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218 G E N Ó M I C A , G E N É T I C A Y V I R O L O G Í A En los procariotas se conocen al menos tres mecanismos de transferencia horizontal de genes: transformación, transduc- ción y conjugación (Capítulo 10). El flujo horizontal de genes puede estar muy extendido en la naturaleza y, en ocasiones, puede traspasar incluso las fronteras de dominios filogenéticos. No obstante, para ser detectable por genómica comparativa, la diferencia entre los organismos debe ser bastante grande. Por ejemplo, se han encontrado varios genes de origen eucariótico en Chlamydia y Rickettsia, dos patógenos humanos. En con- creto, se han hallado dos genes que codifican proteínas simila- res a la histona H1 en el genoma de Chlamydia trachomatis, lo que sugiere su transferencia horizontal desde una fuente euca- riótica, quizás incluso el hospedador humano. Obsérvese que es la situación contraria a la de la mitocondria, en la que los genes del ancestro de las mitocondrias fueron transferidos al núcleo eucariótico (Sección 6.5). Detección del flujo horizontal de genes Las transferencias horizontales de genes se pueden detectar en los genomas una vez que se han anotado los genes (Sección 6.3). La presencia de genes que codifican proteínas encontrados nor- malmente solo en especies con un parentesco muy lejano es una señal de que los genes se originaron por transferencia horizon- tal. Sin embargo, otro indicio de transferencia horizontal es la presencia de un fragmento de DNA cuyo contenido en guanina/ citosina (GC) o cuya preferencia de codones difieran significati- vamente del resto del genoma (Figura 6.29). Con ayuda de estas pistas se han documentado muchos ejemplos de transferen- cia horizontal probable en los genomas de varios procariotas. Un ejemplo clásico es el que se da en el organismo Thermotoga maritima, una especie de Bacteria de la que se ha visto que con- tiene más de 400 genes (más del 20 % de su genoma) de origen arqueano. De estos genes, 81 se encontraron en grupos discre- tos, lo que sugiere que se obtuvieron por transferencia horizon- tal, probablemente de Archaea termófilas que comparten los ambientes calientes habitados por Thermotoga. Los genes transferidos horizontalmente codifican nor- malmente funciones metabólicas diferentes de los procesos moleculares centrales de la replicación, la transcripción y la traducción del DNA y pudiera explicar la semejanza previa- mente mencionada entre los genes metabólicos de Archaea y Bacteria (Sección 6.4). Además, hay varios ejemplos de genes de virulencia de patógenos que han sido adquiridos por trans- ferencia horizontal. Es evidente que, en la naturaleza, los pro- cariotas están activamente intercambiando genes y este proceso funciona probablemente mejorando el genoma de un orga- nismo para una situación o un hábitat concretos. No obstante, es necesario ser cautos al recurrir a la transferencia horizontal para explicar la distribución de genes en un organismo dado. Por ejemplo, cuando el genoma humano se secuenció por pri- mera vez, se identificaron unos 200 genes como producto de la transferencia horizontal desde los procariotas. Sin embargo, cuando se dispuso de más genomas eucariotas para compa- rar, se encontraron homólogos de la mayoría de estos genes en muchos linajes eucarióticos. Por tanto, parece ser que la mayo- ría de estos genes, en realidad, tienen un origen eucariótico. Solo una docena de genes humanos se aceptan hoy en día como fuertes candidatos a tener un origen procariótico relativamente reciente. La expresión «relativamente reciente» se refiere aquí secuenciado los cromosomas de muchos microorganismos diferentes, esas comparaciones son fáciles de hacer, y los resul- tados son, a menudo, sorprendentes. Por ejemplo, los genes de Archaea que intervienen en la replicación, la transcripción y la traducción del DNA son más parecidos a los de Eukarya que a los de Bacteria. Sin embargo, contra todo pronóstico, otros muchos genes arqueanos, por ejemplo los que codifican fun- ciones metabólicas diferentes del procesamiento de la informa- ción, son más parecidos a los de Bacteria que a los de Eukarya. Las herramientas analíticas de la bioinformática permiten deducir muy rápidamente relaciones genéticas entre organis- mos cualesquiera, a nivel de genes individuales, de grupos de genes o del genoma completo. Los resultados obtenidos hasta el momento no hacen sino confirmar el diseño filogenético de la vida deducido originalmente por comparación de secuencias de rRNA ( Sección 12.4), a la vez que sugieren que muchos genes en todos los organismos tienen raíces evolutivas comu- nes. No obstante, estos análisis también han revelado ejemplos de transferencia horizontal, un aspecto importante sobre el que vamos a centrar nuestra atención. MINIRREVISIÓN ¿Qué son genes homólogos? ¿Qué es una familia génica? Compare genes parálogos con genes ortólogos 6.12 Transferencia horizontal de genes y estabilidad del genoma La evolución está basada en la transferencia de rasgos genéti- cos de una generación a la siguiente. No obstante, entre los pro- cariotas también se da la transferencia horizontal de genes (a veces denominada transferencia lateral de genes), y esto puede complicar el estudio de los genomas. La transferencia horizontal de genes se produce cada vez que los genes son transferidos de una célula a otra de modo diferente al proceso habitual de herencia (vertical), en el que el genoma es transferido de una célula madre a una célula hija (Figura 6.29). Figura 6.29 Transferencia genética vertical y horizontal. La transferencia vertical de genes ocurre cuando una célula se divide. La transferencia horizontal de genes ocurre cuando una célula donadora aporta genes suyos a una célula receptora. En los procariotas, la transferencia horizontal ocurre mediante uno de estos tres mecanismos: transformación, transducción y conjugación. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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