BIOQUIMICA MICROBIANA

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BIOQUÍMICA MICROBIANA 
ENZIMAS 
 
Fecha:07-10-17 
Grupo: 4°”C” 
Alumnos: Contreras Miranda Amayrani, De la Cruz Alistac Ana Elizabeht, Sánchez 
Contreras Ma. Isabel 
 
Clasificación y nomenclatura de enzimas 
 
OXIDOREDUCTASAS 
Nombre NADH-Q oxidorreductasa 
Numero E.C 1.6.5.11 
Reacción que cataliza 
Substrato NADH 
H+ 
ubiquinona-1 
Producto NAD+ 
ubiquinol-1 
Km(mM) 
Kcat (1 /mMs -1) 
KI (mM) 
0,0968 - 0,112 
130 – 161 
0,7 - 1 
Residuos catalíticos ---------- 
organismos o microorganismos modelo en las 
que ha sido descrito 
Agrobacterium tumefaciens 
Escherichia coli 
 
Mencionar si requiere cofactores CoQ o ubiquinone 
Tionicotinamida - NADH 
Mencionar si requiere iones Na+ 
Ca 2+ 
Fe 
Mg 2+ 
Mencionar si tiene inhibidores Adenina 
capsaicina-40 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
 432 
Menciona su peso molecular KDa 25 
Estructura Cuaternaria 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
¿En qué residuos? 
No 
Cadena transportadora de electrones. La cadena transportadora de electrones es una serie de 
cuatro complejos (I, II, III, IV) a través de los cuales pasan los electrones. Los electrones son 
llevados del Complejo I y II al Complejo III por la coenzima Q (CoQ o ubiquinona) y del Complejo III al 
Complejo IV por la proteína citocromo c. Los electrones del NADH mitocondrial son transferidos al 
FMN uno de los grupos prostéticos de la NADH-Q oxidorreductasa (Complejo I), posteriormente los 
electrones se transfieren a un segundo tipo de grupo prostético el de las proteínas hierro-azufre y 
de aquí pasarán a la coenzima Q (QH2 o ubiquinol), quien también recibe electrones de la 
succinato-Q reductasa (Complejo II) a este complejo pertenece la enzima del ciclo de Krebs 
succinato deshidrogenasa la que genera FADH2, quien cede sus electrones a proteínas hierro-
azufre y de aquí a la coenzima Q para formar QH2 . La función del Complejo III identificado como Q-
citocromo c oxidorreductasa es catalizar la transferencia de electrones desde QH2 al citocromo c 
oxidado (cyt c). La etapa final de la cadena transportadora de electrones consiste en la oxidación 
del cyt c reducido generado por el Complejo III y la consiguiente reducción del O2 a dos moléculas 
de H2O. Esta reacción es catalizada por la citocromo c oxidasa (Complejo IV). Durante el flujo de 
electrones por la cadena respiratoria se realiza una transferencia de protones (H +) vía los 
Complejos I, III y IV que va desde la matriz de la mitocondria hacia la zona localizada entre la 
membrana mitocondrial interna y externa (espacio intermembranal). 
 
 
TRANSFERASA 
Nombre Glucoquinasa 
Numero E.C 2.7.1.2 
 
 
 
Reacción que cataliza 
 
Substrato D-glucosa + ATP 
Producto ADP + D-glucosa 6-fosfato 
Km(mM) 
Kcat (1 /mMs -1) 
KI (mM) 
0,028 – 45 
0,01 – 11 
0.0000128 (Proteína reguladora GK) 
Residuos catalíticos Asp 205 
organismos o microorganismos modelo en las 
que ha sido descrito 
Rattus norvegicus 
Pseudomonas putida 
Homo sapiens 
Mencionar si requiere cofactores Mg 2+ 
Mencionar si requiere iones ---- 
Mencionar si tiene inhibidores palmitoyl-CoA 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
448 residuos 
Menciona su peso molecular en KDa 52.191 
Estructura cuaternaria 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
¿En qué residuos? 
 
 
Si 
Glicosilación 
-Y61, V62, R63, S64, T65, P66, S151, F152, 
P153, T168, K169, N204, D205, M210, I211, 
Y214,Y215, C220, I 225, G229, C230, N231, 
M235, M238, V241, V244, G246, E256, Q287, 
E290, V452, V455 
Glucolisis: La glucólisis es una serie de reacciones que extraen energía de la glucosa al romperla 
en dos moléculas de tres carbonos llamadas piruvato. La glucólisis es una vía metabólica ancestral 
o sea, que su evolución ocurrió hace mucho tiempo y se encuentra en la gran mayoría de los 
organismos vivos hoy en día. 
En los organismos que realizan respiración celular, la glucólisis es la primera etapa de este 
proceso. Sin embargo, la glucólisis no requiere de oxígeno, por lo que muchos organismos 
anaerobios (organismos que no utilizan oxígeno), también tienen esta vía. 
 
