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I N G E N I E R Í A G E N É T I C A Y B I O T E C N O L O G Í A 355 U N ID A D 2 construido carece de intrones, y por tanto, su mRNA no nece- sita ser procesado. Además, se pueden construir fácilmente promotores y otras secuencias reguladoras dentro del material genético de las secuencias codificantes, y la preferencia codónica ( Secciones 4.11 y 6.3) está garantizada. Mediante estas téc- nicas, se han expresado muchas proteínas humanas y víricas con un alto rendimiento bajo el control de sistemas reguladores bacterianos. Entre dichas proteínas figuran la insulina, la soma- tostatina, proteínas de la cápsida vírica y el interferón. Plegado y estabilidad de las proteínas En ocasiones, la síntesis de una proteína en un nuevo hospe- dador va acompañada de problemas adicionales. Por ejemplo, algunas proteínas son susceptibles de degradación por parte de proteasas intracelulares, por lo que pueden destruirse antes de ser aisladas. Además, algunas proteínas eucarióticas son tóxi- cas para los hospedadores procariotas, de manera que la célula hospedadora del vector de clonación puede morir antes de sin- tetizar una cantidad suficiente del producto deseado. Estos pro- blemas se pueden solucionar modificando el hospedador o el vector. En ocasiones, cuando las proteínas foráneas se producen en gran exceso, forman cuerpos de inclusión dentro del hospeda- dor. Los cuerpos de inclusión consisten en una proteína insolu- ble agregada que con frecuencia se pliega de forma incorrecta o está parcialmente desnaturalizada, y suelen ser tóxicos para la célula hospedadora. Aunque los cuerpos de inclusión son rela- tivamente fáciles de purificar debido a su tamaño, la proteína que contienen suele ser muy dif ícil de disolver y puede estar inactiva. Una posible solución para este problema consiste en Obtención del gen a través de la proteína El conocimiento de la secuencia de un mRNA permite la pro- ducción de cDNA para fines de clonación. En algunos casos, sin embargo, solo se conoce la secuencia de aminoácidos de la pro- teína de interés. La secuencia de aminoácidos se puede emplear para diseñar y sintetizar una sonda de oligonucleótidos que la codifique, como muestra la Figura 11.24. Lamentablemente, la degeneración del código genético supone una complicación para esta técnica. La mayoría de los aminoácidos están codifi- cados por más de un codón ( Tabla 4.5), y el uso de los codo- nes varía de un organismo a otro. Por tanto, la mejor región de un gen para crear una sonda es la que codifica una parte de la proteína donde abunden los aminoácidos especificados por un solo codón (por ejemplo, metionina, AUG; triptófano, UGG) o, como máximo, dos codones (por ejemplo, fenilalanina, UUU, UUC; tirosina, UAU, UAC; histidina, CAU, CAC). Esta estrate- gia aumenta las posibilidades de que la sonda sea prácticamente complementaria del mRNA o el gen de interés. Si no se conoce la secuencia completa de aminoácidos de la proteína, la infor- mación de una secuencia parcial puede ser suficiente. En el caso de algunas proteínas muy pequeñas puede ser fac- tible sintetizar el gen completo (Sección 11.5). Muchas proteí- nas de mamíferos (tales como las valiosas hormonas peptídicas) se producen a partir de la escisión de precursores mayores por la proteasa. Así pues, para producir una hormona peptídica pequeña como la insulina, puede ser más eficaz construir un gen artificial que codifique solo la hormona final y no la pro- teína completa de la que procede de forma natural. La sínte- sis química también permite sintetizar genes modificados que pueden crear nuevas proteínas de utilidad. El método sinté- tico fue usado inicialmente sobretodo para la producción de insulina humana en bacterias. Cabe mencionar que un gen Figura 11.23 DNA complementario (cDNA). Pasos de la síntesis de un cDNA sin intrones que se corresponde con un gen eucariótico mediante una PCR con transcriptasa inversa (RT-PCR). 1 2 35′ 3′ 1 2 33′ 5′ 1 2 35′ 3′ Exón Promotor Codón de inicio 5′ cap Codón de inicio Codón de inicio Codón de parada Codón de parada Codón de parada Sitio poli(A) Transcripción y procesamiento RT-PCR (véase Figura 11.6) A A A A T T T T Gen eucariótico 1 2 35′ 3′ 1 2 33′ 5′cDNA mRNA maduro A A A A GluLysGlu HisTyr COOH Proteína Met TrpH2N 3′ 3′ 3′ 3′ 3′ 3′ 5′ AACC A T A C A C C T A C A C C T A C A C C T A C A C C 5′ 5′ 5′ 5′ T A C A C C A T A A T A A T A A T G A T G G T A G T A G T A G T G G T A T T C T T C T T C T T C T T C C T C C T C C T C C T C C T C 5′ y así sucesivamente C T C C T C C T C C T T C T C A U G U G G U A U G A G C A U A A G G A G Posibles codones de mRNA Oligonucleótidos de DNA (sondas posibles) Secuencia de DNA preferente (basadas en la preferencia codónica del organismo) Figura 11.24 Deducción de la mejor secuencia de una sonda de oligonucleótidos a partir de la secuencia de aminoácidos de la proteína. Dado que muchos aminoácidos están codificados por varios codones, son posibles muchas sondas de ácido nucleico para una secuencia determinada de polipéptidos. Si se conoce el uso de codones que tiene el organismo deseado, se puede seleccionar una secuencia preferida. No es imprescindible conseguir una precisión exacta, puesto que una pequeña proporción de apareamientos erróneos es tolerable, especialmente en el caso de sondas largas. https://booksmedicos.org booksmedicos.org Botón1:
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