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BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELOS _________________________________________________________________ Cabrera-Melgar, V., Calsin Maihuire, L. L., Molina Araujo J., Quispe Umiyauri, A. I., Rosado Ballivián, M. F., Sucasaire Usca, E. M., Taco Calderón, L., Valero Tinta, D. E. Asesor: Doctor (PhD) Armando Jacinto Arenazas Rodríguez, Coordinador del curso: Doctor (PhD) Eusebio Walter Colque Rondón Universidad Nacional de San Agustín de Arequipa Facultad de Ciencias Biológicas, Escuela Profesional de Biología Resumen El presente trabajo de investigación es una revisión bibliográfica, la cual se compila la más reciente información y aplicaciones de organismos modelo en la experimentación científica, desde un enfoque celular. Se utilizó variedad de repositorios, páginas de revistas, bases de datos (UNSA, Scopus, Science, Pubmed, Scielo, Wiley, Google Académico, etc.) para recolectar de información, basándonos en fuentes confiables y publicaciones actuales. Los organismos modelo investigados son de los 5 reinos: procariota, protista, fungí, plantae y animalia. El trabajo demuestra la importancia de los organismos modelo, sus aplicaciones en el campo de la investigación científica, haciendo énfasis en la Biología Celular. Palaras clave: Organismos modelo, biología celular, aplicaciones, experimentación. Abstract This research work is a bibliographic review, which compiles the most recent information and applications of model organisms in scientific experimentation, from a cellular approach. A variety of repositories, journal pages, databases (UNSA, Scopus, Science, Pubmed, Scielo, Wiley, Google Scholar, etc.) were used to collect information, based on reliable sources and current publications. The model organisms investigated are from the 5 kingdoms: prokaryote, protist, fungi, plantae and animalia. The work demonstrates the importance of model organisms, their applications in the field of scientific research, emphasizing Cell Biology. Keywords: Model Organisms, cell biology, applications, experimentation. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 2 Introducción La evolución de las células a partir de un antepasado común tiene importantes implicaciones para la biología celular y molecular como ciencia experimental. Debido a que las propiedades fundamentales de todas las células se han conservado durante la evolución, los principios básicos obtenidos de los experimentos desarrollados con un solo tipo de célula son generalmente aplicables a otras células. Por otra parte, debido a la diversidad de las células actuales, muchos de los experimentos son más fáciles de llevar a cabo con un tipo de células en lugar de otras. Se utilizan diferentes tipos de células y organismos como modelos experimentales para estudiar diversos aspectos de la biología celular y molecular, el uso de estos organismos ha facilitado la comprensión de los diversos procesos celulares y esto ha llevado a un gran avance en investigaciones y experimentaciones de la biología contemporánea. En la actualidad, la clasificación de los seres vivos los divide en tres dominios: Archaea, Bacteria y Eukarya. Los dos primeros son organismos procariotas, mientras que Eukarya corresponde a los organismos eucariontes. Gracias a esta clasificación podemos tener una gran distinción de los Dominios, Reinos, División y así hasta llegar a las Especies debido a la taxonomía, mostrándonos las particularidades de cada organismo como Familia o Especie sirviendo de gran ayuda a las distintas investigaciones como esta que es de tipo celular ya sea en un enfoque unicelular o pluricelular. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 3 1. Procariotas 1.1. Bacillus subtilis: La gran mayoría de cepas de Bacillus subtilis utilizadas en la investigación derivan de la cepa de B. subtilis 168 una cepa auxótrofa de triptófano, es una bacteria grampositiva, aeróbica, encontrada en el suelo, que ha sido usado en la investigación e industrias, en la industria se ha utilizado para la obtención de productos comerciales como la elaboración de probióticos y producción de enzimas usadas, como también, en la elaboración de alimentos, cosméticos y productos biológicos de uso agrícola el género Bacillus como un agente de control biológico e implicaciones en la bioseguridad en lo agrícola). En investigaciones se ha usado a Bacillus subtilis como un organismo modelo, se caracteriza en tener la capacidad de formar esporas: ¿Cómo es la formación de esporas? Las esporas bacterianas son estructuras que contienen material genético, son resistentes a condiciones extremas, germinan rápidamente absorbiendo agua. Con el agua, se realiza una disolución de la cubierta, forma una nueva pared celular y se convierte en una célula activa (Person, 2021). Esporulación: (última estrategia de supervivencia). Al inicio el material genético se encuentra duplicado, en torno a una de las copias crece una membrana y lo que hace esta es separarla del resto de la célula, para esto se requiere un proceso de diferenciación celular, también a ciertas condiciones puede incorporar ADN extraño o extranjero (bacteria competente) ¿Qué es una bacteria competente? Son células bacterianas que se usan para la transformación bacteriana, esto quiere decir que existe la unión de ADN extraño a la membrana celular y el movimiento a través de esta, tiene una importancia como almacenamiento y replicación de ADN y plásmidos. Todo esto facilita la manipulación genética y además que su genoma está totalmente secuenciado, entonces, es un organismo modelo en el estudio de formación de endosporas y diferenciación celular. (Villarreal-Delgado et al., 2018) 1.2. Bacillus thuringiensis: Figura 1. Crystal y esporas de bacillus thuringiensis BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 4 Nota. La fotografía evidencia a una cepa de Bacillus thuringiensis ( Bt ) nativa esporulada después de la autolisis, teñida con Coomassie,los cristales se tiñen de oscuro, mientras que las esporas permanecen claras. Tomado de tomado de Kahn,T. W et al. , 2021. Según Kahn (2021) Bacillus thuringiensis es una bacteria Gram-positiva esporulante productora de la familia de proteínas Cry (crystal). Estas proteínas se utilizan en la agricultura como insecticida debido a que los cultivos son diseñados para expresar la proteína Cry y controlar diversas plagas como el nematodo del quiste de la soja. Cuando la proteína Cry es consumida por el nematodo se presenta una interrupción en la ingesta, parálisis del intestino, descomposición osmótica y finalmente la muerte. Esto se da debido a la activación de la protoxina en un ambiente reductor que desestabiliza sus puentes disulfuros y a la acción de las proteasas que se encuentran en el intestino medio del nematodo. Una vez se activa la toxina, esta reconoce receptores en las vesículas de membrana de la microvellosidad apical de las células del intestino medio del nematodo donde se inserta en la membrana apical y se da la formación de canales de iones o poros en la membrana celular dando por resultado un aumento en la permeabilidad de la membrana celular donde se da la entrada de agua, aniones, cationes y moléculas de mayor peso que destruyen el epitelio intestinal. Una vez destruido el epitelio las esporas de Bacillus thuringiensis se introducen en la hemolinfa provocando una septicemiay finalmente la muerte (Portela,2013). Figura 2. Destrucción del intestino medio de Bacillus thuringiensis. Nota. El intestino medio de Bacillus thuringiensis es destruido debido a una descomposición osmótica que ocasiona la muerte. Tomado de Kahn,T. W et al. , 2021 1.3. Caulobacter crescentus De acuerdo con su clasificación taxonómica, su dominio es bacteria, filo Proteobacteria, clase Alphaproteobacteria, orden Caulobacteres, familia Caulobacterales, género Caulobacter, especie C,crescentus. Caulobacter crescentus es una bacteria gramnegativa acuática la cual se caracteriza por tener un ciclo celular inusual, tiene un crecimiento reducido y puede crecer en los mismos medios que la Escherichia coli. Caulobacter crescentus es dimórfica y https://www.nature.com/articles/s41467-021-23743-3#auth-Theodore_W_-Kahn https://www.nature.com/articles/s41467-021-23743-3#auth-Theodore_W_-Kahn BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 5 asimétrica, es un organismo modelo muy importante para el estudio del ciclo celular bacteriano, la polaridad celular y la diferenciación polar. Resalta por tener una coordinación precisa entre el desarrollo de los orgánulos polares y el ciclo celular, también por tener un regulador maestro de la respuesta CtrA, la cual controla la replicación asimétrica, la morfogénesis polar y la división celular, asimismo es conocida por dividirse en dos tipos celulares: Swarmer cell, está explora y también está en busca de recursos sin embargo no puede replicarse antes de diferenciarse en el segundo tipo celular llamado Stalked cell, la cual sí es capaz de replicarse. Lo que sobresale acerca de las Swarmer cells, es que se pueden aislar en poblaciones mediante un proceso de centrifugación, a partir de esto estas empiezan a dividirse en forma casi sincrónica durante un ciclo celular completo. Esto la convierte en un perfecto modelo para el estudio del ciclo celular bacteriano. Figura 3. Célula predivisional de Caulobacter . Nota.Micrografía electrónica de una célula predivisional de Caulobacter preparada mediante tinción negativa con acetato de uranilo.Tomado de Nat Rev Microbiol 4, 643, por Jones, S. 2006. 