 
 
HIDROLASA 
Nombre Glucosa-6-fosfatasa 
 
Numero E.C 3.1.3.9 
 
 
 
Reacción que cataliza 
 
Substrato D - glucosa 6 - fosfato + H _ {2} O 
Producto D-glucosa + fosfato 
Km(mM) 
Kcat (1 /mMs -1) 
KI (mM) 
0,51 - 2,7 
 
50 – 200 
Residuos catalíticos Arg-170,Arg-83, His-119, His-176 
organismos o microorganismos modelo en las 
que ha sido descrito 
Aspergillus oryzae 
Rattus norvegicus 
Homo sapiens 
Mencionar si requiere cofactores Mg2+ 
Mencionar si requiere iones Cd2 + 
Mencionar si tiene inhibidores 1 - penten - 3 – ona 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
 
Menciona su peso molecular en KDa 36 kD 
Estructura cuaternaria 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
 
 
¿En qué residuos? 
 
 
Si 
Glicoproteína 
Modificación de la cadena lateral 
 
La glucogenogénesis o glucogénesis, es la ruta anabólica por la que tiene lugar 
la síntesis de glucógeno (también llamado glicógeno) a partir de un precursor más simple, la 
glucosa-6-fosfato. Se lleva a cabo principalmente en el hígado, y en menor medida en el músculo, 
es activado por insulina en respuesta a los altos niveles de glucosa, que pueden ser (por ejemplo) 
posteriores a la ingesta de alimentos con carbohidratos.La Glucosa se convierte en glucosa-6-
fosfato mediante una reacción irreversible catalizada por 
la glucoquinasa o hexoquinasadependiendo del tejido en cuestión. 
glucosa + ATP → glucosa-6-P + ADP 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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https://es.wikipedia.org/wiki/Bios%C3%ADntesis
https://es.wikipedia.org/wiki/Gluc%C3%B3geno
https://es.wikipedia.org/wiki/Insulina
https://es.wikipedia.org/wiki/Glucosa
https://es.wikipedia.org/wiki/Glucosa-6-fosfato
https://es.wikipedia.org/wiki/Glucosa-6-fosfato
https://es.wikipedia.org/wiki/Glucoquinasa
https://es.wikipedia.org/wiki/Hexoquinasa
LIASA 
Nombre Aconitasa 
Numero E.C 4.2.1.3 
 
 
 
Reacción que cataliza 
 
Substrato Cisaconitato 
Producto Citrato 
-Km(mM) 
-Kcat (1 /mMs -1) 
-KI (mM) 
0,0035 - 0,2 
26 
0,4 - 0,51 (Fumarato) 
Residuos catalíticos D125, H126, H178, D205, H207, E302, S778, 
organismos o microorganismos modelo en las 
que ha sido descrito 
-Drosophila melanogaster 
-Canis lupus familiaris 
-Homo sapiens 
Mencionar si requiere cofactores Fe 2+ 
Mencionar si requiere iones ---- 
Mencionar si tiene inhibidores 1,10-fenantrolina 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
888 residuos 
Menciona su peso molecular en KDa 108.201 
Estructura Cuaternaria. 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
¿En qué residuos? 
 
 
-Si 
-Modificación proteolítica y en la cadena lateral. 
-Q86, F88, T89, I176, I177, H178, H207, S350, 
Q351, S436, C437, C506, I507, G508, S510, 
N535, G540, R541, V542, H543, P544, G684, 
N685, R713, S778, S779, R780. 
Ciclo del ácido Krebs ò tricarboxílico: Es una sucesión de reacciones químicas, que forma parte de 
la respiración celular en todas las células aeróbicas, donde es liberada energía almacenada a 
través de la oxidación del acetil-CoA derivado de carbohidratos, grasas y proteínas en dióxido de 
carbono y energía química en forma de trifosfato de adenosina (ATP). En células eucariotas se 
realiza en la matriz mitocondrial. En las procariotas, el ciclo de Krebs se realiza en el citoplasma. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
http://www.uniprot.org/keywords/KW-0816
 
ISOMERASAS 
Nombre Glucosa-6-fosfato isomerasa 
 
Numero E.C 5.3.1.9 
Reacción que cataliza 
 
Substrato D-glucosa 6-fosfato 
Producto D-fructosa 6-fosfato 
Km(mM) 
Kcat (1 /mMs -1) 
KI (mM) 
0,031 – 170 
0,02 – 162 
12,3 
Residuos catalíticos Arg202 - Glu145 - Glu285 - Gly201 - Lys139 - 
Lys420 
organismos o microorganismosmodelo en las 
que ha sido descrito 
Aeropyrum pernix 
Echinococcus multilocularis 
Mencionar si requiere cofactores ------------ 
Mencionar si requiere iones Co 2 + 
Cu 2 + 
Mencionar si tiene inhibidores 1,5-Anhidroglucitol 6-fosfato 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
 
 442 
Menciona su peso molecular KDa 63.20 
Estructura Cuaternaria 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
¿En qué residuos? 
 
