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Universidad Abierta y a Distancia de México División de Ciencias de la Salud, Biológicas y Ambientales Ingeniería en Biotecnología Genética Molecular Bacteriana Unidad 3 Actividad 2 Cuerpos de Inclusión Jessica Verónica Mendoza Prado ES202104539 Grupo BI-BGMB-2301-B2-002 11 de junio de 2023 Cuerpos de inclusión Los cuerpos de inclusión son agregados de macromoléculas, generalmente proteínas que pueden encontrarse en el citoplasma, núcleo celular. Son resultado de la sobreexpresión genética o de la mutación de genes con modificaciones post traducción erróneas. En el área biotecnológica, son de especial relevancia en los cultivos con E. coli, uno de los principales hospederos y principal herramienta de síntesis de biomoléculas para diversas aplicaciones. Estos agregados en E. coli son resultado de un desequilibrio en el plegado, agregación y degradación proteica, asociado a factores como metabolismo celular, síntesis proteica y maquinaria de modificaciones, así como las condiciones ambientales a las que esta expuesta la célula. Estrategias experimentales para minimizar la formación de cuerpos de inclusión en cultivos bacterianos • Disminuir la temperatura del cultivo en la fase de inducción o Lo que pretende esta estrategia es reducir el tiempo de expresión de las proteínas. Se usa una primera fase a 37°C para el crecimiento celular y una segunda a 20°C para la inducción de expresión proteica. • Añadir glucosa en el medio de cultivo o Propone reducir la expresión de las proteínas a través del efecto de represión catabólico que ejerce la glucosa sobre la inducción. o Según los reportes se usa un volumen de 1-2% • Añadir aditivos químicos o Pueden usarse aditivos como D-sorbitol, glicerol, etanol NaCl entre otros. ▪ Sorbitol .5-1.0 molar, NaCl .2-.8 M. o Causan estrés osmótico induciendo la síntesis de osmolitos. o El etanol en particular ejerce un efecto de shock térmico que induce la expresión de chaperones. ▪ Uso de concentración al 3% • Añadir cofactores de crecimiento proteico en el medio de cultivo Alta expresión protéica Vectores con promotores fuertes Optimización en el uso de codones Uso de cepas de rápido desarrollo Dificultad para mantener homeostásis proteíca Sobrepaso en la capacidad de modificaciones post traduccion y plegado Plegamiento erróneo Estrés celular Sobrecarga metabólica Aumento en demanda de energía Acumulo de proteínas mal plegadas Formación de cuerpos de inclusión Ilustración 1 Cuerpos de inclusión por sobre expresión de TGZp en E. coli o Se pretende que ayuden en el plegamiento de las proteínas, dado que algunas requieren de estos cofactores para plegarse adecuadamente • Co expresión de chaperones o Auxiliares en el pliegue adecuado de las proteínas o GroEL, GroES, ClpB • Co expresión de foldasa o Ayuda en el plegamiento adecuado proteico y la formación de enlaces de disulfuro o Se incluye isomerasa de disulfuro proteico e isomerasa de peptidil prolil • Usar un promotor más débil o Reduce la tasa de expresión de las proteínas o Permite que haya un mejor balance entre la síntesis proteica y el plegamiento. o Reduce el estrés metabólico en las células hospederas. Estrategias experimentales para disolver los cuerpos de inclusión en proteínas recombinantes • Buffer Tris-Cl o Es un método de solubilización que no desnaturaliza las proteínas para cuerpos de inclusión no clásicos. No es necesario redoblar. • Baja concentración de urea o Permite una solubilización media. No desnaturaliza todas las proteínas. • Disolución flash o Es el método más sencillo • Disolución pulsátil o Requiere poco buffer y rescata más proteínas • Diálisis de un paso o Exitoso en proteínas solubles en estadios intermediarios • Cromatografía de una sola columna o Separa la forma intermedia de las plegadas • Cromatografía de afinidad o Uso limitado a los casos en que Tag no interfiere con el plegado • Cromatografía con presencia de chaperones o Reduce la agregación al imitar las condiciones in vivo Bibliografía Bhatwa A, Wang W, Hassan YI, Abraham N, Li X-Z and Zhou T (2021) Challenges Associated With the Formation of Recombinant Protein Inclusion Bodies in Escherichia coli and Strategies to Address Them for Industrial Applications. Front. Bioeng. Biotechnol. 9:630551. Singh A, Upadhyay V, Upadhyay AK, Singh SM and Panda AK. (2015) Protein recovery from inclusion bodies of Escherichia coli using mild solubilization process. Micro. Cell Fact. 14:41.
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