Manual Toma de Muestras Microbiologia Hospital de Rancagua 2011

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Manual Toma de Muestras Microbiología 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Manual Toma de Muestras 
Microbiología. 
 
Elaborado por: Revisado por: Aprobado por: 
TM. M. Elena Díaz F. 
 
TM. Maximiliano 
Ramírez A. 
 
TM. Antonio Sanaguas 
I. 
 
 
Dr. Sonia Correa 
 
BQ. Rodrigo González. 
 
Dr. Adriana Pinto T. 
Fecha: 01/08/2011 Fecha: 21/09/2011 Fecha: 21/09/2011 
Firmas 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras 
Microbiologia. 
Código: SGC-LC-TMB V0 
Fecha: 21 sept. 2011 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
INDICE 
INTRODUCCION 3 
 Requisitos para una buena toma de muestra 3 
Uso correcto de las órdenes de exámenes 5 
NORMA DE TOMA DE CULTIVOS 6 
COMITE DE INFECCIONES ASOCIADAS 
A LA ATENCION DE SALUD IAAS 7 
Criterios de Rechazo de Solicitudes y/o Muestras 7 
CULTIVO DE ANAEROBIOS 8 
CULTIVO ASPIRADO ENDOTRAQUEAL CUANTITATIVO (AET) 10 
CULTIVO LÍQUIDO BILIAR 12 
CULTIVO CATETER VENOSO CENTRAL 13 
COPROCULTIVO 14 
EXPECTORACION 15 
CULTIVO FARINGEO 16 
HEMOCULTIVO 17 
Relación sangre / caldo y tipos de frascos 18 
HEMOCULTIVOS CUANTITATIVOS 20 
BACTEREMIA ASOCIADA A CVC. 22 
INFECCIONES A LA PIEL Y TEJIDO SUBCUTANEO 23 
 LESIONES SUPERFICIALES ERITOMATOSAS 23 
 ULCERAS Y NODULOS 25 
 SENOS PARANASALES 26 
 INFECCIONES DE HERIDAS 27 
 MORDEDURAS 28 
LAVADO BRONCO-ALVEOLAR 29 
LEUCOCITOS FECALES 30 
LIQUIDO ASCITICO 31 
 
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LIQUIDO ARTICULAR O SINOVIAL 32 
CULTIVO LÍQUIDO CEFALORRAQUIDEO (LCR) 34 
LIQUIDO PERITONEAL 36 
LIQUIDO PLEURAL 37 
CULTIVO NASAL 38 
MYCOPLASMA HOMINIS Y UREAPLASMA UREALYTICUM 39 
CULTIVO OCULAR 40 
CULTIVO OTICO 41 
ROTAVIRUS Y ADENOVIRUS en deposiciones. 42 
CULTIVO SENOS PARANASALES 43 
CULTIVO TEJIDOS, BIOPSIAS y ABSCESOS. 44 
MUESTRAS DEL TRACTO GENITAL FEMENINO. 46 
MUESTRAS DEL TRACTO GENITAL MASCULINO 48 
UROCULTIVO. 50 
VIRUS RESPIRATORIOS POR IFI. 53 
BORDETELLA POR IFD. 55 
BIBLIOGRAFIA. 58 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
INTRODUCCION 
El diagnostico de las enfermedades infecciosas, se basa en el estudio de 
los síntomas y signos clínicos, así como en la demostración de la presencia del 
agente, de sus productos o de la huella que este ha dejado en su contacto con el 
sistema inmune del individuo. 
El diagnóstico clínico es, en muchos casos, orientador luego de evaluar los 
datos que ofrecen la historia clínica y la exploración, pero, la confirmación de un 
diagnóstico clínico, requiere, en enfermedades infecciosas, del diagnóstico 
etiológico que confiere el laboratorio de Microbiología Clínica. 
La información diagnostica que el laboratorio de Microbiología puede 
proporcionar, depende de la calidad de la muestra recibida. 
Una muestra mal tomada, en escasa cantidad o mal transportada, 
determinara un posible fallo en la recuperación de o los agentes patógenos, 
induciendo errores en el diagnóstico, como también en un tratamiento inadecuado 
del enfermo. 
 
Requisitos para una buena toma de muestra. 
 
1. Personal idóneo en la toma de muestra. 
 
2. Indicaciones claras al paciente respecto del examen se le va a realizar. 
 
 
3. Preparación adecuada del paciente, como aseo previo, uso de antisépticos, 
uso de tapón vaginal, cuando corresponda. 
 
4. Muestra representativa del proceso infeccioso. 
 
 
5. Muestra tomada antes del tratamiento antimicrobiano. De lo contrario 
especificar en la orden. 
 
6. Muestra tomada con la cantidad adecuada. 
 
 
7. Uso correcto de los medios de transporte. 
 
 
 
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MUESTRA MEDIO DE TRANSPORTE 
Aspirado nasofaríngeo para virus respiratorios. Buffer pH 7.2. 
Aspirado nasofaríngeo para Bordetella. Suero fisiológico. 
Coprocultivo. Cary Blair. 
Secreciones en tórula. Stuart. 
 
8. Número de muestras adecuada. 
 
9. Las muestras recolectadas en tubos estériles sin medio de transporte, deben 
enviarse al laboratorio a la brevedad. 
 
 
10. Como bioseguridad, las muestras deben transportarse al laboratorio, dentro de 
unidades térmicas, sin hielo o unidad refrigerante, a excepción de los 
aspirados nasofaríngeos para pesquisa de virus respiratorios. 
 
11. Especificar examen solicitado, bacteria o grupo de microorganismo que se 
desea pesquisar, Ej. 
 
 Anaeróbios. 
 Hongos, Levaduras. 
 Difteria. 
 Gonococo. 
 Vírus Respiratório. 
 Enterococo de deposición. 
 
12. Frente a cualquier duda o consulta referente a determinada muestra, resultado 
de examen, toma de muestra que no aparezca en este manual, etc., 
contactarse con el laboratorio de Microbiología, en horario de 8.00 – 16.50 hrs. 
de lunes a viernes o con el tecnólogo médico de turno fuera de este horario. 
 
13. Es importante que la solicitud de examen, especifique la edad del paciente, ya 
sea porque algunos hallazgos bacteriológicos se deben enviar al Instituto de 
Salud Pública con todos los datos o porque algunos procedimientos de uso de 
algún determinado medio de cultivo, depende exclusivamente de la edad del 
paciente: flujos vaginales se les agrega Agar Mac Conkey en menores de 14 
años; la vigilancia de Vibrio cholerae difiere en aquellos pacientes mayores de 
18 años, de los que tienen menos de ésta edad. 
 
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Uso correcto de las órdenes de exámenes. 
 
EXAMEN ORDEN 
 
VIRUS RESPIRATORIO 
(inmunofluorescencia) 
 
Orden normal de Bacteriología adicionada 
de IRA grave en caso de estudio de 
virus influenza AH1N1. 
 
BORDETELLA PERTUSSIS 
(inmunofluorescencia): 
 
Orden normal de bacteriología 
 
PARALISIS FLACCIDA: 
 
Formulario especial del ISP 
 
SARAMPION: 
 
Formulario especial del ISP 
 
HANTA VIRUS: 
 
Formulario especial del ISP 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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NORMA DE TOMA DE CULTIVOS. 
 
En relación a la solicitud de cultivos microbiológicos, se recomienda lo 
siguiente: 
 La solicitud de toma de cultivo debe corresponder a una hipótesis 
diagnóstica de infección, que requiere su confirmación por laboratorio junto 
a la identificación del agente causal y el antibiograma para realizar 
tratamiento específico. 
 
 No está indicado realizar cultivos rutinarios de vigilancia, como escaras y 
úlceras de decúbito, TET, CUP, Catéter Venoso Central o al trasladar 
pacientes desde un servicio a otro, sin una clara sospecha clínica de 
infección, ya que es sabido que el paciente en menos de 48 hrs. desde su 
ingreso al establecimiento, es colonizado por microorganismos 
intrahospitalarios y sus resultados (+) pueden producir confusión y estimular 
el uso inadecuado de antimicrobianos con el consiguienteaumento de los 
costos de atención. 
 
 Se debe consignar la toma de muestras en la ficha clínica y hoja de 
enfermería en el caso de traslado de paciente desde un servicio a otro, 
evitando repetir la toma de muestra. 
 
 En el caso de múltiples heridas o escaras con signo de infección, se 
recomienda la toma de solo una muestra del sitio más representativo 
(mayor presencia de secreción purulenta), previo aseo con suero fisiológico. 
 
 Se debe considerar además, que al solicitar un cultivo se debe esperar su 
resultado final (hasta 72 hrs.) antes de solicitar nueva muestra, ya que las 
muestras seriadas en 24 hrs. no han demostrado mejor rendimiento 
diagnóstico (excepto hemocultivos). 
 
