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Ediciones Universidad Santo Tomás Manual de Biología Celular Miguel Castro Retamal Pablo Nelson Hunt (editores) Manual de Biología Celular Miguel Castro Retamal Pablo Nelson Hunt (editores) Manual de Biología Celular Manual de biología celular Primera edición: enero de 2015 © Miguel Castro Retamal, Pablo Nelson Hunt, 2015 Registro de Propiedad Intelectual Nº 246.267 © Ediciones Universidad Santo Tomás Avenida Ejército 146, Santiago Dirección de Investigación y Postgrado Contacto: iespinoza@santotomas.cl Producción editorial: RIL editores Tel. Fax. (56-2) 2238100 ril@rileditores.com • www.rileditores.com Impreso en Chile • Printed in Chile ISBN 978-956-7946-33-4 Derechos reservados. Índice Sobre los autores .......................................................................... 11 Colaboradores .............................................................................. 13 Prólogo ........................................................................................ 15 Introducción ................................................................................. 17 Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante ........ 19 Capítulo 1 Fundamentos básicos para la biología celular .................. 31 1.1. La teoría celular .................................................................... 35 1.2. Características de los seres vivos ........................................... 36 1.3. Niveles de organización de la materia ................................... 37 1.4. Estructura del átomo y tipos de enlaces ................................. 39 1.5. Teorías del origen de la vida .................................................. 42 1.6. Condiciones de la tierra primitiva ......................................... 43 1.7. Biomoléculas ......................................................................... 44 1.7.1. Agua ............................................................................ 45 1.7.2. Hidratos de carbono .................................................... 49 1.7.3. Lípidos ........................................................................ 54 1.7.4. Proteínas ..................................................................... 58 1.7.5. Ácidos nucleicos .......................................................... 66 Estructura del DNA ..................................................................... 69 Estructura del RNA ...................................................................... 70 Para saber más: ............................................................................ 71 Preguntas de autoevaluación y estudio ......................................... 72 Capítulo 2 La membrana plasmática .......................................................... 77 2.1. Composición de las membranas biológicas ............................ 78 2.1.1. Lípidos de membrana .................................................. 78 2.2 Estructura de la membrana plasmática ................................... 85 2.3. Funciones biológicas de la membrana plasmática .................. 86 2.4. Mecanismos de transporte de membrana .............................. 87 2.4.1. Transporte pasivo ........................................................ 87 2.4.2. Transporte activo ........................................................ 94 2.5 Transporte de macromoléculas o estructuras de mayor tamaño .................................................... 95 Para saber más: ............................................................................ 99 Preguntas de autoevaluación y estudio ....................................... 100 Capítulo 3 Interacciones entre la célula y su entorno ....................... 103 3.1. Matriz extracelular .............................................................. 103 3.2. Uniones intercelulares ......................................................... 110 3.3. Citoesqueleto ...................................................................... 119 Para saber más: .......................................................................... 126 Preguntas de autoevaluación y estudio ....................................... 127 Capítulo 4 Sistema de endomembranas ................................................... 129 4.1. Envoltura nuclear ................................................................ 129 4.2. Retículo endoplasmático ..................................................... 129 4.2.1. Retículo endoplasmático rugoso (RER) ............................ 130 4.2.2. Retículo endoplasmático liso (REL) ................................. 134 4.3. El aparato de Golgi ............................................................ 136 Para saber más: .......................................................................... 141 Preguntas de autoevaluación y estudio ....................................... 142 Capítulo 5 Bioenergía ................................................................................ 145 5.1. Glicólisis ............................................................................. 147 5.2. Estructura y función de la mitocondria ............................... 149 5.3 Respiración celular ............................................................... 152 5.4. Fotosíntesis ......................................................................... 162 Para saber más: ......................................................................... 166 Preguntas de autoevaluación y estudio ....................................... 167 Capítulo 6 Núcleo, proliferación y expresión génica .......................... 171 6.1 Núcleo ................................................................................. 171 6.2 Ciclo celular ......................................................................... 175 6.2.1 Regulación del ciclo celular ........................................ 177 6.2.2 Mitosis ........................................................................ 180 6.2.3 Meiosis ....................................................................... 182 6.2.3.1. Etapas de la meiosis........................................ 182 6.3 Replicación del dna .............................................................. 185 6.3.1 Replicación de la hebra conductora y rezagada .......... 186 6.4. Transcripción ...................................................................... 189 6.4.1. Transcripción en procariontes ................................... 189 6.4.2. Transcripción en células eucariontes .......................... 193 6.5. Traducción ......................................................................... 196 6.5.1 Traducción en procariontes ........................................ 198 6.5.2 Traducción en eucariontes .......................................... 203 Para saber más: .......................................................................... 203 Preguntas de autoevaluación y estudio ....................................... 204 11 Sobre los autores Miguel Castro Retamal Bioquímico y Doctor en Microbiología de la Universidad de Santiago de Chile. Desde el año 2003 ha estado vinculado al Departamento de Ciencias Básicas de la Universidad Santo Tomás, sede Santiago, realizando docencia en Biología Celular y Bioquímica. Actualmente, se desempeña como Coordinador del área Biología Celular y Coordi- nador Docente del Departamento de Ciencias Básicas de la señalada institución. Posee experiencia en microbiología de organismos extremófilos, resistencia bacteriana a metales pesados y utilización de sistemas biológicos para la síntesis de nanopartículas metálicas. Es uno de los responsables del Laboratorio de Investigación del Departamento de Ciencias Básicas, profesor director e informante de tesis, tutor de Unidades de Investigación para alumnos de la carrera de Medicina Veterinaria y Biotecnología. Pablo Nelson Hunt Bioquímico de la Universidad de Santiago de Chile y Doctor en Cien- cias Biológicas, mención Biología Celular y Molecular de la PontificiaUniversidad Católica de Chile. Desde el año 2008 ha estado vinculado al Departamento de Ciencias Básicas de la Universidad Santo Tomás, sede Santiago, realizando docencia en Bioquímica. Actualmente, se des- empeña como coordinador del área Bioquímica, del Departamento de Ciencias Básicas de la UST, sede Santiago. Su área de investigación está centrada en modelos de morfogénesis epitelial. Posee vasta experiencia en sistemas de cultivos celulares animales y es uno de los responsa- bles del Laboratorio de Investigación del Departamento de Ciencias Básicas. Profesor director e informante de tesis, tutor de Unidades de Investigación para alumnos de la carrera de Medicina Veterinaria y Biotecnología. 