1.4. Chloroflexus aurantiacus. De acuerdo a su clasificación taxonómica, su dominio es bacteria, filo Cloroflexi, Clase Clorofexia, Orden Chloroflexaceae, Género Chloroflexus, y especie Chloroflexus aurantiacus La Chloroflexus aurantiacus es una bacteria fotosintética, la primera aislada fue de fuentes termales en Sokokura, Japón. Es fotótrofica anoxigénica filamentosa (FAP), es decir que no producen oxígeno como subproducto de la fotosíntesis, más bien usa compuestos de azufre reducido como sulfuro de hidrógeno, tiosulfato o azufre elemental. Además, es termófila al crecer entre temperaturas de 35 °C a 70 °C y puede sobrevivir en la oscuridad si hay oxígeno. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 6 Se realizó su secuenciación genómica de acuerdo a la investigación realizada por Tang, KH., Barry, K., Chertkov, O. et al. (2011), en la cual se encontró genes para: el fotosistema quimérico, cadena de transporte de electrones fotosintéticos, el ciclo de fijación de carbono autotrófico del 3-hidroxipropionato, el ciclo del glioxilato, y la vía de reducción del azufre. El genoma de Cfl. Aurantiacus, tiene características singulares en sus vías metabólicas (puede crecer fotoautotróficamente y fotoheterotróficamente en condiciones de crecimiento anaeróbico y quimiotróficamente en condiciones de crecimiento aeróbico), también se encontró: genes duplicados y pares de enzimas aeróbicas y anaeróbicas en la cadena de transporte de electrones, operación en varias vías de asimilación de carbono, etc. Su importancia radica en que Chloroflexus spp son las primeras bacterias capaces de realizar fotosíntesis, por tanto, su genoma puede ser de mucha utilidad en estudios de las conexiones evolutivas de la fotosíntesis y en la horizontalización entre especies o transferencias de genes laterales, como se muestra en la siguiente figura del estudio mencionado anteriormente. Figura 4. Transferencias de genes laterales/ horizontales propuestas entre Cfl. Aurantiacus y otras bacterias fototróficas. Nota: Se describe la transferencia de genes desde Cfl. Aurantiacus o hacia éste desde otras bacterias (púrpuras, verdes sulfurosos, cianobacterias y heliobacterias). Tomado de Complete genome sequence of the filamentous anoxygenic phototrophic bacterium Chloroflexus aurantiacus. Esto ya se explicaba en un artículo de Pennisi, E. (2002) en el que los estudios genéticos comparativos de ese entonces, de los 200 genes compartidos se encontró 50 genes fotosintéticos, es así que los genes de la fotosíntesis se han movido de un organismo a otro a lo largo del tiempo. https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-334 https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-334 https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-334 https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-334 https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-12-334 BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 7 1.5. Escherichia coli Escherichia coli forma parte del microbiota intestinal de la mayoría de las especies animales y del hombre y es uno de los organismos modelo más explorados para la investigación de la evolución y adaptación bacteriana en diferentes condiciones de crecimiento (Kaper et al., 2004; Morales et al., 2007; Alteri y Mobley 2012; Leimbach et al., 2013; Dellepiane y Morales-Cauti, 2018). Este microorganismo puede desarrollarse en diferentes nichos, pudiendo encontrarse en los hospederos vivos, el medio ambiente y los alimentos, por lo que también se le considera un indicador de contaminación fecal y, por ende, de prácticas deficientes de higiene (Lucas et al., 2016b; Corzo-Ariyama et al., 2019). Una de las especies bacterianas más versátiles, ya que además de las cepas comensales, presenta cepas específicas que tienen el potencial de causar numerosas patologías intestinales y extraintestinales (Gordon y Cowling, 2003; Morales et al., 2007; Croxen y Finlay, 2010; Tenaillon et al., 2010; Alteri y Mobley, 2012). La gran versatilidad de E. coli se explica en su alto potencial de recombinación (Tenaillon et al., 2010), lo que resulta, además, en una enorme variabilidad genética, por lo que su tipificación juega un papel crítico en el avance de la comprensión de la evolución (Morales et al., 2017), capacidad de causar enfermedad, transmisión y vigilancia de este microorganismo. La tipificación molecular de E. coli puede ser realizada mediante metodologías como la electroforesis de enzimas multilocus (multilocus enzyme electrophoresis, MLEE), tipificación multilocus de secuencias (Multilocus sequence typing, MLST), por reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase chain reaction, PCR) y por la secuenciación del genoma (Clermont et al., 2015). Se ha demostrado que las cepas de E. coli pueden dividirse en cuatro grupos filogenéticos principales: A, B1, B2 y D. Esta tipificación, además, se relaciona con el carácter virulento de las cepas de E. coli, pues las cepas virulentas extraintestinales (ExPEC) pertenecen principalmente al filogrupo B2 y, en menor medida, al grupo D (Herzer et al., 1990; Clermont et al., 2000, 2015; Wirth et al., 2006; Bok et al.,2020); por otro lado están las cepas que pertenecen a los grupos B1 y A, descritas normalmente como cepas comensales (Bok et al., 2020). Entre los métodos que permiten realizar esta tipificación existe uno que se destaca por su sencillez y rapidez, denominado «método http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B22 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B28 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B28 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B1 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B23 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B23 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B26 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B10 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B10 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B17 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B11 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B36 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B36 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B36 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B36 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B9 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B19 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B7 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B37 http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B4 BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 8 Clermont» (Clermont et al., 2000), el cual se basa en la detección de tres marcadores genéticos (chuA, yjaA y TSPE4.C2) mediante PCR, mostrando una excelente congruencia con métodos de referencia como el MLST en la asignación de filogrupos (Gordon et al., 2008; Clermont et al., 2015). 1.6. Fischerella thermalis Poseedor de la proteína OCP2, carotenoide naranja relacionado con la fotoprotección de los en cianobacterias, evita daños en contra radiaciones. Poseen capacidad termófila puesto que alcanzan temperaturas entre 60 °C a 64 °C sin alteraciones en sus funciones fotosintéticas. (Pivato, M. 2021) Heterocisto funcional a temperaturas mayores a 60 °C, con correcta función fijadora de nitrógeno atmosférico y carbono. Sin disfuncionalidad de fotosistemas 1, 2, ficobilisomas y citocromos cuando son expuestos a radiación o a temperaturas extremas. Poseen genes relacionados con la ramificación, que son inexistentes en el orden Nostocales. (Alcorta, J. 2019) Figura 5. Ramificación de F. thermalis prominente de sus heterocistos Nota: visualización de las ramificaciones verdaderas en microscopía electrónica. Tomado de: Fischerella thermalis: un organismo modelo para estudiar la diazotrofia termófila, la fotosíntesis y la multicelularidad en cianobacterias. Alcorta, J., et al. 2019. 