 No está indicado tomar muestras de loquios, objetos inanimados, manos y 
nariz del personal (excepto en estudios de portación en casos de brotes) y 
de antisépticos y desinfectantes (estudios en casos y condiciones 
especiales). 
 
 
 
 
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COMITE DE INFECCIONES ASOCIADAS A LA ATENCION DE SALUD IAAS. 
 
Criterios de Rechazo de Solicitudes y/o Muestras 
 
Si las solicitudes y/o las muestras no cumplen los requisitos mínimos 
indispensables para su correcto procesamiento el laboratorio deberá aclarar las 
discrepancias con el servicio que las envío, previo a su realización y en algunos 
casos será imposible su procesamiento hasta tanto se envíe la muestra correcta. 
Los siguientes son algunos ejemplos de ello: 
A. Discrepancia entre la identificación del paciente que figura en la solicitud del 
examen y la que figura en el rotulo de la muestra. Acción: Rechazo de la 
muestra, hasta que se envíe correctamente, por parte del Servicio 
Clínico. 
B. No se indica en la solicitud de examen, el tipo de muestra a analizar y/o 
procedencia anatómica del mismo. Acción: Llamar al servicio que lo envió. 
No se procesará hasta tanto se conozcan esos datos, imprescindibles 
para la realización del estudio. 
C. Muestra enviada en frasco no estéril o con conservantes (formol). Acción: 
Rechazo de la muestra, hasta que se envíe correctamente, por parte del 
Servicio Clínico. 
D. Muestra enviada en envase o tubo con pérdida o derrame Acción: No 
procesar. Esterilizar la muestra y solicitar una nueva. 
E. Muestra inadecuada para realizar el estudio solicitado. Acción: No procesar. 
Informar al servicio que la muestra es inadecuada e indicar cual muestra 
deberá enviar. 
F. Cultivo anaerobio solicitado en exudado faríngeo, expectoración, orina, 
secreciones vaginales, úlceras o fístulas entre otras. Acción: No procesar 
.Comunicarse con el servicio y explicar las razones. 
G. Muestra en cantidad insuficiente para realizar los exámenes solicitados: 
Acción: Solicitar muestra adicional, si no es posible establecer 
prioridades de procesamiento en acuerdo con el médico tratante. 
H. Muestras repetidas por más de una vez en el mismo día, excepto 
hemocultivos. Acción: Procesar una sola muestra por día y comunicarse 
al servicio para que justifique el procesamiento de las muestras 
restantes. 
I. Muestra evidentemente contaminada. Acción: Descartar la muestra y 
solicitar otra. 
 
 
 
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CULTIVO DE ANAEROBIOS 
 
TOMA DE MUESTRA: Debe ser realizada por profesional idóneo 
SITIO ANATOMICO MUESTRA METODO 
 
 
SNC 
LCR 
Abscesos 
Biopsias de tejidos 
Autopsias o material 
quirúrgico 
 
Punción Lumbar 
Aspiraciones con aguja 
y jeringa 
 
AREA DENTAL 
(Oído-Nasal-Garganta 
Senos paranasales) 
Abscesos 
Material de Biopsias 
Sinusal en Sinusitis 
crónica. 
Quirúrgica. 
 
 
Aspiraciones con jeringa 
 
AREA PULMONAR 
Transtraqueal 
Pulmón 
Broncoscopía 
 
Aspiración con jeringa 
Punción percutánea 
Catéter con protector 
de doble envoltura. 
AREA ABDOMINAL Líquido de paracentesis 
Abscesos profundos 
Cirugía 
Aspiración con jeringa 
libre de contaminación 
intestinal. 
 
TRACTO GENITAL 
FEMENINO 
Laparoscopía quirúrgica 
Cavidad endometrial 
Líquido amniótico 
Placenta 
 
Aspiración con jeringa. 
TRACTO URINARIO Orina Aspiración supra púbica 
 
HUESOS Y 
ARTICULACIONES 
Artritis supurativa 
Material de drenaje 
después de cirugía: Ej.: 
Osteomielitis. 
Aspiración de Articulaciones. 
Aspiración profunda. 
 
 
 
 
 
 
 
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TEJIDOS BLANDOS: 
 
Heridas. 
Abrir y hacer aspiración 
profunda del margen 
orilla o lesión ósea 
subyacente. 
 
Biopsias 
Del fondo de la herida 
después de limpieza por 
arrastre con suero 
fisiológico. 
 
Senos paranasales 
Aspiración con jeringa y 
pequeño catéter plástico 
después de asepsia de piel 
con alcohol 70% 
Abscesos profundos 
Celulitis anaerobia. 
Gangrena vascular 
infectada. 
 
Aspiración con jeringa. 
Mionecrosis gangrenosa 
Muestras quirúrgicas. 
Biopsias. 
Superficies ulcerosas. 
Pus. 
 
Aspiración con jeringa. 
 
 
Cantidad de muestra: En lo posible 1-5 ml 
Transporte de la Muestra: Se utiliza un medio de transporte comercial para 
anaerobios: Portagem de Biomerieux, diseñado 
para muestras líquidas. Una vez colocada la 
muestra dentro del frasco de transporte, 
mantener a temperatura ambiente. Enviar a 
laboratorio. 
Entrega de Resultados: Informe preliminar a las 48 - 96 horas. 
 
 
 
 
 
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 CULTIVO ASPIRADO ENDOTRAQUEAL CUANTITATIVO (AET). 
INDICACIONES: 
A todo paciente con sospecha de neumonía asociada a ventilación 
mecánica, por más de 48 horas y presencia de criterios clínicos radiológicos, en el 
cual no se hayan efectuado cambios de tratamiento antimicrobiano durante las 
últimas 72 horas. 
TOMA DE MUESTRA: 
Debe ser tomada en forma estéril utilizando un catéter de aspiración 
introducido en el tubo endotraqueal y conectado el otro extremo del catéter, a un 
colector o trampa estéril apropiada. 
El procedimiento debe ser realizado por un profesional entrenado con 
ayudante. El catéter debe ser introducido hasta encontrar resistencia y no se debe 
diluir la muestra con el fin de facilitar su recolección. 
Si las secreciones son espesas, se deben aplicar aspiraciones intermitentes 
hasta conseguir la muestra. 
La muestra debe ser enviada rápidamente al laboratorio, especificando que 
se requiere cultivo de aspirado endotraqueal cuantitativo ( AETC ). 
 
TRANSPORTE: 
Se transporta en trampa de aspiración, cerrada a temperatura ambiente. 
 
HORARIO DE RECEPCION: 
 De Lunes a Viernes hasta las 12 AM. No enviar fuera de este horario ni en 
días festivos (sin excepción). 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 
A las 48 –72 horas. Se informará cada microorganismo aislado con su 
recuento de colonias y estudio de sensibilidad correspondiente. 
 
 
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PUNTO DE CORTE: 
Recuento >= 1.000.000 UFC /ml. 
Sensibilidad para NAVM : 71 –82 % 
Especificidad para NAVM : 83-86 % 
Recuento <= 1.000 UFC / ml.: Exclusión de diagnóstico de NAVM. 
Recuento entre > 1.000 y < 1.000.000 UFC / ml.: Interpretación según criterios 
médicos. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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CULTIVO LÍQUIDO BILIAR. 
INDICACIONES: 
 Colangitis 
 Estudio de portación de Salmonella typhi. 
 
TOMA DE MUESTRA:La bilis se puede recolectar: 
 Por punción directa de la vía biliar durante la cirugía. 
 A través de endoscopia digestiva alta, desde la ampolla de vater. 
 Recolectar en un tubo estéril sin medio de transporte. 
 
CANTIDAD: 
 4 a 5 ml. es suficiente. Recolectar en tubo de polietileno estéril, tapa rosca. 
 
TRANSPORTE: 
 Transportar al laboratorio lo más pronto posible, dentro de unidad de transporte 
térmico 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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CULTIVO CATETER VENOSO CENTRAL 
INDICACIONES: 
El estudio de catéteres que se realiza en forma rutinaria a nivel del 
Laboratorio de Microbiología es la técnica semicuantitativa de Maki. Esta técnica 
permite valorar la contaminación extraluminal del catéter, principal mecanismo por 
el cual se contaminan los catéteres de corta permanencia y pueden llegar a ser el 
origen de una bacteriemia. 
Paciente con catéter venoso central que presente fiebre sobre 38 grados C. 
aumento de volumen, enrojecimiento, aumento de temperatura local en sitio de 
inserción del catéter, ò que presente fiebre > 38º, sin foco detectado, que se 
sospeche bacteremia asociada a CVC, y que se retire el catéter. 
TOMA DE MUESTRA: 
 Desinfectar con alcohol al 70% una zona de piel de unos 10cm 
correspondientes a la zona de entrada del catéter. Hacerlo en forma de 
círculos comenzando por el centro. 
 Retirar el catéter con la máxima asepsia. 
 Ayudándonos de las pinzas y las tijeras estériles, cortar los 3 cm dístales del 
catéter que corresponden a la porción intravascular. 
 Introducir el segmento de catéter en un tubo de polietileno, tapa rosca, estéril, 
correctamente identificado, o tubo de vidrio sin medio de transporte. 
 
