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234 G E N Ó M I C A , G E N É T I C A Y V I R O L O G Í A propia RNA-polimerasa o bloqueando la unión de las proteí- nas TBP (proteína de unión a TATA) y TFB (factor de transcrip- ción B), que son necesarias para que pla RNA-polimerasa se una al promotor en las arqueas ( Sección 4.9). Al menos algu- nas proteínas activadoras de arqueas funcionan justo en sen- tido contrario, incorporando la TBP al promotor y facilitando así la transcripción. Control de la asimilación de nitrógeno en Archaea Un buen ejemplo de represor en arqueas es la proteína NrpR del metanógeno Methanococcus maripaludis. Esta proteína reprime los genes implicados en la asimilación del nitrógeno (Figura 7.16), como los que intervienen en la fijación de nitró- geno ( Sección 3.17) o en la síntesis de glutamina ( Sec- ción 3.15). Cuando hay una gran cantidad de nitrógeno orgánico en la célula de M. maripaludis, NrpR reprime los genes de asi- milación de nitrógeno. Sin embargo, si la cantidad de com- puestos de nitrógeno se vuelve limitante, el �-cetoglutarato se acumula en grandes niveles. Esto ocurre porque el �-cetogluta- rato, un intermediario del ciclo del ácido cítrico, es también el aceptor principal de amonio durante la asimilación de nitrógeno. Un aumento de la cantidad de �-cetoglutarato indica a la célula que el amoníaco es limitante y que es necesario activar otras rutas para obtenerlo, como la fijación de nitrógeno o la enzima de alta afinidad de asimilación de nitrógeno glutamina- sintetasa. Un nivel alto de �-ceto glutarato actúa como inductor mediante la unión a la proteína NrpR. En este caso, NrpR pierde 7.6 Control de la transcripción en Archaea Hay dos estrategias alternativas para regular la actividad de la RNA-polimerasa. Una de ellas, de uso predominante en Bac- teria, consiste en utilizar las proteínas de unión al DNA que bloquean la actividad RNA-polimerasa (proteínas represoras) o bien la promueven (proteínas activadoras). La otra estrategia, más frecuente en los eucariotas, consiste en coordinar nume- rosas proteínas de unión a DNA, conocidas como factores de transcripción, para que interaccionen con la RNA-polimerasa. Quizá resulte sorprendente que, a pesar de que los mecanis- mos de transcripción en las arqueas y en los eucariotas Eukarya (Capítulo 4) son más parecidos, la regulación de la transcrip- ción en las arqueas se parezca más a la de las bacterias. Se han caracterizado pocas proteínas activadoras o represo- ras de Archaea en detalle, pero parece claro que en ese domi- nio existen ambos tipos de proteínas reguladoras. Las proteínas represoras arqueanas funcionan bloqueando la unión de la RNA- polimerasa lacZ lacY lacAlacl LacZ LacY LacA C P ODNA Proteína CRP cAMP Catabolismo de lactosa lacZ lacY lacAmRNA Genes estructurales lac Transcripción mRNA Traducción lacl LacI Represor inactivo Inductor Represor activo El represor activo se une al operador y bloquea la transcripción La unión de CRP capta la RNA-polimerasa Transcripción Traducción Figura 7.15 Regulación global del operón lac. El operón lac está formado por lacZ, que codifica la enzima �-galactosidasa, lacY, que codifica la lactosa-permeasa, y lacA que codifica la lactosa-acetilasa. La proteína represora LacI, que está codificada por un gen separado, lacI, se une al operador (O) excepto cuando el inductor está presente. CRP se une al sitio C cuando está activado por AMP cíclico y capta RNA-polimerasa para unirse al promotor (P). Para que el operón lac sea transcrito por la RNA-polimerasa, el represor LacI debe estar ausente (que es lo mismo que el inductor esté presente) y los niveles de AMP cíclico deben ser altos (debido a la ausencia de glucosa), por tanto permitiendo la unión de CRP. α-cetoglutarato ( ) Glutamato NH3 NrpR DNA RNA polimerasa TFB TBP NrpR Bloquea la unión de TFB y TBP; no hay transcripción. NrpR se une al α-cetoglutarato. Transcripción activa. Cuando se libera NrpR, TBP y TFB pueden unirse. BRE TATA INIT Figura 7.16 Represión de los genes del metabolismo del nitrógeno en Archaea. La proteína NrpR de Methanococcus maripaludis actúa como represor. Bloquea la unión de las proteínas TFB y TBP, necesarias para el reconocimiento del promotor, al sitio BRE y a la caja TATA, respectivamente. Si hay escasez de amoníaco, el �-cetoglutarato no se transforma en glutamato. Así, el �-cetoglutarato se acumula y se une a NrpR, de forma que lo libera del DNA. Ahora pueden unirse las proteínas TBP y TFB, lo que, a su vez, permite la unión de la RNA polimerasa y la transcripción del operón. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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