Logo Studenta

Biologia de los microorganismos-1068 (445)

¡Estudia con miles de materiales!

Vista previa del material en texto

212 G E N Ó M I C A , G E N É T I C A Y V I R O L O G Í A
Los datos del interactoma se expresan normalmente en la 
forma de diagramas de redes, donde cada nodo representa 
una proteína y las líneas de conexión representando las inte-
racciones. Los diagramas de interactomas completos pueden 
ser muy complejos; por tanto, interactomas más centrados 
en una función, como la red de proteínas de la motilidad de 
la bacteria Campylobacter jejuni (Figura  6.22), son más ins-
tructivos. Esta figura muestra las interacciones fundamentales 
entre componentes bien conocidos del sistema de quimiotaxia 
(  Secciones 2.19 y 7.8) e incluye todas las otras proteínas que 
interaccionan con estas. 
MINIRREVISIÓN
 ¿Por qué el término «proteoma» es ambiguo, mientras que el 
término «genoma» no lo es?
 ¿Cuáles son los métodos experimentales más frecuentes para 
estudiar el proteoma?
 ¿Qué es el interactoma?
6.9 La metabolómica y la biología 
de sistemas
El metaboloma es el conjunto completo de intermediarios 
metabólicos y otras moléculas pequeñas producidas en un orga-
nismo. La metabolómica ha ido a la zaga de otras «ómicas», en 
gran parte debido a la inmensa diversidad química de los peque-
ños metabolitos que pueden estar presentes en una célula. Esto 
convierte el estudio sistemático en un desaf ío técnico. Los pri-
meros intentos se hicieron mediante análisis de resonancia 
magnética nuclear (RMN) de extractos celulares marcados con 
13C-glucosa (13C es un isótopo pesado de carbono, la mayoría 
de estos son 12C). Sin embargo, la sensibilidad este método es 
limitada y el número de compuestos que se pueden identificar 
El interactoma
Por analogía con los términos «genoma» y «proteoma», el interac-
toma es el conjunto completo de interacciones entre las macromo-
léculas dentro de la célula (Figura 6.22). Originalmente, el término 
interactoma se aplicó a las interacciones entre proteínas, muchas 
de las cuales se ensamblan en complejos. Sin embargo, también 
es posible considerar las interacciones entre diferentes clases de 
macromoléculas, como es el caso del interactoma proteína-RNA.
Figura 6.21 Proteómica comparativa. Compararon por categorías
funcionales de las secuencias de proteínas que contienen dominios de unión a 
zinc de 40 Bacteria, 12 Archaea y 5 Eukarya. Las proteínas que contienen zinc 
son del 5 % al 6 % del total de proteínas en procariotas y del 8 % al 9 % en 
eucariotas, y muchas son enzimas. Los eucariotas también contienen factores 
de transcripción exclusivos que contienen zinc.
20
40
60
80
100
P
ro
te
ín
a
s
 c
o
n
 d
o
m
in
io
s
 d
e
 u
n
ió
n
 a
 Z
n
 (
%
)
Enzimas Factores de
transcripción 
Otras
funciones
Eucariotas Procariotas Eucariotas
y procariotas
Figura 6.22 Interactoma de las proteínas de la motilidad en Campylobacter jejuni. Esta red ilustra cómo se representan usualmente los datos del
interactoma. (a) Subsección de la red que muestra proteínas bien conocidas de la ruta de transducción de señales de la quimiotaxia (CheW, CheA, y CheY) y sus 
compañeras. MCP, proteínas de la quimiotaxia aceptoras de metilo ( Sección 7.8). (b) Interacciones más probables entre todas las proteínas conocidas que 
participan en la motilidad. Nótese que hay seis redes pequeñas que quedan fuera de la red principal.
https://booksmedicos.org
	booksmedicos.org
	Botón1:

Continuar navegando