TAMAÑO DE LA MUESTRA: 
3 cm de la porción más distal. Porciones mayores dificultan el procesamiento en el 
laboratorio. Debe acompañarse de 2 hemocultivos periféricos. 
TRANSPORTE: 
La muestra deberá enviarse al laboratorio en un periodo inferior a 30 
minutos. Cuando esto no sea posible deberá conservarse a 4°C por 12 horas 
como máximo. Llevar a laboratorio. 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
 
 
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COPROCULTIVO. 
TOMA DE MUESTRA: 
 La muestra para el cultivo microbiológico puede obtenerse de 2 formas, 
dependiendo del estado del paciente: 
TORULA RECTAL O SONDA RECTAL: 
 
 Estas técnicas se utilizan especialmente en el niño menor. 
 Con tórula: con tórula de algodón, humedecer en el medio de transporte Cary 
y Blair en introducir por el recto aproximadamente 2 cm., haciéndole girar 
suavemente. Volver la tórula al tubo con medio de transporte. 
 Sonda rectal: Se debe emplear una sonda de NELATON fina y se aspira con 
jeringa. 
 Agregar sobre el medio de transporte Cary y Blair sin la tórula, 1-2 ml. del 
aspirado. 
 Volver a colocar la tórula. 
 
RECOLECCION DE DEPOSICION EMITIDA: 
 El paciente debe emitir la deposición en un recipiente muy limpio, desde el 
cual se recolecta, con la tórula de algodón, la fracción de deposición que 
muestra mayor alteración (sangre, pus, mucosidad). 
 Colocar la tórula en el medio de transporte. 
 
NUMERO DE MUESTRAS: 
 Se deben tomar 2 a 3 muestras de deposición en tiempos diferentes. Enviar 
juntas al laboratorio. 
 Para estudio de portadores, se deben tomar 3 a 4 muestras seriadas (en días 
diferentes) 
 
TRANSPORTE: 
 Las muestras se mantienen y se transportan a temperatura ambiente, en medio 
de transporte Cary y Blair. 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 72 horas. 
 
 
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EXPECTORACION 
 INDICACIONES: 
 Paciente con neumonía 
 Enfermedad bronquial crónica reagudizada. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
1. Paciente debe lavarse los dientes y realizar enjuagues con agua corriente, 
para limpiar la cavidad oral. 
2. Obtener el esputo tras una expectoración profunda, luego de un esfuerzo de 
tos, preferentemente matinal. 
3. El kinesiólogo o enfermera debe asistir al paciente durante la obtención de 
ésta. La muestra debe provenir del sector bajo del tracto respiratorio. 
4. La saliva no sirve para realizar este estudio. 
5. De no producirse expectoración espontánea, puede inducirse el esputo con 
nebulizaciones con suero fisiológico. 
6. Obtener muestra previo inicio de la terapia antimicrobiana. 
7. Depositar muestra en placa Petri estéril, diseñada para este propósito, o en 
frasco de boca ancha tapa rosca estéril. 
 
VOLUMEN: De 2 a 10 ml. si es posible. 
TRANSPORTE: 
La muestra debe enviarse de inmediato al Laboratorio. No debe demorar 
más de dos horas en llegar al laboratorio. Transportar placa dentro de una unidad 
de transporte térmico. 
NOTA: Una muestra representativa debe presentar al Gram las siguientes 
características, en cuyo caso contrario el examen se debe repetir: 
 ≥ 25 Polimorfonucleares por campo. 
 ≤ 10 Células epiteliales por campo. 
 
HORARIO DE RECEPCION: De 8.00 a 12.00 horas, de Lunes a Viernes. 
ENTREGA DE RESULTADOS: A LAS 48 – 72 hrs. 
 
 
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CULTIVO FARINGEO. 
INDICACIONES: 
 El agente principal de faringitis es Streptococcus pyogenes. 
 El estudio de Neisseria meningitidis se realiza con propósitos 
epidemiológicos. 
 El estudio de faringitis gonocócica debe ser solicitada en forma específica 
por el médico. 
 El estudio de Corynebacterium difhtheriae se realiza sólo cuando se solicita 
expresamente. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
1. SECRECION FARINGEA. 
 Buena iluminación y exposición de la faringe del paciente. 
 Deprimir la lengua con baja lengua. 
 Frotar la tórula con la pared posterior de la faringe y las amígdalas tocando 
cualquier exudado. 
 Evitar tocar la lengua, úvula y pared de la boca. 
 
2. ESTUDIO PARA CORYNEBACTERIUM DIPTHERIAE: Tomar 2 muestras con 
tórula, utilizando baja lengua, pasándola por el reborde de la 
pseudomembrana. 
3. ESTUDIO PARA NEISSERIA MENINGITIDIS: Muestra nasofaríngea. Tomar la 
muestra con tórula, por detrás de la úvula en la porción nasal de la faringe. 
4. ESTUDIO PARA N. GONORRHOEAE: Tomar la muestra con tórula como en 
cultivo faríngeo. 
 
TRANSPORTE: 
Enviar la tórula en medio de transporte Stuart, a temperatura ambiente, 
dentro de una unidad de transporte térmica. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 – 72 hrs 
 
 
 
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HEMOCULTIVO. 
INDICACION: 
Compromiso del estado general asociado a: 
 Fiebre > 38 ° C. 
 Hipotermia < 36° C. 
 Leucocitosis > 10.000 
 Granulocitopenia < 1.000 polimorfonucleares x ml. 
 O una combinación de ellos. 
 En pacientes que por su condición debilitada no responden con fiebre, 
guiarse por los síntomas y signos clínicos de sepsis: taquicardia, 
palidez, hipotensión, sudoración. 
 Paciente con antimicrobianos, en que se sospecha falla de tratamiento, 
previo al cambio de terapia. 
 
MOMENTO DE LA OBTENCION: 
 Lo antes posible después de constatada el alza febril (38°) 
 
INTERVALO DE TIEMPO: 
 Tomar en forma simultánea, el set de hemocultivos pero de sitios de 
punción diferentes. (brazo izquierdo, brazo derecho). 
 
VOLUMEN DE SANGRE POR FRASCO Y N° DE MUESTRAS: 
 En adultos tomar 10 ml. de sangre por frasco, completando set de 2 
muestras. 
Endocarditis infecciosa : 3 frascos en 24 hrs. 
 
Esperar hasta 24 hrs. antes de repetir un nuevo set de 3 frascos adicionales; si 
los 3 frascos primeros están negativos hasta ese momento. 
 
 
 
 
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1. RECIEN NACIDOS: 1 ml. de sangre por frasco completando un set de 2 
frascos. 
2. LACTANTES 1 MES- 1 AÑO: 1,5 ml. de sangre por frasco, completando un set 
de 2 frascos. 
3. MAYORES DE 2 AÑOS: 2,5 ml. de sangre por frasco, completando un set de 
2 frascos. 
4. ADOLESCENTES: 5 – 10 ml. de sangre por frasco, completando un set de 2 
frascos. 
 
Relación sangre / caldo y tipos de frascos: 
Se debe mantener una relación 1/5 a 1/10 respecto de la dilución sangre / 
caldo de cultivo. Se utilizan frascos comerciales BACT ALERT. 
 Frascos verdes, con 40 ml. de medio de cultivo, para pacientes adultos: 
agregar 10 ml. sangre por frasco. 
 Frascos amarillos, con 20 ml. de medio de cultivo, para pacientes 
pediátricos, máximo de 4 ml. de sangre por frasco. Contienen partículas de 
carbón para inactivar antibióticos. 
 
Ambos tipos de frascos permiten el crecimiento de bacterias aerobias, 
anaerobios facultativos, hongos. Para anaerobios se necesitan frascos especiales. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
1. Muestra tomada por personal adiestrado (enfermera), con guantes de 
procedimiento. 
2. Seleccionar la vena periférica de más fácil acceso. 
3. Lavar la extremidad elegida con agua y jabón. 
4. Aplicar con tórula de algodón, alcohol 70 %, en forma concéntrica, 
partiendo desde el lugar donde se va a puncionar, hacia la periferia. 
5. Puncionar la vena y aspirar sangre. 
6. Desinfectar la tapa frasco donde se va a inocular la sangre, con alcohol 
70% 
7. Pinchar la tapa de goma e inocular la sangre que se mezcla con el medio 
de cultivo. No cambiar de aguja para hacer este proceso. 
 
