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Módulo común PSU – Contenidos de I y II año medio PRETCH Manuel Mallol Simmonds Coordinador Biología Preuniversitario de Estudiantes Tradicionales de Chile ® 2 0 1 2 P á g i n a | 2 Manuel Mallol Simmonds Prólogo La biología es uno de los componentes de la familia de las ciencias naturales, encargada del estudio de los componentes bióticos y abióticos que son cruciales para el desarrollo de la vida. En este libro se incluyen todos los contenidos exigidos por el MINEDUC (Ministerio de Educación) para los niveles medios I y II, además de contenidos adicionales seleccionados para una mejor comprensión y extrapolación del conocimiento hacia diferentes áreas. Además, cada capítulo posee doce ejercicios desarrollados para ejercitar las cinco habilidades cognitivas que el alumno debe dominar para rendir satisfactoriamente la Prueba de Selección Universitaria (PSU): Reconocimiento, Comprensión, Análisis, Síntesis y Evaluación. Espero que disfrutes leyendo este libro tanto como se disfrutó en su escritura y desarrollo. Manuel Mallol Simmonds Estudiante de medicina Universidad de Santiago de Chile (USACH) Todos los derechos de autor reservados 3 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Bibliografía Este libro ha sido elaborado con el conocimiento adquirido en los años de experiencia docente y universitaria en Medicina. Todas las consultas en diferentes tópicos fueron realizadas desde los siguientes libros utilizados en ramos universitarios - Alberts B, “Biología Molecular de la Célula” IV edición. - Lehninger, “Principios de Bioquímica” V edición - Guyton, “Fisiología médica”, XI edición La PSU de ciencias con electivo biología ▪ Datos específicos La Prueba de Selección Universitaria (PSU) de Ciencias es una de las dos pruebas electivas que el postulante debe rendir en el proceso de admisión oficial a la educación superior (el postulante debe rendir al menos una de las pruebas electivas). Esta PSU difiere de Lenguaje, Matemática e Historia en que abarca tres doctrinas diferentes: Biología, Física y Química. En base a lo anterior existen tres modalidades de la PSU de ciencias, a saber: - PSU de ciencias – Biología - PSU de ciencias – Química - PSU de ciencias – Física La prueba está constituida de 80 preguntas de selección múltiple, distribuidas de la siguiente manera: - 18 preguntas de módulo común física - 18 preguntas de módulo común química - 18 preguntas de módulo común biología - 26 preguntas de módulo electivo En las preguntas del tipo módulo común (MC) se evalúan los contenidos de física, química y biología desde Primero medio a Segundo medio. Las dieciocho preguntas de MC en cada una de las doctrinas evaluadas son obligatorias para cualquier postulante que rinda la PSU de ciencias. Las veintiséis preguntas abarcadas por el módulo electivo (ME) son conocimientos entregados desde Primero medio a Cuarto medio respecto a la doctrina elegida por el postulante (p. ej: Si el postulante eligió dar la PSU de ciencias con biología electivo, las veintiséis preguntas del ME serán de biología entre Primero y Cuarto medio). Los indicadores de las preguntas en la PSU de ciencias se acompañan, además del número de la pregunta, con el indicador MC o ME, aclarando si la pregunta pertenece al módulo electivo o común. Dependiendo de la elección del postulante, el MC y ME de una doctrina se mezclaran, por lo que las preguntas serán entregadas aleatoriamente (p. ej: 1. MC, 2. MC, 3. ME, 4. MC…). Importancia de la PSU de ciencias Si bien la PSU de ciencias no es obligatoria, es un importante determinante de las aptitudes específicas del postulante hacia la educación superior. Rendir esta PSU es la única P á g i n a | 4 Manuel Mallol Simmonds manera de probar la base de conocimientos en un área en particular, en muchos casos relacionada con las preferencias de postulación a carreras. Las carreras científicas tanto en universidades pertenecientes al Concejo de Rectores como en universidades privadas consideran en su ponderación la PSU de ciencias (tomando en cuenta que las primeras consideran más el puntaje de esta prueba que las segundas). Finalmente, la constitución triple de esta prueba otorga al postulante que decida prepararla una base sobre tres doctrinas íntimamente relacionadas con el cuestionamiento del por qué la vida es como la conocemos. Tabla de especificaciones DEMRE (última disponible 2009) Áreas/Ejes Temáticos Cantidad de Ítemes por Módulo Total de Ítemes por Área/Eje Módulo Común Módulo Electivo Organización, estructura y actividad celular. 4 5 9 Procesos y funciones vitales. 6 9 15 Biología humana y salud. 3 4 7 Variabilidad, herencia y evolución. 2 5 7 Organismo y ambiente. 3 3 6 Total 18 26 44 El total de ítemes por cada Área Temática es sólo referencial. 5 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds SECCION I: LA CELULA Capítulo I – El agua y los iones…………………………… 8 El agua……………………………….…………………………… 9 Los iones…………………………………………………….... 11 Capítulo II – Las biomoléculas…………………………… 17 Los carbohidratos……………………………………………… 18 Las proteínas………………………………………………….. 21 Los lípidos………………………………………………….. 25 Los ácidos nucleicos………………………………………… 29 Capítulo III – Las enzimas………………………………… 38 Capítulo IV – Microscopía y generalidades celulares… 48 Historia y teoría celular………………………………………… 49 Microscopía…………………………………………………. 52 Las células procariotas………………………………………… 54 Las células eucariotas…………………………………………. 56 Formas de vida celular………………………………………… 62 Capítulo V – La membrana plasmática………………… 67 Composición y estructura……………………………………… 68 Transportes a través de la membrana…………………………. 70 Diferencias entre membranas plasmáticas…………………… 79 Capítulo VI – Catabolismo celular eucariota…………… 85 Generalidades y estructura mitocondrial……………………….. 86 La glucólisis……………………………….………………… 88 La acetilación de la Coenzima A……………………………….. 88 Ciclo de Krebs……………………………….……………… 89 Fosforilación oxidativa…………………………………………. 90 Capítulo VII – Catabolismo celular procariota y anabolismo 96 Rutas de catabolismo alternativo………………………………. 97 Fermentación………………………………………………….. 98 Anabolismo y estructura cloroplastídea………………………… 99 Fotosintesis dependiente de la luz…………………………… 104 Fotosintesis independiente de la luz…………………………… 105 Capítulo VIII – Ciclo celular…………………………… 111 Diferentes estados del DNA nuclear…………………………… 112 Ciclo celular mitótico………………………………………… 117 Origen del cáncer y control del ciclo celular……………………. 120 Apoptosis……………………………………………………. 121 P á g i n a | 6 Manuel Mallol Simmonds Ciclo celular meiótico………………………………………….. 124 SECCION II: FISIOLOGIA HUMANA 1 Capítulo IX – Nutrición y dietética……………………… 131 Los alimentos y sus nutrientes…………………………………. 133 Las vitaminas………………………………………………….. 