13 Colaboradores Jorge Garrido Negri. Médico Cirujano de la Universidad de Chile, ha dedicado toda su vida a la investigación, alcanzando el grado de Profesor Titular de la Pon- tificia Universidad Católica de Chile, dirigiendo numerosos proyectos de investigación FONDECYT. Se ha desempeñado en diversos cargos, entre los que se incluye la presidencia del Consejo Superior de Ciencia. En la UST, alcanzó los cargos de Decano de la Facultad de Salud y Director de Investigación y Postgrado. Es experto en Biología Celular y Microscopía, actualmente, desarrolla docencia en el Departamento de Ciencias Básicas de la UST. Autor de un nutrido número trabajos publicados en revistas ISI. Claudia Reinoso Guzmán. Bioquímico y Doctor en Microbiología de la Universidad de Santiago de Chile, y desde el año 2008 realiza docencia en el Departamento de Ciencias Básicas de la Universidad Santo Tomás, sede Santiago. De- sarrolló su investigación doctoral en el laboratorio de Microbiología Molecular de la Facultad de Química y Biología de USACH en el área de metabolismo bacteriano y estrés oxidativo frente a metales pesados. Parte de su trabajo fue realizado en el laboratorio de Metabolismo Celular, Adaptación y Toxicología de la Universidad Laurentian en Sudbury, Canadá. Anteriormente se desempeñó en el laboratorio de Virología Molecular de la Universidad de Santiago de Chile. Lorena Tapia Decebal-Cuza Bioquímico de la Universidad de Santiago de Chile y Magister en Peda- gogía Universitaria de la Universidad Mayor. Diplomado en Educación Superior en la Universidad Santo Tomás. Desde el año 2002 se ha desempeñado como docente del área Bioquímica en el Departamento de Ciencias Básicas de la Universidad Santo Tomás, sede Santiago y es Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 14 profesor participante de los tópicos de Enzimología que se imparten en los cursos de Bioquímica dictados para la carrera de Tecnología Médica. Dentro de sus áreas de interés se encuentran el desarrollo de técnicas de innovación pedagógicas donde ha participado en proyectos de diseño de Módulos Interactivos. Actualmente, es Coordinadora Administrativa del Programa de Bachillerato en Ciencias de la sede de Santiago de la Universidad Santo Tomás. Francisco Urbina Rodriguez Químico y Licenciado en Química de la Universidad de Santiago de Chile, Magister en docencia Universitaria, Universidad Autónoma de Chile. Desde el año 2002 se ha desempeñado como docente en diversas áreas de la Química en la Universidad de Santiago de Chile, Universidad Santo Tomás y Universidad Autónoma. Su desarrollo en investigación se ha centrado principalmente, en la extracción, purificación y deter- minación estructural de metabolitos secundarios aislados de plantas chilenas, y el estudio de su capacidad antioxidantes. Sebastián Sepúlveda Miranda Licenciado en Bioquímica, Profesor de Biología y Ciencias Naturales y Licenciado en Educación de la Pontificia Universidad Católica de Chile. Magister en dirección Educacional de la Universidad Andrés Bello. Desde el año 2007 se ha desempeñado docente en diversos establecimientos educacionales particulares y subvencionados de la Región Metropolitana. Cuenta con estudios de postgrado en el área de la Biología Celular y partir del año 2014 realiza docencia en el Departamento de Ciencias Básicas de la Universidad Santo Tomás, sede Santiago. 15 Prólogo Sin duda y hace años ya, estamos viviendo una verdadera revolución en lo que a ciencia en general y a ciencias de la vida en particular, se refiere. La velocidad con que hoy se genera el conocimiento no tiene precedente en la historia del hombre. Es por esto mismo que la conti- nua recopilación, actualización y comunicación expedita de los nuevos hallazgos cobra especial relevancia. El esfuerzo de los autores de este libro, especialmente en relación a la colección de temas y aspectos elegidos, permite poner a disposición de estudiantes, profesores y público en general -en un lenguaje accesible a todos- el estado del arte de los contenidos de esta importante disciplina. La manera de presentarlos hace que el lector tenga la posibilidad de informarse y analizar fluida y relajadamente, en un lenguaje apropiado, los conceptos básicos vertidos allí. Cualquiera puede beneficiarse con la lectura de este texto, inclu- yendo a aquellos que ya han adquirido previamente una formación biológica básica. Incluso, tal vez muchos interesados sólo por curiosi- dad sentirán probablemente la excitación que sentimos los científicos al irnos adentrando más y más en los misterios del fenómeno vital que hacen posible las moléculas, estructuras y procesos descritos en este libro. Sinceramente recomiendo la lectura del mismo, puesto que como los propios autores mencionan en su introducción, sin pretender re- emplazar y menos competir con obras clásicas en la materia, el texto está diseñado para que alumnos de primer nivel e incluso profesores deseosos de actualizarse y perfeccionarse encuentren un fuerte apoyo en este manual. No menos importante y para terminar, me siento profundamente agradecido de haber sido invitado a decir algunas simples palabras Claudio Vásquez G. 16 sobre este texto concebido y escrito por dos de mis mejores ex-alumnos en la Universidad. Vayan para ellos y sus lectores mis más sinceros parabienes y deseos de éxito. Claudio Vásquez G. Dr. en Ciencias Biológicas m/Biología Celular, Pontificia Universidad Católica de Chile Profesor Titular Universidad de Santiago de Chile 17 Introducción La biología celular es una disciplina fascinante que nos permite entender los principios básicos de la vida e incluso nos motiva a preguntarnos si existen otros lugares en el universo donde esta pudiera desarrollarse. Sin embargo, abordar su estudio puede ser complejo. En este sentido, nuestro Manual de Biología Celular está diseñado para entregar los contenidos básicos al estudiante que aborda por primera vez el estudio de esta disciplina, como es el caso de los alumnos que ingresan a primer año de universidad, así como a estudiantes y profesores de colegio que buscan profundizar sus conocimientos de la célula. Nuestro manual no pretende reemplazar al material clásico y de excelente calidad existen- te, como los con los textos de Alberts y col. (Biología molecular de la célula) y Karp (Biología celular y molecular), sino más bien persigue dar un piso básico para la posterior comprensión a cabalidad de textos más complejos. Es por lo anterior que, para el diseño de la presente obra, hemos recogido inquietudes de estudiantes, docentes y la propia experiencia de los autores tras varios años de impartir la cátedra de Biología Celular tanto en la Universidad Santo Tomás como en otras instituciones de educación superior (estatales y privadas). En general, el estudiante que ingresa a primer año de universidad, al enfrentarse al curso de Biología Celular, desconoce el correcto uso del material de apoyo sugerido en los programas, por lo que le es muy difícil seleccionar y separar la información relevante que necesi- ta extraer de un texto. Esto se evidencia más cuando debe recurrir a bibliografía de alto nivel, considerando la poca familiaridad tanto con el tema particular, así como con técnicascorrectas de estudio. Es por ello que la estrategia de este manual aborda la idea de familiarizar al estudiante con los conceptos, procesos y funciones celulares de forma simple, directa y acotada, de manera que, posteriormente, el alumno pueda acudir a material de mayor especialización con una visión clara de los contenidos que necesita complementar o profundizar. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 18 Para apoyar aún más al estudiante, este Manual incluye un apar- tado con diferentes sugerencias relacionadas con metodologías de estudio. Estas pretenden entregar herramientas adicionales y útiles que pueden aportar para que el estudiante obtenga una buena disciplina de estudio, lo que conllevará un aprendizaje significativo de esta y otras materias, y, por tanto, un buen desempeño académico. Adicionalmen- te, cada capítulo concluye con una batería de preguntas enfocadas a desarrollar la capacidad descriptiva, analítica y deductiva del alumno. Este Manual por sí solo no logrará ni garantiza el éxito académico. Para ello, es imprescindible la dedicación personal y superación diaria del estudiante. 19 Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante Uno de los objetivos de este Manual es ayudar a los y las estudiantes a lograr el máximo rendimiento en la asignatura de Biología Celular, por ello, en este primer capítulo entregaremos consejos y sugerencias destinadas a orientarlos en cómo programar su tiempo y organizar el material de estudio para lograr los mejores resultados. Está comprobado que el éxito académico se relaciona con múltiples factores. Uno de los más importantes corresponde a los hábitos de estudio. Constantemente a los estudiantes se les menciona que «no tienen hábitos de estudio», sin que les quede muy claro qué significa el tenerlos o no. Antes de avanzar, es pertinente dar respuesta a la siguiente pregunta ¿Qué son hábitos? Un hábito puede definirse como: «Una actividad que se realiza o practica constantemente». Si lo anterior se lleva al plano académico, podemos establecer que algunos hábitos de estudio importantes son: - Planificación del tiempo de estudio: la planificación del tiempo destinado a las diferentes actividades diarias es de gran importancia para lograr el éxito en los estudios. Dentro de esta organización es recomendable realizar un plan de actividades diarias lo más realista posible y que incluya las horas destinadas a cada una de ellas (estudio, transporte, descanso, etcétera). Para esto se recomienda realizar una tabla que incluya las 24 horas de cada día de la semana, que debe ser completada con las diversas actividades diarias (Tabla 1). Posteriormente, se debe analizar regularmente, con el fin de evaluar si el tiempo destinado a las diferentes actividades consideradas en la planificación inicial es suficiente o no para lograr el éxito. Esto debido a que al comienzo del curso es difícil determinar cuántas horas se debe asignar al estudio de cada materia, pero, a medida que pasan las sema- nas, es posible realizar dicha evaluación para obtener valores realistas. Para esto se deben formular ciertas preguntas, como por ejemplo: Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 20 — ¿Cuál es la cantidad de temas que se debe tratar de estudiar cada semana en cada asignatura? — ¿Cuánto tiempo estimado se requiere para estudiar dichas materias? — ¿Es suficiente el tiempo asignado en la planificación inicial? Si no es así, ¿qué actividades de la semana puedo disminuir con el fin de aumentar las horas de estudio? En este punto es muy importante respetar las horas destinadas al descanso, por su importancia fun- damental en el buen funcionamiento de nuestro organismo. Tabla 1. Planificación de actividades diarias La siguiente tabla indica, a modo de ejemplo, la planificación de un día de la semana. Horas/días Lunes Martes Miércoles Jueves Viernes Sábado Domingo 00:00-01:00 