 
 
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Fecha: 21 sept. 2011 
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TRANSPORTE: 
A temperatura ambiente, como máximo 6 horas antes de incubarse en el 
laboratorio. 
HORARIO DE RECEPCION: Las 24 hrs. del día. 
ENTREGA DE RESULTADOS: 
Los hemocultivos se mantienen por 5 días antes de darlos por negativos. 
La excepción se da ante la sospecha de algún microorganismo fastidioso, 
de hongo o ante un diagnóstico de Endocarditis bacteriana, en el cual se incuban 
hasta 10 días. 
En caso de estar positivos. Se da un informe preliminar. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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HEMOCULTIVOS CUANTITATIVOS 
PROPOSITO: Detectar en forma oportuna las infecciones asociadas a catéter 
venoso central, con el fin de indicar con justificación el retiro del catéter. Se basa 
en el recuento diferencial de bacterias presentes en la circulación sistémica 
periférica y en el catéter venoso central. No se requiere infección en el sitio de 
inserción del catéter para indicar bacteriemia asociada a CVC. 
Sensibilidad: > 80% 
Especificidad: 94 – 100 % 
 
INDICACIONES: A todo paciente con catéter venoso central, de más de 24 horas, 
con fiebre mayor o igual a 38° C, sin otro foco infeccioso documentado. 
ORDEN MÉDICA: Se debe especificar en la orden médica, cultivo de hemocultivos 
cuantitativos, central y periférico. 
 
MUESTRAS: Rotular 2 jeringas CENTRAL Y PERIFERICA. 
 
1. Preparación de la piel para punción periférica, del mismo modo que para 
toma de hemocultivos. 
2. Extraer 1.0 ml. de sangre por vena periférica con jeringa heparinizada. 
3. Taponar jeringa.(tapones estériles) 
4. Destapar catéter central. 
5. Con técnica aséptica, retirar suero del catéter con una jeringa. 
6. Extraer con jeringa heparinizada 1.0 ml. de sangre por el catéter central. 
7. Taponar jeringa (tapones estériles) 
8. Colocar 5 ml. de suero fisiológico estéril por el catéter y cerrar el circuito 
9. Colocar apósitos y tela. 
 
TRANSPORTE: 
Enviar inmediatamente al laboratorio, el par de jeringas taponadas, rotuladas, a 
temperatura ambiente. La orden debe indicar hemocultivos cuantitativos. 
Se debe acompañar de 2 hemocultivos tradicionales. 
 
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HORARIO DE RECEPCION: 
De lunes a viernes hasta las 12 hrs. AM. No enviar fuera de este horario ni en 
días Sábado y festivos. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 48 – 72 horas. 
 
INTERPRETACION: 
 
 Sin crecimiento de bacterias o menos de 5 colonias por placa: Negativo a 
las 72 hrs. 
 Si el recuento bacteriano es superior 5 a 10 veces, en el cultivo del catéter 
central, sobre el cultivo periférico, con crecimiento de más de 5 colonias por 
placa: Infección del torrente sanguíneo asociado a catéter venoso central 
(CVC). Se realizará identificación y estudio de sensibilidad para tratamiento 
antibiótico específico y es orden de retiro del catéter. 
 Si por el contrario, el resultado del recuento del catéter central, no es 
superior al recuento periférico, con más de 5 colonias por placa: Probable 
infección del torrente sanguíneo asociado a catéter: Interpretación según 
clínica y agente identificado. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
BACTEREMIA ASOCIADA A CVC. 
Los hemocultivos automatizados permiten agregar un método adicional de 
diagnóstico de bacteriemia asociada a catéter central. 
Se toma una muestra de sangre, del CVC y otra muestra de sangre 
periférica, según procedimiento indicado previamente. 
 
ROTULAR: frasco 1: CVC y frasco 2: periférico. 
VOLUMEN:5- 10 ml. en pacientes adultos. Hasta 4 ml. en pacientes pediátricos. 
IMPORTANTE: Igual volumen en ambos frascos. 
ORDEN MEDICA: Indicar Hemocultivos CVC y periférico. 
TRANSPORTE: Enviar inmediatamente al Laboratorio, a temperatura ambiente. 
HORARIO RECEPCION: Las 24 hrs. del día. 
Se incuban en forma habitual en equipo automatizado, y si la muestra 
central es positiva con más de 2 horas de diferencia con respecto a la muestra 
periférica, es diagnóstico de bacteriemia asociada a CVC. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
INFECCIONES DE LA PIEL Y TEJIDO SUBCUTANEO 
LESIONES SUPERFICIALES ERITEMATOSAS 
 
ENFERMEDADES 
Y 
SINTOMAS 
MICROORGANISMOS 
QUE COMUNMENTE 
LA CAUSAN 
TOMA DE MUESTRA Y 
TRANSPORTE 
ERISEPELA 
Streptococos grupo A. 
(piógenes) 
 
EXUDATIVAS: Con tórula 
Desde el borde de la lesión. 
Con limpieza previa. 
 
 
 
COSTRAS: Remover la 
Costra con suero fisiológico 
y frotar la tórula. 
 
INFECCIONES PURULENTAS 
Aspirar en la zona de inflamación 
más aparente (bordes) con aguja 
y jeringa con 0.2 ml. de suero 
fisiológico estéril. 
 
TRANSPORTE AEROBIO: 
CELULITIS 
Streptococcus grupo A. 
Staphylococcus aureus. 
Anaerobios. 
ERSIPELOTHRIX 
Erisipelothrix 
insidiosa 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
IMPETIGO: 
Streptococcus 
grupo A. 
Staphylococcus 
aureus. 
 
Tórulas en medio de 
Transporte Stuart. 
Secreciones purulentas en medio 
de transporte Stuart sin tórula. 
Enviar dentro de unidad de 
transporte térmico. 
 
 
TRANSPORTE ANAEROBIO: 
 
En medio de transporte comercial 
para anaerobios dentro de unidad 
de transporte térmico. 
 
FOLICULITIS: 
Staphylococcus 
aureus. 
Pseudomonasaeruginosa. 
PARONIQUIA 
Staphylococcus 
aureus. 
Candida spp. 
PANADIZO 
 
Staphylococcus 
aureus. 
Virus herpes simplex. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
ULCERAS Y NODULOS 
 
 
ENFERMEDADES Y 
SINTOMAS 
MICROORGANISMOS 
QUE COMUNMENTE 
LA CAUSAN 
TOMA DE MUESTRA 
Y TRANSPORTE 
DIFTERIA CUTANEA. 
 
Corynebacterium 
Diphteriae. 
 
Toma de exudados con tòrula. 
 
ANTHRAX. Bacillus anthracis. 
 
Toma de exudados y heridas 
con tòrula. 
 
Tejidos o material contaminado 
con B. anthracis. 
 
Sangre. 
 
TRANSPORTE: 
 
Tórulas en medio de transporte 
Stuart. 
Tejidos en tubo estéril. 
Frascos de hemocultivo en caso 
de sangre. 
 Enviar dentro de unidad de trans- 
 porte térmico. 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
SENOS PARANASALES: 
 
ENFERMEDADES Y 
SINTOMAS 
 
MICROORGANISMOS 
QUE COMUNMENTE 
LA CAUSAN 
 
TOMA DE MUESTRA Y 
TRANSPORTE 
 
 
ACTINOMICOSIS 
 
Actinomyces spp. 
Proopribacterium 
propiónica. 
 
Desinfectar la piel con 
alcohol 70°. 
 
Aspirar con aguja y jeringa desde 
abscesos. 
 
Material desde biopsias. 
 
TRANSPORTE: 
En medio de transporte comercial 
para anaerobios dentro de unidad 
de transporte térmico. 
 
Diversos focos 
de infecciones 
profundas o crónicas. 
 
Staphylocccus aureus. 
Enterobacterias. 
Pseudomonas spp. 
 
 
Aspiración con aguja y jeringa 
desde abscesos. 
 
 
TRANSPORTE: 
En tubo estéril o en medio de 
transporte Stuart sin la tórula; 
dentro de unidad de transporte 
térmico. 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
INFECCIONES DE HERIDAS 
 
ENFERMEDAD Y 
SINTOMAS 
 
MICROORGANISMOS 
QUE COMUNMENTE 
LA CAUSAN 
 
TOMA DE MUESTRA Y 
TRANSPORTE 
 
INFECCIONES 
DE HERIDAS 
POST 
OPERATORIA 
 
Staphylococcus aureus 
Streptococcus Grupo A 
Enterococcus 
Enterobacterias 
Bacteroides 
Clostridium 
-Limpieza por arrastre con 
suero fisiológico, luego aplicar 
de la lesión. 
-Pus por aspiración con aguja y 
jeringa. 
-Tejidos desde biopsias. 
TRANSPORTE: 
 
AEROBIO: 
Medio de transporte Stuart 
Tubo estéril. 
ANAEROBIO: 
Medio de transporte 
comercial para anaerobios. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
MORDEDURAS 
ENFERMEDAD Y 
SINTOMAS 
MICROORGANISMOS 
QUE COMUNMENTE 
LA CAUSAN 
TOMA DE MUESTRA Y 
TRANSPORTE 
 
 
MORDEDURAS 
ANIMALES 
 
 
Pasteurella multocida. 
Streptobacillus moniliformes. 
Spirillum minus. 
-Limpieza por arrastre con suero 
fisiológico, luego aplicar tòrula 
en el fondo de la lesión. 
-Pus, por aspiración con aguja y 
jeringa. 
 