138 Tasa Metabólica Basal e Indice de Masa Corporal…………… 139 Enfermedades nutricionales…………………………………… 142 Anexo I – Organización tisular…………………………… 149 Capítulo X – Aparato digestivo…………………………… 156 Generalidades anatómicas…………………………………… 157 La digestión mecánica………………………………………… 164 La digestión enzimática (química) …………………………… 166 Absorción de nutrientes y sustancias………………………… 168 Enfermedades del aparato digestivo……………………………170 Capítulo XI – Sistema cardiovascular………………… 177 La sangre…………………………………………………… 178 El sistema vascular…………………………………………… 183 El sistema cardiaco…………………………………………… 186 Adaptaciones del sistema cardiovascular……………………… 190 El sistema linfático…………………………………………… 192 Enfermedades del sistema cardiovascular…………………… 193 Capítulo XII – Aparato respiratorio…………………… 200 Generalidades anatómicas…………………………………… 201 Dinámica respiratoria en vertebrados superiores……………… 205 Intercambio y transporte de gases: Hematosis……………… 206 Adaptaciones a condiciones de bajo oxígeno………………… 210 La respiración en otros organismos………………………… 211 Enfermedades del aparato respiratorio………………………… 213 Capítulo XIII – La excreción……………………………… 220 Generaldades del aparato nefrourinario……………………… 221 La piel y los pulmones como órganos excretores……………… 224 El aparato digestivo como órgano excretor…………………… 225 Capítulo XIV – Sistema endocrino…………………… 229 Concepto de hormona………………………………………… 230 Hipotálamo e hipófisis………………………………………… 233 La tiroides…………………………………………………… 235 Glándulas suprarrenales……………………………………… 237 7 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds El páncreas endocrino………………………………………… 238 Las gónadas………………………………………………… 240 Otras glándulas endocrinas…………………………………… 242 Fitohormonas………………………………………………… 243 SECCION III: REPRODUCCIÓN Y DESARROLLO Capítulo XV – La reproducción………………………… 247 Reproducción sexual y asexual en organismos simples……… 248 Reproducción sexual en unicelulares, animales y plantas……… 250 Reproducción humana………………………………………… 252 El ciclo menstrual……………………………………………… 257 Enfermedades de transmisión sexual………………………… 261 Capítulo XVI – Gametogénesis y fecundación……… 271 Ovogénesis…………………………………………………… 272 Espermatogénesis…………………………………………… 273 El viaje de los gametos………………………………………… 276 La fecundación………………………………………………… 278 Apéndice: Los métodos anticonceptivos……………………… 281 Capítulo XVII – Desarrollo y crecimiento…………… 290 Desarrollo embrionario………………………………………… 291 Desarrollo fetal……………………………………………… 294 Anexos embrionarios………………………………………… 295 Parto, lactancia y crecimiento neonatal………………………… 299 Infancia y niñez……………………………………………… 301 Pubertad……………………………………………………… 302 SECCION IV: GENETICA Capítulo XVIII – Variabilidad intraespecie…………… 309 ¿Qué es la variabilidad? ……………………………………… 310 Generadores de variabilidad…………………………………… 310 Manifestaciones de variabilidad intraespecie…………………… 312 Frecuencia de alelos en una población………………………… 313 Capítulo XIX – Genética y herencia……………………… 317 Generalidades de la genética………………………………… 318 Herencia mendeliana………………………………………… 318 Herencia intermedia…………………………………………… 324 Codominancia………………………………………………… 325 P á g i n a | 8 Manuel Mallol Simmonds Herencia ligada al sexo……………………………………… 327 Pedigrís……………………………………………………… 327 Apendice: Mutaciones y enfermedades genéticas……………… 331 Las mutaciones……………………………………………… 331 Enfermedades genéticas……………………………………… 333 SECCION V: ECOLOGIA Y MEDIOAMBIENTE Capítulo XX – Ecología…………………………………… 342 Método científico……………………………………………… 343 La biósfera…………………………………………………… 344 Flujos de energía……………………………………………… 344 Ciclos biogeoquímicos………………………………………… 349 La lluvia ácida y el efecto invernadero………………………… 353 9 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds M an u el M al lo l S im m o n d s I M e d io C p . I - E l A g u a y l o s io n e s El agua es una molécula ampliamente estudiada bajo los prismas de diferentes ciencias naturales. En la biología, el agua permite la existencia y desarrollo de la vida tal y como la conocemos, siendo una molécula imprescindible en el estudio de la misma. Por otra parte, los iones son importantes elementos que aportan la dinámica necesaria a muchos procesos fisiológicos que ocurren a cada segundo en la vida de un individuo. Manuel Mallol Simmonds Módulo común y electivo http://www.pretch.cl http://moodle.pretch.cl http://www.pretch.cl/ http://moodle.pretch.cl/ P á g i n a | 10 Manuel Mallol Simmonds Capítulo I – El agua y los iones Para comprender de manera correcta los temas que se presentarán a lo largo del desarrollo del curso de biología, debemos hacer hincapié en las moléculas que componen a todos los seres vivos. Dichas moléculas son conocidas en el mundo biológico como biomoléculas, las cuales son, generalmente, grandes polímeros (molécula compuesta de muchas unidades fundamentales) compuestos en base a aminoácidos, nucleótidos, monosacáridos, etc. El agua y los iones son puntos importantes a tratar en este capítulo. Su organización, procesamiento y distribución en diferentes localizaciones celulares confiere y determina la morfofisiología celular tal y como la conocemos hoy en día. La organización de la materia en los sistemas biológicos tiene características especiales, como la presencia de niveles de organización microcomplejos (biomoléculas) hasta sistemas macrocomplejos (organismos y ecosistemas). 11 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds El agua ▪ Características físicoquímicas El agua es una molécula compuesta en base a hidrogeno y oxigeno, unidos por enlaces covalentes en la proporción 2:1 respectivamente, teniendo como formula química H2O. Posee una geometría angular, teniendo 104,5° entre cada átomo de hidrógeno. La distribución especial de los átomos en esta molécula forma polos eléctricos, siendo negativo el polo del oxígeno y positivo el lado de los hidrógenos. Molécula de agua (δ = Carga) El agua posee un alto calor específico, el que se define como la cantidad de energía (cal) que requiere un gramo de sustancia para elevar su temperatura en un grado celsius (°C). Esto otorga los privilegios necesarios al agua de ser el componente principal de las células (65- 70% de su peso) puesto que no varía mucho su temperatura con pequeños cambios calóricos y tiene un alto punto de ebullición (en contraste con otros solventes como el etanol y soluciones oleosas). Otras características que presenta el agua son: Alta tensión superficial Solvatación (o hidratación) Disolvente biológico por excelencia Medio de reacciones bioquímicas ▪ Aplicaciones biológicas del agua El agua, como se mencionó antes, es el principal componente líquido de las células, y por consiguiente, de los seres vivos. Aproximadamente un 70% del peso neto de un organismo corresponde a agua en