1.7. Mycoplasma genitalium El Mycoplasma es un organismo que no posee pared celular así provocando cambios celulares, como en el metabolismo o crecimiento celular, por lo tanto, no son sensibles a los antibióticos que inhiben la síntesis de pared celular tal como la penicilina y además que sus genomas son muy reducidos siendo 525 por lo cual se le considera un modelo célula mínima (María Lluch, 2010). Mayormente este tipo de organismo se sitúa como parásito o comensal de varios animales vertebrados y en el caso del ser humano varias de estas especies son agentes patógenos como el Mycoplasma genitalium (imagen 1). Este infecta y habita http://www.scielo.org.pe/scielo.php?pid=S1609-91172020000200040&script=sci_arttext#B16 BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 9 el sistema reproductivo en las células epiteliales ciliadas, a través de las relaciones sexuales es como se obtiene afectando en las mujeres con cervicitis y en la enfermedad pélvica inflamatoria y en hombres ocacionando uretritis, proctitis y/o faringitis (Mondoja, 2017). Figura 6. Imagen de mecanismo de infección producida en el cuerpo humano por Mycoplasma genitalium. Nota: Se observa como el mycoplasma actúa como parásito en el cuerpo humano atacando los eritrocitos como también suelen infectar células epiteliales ciliadas del tracto urinario. Tomado de: Un proceso clave para la supervivencia de ‘Mycoplasma genitalium’ en el tracto urogenital 1.8. Pseudomonas fluorescens Pseudomonas fluorescens es una especie bacteriana, Gram-negativa perteneciente al Filo proteobacteria, este es un organismo modelo utilizado como un biocontrolador de fitopatógeno, reductor de metales pesados y para futuros tratamientos de biorremediación. Este organismo se caracteriza por presentar una gran diversidad metabólica y contienen información genética necesaria para la producción de vías enzimáticas (Reuter, C. 2019), por otra parte tienen un gran potencial de degradación de compuestos aromáticos y xenobióticos, presentando la capacidad de colonizar el sistema radicular de plantas, formar biopelículas (Matthijs et al. 2007 como se citó en Guerra, G. A et al. 2011). Algunas especies de Pseudomonas como las P. fluorescens pueden reducir eficazmente el Cr (VI) en aguas residuales industriales y mostrar gran potencial en la biorremediación de Cr (VI). El mecanismo por el cual las P. fluorescens reducen el Cr (VI), se debe a que el ion cromato puede atravesar la membrana celular de la bacteria a través de un transportador aniónico no específico de sulfato. En presencia de oxígeno, la enzima (cromato reductasas) es responsable de la reducción aeróbica de Cr (VI) a Cr III, se requiere NAD(P)H. (Castillo, S., et al. 2015) BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 10 Figura 7. Transporte y toxicidad del cromo en la célula bacteriana. Nota. Transporte y toxicidad del cromo en la célula bacteriana. A) Captación del Cr(VI) a través del sistema de transporte de sulfato. B) Reducción extracelular de Cr(VI) a Cr(III) el cual no atraviesa la membrana. C) Reducción intracelular de Cr(VI) Cr(III). D) Estrés oxidativo causado por la generación de especies reactivas de oxígeno como consecuencia de la reducción del Cr(VI) y E) Daño ocasionado a las proteínas y al ADN. Modificado de Ramírez-Díaz et al. (2008). 2.Protistas 2.1 Dictyostelium discoideum Es un eucarionte unicelular ameboide que pertenece a uno de los grupos de "amebas sociales", por lo general suelen alimentarse de bacterias y levaduras, cuando escasean estos recursos pueden comportarse como una población amebiana mediante un mecanismo de señalización celular que consiste en liberar y reconocer AMPc (adenosín monofosfato cíclico), para así formar un cuerpo fructífero en donde cuyos miembros fagocitan independientemente, se juntan para formar una masa celular: un pseudoplasmodio. Es así como estas amebas "cooperan" en la formación de una fructificación multicelular arboriforme (cuerpo fructífero). Son gregarias, en un sentido "no etológico" (no de comportamiento) sino bioquímico y morfogenético (Vadell, 2010). Posee 2 tipos celulares mayoritarios:esporas y células tallo que están en una proporción de 80% y 20% respectivamente. Las esporas son estructuras de resistencia que permiten la supervivencia de la especie durante largos periodos de tiempo y forman la bolsa de esporas (sorocarpo) que se sitúa en el ápice del tallo. Las células tallo son células muertas con una pared celular compuesta de celulosa. Además de formar el tallo, constituyen el disco basal que es el anclaje al sustrato y el soporte de toda la estructura. (Vadell, 2010). Posee dos fases: Unicelular: En la fase unicelular Dictyostelium se mantiene en estado ameboide y se divide por mitosis. En un medio sólido, las amebas se alimentan de bacterias o levaduras mediante fagocitosis. En un medio líquido, englobando BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 11 grandes cantidades de medio mediante pinocitosis proceso que nunca ocurre en la naturaleza. Otra característica fundamental de la fase unicelular es la motilidad celular y la quimiotaxis, es decir las amebas son capaces de moverse rápidamente en respuesta a la concentración de un químico. La motilidad y la capacidad de respuesta ante los estímulos externos se debe a la rápida reorganización del citoesqueleto (Corcuera, 2008). Pluricelular: Ocurre cuando la ameba detecta la escasez de nutrientes y desencadena todo ese mecanismo ya explicado anteriormente, con el AMPc todo esto sucede antes de que los nutrientes desaparezcan siendo segregado PSF (pre- sarvation factor) que es una glicoproteína que funciona como sensor del estado nutricional. Una característica esencial en la formación del cuerpo fructífero de la densidad celular es que al ser bajo ocasiona que la estructura del cuerpo sea pequeña y de pocas esporas, pero cuando es mayor esta densidad el cuerpo fructífero será de mayor tamaño y colapsara en el sustrato debido a que el tallo no ofrece una resistencia adecuada. Además existe otro mecanismo que controla el número celular del cuerpo fructífero es el CFs (counting factors) este regula la cantidad de amebas que sean agregadas, siendo esta unión originada a través de ondas que manifiesta una ante la escasez de los recursos para así que otra ameba reconozca dicha onda migrando hasta su dirección y al unirse, la onda se incrementa generando que otras más lejanas se unan así hasta formar el cuerpo fructífero (Corcuera, 2008). Figura 8. Fase Unicelular y Celular de Dictyostelium discoideum Nota. Se describe las dos fases de Dictyostelium discoideum donde se obtiene finalmente el cuerpo fructífero maduro. Tomado de Vadell, E. M. 2010. 2.2 Euglena gracilis Se estudió mediante la injerta de su paramilon con capacidad de respuesta inmune, en ratones mostrando una mejor supervivencia a BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 12 la infección de la gripe humana. (Barsanti, L. 2020) Creciendo bajo condiciones fotoauxotróficas son ricos en ácido linolénico y contienen cantidades relativamente pequeñas de ácido polineoicos. Expuestas a cadmio orgánico sufren efectos de citotoxicidad como el rompimiento de la cadena de ADN y la membrana intracelular, resultado de ello se forma el estrés oxidativo. Las células morfológicamente alteradas inducidas mostraron una intensa fluorescencia de dihidrofluoresceína. (Watanabe, M. 2002) Posee un sistema de endomembrana desarrollado, y procesamiento sintético de ARN en laboratorios para la manipulación de su transcriptoma y proteomas, en su sistema fotosintético. Posee flexibilidad metabólica, y esto está relacionado a su carencia de membrana celular. (Ebenezer, 2019) 2.3. Foraminíferas Los foraminíferos son protozoos unicelulares pertenecientes al filo, subfilo y clase Foraminifera siendo los más abundantes del ambiente marino y corresponden al mayor componente de la fauna bentónica. Están compuestos por un citoplasma incoloro, aunque puede contener material lipídico, su célula está protegida por un esqueleto externo denominado testa o concha, formada por el propio organismo a través de vesículas citoplasmáticas segregadas por el aparato de Golgi. (Hansen 1999). Poseen características que los convierten en excelentes bioindicadores de cambios ambientales y contaminación costera, por su amplia distribución y ciclo de vida corto, dando información y mostrando respuesta rápida a cambios ambientales en un periodo de tiempo. Según (Alve & Nagy, 1986, como se citó en Tavera, 2019), adicionalmente, pueden ser fácilmente recolectados en grandes cantidades, lo que contribuye a un análisis estadístico robusto y a su vez, pueden mantenerse vivos en condiciones de laboratorio, permitiendo identificar las respuestas de los mismos frente algún contaminante específico o estrés ambiental. Aplicaciones en investigaciones realizadas con los Foraminíferos BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 13 Bioindicadores La mayoría de foraminíferos presentan un caparazón de material calcáreo, que por su excelente preservación proporciona un registro del estrés ambiental a lo largo del tiempo, y también presentan una mayor sensibilidad al deterioro ambiental. De acuerdo a Cesar, A., (2003), las zonas costeras, se encuentran sometidas a un constante estrés ambiental principalmente por la contaminación de origen antrópico, provenientes de actividades de industrialización, urbanización, turismo, agricultura y acuicultura. Estos residuos contienen contaminantes orgánicos, metales pesados, nutrientes, aceites, patógenos e Hidrocarburos Aromáticos Policíclicos (PHAs), que al ser depositados en los sedimentos marinos tienden a acumularse en la fauna marina, en consecuencia, afectan las condiciones ambientales de las redes tróficas marinas produciendo deficiencias en los micronutrientes. Los metales pesados poseen cierta