TRANSPORTE: 
 
AEROBIO: 
 
Tórula en medio de transporte 
Stuart. 
ANAEROBIOS: 
 
En medio de transporte comercial 
para anaerobios. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 
AEROBIO: 48 - 72 Hrs. Mínimo. 
ANAEROBIO: Informe preliminar a las 48 - 96 hrs. 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
LAVADO BRONCO-ALVEOLAR 
INDICACIONES: 
 Paciente con neumonía de difícil diagnóstico 
 Pacientes inmunodeprimidos con neumonía. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Debe ser tomada por un médico especialista. 
 
TRANSPORTE: 
 En el mismo set de toma de muestra, de inmediato al laboratorio, 
sin refrigerar . 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: a las 48 – 72 hrs. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
LEUCOCITOS FECALES 
 
 TOMA DE MUESTRA: 
1.- Deposición por emisión espontánea. 
2.- Deposición obtenida por sonda rectal. 
 En ambos casos de deposición se deposita en una frasco de polietileno 
 limpio, entregar a laboratorio. 
 
LIMITACIONES: 
FALSOS NEGATIVOS: deficiente toma de muestra. 
FALSOS POSITIVOS: dermatitis del pañal. 
COLITIS ULCEROSA: leucocitos abundantes. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: Durante el día. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
LIQUIDO ASCITICO 
GENERALIDADES: 
Liquido peritoneal: líquido ubicado entre el peritoneo parietal y visceral (cavidad 
abdominal, peritoneal) 
 Ascitis: acúmulo anormal de líquido en la cavidad abdominal. 
 Peritonitis: inflamación del peritoneo. 
 Peritonitis primaria: peritonitis bacteriana sin evidencia de ruptura de 
víscera. 
 PBE: peritonitis bacteriana espontáneas Ascitis (cirrosis). 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Por punción y aspiración de líquido de cavidad abdominal. 
-Personal entrenado 
-Técnica aséptica 
 
NUMERO DE MUESTRAS: 
1. Tubo con Heparina, tapa verde: para análisis bioquímico (glicemia, proteínas, 
otros ). 
2. Tubo con EDTA, tapa lila: para recuento celular y diferencial. 
3.-Tubo estéril para microbiología, ò tubo tapa roja estéril, sin anticoagulante:3-5ml 
para gram y cultivo.. 
4. Inoculación directa en frasco de hemocultivo pediátrico (amarillo), con 1-3 ml de 
líquido. 
 
TRANSPORTE: 
-Transportar lo antes posible al Laboratorio, a temperatura ambiente. 
HORARIO RECEPCION: 
Durante las 24 horas. 
ENTREGA DE RESULTADOS: 
A las 48 horas, mínimo. 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
LIQUIDO ARTICULAR O SINOVIAL 
INDICACIONES: 
Fundamentalmente para evaluar las alteraciones del líquido sinovial en las artritis. 
La inflamación de estas articulaciones se puede producir por: 
 Agente físico o mecánico (traumatismos, gota) 
 Agentes químicos (hemofilia) 
 Artritis supuradas o sépticas 
 Artritis por reacciones inmunológicas o autoinmunes 
 Artritis reumatoide y fiebre 
 
TOMA DE MUESTRA: Se realiza por punción articular: 
 Personal entrenado 
 Técnica aséptica 
 Anestesia local 
 Procesar antes de 4 horas de obtenido 
 
NUMERO DE MUESTRAS: 
1. Tubo con Heparina, tapa verde: para análisis bioquímico. 
2. Tubo con EDTA, tapa lila: para recuento celular y diferencial. 
3. Tubo estéril para microbiología o tubo tapa roja estéril, sin anticoagulante: 3 
a 5 ml, para gram y cultivo. 
4. Inoculación directa en frasco de hemocultivo pediátrico (amarillo) con 1-3 
ml. de líquido. 
TRANSPORTE: 
 Piedra angular del diagnóstico etiológico: 
 Antes de iniciar antibióticos 
 Transporte y procesamiento rápido 
 Sensibilidad de Gram y Cultivo: 60-90%. 
 
 Transportar las muestras tomadas, lo más rápido posible al laboratorio, a 
temperatura ambiente. 
 
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Fecha: 21 sept. 2011 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
HORARIO RECEPCION: Durante las 24 horas. 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 horas, mínimo. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
CULTIVO LÍQUIDO CEFALORRAQUIDEO (LCR) 
 
INDICACIONES: 
-meningitis infecciosa -poliomielitis 
-hemorragias meníngeas -LES 
-encefalitis -sarcoidosis 
-neuropatías -vasculitis 
-hipertensión intracraneal benigna -sífilis nerviosa 
-epilepsia -hidrocefalia normo-tensa-demencia de origen metabólico -síndrome Guillain Barre 
-esclerosis múltiple y sus variantes -personas VIH + 
-linfoma, leucemia y otro tipo de tumores que involucran al SNC. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Muestra obtenida por un médico entrenado en la técnica de punción lumbar. 
 Técnica aséptica. 
 
PROCEDIMIENTO: 
 Limpieza por arrastre de la región lumbar del paciente con agua y jabón. 
 Limpiar la piel con tórula de algodón impregnada con alcohol 70% mediante 
movimientos concéntricos que van desde el lugar donde se realizará la 
punción, hacia afuera. 
 Proceder a la punción lumbar con técnica aséptica (campo estéril y equipo 
de profesionales con vestimenta de protección estéril. 
 Recolectar el LCR en frascos estériles plásticos con tapa rosca 
(citoquímico, bacteriológico y TBC cuando se sospeche). 
1.-Tubo con Heparina, tapa verde: para análisis bioquímico. (Glucosa, 
y proteínas) . 
2.- Tubo con EDTA, tapa lila: para recuento celular y diferencial. 
3.- Tubo estéril para microbiología,o tubo tapa roja estéril sin anticoa-
gulante, 1-2 ml.: para gram y cultivo. 
4.- Tubo estéril sin anticoagulante para ADA (TBC). 
5.- Tubo estéril para cultivo Koch sin anticoagulante. 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
 Inocular además, 1 frasco de hemocultivo pediátrico (amarillo), con 1 
 ml. de LCR. si es posible. 
 Lo adecuado para el estudio bacteriológico es de 2 ml. de LCR. 
 En aquellos casos en que se obtiene escasa cantidad de muestra, el clínico 
debe indicar orden, cuál de los estudios que se realizan con el LCR reviste 
mayor importancia. 
 Otra forma de tomar muestra de líquido cefalorraquídeo es por drenaje 
ventricular y por punción de fontanela. 
 
TRANSPORTE: 
 Se debe enviar a la mayor brevedad posible al laboratorio, en un tubo 
estéril plástico tapa rosca, a temperatura ambiente (no refrigerar), junto 
con el frasco de hemocultivo. 
 Transportar dentro de una unidad de transporte térmico. 
 
ENTREGA RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
NOTA: Si se envía frasco de hemocultivo con LCR ,no deje de enviar además LCR 
en tubo tapa roja para gram directo y siembra de la muestra. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
LIQUIDO PERITONEAL 
En el caso de: 
 Peritonitis bacteriana 2ª: perforación víscera (apendicitis, trauma). 
 Peritonitis 3ª: complicación de peritonitis secundaria. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Se realiza durante el intra-operatorio con jeringa estéril. 
 Personal entrenado 
 Técnica aséptica 
 
Recolectar muestra, en tubo de polietileno, tapa rosca estéril o tubo tapa roja, sin 
anticoagulante, para estudio microbiológico, de 3 a 5 ml es suficiente para realizar 
el estudio de gram y cultivo. 
No se recomienda inocular frasco de hemocultivo, ya que este tipo de muestras 
viene con una carga bacteriana alta. 
 
TRANSPORTE: 
-Transportar lo antes posible al Laboratorio, a temperatura ambiente, dentro de 
una unidad de transporte térmico. 
 