estado líquido. Esto es por su estabilidad ante oscilaciones de temperatura y por su extraordinaria capacidad de rodear otras moléculas cargadas (solvatar), permitiéndoles fluir, moverse y reaccionar con otras. P á g i n a | 12 Manuel Mallol Simmonds Es muy improbable encontrar agua en estado puro (agua libre) dentro de sistemas biológicos; casi siempre se encuentra actuando como disolvente ya sea para iones (véase más adelante), sales u otras biomoléculas. También es importante destacar el rol lubricante del agua en superficies corporales como las articulaciones, mucosas, etc. El gran uso del agua por los sistemas vivos se vereflejada en el desarrollo de un organismo (ontogenia). Todos los organismos tienen su desarrollo, desde la fecundación hasta el nacimiento, rodeados de agua (clara de huevo, líquido amniótico, etc). Se sabe que el origen de las primeras moléculas surgió en agua (formación de las primeras micelas; vesículas rodeadas de lípidos con agua en su interior). Esos antecedentes pueden explicar de cierta manera el porcentaje de agua presente en las células, además de sus propiedades ya mencionadas. Curiosidades… Iones Antiguamente se pensaba que el constituyente mínimo de toda la materia correspondía al átomo. Hoy por hoy se sabe que átomos están compuestos por partículas subatómicas (electrones, protones y neutrones) y estos a su vez en partículas más pequeñas (quarks). Los electrones y protones poseen carga eléctrica, respectivamente negativa y positiva. En un átomo en estado normal, como el Carbono (C), la suma de electrones y protones da siempre una carga neta igual a 0 C (Coulombs). Sin embargo, con mucha frecuencia es posible encontrar átomos cuya suma de cargas no siempre resulta 0 C, proporcionando átomos con carga positiva o negativa. Estos átomos cargados son llamados iones (átomos que han perdido o ganado electrones). ¿Sabías que con el agua de todas las personas de un Estadio Nacional lleno (aprox. 60.000 personas) podríamos llenar una piscina olímpica? 13 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Distribución de iones comunes en el líquido intracelular y extracelular. El tamaño del símbolo químico es proporcional a su concentración. Existen iones con carga positiva (cationes) y con carga negativa (aniones). En la célula la suma de determinadas concentraciones de aniones y cationes da como resultado potenciales eléctricos (medidos en mV; milivolt). Nombre Tabla periódica Tipo de ion Rol general Sodio Na Catión (Na + ; ion sodio) Despolarización / Transporte activo secundario / Equilibrio hidrosalino Hidrógeno H Catión (H + ; protón) Gradiente electroquímico / cotransporte Potasio K Catión (K + ; ion potasio) Repolarización / Cotransporte Cloro Cl Anión (Cl - ; cloruro) Cotransporte / Hiperpolarizador Calcio Ca Catión (Ca 2+ ; ion calcio) Contracción muscular / mensajero intracelular / Exocitosis / Huesos y dientes / Hemostasis Magnesio Mg Catión (Mg 2+ ; ion magnesio) Componente de la clorofila. Estabilizador intracelular de biomoléculas como DNA y ATP Fósforo P Anión (PO 4- ; grupo fosfato) Constituyente de ácidos nucleicos / moléculas energéticas / Señalizaciones Bicarbonato // Anión (HCO3 - ; ion bicarbonato) Buffer (aumento del pH) P á g i n a | 14 Manuel Mallol Simmonds Existen también elementos inorgánicos, como sales de calcio y fosforo (entre otras), que tienen una gran importancia en órganos como los huesos. Además, las sales minerales de distintos componentes (NaCl, KCl, etc) al disolverse en agua, liberan iones utilizados por las células (principio de solvatación). Las sales se encuentran de manera natural en las aguas de río, principalmente obtenidas por el contacto y roce con arena, tierra y/o rocas. El exceso de sales minerales en el organismo, esencialmente de calcio y fosfato puede ocasionar la aparición de “piedras” en órganos como los riñones y la vesícula biliar, patologías llamadas respectivamente nefrolitiasis ó cálculos renales y colelitiasis o cálculos vesiculares. Por otra parte, hay que señalar que existen elementos que muchas veces se encuentran unidos a otras moléculas, como los que se señalan a continuación: Nombre Símbolo Rol principal Carbono C Esqueleto de biomoléculas Nitrógeno N Componente de ácidos nucleicos y proteínas. Oxígeno O Componente del agua, grupos COOH y grupos fosfato. Azufre S Componente de aminoácidos sulfurados (puentes disulfuro) Oligoelementos (trazas) Variados Aporte de cofactores, estabilizadores, etc (Zinc, selenio, etc). ¿Qué proporción de elementos existe en el organismo? Del 30% restante de masa corporal (recordar que el 70% es agua), la proporción de elementos es la siguiente: 15 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Ejemplo de ejercicio PSU: MC Un investigador desea estudiar la cantidad de agua libre que existe en el medio intracelular. A su sorpresa, al concluir el estudio no pudo obtener agua pura en ningún compartimento intracelular. ¿A que puede deberse dicho fenómeno? a) La cantidad de células que analizó fue insuficiente, porque existen tipos de células que poseen agua libre. b) Era lo que debía esperarse, puesto que el agua en las células siempre está actuando como disolvente de biomoléculas y elementos. c) Era lo que debía esperarse, puesto que el agua libre solo existe en células procariotas d) Es imposible determinar el por qué de la sorpresa de las conclusiones e) Ninguna de las anteriores La respuesta correcta en este caso es la alternativa b). La alternativa a) no es correcta, debido a que no existen tipos de células que posean agua pura. La alternativa b) dice algo que es correcto y que el investigador no consideró en un comienzo. La alternativa c) no es correcta, debido a que las células procariotas poseen agua actuando como disolvente de iones y biomoléculas, al igual que las células eucariotas. La alternativa d) no es certera, y la información que brinda el encabezado es suficiente para saber donde estuvo el error. Tip PSU Es improbable que haya más de una pregunta sobre agua e iones en la PSU. Lo que si te vas a encontrar es que las demás preguntas dan por sabido todos los conceptos relacionados con el capítulo, por lo que estos dos puntos analizados deben ser estudiados a cabalidad, esencialmente para comprender lo que continuará en los siguientes capítulos. Ejercicios Capítulo I “El agua y los iones” 1. El agua presenta propiedades que la convierten en la molécula esencial de la vida. ¿Cuál de las siguientes NO es característica del agua? a) Su molécula es polar b) Tiene bajo calor especifico c) Sus moléculas pueden formar enlaces de hidrogeno entre sí d) Presenta pH neutro e) Puede flotar en estado solido 2. El agua tiene un alto calor específico. Se define calor especifico como: I. La