Dormir 01:00-02:00 Dormir 02:00-03:00 Dormir 03:00-04:00 Dormir 04:00-05:00 Dormir 05:00-06:00 Dormir 06:00-07:00 Levantarse 07:00-08:00 Transporte 08:00-09:00 Clases 09:00-10:00 Clases 10:00-11:00 Clases 11:00-12:00 Clases 12:00-13:00 Clases 13:00-14:00 Almuerzo 14:00-15:00 Estudio 15:00-16:00 Estudio 16:00-17:00 Estudio 17:00-18:00 Transporte 18:00-19:00 Tiempo libre 19:00-20:00 Tiempo libre 20:00-21:00 Comer 21:00-22:00 Estudio 22:00-23:00 Estudio 23:00-24:00 Dormir Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante 21 — Asistir periódicamente a clases y tomar buenos apuntes: los estudiantes deben asistir a clases y tomar sus propios apuntes, ya que esto representa la base de los conocimientos a estudiar. Actualmente, es cada vez más frecuente que las instituciones de educación superior tengan sistemas computacionales que permiten a los docentes colocar a disposición del alumnado, en forma anticipada, todo el material que se utilizará en el transcurso del semestre. Es recomendable que usted descargue el mate- rial existente, así como el programa de la asignatura, para idealmente preparar en forma anticipada el tema que se tratará en la clase. Al momento de tomar notas debe tener en cuenta varios factores importantes, entre ellos, que es necesario primero oír atentamente al profesor, entender la idea principal y finalmente escribirla con sus propias palabras y de forma resumida. ¿Cómo se puede lograr esto? Dentro de las técnicas que se pueden utilizar, se encuentran: — Utilizar lápices de distintos colores para los títulos principales de la materia. — Dejar algunos espacios libres entre temas distintos, por si se tiene que completar alguna idea. — Utilizar abreviaciones de algunas palabras, con el fin de aumentar la velocidad de escritura. — Escribir con letra los más clara posible, ya que con esto se evita tener que pasar los apuntes en limpio, lo que implica un ahorro importante de tiempo que se puede utilizar para avanzar en el estudio u otras actividades, según su planificación personal. — Condiciones para un estudio efectivo: los factores ambientales tienen una gran importancia al momento de planificar y programar el estudio, por esto es recomendable invertir un poco de tiempo en evaluar este aspecto hasta encontrar un sitio adecuado para estudiar. Idealmente, el lugar destinado al estudio debe ser un espacio si- lencioso, que cuente con buena iluminación, temperatura agradable y buena ventilación. Lo más importante es que para usted sea un lugar cómodo. Por ejemplo, algunos pueden preferir estudiar en un escritorio, otros se sienten más cómodos estudiando sobre sus propias camas, o sentado en una silla en el comedor de su casa. Así, cada uno debe encontrar un sitio de estudio que favorezca la concentración. — Estudiar todos los días: dedicar un tiempo determinado para el estudio de todas las asignaturas que se están cursando en el momento. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 22 Se debe evitar dejar asignaturas «de lado» por considerarlas de menor dificultad. Idealmente, se debe estudiar desde el primer día de clases utilizando aproximadamente dos a tres horas para este propósito. No es conveniente estudiar mucho un solo día y descansar los siguientes, en cambio, se recomienda distribuir el trabajo y el esfuerzo. Tampoco es conveniente realizar un estudio exigente los días cercanos a una evaluación, ya que de esta manera no se logra asimilar correctamente la materia y en pocos días esta se habrá olvidado. La clave está, entonces, en planificar anticipadamente. Es recomendable estudiar de día, especialmente en las mañanas, horas durante las cuales la mente se encuentra más despejada. El es- tudio durante la noche se debe realizar solo si es necesario ya que su mente está más cansada, la concentración es menor y al día siguiente se encontrará más agotado. — Incluir periodos de descanso durante el estudio: durante las horas de estudio debe tomar periodos cortos de descanso, de no más de 15 minutos, para salir del lugar donde seencuentre, tomar aire, ir al baño, comer algo, etcétera. Esto es importante para despejar la mente. — Mantener la atención y la concentración en el estudio: esto es fun- damental para aprovechar las horas dedicadas al estudio. Para ello debe centrar su atención en la tarea que está realizando e ignorar lo que ocurre en su entorno. Si usted tiene un smartphone o pretende usar su computador co- nectado a Internet para complementar el estudio, considere apagar el teléfono, o al menos dejarlo en modo silencioso, e idealmente no conteste llamadas; desconecte todas las aplicaciones de mensajería como Snap- chat, WhatsApp, Viber, Telegram y otras similares, pues constituyen una distracción. Considere lo mismo para su computador. Usted no podrá tener un estudio eficiente si al mismo tiempo está chateando o mirando el Facebook de sus amigos que lo acaban de etiquetar en una foto. Utilice el computador exclusivamente para complementar su estudio. Estos son solo algunos de los hábitos de estudio que pueden contri- buir a que su tiempo destinado a esta tarea sea más provechoso. Pero, ¿cómo debe afrontar el estudio una vez que se ha propuesto comenzar? Los consejos y sugerencias que les entregamos en este capítulo, si bien se enfocan al estudio de la asignatura de Biología Celular, también pueden ser aplicados en otras asignaturas. Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante 23 Fases del estudio Lo primero que debe tener en cuenta es que el estudiar no está relacio- nado con aprender frases o ideas de memoria que no logra entender. Se requiere que usted sea capaz de seguir un orden lógico para que su cerebro reciba y almacene la información. — Preparación previa: antes de comenzar es importante preparar su lugar de estudio. Debe tener todo el material a mano: apuntes, libros, cuaderno para tomar notas, lápices adecuados, etcétera. De esta ma- nera evitará perder tiempo levantándose a cada instante de su sitio. También es importante que ordene el entorno del lugar destinado a estudiar para evitar futuras distracciones. — Técnicas de estudio: al momento de enfrentar una asignatura, es de gran importancia la técnica de estudio que empleará, ya que si utiliza una técnica incorrecta para usted, esto puede provocar desaliento e incluso dudas respecto a la capacidad personal. Por otro lado, la utilización de una técnica adecuada facilita la comprensión y asimilación de los temas, lo que produce satisfacción y aumenta la seguridad en el estudio. Existen diferentes técnicas que ayudan a mejorar el estudio. Cada persona debe tener un método de estudio individual que considere su propia capacidad de aprendizaje, entendimiento y memorización de los temas. Una de las técnicas de estudio existente consiste en realizar pasos o etapas sucesivas que van aumentando el nivel de entendimiento de los conceptos a estudiar, por ejemplo: prelectura, lectura analítica, subrayado, esquematización, resumen, socialización o autocontrol. — Prelectura: se busca tener una visión general de los contenidos y captar las ideas principales del tema. Consiste en realizar una primera lectura rápida con el objetivo de entender de qué se trata la materia. Este procedimiento involucra la lectura de los títulos, encabezados, gráficos y esquemas de los textos. La idea general de este procedimiento es que sirva para formarse una idea general del tema, sin detenerse en los detalles. - Lectura analítica: consiste en realizar una lectura detenida y com- prensiva del tema completo, lo que involucra investigar los conceptos que se desconocen (buscarlos en libros o diccionarios si es necesario). Este procedimiento está orientado a que usted sea capaz de entender la Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 24 idea principal de un párrafo. Para esto puede escribir notas al margen con los conceptos principales indicados en el texto, con sus propias palabras, de manera de organizar la información de acuerdo a su per- sonal forma de pensamiento. Es importante que logre entender bien un párrafo antes de pasar al siguiente. — Subrayado: consiste en marcar las palabras clave, principales o se- cundarias y frases de interés, con el fin de favorecer la comprensión de un texto (Figura 1). Es importante que el subrayado se realice después de la lectura analítica, es decir una vez que entienda la idea principal de cada párrafo. Las primeras veces es recomendable subrayar todo con un mismo color, pero cuando comience a familiarizarse con la técnica puede utili- zar un color para las ideas principales y otro para las ideas secundarias de cada párrafo. También puede utilizar otros símbolos como flechas, signos u otra notación que le ayude a destacar y relacionar contenidos. Cuando hay que subrayar muchas líneas, es preferible utilizar paréntesis o corchetes para no sobrecargar el texto de anotaciones y subrayados que no ayudarán al análisis posterior de la lectura. Utilizar esta técnica tiene entre sus principales ventajas facilitar la comprensión del texto, porque obliga a diferenciar lo principal de lo secundario y al mismo tiempo ayuda a la concentración, desarrollando la capacidad de análisis y facilitando el repaso final. — Esquemas: consisten en organizar en forma jerárquica las ideas del texto (de las ideas principales hasta aquellas de menor importancia). Esto permite obtener de forma visual, rápida y clara las ideas generales y secundarias utilizando símbolos, flechas y conectores entre una idea y otra. Un ejemplo son los «mapas conceptuales», instrumentos de organización y represen- tación de conocimientos que relacionan los conceptos más importantes de los contenidos estudiados. Los conceptos se ubican en recuadros o círculos y se relacionan mediante líneas que los unen. Las líneas, a su vez, tienen palabras que describen la asociación entre los conceptos (Figura 2). Otro tipo de representación son los «esquemas de llave», que