HORARIO RECEPCION: Durante las 24 horas. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 horas, mínimo. 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
 
LIQUIDO PLEURAL 
 
INDICACIONES: 
 Todo paciente que presente signos clínicos y/o radiológicos de derrame 
pleural de etiología no precisada. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
Debe ser realizada por un médico entrenado en la técnica de toracentesis, la 
punción aspirativa debe realizarse bajo rigurosa técnica aséptica. Se debe 
recolectar: 
1. Tubo con Heparina, tapa verde: para análisis bioquímico (glicemia, 
proteínas, otros) 
2. Tubo con EDTA, tapa lila: para recuento celular y diferencial. 
3. Tubo estéril para microbiología, o tubo tapa roja estéril, sin anticoagulante: 
3-5ml, para gram y cultivo. 
4. Inoculación directa en frasco de hemocultivo pediátrico (amarillo), con 1-3 
ml de líquido. 
5. Tubo para ADA (TBC) con citrato. 
6. Tubo estéril para cultivo de Koch.(TBC) 
 
TRANSPORTE: 
Transportar lo antes posible al Laboratorio, a temperatura ambiente, dentro de una 
unidad de transporte térmico. 
 
HORARIO RECEPCION: Durante las 24 horas. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
 
CULTIVO NASAL 
Portación nasal de Staphylococcus aureus está presente en 20 – 25 % de 
individuos sanos en la comunidad y con frecuencia en el ambiente hospitalario 
aumenta, de modo que solo se tomarán muestras del personal del hospital en 
caso de un brote intrahospitalario bien documentado, que permita establecer que 
se trata de la misma cepa, indicado por comité IAAS. 
 
 MUESTRA: Secreción nasal. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Introducir tórula humedecida en solución salina y rotar en el vestíbulo de 
ambas fosas nasales (tabique y cara interna de aletas nasales) 
 
TRANSPORTE: 
 Tórula en medio de transporte Stuart , a temperatura ambiente. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
MYCOPLASMA HOMINIS Y UREAPLASMA UREALYTICUM 
 
 Se envía información para el cultivo, identificación y estudio de sensibilidad de 
micoplasma urogenitales. Para el diagnóstico de micoplasma urogenitales se 
realiza: 
 Cultivo 
 Identificación 
 Recuento 
 Test de sensibilidad 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Para muestras vaginales, friccionar bien la mucosa para recoger la mayor 
cantidad de células posibles. 
 Efectuar la toma de muestra antes de cualquier antibioterapia. 
 Se debe aplicar técnica para evitar las contaminaciones por otras bacterias. 
 Después de tomar la muestra, colocar inmediatamente la tórula de 
DRALON en el frasco R 1 (cortar con tijeras) 
 Enviar el frasco R 1 al laboratorio. 
Identifica: Micoplasma hominis, Ureaplasma urealyticum. 
 
ANTIBIOTICOS A ESTUDIAR: 
Doxicilina Ofloxacina Claritromicina Azitromicina 
Eritromicina Tetraciclina Ciprofloxacino 
 
TRANSPORTE: 
-Transportar lo antes posible al Laboratorio, a temperatura ambiente, dentro de 
una unidad de transporte térmico. 
Informe de resultados: A las 48 horas. 
Muestras diarias máximas a enviar al laboratorio: 2 muestras hasta las 14 horas, 
de lunes a jueves (excepto festivos). 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
CULTIVO OCULAR 
GENERALIDADES: 
1. Muestra precoz, tomada en la forma más aséptica posible y antes de la 
aplicación de antimicrobianos. 
2. La actividad antimicrobiana de los anestésicos tópicos usados pueden 
interferir con el cultivo. 
 
MUESTRA: 
 SECRECION OCULAR 
 RASPADO CONJUNTIVAL 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Tomar la muestra para cultivo antes de la aplicación de anestésico típico. 
 Tomar la muestra con extremo cuidado, con la ayuda de otra persona que 
inmovilice la cabeza del paciente. 
 Obtener la secreción con tórula estéril del fondo de saco inferior en el 
ángulo interno del ojo del extremo interior del párpado, previo aseo ocular 
con suero fisiológico. 
 Rotar la tórula suavemente para que toda la superficie del algodón se 
empape en la secreción. 
 
TRANSPORTE: 
 Introducir la tórula en el medio transporte Stuart y mantener a temperatura 
ambiente. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 hrs. mínimo. 
 
 
 
 
 
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CULTIVO OTICO 
 Fluido del oído medio obtenido por Timpanocéntesis ( no es un 
procedimiento de rutina) 
 Secreción del conducto auditivo externo. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
1. TIMPANOCENTESIS: La muestra debe ser tomada por un 
Otorrinolaringólogo. 
 
2. SECRECION CONDUCTO AUDITIVO EXTERNO: 
 
 Aseo cuidadoso de la piel con suero fisiológico para disminuir 
posibilidades de arrastrar bacterias presentes normalmente en esta 
zona. 
 Tomar con una tórula fina llegando hasta las cercanías del tímpano. 
 Dirigir la tórula en sentido oblicuo de atrás hacia adelante y de abajo 
hacia arriba. 
 
TRANSPORTE: 
Cultivo aerobio: Transportar a temperatura ambiente en medio Stuart. 
 
Cultivo anaerobio: Transportar en medio anaerobio comercial, a temperatura 
ambiente. 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 48 horas mínimo. 
 
 
 
 
 
 
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ROTAVIRUS Y ADENOVIRUS (Por Enzimoinmunoensayo) en deposiciones. 
Rotavirus es el virus que más frecuentemente produce diarrea en los niños 
y se trasmite por contacto con alimentos, manos u objetos contaminados por 
deposiciones de personas infectadas. Se presenta en forma más grave en 
menores de 2 años y se cree que a los 3 años todos los niños ya han tenido 
contacto con el virus. 
Adenovirus, corresponden a un grupo de virus que causan diferentes tipos 
de enfermedades en el hombre. La mayoría de ellos producen infecciones 
respiratorias, y otros, menos frecuentemente, infecciones gastrointestinales. 
Pueden afectar a personas de cualquier edad aunque es más frecuente en los 
niños. Se presentan durante todo el año con un discreto ascenso a fines del 
invierno, primavera y principios del verano. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
1. Deposición por emisión espontánea 
2. Deposición obtenida por sonda rectal. 
3. Depositar en caja o frasco plástico limpio entregada por laboratorio. 
4. La muestra para leucocitos fecales sirve además para pesquisa de rotavirus., 
si la cantidad es de aproximadamente de 2 ml. de deposición líquida o una 
porción de 1 – 2 gramos de deposición sólida. 
 
TRANSPORTE: 
Llevar al Laboratorio, en caja o frasco plástico a temperatura ambiente. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: Durante el día. 
 
 
 
 
 
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CULTIVO SENOS PARANASALES 
MUESTRA: 
 Aspirado obtenido por punción de los senos paranasales. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 La muestra debe ser obtenida por otorrinolaringólogo. 
 Limpiar la mucosa nasal en el punto de la aspiración para eliminar 
microorganismos contaminantes. 
 Obtener el aspirado por punción aséptica con jeringa. 
 
CULTIVO AEROBIO: 
 Depositar la muestra en medio de transporte Stuart y enviar a temperatura 
ambiente., 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 48 horas mínimo. 
 
CULTIVO ANAEROBIO: 
 Enviar en medio de transporte comercial para anaerobios, a temperatura 
ambiente., 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 
Informe preliminar a las 48 – 96 Horas. 
 
 
 
 
 
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CULTIVO TEJIDOS, BIOPSIAS y ABSCESOS. 
El examen microbiológico de tejidos obtenidos por cirugía o muestras de 
biopsias se consideran importantes, porque este tipo de muestras pueden 
representar al proceso patológico entero. 
Las muestras quirúrgicas van a depender del sitio anatómico, del tipo de 
enfermedad, como también del cuidado del cuidado ejercitado durante el corte 
quirúrgico y dela información médica, lo que ayudará a buscar el agente 
etiológico. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Debe ser realizada por profesional idóneo. 
 Cuando la lesión es grande o numerosa deben tomarse varias muestras 
desde diferentes sitios. 
 En casos de escaras, deben ser removidas antes de realizarse la biopsia y 
recolectar al menos 1 gr. de tejido. 
 
1. TEJIDOS BLANDOS: Extraer la muestra con aguja y jeringa cuando la lesión 
permita la incisión y drenaje, o un trozo de tejido obtenido con técnica 
aséptica. 
 
2. MUESTRAS DE TEJIDOS POSTMORTEM: limitado para órganos específicos 
en el cual se sospecha la infección. 
 
3. MUESTRAS DE AUTOPSIA: obtener una porción grande de tejido con al 
menos, una superficie serosa o capsular intacta. 
 
4. ABSCESOS: debe incluir una muestra del contenido líquido interno como 
también una porción de las paredes. Extraer con aguja y jeringa. 
 
 
 
 
 
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TRANSPORTE AEROBIO: 
 Las muestras de biopsias y / o tejidos se colocan dentro de un frasco estéril 
de boca ancha. 
 Si la muestra es pequeña o escasa, colocar suero fisiológico. 
 En casos de abscesos colocar en tubo estéril o en medio de transporte 
Stuart sin la tórula. 
 