Si 
sin glicoproteína 
Ile3 , Asp6, Ala74, Ile78, Gln107, Ala111 
 
La glucosa-6-fosfato isomerasa es una enzima, presente en gran parte de los seres vivos; cataliza 
la reacción reversible de glucosa-6-fosfato a fructosa-6-fosfato. En el citoplasma, forma parte de las 
rutas metabólicas de la glucólisis y la gluconeogénesis, y en la matriz extracelular funciona como 
factor neurotrófico para cierto tipo de neuronas. La reacción es la siguiente: La fosfoglucosa 
isomerasa cataliza la isomerización reversible de glucosa 6-fosfato a fructosa 6-fosfato. Además, se 
ha demostrado que la fosfoglucosa isómera tiene funciones equivalentes a la neuroleuquina, el 
factor de motilidad autócrina y el factor de maduración. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
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LIGASA 
Nombre Piruvato carboxilasa 
Numero E.C 6.4.1.1 
 
 
 
Reacción que cataliza 
 
Substrato ATP + piruvato + HCO _ {3} 
Producto ADP + oxaloacetato + fosfato 
Km(mM) 
Kcat (1 /mMs -1) 
KI (mM) 
3,3 – 18 
0,0011 – 99 
2,24 - 5,34 
Residuos catalíticos 
organismos o microorganismos modelo en las 
que ha sido descrito 
Gallus gallus 
Rhizobium etli 
Mencionar si requiere cofactores Biotina 
Mencionar si requiere iones Co2 + 
Mencionar si tiene inhibidores 1,10-fenantrolina 
Menciona el número de residuos que forman a 
la enzima 
680 residuos 
Menciona su peso molecular en KDa 130 KD 
Estructura Cuaternaria 
La cadena polipeptídica 
¿Sufre modificaciones post-traduccionales? 
¿Cuáles? 
 
¿En qué residuos? 
 
 
Si 
Modificación de la cadena lateral 
Gluconeogenesis una ruta metabólica anabólica que permite la biosíntesis de glucosa a partir de 
precursores no glucídicos. Incluye la utilización de varios aminoácidos, lactato, piruvato, glicerol y 
cualquiera de los intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos (o ciclo de Krebs) como 
fuentes de carbono para la vía metabólica..Oxaloacetato es intermediario en la producción del 
fosfoenolpiruvato en la gluconeogénesis. La conversión de piruvato a fosfoenolpiruvato en la 
gluconeogénesis se lleva a cabo en dos pasos. El primero de ellos es la reacción de piruvato 
y dióxido de carbono para dar oxaloacetato. Este paso requiere energía, la cual queda disponible 
por hidrólisis de ATP. 
La enzima que cataliza esta reacción es la piruvato carboxilasa, una enzima alostérica que se 
encuentra en la mitocondria. El acetil-CoA es un efector alostérico que activa la piruvato 
carboxilasa. Cuando hay más acetil-CoA del necesario para mantener el ciclo del ácido cítrico, el 
piruvato se dirige a la gluconeogénesis. El ion magnesio y la biotina son necesarios para una 
catálisis eficaz. 
 
 
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javascript:Org('29449')
https://es.wikipedia.org/wiki/Ruta_metab%C3%B3lica
https://es.wikipedia.org/wiki/Anab%C3%B3lica
https://es.wikipedia.org/wiki/Bios%C3%ADntesis
https://es.wikipedia.org/wiki/Glucosa
https://es.wikipedia.org/wiki/Gl%C3%BAcido
https://es.wikipedia.org/wiki/Amino%C3%A1cido
https://es.wikipedia.org/wiki/Lactato
https://es.wikipedia.org/wiki/Piruvato
https://es.wikipedia.org/wiki/Glicerol
https://es.wikipedia.org/wiki/Ciclo_de_los_%C3%A1cidos_tricarbox%C3%ADlicos
https://es.wikipedia.org/wiki/Carbono
https://es.wikipedia.org/wiki/Di%C3%B3xido_de_carbono
https://es.wikipedia.org/wiki/Hidr%C3%B3lisis
https://es.wikipedia.org/wiki/Adenos%C3%ADn_trifosfato
https://es.wikipedia.org/wiki/Piruvato_carboxilasa
https://es.wikipedia.org/wiki/Enzima_alost%C3%A9rica
https://es.wikipedia.org/wiki/Mitocondria
https://es.wikipedia.org/wiki/Acetil-CoA
https://es.wikipedia.org/wiki/Ciclo_del_%C3%A1cido_c%C3%ADtrico
https://es.wikipedia.org/wiki/Magnesio
https://es.wikipedia.org/wiki/Biotina