permiten organizar ideas que se autocontienen, al mismo tiempo que cada una de ellas tiene importancia por separado. Las ideas generales se colocan a la izquierda y las específicas a la derecha (Figura 3). Los esquemas son personales, deben ser elaborados con palabras propias y utilizando las conexiones que cada uno considere importantes, Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante 25 teniendo siempre en cuenta ir de lo principal a lo secundario. También es relevante considerar no utilizar esquemas demasiado grandes (lo ideal es que sean del tamaño de una hoja), para que sea más fácil su estudio. Una realidad de nuestra constitución biológica: somos organis- mos periódicos en fase con dos ciclos geofísicos de gran regularidad: el día y el año. Somos depositarios tanto de un reloj como de un calendario biológico. Estos ciclos geofísicos poseen dos características relevantes: su predictibilidad —por ejemplo, el periodo medio de la rotación de la Tierra ha disminuido solo unos veinte segundos en el último millón de años— y su fuerte influencia sobre distintos aspectos del medio ambiente, en particular la iluminación y la temperatura. La amplitud de los cambios en estas variables es importante; así, por ejemplo, la iluminación puede variar desde 104 lux en el mediodía de un día soleado hasta 10,3 lux en una noche de tormenta con cielo encapotado. En las regiones continentales de las zonas templadas la temperatura puede variar desde más de 35°C en verano, a varios grados bajo cero en invierno. No es de extrañar, entonces, que la conducta y fisiología de la inmensa mayoría de las especies vivientes se hayan adaptado y muestren tanto una periodicidad de 24 horas como de 365 días. La diferenciación en especies con actividad diurna, nocturna o crepuscular indica la poderosa función modeladora que la noche y el día han tenido en el proceso evolutivo; función modeladora ejercida también por los ciclos anuales, que podemos apreciar en conductas biológicas como la hibernación o la reproducción estacional.No existen dudas acerca de que el «reloj biológico» es una realidad presente en el genoma de cada célula de un organismo multicelular. La evolución en un ambiente con periodicidad de 24 horas ha deter- minado la selección del «estigma» periódico incorporado al material genético celular. ¿Cómo se sincronizan las actividades de estas múltiples unidades celulares rítmicas en un organismo pluricelular? Esto se logra a través de los dos grandes comunicadores biológicos existentes en los seres vivos: el sistema nervioso y el endocrino. Figura 1. Ejemplo de subrayado de apuntes. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 26 A MAPA CONCEPTUAL ESTRATEGIA DE APRENDIZAJE ELEMENTOS CARACTERÍSTICAS es una sus sus son son CONCEPTOS PROPOSICIONES PALABRAS CLAVE IMPACTO VISUAL JERARQUIZACIÓN SIMPLIFICACIÓN B MEMBRANA PLÁSTICA COMPONENTES FUNCIONES sus sus son son CARBOHIDRATOS PROTEINAS LÍPIDOS DELIMITAR LA CÉLULA BARRERA SEMIPERMEABLE RECIBIR Y TRANSMITIR SEÑALES Figura 2. Esquemas de mapa conceptual. (A) Mapa conceptual que represen- ta en forma organizada los diferentes conceptos y sus relaciones.(B) Mapa conceptual aplicado al tema de membrana plasmática. Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante 27 A Idea general Idea principal Idea principal Idea secundaria Idea secundaria Idea detalle Idea detalle B Célula Eucarionte Bacterias Célula animal Célula vegetal Sin núcleo definido Sin organelos Pared celular Información genética en citoplasma Posee núcleo definido Posee organelos Sin pared celular Posee centriolo Posee núcleo definido Posee organelos Posee pared celular Posee cloroplastos y vacuola Procarionte Figura 3. Esquemas tipo llave. (A) Esquema de llave, organiza ideas que se autocontienen, siempre desde lo general a lo particular. (B) Esquema de llave aplicado al tema de las características de la célula. — Resumen: escrito breve que se confecciona usando palabras propias y que incluye las ideas principales que se subrayaron anteriormente. También es recomendable que contenga las opiniones del autor (si Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 28 es que existen) y sus propias opiniones sobre el tema, esto ayuda al posterior análisis final. — Socialización o autocontrol: este procedimiento refleja lo aprendido ya sea compartiendo opiniones entre los compañeros del curso o con alguien de mayor experiencia en el tema. Es recomendable estudiar en grupo ya que en ellos se puede discutir sobre el tema. Si prefiere estudiar solo, entonces puede autopreguntarse. Cómo enfrentar las evaluaciones Durante su vida como estudiante estará constantemente sometido a pruebas y exámenes, por lo que es primordial saber cómo afrontarlos. Se considera normal que el alumno esté algo nervioso antes de iniciar un examen, lo que puede ayudar a que esté más atento. Sin embargo, en algunos casos el estrés muy intenso puede interferir en la concentración y el rendimiento. A continuación encontrará una serie de recomendaciones que pueden orientarlo para enfrentar de buena manera una evaluación. Consejos previos a una prueba o examen: — Dormir bien y descansar lo suficiente. Tratar de acostarse temprano la noche anterior. — Presentarse a rendir la prueba con anticipación. El llegar apurado o tarde aumenta el nerviosismo. — Asegurarse anticipadamente de contar con el material necesario (lápices, calculadora, goma de borrar, etcétera). — Mantenerse relajado y perder los nervios antes de la prueba. — No intentar comprobar si se recuerda todo conversando con com- pañeros antes de la prueba. — No leer rápidamente la materia a último momento. Consejos generales para enfrentar las preguntas de la prueba: — Leer las instrucciones generales y escuchar atentamente lo que indica el profesor o profesora. — Leer atentamente cada pregunta, asegurándose de comprender lo que se pide. Sugerencias pedagógicas y metodológicas para el estudiante 29 — Buscar las palabras clave de cada pregunta (indique, explique, cal- cule, defina, demuestre, compare, etcétera) que se relacionan con el nivel de dificultad y de conocimiento que esta involucra. — Es preferible comenzar a responder aquellas preguntas que se domi- nan, ya que esto ayuda a reforzar la confianza, para luego continuar con las que requieren un mayor análisis y finalmente abordar las de alta dificultad. — Después de contestar, lea nuevamente la pregunta y la respuesta para comprobarla. — Es recomendable llevar un reloj para controlar el tiempo restante. — Dejar unos minutos para revisar la prueba completa antes de en- tregarla. Consejos específicos para las preguntas de desarrollo: — Como ya lo mencionamos, es importante leer atentamente el enca- bezado, buscando las palabras clave e identificando exactamente lo que se está preguntando. Por ejemplo: es distinto lo que deben responder si la pregunta comienza con «definir», «analizar» o «ex- plicar». — Idear en la mente una respuesta a la pregunta para ordenar sus propias ideas, así se evitan errores en la redacción final o contra- dicciones en la respuesta. — La respuesta debe estar escrita con letra clara y ordenada, ya que una buena presentación demuestra orden y claridad en las ideas. — No debe cometer faltas de ortografía. Si existe alguna palabra de cuya forma correcta no está seguro es preferible que la cambie por algún sinónimo. Consejos específicos para las preguntas de alternativas: En estas preguntas también es importante seguir los consejos mencionados anteriormente, además es aconsejable: — Leer las instrucciones generales. Si la prueba tiene descuento por respuestas incorrectas, no es recomendable responder apresurada- mente y menos intentar adivinar aquellas repuestas que no conoce. — En cada pregunta debe prestar atención a las palabras claves: «siem- pre», «a veces», «todos», «ninguno». Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 30 — Debe comenzar a responder las preguntas en las que no tiene duda de cuál es la respuesta correcta. — Marque las preguntas donde tiene dudas en dos o tres alternativas. Pueden dejar alguna nota al margen para orientar el análisis cuando la retome. — Una vez que ha respondido la prueba completa, en una primera revi- sión retome las preguntas que presentaron dudas. Es recomendable que analice cuánto tiempo queda para el final de la prueba, esto le permitirá planificar el tiempo que puede invertir en cada pregunta. Una vez rendida la evaluación la mayoría de los estudiantes se conforma con recibir la calificación correspondiente, sin embargo es fundamental que usted analice su desempeño, esto implica identificar claramente cuáles fueron sus errores. Para ello, normalmente los do- centes entregan una pauta de corrección que le permite conocer las respuestas correctas. Si esto no es suficiente, consulte directamente al docente para aclarar sus dudas. Recuerde que los errores también pueden ser una fuente de aprendizaje. Las sugerencias indicadas en este capítulo persiguen que usted logre un buen rendimiento académico, sin embargo es muy importante tener presente que, para ello, deben realizarse en forma continua y metódica. Para saber más: 1. Álvarez, L. (2004). Técnicas de estudio para alumnos de E.S.O. Investi- gación y Educación, 9. Disponible en http://www.csi-f.es/archivos_mi- gracion_estructura/andalucia/modules/mod_sevilla/archivos/revistaense/ n9/estudio.PDF 2. Barraza, A. (2007). El estrés de examen. Disponible en http://www. psicologiacientifica.com/bv/psicologiapdf-306-el-estres-de-examen.pdf 3. Martínez-Otero, V. y Torres L. (2005). Análisis de los hábitos de estudio en una muestra de alumnos universitarios. Revista Iberoamericana de Educación, 35. 4. Vidal, L., Gálvez, M. y Reyes-Sánchez, L. B. (2009). Análisis de hábitos de estudio en alumnos de primer año de Ingeniería Civil Agrícola. For- mación Universitaria, 2, 27-33. 