. TRANSPORTE ANAEROBIO: 
 Enviar en medio de transporte comercial para anaerobios, a temperatura 
ambiente. 
 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: 48 hrs. mínimo 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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MUESTRAS DEL TRACTO GENITAL FEMENINO. 
 
SITIO 
ANATOMICO 
MICROORGANISMOS MUESTRA RECOLECCION DE MUESTRA 
VULVA Haemophilus ducreyi. Aspirado ó tórula 
TRANSPORTE 
1.- irrigar con 0,5 ml. de suero 
fisiológico y aspirar. 
2.-Tomar muestra desde la 
lesión con tórula humedecida 
con suero fisiológico. 
GLANDULA 
DE 
BARTHOLINO 
 
Neisseria gonorrhoeae 
C. trachomatis. 
Bacterias aerobias 
y anaerobias. 
U.urealyticum. 
Aspirado de 
la glándula. 
 
Aspirar el absceso 
con aguja y jeringa, previo aseo 
genital. 
 
CULTIVO AEROBIO: 
Enviar en medio de 
transporte Stuart. 
 
CULTIVO ANAEROBIO: 
En medio de transporte comercial. 
 
 
 
 
 
 
VAGINA 
 
 
 
 
 
 
 
Trichomonas vaginalis. 
Candida albicans. 
Gardnerella vaginalis. 
Streptococcus Grupo B. 
 
Secreción vaginal. 
1.-Realizar aseo genital segùn 
normativa. 
2.-Colocar espéculo sin lubricante. 
3.-Introducir una sonda 
a través de la vagina, 
conectada a una jeringa 
que contenga 2 ml. de 
suero fisiológico. 
4.-Hacer lavado vaginal 
con el suero fisiológico. 
5.-Colocar el producto 
del lavado en tubo estéril. 
 
 
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VAGINA 
 
 
 
 
 
 
Listeria monocytogenes. Tórula vaginal 
1.-Realizar aseo genital según 
normativa 
 
2.-Tomar la muestra con tórula de 
la mucosa vaginal. 
 
3.-Enviar en medio de transporte 
Stuart. 
CERVIX Neisseria gonorrhoeae 
Tórula en medio de 
transporte Stuart. 
1.Realizar aseo genital según 
normativa. 
2.Limpiar cérvix de secreción 
vaginal y mucus. 
3.Usar espéculo sin lubricante. 
4.Tomar muestra de exudado 
endocervical haciendo rodar la 
tórula. 
ENDOMETRIO 
 
Bacterias aerobias y 
anaerobias. 
C.trachomatis. 
Aspirado tórula 
 
Aspirado transcervical a través 
de cateter. 
Tórula en cirugía en medio 
de transporte Stuart. 
 
TROMPAS DE 
FALOPIO 
 
Neisseria gonorrhoeae. 
C. trachomatis. 
bacterias aerobias y 
anaerobias. 
Aspirado tórula 
 
La toma de muestra se hace 
en la cirugía. 
LIQUIDO 
AMNIOTICO 
Bacterias aerobias y 
anaerobias. 
Líquido amniótico 
Amniocéntesis. 
Catéter intrauterino. 
Tórula desde cesárea 
en medio de transporte Stuart.NOTA: Los aspirados para cultivo aerobio se pueden transportar en medio Stuart sin la 
tórula. Para cultivo anaerobio utilizar medio comercial anaerobio. 
 
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MUESTRAS DEL TRACTO GENITAL MASCULINO 
 
SITIO 
ANATOMICO 
 
MICROORGANISMO 
 
MUESTRA 
 
RECOLECCION DE 
MUESTRA 
Y TRANSPORTE 
PROSTATA: 
Neisseria 
gonorrhoeae. 
Escherichia coli. 
Enterobacter spp. 
Klebsiella spp. 
Proteus spp. 
Serratia spp. 
Pseudomonas spp. 
Enrerococcus. 
Staphylococcus 
Saprophyticus. 
Post masaje 
prostático 
de secreción 
uretral 
tomada por 
urólogo. 
 
Cultivo de 
semen 
 
Masajear próstata a 
través del recto. 
Colocar líquido en tubo 
estéril o con tórula en medio 
de transporte Stuart. 
Colocar en tubo estéril 
 
 
 
ABSCESO 
PROSTATICO 
Staphylococcus 
aureus 
Post masaje 
prostàtico 
Secreciòn 
uretral 
tomada por 
urólogo. 
Idem al anterior 
EPIDIDIMO 
Neisseria 
gonorrhoeae. 
Chlamydia 
trachomatis. 
Enterobacterias 
Pseudomonas spp. 
Cocaceas gram 
positivas. 
Secreción 
uretral 
Orina de 
primera 
micción. 
Cultivo de 
semen 
 
Tórula en medio de 
transporte Stuart. 
Tubo estéril. 
TESTICULAR 
(ORQUITIS) 
Enterobacterias. 
Staphylococcus spp. 
Streptococcus spp. 
Secreción 
tomada con 
tórula en la 
cirugía. 
 
En medio de transporte 
Stuart. 
 
 
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URETRAL: 
Chlamydia 
trachomatis. 
Neisseria 
gonorrhoeae. 
Haemophilus spp. 
Ureaplasma 
urealyticum. 
Secreción 
uretral. 
 
 
Realizar aseo genital. 
Exteriorizar la secreción 
por presión de uretra hacia 
Introducir tórula de 
DRALON 2 cms. 
Rotar tórula. 
Colocar en medio 
de transporte. 
 
 
 
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UROCULTIVO. 
INDICACIONES: 
1. Sospecha ITU: Disuria, hematuria, orinas turbias, mal olor. 
2. Síndrome febril en estudio. 
3. Examen pre-operatorio. 
4. Previo procedimiento invasivo urológico. 
 
TOMA DE MUESTRA: 
 Tomar la primera micción de la mañana. Si no es posible, dejar 
permanecer la orina en la vejiga el mayor tiempo posible para aumentar el 
número de microorganismo para volumen.(> 4 horas) 
 La orina es un líquido estéril, pero bajo ciertas condiciones puede 
contaminarse con flora de la uretra, próstata o periné. 
 
ORINA DE 2° CHORRO: 
 Este método depende de la edad, sexo y habilidad del paciente para 
cooperar. Debe instruirse al paciente en forma verbal y escrita (pacientes 
que se les da hora) para tomar la muestra. 
 Debe ser tomada por personal adiestrado. 
 
TOMA DE MUESTRA PARA PACIENTES FEMENINAS: 
 Lavarse las manos con agua y jabón, enjuagarse y secar con toalla nova. 
 Realizar aseo genital: con una tórula de algodón con jabón, limpie los labios 
mayores por separado, con un solo movimiento de arrastre de arriba hacia 
abajo. Separe los labios mayores con el dedo índice y pulgar y limpie en la 
misma forma los labios menores y vestíbulo. 
 Enjuagar con agua tibia usando el resto de las rótulas de algodón. 
 Colocar un tapón de gasa estéril en la vagina. 
 Orinar una cantidad pequeña en el baño y después recolectar la orina 
restante en un tubo estéril o frasco. Cerrar evitando el contacto con dedos, 
genitales externos o ropa. 
 Sacar tapón vaginal y eliminar. 
 Enviar antes de una hora al laboratorio. 
 
 
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TOMA DE MUESTRA PARA PACIENTES MASCULINOS: 
 Lavarse las manos con agua y jabón, enjuagar y secar con toalla nova. 
 Lavado: retrae el prepucio, limpiar con tórula de algodón y jabón 
prolijamente con movimiento de arrastre. 
 Enjuagar con agua tibia y secar con tórula de algodón. 
 Orinar: el primer chorro se elimina: recolectar la muestra de orina restante 
directo al tubo estéril. 
 Cerrar el tubo. 
 
 
CATETER DE PERMANENCIA PROLONGADA (PUNCION): 
 Desinfectar sonda con una tórula de algodón con alcohol 70 °.dejando 
que se evapore. 
 Puncionar directamente el catéter con aguja en extremo distal de la sonda. 
 Colocar la orina aspirada en un frasco o tubo estéril 
 
 
CATETERIZACION: 
 Obtener orina por método de cateterización de la vejiga con técnica 
aséptica. 
 No se recomienda rutinariamente por el riesgo de introducir bacterias a la 
vejiga. 
 Indicar en la orden de laboratorio muestra tomada por catéter. 
 
 
PUNCION VESICAL: 
 Obtenida por técnica aséptica por médico. 
 Indicar en la orden: “muestra por punción”. 
 
