrados generalmente son ambiguos y son insuficientes para explicar la especificidad de reconocimiento (Itoh et al, 2011). Varios estudios sobre mutantes pérdida de función y genes knockeados sugieren que cada isoforma de CDPK en plantas posee una función fisiológica distinta, tales como respuesta a estrés, estrés oxidativo, respuesta a GA, crecimiento del tubo polínico y regulación de estomas. La búsqueda de proteínas que interaccionan con el dominio NTV de CDPKs ha sido liderada por ensayos de dos híbridos o por Purificación de Afinidad en Tándem (TAP), aunque se han identificado solamente unos pocos sustratos. Estas técnicas pueden ayudar a entender los roles fisiológicos de cada CDPK y la compleja red de señalización mediada por calcio en plantas (Itoh et al, 2011). Por ensayos de dos híbridos, se ha demostrado que el dominio NTV de AtCPK32 participa en la interacción con el factor de transcripción ABF4, y McCDPK1 (Mesembryanthemum crystallinum) también interacciona con su sustrato, CSP1 (Proteína sustrato de CDPK 1) (Itoh et al, 2011; Pathatkar y Cushman, 2000). La primera evidencia concluyente que ha logrado definir una vía de señalización entre la activación de CDPKs y la inducción de una respuesta in vivo se realizó en tabaco. Se aislaron 2 cDNAs, denominados NtCDPK2 y 3, cuyos trancriptos aumentan luego de aplicar elicitores de defensa y estrés hiperosmótico. El elicitor Avr9 generó la respuesta más pronunciada. La función de NtCDPK2 se investigó utilizando plantas silenciadas para esta isoforma, que presentaron un fenotipo de respuesta hipersensible reducida y demorada. El silenciamiento se correspondió con una pérdida de la acumulación del ARNm de la CDPKs (Romeis et al., 2001). Otros trabajos de Romeis indican que una elevada señalización de CDPK compromete la activación de MAPKs inducidas por estrés, lo cual permite sugerir que las vías de CDPKs y MAPKs no son independientes y que es necesaria una regulación de ambas vías coordinada para controlar la especificidad de las respuestas a estreses bióticos y abióticos. En otros ejemplos, AtCPK3 y AtCPK6 de Arabidopsis participan en la regulación del cierre de estomas, en respuesta al ABA y al aumento en la concentración exterior de calcio. Además, en mutantes dobles y simples de cdpk3 y cdpk6, resultó afectada la permeabilidad de los canales permeables a calcio de la membrana plasmática de células de la guarda. Estos canales se activan por calcio y por ABA. Además, CPK4 y CK11 son críticas para la respuesta a ABA en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Itoh%20T%22%5BAuthor%5D http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Itoh%20T%22%5BAuthor%5D 13 células de la guarda, debido a que fosforilan al ABF1 y ABF4 in vitro, que son factores de transcripción de respuesta a ABA. También en tabaco se ha demostrado que la CDPK1 regula la transcripción del factor de transcripción RSG (Represión del crecimiento del brote: REPRESSION OF SHOOT GROWTH) en respuesta a giberelinas. La fosforilación de la Serina 114 del RSG mediada por NtCDPK1 promueve la interaccióncon proteínas 14-3-3, que regulan la localización intracelular de este factor de transcripción. En estudios posteriores realizados en tabaco, demostraron que el dominio NTV de NtCDPK1 le confiere actividad de quinasa específica de RSG, a una proteína heteróloga de Arabidopsis, AtCPK9 (para esto generaron una proteína quimera con el dominio NTV de tabaco y el resto de los dominios de AtCPK9). AtCPK9 no es capaz de fosforilar a RSG en su forma salvaje. Este hallazgo sugiere que el reconocimiento del sustrato por una CDPK sucede en una región independiente del dominio catalítico quinasa (Itoh et al, 2011), y probablemente sea en el dominio variable N terminal. Otros trabajos en Solanum tuberosum (papa) sugieren que StCDPK4 y StCDPK5 fosforilan a la enzima NADPH oxidasa y de esa forma regulan la producción de especies reactivas de oxigeno (ROS). Realizaron una expresión ectópica de un mutante activo constitutivo de StCDPK5 que provocó la producción de ROS en hojas de N. benthamiana. Esta producción de ROS se interrumpió al realizar un knock down de CDPK5 (Yoshioka, 2009). En síntesis, estos trabajos apuntan hacia un rol crítico de las CDPKs en diversos procesos biológicos (Kudla et al, 2010). Todo lo mencionado anteriormente se resume en la Fig 1.7. Fig 1.7. El sistema de señalización mediado por CDPK para traducir las signatures de calcio en fosforilación