31 Capítulo 1 Fundamentos básicos para la biología celular La célulaconstituye la unidad estructural y funcional básica de todos los seres vivos. En términos prácticos podemos afirmar que la célula es tan importante para la biología como el átomo para la química. Algunos organismos se denominan unicelulares debido a que están constituidos por una célula, como es el caso de bacterias, levaduras y protozoos como las amebas. Otros, como los insectos, reptiles, aves, plantas superiores y mamíferos, están formados por miles o millones de células que presentan diferentes grados de especialización. Por este motivo son conocidos como organismos multicelulares. Existe una gran diversidad de tipos celulares que presentan grandes diferencias en lo referido a su morfología y funciones. Por ejemplo, una célula bacteriana como Escherichia coli mide solo algunos micróme- tros (1µm=10-6 metros), a diferencia de una neurona, que también es una sola célula, pero posee mucho mayor tamaño y un gran nivel de especialización. Pese a esto, es posible encontrar algunas característi- cas comunes entre células distintas, por ejemplo, la presencia de una delgada membrana celular o membrana plasmática, compuesta funda- mentalmente por fosfolípidos y proteínas. En células vegetales, hongos y bacterias, la membrana celular está recubierta y protegida por una estructura compuesta de diferentes polisacáridos llamada pared celular. Otra característica común a distintos tipos celulares es la existencia de metabolismo, es decir, un conjunto de reacciones bioquímicas de síntesis y degradación que permiten satisfacer los requerimientos energéticos y la síntesis de biomoléculas importantes para la supervivencia de la célula. Finalmente, todas las células poseen material genético en forma de DNA y RNA, el cual dirige todas las actividades presentes en ellas. De acuerdo a su organización, se distinguen dos tipos de células: procariontes y eucariontes. Habitualmente, las células eucariontes son Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 32 de mayor tamaño que las procariontes. En estas últimas, el DNA que constituye el material genético se encuentra localizado en el citoplasma como una gran macromolécula circular asociada débilmente con algu- nas proteínas, región que se denomina nucleoide. Otra característica fundamental de estos sistemas es que no existe compartimentalización del citoplasma (Figura 1.1). En eucariontes, el DNA se presenta como una molécula lineal fuertemente unida a proteínas llamadas histonas y se encuentra localizado mayoritariamente en el núcleo, delimitado por una doble membrana denominada carioteca o membrana nuclear que separa físicamente el material genético del resto de los contenidos celulares. Dependiendo del tipo celular, también es posible encontrar DNA en algunos organelos, como las mitocondrias en animales y cloroplastos y mitocondrias en vegetales. Fimbria Pared celular Membrana celular DNA Ribosoma Flagelo Figura 1.1. Esquema de una célula procarionte. Se indican las principales estructuras presentes en una célula procarionte típica. Fundamentos básicos para la biología celular 33 Tanto procariontes como eucariontes contienen en su citoplasma una gran cantidad de macromoléculas, iones y una abundante cantidad de agua. También se distingue la presencia de ribosomas, organelos no membranosos asociados a la síntesis de proteínas que están presentes en todos los tipos celulares. Una de las principales características del citoplasma de las células eucarióticas es la presencia en él de diferentes compartimentos denominados organelos, que se han especializado en la realización de ciertas funciones específicas (Tabla 1.1). Debido a que las células eucariontes y procariontes comparten ciertas características en su funcionamiento, algunos científicos pos- tularon la existencia de ancestros comunes. Actualmente, se acepta la idea de que en algún momento de la historia del planeta los eucarion- tes surgieron de ancestros procariontes y evolucionaron de manera independiente (Figura 1.2). Tabla 1.1. Organelos presentes en células eucariontes La tabla indica el nombre de organelos presentes en la célula eu- carionte y su función principal. ORGANELO FUNCIÓN ASOCIADA Núcleo Contiene el material genético. Retículo Endoplasmático Rugoso Síntesis de proteínas de membrana, lisosomales y de secreción. Retículo Endoplasmático Liso Síntesis de lípidos, almacenamiento de calcio, destoxificación. Aparato de Golgi Maduración de proteínas provenientes del Retículo Endoplasmático Rugoso. Mitocondria Síntesis ATP, Ciclo de Krebs, β-oxidación de lípidos (cadena corta). Lisosoma Digestión celular, autofagia. Peroxisoma β-oxidación de lípidos (cadena larga), degradación de H 2 O 2 . Cloroplastos Fotosíntesis, fijación de CO 2 . Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 34 De acuerdo a lo propuesto por el científico Carl Woese en fun- ción de sistemas de taxonomía molecular, los organismos se agrupan en tres categorías principales llamadas dominios, estos son: Bacteria, Archaea y Eukarya. Dentro del dominio de los Eukarya se encuentran cuatro reinos: protistas, hongos, plantas y animales. Los organismos pertenecientes al dominio Bacteria incluyen dos reinos: eubacterias y cianobacterias. En el dominio Archaea se pueden mencionar las archeobacterias acidófilas, termoplasmales y metanobacterias. Tanto las eubacterias como las archeobacterias son procariontes. Bacteria verde filamentosa Spirochaetes Proteobacteria Cianobacteria Planctomyes Bacteroides Cytophaga Thermotoga Aquifex Gram positiva Ancestro universal Methanosarcina Methanobacterium Methanococcus T. celer Thermoproteus Pyrodictium Halófilos Entamoeba Myxomycota Animales Fungi Plantas Ciliophora Flagelados Tricomonadas Microsporidias Diplomonadas Bacteria Archaea Eukarya Figura 1.2. Árbol filogenético de la vida. Los diferentes tipos celulares derivan de una célula ancestral. Los procariontes son en general unicelulares, aunque en algunos casos las células forman racimos, filamentos o cadenas. Además, pueden ser autótrofos o heterótrofos. Los protistas en su mayoría son eucarion- tes unicelulares, existiendo algunos ejemplos de multicelulares simples que no poseen tejidos especializados e incluyen tanto heterótrofos como autótrofos fotosintéticos. Los hongos, plantas y animales constituyen organismos eucariontes multicelulares, de ellos animales y hongos son heterótrofos, mientras que las plantas son autótrofos fotosintéticos, salvo algunos casos como el de la Pipa de Indio (Monotropa hypopitys) que carece de clorofila y es una planta parásita. Fundamentos básicos para la biología celular 35 1.1. La teoría celular En sus inicios, a comienzos del siglo XVII, los trabajos en el área de la biología y microbiología se limitaron a la descripción, lo más detallada posible, de un mundo diminuto, detectable mediante el uso de lupas o lentes de aumento pero invisible a simple vista. La invención del microscopio contribuyó enormemente al estudio de la célula, siendo Pierre Borel, aproximadamente en 1630, uno de los primeros biólogos que utilizó este instrumento en sus observaciones. En 1665, Robert Hooke introdujo el término célula para describir un con- junto de poros (celdas) que formaban la estructura del corcho, y en 1674, Antón van Leeuwenhoek describió una serie de pequeños «animalitos» presentes en una gota de agua, constituyendo esta la primera observación de organismos unicelulares vivos. También describió diferentes formas de bacterias presentes en material raspado obtenido de sus propios dientes. En 1838, Matthias Schleiden concluyó que las plantas estaban constituidas de células y que el embrión de la planta tuvo su origen en una sola célula. Un año después, el zoólogo Theodor Schwann pu- blicó que las células de las plantas y animales eran estructuralmente semejantes. Estas ideas constituyen los dos primeros postulados de la teoría celular: — todos los organismos están formadospor una o más células, y — la célula es la unidad estructural básica de la vida. En 1855 Rudolf Virchow, patólogo alemán, formuló una hipótesis que actualmente constituye el tercer postulado de la teoría celular: — las células solo pueden originarse por división de una célula pre- existente. Actualmente, la acumulación de conocimientos sobre las carac- terísticas y procesos que ocurren en la célula permite complementar estos tres postulados clásicos, por lo es posible incluir a lo anterior otras consideraciones como: — todas las células poseen metabolismo. — la célula es la unidad fisiológica de la vida, ya que las funciones vitales de los organismos ocurren dentro de ella, o en su entorno inmediato. — la célula es la unidad genética de la vida, ya que cada una de ellas contiene toda la información hereditaria almacenada en las molé- Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 36 culas de DNA, las que son transmitidas a la siguiente generación durante el proceso de división. — algunos organismos se encuentran formados solo por una célula (unicelulares) y otros por muchas células (multicelulares). 