cantidad de calor que se necesita para subir en 1ºC la temperatura de 1gr o 1cc de sustancia II. La cantidad de calor necesario para subir en 1ºC la temperatura de 1gr o 1cc de agua III. La cantidad de calor que se necesita para subir en 1ºC la temperatura de 1gr o 1ml de sustancia. P á g i n a | 16 Manuel Mallol Simmonds a) Solo I b) Solo II c) Solo III d) Solo I y III e) Solo II y III 3. El proceso para obtener un ion a partir de un átomo consiste en: a) Ganancia o pérdida de electrones b) Ganancia o pérdida de protones c) Ganancia o pérdida de neutrones d) Fusión nuclear entre átomos de baja masa e) Ninguna de las anteriores 4. Son propiedades de relevancia biológica del agua: I. Ser humectante y lubricadora II. Entre 0 y 4 ºC su volumen disminuye y su densidad aumenta III. Posee gran cohesión entre sus átomos IV. Está formada por dos moléculas de hidrogeno y una de oxigeno V. Puede formar puentes de hidrogeno con otras moléculas de agua a) Solo I y III b) Solo I, II y III c) Solo III y IV d) Solo III y V e) Solo I y V 5. ¿Cuál de los siguientes elementos está presente tanto en huesos como en los dientes? a) Fosforo b) Potasio c) Calcio d) Sodio e) Azufre 6. Indique cual de las siguientes afirmaciones es FALSA: I. El potasio es el principal catión del interior de las células II. El nitrógeno es componente de todas las proteínas y ácidos nucleicos III. Calcio: importante en la contracción muscular, conducción de impulsos nerviosos y coagulación de la sangre. IV. El Na + es elprincipal catión del líquido intersticial (tisular) y es importante en el equilibrio hidrosalino del cuerpo. a) Solo I b) Solo II c) Solo III d) Solo IV e) Ninguna de las anteriores 1 2 3 4 5 6 B D A E C E 17 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds El agua es una molécula ampliamente estudiada bajo los prismas de diferentes ciencias naturales. En la biología, el agua permite la existencia y desarrollo de la vida tal y como la conocemos, siendo una molécula imprescindible en el estudio de la misma. Por otra parte, los iones son importantes elementos que aportan la dinámica necesaria a muchos procesos fisiológicos que ocurren a cada segundo en la vida de un individuo C p . I I – L a s b io m o lé cu la s M an u el M al lo l S im m o n d s I M e d io [Escriba una cita del documento o del resumen de un punto interesante. Puede situar el cuadro de texto en cualquier lugar del documento. Utilice la ficha Herramientas de cuadro de texto para cambiar el formato del cuadro de texto de la cita.] Manuel Mallol Simmonds Módulo común y electivo http://www.pretch.cl http://moodle.pretch.cl Los carbohidratos Los lípidos Las proteínas Los ácidos nucleicos http://www.pretch.cl/ http://moodle.pretch.cl/ P á g i n a | 18 Manuel Mallol Simmonds Capítulo II – Las biomoléculas En el capítulo anterior se describieron las propiedades de relevancia biológica del agua y de los iones, dos importantes conceptos esenciales para la comprensión de la biología. En este capítulo nos adentraremos en las propiedades estructurales, dinámicas y funcionales de los lípidos, carbohidratos, ácidos nucleicos y proteínas. Los carbohidratos Los glúcidos o carbohidratos son moléculas poliméricas formadas por uno o varios monosacáridos, unidos a través de un enlace covalente llamado enlace glucosídico. Sus diferentes funciones en la biología oscilan desde aspectos energéticos, estructurales e identificadores hasta codificadores de información. ▪ Los monosacáridos nota Como se mencionó, los constituyentes monoméricos de los carbohidratos corresponden a los monosacáridos. Estos son moléculas compuestas por Carbono, Hidrogeno y Oxigeno en la proporción Cn(H2O)n. Existen dos grandes familias: una conjugadas a un grupo aldehído y otra a un grupo cetona. Dentro de esta división, son clasificados según el número de átomos de carbono que contengan. Para la PSU las que ganan importancia corresponden a: o Triosas: Son poco conocidas. Los únicos componentes de esta familia corresponden al gliceraldehido y la dihidroxicetona. Generalmente se encuentran en forma de metabolitos o intermediarios. o Pentosas: Sus exponentes comúnmente citados son la ribosa y la 2-desoxirribosa, ambas aldopentosas. Forman parte de los nucleótidos del RNA, DNA y energéticos (como el ATP). o Hexosas: Son las más conocidas. En ellas podemos citar a la galactosa, la fructosa y a la glucosa. La glucosa existe en dos estados conformacionales: α-glucosa y β-glucosa. La α -glucosa es el combustible energético de casi todos los seres vivos. Se encuentra en forma polimérica en el almidón y el glucógeno. Forma parte de la sacarosa y de la lactosa. La β -glucosa es constituyente de algunos disacáridos y del polímero estructural celulosa, presente en células eucariontes vegetales. También es combustible energético de isópteros (termitas), gracias a que poseen un protozoo simbionte en su intestino (Trichonympha sp.) capaz Monosacaridos Triosas (3C) Pentosas (5C) Hexosas (6C) 19 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds de producir celulasa, enzima que puede digerir la celulosa. En general los demás seres vivos no poseen dicha enzima, por lo que no pueden utilizar la celulosa como fuente de energía. Comparación entre la α – glucosa y la β-glucosa. La primera posee el grupo OH del carbono 1 bajo el eje, mientras que la segunda lo posee arriba ▪ Los disacáridos nota Los disacáridos son el producto de la unión entre dos monosacáridos, sean iguales o diferentes, a través de un enlace O-glucosídico. La formación de los disacáridos tiene lugar a través de condensación, formando H2O De igual manera que la síntesis de disacáridos, su lisis es llevada a cabo por hidrólisis (añadir agua), proceso realizado por enzimas especificas para dicho disacárido. Los disacáridos de interés para la PSU son: o Lactosa: Disacárido formado por galactosa y glucosa. Presente en la leche. o Sacarosa: Disacárido formado por glucosa y fructosa. Corresponde al azúcar de mesa. o Maltosa: Disacárido formado por glucosa y glucosa. Es el producto de la actividad de la a-amilasa salival, intestinal y pancreática sobre el almidón. Lactosa, un disacárido. Se aprecian sus unidades fundamentales: Galactosa y glucosa ▪ Los polisacáridos nota Los polisacáridos son polímeros de monosacáridos, sean estos homogéneos (iguales) o heterogéneos (mezclas). Son la forma más común de encontrar glúcidos en la naturaleza (madera, algodón, cereales, tubérculos, etc), y generalmente actúan como reservas de energía o como soporte estructural. Los polisacáridos de interés para la PSU son: Figura 8. Tres diferentes disacáridos (Lactosa, Sucralosa P á g i n a | 20 Manuel Mallol Simmonds o Almidón: Polisacárido de α-glucosa. Está formado por cadenas lineales de