de proteínas. RSG: factor de transcripción (Repression of Shoot Growth), ABF: factor de transcripción de respuesta a ABA, (ABA response element binding factor). (Kudla et al, 2010). http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Itoh%20T%22%5BAuthor%5D http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=%22Yoshioka%20H%22%5BAuthor%5D 14 Modelo de trabajo: el cultivo Solanum tuberosum La papa (Solanum tuberosum L.) es un miembro de las Solanaceas, una familia importante económicamente que incluye tomate, pimienta, berenjena, petunia y tabaco. La papa ocupa un rango eco-geográfico amplio, y es uno de los cultivos más importantes entre los que producen estolones, que bajo condiciones ambientales apropiadas generan tubérculos. Su producción alcanzó en el ano 2009, 300 millones de toneladas (http://www.fao.org). Los tubérculos son una fuente importante dietaria de almidón, proteínas, antioxidantes y vitaminas, y a su vez ofrece un sistema de propagación vegetativa (http://www.nature.com/ nature/journal/v475/n7355 /full/nature10158.html) Las plantas de papa tuberizan bajo condiciones de días cortos y noches frías. La tuberización es un proceso morfo-fisiológico altamente coordinado que ocurre en estolones subterráneos, bajo la influencia de factores extrínsecos e intrínsecos. En la planta de papa, cada brote del tubérculo posee el potencial para tuberizar (Sarkar, 2008). La tuberización es un proceso de desarrollo único de algunas especies de Solanaceas, que bajo condiciones favorables se diferencian a órganos especializados subterráneos, o tubérculos. Los tubérculos son tallos subterráneos modificados, con entrenudos muy pequeños engrosados y hojas pequeñas subyacentes a los brotes axilares u さojosざ del tuHéヴIulo. Los tubérculos cumplen una función doble, como órganos de almacenamiento y como un sistema de propagación vegetal. En la Fig 1.8 se muestra un esquema del ciclo de vida de la planta de papa. Fig 1.8. Ciclo de vida de Solanum tuberosum Luego de un periodo invernal de dormición, los brotes axilares se reactivan y crecen para producir una planta genéticamente igual a la planta madre. Los tubérculos funcionan como órganos perpetuos de estas especies anuales, acumulan gran cantidad de almidón, poseen bajo contenido de grasas y un contenido proteico alto, similar al de los cereales. A su vez poseen la ventaja de una composición nutricional más equilibrada de amino ácidos esenciales. Un tubérculo de tamaño mediano provee la mitad de los requerimientos diarios de vitamina C. 15 Debido a sus propiedades nutricionales y a la facilidad de propagación, la papa es el tercer cultivo más importante en el mundo luego del arroz y el trigo en términos de consumo humano (http://www.cipotato.org/potato). Es procesado además para la obtención de almidón y alcohol (Tabla 1.2). Los tubérculos se forman en la región subapical de estructuras tipo tallos o estolones, que se desarrollan en la base del tallo principal. En condiciones no inductoras de la tuberización, los estolones crecen como tallos horizontales y, si son expuestos a una cantidad suficiente de luz, se tornan verdes y emergen del suelo para forman nuevos brotes. Durante este proceso, el estolón adquiere todas las características de un tallo principal, formando raíces y hojas y eventualmente, floreciendo. Bajo condiciones de bajas temperaturas o de días cortos, la elongación de los estolones se detiene y el ápice del estolón comienza a engrosarse para formar un tubérculo. Las etapas de formación del tubérculo han sido clasificadas en 8 estadios (Fig 1.9) (Kloosterman et al, 2005). Fig 1.9. Estadíos de tuberización obtenidos de plantas crecidas en macetas (arriba). Representación esquemática del desarrollo del tubérculo que consiste de 8 estadios de desarrollo que involucran un total de 25 días en condiciones inductoras de la tuberización (días cortos, 8 hs de luz) (abajo) (Kloosterman et al, 2005). El engrosamiento del ápice se correlaciona con una expansión y división celular radial de las células localizadas en la médula y en la corteza de la parte subapical del estolón. Subsecuentemente, se suceden rondas de división celular aleatoria y expansión de las células de la región perimedular, que contribuye a aumentar el tamaño del tubérculo. Estos cambios en la división celular están acompañados por un cambio definido en el programa de desarrollo de las células meristemáticas subapicales del estolón. Este cambio determina