1.2. Características de los seres vivos En los organismos ocurren constantemente una serie de procesos que los hacen distintos a la materia inorgánica. En términos generales, se entiende como organismo vivo a todo aquel que es capaz de realizar las siguientes actividades: Reproducción: es la capacidad que tienen los seres vivos para pro- ducir copias de sí mismos, generando nuevos individuos similares a sus progenitores utilizando para ello mecanismos sexuales o asexuales. La importancia de esta función radica en perpetuar la especie en el tiempo. Metabolismo: es la capacidad de los seres vivos para extraer y transformar la energía del medio y utilizarla para la síntesis y man- tención de sus propias estructuras. Se divide en dos grandes grupos de reacciones: — Catabolismo o reacciones catabólicas, que permiten la degradación de nutrientes hasta precursores simples, liberando energía en el proceso. — Anabolismo o reacciones anabólicas (biosíntesis), que permiten utilizar precursores simples para construir las moléculas propias de la célula. Estas reacciones requieren energía. Relación o sensibilidad con su entorno: es la capacidad de recibir es- tímulos y reaccionar frente a ellos. El conjunto de reacciones y respuestas que desarrollan los seres vivos para mantener sus condiciones internas constantes, a pesar de los cambios ambientales, se denomina homeostasis. Evolución: se refiere a las modificaciones que deben ocurrir en los organismos para que se adapten a cambios del ambiente. Estos cambios ocurren a nivel genético en una población y son transmitidos a las nuevas generaciones, lo que permite la adaptación e incluso la aparición de nuevas especies. Los aspectos anteriores pueden observarse en organismos como bacterias, plantas y animales; sin embargo, no son tan fáciles de apreciar en los virus, ya que estos no poseen metabolismo propio y Fundamentos básicos para la biología celular 37 necesitan infectar una célula con el fin de reproducirse. Los virus no son materia inerte ya que las moléculas que encierran en su interior poseen la información necesaria para obtener copias de sí mismos. Por este motivo se acepta que los virus están situados en la frontera entre lo vivo y lo inerte, es decir, en la frontera de la vida. 1.3. Niveles de organización de la materia Los átomos constituyen el nivel más pequeño de un elemento que man- tiene sus propiedades químicas individuales. Estos se organizan para formar moléculas, y estas, a su vez, constituyen las células. Las células forman parte de tejidos, los cuales se organizan en órganos. Estos últimos dan origen a aparatos y sistemas. Un conjunto de aparatos y sistemas que funcionan coordinadamente constituyen un ser vivo (Figura 1.3). Un grupo de individuos que comparten las mismas características genéticas forman una especie o población y un grupo de poblaciones diferentes constituye una comunidad. Las comunidades actúan recíprocamente con su ambiente para formar un ecosistema y la suma de todos los ecosis- temas y comunidades en la Tierra es lo que conocemos como biósfera. Átomo Molécula (DNA) Organelo (Núcleo) Célula Tejido (Epitelio Intestinal) Órgano (Hígado) Sistema (Digestivo) Organismo Figura 1.3. Niveles de organización de la materia para formar un organismo. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 38 Algunas de las características más importantes de los niveles de organización de la materia, según su complejidad, son: Nivel subatómico: lo integran las partículas más pequeñas de la materia, como son los protones, neutrones y electrones. Nivel atómico: cada átomo posee un núcleo que está formado por protones que tienen carga positiva y neutrones carentes de carga, que tienen la misma masa de los protones. Alrededor del núcleo y en constante movimiento se encuentran los electrones, que poseen carga negativa. Existen átomos del mismo elemento que contienen distinto número de neutrones, por lo que difieren en su masa pero no en sus propieda- des químicas. Estos se denominan isótopos, como por ejemplo el 16O y 18O; 12C y 14C. Nivel molecular: a nivel molecular, los elementos están formados por átomos del mismo tipo. Por otra parte, los compuestos son molé- culas que se encuentran constituidas por átomos diferentes, como es el caso del agua. Nivel celular: moléculas como fosfolípidos y proteínas consti- tuyen membranas estructurales, que poseen funciones específicas. Todas las células poseen una membrana que las delimita. En euca- riontes existen estructuras especializadas como compartimentos, denominadas organelos, como por ejemplo: retículo endoplasmático (liso y rugoso), cloroplastos, mitocondrias, aparato de Golgi, núcleo, lisosomas y vacuolas. Nivel orgánico: hay células que existen en forma independiente o unicelular y otras que se organizan en niveles más complejos hasta for- mar organismos pluricelulares. En ellos existen tejidos especializados, órganos y sistemas que desempeñan funciones altamente específicas. Nivel de población: corresponde a un conjunto de individuos de la misma especie que viven en un lugar específico por un determinado periodo de tiempo. Nivel de ecosistema: se refiere a un conjunto de poblaciones que habitan en una misma zona y forman una comunidad. Estas comu- nidades y las relaciones que se establecen con su entorno forman un ecosistema. Por ejemplo, los factores climáticos delimitan lugares de vegetación similar que a su vez permiten la existencia de un tipo de fauna concreta, repitiéndose dichas zonas en áreas muy extensas de la Tierra que reciben el nombre de biomas. El conjunto de todos los Fundamentos básicos para la biología celular 39 biomas terrestres forma la biósfera, es decir, la capa de la Tierra habi- tada por seres vivos y, por tanto, su nivel de organización más amplio. 1.4. Estructura del átomo y tipos de enlaces El átomo es el constituyente básico de la materia. También se define como la partícula más pequeña de un elemento que mantiene todas sus propiedades. En términos estructurales, posee un núcleo central que está formado por dos tipos de partículas subatómicas y rodeado por electrones. Protones: poseen masa y carga positiva. Su número determina el número atómico del elemento, por ejemplo el carbono posee seis protones y este es su número atómico. Neutrones: son eléctricamente neutros (sin carga) y poseen la misma masa que los protones. En algunos casos, átomos de un mismo elemento presentan un diferente número de neutrones en su núcleo manteniendo constante el número de protones; estas variaciones se denominan isótopos, por ejemplo el carbono, existe mayoritariamente como el isótopo estable carbono 12 (12C), que posee en su núcleo seis protones y seis neutrones. Sin embargo, también es posible encontrar en el planeta un isótopo menos estable llamado carbono14 (14C), que en su núcleo presenta ocho neutrones y seis protones, igual que 12C. Electrones: se encuentran rodeando al núcleo atómico y en cons- tante movimiento distribuidos en diferentes orbitales. Poseen carga negativa y su número es equivalente al número de protones que existe en el núcleo. En el caso del 12C, dado que posee seis protones en su núcleo, existen seis electrones distribuidos en diferentes orbitales de energía. Los átomos pueden interactuar entre sí debido a los electrones que poseen en sus orbitales de energía. Un orbital incompleto es mucho menos estable que un orbital completo y, por lo tanto, los átomos con orbitales incompletos son muy propensos a interactuar con otros, lo que significa perder, ganar o compartir electrones. Esto es la base del enlace químico. Los compuestos iónicos son formados por elementos con una gran diferencia de electronegatividad, cuyos enlaces son el producto de fuerzas electrostáticas de atracción entre aniones y cationes. Si la menor energía se logra mediante la transferencia completa de uno o más electrones de un átomo a otro se forman iones (catión que posee Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 40 carga positiva o anión si tiene carga negativa), y el compuesto perma- nece unido por las fuerzas electrostáticas entre ellos. Un ejemplo de compuesto que presenta este enlace es el cloruro de sodio o sal común. La unión de fuerzas de atracción entre dos átomos con electro- negatividades similares o iguales se denomina enlace covalente y es el resultado de compartir uno o más pares de electrones, lo que provoca una menor energía potencial. Este enlace se forma exclusivamente entre átomos no metálicos. Los compuestos formados por este tipo de enlace pueden ser gases atmosféricos, como por ejemplo: O 2 , N 2 , H 2 O, CO 2 ; combustibles comunes como el metano (CH 4 ) (Figura 1.4); y la mayoría las moléculas que se encuentran en el cuerpo humano como proteínas, lípidos DNA y RNA. Figura 1.4. Ejemplos de fórmula y estructura química de algunas moléculas inorgánicas. Fundamentos básicos para la biología celular 41 Frecuentemente en los sistemas biológicos, las moléculas presentan diferentes fuerzas intermoleculares que se relacionan con sus propie- dades y estabilidad. Una de estas interacciones es el puente de hidró- geno, que está relacionado con las propiedades del agua. También es la interacción que existe entre las bases nitrogenadas del DNA y es en gran medida responsable de estabilizar la estructura de las proteínas. El puente de hidrógeno es la unión débil, no covalente entre un átomo de hidrógeno y un elemento electronegativo presente en otra molécula (como oxígeno o nitrógeno). Para que este tipo de unión se produzca, el hidrógeno debe estar a su vez unido covalentemente a un elemento electronegativo, el cual atraerá los electrones del enlace, generando en su entorno un exceso de carga negativa (δ-), mientras que en torno al átomo de hidrógeno se genera un déficit de electrones (δ+) (Figura 1.5). Figura 1.5. Ejemplos de puente de hidrógeno entre diferente moléculas. (A) agua, (B) alcohol y agua, (C) cetona y agua, (D) amina y agua. Los puentes de hidrógeno se representan con línea punteada. Otra interacción conocida entre las biomoléculas son las hidro- fóbicas, que se originan cuando moléculas hidrófobas, o sea, que no son solubles en agua, tienden a agruparse cuando se encuentran en solventes acuosos. Este es el caso de los aminoácidos con radicales Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 42 apolares que durante el plegamiento de la proteína que los contiene son aislados del solvente y permanecen hacia el interior de la estruc- tura. En cambio, en el caso de las proteínas transmembranas, los radicales hidrófobos pueden encontrarse expuestos, encontrándose con las colas hidrófobas de los lípidos de la bicapa lipídica que forma la membrana celular. Finalmente, en las interacciones electrostáticas se relacionan con la atracción o repulsión de cargas eléctricas. Las moléculas que parti cipan contienen en su estructura grupos cargados que les permiten interac- cionar con moléculas similares o con diferentes iones. Por ejemplo, en una proteína las cadenas laterales ácidas o básicas pueden interactuar con iones presentes en el medio o con otras cadenas cargadas. Es decir, si una cadena tiene carga positiva, podría interactuar con otra que posea carga negativa. 