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U N ID A D 3 403 C A P Í T U L O 13 Diversidad metabólica de los microorganismos microbiología actual Descifrando el metabolismo microbiano Una vez que se consigue tener una bacteria en un cultivo de labo- ratorio, lo más inmediato suele ser determinar su modo de vida; es decir, sus capacidades metabólicas. Pero, ¿qué pasa con los orga- nismos que todavía no se han podido cultivar?, ¿podemos llegar a entender también cómo funcionan? Sí, podemos; pero más que su metabolismo, hay que estudiar sus genes. Para estudiar los procesos metabólicos microbianos en un acuí- fero anóxico cerca del río Colorado (foto de la derecha), unos ecólo- gos microbianos aislaron el DNA total de la comunidad microbiana del acuífero directamente en el sitio (foto de la izquierda) y, a partir del DNA, reconstruyeron y secuenciaron unos cincuenta genomas.1 Mediante los análisis de las secuencias los investigadores desentra- ñaron los diferentes tipos de metabolismo de la comunidad micro- biana del acuífero y examinaron otros aspectos importantes de la biología de dicha comunidad. Para su sorpresa, encontraron que la principal estrategia catabólica utilizada no era la respiración anae- robia, sino la fermentación y el metabolismo del hidrógeno. Ade- más, algunos tipos de metabolismo que se creían exclusivos de las arqueas también se detectaron en las bacterias del acuífero. Muchas de las bacterias sin cultivar del acuífero ya habían sido detectadas en estudios de diversidad en otros ambientes anóxicos. No obstante, como el enfoque del estudio en el acuífero relacionaba la filogenia con el metabolismo, se pusieron de manifiesto las capa- cidades metabólicas de estos organismos sin cultivar. En realidad, examinado los esquemas genéticos de la comunidad microbiana fue posible reconstruir rutas metabólicas enteras. Estos resultados facilitarán seguramente el diseño de los experimentos con cultivos de enriquecimiento para hacer crecer las bacterias del acuífero. Uno de los objetivos de la ecología microbiana es trasladar microorganismos de interés al cultivo de laboratorio. Mientras tanto, se pueden seguir estudiando las propiedades de los orga- nismos sin cultivar mediante la metagenómica. Una vez que se conocen la diversidad y los perfiles metabólicos de una comunidad microbiana, empieza a ser posible predecir cómo funciona el eco- sistema y cómo se puede ver alterado por la contaminación u otro tipo de perturbaciones. 1Wrighton, K. C., et al. 2012. Fermentation, hydrogen, and sulfur metabolism in mul- tiple uncultivated bacterial phyla. Science 337: 1661-1665. I Fototrofia 404 II Quimiolitotrofia 417 III Fermentaciones 426 IV Respiración anaerobia 436 V Metabolismo de los hidrocarburos 450 https://booksmedicos.org Capítulo 13 Diversidad metabólica de los microorganismos booksmedicos.org Botón1:
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