α-glucosa llamadas amilosas y por cadenas ramificadas de α-glucosa llamadas amilopectinas. Su biosíntesis es llevada a cabo por los organismos productores (plantas), actuando como reserva de α-glucosa. o Glucógeno: Polisacárido ramificado de α-glucosa. Está formado por cadenas lineales de α -glucosa enlazadas unas con otras. Es más compacto que el almidón y es la principal forma de reserva de α-glucosa en las células eucariontes animales. Su depósito principal en los animales es el hígado, y luego el musculo estriado. (Izquierda) Gránulos de almidón en célula vegetal, vistos por microscopía electrónica de transmisión (MET). (Derecha) Gránulos de glucógeno en hepatocito (célula del hígado) a través de MET. Se aprecia la diferencia de tamaño de los gránulos. o Celulosa: Polisacárido estructural formado por cadenas entrecruzadas lineales de β- glucosa. Presente en las células eucariontes vegetales y la pared celular de algunos hongos. o Peptidoglicáno: Polisacárido estructural propio de bacterias formado por unidades repetidas de un disacárido especial, entrelazadas por cadenas cortas de aminoácidos. o Quitina: Polisacárido estructural presente en el exoesqueleto de muchos artrópodos. Está formada por unidades repetidas de N-acetilglicosamina. 21 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Interacción y organización de la celulosa en la pared celular. La interacción entre cadenas de celulosa es del tipo puente de hidrógeno. Las proteínas Conocidas también como polipéptidos o polímeros de aminoácidos, las proteínas son importantes biomoléculas celulares compuestas de Carbono, Hidrógeno, Nitrógeno, Oxígeno y Azufre. Pueden llegar a tener enorme número de roles dentro de la dinámica celular. Comenzaremos el análisis de las proteínas por sus constituyentes monoméricos: los aminoácidos. ▪ Los aminoácidos Los aminoácidos son los las unidades monoméricas de las proteínas. En la naturaleza proteica existen veinte, de los cuales diez (Isoleucina, Leucina, Lisina, Metionina, Fenilalalina, Treonina, Triptófano, Valina, Tirosina* e Histidina) no son sintetizados por el organismo humano (y otros organismos) siendo necesaria su ingesta en la dieta (aminoácidos esenciales) Existen aminoácidos raros que no forman parte de las proteínas, pero son importantes intermediarios.Dos buenos ejemplos corresponden a la citrulina y la ornitina, dos aminoácidos presentes en el ciclo de la urea. Químicamente consisten en un carbono quiral (que posee cuatro sustituyentes diferentes) siendo tres de ellos altamente conservados entre los veinte aminoácidos. Estos sustituyentes corresponden a: Un átomo de hidrógeno (H) Un grupo amino (NH2) Un grupo carboxilo (COOH) Un radical [R] (el que otorga la identidad a cada aminoácido) P á g i n a | 22 Manuel Mallol Simmonds Estructura básica de un aminoácido único en solución acuosa. Los grupos NH2 y COOH se muestran cargados por consecuencia de no estar unido a un polipéptido y estar disuelto en agua. Dentro de los aminoácidos, podemos distinguir diferentes familias: o Cargados (hidrofílicos) o Apolares (hidrofóbicos) La anterior clasificación cobra importancia en el hecho que las diferentes combinaciones de aminoácidos contribuyen a una conformación tridimensional propia (véase más adelante); cada proteína tiene su propia combinación. ▪ Estructuras proteicas Las proteínas tienen la complejidad de poseer varias estructuras conformacionales, en relación al estado de síntesis en el que éstas se encuentran. Es conveniente señalar (aunque se verá en capítulos posteriores) que la síntesis de las proteínas se lleva a cabo en tres diferentes complejos celulares: los ribosomas, el Reticulo Endoplasmático (o ergastoplasma) Rugoso y el Aparato de Golgi. Las proteínas poseen cuatro estructuras, conforme a su grado de maduración (en estricta relación con su función futura): a. Estructura lineal (Primaria) b. Estructura Secundaria Helice alfa Hoja beta (pliegues) c. Estructura globular (terciaria) d. Estructura heterogenia (cuaternaria) 23 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Estructuras proteicas. La estructura lineal es la estructura que se obtiene apenas la cadena de aminoácidos ha sido producida en el ribosoma. En ese periodo la cadena es muy joven y no ha sufrido las modificaciones necesarias para ejercer su efecto definitivo. Las hormonas peptídicas (cuyo número de aminoácidos no supera los diez en general) son una gran excepción a esta regla. Para obtener la estructura lineal es necesario unir varios aminoácidos estrictamente seleccionados. Esta unión entre aminoácidos se conoce como enlace peptídico, y se forma de manera semejante al enlace O-glucosídico: por condensación. La estructura secundaria se obtiene cuando los aminoácidos de la cadena lineal comienzan a interaccionar unos con otros (p. ej. Aminoácidos positivos y negativos tienden a atraerse, y si están muy separados la cadena lineal tenderá a plegarse). La fuerza presente en dicha estructura corresponde a los puentes de hidrogeno. Dependiendo de esta interacción se pueden formar dos estructuras: Una hélice, α-hélice, o una estructura “quiebrada” o plegada, conocida como hoja beta o β-plegada. En un mismo polipéptido pueden coexistir ambas estructuras. La estructura terciaria aparece cuando la proteína ya ha sido modificada en el RER y ya cursa su modificación final en el aparato de Golgi. Los aminoácidos que poseen radicales sulfurados (cisteína) forman enlaces del tipo puentes disulfuros (cisteína-cisteína). La posición de P á g i n a | 24 Manuel Mallol Simmonds dichos aminoácidos está determinada genéticamente para lograr establecer una estructura funcional acorde a la proteína. Una vez que se forman estos puentes, la proteína puede ejercer una función. La estructura cuaternaria no está presente en todas las proteínas. Consiste en la interacción covalente entre dos o más cadenas peptídicas diferentes en estructura terciaria (en general tienden a ser grandes proteínas). El exponente más conocido de esta estructura es la hemoglobina, la cual será estudiada en la guía dedicada al aparato respiratorio. En resumen, las estructuras proteicas poseen las siguientes características: Estructura Característica Enlace responsable Ejemplo Primaria Estructura lineal Enlace peptídico LH, FSH, GH. Secundaria α-Hélice; β- Plegada Puentes de hidrógeno Segmentos en diferentes proteínas. Terciaria Estructura globular potencialmente funcional Puente disulfuro RNA polimerasa II Cuaternaria Interacción entre diferentes péptidos grandes Covalente entre proteínas diferentes Hemoglobina ▪ Función de las proteínas Ya se dijo al comienzo de este tópico que las proteínas poseen muchas funciones, dependiendo de la estructura primaria que se les haya conferido. Dentro de esas funciones las de mayor importancia para la PSU son: o Enzimas o Canales iónicos o Proteínas de adhesión celular o Proteínas de señalización intracelular o Receptores celulares o Pigmentos o Soportes tisulares (colágeno) o Hormonas o Soporte celular (citoesqueleto) o Inmunidad (anticuerpos) o Contracción muscular o Coagulación sanguínea o Transporte de O2/CO2 Las funciones antes mencionadas irán apareciendo en el análisis de diferentes tópicos, en los que se aplicará su función al contexto del sistema/aparato o dinámica respectiva. 