1.5. Teorías del origen de la vida Explicar el origen de la vida ha sido un gran desafío para diversas cul- turas a lo largo de la historia de la humanidad. En general las teorías se basan en los conocimientos que poseía el ser humano al momento de elaborarlas. Dentro de las más importantes podemos mencionar: Creacionismo: sostiene que todas las formas de vida, incluido el ser humano, fueron creadas por uno o varios dioses, a quienes también se les atribuye la creación de todo el universo. Estas teorías fueron muy frecuentes en diversas culturas antiguas (egipcios, mayas, griegos, etcétera). Generación espontánea: propuesta inicialmente por Aristóteles. De acuerdo a ella, los seres vivos se crean a partir de la combinación adecuada de materia inerte, por ejemplo «los ratones se crean a partir de alimentos en descomposición y ropa sucia». En su formulación original, esta teoría fue rebatida por expe- rimentos llevados a cabo por Francesco Redi y Louis Pasteur, que demostraron la imposibilidad de que los seres vivos, incluso los más simples, pudieran aparecer «espontáneamente» de la materia inerte. Panspermia: plantea que la vida se originó fuera del planeta, en cualquier parte del universo, y que habría llegado a la Tierra dentro de meteoritos, siendo liberada al colisionar estos con el planeta y dispersar Fundamentos básicos para la biología celular 43 su contenido en la atmósfera. Los meteoritos habrían «sembrado» el planeta con la vida proveniente del exterior. Inicialmente postulada por el griego Anaxágoras, su formulación científica moderna fue propuesta por el premio Nobel de Química Svante Arrhenius y defendida por los físicos Fred Hoyle y Chandra Wickramasinghe, especialmente después del supuesto hallazgo de biomoléculas entre los restos del meteorito Murchison, caído en 1969 en Australia. Quimiosíntesis: actualmente es la más aceptada. Plantea que las condiciones de la Tierra primitiva habrían permitido la formación de mo- léculas orgánicas básicas a partir de las cuales se originaron los primeros seres vivos. Esta hipótesis se generó a partir del trabajo independiente del bioquímico ruso Alexander Oparin y el matemático y botánico inglés John Haldane. Se trata de la teoría con más sustento científico. 1.6. Condiciones de la tierra primitiva De acuerdo a diversos estudios, se calcula que nuestro planeta se formó hace aproximadamente 4.500 millones de años. Sin embargo, la apa- rición de las primeras formas de vida habría ocurrido mucho después, aproximadamente hace 3.500 millones de años. Sin duda las condiciones que presentaba el planeta tras su formación eran muy diferentes a las actuales. Se sugiere que los océanos habrían aparecido en épocas tempranas, posteriores a su formación, en un am- biente caracterizado por la presencia de altas temperatura. La elevada evaporación habría permitido abundantes precipitaciones y tormentas eléctricas. Además, la atmósfera fuertemente reductora carecía de oxíge- no, por lo que tampoco existía la capa de ozono para proteger al planeta de la radiación ultravioleta (UV). En estas condiciones, a medida que la Tierra se enfriaba, diferentes moléculas inorgánicas en estado gaseoso, como H 2 , NH 3 , CH 4 y H 2 O, podrían haber reaccionado para generar moléculas orgánicas presentes en los seres vivos. En 1953, Stanley Miller y Joseph Urey intentaron reproducir en el laboratorio las condiciones existentes en la Tierra primitiva hace cua- tro mil millones de años. Para ello colocaron en un recipiente cerrado unamezcla de gases consistente en: H 2 , NH 3 , CH 4 y H 2 O (en forma de vapor). Este recipiente (Figura 1.6) se hacía hervir y los gases produ- cidos eran expuestos a descargas eléctricas. Finalmente, se analizaron Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 44 los productos obtenidos identificando moléculas como aminoácidos, aldehídos, ácidos nucleicos y azúcares. Este experimento demostró que en las condiciones que presentaba la atmósfera primitiva sería posible la síntesis de compuestos orgánicos esenciales para los seres vivos, a partir de moléculas inorgánicas. Figura 1.6. Esquema del sistema usado en el experimento de Miller y Urey. 1.7. Biomoléculas Los resultados obtenidos del análisis químico de los componentes celulares demuestran que los seres vivos están formados por una serie de elementos y compuestos químicos. En general, los elementos que forman parte de los seres vivos se denominan bioelementos. Estos, a su vez, interactúan para formar biomoléculas tanto orgánicas como inorgánicas. Dentro de las moléculas inorgánicas se encuentran: agua, sales minerales y gases como O 2, CO 2, y N 2 . Las biomoléculas orgánicas incluyen carbohidratos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. Fundamentos básicos para la biología celular 45 1.7.1. Agua El agua es fundamental para todas las formas de vida conocidas. Es la sustancia más abundante en la célula y puede constituir cerca del 70% de su masa. Por ejemplo, en una persona de 70 kilos, 49 de ellos corresponden a la masa del agua contenida en su organismo. Sumado a lo anterior, el agua es también el medio en que se realizan la mayoría de las reacciones bioquímicas del metabolismo celular. La molécula de agua está formada por dos átomos de hidrógeno unidos a un átomo de oxígeno mediante enlaces covalentes, lo que da origen a un ángulo de aproximadamente 104,5º en su estructura. Las propiedades más importantes del agua se pueden resumir en: La molécula de agua tiene carácter polar (dipolar): debido a la ma- yor electronegatividad del oxígeno con respecto al hidrógeno, la carga interna en la molécula se distribuye en forma asimétrica, generando una mayor densidad electrónica sobre el oxígeno (δ-) y un déficit en los átomos de hidrógeno (δ+). Es importante notar que a pesar de los desplazamientos polarizados de carga dentro de la molécula de agua, su carga formal es cero, o sea, es eléctricamente neutra (Figura 1.7). El carácter dipolar de la molécula de agua le permite interactuar con otras mediante puentes de hidrógeno (Figura 1.8). De esta manera, cada molécula de agua puede establecer hasta cuatro puentes de hidró- geno con otras moléculas de agua que la rodean, cuyo ordenamiento depende de la temperatura a la cual se encuentran, formando cristales altamente ordenados en estado sólido y, por lo tanto, ocupando un mayor volumen, o en estado móvil, como líquido, donde las moléculas poseen menor orden y ocupan menor volumen. En estado gaseoso, las interacciones por puentes de hidrógeno entre las moléculas de agua se han perdido. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 46 Figura 1.7. Estructura de la molécula de agua. (δ-) representa mayor densidad electrónica sobre el oxígeno, (δ+) muestra un déficit de densidad electrónica en los átomos de hidrógeno. Molécula de Agua Enlace covalente Puente de hidrógeno Figura 1.8. Enlaces químicos en la molécula de agua. Los enlaces covalentes se denotan por líneas continuas, mientras que las interacciones por puentes de hidrógeno con una línea punteada o segmentada. El agua permanece en estado líquido en un amplio margen de temperaturas (0º-100º), debido a que una molécula de agua puede interactuar por puentes de hidrógeno entre moléculas de agua (3 o 4, dependiendo de la temperatura). Si bien cada puente de hidrógeno es un enlace muy débil (1-5 Kcal/mol), la sumatoria del gran número que se forma entre las moléculas de agua estabiliza la interacción entre ellas, requiriéndose mucha energía para romperlos todos y así pasar a estado gaseoso. Esta propiedad se relaciona directamente con que: Fundamentos básicos para la biología celular 47 El agua posee un elevado calor específico. Esto se define como la cantidad de calor que se necesita por unidad de masa para elevar la temperatura un grado Celsius. El calor específico del agua es 1 caloría/ gramo°C = 4,19 J/gramo°C, que es más alto que el de cualquier otro solvente común (por ejemplo, el calor específico para el etanol es de 2,44 J/gramo°C). Entre otras cosas, esto permite la conducción de ca- lor en el organismo contribuyendo a la termorregulación, al mantener constante e igualar la temperatura en las diferentes zonas corporales. El agua es buen solvente para moléculas polares: por su estruc- tura molecular angular y la diferencia de electronegatividad entre el hidrógeno y el oxígeno con la consecuente distribución asimétrica de la densidad electrónica, las moléculas de agua son capaces de solvatar compuestos polares o iónicos. La solvatación consiste en que las mo- léculas de solvente rodean ordenadamente al soluto estabilizándolo, quedando este último, disuelto. Un claro ejemplo de solvatación lo encontramos en la disolución de NaCl: en solución acuosa los iones que conforman la sal se separan quedando como Na+ y Cl-, cada uno de estos solvatados por moléculas de agua (Figura 1.9). Algunas moléculas con grupos polares, como los alcoholes (R-OH), son capaces de formar puentes de hidrógeno con moléculas de agua (Figura 1.5 B), quedando así solvatados y estabilizados (Figura 1.10). Asimismo, el agua es capaz de solubilizar moléculas biológicas que poseen grupos cargados (ionizables), como COO- y (NH 3 )+. Las moléculas que se disuel- ven en agua se denominan hidrófilas, es decir, que tienen afinidad por el agua. Un gran número de moléculas celulares pertenece a esta categoría, como azúcares, DNA, RNA y la mayor parte de las proteínas. Las moléculas hidrofóbicas como los lípidos no tienen afinidad por el agua debido a que no poseen carga o regiones polares y, por lo tanto, son incapaces de formar puentes de hidrógeno con ella o los forman en un número reducido. Un ejemplo de lo anterior lo constituye la homogenización de agua y aceite, que da como resultado una mezcla denominada emulsión, la cual, luego de un tiempo se separa en dos fases. Las moléculas apolares, al encontrarse en una solución acuosa, tienden a unirse entre sí, estabilizándose mediante interacciones hidro- fóbicas (Figura 1.10). Este tipo de uniones permite que las moléculas apolares se protejan de la presencia de moléculas de agua. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 48 Figura 1.9. Solvatación de NaCl. El agua se orienta en torno a los iones de acuerdo a la carga que estos presentan. En el caso del catión sodio, la orienta- ción está dada por los átomos de oxígeno (δ-) y para el anión por los átomos de hidrógeno (δ+). Las moléculas de agua exhiben elevada fuerza de cohesión y adhesión, esto es, asociación entre moléculas de agua (cohesión) y entre moléculas de agua y superficies polares (adhesión). Los puentes de hidrógeno mantienen a las moléculas de agua fuertemente unidas, formando una estructura compacta que la convierte en un líquido casi incompresible. Producto de estas interacciones encontramos fenómenos como la tensión superficial. Fundamentos básicos para la biología celular 49 Figura 1.10. Comportamiento de moléculas polares y apolares en agua. Las moléculas polares puede ser solvatadas por el agua, de esta forma son disueltas. Las moléculas apolares, en cambio, no pueden ser solvatadas y debido a esto son insolubles en agua, sin embargo pueden agruparse mediante interacciones hidrofóbicas. 1.7.2. Hidratos de carbono Se conocen también como glúcidos o carbohidratos. Son macromolé- culas formadas por carbono (C), hidrógeno (H) y oxígeno (O). Los hidratos de carbono más simples se denominan monosacári- dos, mientras que los más grandes ycomplejos reciben el nombre de polisacáridos y pueden estar compuestos por monosacáridos similares o idénticos. Las funciones que realizan los carbohidratos son variadas, incluyendo energéticas, estructurales o como señales de localización o comunicación intercelular, como es el caso de los oligosacáridos presentes en la membrana celular (glicocálix). En términos químicos estas biomoléculas son principalmente polihidroxialdehídos (R-CHO) o polihidroxicetonas (R-CO-R). Solo en algunos casos incluyen nitró- geno, fósforo o azufre como parte de su estructura. En los siguientes párrafos nos referiremos brevemente a los tipos de carbohidratos indicados anteriormente. Molécula Polar Capas de Solvatación Molécula Apolar Molécula Apolar Interacción Hidrofóbica Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 50 Monosacáridos: son los carbohidratos más simples. Están com- puestos por una cadena de átomos de carbono con átomos de hidró- geno y oxígeno enlazados de acuerdo a la proporción de 1 carbono: 2 hidrógenos: 1 oxígeno (CH 2 O)n. Su nomenclatura está determinada por el número de carbonos que compone la cadena principal. Por ejemplo, una cadena que contiene 3 átomos de carbono se denomina triosa, tetrosa si contiene 4 carbonos; pentosa si posee 5 y así sucesivamente. También se debe considerar el grupo funcional que presenta la cade- na, que puede ser aldehído, en cuyo caso se hablará de la «aldosa» o «cetosa» si el grupo principal corresponde a una cetona (Figura 1.11). A B Grupo aldehido Grupocetona Aldopentosa (D-Ribosa) Centopentosa (D-Ribulosa) Figura 1.11. Ejemplos de carbohidratos en forma aldosa (A) y cetosa (B). Se indica el grupo aldehído y cetona en cada caso. Los monosacáridos son moléculas inestables en medio acuoso y por este motivo se ciclan, para lo cual los grupos aldehídos o cetonas reaccionan con un hidroxilo de la misma cadena convirtiéndola en una estructura en forma de anillo (Figura 1.12). Si el anillo está formado por seis elementos (cinco carbonos y un oxígeno) recibe el nombre de piranosa. En cambio, si el anillo posee solo cinco elementos (cuatro carbonos y un oxígeno) se denomina furanosa. Dentro de los mo- nosacáridos más comunes encontramos hexosas como la glucosa, la fructosa y la galactosa, o pentosas como la ribosa y la desoxirribosa. Fundamentos básicos para la biología celular 51 Figura 1.12. Representación del monómero de glucosa. (A) forma lineal y (B) forma cíclica (piranosa). Disacáridos: están compuestos por dos monosacáridos unidos por un enlace covalente denominado glicosídico (glucosídico). La reacción de unión de monosacáridos se denomina condensación e implica la pérdida de una molécula de agua por cada par de moléculas de mo- nosacáridos unidos (Figura 1.13). Estas moléculas pueden volver a separarse por hidrólisis (la adición de una molécula de agua) para formar nuevamente las unidades de monosacáridos. La hidrólisis es una reacción exergónica, es decir, la energía química de enlace de sus productos es menor que la de la molécula original, por lo tanto, en esta reacción se libera energía. Al contrario, la unión de dos monosacáridos para formar un disacárido requiere la aplicación de energía. Tal como se observa en la Figura 1.13, un disacárido puede estar formado por monosacáridos diferentes. Los disacáridos más comunes son: — Sacarosa: glucosa + fructosa — Maltosa: glucosa + glucosa — Lactosa: glucosa + galactosa. Oligosacáridos: corresponden a cadenas cortas de entre 12 y 30 unidades monoméricas. Generalmente se encuentran unidos por enlaces covalentes a lípidos y proteínas, formando glicolípidos y glicoproteínas Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 52 que son de especial importancia en la superficie de la membrana celular donde desempeñan funciones informativas y de reconocimiento. Polisacáridos: están formados por largas cadenas simples o ramifi- cadas de monosacáridos que pueden estar compuestas por monómeros iguales (homopolisacáridos) o monómeros diferentes (heteropolisacá- ridos) (Figura 1.14). Algunos tienen funciones estructurales, como la celulosa de vegetales y la quitina de los hongos (Figura 1.15). Otros constituyen una reserva de azúcar con fines energéticos, como el almi- dón, que está formado por moléculas de glucosa y es el polisacárido de reserva de las plantas, mientras que en bacterias y animales el glicógeno cumple este rol. Ambos polisacáridos deben hidrolizarse a sus unidades monoméricas básicas antes de ser utilizados como fuente de energía. Figura 1.13. Formación de disacáridos. Ejemplo de formación de sacarosa, el proceso implica la formación de un enlace glicosídico entre la glucosa y la fructosa, con la pérdida de una molécula de agua. El glicógeno está formado exclusivamente por glucosa, es decir es un homopolímero que puede llegar a tener 120 mil monómeros. Más o menos cada 10 unidades monoméricas existen puntos de ramificación Fundamentos básicos para la biología celular 53 en la cadena (Figura 1.15). En animales el glicógeno se almacena en hígado y músculos. La mayor parte de los vegetales utilizan el almidón como molécula de reserva energética. Este polisacárido, al igual que el glicógeno, es un polímero de glucosa, cuya organización estructural es diferente debido a que está constituido por una mezcla de amilosa y amilopectina: — Amilosa: homopolímero de glucosa, de 300 a 3.000 subunidades formando una cadena lineal, de estructura tridimensional helicoi- dal, con escasas o nulas ramificaciones. Puede constituir el 25% del almidón. — Amilopectina: homopolímero de glucosa, de 200 a 200 mil subuni- dades formando una cadena lineal altamente ramificada. Constituye aproximadamente el 75% del almidón. Aunque los animales no producen almidón, poseen la enzima amilasa que les permite hidrolizarlo y obtener glucosa. Figura 1.14. Estructura de homopolisacáridos y heteropolisacáridos. Los homopolisacáridos están formados por la misma unidad monomérica; en cambio, los héteropolisacáridos presentan más de un tipo de unidad mono- mérica básica. Miguel Castro Retamal y Pablo Nelson Hunt 54 Figura. 1.15. Estructura de polisacáridos. (A) Amilosa, (B) Celulosa y (C) Glicógeno. 1.7.3. Lípidos Son un grupo de moléculas orgánicas de composición química variada que tienen en común su incapacidad para disolverse en agua (hidrofó- bicos), pero sí son solubles en solventes orgánicos, como por ejemplo en cloroformo, éter o benceno. Los lípidos y compuestos relacionados poseen en su estructura largas cadenas hidrocarbonadas alifáticas o de anillos bencénicos. Para las funciones celulares, los lípidos más importantes son las grasas, esteroides y los fosfolípidos. Dentro de las funciones que desempeñan en la célula tenemos: Fundamentos básicos para la biología celular 55 — almacenamiento de energía, — funciones estructurales (forman parte de la membrana plasmática), — ser agentes formadores de emulsiones, — ser precursores de hormonas, y — ser mensajeros intracelulares. Grasas: constan de una molécula de glicerol unida mediante enlaces de tipo éster a tres ácidos grasos. En esta condición la molécula se deno- mina triacilglicerol o triglicérido (Figura 1.16). Estos se almacenan en el tejido adiposo del cuerpo, como reserva de energía. Los triglicéridos también se encuentran presentes en plasma producto de la ingesta de alimentos que los contienen o de la síntesis en el hígado a partir de otros nutrientes. El hígado transforma el exceso de calorías, grasas o hidratos de carbono consumidos en triglicéridos para ser utilizados en períodos de escasez. En dicha situación los triglicéridos son hidrolizados y los ácidos grasos resultantes son gradualmente liberados y metabolizados de acuerdo a los requerimientos de energía del organismo. Los ácidos grasos poseen una larga cadena hidrocarbonada sin ramificaciones y de características hidrofóbicas. En uno de sus extremos presentan un grupo carboxilo (-COOH) con características
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