afinidad con los organismos unicelulares, por tanto, estos agentes son absorbidos por medio de la membrana celular y a través del proceso de difusión, que controla la velocidad de captación y unión de las proteínas dentro de la célula. En investigaciones en zonas con algún tipo de estrés ambiental: salinidades extremas, temperatura, carencia o exceso de alimento, bajo contenido de oxígeno disuelto, polución y actividades antropogénicas mencionadas por (Boltovskoy et al., 1991, como se citó en Tavera, 2019) se ha registrado respuestas de los foraminíferos bentónicos frente a condiciones ecológicas adversas, tales como cambios en la abundancia y diversidad de las comunidades, observando predominancia de especies oportunistas, extinciones locales y presencia de anormalidades en los caparazones (tamaño, forma y disposición de las cámaras) que pueden ser causadas por factores ecológicos y físicos. De acuerdo a la investigación realizada por Tavera, (2019) en la bahía de mejillones del norte de Chile los resultados obtenidos fueron que debido a la contaminación de antropogénica, especialmente por los metales pesados se evidenció anomalías en la morfología de los caparazones de los foraminíferos como una reducción del tamaño de las cámaras, descalcificación, un enrollamiento distorsionado y aperturas dobles, esto también afectó su supervivencia, posiblemente debido a la alteración que BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 14 causaban estos metales potencialmente tóxicos en su funcionamiento celular. 2.4. Vorticella convallaria: Vorticella convallariaes una de las máquinas celulares más rápidas y potentes. El cuerpo celular está unido a un sustrato por un tallo delgado que contiene una estructura polimérica (Isac, Rodríguez, Salas, Fernández, s. f.): el espasmonema. El enrollamiento helicoidal del tallo resulta de la rápida contracción del espasmonema, un evento mediado por la unión del calcio, que se utiliza para generar movimiento a nivel celular y molecular, el tallo vorticella es un cuerpo zooide que se contrae en enrollamiento helicoidal, si existe una ausencia de calcio los filamentos de espamina se pondrán paralelos, además que se va a cargar negativamente(«MOTIVOS», s. f.), la espamina es una proteína del espasmonema que fija el calcio. Figura 9. Zoología UCR - Reseña del ciliado Vorticella convallaria. (s. f.) Nota.Vorticella convallaria es un organismo unicelular con forma de campana invertida. En su morfología destaca una corona de cilios de dos bandas al borde de la boca celular que se mueven secuencialmente.Tomado de zoología UCR - (s. f.) Ahora si existe una cantidad alta de calcio en el medio está generará contracciones, la señal se propaga por las reservas de la membrana dentro de la espasmonema neutralizando las cargas (colapso entrópico). Los investigadores han realizado experimentos en Vorticella, tallos tratados en glicerol (Upadhyaya et al., 2008), ¿Por qué con glicerol? El glicerol es un alcohol este se usa para permeabilizar la membrana de la Vorticella y así poder aumentar calcio o disminuir el calcio. Después de la contracción, el tallo se desenrolla y vuelve a extenderse espontáneamente. Se habla de este organismo porque en las contracciones que se BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 15 realiza participa una proteína que es la espamina, esta es una proteína homóloga a las del dominio estructural de LA MANO EF («Mano EF», s. f.) que es un tipo de proteínas con afinidad al calcio. La Centrina pertenece a este grupo, esta proteína es un componente de los centros organizadores microtubulares, es decir trabaja con los centriolos y cuerpos basales, todo esto implicados en la mitosis (división celular) El ciliado Vorticella convallaria es útil para varias aplicaciones biofluídicas ya que tiene una gran capacidad magnética debido a los cilios que tiene, se alimenta de bacterias siendo atraídas por la capacidad magnética, esto contribuye a la autodepuración del agua en los lugares que habita. Actúa eliminando el exceso de bacterias no floculadas, es decir, consumen bacterias que son libres o no formadoras de flóculos (bacterias dispersas). Se encuentra en medios con cierta cantidad de materia orgánica y se desarrolla en sistemas de fangos activados cuando su funcionamiento es estable, la presencia de protozoos ciliados en los fangos activos es de gran importancia en el proceso, ya que contribuyen directamente a la clarificación del agua a través de dos actividades, que son la floculación y la depredación, siendo esta última la más importante. Cuando hay un número elevado de protozoos ciliados, el agua tendrá menor turbidez y menor DBO que cuando no los hay. Los ciliados se alimentan también de bacterias patógenas, por lo que contribuyen a la reducción de sus niveles. 3. Fungi 3.1 Aspergillus niger Según Villena (2022) Aspergillus niger es un hongo común formándose como moho negro en frutas cítricas y es utilizado para la obtención de enzimas a nivel industrial tal como la glucanasa o celulasa. Este último es una enzima degradadora de la celulosa que es el principal componente de la pared celular de los vegetales siendo ésta muy resistente ante la fermentación, para así la formación de sustratos que sirven de fuente nutricional para vegetales y hongos, mayormente su uso industrial apoya en la agronomía, muchos son los organismos que producen la celulasa pero son pocas las enzimas producidas a nivel extracelular capaces de hidrolizar la celulosa siendo este el caso de la Aspergillus niger. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 16 Figura 10. Vista de Aspergillus niger a través del microscopio Nota. Aspergillus niger, especie común del género Aspergillus que se encuentra en el aire y en las aguas residuales de los vertederos. Tomado de Dreamstime (s.f) Este hongo muestra algunas ventajas para la producción industrial de enzimas debido a que tiene un alto nivel de producción, presenta buenas propiedades para el cultivo, pero estas requieren un contacto cercano con el sustrato en este caso bagazo de caña de azúcar debido a su nutrición heterótrofa, secreción de enzimas extracelulares, absorción de nutrientes a través de la pared celular y el crecimiento apical de sus hifas. (Llenque, 2015) Según Llenque (2015) utilizando el bagazo de caña seco con esporas de Aspergillus niger inmovilizadas en agar y fermentadores de columna tipo sistema batch agitados por inyección de aire filtrado por cinco días en oscuridad, indujo una mayor actividad celulolítica a los tres días de fermentación evidenciando una interacción positiva hasta formarse un micelio. La presencia de las celulasas se puede detectar desde los dos primeros días de la interacción de los protagonistas de este proceso, en donde la cantidad de enzimas se incrementa debido al bagazo de caña de azúcar que permitió la metabolización de la celulosa para obtener moléculas de glucosa, por lo cual el hongo tuvo que excretar las celulasas para hidrolizar los enlaces de los glúcidos del bagazo para luego poder absorberlas por su pared celular. Los eventos descritos anteriormente ocurrieron en el sistema permitiendo la formación de biopelículas por parte del hongo en el bagazo de caña de azúcar, contribuyendo así a su crecimiento y metabolismo así siendo todo esto para la formación de celulasas que mejoraran los cultivos. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 17 Figura 11. Actividad de Aspergillus niger Not Nota. En esta imagen podemos apreciar el sistema de reacciones en un medio sólido celulósico. Tomado de Ramos, L. B et al. 2017. 3.2. Aspergillus niger, Pseudocamarosporium, Penicillium link y Alternaria nees ex Según el Dpto. Biología Vegetal y Ecología de la Universidad de Almería, el filo Ascomycota constituye el taxón fúngico con mayor número de especies, la mayor parte son saprofitos descomponedores, son importantes en producción de antibióticos, industria alimentaria, química y agrícola. La estructura macroscópica de los ascomicetos es muy variada, presenta ascos, célula en forma de saco que contiene un número determinado de ascósporas, es una estructura particular de meiosporangio, su micelio es septado, excepto en levaduras. Su ciclo de vida consta de una fase sexual (por ascósporas) y de otra asexual (conidios). Aspergillus o moho negro es un hongo filamentoso hialino, saprofito, perteneciente al filo Ascomycota. Se encuentra formado por hifas hialinas septadas y puede tener reproducción sexual y asexual. De las aprox. 