a la planta hacia la formación del tubérculo. El crecimiento del meristema también es determinado, y la división celular se detiene luego de unos pocos ciclos. El mecanismo de さdescargaざ de sacarosa cambia de apoplástico a simplástico, y disminuye la actividad de una enzima invertasa de pared celular. Esto se acompaña de un aumento rápido en la actividad de la enzima sacarosa sintasa y fructoquinasa. Durante la fase de crecimiento inicial y rápido, los tubérculos acumulan http://www.cipotato.org/potato 16 compuestos de almacenamiento, principalmente en forma de almidón y proteínas (por ejemplo, patatina e inhibidores de proteasas), que sirven como fuente de energía a la futura planta. En su hábitat natural, la diferenciación de los tubérculos de papa ocurre en otoño o invierno temprano, dependiendo del genotipo. Estos tubérculos nuevos atraviesan un periodo de inactividad o endodormición, que se caracteriza por la ausencia de crecimiento de brotes, aún si son expuestos a condiciones inductoras de la tuberización. Este periodo fisiológico dura unos pocos meses y asegura la supervivencia de la planta durante las bajas temperaturas del invierno. La brotación del tubérculo es un fenómeno deseado cuando se requieren tubérculos semilla, en cambio, no se desea durante el almacenamiento, debido a que reduce la vida del tubérculo post-cosecha y disminuye su calidad nutricional (Rodríguez-Falcon et al, 2006). Papa-Solanum tuberosum Nutrición Un tubérculo de tamaño mediano contiene aproximadamente la mitad del requerimiento diario de un adulto de vitamina C, es bajo en grasas ya que contiene solo 5% del contenido graso del trigo y un cuarto las calorías que contiene el pan. Hervida, la papa contiene más proteínas que el maíz, y dos veces más de calcio. Historia Solanum tuberosum se originó en las montañas de América del sur donde se ha consumido por más 800 años. Los explorados españoles introdujeron la planta en Europa a fines de la década 16 como una curiosidad botánica. Para el siglo 19 ya se había extendido a toda Europa, proveyendocomida abundante y económica para los trabajadores de la revolución industrial. Producción global Actualmente la papa es el cuarto cultivo más importante en el mundo, con una producción anual que alcanza las 300 millones de toneladas. Más de un tercio de la producción de papa proviene de países en desarrollo (en 1960 solo el 11% provenía de dichos países). http://www.cipotato.org/potato/ Tabla 1.2. Características nutritivas del cultivo Solanum tuberosum, historia y producción (http://www.cipotato.org/potato/) Brotación del tubérculo de Solanum tuberosum Luego de su formación, los tubérculos atraviesan un periodo de dormición que se caracteriza por la ausencia de brotes visibles. El estado de dormición comienza cuando se detiene la actividad meristemática durante la tuberización. La duración del periodo de dormición depende del trasfondo genético y es afectado por condiciones pre y post-cosecha. Al comienzo de la brotación del tubérculo, el mismo se vuelve una fuente de crecimiento para el brote en desarrollo. Esto se asocia con cambios estructurales y metabólicos y con cambios en los patrones de expresión génica. Además, las fitohormonas tienen un rol importante en la regulación y ruptura de la dormición (brotación). Las giberelinas (GAs) y las citoquininas (CKs) están involucradas en la ruptura de la dormición, mientras que el ABA y el etileno se han asociado con el mantenimiento de este proceso. En cuanto al efecto de auxinas, hay estudios que demuestran que la concentración de AIA libre en brotes disminuye durante la dormición, otros estudios de inmunolocalización sugieren que AIA podría estimular el crecimiento del brote promoviendo procesos de diferenciación tempranos. Se ha identificado el gen de respuesta a auxina ARF6 (auxin response factor family) como un marcador de la reactivación del meristema en tubérculos. En los años 50s ya existían indicios de que las GAs eran capaces de romper la dormición de los tubérculos. Estudios posteriores detectaron un aumento en la concentración de sustancias 17 similares a las GAs al comienzo de la brotación, sugiriendo que esta fitohormona regula este proceso. De todas formas, la función de las GAs en la brotación continúa siendo controversial, debido a que estudios cuantitativos demostraron altos niveles de GA1 y GA20 (forma bioactiva predominante) sólo en tubérculos que ya presentaban brotes activos, y en proceso