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Biologia de los microorganismos (635)

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400 D I V E R S I D A D M I C R O B I A N A
hicieron en los últimos 600 millones de años. El árbol 
universal de la vida muestra que los dominios Bacteria y 
Archaea se escindieron el uno del otro hace eones, y que 
Eukarya se escindió de Archaea más tarde en la historia de 
la vida.
Las secuencias moleculares acumulan mutaciones 
al azar a lo largo del tiempo, y se utiliza el análisis 
filogenético molecular para determinar la historia evolutiva 
de la vida. Un árbol filogenético es un diagrama en el que se 
representa la historia evolutiva de un grupo de genes o de 
organismos.
La evolución se define como un cambio en las 
frecuencias alélicas a lo largo del tiempo. Los alelos 
nuevos se forman mediante los procesos de mutación y 
recombinación. Las mutaciones se producen al azar, y la 
mayoría de ellas son neutras o deletéreas, pero algunas 
resultan beneficiosas. La selección natural y la deriva 
genética son dos mecanismos que hacen que las frecuencias 
alélicas cambien con el tiempo.
Los genomas microbianos son dinámicos, 
y su tamaño y contenido de genes pueden variar 
considerablemente entre cepas de una misma especie. 
Se define el genoma esencial como el conjunto de todos 
los genes compartidos por una especie, mientras que el 
pangenoma es el genoma esencial más los genes cuya 
presencia varía entre las cepas de una especie.
Actualmente las especies de Bacteria y Archaea 
se definen operativamente a partir de los rasgos genéticos 
y fenotípicos compartidos. La naturaleza dinámica de los 
genomas microbianos y la abundancia de genes adquiridos 
por transferencia horizontal han planteado dudas acerca de 
la naturaleza de las especies microbianas. Se han propuesto 
muchos mecanismos para describir la formación de las 
especies, pero no existe consenso acerca de cuáles son las 
fuerzas ecológicas y evolutivas que mejor pueden explicar 
el origen de las especies microbianas.
La sistemática es el estudio de la diversidad y las 
relaciones de los organismos vivos. La taxonomía polifásica 
se basa en la información fenotípica, genotípica y filogenética. 
Las especies bacterianas se pueden distinguir genotípicamente 
mediante técnicas de hibridación DNA-DNA, huella de 
DNA, MLST o por análisis multigénico o del genoma 
completo. Algunos rasgos fenotípicos útiles en taxonomía 
son la morfología, la motilidad, el metabolismo y la química 
celular, especialmente los análisis de lípidos.
En microbiología, la nomenclatura sigue el 
sistema binomial que se utiliza en toda la biología. Para el 
reconocimiento formal de una nueva especie procariota se 
debe depositar una muestra del organismo en colecciones 
de cultivo y publicar el nombre y la descripción de la nueva 
especie. El Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology y The 
Prokaryotes son las principales recopilaciones taxonómicas 
de bacterias y arqueas.
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GLOSARIO DE TÉRMINOS
Alelo: variante de secuencia de un gen 
determinado.
Alineación de secuencias: inserción de 
huecos en un conjunto de secuencias 
moleculares organizadas en filas de 
modo que las posiciones homólogas 
estén dispuestas en columnas verticales. 
La alineación es necesaria antes 
del análisis filogenético porque las 
deleciones y las mutaciones de inserción 
causan variaciones en la longitud de las 
secuencias moleculares.
Análisis multilocus de secuencia 
(MLST): herramienta taxonómica 
para clasificar organismos a partir de 
las variaciones de secuencia génica en 
varios genes constitutivos.
Aptitud (fitness): capacidad de 
un organismo para sobrevivir y 
reproducirse en comparación con los 
organismos competidores.
Árbol filogenético: esquema que 
representa la historia evolutiva de un 
organismo; está formado por nudos y 
ramas.
Árbol universal de la vida: árbol 
filogenético que muestra las posiciones 
de representantes de todos los dominios 
de la vida celular.
Archaea: procariotas relacionados 
filogenéticamente diferentes de 
Bacteria.
Bacteria: procariotas relacionados 
filogenéticamente diferentes de Archaea.
Deriva genética: proceso que ocasiona un 
cambio en las frecuencias alélicas de una 
población como resultado de cambios al 
azar en el número de descendientes de 
cada individuo a lo largo del tiempo.
Dominio: en sentido taxonómico, el nivel 
más alto de la clasificación biológica.
Especie: en microbiología, colección 
de cepas que comparten las mismas 
propiedades principales y se diferencian 
de otras colecciones de cepas en una 
o más propiedades significativas;
filogenéticamente se definen como un
grupo monofilético exclusivo según su
secuencia de DNA.
Estromatolito: tapete microbiano 
laminado formado normalmente por 
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