25 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Los lípidos Los lípidos son otra de las biomoléculas de importancia para la vida celular. Están formados casi en su totalidad por Carbono e Hidrógeno, con cantidades mínimas de Oxígeno. Son comúnmente llamados grasas, dado su comportamiento aceitoso a nivel macroscópico. A nivel general, sus funciones son: o Aislantes termomecánicos o Reservas de alta energía Al contrario de las demás biomoléculas, los lípidos no forman parte de la familia de los polímeros, sino que sólo son grandes moléculas que pueden ser divididas en cierto número de unidades fundamentales. En la célula es posible encontrarlos de diferentes maneras, con diferentes funciones. Antes de comenzar su análisis, es conveniente hacer hincapié en un grupo de moléculas especiales íntimamente ligadas a ellos: los ácidos grasos. ▪ Los ácidos grasos Es cierto que los lípidos no son polímeros, por lo que decir que los lípidos están formados por muchas unidades de ácidos grasos estaría totalmente errado. Sin embargo, es correcto decir que la mayoría de los lípidos poseen ácidos grasos (hasta un número máximo de 3). Los ácidos grasos son largas cadenas hidrocarbonadas (de 4 a 36 átomos de carbono) unidas a un grupo carboxilo, el cual les confiere un carácter ácido. No poseen carga eléctrica, por lo que son altamente hidrofóbicos (en solución acuosa tienden a formar micelas; nunca forman solución en agua). Según la cantidad de enlaces dobles que posean, se clasifican en ácidos grasos saturados (que no poseen enlaces dobles; los átomos de carbono se encuentran saturados de hidrogeno) y en ácidos grasos insaturados (que poseen, al menos, un enlace doble en la cadena hidrocarbonada). (a) Acido graso saturado, se aprecia su forma recta. (b). Acido graso monoinsaturado, se aprecia su “quiebre”. Los ácidos grasos poliinsaturados (con muchos enlaces dobles) interaccionan mejor con el agua que los ácidos grasos saturados, lo que los cataloga como menos perjudiciales a la salud, debido a su mayor facilidad de metabolización y/o eliminación. P á g i n a | 26 Manuel Mallol Simmonds Existen ácidos grasos que no pueden ser sintetizados por el organismo, los llamados ácidos grasos esenciales (ácido araquidónico, acido linoléico y ácido linolénico, entre otros). Dichos ácidos grasos serán comentados con mayor detalle en el capítulo de nutrición. ▪ Los triglicéridos Una de las formas más comunes de encontrar ácidos grasos es en forma de triacilgliceroles, más conocidos como triglicéridos. Las acumulaciones de triglicéridos en los alimentos son llamadas por la gente común como “grasa”. Los triglicéridos consisten en tres moléculasde ácidos grasos unidos a un alcohol de tres carbonos llamado glicerol. (Arriba) Molécula de glicerol. (Centro) Expresión tridimensional de un triglicérido mixto. (Abajo) Expresión molecular de un triglicérido mixto (el acido graso central es poliinsaturado). Los triglicéridos son almacenados en forma de gota lipídica en unas células especializadas llamadas adipocitos, formadoras del tejido adiposo. Ante estímulos endocrinos (hormona leptina), los triglicéridos pueden ser degradados y liberar sus ácidos grasos (p. ej. En el caso de una hambruna prolongada). 27 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Microfotografía electrónica de transmisión sobre el tejido adiposo unilocular. Se aprecian cuatro fragmentos de cuatro adipocitos. En el de la esquina inferior derecha es posible apreciar el núcleo apretado contra la periferia a causa de la gota lipídica (marcada con un asterisco). 16.000x El tejido adiposo se conoce como reserva de energía debido a que los ácidos grasos pueden ser metabolizados a energía celular, proceso detallado en capítulos ulteriores. ▪ Los fosfolípidos Los fosfolípidos son la familia de lípidos responsable de la estructuración y dinámica de la membrana plasmática de las células. Posee una conformación molecular que le permite tener un extremo con carga eléctrica (hidrofílico) y otro apolar (hidrofóbico), convirtiéndolo en una molécula anfipática. El extremo apolar generalmente está formado por dos ácidos grasos, uno saturado y otro insaturado (generalmente) El extremo polar está formado por un grupo fosfato conjugado a un radical, de ahí las cuatro variedades de fosfolípidos. No las detallaremos, porque no son importantes para la PSU. Ambos extremos están conectados a través de enlaces ester a una molécula de glicerol, muy parecido al caso de un triacilglicerol. * P á g i n a | 28 Manuel Mallol Simmonds Estructura molecular y tridimensional de la fosfatidilcolina, un fosfolípido. Se aprecia la diferencia entre el acido graso saturado e insaturado, común entre los fosfolípidos. Las membranas plasmáticas están formadas por una bicapa lipídica de fosfolípidos principalmente, con proteínas incrustadas en ella. El interior de la bicapa está formado por los extremos hidrofóbicos de los fosfolípidos (los ácidos grasos) y las caras externa e interna por los grupos polares de los mismos. Además de participar en la conformación de la membrana plasmática, muchos fosfolípidos participan en la vía de transmisión intracelular de señales externas. ▪ Los esfingolípidos Otra gran familia de lípidos formadores de membrana plasmática son los esfingolípidos. Estos lípidos poseen un amino-alcohol de cadena larga llamado esfingosina. Su organización molecular consiste en: esfingosina, uno o dos ácidos grasos y un radical variable unidos a una molécula de glicerol. Exponentes de esta familia son la esfingomielina y la ceramida. La función de este tipo de lípidos se ve marcada en las neuronas (células del tejido nervioso), en donde actúan principalmente como receptoras de señales extracelulares, activando la cascada de eventos que comunica la señal con el interior de la célula. ▪ Los esteroles La familia de los esteroles difiere molecularmente de las otras familias de lípidos debido a que no posee ni glicerol ni ácidos grasos en su estructura. En su lugar posee una estructura de cuatro anillos hidrocarbonados fusionados, a partir del cual se derivan todas las moléculas pertenecientes a esta familia, entre las que se destacan las hormonas