Marcadores geneticos 2015

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Marcadores geneticos
Marcadores geneticos
• Morfologicos
• Bioquimicos 
– Grupos sanguineos
– Proteinas plasmaticas
• Moleculares
– RFLP
– Microsatelites
– SNPs
Marcadores geneticos
• Morfologicos
aa
Aa
Aa
Marcadores geneticos
• Bioquimicos 
– Grupos sanguineos
– Proteinas plasmaticas
Grupos
Sanguíneos
Factores Alelos
A Aa, Ab, Ac, Ad, Ae, Af, Ag
Aa, Aadf, Aadg, Ab, Abc,
A bce, Ac, Acd, Ace, Ae, A-
C Ca Ca, C-
D
Da, Db, Dc, Dd, De, Df, Dg,
Dh, Di, Dk, DI, Dm, Dn, Do
D adl, D adln, D bcm, D cgm,
D cefgm, D cegimn, D del ,
Ddelo, D dln, D dfki,
D dkl ,D dghm, D-
K Ka Ka, K-
P Pa, Pb, Pc Pa, Pac, Pb, P-
Q Qa, Qb, Qc Q abc, Q ac, Qb, Qc, Q-
U Ua Ua, U-
Tabla 1 Grupos sanguíneos del equino
http://www.monografiasveterinaria.uchile.cl/index.php/MMV/article/view/4879/4765
http://www.monografiasveterinaria.uchile.cl/index.php/MMV/article/view/4879/4765
Sistema Locus Alelos
Albúmina
Al A, B
Fosfatasa ácida AP F, S
Anhidrasa carbónica CA F, I, L, O, S
Catalasa Cat F, S
NADH diaforasa Dia F, S
Esterasa Es F, G, H, I, S
Peptidasa A Pep A F, S
Prot. ligante Vit. D Gc F, S
Hemoglobina Hb A, BI, BII
Postalbúmina Xk F, K, S
6-fosfogluconato
dehidrogenasa
PGD D, F, S
Fosfoglucomutasa PGM F, S, V
Fosfohexosa isomerasa PHI F,1, S
Inhibidor Proteasa Pi
F, G, I, L, N, P, Q, R,
S1 S2 T, U, V, W, Z
Transferrina Tf D, F1, F2, H, M, O, R
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Tabla 2 
Proteinas
plasmaticas
en equinos
http://www.monografiasveterinaria.uchile.cl/index.php/MMV/article/view/4879/4765
Marcadores geneticos
• Moleculares
– Polimorfimo de longitud de fragmentos de 
restriccion (RFLP)
– Microsatelites (STR)
– Polimorfismos de nucleotide simple (SNP)
– Otros: RAPD, AFLP, SCARS, etc. 
RFLP
Polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción 
Moleculares
– RFLP
Moleculares
– RFLP
Moleculares
– RFLP
Marcadores Moleculares
• Microsatelites
• Son altamente polimórficos 
• Son muy abundantes y están distribuidos por todo el genoma 
• Son de herencia codominante (se distinguen todos los 
homocigotos entre sí y estos de los heterocigotos) 
• Son muy reproducibles 
• Se necesita poco ADN para detectarlos 
• Su automatización es fácil 
• Alta tasa de mutacion (desventaja)
Microsatelites
Di-nucleotido: CACACACA
Trinucleotido: ATGATGATGATG 
Alelo A: CACACACA (4 repeticiones de CA)
Alelo B: CACACA (3 repeticiones de CA)
Alelo C: CACA (2 repeticiones de CA)
8/4 6/6Genotipo
Moleculares
– STR
Marcadores geneticos
Figura 2. Lectura del locus YWLL 08 de alpacas para la determinación de parentesco utilizando la
técnica de tinción con nitrato de plata (Uso de PCR simple).
Lectura del locus YWLL 08 para la obtención de patrones alélicos. MPM = Marcador de
Peso Molecular (Eco1471/PvuI) L1 = Blanco, L2 = Patrón alelos 134 y 166, L3 = Alegado
Padre 2, L4 = Blanco, L5 = Cría, L6= Madre, L7 = Verdadero Padre y L8 = Patrón alelo 138.
Rodriguez y colaboradores (2004)
Rodirguez y colaboradores (2004)
PCR 
Múltiple 
Microsatélites H(o) PIC PE PEa
M1
LCA 19 0.702 0.709 0.548
0.9191
YWLL 29 0.787 0.786 0.634
YWLL 40 0.660 0.604 0.408
YWLL 46 0.383 0.307 0.174
M2
LCA 23 0.638 0.779 0.621
0.9286LCA 22 0.511 0.477 0.294
YWLL 36 0.894 0.852 0.733
M3 
YWLL 43 0.304 0.639 0.452
0.9637LCA 5 0.809 0.744 0.575
YWLL 08 0.915 0.918 0.844
M1+M2+M3
10 
Microsatélites 
0.9998
Heterocigocidad observada (H(o)), contenido de información polimórfica (PIC) y probabilidad de exclusión individual 
(PE) y acumulada (PEa) de microsatélites utilizados para determinar parentesco y paternidad en alpacas
Marcadores Moleculares
• SNPs
• Marcadores muy abundantes- permite un mapeo fino de los 
caracteres. 
• SNPs pueden ocurrir dentro de la secuencia de un gen y podria 
ser la mutacion causal de la variacion fenotipica del caracter. 
• Co-dominante
• Varias tecnologias existen para genotipar los SNP – desde 
reacciones simples (ABI Taqman) hacia genotipado simultaneo 
de >50,000 SNPs (Affymetrix) 
• Gen Chip (SNP portability)
• SNPs son los marcadores moleculares modernos.
• Bialelicos
Polimorfismos de un solo nucleotido
SNPs
Identificacion y genotipado de SNPs
ADN Productos PCR 
SNP (C/T)
Amplicacion 
especifica-gen
Secuenciamiento
Frecuencias 
alelicas
x
y

 yx
x
SNPs con 
frecuencias alelicas 
moderadas
Genotipado de 
individuos
PCR-RFLP
SNPs
SNPs