 
 
 
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TRANSPORTE: 
 En el mismo tubo o recolector con orina, enviar antes de 1 hora al 
laboratorio. 
 Transportar a temperatura ambiente, dentro de una unidad de transporte 
térmico. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: A las 24 – 48 horas. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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VIRUS RESPIRATORIOS POR IFI. 
 Virus respiratorio Sincicial 
 Adenovirus 
 Parainfluenza 1- 2- 3 
 Influenza A 
 Influenza B 
 
La actividad más importante desarrollada por la sección de 
inmunofluorescencia es la determinación de infecciones por virus respiratorios, los 
cuales están asociados a infecciones respiratorias agudas del tracto respiratorio 
bajo y representan una de las principales causas de hospitalización en menores 
de dos años. 
 Las infecciones respiratorias agudas bajas ocupan el primer lugar en la tasa 
de mortalidad entre el mes y los doce meses y el segundo lugar desde el año a los 
cuatro años de vida. La mortalidad se incrementa ante la presencia de factores de 
riesgo como displasia broncopulmonar en prematuros, cardiopatías congénitas, 
inmunosupresiones, etc. 
 Los agentes etiológicos asociados con mayor frecuencia a infecciones 
respiratorias agudas bajas son los virus respiratorios, principalmente el virus 
sincicial respiratorio, adenovirus y parainfluenza. El adenovirus es el agente 
etiológico de mayor gravedad con una mortalidad de hasta 10% con secuelas 
como bronquiectasias, bronquiolitis obliterante o fibrosis pulmonar. 
 
TOMA DE MUESTRA: ASPIRADO NASOFARINGEO 
 
 Muestra tomada por profesional idóneo. 
 Muestra óptima es el aspirado nasofaríngeo. 
 
 
 
 
 
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MATERIALES. UNA BANDEJA CON: 
1. Tubo estéril, provisto de doble entrada. 
2.- Una sonda estéril para aspiración (nelatón N° 8) 
3.- Gradilla para tubos en cubeta con baño de hielo. 
4.- Bomba de vacío. 
5.- Un par de guantes estériles. 
 
PROCEDIMIENTO: 
- Lavarse las manos 
- Colocarse guantes 
- Conectar el tubo a la sonda de aspiración y al sistema de aspiración. 
- Introducir la sonda sin aspirar, por una fosa nasal hasta la nasofaringe y 
 retirar la sonda aspirando. 
- Repetir el procedimiento en la otra fosa nasal. 
- Aspirar un volumen aproximado de 6 – 8 ml. de solución buffer pH 7.2. frío, 
 a través del tubo 
- Cambiar la tapa del tubo colectar. 
- Enviar al laboratorio con la orden de examen. La muestra debe permanecer 
 todo el tiempo hasta la llegada al laboratorio, en baño de hielo. 
- Se deben enviar inmediatamente. 
 
 
TRANSPORTE: 
 La muestra debe sertransportada al laboratorio en tubo plástico, estéril, 
con tapa rosca, con 6-8 ml. de solución buffer pH 7.2, con unidad 
refrigerante, dentro de una unidad de transporte térmico. 
 Enviar de inmediato. 
 
HORARIO DE RECEPCION : hasta las 8:30 horas. 
ENTREGA DE RESULTADOS: Durante el día. 
 
 
 
 
 
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BORDETELLA POR IFD. 
Una de las actividades de la sección de inmunofluorescencia es la 
determinación de infecciones por Bordetella pertussis, patógeno exclusivamente 
humano, agente etiológico de la coqueluche o tos convulsiva, enfermedad 
endémica con ciclos epidémicos cada tres o cuatro años. Produce una infección 
respiratoria aguda, grave, altamente contagiosa, de declaración obligatoria cuyas 
manifestaciones clínicas dependen de la edad del paciente, el estado 
inmunológico, nutricional y que afecta mayoritariamente a los niños menores de un 
año de edad. 
La transmisión de la enfermedad ocurre de persona a persona a través de 
aerosoles o gotas de secreción de un individuo infectado. Luego de un período de 
incubación en general de siete días comienza la fase catarral que dura de una a 
dos semanas y cuya sintomatología puede confundirse con otras infecciones 
respiratorias. Esta es la etapa más contagiosa de la enfermedad. La siguiente fase 
es la paroxística que dura entre tres y seis semanas, presentándose con accesos 
de tos, estridor inspiratorio y vómitos después de la tos. En niños pequeños 
pueden no desarrollarse paroxismos ni estridor pero pueden presentar cianosis, 
apnea y muerte súbita. El último período es el de convalecencia que puede llegar 
a durar varios meses. 
 
 
TOMA DE MUESTRA: ASPIRADO NASOFARINGEO 
 
 Muestra tomada por profesional idóneo. 
 Muestra óptima es el aspirado nasofaríngeo. 
 
 
 
 
 
 
 
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MATERIALES. UNA BANDEJA CON: 
1. Tubo estéril, provisto de doble entrada. 
2.- Una sonda estéril para aspiración (nelatón N° 8) 
3.- Gradilla para tubos en cubeta con baño de hielo. 
4.- Bomba de vacío. 
5.- Un par de guantes estériles. 
 
PROCEDIMIENTO: 
- Lavarse las manos 
- Colocarse guantes 
- Conectar el tubo a la sonda de aspiración y al sistema de aspiración. 
- Introducir la sonda sin aspirar, por una fosa nasal hasta la nasofaringe y 
 retirar la sonda aspirando. 
- Repetir el procedimiento en la otra fosa nasal. 
- Aspirar un volumen aproximado de 6 – 8 ml. de suero fisiológico, a través 
 del tubo colector para arrastrar toda la secreción. 
- Cambiar la tapa del tubo colectar. 
- Enviar al laboratorio con la orden de examen. La muestra debe permanecer 
 todo el tiempo hasta la llegada al laboratorio, en baño de hielo. 
- Se deben enviar inmediatamente. 
 
TRANSPORTE: 
 
 La muestra debe ser transportada al laboratorio en tubo plástico, estéril, 
con tapa rosca, con 6-8 ml. suero fisiológico, con unidad refrigerante, 
dentro de una unidad de transporte térmico. 
 Enviar de inmediato. 
 
 
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La recepción de las muestras se realizara en jornada normal entre las 
8:00am a las 8:30pm de lunes a viernes; durante campañas de invierno se 
recepcionarán las muestras en el mismo horario de jornada normal de lunes a 
domingos. 
Cada muestra para ser recepcionada debe venir con su respectiva orden y 
rotulada en forma legible, bien sellada y como punto crítico que traiga una buena 
muestra de secreción nasofaríngea; muestras que no traigan una buena muestra, 
mal rotuladas o mal selladas deben ser devueltas al servicio de origen. 
 
ENTREGA DE RESULTADOS: Durante el día. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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BIBLIOGRAFIA. 
 Ulloa, Valenzuela, Pefaur, Martínez. Manual de Procedimientos de 
Muestras Clínicas para diagnóstico bacteriológico. 1995 Santiago. 
 
 Lennette, Balows, Hauster y Shadomy. Manual de Microbiología Clínica. 
4ta. Edición 1991, Washington D.C. 
 
 Procedimientos técnicos de Laboratorio Clínico. Vol. 1 Instituto Salud 
Pública, 1994. 
 
 Murray, Baron, Jorgensen, Landry, Pfaller. Manual de Microbiología Clínica. 
9ª Edición 2007. 
 
 Koneman E, Allen S, Dowell V, Sommers H. Diagnóstico microbiológico. 
Editorial Médica Panamericana. 3a ed. 1992, Buenos Aires. 
 
 Lauderdale T, Chapin K, Murray P. Reagents. En: Murray PR, Baron EJ, 
Pfaller MA, Tenover FC. Yolken RH. Manual of Clinical Microbiology. 7a ed. 
Washington DC: American Society for Microbiology; 1999. 
 
 Mc Clatchey KD. Clinical Laboratory Medicine. Baltimore: Williams and 
Wilkins, Baltimore, MD, 1994. 
 
 Koneman EW, Allen SD, Janda WM ,Schreckenberger PC, Winn WC. The 
Role of the Microbiology Laboratory in the Diagnosis of Infectious Diseases: 
Guideline to Practice and Management. En: Diagnostic Microbiology. 5th ed. 
Philadelphia: JB Lipincott Company, 1997. 
 
 Murray PR, Baron EJ, Pfaller MA, Tenover FC, Yolken RH. Manual of 
Clinical Microbiology 7th ed. American Society for Microbiology, Washington 
DC 1999. 
 
 Murray PR. Specimen Collection and Transport. ASM Pocket Guide to 
Clinical Microbiology. Washington, 1996; 3: 40-705. 
 
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Manual Toma de Muestras Microbiología 
 
 Miller JM. A Guide to Specimen Management in Clinical Microbiology. 1996. 
American Society for Microbiology, Press Wasington DC1996; 3: 37-115 
 
 Henry JB. Diagnóstico y Tratamiento Clínicos por el Laboratorio. 9ª Ed. 
Masson-Salvat, Ediciones Científicas y Técnicas, SA. Mexico, 1997. 
 
 Gilberto AM, Mauricio AR. Interpretación Clínica del Laboratorio. 6ª ed. Ed. 
Médica Panamericana. LDA, Colombia, 2000.