lipídicas (que conservan la estructura de cuatro anillos), vitaminas y pigmentos (que son estructuras derivadas del núcleo con cuatro anillos). Estructura tridimensional y molecular de un esterol muy conocido: el colesterol. Se aprecia el extremo polar que esta molécula posee gracias a un OH en el anillo A. El colesterol es un esterol conjugado con cadenas hidrocarbonadas que le confirieren un comportamiento anfipático. Esta molécula es muy importante en el mantenimiento de la fluidez de 29 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds la membrana plasmática de las células eucarionte y de algunas bacterias, dado que interviene en las fuerzas de Van der Walls de los ácidos grasos de los fosfolípidos, dejando la membrana en un estado de “gel” (se analizará más adelante) Usualmente se le atribuye a efectos dañinos. Hay que destacar que el comúnmente denominado “colesterol malo” corresponde a las lipoproteínas y apolipoproteinas de baja densidad (apoLDL, LDL y VLDL), las cuales son vesículas con pocas proteínas y mucho colesterol en su interior, cuyo rol consiste en su transporte por la sangre. Estas vesículas se pueden acumular en los vasos sanguíneos, especialmente arterias, formando una placa de lípidos (placa aterosclerótica o ateroma), disminuyendo la luz del vaso. Con el pasar del tiempo ese vaso puede llegar a ocluirse. Esta patología se conoce como aterosclerosis. Cortes transversales en arteria con aterosclerosis. La imagen de la esquina superior izquierda muestra una arteria normal. La imagen de la esquina superior derecha muestra ya formación de una placa aterómica. En la esquina inferior izquierda se observa la notoria disminución de la luz vascular y en la esquina inferior derecha se observa como un coagulo sanguíneo quedó atrapado debido a la disminución del diámetro de la luz. El “colesterol bueno”, atribuido a las lipoproteínas y apolipoproteinas de alta densidad (apoHDL, HDL y VHDL) son vesículas que tienen una mayor carga proteica que de colesterol, por lo que no tienen un riesgo tan alto de producir aterosclerosis como las LDL, las apoLDL y VLDL. Los ácidos nucleícos Finalmente, concluiremos este tópico con una familia infaltable de biomoléculas celulares. Los ácidos nucleícos son biomoléculas poliméricas formadas por Carbono, Hidrógeno, Nitrógeno, Oxigeno y Fósforo, organizadas en unidades monoméricas llamadas nucleótidos. Los exponentes más conocidos de esta familia de biomoléculas consisten en el DNA (ácido desoxirribonucleico; desoxirribonucleic acid) y el RNA (ácido ribonucleico; ribonucleic acid). El rol que poseen los ácidos nucleícos en la célula está íntimamente relacionado con la información genética. La dinámica de funcionamiento del DNA y del RNA se analizará en mayor profundidad en guías del módulo electivo. Por ahora, comenzaremos este punto describiendo como se organizan las unidades fundamentales de los ácidos nucleícos: los nucleótidos. P á g i n a | 30 Manuel Mallol Simmonds ▪ Los nucleótidos Los nucleótidos son los componentes monoméricos de los ácidos nucleícos. Están compuestos de tres componentes estructuralmente diferentes: - Un grupo fosfato (véase en el capítulo 1) - Una pentosa (ribosa o desoxirribosa) - Una base nitrogenada (Adenina, Timina, Guanina, Uracilo o Citosina). El grupo fosfato se encuentra en todos los nucleótidos, ya sea como monofosfato (un grupo P), difosfato (dos grupos P) o trifosfato (tres grupos P). Cabe señalar que los componentes del DNA y RNA solo son nucleótidos monofosfatados. Los nucleótidos difosfatados y trifosfatados (como el ADP y el ATP) poseen otras funciones en la célula, que serán comentadas en guías posteriores. Estructura básica de un nucleótido. En el rectángulo superior derecho se expresa el lugar que ocupa la base nitrogenada (purina [Adenina o Guanina] o pirimidina [Citosina, Timina o Uracilo]), bajo él se destaca la pentosa (en este caso una ribosa) y a su izquierda el grupo fosfato unido al C5. Las bases nitrogenadas son moléculas pequeñas provenientes de dos familias: las purinas (cuyos constituyentes son la Adenina y Guanina) que se caracterizan por la presencia de un anillo doble, y las pirimidinas (cuyos constituyentes son la Citosina, Uracilo y Timina) que se caracterizanpor la presencia de un anillo único. 31 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Estructura química de las purinas y pirimidinas Las pentosas que forman nucleótidos (que fueron mencionadas en el punto referente a carbohidratos) corresponden a la ribosa y la desoxirribosa. La única diferencia entre ambas, es que la desoxirribosa no posee un oxigeno en el carbono 2, que si posee la ribosa. (izq) Desoxirribosa. (der) Ribosa. Destáquese la presencia de oxígeno en la ribosa y su ausencia en la desoxirribosa (marcado con un cuadrado rojo). ▪ Acido Desoxirribonucleico, DNA o ADN Esta biomolécula se analizará con mayor detalle y precisión en el módulo electivo El ácido desoxirribonucleico (ADN, DNA) es una biomolécula formada por los nucleótidos dAMP (Adenina), dTMP (Timina), dCMP (Citosina) y dGMP (Guanina), ordenados en forma de hélice dextrógira (sentido de giro a la derecha) de una larga longitud. La “d” antes de cada sigla de nucleótido representa la presencia de la pentosa desoxirribosa, característica especial y única del DNA. Posee dos tipos de enlaces que mantienen la hélice estable. En sentido horizontal (base nitrogenada con base nitrogenada) participan los enlaces de hidrógeno. En sentido vertical (grupo fosfato con grupo fosfato) participan los enlaces 5’-3’-fosfodiester. P á g i n a | 32 Manuel Mallol Simmonds El DNA, el sentido dextrógiro de su enrollamiento. En amarillo se representan las bases nitrogenadas y en azul los grupos fosfato junto con las desoxirribosas. Los nucleótidos que componen el DNA se ordenan de tal manera que siempre la Adenina forma enlaces de hidrógeno con la Timina y la Guanina con la Citosina Únicamente es posible encontrar DNA en: - Núcleo eucarionte - Nucleoide procarionte - Plásmidos procariontes - Mitocondrias y cloroplastos 33 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds - Virus DNA - Kinetoplastos (estructuras protozoarias) Curiosidades… El DNA es un largo pergamino que contiene todas las instrucciones para confeccionar las proteínas en los ribosomas, y así poder desarrollar un individuo completo y su dinámica bioquímica, biológica y ontogénica. Si pudiésemos estirarlo y medirlo, su longitud sería de dos metros aproximadamente (en células eucarionte). Las letras que componen las palabras dentro de este “mensaje genético” son los nucleótidos antes mencionados, que en un orden específico forman diferentes palabras conocidas como genes. El DNA presente en cloroplastos y mitocondrias, así como en