180 especies, estas se diferencian en tamaño, tasa de crecimiento, textura y color de la colonia. Hongos como agentes de Biorremediación Las actividades industriales generan contaminación ambiental, del agua, suelo y subsuelo con metales ecotóxicos, estos no pueden degradarse, sólo pueden transformarse y/o retirarse del medio. Los metales ecotóxicos, son considerados contaminantes tóxicos por su persistencia enel medio ambiente. Las tecnologías convencionales de remoción de metales ecotóxicos son muy costosas, debido a ello se ha empezado a explorar el uso de microorganismos para la biorremoción de diferentes metales. Según Aymara Uscamayta, C. G. (2018) “los hongos y sus enzimas ligninolíticas han sido investigados para la eliminación de un amplio espectro de contaminantes orgánicos e inorgánicos traza, por presentar un mayor https://w3.ual.es/GruposInv/myco-ual/galeria25/image4.htm BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 18 desarrollo micelar en presencia de metales ecotóxicos”. La biorremoción es un proceso que produce subproductos no tóxicos, es rápido, a costo bajo, diseño y operatividad simple. Según Belay, (2017), la biorremoción de metales por hongos implica una combinación de dos procesos: bioacumulación (proceso del metabolismo activo, que incluye transporte celular y la partición en componentes intracelulares) y biosorción (unión de metales a la biomasa por procesos que no requieren energía metabólica). También es un proceso de catálisis biológica, en la cual biomasa viva o muerta capta iones metálicos, para este proceso se involucra una fase sólida, como las membranas o paredes celulares las cuales funcionan como biosorbentes, y una fase líquida, donde el agua funciona como solvente y contiene los iones metálicos los cuales serán biosorbidos, sorbato. (Gregory Sandoval, 2006, como se citó en Villaveces Palacio, C. (2019). Figura 12. Proceso de biosorción, bioacumulación y biotransformación Nota. Proceso de biosorción, bioacumulación y biotransformación. Tomada de Villaveces Palacio, C. (2019). Las estrategias de biorremediación de acuerdo a la investigación de Cañizares- Villanueva, R. O. (2000) incluyen precipitación de metales extracelulares, inhibición del flujo, aumento del flujo de elementos, producción de enzimas intracelulares - extracelulares, unión de metales a las paredes celulares (principal sitio de acumulación), secuestro intracelular, formación de complejos insolubles, captación a través de biopolímeros purificados, además las células impermeabilizadas con carbonato o detergente, pueden aumentar su captación y acumular metales como gránulos o depósitos intracelulares En la investigación realizada por Aymara Uscamayta, C. G. (2018) se utilizaron 4 cepas fúngicas de los géneros Aspergillus, BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 19 Pseudocamarosporium, Penicillium y Alternaria (aisladas de efluentes industriales) y metales ecotóxicos (Cr, Pb, B, Fe), se probó durante 21 días con diferentes concentraciones, durante el proceso se observó un efecto sobre el crecimiento de los hongos en base al valor del diámetro de los micelios. Los resultados fueron que el nivel de tolerancia depende del metal, en las cepas de A. niger y Pseudocamarosporium se obtuvo un crecimiento radial fuerte, en concentraciones de 500 ppm de iones metálicos se encontró que ambas sobresalieron por su adaptación a la presencia de metales ecotóxicos, y en mayor medida A. niger, por tanto, se concluye que esta es un candidato prometedor para la eliminación de metales ecotóxicos en ambientes contaminados. En otro estudio con hongos micorrízicos arbusculares (HMA) y la fitorremediación de Pb, de Alvarado, C. et al. (2011), menciona que los HMA presentan una asociación simbiótica con más del 80% de plantas terrestres cuyas esporas tienen un distinto nivel de sensibilidad a la presencia de metales, por tanto, contribuyen a la inmovilización de metales, mediante las glicoproteínas secretadas por el hongo, absorción del pb en paredes celulares y la quelación de metales al interior de la hifa. Un agente potencial de retención de Pb en el micelio de los HMA son las metalotioneínas que son polipéptidos capaces de adsorber metales pesados, es por ello que la asociación de hongos micorrízicos arbusculares con plantas le confiere estos beneficios nutricionales y de resistencia a diferentes factores de estrés, tanto bióticos como abióticos. 3.3. Ganoderma lucidum El hongo ganoderma lucidum es un basidiomicete que pertenece a la familia Ganodermataceae. Este organismo posee numerosos compuestos bioactivos con potencial medicinal, principalmente triterpenos (ácidos ganodéricos), polisacáridos y polifenoles (Bidegain, M. 2017). Figura 12. Macroscopía y microscopía de Ganoderma sp BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 20 Nota. Evaluación de sustratos para la producción de polisacáridos y biomasa de Ganoderma sp. Tomado de López, X. et al., 2015 En Wang, F. et al. (2015) se utilizó el polvo de esporas de Ganoderma lucidum (GLSP) en ratas diabéticas. Los resultados obtenidos fueron la reducción del nivel de glucosa y la síntesis de lípidos. La intervención de GLSP atenuó en gran medida el nivel de estrés oxidativo en las ratas diabéticas. Según Jiang. J, et al. (2006) los resultados de su investigación sugieren que G. lucidum inhibe la proliferación de células de cáncer de mama humano y contiene compuestos biológicamente activos con especificidad contra el receptor de estrógenos y la señalización de NF-kappaB La actividad antitumoral de G. lucidum se debería a la acción conjunta de varios de sus componentes como sus polisacáridos que median en el sistema inmune incrementando la producción de citoquinas, la inhibición de la ADN polimerasa y de la modificación postranscripcional de oncoproteínas. (Wasser, S. 2005 como se citó en Bidegain, M. 2017) Según Figlas, D., & Curveto, N. (2010). Se han encontrado propiedades físico-químicas de más de 150 triterpenoides encontrados en G.lucidum. Estos pueden inhibir la invasión y metástasis tumoral como en las células humanas de hepatoma. a través de la supresión de proteincinasa C (PKC). 3.4. Neurospora crassa: Neurospora crassa es un hongo ascomiceto utilizado como modelo para el estudio de la fotobiología (interacciones entre radiaciones no ionizantes) La percepción de luz llega a las proteínas (fotorreceptoras) a unas proteínas específicas llamadas cromoproteínas lo que provoca cambios conformacionales, cambios bioquímicos y fisiológicos (Grajales, Castro, & Sánchez, s. f.). La luz es una fuente de energía imprescindible para organismos fotosintéticos. En muchos hongos es esencial para la regulación de su metabolismo, como la producción y dispersión de esporas, es un hongo heterotálico, quiere decir que necesita dos parejas compatibles para su reproducción BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 21 sexual. Sus células realizan divisiones mitóticas que se almacenan en unos sacos membranosos llamadas ascas, estas ascas son el aparato reproductor de este hongo, ya que forma ascosporas (esporas sexuales) por todo esto se le considera como un organismo modelo porque posee un gran potencial para la investigación genética. ¿Qué tiene que ver la fotobiología? («Las reacciones dependientes de la luz», s. f.) Gracias a que este hongo capta la luz azul, es esta misma que regula ciertos procesos metabólicos como la carotenogénesis y esporulación. Neurospora crassa ha servido como organismo modelo en la investigación de la percepción de luz azul y la transducción de la señal lumínica (proceso por el cual se genera una respuesta en los fotorreceptores) han contribuido al conocimiento de algunos de los mecanismos moleculares implicadosen las respuestas a la luz (Sánchez & del Mar, 2017). La luz se percibe a través del complejo White Collar (WCC) ¿Qué es el complejo White Collar? Es un complejo que depende de la luz y que a su vez tiene cierta caracterización de los genes WC I y WC II, estos dos son clave para la respuesta a la luz, ya que actúan como un factor de transcripción regulando las expresiones de los genes, además de que existe otros tipos de genes del Neurospora crassa para fotorreceptores secundarios como los fitocromos, opsina y criptocromos. (s. f.-d) Neurospora crassa ha desempeñado un papel fundamental en la elucidación de los mecanismos moleculares de los ritmos circadianos, se ha utilizado N. crassa como organismo modelo de los ritmos circadianos porque es fácil de cultivar y trabajar en el laboratorio, se ha estudiado durante muchos años y su ritmo de formación de esporas es fácil de ver. N. crassa produce una nueva generación de esporas, pues el moho está bajo un ciclo circadiano de 24 horas controlado por sus genes. Este ciclo se mantiene incluso cuando el hongo es mantenido en la oscuridad permanente de un laboratorio, pero el moho ajustará el ciclo a un periodo de 22 horas al cabo de un tiempo. Se ha encontrado en N. crassa dos genes (WC-1 y WC-2) y la enzima Succinato deshidrogenasa los cuales son importantes para el reloj en el hongo, y resulta que estos genes se encuentran en todos los organismos, pero nadie sabía que estaban relacionados con el reloj. Esto podría significar que se tiene dos pistas sobre la identidad de un posible reloj universal. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 22 3.5. Saccharomyces cerevisiae La levadura Saccharomyces cerevisiae (S. cerevisiae) (Saccharomycetaceae), es uno de los organismos modelo eucariota más utilizados. Se ha empleado para estudiar el envejecimiento, regulación de la expresión génica, señales de transducción, ciclo celular, metabolismo, apoptosis, enfermedades neurodegenerativas y muchos otros procesos biológicos. Según Karathia et al. (2011) existen hasta el 30% de genes implicados en enfermedades humanas que pueden tener ortólogos (secuencias homólogas) en el proteoma de la levadura. La humanización sistemática de los genes de levadura, ha revelado funciones conservadas y modularidad genética. Según Kachroo et al. (2015) aproximadamente el 47% de los genes esenciales de la levadura pueden ser reemplazados por sus genes ortólogos humanos. Según estas características ventajosas Tucker & Fields (2001), han utilizado la levadura como una herramienta experimental para muchos estudios biológicos. El análisis de dos híbridos en levadura, han sido utilizados para su identificación a través de la interacción de biomoléculas funcionales mediante la interacción proteína-proteína. La levadura también se ha utilizado para el cribado de inhibidores químicos de proteínas humanas. Se han desarrollado varios métodos de cribado de alto rendimiento, tales como el cribado de estrógeno de levadura (Tucker & Fields, 2001). No posee dependencia de mitocondrias, suministra ATP del medio extracelular, directamente del citosol por la fermentación. Presencia de ramificaciones en su mitocondria, dependientes de la cantidad de carbono presente. (Ardiani, A. 2010) Posee un genoma secuenciado, gracias a ello se hace de fácil manipulación genética, un organismo ideal para las técnicas de criopreparación. (Busher, C. 2010) Saccharomyces cerevisiae puede sintetizar y degradar trehalosa y, dependiendo de las condiciones ambientales y la etapa del ciclo de vida, la trehalosa puede representar menos del 1% o más del 23% del peso seco de las células. Tiene un papel importante en su ciclo de vida. (Nwaka, S. 1997) Es empleada por los investigadores reguladores de la señalización de proteína G (RGS), proteínas encargadas de transmitir señales de manera inter y extra celular. Utilizada también para evaluar las funciones de la proteína G en otros organismos. En su reproducción posee una fase haploide, BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 23 lo cual indica que puede identificar y caracterizar mutaciones recesivas. (Ginger, A. 2002) Aplicación biomédica: Reparación celular entera por inserción de S. cerevisiae a causa de su pared celular de glucano, absorbidas por fagocitosis y reaccionando con las células DC y macrofagos dando una “señalización de peligro''. (Ardiniani, A. 2010) Figura 13. Células presentadoras de antígeno Nota. Medio de administración de vacunas a base de S. cerevisiae. Tomado de Vaccines based on whole recombinant Saccharomyces cerevisiae cells. Ardiani, A. 2010. 4. Plantae 4.1 Briofitas: 4.4.1 Physcomitrella patens Es un organismo multicelular al que se le considera organismo modelo por tener investigaciones como la evolución de los vegetales, desarrollo y su fisiología ya que comparte características con las plantas vasculares. Estos organismos poseen recombinaciones homólogas muy eficientes eso quiere decir que este musgo se puede usar como una herramienta para estudiar las funciones de genes para conocer la evolución de las plantas haciendo que esta sea de gran importancia de estudios genéticos (Castro, 2014). Figura 14. Physcomitrella patens vista más cercana. Nota: Análisis genético de la función del bucle DEK1 en el patrón corporal tridimensional en Physcomitrella patens. Tomado de: Stomata in the moss Physcomitrella patens BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 24 Los organismos eucariotas desarrollaron unos mecanismos de reciclar los componentes intracelulares con el estrés biótico o abiótico siendo uno de estos mecanismos la autofagia esta es la principal forma de poder degradar proteínas y otros componentes de la célula (Ruibal, 2015), se encuentra desde el momento de la concepción sin esta prácticamente no habría desarrollo del cigoto, siendo así imprescindible para la homeostasis, en el caso de las plantas existen dos tipos de autofagia siendo: • Microfagia: El secuestro de citoplasma por invaginación de la membrana de la vacuola/lisosoma (Plaza, 2017). • Macrofagia: Involucra el secuestro de constituyentes citoplasmáticos formando estructuras vesiculares de doble o multimembranas, conocidas como autofagosomas (Plaza,2017). Esta ocurre cuando el musgo llega a no tener nutrientes o tener partes dañadas para mantener la homeostasis o incluso cuando entran sustancias dañinas la Physcomitrella patens crea un autolisosoma para poder aprovechar las sustancias en caso de ser propias, en caso de ser externas y dañinas las desecha (Plaza, 2017). Figura 15. Fases del proceso de autofagia. Nota: Se observan los procesos de inducción, formación del autofagosoma, fusión y degradación. Tomado de: Autofagia: Cómo nuestras células se reciclan. Al inducir un estrés abiótico de tipo senescencia la autofagia se encontrará en un nivel básico, el estrés nutricional: luz y medio sin nitrógeno, oscuridad y medio con nitrógeno, oscuridad y medio sin nitrógeno ocasiona una variabilidad en el desarrollo de la planta, cada uno de estos tipos de estrés afecta de forma negativa a la Physcomitrella patens (Plaza, 2017). 4.4.2 Sphagnum magellanicum Es un musgo que crece en Argentina, Chile y Perú y se encuentra distribuido dentro de los bosques húmedos y en los suelos pantanosos. Se adapta muy bien a los ambientes actuales y los cambios causadospor el calentamiento global. Tienen propiedades especiales que cumplen un rol ecológico importante en el funcionamiento del ecosistema, como agentes activos de retención de agua, colonizadores, BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 25 fijadores de nitrógeno y estabilizadores del suelo. (Paz,2019) Según Choque (2016) Sphagnum magellanicum cuando muere, se deposita junto al agua y se forma la turba lo que da lugar a las turberas, que son un tipo de humedal formado de plantas adaptadas a vivir en sitios inundados de agua, con un bajo contenido de oxígeno y escasa disponibilidad de nutrientes. Es un organismo modelo porque las hojas de Sphagnum son especializadas ya que forman un tejido especial que contiene clorofila, clorocistos e hidrocitos libres de contenido de células muertas, que permiten almacenar agua gracias a que las células epidérmicas del Sphagnum que están vacíos y presentan poros que se abren hacia el exterior para absorber agua, iones metálicos, materia orgánica y aceites entre otros contaminantes lo que ha fomentado que sea un buen insumo para biofiltros de aire y agua debido a la capacidad para frenar la formación de biopelícula en sistemas acuosos Figura 16. Absorción de agua por Sphagnum magellanicum Nota: Aquí podemos observar como el agua entra por el rizoide y se almacena en el parénquima de reserva y también se visualizan los poros aeríferos. 4.2 Pteridofitas: 4.2.1 Ceratophrys richardii Ceraptoris richardii en estudios de investigación genética ha sido un valioso organismo modelo para comprender la evolución de helechos y plantas, alternancia de generaciones, genética, dinámica de poblaciones, entre otros. El uso de "C-Fern" se ve facilitado por el hecho que crece fácilmente en una placa de cultivo celular en medio de agar, alcanzando la madurez sexual dentro de las 2-3 semanas de la inoculación de las esporas, con espermatozoides móviles visibles en este momento. En el transcurso de aproximadamente 6 semanas se puede BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 26 observar la germinación, la determinación del sexo y el desarrollo de gametofitos, fertilización, embriogénesis, organogénesis y crecimiento de esporofitos, lo que permite un estudio increíblemente completo del ciclo de vida de los helechos homosporosos en un período de tiempo relativamente corto. Además, debido al pequeño tamaño de la planta, se pueden observar muchos especímenes creciendo simultáneamente, lo que permite tamaños de muestra más grandes en estudios de investigación. Siguiendo el cultivo de "C-Fern" en platos, se puede trasplantar a un sustrato de tierra, donde se puede permitir que crezca más y se pueden utilizar las generaciones futuras para estudios posteriores. Se han realizado trabajos de investigación en C. richardii porque permite investigar la evolución y las diferencias genómicas entre la heterosporía y la homoesporía. En esta especie, la determinación sexual esta epinegenéticamente controlada por la feromona Anteridiógeno, la cual ha contribuido a analizar los genes que controlan la masculinidad y femeneidad bajo la acción del Anteridógeno. La espora de C. richardii, también ha sido empleada en el estudio de la polarización celular dirigida por la gravedad. Este sistema es ideal porque tiene un crecimiento y un patrón de desarrollo altamente predecible, y que responde principalmente a la fuerza mecánica de la gravedad durante la polarización. Figura 17. Esporas de C. richardii. Nota: El esporofito de Ceratopteris richardii. (A) Una planta entera con hojas reproductivas (flecha) y vegetativas. Las hojas vegetativas están menos disecadas que las reproductivas. Todas las raíces post embrionarias son raíces adventicias y se originan en la base de cada hoja. (B) Esporangios desnudos en la superficie abaxial de una hoja reproductiva. Se eliminó parte del margen de la hoja para mostrar los esporangios. La mayoría de los esporangios maduran al mismo tiempo, pero unos pocos esporangios se desarrollan más tarde que otros (flecha). Tomado de: Characterization of MADS homeotic genes in the fern Ceratopteris richardii. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 27 4.2.3 Dryopteris erythrosora Dinámica estacional del contenido total de flavonoides y actividad antioxidante de Dryopteris erythrosora, para esto se realizó estudios para poder saber el contenido total de flavonoides que se encuentran en las diferentes partes de Dryopteris erythrosora (Cao, Xia, Chen, Xiao, & Wang, 2013), este organismo tiene la capacidad de realizar una caracterización de flavonoides de Dryopteris erythrosora y evaluación de sus actividades antioxidantes, anticancerígenas e inhibidoras de la acetilcolinesterasa («Helecho Autumn», s. f.) ¿Qué son los flavonoides? Son los pigmentos naturales de frutas y verduras, lo poseen para una protección contra los rayos UV, protección ambiental y de sustancias químicas. Son compuesto fenólicos, esto quiere decir que son compuestos orgánicos cuyas estructuras moleculares contienen al menos un grupo fenol, un anillo aromático unido a un grupo hidroxilo, no aportan energía por eso fue considerado sustancias inservibles hace mucho tiempo, en la actualidad se notó que tiene acciones antioxidantes (eliminación de radicales libres) Se habló de acción antioxidante de un compuesto fenólico, este es un excelente en la propiedad de quelación, esto quiere decir que protege al organismo contra el daño oxidativo (Martínez-Flórez, González-Gallego, Culebras, & Tuñón, s. f.) Pero los antioxidantes tienen una doble cara y pueden actuar como prooxidantes en determinadas circunstancias (algunos flavonoides pueden contener prooxidantes en altas dosis) ¿Qué es un prooxidante? Estos aumentan el estrés oxidativo (exceso de radicales libres) esto puede ocasionar daños a ciertos componentes celulares, reacciones oxido reducción, los radicales libres son especies reactivas al oxígeno, por lo tanto tienen alta capacidad oxidante ocasionando daños al ADN, aminoácidos, ácidos grasos y componentes biológicos, los organismo posee mecanismos de neutralización contra este efecto, pero que no son sintetizados en el organismo, entonces cómo actúa un prooxidante, aumenta la formación de radicales libre e inhibe la acción de las sustancias antioxidantes, los daños a las mitocondria y otros organelos provocarán una disminución energética celular entonces también a los tejidos, esto hace que las células se deterioran provocando un envejecimiento y el daño al ADN provocaría cáncer (Zhang et al., 2019) BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 28 Figura 18. Antioxidante neutralizando radical libre. Nota: Los antioxidantes pueden neutralizar el exceso de radicales libres durante la actividad oxidativa, propia del organismo. Tomado de:Antioxidantes y prevención del cáncer. 4.4 Angiospermas 4.4.1 Arabidopsis thaliana Arabidopsis thaliana La Arabidopsis thaliana es un organismo modelo muy utilizado, la investigación de esta ha ayudado a formar la base de la biología moderna. Es una planta angiosperma pequeña que crece rápidamente y florece en interiores. Según Woodward, A. & Bartel, B. (2018) se desarrolla en 6 semanas de acuerdo a ciertas condiciones, por su complejidad metabólica se emplea en investigaciones bioquímicay genéticas, debido a que su genoma es pequeño ~132 Mbp, es autofértil, produce miles de descendientes por su autopolinización y es económica. Efecto de bioestimulantes, daños oxidativos y estrés salino Los bioestimulantes (Oligosacáridos derivados de la pared de hongos) pueden ser una alternativa al uso de agroquímicos, estos intervienen en el proceso de defensa de las plantas. Estos determinan los niveles de oxidación en componentes solubles para conocer el estado de la célula cuando está en estrés salino, participan en el funcionamiento del sistema ubiquitina- proteasoma. Según Vásquez, C. (2016) el efecto del bioestimulante OF (Fungal Oligosaccharides) sobre la respuesta en plantas de Arabidopsis thaliana sembradas in vitro, en condiciones normales presentaron una disminución en la oxidación de componentes lipídicos y proteicos. Los resultados fueron que el bioestimulantes FO estimula las vías de defensa de la planta, tolerancia al estrés y mejor procesamiento de la oxidación de las biomoléculas afectadas. El estudio se aplicó a todas las partes de la planta y se demuestra que los efectos de los bioestimulantes son diferentes según la ubicación. BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 29 Respondiendo al estrés con la inmunidad de la pared celular Las plantas a diario se enfrentan a estrés biótico y abiótico (colonización de patógeno o plagas), para contrarrestarlos estás desarrollan mecanismos de resistencia como el sistema de monitoreo molecular, en el cuál detectan señales y desencadenan respuestas específicas. Sin embargo, al realizar estas estrategias pueden limitar sus procesos fisiológicos, es así que su sistema de monitoreo autónomo celular ha evolucionado para detectar señales y dar respuestas adaptativas y defensivas. De acuerdo a Bacete, L. et al (2018), la pared celular de las plantas es un sistema de monitoreo, ya que cambia sus propiedades de acuerdo al estrés ambiental y patógenos que se presenten. Además, las plantas tienen un sistema de inmunidad innato (receptores de reconocimiento de patrones o PRR) que se anclan a la membrana plasmática detectando los patrones moleculares asociados a microbios o MAMP, y así activando la inmunidad desencadenada por patrones o PTI. También reconoce factores microbianos por sus proteínas citoplasmáticas que son codificadas por genes y patrones moleculares asociados al daño o DAMP, estas son moléculas que se liberan de la pared celular. Figura 19. Alteraciones de Arabidopsis thaliana la integridad de la pared celular desencadena respuestas de resistencia a enfermedades. Nota: La pared celular está compuesta por celulosa, polisacáridos de pectina, 2 hemicelulosas; las alteraciones de la biosíntesis de celulosa desencadenan respuestas defensivas mediadas por las hormonas ácido jasmónico (JA), etileno (ET) o ácido abscísico (ABA); en alteraciones de pectina activan respuestas dadas por JA o SA; la reacción de la hemicelulosa ocasiona la activación de vías de señalización de brasinoesteroides BR y ABA, etc. Tomado de Plant cell wall-mediated immunity: cell wall changes trigger disease resistance responses. Entonces mediante él modelo estudiado se demuestra el desarrollo de sistemas de monitoreo de estrés, ya que estos reconocen las señales de alerta. La Arabidopsis spp. tiene una gran cantidad de receptores con capacidad de reconocimiento específico y diversas, conforme se descubran más patrones moleculares asociados al daño BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 30 DAMP, se podrá identificar a más receptores específicos. 4.4.2. Brassica rapa Brassica rapa es una planta de la familia de las brassicaceae, esta se adapta muy bien a los climas fríos, engloba 380 géneros y unas 3.000 especies propias de regiones templadas o frías del hemisferio norte (Zambrano, J. P. 2015). Esta planta se caracteriza por tener fácil germinación y crecimiento, alto contenido de macro y micronutrientes y por su alto contenido de glucosinolatos (Arias, D. 2009). Portugal, G. (2019) realizó un trabajo de investigación para la remoción de plomo en soluciones acuosas con Brassica rapa. Los resultados lograron la remoción de plomo del 6.29% a los a los 21 días de exposición al contaminante, se concluye que a mayor tiempo de exposición se ejercerá una mayor remoción, en cantidades excesivas la planta presentará reacciones morfológicas debido a la alta toxicidad del metal. Figura 20. Mecanismos involucrados en la acumulación de metales en plantas. Nota. Para que un compuesto sea acumulado en la planta este debe pasar por una serie de procesos: movilización de los compuestos metálicos por la secreción de agentes quelantes y acidificación de la rizosfera; la incorporación de los metales quelados, siendo secuestrados en las raíces; posteriormente los metales son transportados al tallo vía el xilema, después de llegar al apoplasto de la hoja los metales entran a las células y finalmente son secuestrados por la vacuola. Tomado de Clemens et al, 2002. Cuti, Y. G & Prado, Y. B. (2019) trabajó con la flor de Brassica rapa, este trabajo de investigación logró determinar la capacidad antioxidante mediante el método de radical DPPH, lo que le brinda la capacidad de inhibir la oxidación de los radicales libres evitando su posible daño celular, envejecimiento o algún tipo de cáncer. Zambrano, J. P. (2015) realizó un diseño experimental a través de la administración de dietas con distintos porcentajes de fibra de Brassica rapa a distintos grupos de ratas. Los BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 31 resultados evidenciaron su efectividad puesto que en 4 semanas redujo de 10 a 17% el peso de las ratas. Los posibles mecanismos de acción para reducir el porcentaje grasa corporal se dio a nivel de la modificación del metabolismo de los nutrientes y el incremento del gasto energético. La proteína de Brassica rapa tiene un buen balance de aminoácidos, especialmente rica en aminoácidos azufrados los cuales son considerados como unidades básicas de construcción de los potenciales inmunológicos y antioxidantes de los animales” (Geraert, P. A. et al. 2013). 