de elongación. Además, la manipulación de los niveles endógenos de GA a través de la expresión ectópica de GA20 oxidasa1 y GA2 oxidasa1, no alteró el proceso de dormición, indicando que las GAs podrían ejercer mayor influencia durante sobre la brotación que durante la ruptura de la dormición. Las CKs pueden inducir de forma rápida la brotación en tubérculos en dormición. Se ha demostrado que hay un aumento de los niveles endógenos de CKs antes de la ruptura de la dormición, especialmente en los brotes apicales, laterales y en el tejido circundante. A nivel celular, la dormición se caracteriza por un arresto en la fase mitótica G1 de las células meristemáticas, demostrado a través de microdensitometría y medidas en citometría de flujo. Para la terminación de dicha fase se requieren unas ciclinas tipo D (CycD). Tres grupos de estas ciclinas han sido identificadas en Arabidopsis, CycD1, CycD2, y CycD3. Durante el ciclo de división celular, las ciclinas forman complejos con quinasas dependientes de ciclinas (CDKs), que luego fosforilan proteínas relacionadas con el retinoblastoma. Esto permite la liberación de factores de transcripción de tipo E2F y genera la transición de la fase G1 a la fase S (Hartman et al, 2011) Formación del tubérculo en Solanum tuberosum Las variaciones del fotoperiodo determinan el tiempo de floración en muchas plantas, y en la planta de papa, es crucial para promover la diferenciación y formación del tubérculo. La longitud del día es percibida en las hojas, y bajo condiciones inductoras las hojas sintetizan una señal sistémica que es transportada hacia los estolones subterráneos para inducir el desarrollo del tubérculo. La planta de papa originariamente se cultivó en Sudamérica, en la región cercana al ecuador, donde la longitud del día es de aproximadamente 12 hs (condiciones denominadas de días cortos o DCs) y la temperatura es baja. Solanum tuberosum ssp. Andigena se encuentra adaptada a estas condiciones y tuberiza muy poco o nada cuando es cultivada a mayores temperaturas. Algunos cultivares más modernos como Solanum tuberosum ssp. tuberosum que son cultivados en el sur de Chile se encuentras más adaptados a condiciones de días más largos y temperaturas más elevadas, como son las condiciones en Europa y Norteamérica, por ejemplo (Fig 1.10) 18 Fig 1.10. Esquema de la señal mediada por el fotoperiodo que active una señal a larga distancia (flechas azules) que se mueve desde las hojas y a través del floema, para inducir la formación del tubérculo. Plantas de papa que responden al fotoperiodo presentan un comportamiento como el mostrado en las imágenes: ante días cortos inducen la formación de tubérculos, mientras que en condiciones de días largos se inhibe la tuberización Los días cortos, temperaturas bajas y baja concentración de nitrógeno en el suelo promueven la tuberización, mientras que la formación del tubérculo se retrasa por días largos (DLs), altas temperaturas y fertilizantes con alto contenido de nitrógeno. Las condiciones de DCs inducen la formación del órgano de reserva en todas las variedades de papa, aunque existen variaciones. S. tuberosum ssp. andígena y S. demissum son estrictamente dependientes de DCs para tuberizar, es decir, precisan 8 hs de luz y no produce tubérculos cuando son sometidas a días largos (16 hs de luz). Además, tampoco producen tubérculos bajo condiciones de DCs pero suplementadas con un pulso de 15 minutos de luz en el medio del periodo nocturno. (Fig 1.11) Estos resultados demuestran que las noches largas (NLs) son las que verdaderamente inducen la tuberización, más que las condiciones de DCs (Mariana Rodriguez-Falcon et al, 2006). Fig 1.14. La duración del día controla la tuberización en papas andigena. Las especies de andigena son estrictamente dependientes de días cortos (8-10 hs de luz) para tuberizar y no tuberizan bajo condiciones de días largos (14-16 hs de luz). La longitud total de la duración de la noche determinar la respuesta para tuberizar o no. La interrupción de una noche larga con un pulso de luz de 15 min inhibe la formación del tubérculo. Los fitocromos sensan la longitud del día En el genoma de la papa, dos genes que codifican fitocromos (PHYA y PHYB) se acumulan de forma estable en hojas y perciben la duración del dia. PHYB actúa en condiciones no inductoras de la tuberización (DCs + un pulso de luz durante la noche, DLs) como un represor de la tuberización (mediada por condiciones inductoras