4.4.3. Chenopodium quinoa Es una hierba que pertenece a la subfamilia Chenopodiaceae, su semilla se reconoce y clasifica como grano integral, es originaria del altiplano de los Andes, tiene una gran adaptabilidad en cuanto al uso de agua y logra soportar temperaturas de hasta -4 °C, poseyendo un ciclo de vida anual. Carpio, G., et al. (2020) expusieron que Chenopodium quinoa tiene la capacidad de contraatacar distintas patologías, pero también dentro de su composición contiene antinutrientes como los saponósidos, también conocidos como saponinas, que son glucósidos naturales que tienen actividad citotóxica inducida por las saponinas las cuales activan las vías apoptóticas a través de Caspasa 3 (enzima efectora de la apoptosis). Figura 21. Caspasa 3 y vía intrínseca de la apoptosis. Nota: La via puede ser activada por señales negativas, como la ausencia de citocinas, hormonas y factores de crecimiento en el entorno inmediato de la célula, varios inductores de estrés o daño del ADN o por una señal positiva como la presencia de hipoxia, toxinas, radiación, especies reactivas de oxígeno, virus y una variedad de agentes tóxicos. Tomado de: Evaluación de la actividad citotóxica de saponinas y sapogeninas provenientes de residuos de Chenopodium quinoa. Los monosacáridos (d-galactosa) de la quinoa exhibieronactividad antioxidante, que fueron inducidos en organismos como ratones, los monosacáridos demostraron una actividad antioxidante superior a compuestos químicos como DPPH, aumentan las enzimas BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 32 antioxidantes en el hígado y cerebro, reduciendo la peroxidación de lípidos. (Tag, Y. & Rong, T. 2017) El genoma del cloroplasto de C. Quinoa posee menos pb en comparación a otra especie de Chenopodium, ya que C. album posee 68 pb más, siendo 152099 y 152167 respectivamente, identificándose 119 genes (78 codificadores de proteínas, 37 tRNA y 4 rRNA). La secuencia de este genoma podría facilitar la identificación del factor de transcripción que controla la producción de saponinas y también mutaciones que parecen causar un empalme alternativo y un codón prematuro. (Pereira, E. 2020) Chenopodium quinoa es considerada una planta halófita, posee “vejigas de sal” que intervienen en la expresión del estrés salino, se hace un secuestro de Na+ en las vacuolas, mejora la retención de k+ y el desarrollo de la apertura osmótica. La vejiga de sal es de naturaleza heterótrofa, en contraste con el mesófilo de las hojas, las células epidermales de la vejiga carecen de grana, y se estima que su capacidad fotosintética sea abruptamente baja, pero estas en conjunto operan de forma cíclica en el transporte de electrones, y conjunto con las mitocondrias, llegando a producir ATP para energizar el transporte de sal. (Verena, A. 2013) 4.4.4. Eugenia uniflora (pitanga) Eugenia uniflora l. Es un árbol frutal neotropical miembro de la familia Myrtaceae distribuido ampliamente en los países de América del sur y se caracteriza por la síntesis de metabolitos secundarios estos con importantes actividades biológicas. Los beneficios atribuidos a la pitanga es gracias a sus metabolitos secundarios los cuales presentan potente actividad antibacteriana y antifúngica en sus hojas, entre los que se encuentran compuestos fenólicos (flavonoides, terpenos, taninos, antraquinonas y aceites esenciales). (AMORIM et al., 2009 como se citó en Moura, G. S., et al 2018) Aplicaciones con Eugenia uniflora En la investigación realizada por Sobeh, M., et al. (2016) utilizaron el aceite esencial de E. uniflora para evaluar actividad antimicrobiana, mediante un método de microdilución a seis especies de bacterias grampositivas como Staphylococcus aureus, tres especies de bacterias gramnegativas entre BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 33 ellas Escherichia coli y dos especies de hongos Candida parapsilosis y Candida albicans. Los resultados evidenciaron actividad antibacteriana y antifúngica. Su actividad antibacteriana se da gracias a los compuestos monoterpénicos que interfieren en la permeabilidad de la membrana celular bacteriana ocasionando la salida de iones y ATP lo que resulta la inhibición de la cadena respiratoria, mientras que los sesquiterpenos al inhibir la descarboxilasa de histidina conlleva a lisis celular (Tenorio Huamani, S. G., & Muñoz Cordero, C. V. 2020). Según Bezerra, F. A., et al. (2016) considerando el potencial farmacológico del extracto de hoja de E. uniflora se investigó la citotoxicidad y la actividad antioxidante del extracto etanólico de E. uniflora en leucocitos y eritrocitos humanos donde se evidencio que las hojas de E. uniflora no presentaron citotoxicidad ni genotoxicidad a células humanas en las concentraciones ensayadas (1-480 mg/mL). También se demostró que dicho extracto inhibió el radical libre 2,2 difenil - 1-picrilhidracina (DPPH), lo que demuestra que los componentes químicos del extracto de la planta E. uniflora presentan propiedades antioxidantes. Figura 22. Proceso de estrés oxidativo. Nota: Los radicales libres son moléculas inestables (perdieron un electrón) y altamente reactivas. Su misión es la de remover el electrón que les hace falta, de las moléculas que están a su alrededor para obtener su estabilidad. La molécula atacada (que ahora no tiene un electrón) se convierte entonces en un radical libre y de esta manera se inicia una reacción en cadena que dañará muchas células y puede ser indefinida si los antioxidantes no intervienen. Tomado de: Radicales Libres - Aliados del envejecimiento. 4.4.5. Hordeum vulgare La cebada ha sido ampliamente utilizada como cultivo modelo para estudiar procesos genéticos, moleculares y fisiológicos. Es considerado también un cultivo modelo por ser una especie autopolinizada teniendo en cuenta su genoma de generación diploide y un complemento haploide de 7 cromosomas. Esto garantiza la diversidad genética natural que permite que la planta se adapte de manera efectiva a diversos desafíos ambientales, como temperaturas frías, sequía, alcalinidad y salinidad, y la convierte en una BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 34 especie modelo perfecta para investigar la adaptación de los cultivos. (Führs, H. 2010) Investigaciones realizadas en Hordeum vulgare: Se suministró 2- aminoetanol a los cultivos de cebada afectados por estrés por sequía, se mostró que esto disminuye el déficit hídrico, esto causó una disminución de pérdida de clorofila. (Willburt, A. 2005) Figura 1. 2-aminoetanol como pretratamiento contra daño oxidativo en la membrana. Nota: Inducido por paraquat hacia cloroplastos de la cebada. Microfotografía electrónica tomada 8 h después de la aplicación de paraquat. Control, tratamiento y pretratamiento. Tomado de: Improvement of tolerance to paraquat and drought in barley (Hordeum vulgare L.) by exogenous 2-aminoethanol: effects on superoxide dismutase activity and chloroplast ultrastructure. Se realizaron estudios sobre la estructura de sus cloroplastos y como es su desarrollo frente a diversas exposiciones de luz, muestra una relación de ribosomas con la membrana del tilacoide. Se hizo uso de la quelación de calcio, la cual es muy común para la formación de cromosomas en organismos superiores, y se mostró que los cromosomas mostraron una estructura con menor condensación, lo que sugiere un mecanismo similar de condensación cromosómica en humanos y plantas. (Yazri, A. 2021) Sometimiento a biocarbon, el cual dispone de PAH, que se mostró que induce al estrés oxidativo y baja el índice mitótico de la planta. La exposición a NP inhibe el crecimiento de la planta y también muestra un aumento de micronúcleos, proporciona un riego potencial de genotoxicidad. (Yun, Y. 2019) BIOLOGÍA CELULAR Y ORGANISMOS MODELO 35 Figura 23. Inserción de Nitro-PAH en Hordeum vulgare acorde a su crecimiento. Nota: Estrés oxidativo con relación a una peroxidación de lisosomas, desembocado en una genotoxicidad por la disminución del índice mitótico. Tomado de: La exposición a los Nitro-PAH interfiere con la germinación y el crecimiento temprano de Hordeum vulgare a través del estrés oxidativo. 4.4.6. Nicotiana Tabacum Permite la mutagénesis digerida, la inserción de genes en sitios objetivos mediante la reparación de ADN endógeno, reparación de extremos no homólogos en la reparación de ruptura de cadenas. (Zhou, X. 2016) Contienen un depósito de calosa (1-3 glucano) que cierran los plasmodesmos celulares y evitan el contagio. Tiene plasmodesmos que intervienen en el movimiento intercelular de los virus, estudios relacionados mostraron que en su primera
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