de DCs). En mutantes phyB, la vía que induce la tuberización está constitutivamente activada y estas plantas son capaces de tuberizar bajo cualquier condición (DLs o DCs). PHYB reprime la síntesis del estímulo tuberizante en hojas, bajo condiciones no inductoras (Fig 1.11). Las plantas phyB, además de perder el control por fotoperiodo que conduce a la tuberización, poseen un fenotipo elongado, similar al 19 generado por plantas cuando son tratadas con dosis saturantes de GAs (Rodriguez Falcon et al, 2006) Fig 1.11 Esquema de acción de plantas mutante phyB. Poseen una activación constitutiva de la via inductora de la tuberización de DCs y son insensibles a la duración del dia. Las giberelinas demoran la tuberizacion Las GAs regulan el inicio de formación del tubérculo, ya que se retrasa por el agregado de GA3 (un tipo de hormona GA, las diferentes hormonas varian en la cantidad de carbonos y cantidad de grupos oxidrilos). En cambio, al agregar inhibidores de la biosíntesis de la hormona,como tetciclacis, clorido de clorocolina (CCC), paclobutrazol o ancimidol, aumenta la formación de tubérculos en segmentos de entrenudos y en plantas de invernadero. El inicio de formación del tubérculo se corresponde con una disminución en el contenido de GA endógeno en el estolón. Además, al modificar los niveles endógenos de GAs por sobreexpresión o inhibición por antisentido del gen StGA20oxi1 (que codifica para la proteína GA20 oxidasa, de la biosíntesis de la hormona), resulta en un retraso o adelanto del inicio de la tuberizaoción en condiciones de DCs, demostrando una correlación entre los niveles de GA endogenos y el inicio de la tuberización (Rodriguez Falcon et al, 2006). Además, un mutante enano denominado andigena ga1 (bloqueado en un paso de la biosíntesis de la hormona), puede formar tubérculos en condiciones de días largos (condición no inductora de la tuberizacion. La transferencia a condiciones de DCs induce la tuberizacion rápidamente en estas plantas enanas, indicando que aunque el requerimiento de DCs es menos severo que en plantas salvaje, la tuberizacion en estos mutantes se encuentra regulada por el fotoperiodo. Esto indica dos vías independientes de tuberizacion: una vía dependiente del fotoperiodo, y una via dependiente de GAs. El balance entre el efecto inductor e inhibidor de estas vías determinan la formación del tubérculo. La proteína GA20-oxidasa y la GA3-hidroxilasa, catalizan los 2 últimos pasos en la via biosintética de las GAs, y la proteina GA2-oxidasa cataliza la degradación de formas bioactivas de las GAs a catabolitos inactivos. Estas enzimas codifican pasos regulatorios clave en la biosíntesis de GAs y la homeostasis, y además están sujetas a un control por retroalimentación por el producto final, GA1, y están reguladas en respuesta a fotoperiodo o fitocromos (Rodriguez Falcon et al, 2006). Vía Dias Cortos Vía Dias Cortos Señal tuberizante Señal tuberizante DLs DLs Plantas salvajes Plantas phyB Tuberización 20 Fig 1.12. Ruta biosintética de la hormona GA. Se indica con un recuadro verde las enzimas GA20-oxidasa (GA20ox) que genera el precursor GA20 y la GA3-hidroxilasa (GA3ox) que genera GA1. Al estudiar los transcriptos del gen GA 20-oxidasa, no se detectaron cambios importantes en su expresión en condiciones de DCs o DLs. En cambio, si al estudiar al gen StGA3ox2 (codifica la proteina GA3-hidroxilasa): en condiciones de DLs, este ARNm se acumuló de forma abundante en estolones, pero no en tallos. Al transferir a condiciones de DCs, aumentó su expresión en el ápice y en los entrenudos de la planta, pero se reprime por completo en el estolón, regulando negativamente la síntesis de la hormona, durante la tuberización. Además, datos de microarrays sugieren el transcripto de GA2-oxidasa esta regulado positivamente en estolones inducidos. La expression del gen GA2-oxidasa aumenta temprano en condiciones inductoras de la tuberización, incluso antes de detectar visiblemente la hinchazón (swelling) del estolón, indicio del comienzo de formación del tubérculo y precede a la acumulación del transcripto TUB8, que posee un rol estructural y su expresión aumenta en estadios iniciales de la formación del tubérculo (Taylor et al, 1992) Entonces, la caída en los niveles de GA1 es un evento clave en la tuberización, sin embargo, todavía no es muy claro como esta señal dependiente de GA se integra con la señal generada por DCs, que proviene de las hojas de la planta (Rodríguez-Falcón, 2006) Síntesis de GAs en tejidos aéreos Para estudiar la función de la GA3-hidroxilasa, se generaron plantas transgénicas de papa sobreexpresando el gen StGA3ox2. Estas plantas presentan un fenotipo mas alto y un mayor contenido de GA1 en los brotes. De forma contraria a lo esperado, estas plantas tuberizan 21 antes en condiciones de DCs, y su rendimiento en tubérculos es mayor que en plantas salvajes. Esto parece indicar que altos niveles del precursor GA20 (sustrato de la GA3-hidroxilasa) posee un efecto negativo sobre la tuberización. Esta observación también esta respaldada por estudios donde sobreexpresan el gen GA20 oxidasa (genera GA20) y estas plantas tardaban mas en tuberizar en condiciones de DCs (Carrera et al, 2000). Pero también presentaron un efecto que promueve la tuberización, debido a un aumento en la síntesis de GA1 en el brote. Este resultado contradictorio, quizás se deba a que GA20 es un inhibidor más potente de la tuberización que GA1, o de forma alternativa, que GA20 y GA1 son transportadas hacia el estolón de forma diferente. Es posible que, GA20 sea transportada rápidamente e inhibe la tuberización, mientras que GA1 permanece en las células que la sintetizaron y actua solo en esas células. Como conclusion, de forma contraria a la idea general de que las GAs inhiben la tuberización, se cree que altos niveles de GAs en el estolón inhiben la tuberización, mientras que una alta tasa de conversión de GA20 a GA1 en los brotes la favorecen (probablemente disminuyendo los niveles de GA20 en los tejidos aéreos y de esta forma se transporta menos cantidad del precursor al estolón (Rodríguez-Falcón, 2006) Las giberelinas poseen un efecto local en el estolón Una planta andigena mutante de ga1, presenta un fenotipo de planta enana, y puede formar tubérculos en condiciones de DLs, corroborando que las GAs participan en la señalización mediada por el fotoperiodo. Pero, varias evidencias como la caída en los niveles de GA1 en el tip del estolón al inicio de la tuberización, promueven la idea de que el efecto inhibitorio es local, en el estolón. Recientemente, se encontró evidencia de que las GAs reprimen la diferenciación del estolón: líneas de papa salvajes y phyB fueron bloqueadas (ambas líneas) en vías de respuesta a GA, por expresión del alelo dominante gai-1. Este alelo codifica una proteina DELLA con una delecion de 17 aminoacidos que impide su degradación (mediada por GA) de forma tal que las respuestas a GA están permanentemente reprimidas. Esto conduce a un fenotipo enano severo en ambas trasfondos genéticos. Aunque la respuesta a GA esta comprometida, el tiempo de tuberización no resultó afectado en estos transformantes, sugiriendo que las vías de GA y fotoperiodo sobre la tuberización son independientes. Fig 13. Modelos de la via de señalizacion por GA. En presencia de GA, esta fitohormona se une al receptor GID1. En ausencia de GA bioactivas, las proteínas DELLAS reprimen las respuestas a GAs, y el receptor GID1 se encuentra unido a GA, promoviendo la interaccion con una proteína DELLA. El complejo GA-GID1-DELLA encuentra una SCF3 ligasa que dispara la ubiquitinacion y degradación en el proteosoma 26S. Las proteínas DELLAs también pueden ser inactivadas por una via independiente de proteólisis en ausencia de la proteína F-box AtSLY1/OsGID2. La degradación o inactivación de las DELLAs libera la represión sobre las respuestas a GAs (Achard y Genschik, 2008) 22 Efecto del ABA sobre la tuberización Se cree que esta hormona esta implicada de alguna manera en la tuberización porque el agregado de ABA exógena indujo una mayor y mas temprana producción de tubérculos. In vitro, también se demostró que la aplicación de alta sacarosa y ABA condujo a una tuberización mas temprana. En medios con baja sacarosa o con GA, el ABA también estimula la formación de tubérculos, contrarrestando el efecto inhibitorio de las GAs. Sin embargo la tuberización no se asocia con un aumento de los niveles de ABA, ya que se observó una disminución en esos niveles en estolones inducidos durante el desarrollo. El mutante droopy (deficiente en ABA) de S. phureja tuberiza normalmente, indicando que no es necesaria la síntesis de ABA para la inducción de la tuberización. Se concluyó entonces que ABA no posee un papel esencial en la formacin del tubérculos y que el efecto estimulante de esta hormona es debido al efecto antagónico
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