bacterias es mucho más corto que el de las células eucariontes, estando organizado en un solo cromosoma (se verá en profundidad en guías ulteriores) circular (a diferencia de los eucariontes, que es lineal). ▪ Acido Ribonucleico El ácido ribonucleico (ARN, RNA) es una biomolécula formada por los nucleótidos AMP (Adenina), UMP (Uracilo), CMP (Citosina) y GMP (Guanina), ordenados en diferentes estructuras, todas lineales de larga o corta longitud. Son cadenas similares al DNA (poseen enlaces 5’-3’ fosfodiester y pueden formar enlaces de hidrógeno) pero no son dobles cadenas en hélice, sino que son monocatenarios (una sola cadena). Los nucleótidos constituyentes del RNA poseen todos las mismas bases nitrogenadas del DNA con excepción del Uracilo, y a diferencia del DNA poseen ribosa en su estructura. ¿Sabías que la longitud total del ADN que posee un ser humano es equivalente a realizar siete mil viajes ida- vuelta a la Luna? P á g i n a | 34 Manuel Mallol Simmonds (Izquierda) Diagrama de la estructura de un mRNA (RNA mensajero). (Derecha) Diagrama molecular del esquema adyacente. Se mencionó que el DNA en las células tiene un rol central en el almacenamiento de información genética, fundamental para el correcto funcionamiento de la célula. En base a eso la naturaleza creó un acido nucleico que pudiese copiar la información genética (o parte de ella), salir del núcleo y de esa manera expresarse. Si algo le pasase a esa molécula, simplemente se sintetizaría otra, dado que solo es una copia de la original. Si algo le pasase al DNA (daño irreparable) la célula debe morir. Así podemos distinguir, de manera general tres tipos de RNAs, que serán profundizados en el módulo electivo de biología: o RNA mensajero o RNA ribosomal o RNA de transferencia En resumen, el RNA es una copia de una de las cadenas del DNA, generada por un proceso llamado transcripción. Ejemplo de ejercicio PSU: MC De las siguientes, ¿Cuál(es) es(son) función(es) propia(s) de las proteínas? I. Formar parte del exoesqueleto de artrópodos. II. Almacenar información genética III. Ser catalizadoras positivas en reacciones bioquímicas. IV. Constituir la matriz de soporte de las células (citoesqueleto). a) Solo I 35 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds b) Solo II c) Solo I y II d) Solo II y III e) Solo III y IV La respuesta correcta en este caso es la alternativa e). La alternativa a) no es correcta porque el exoesqueleto de artrópodos está constituido por quitina, un polisacárido. La alternativa b) tampoco es correcta porque es el DNA, un ácido nucleico, es el encargado de almacenar información genética. La alternativa c) no es correcta porque considera los enunciados I y II. La alternativa d) no es correcta porque, si bien los catalizadores positivos en reacciones químicas son, por excelencia, las enzimas, que sí son proteínas, considera el enunciado II, que no es correcto. Finalmente la alternativa e) es correcta, porque el citoesqueleto está formado por proteínas, al igual que las enzimas. Tip PSU Generalmente aparecen preguntas relacionadas con esta guía, pero se basan en el dominio de los conceptos básicos. Te reiteramos que se esfuerces por dominar las bases de cada biomolécula, y posteriormente avances hacia los detalles. Ejercicios Capítulo II “Las Biomoléculas” 1. La formula general para un monosacárido es Cn(H2O)n. Entonces la formula general para un disacárido debe ser: a) C12H24O12 b) C12H22O11 c) Cn(H2O)n-1 d) Cn(H2O)n + Cn(H2O)n e) C12H22O12 2. Una molécula está compuesta por una cadena de carbonos e hidrógenos, y presenta enlaces simpes y dobles entre los C. Presenta además un grupo carboxilo. Esta molécula corresponde a: a) Base nitrogenada b) Acido débil c) Carbohidrato d) Acido graso e) Triglicérido 3. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es falsa? a) El RNAt y RNAm tienen el mismo tipo de bases pirimídicas b) El uracilo puede ser un componente del genoma viral c) El DNA presenta doble hélice en eucariontes y procariontes d) El enlace entre G y C es más fuerte que el enlace entre A y T P á g i n a | 36 Manuel Mallol Simmonds e) La adenina del DNA es distinta a la adenina del RNAm 4. La sacarosa es el azúcar que endulza normalmente el té. Es un disacárido, es decir, un carbohidrato formado por la unión de 2 monosacáridos. ¿Cuáles son los monosacáridos que forman la sacarosa? a) Glucosa y lactosa b) Galactosa y manosa c) Glucosa y fructosa d) Glucosa y glucosa e) Manosa y fructosa 5. Los carbohidratos, en sus diferentes formas, son utilizados como fuente de obtención de energía o bien tienen un rol estructural. Indique cual(es) de los siguientes carbohidratos es(son) sintetizado(s) para que cumpla(n) un rol estructural: I. α-Glucosa II. Almidón III. Celulosa IV. Quitina a) Solo I y II b) Solo II y III c) Solo III y IV d) Solo III e) Todas las anteriores 6. El DNA es la molécula que porta la información genética en todos los seres vivos. De los siguientes compuestos, ¿Cuáles forman parte de su estructura? a) Fosfato y ribosa b) Timina y guanina c) Desoxiribosa y ribosa d) Adenina y uracilo e) Citosina y trifosfato 7. De las siguientes moléculas sonexclusivamente LIPIDOS: I. Triglicéridos II. Aminoácidos III. Mielina IV. Carotenoides V. Lipoproteinas a) Solo I, III, IV y V b) Solo I, II y III c) Solo III, IV y V d) Solo I, III y IV e) I, II, III, IV y V 8. El enlace covalente que une dos aminoácidos se denomina: a) Glucosídico b) Enlace de hidrógeno 37 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds c) Covalente coordinado d) Peptídico e) Iónico 9. Las proteínas son esenciales en la química de la vida ya que cumplen numerosas funciones, entre las cuales se encuentran: a) Funciones reguladoras b) Función de defensa c) Reconocimientos de señales químicas d) Codifica la información genética e) Todas las anteriores 10. Un investigador desea aislar fehacientemente el receptor del neurotransmisor 5-HT en las neuronas del núcleo trigémino vascular, para determinar el rol de este NT en la generación de migraña. Para ello posee tres enzimas A, B y C, respectivamente capaces de aislar Carbohidratos, Proteínas y Lípidos esteroidales. Antes de comenzar el experimento, le pide su concejo, ¿Qué enzima debería utilizar para lograr su objetivo? a) A, dado que los receptores de membrana generalmente son polisacáridos modificados b) A, para extraer el glicocálix de la neurona. c) B, dado que los receptores de membrana son proteínas integrales multi-paso. d) B, dado que es necesario degradar las proteínas de membrana para disolverla y aislar el receptor, que es lipídico. e) C, dado que el receptor de 5-HT es el único receptor de origen esteroidal presente en las membranas plasmáticas. 1 2 3 4 5 6 C D E C C B 7 8 9 10 D D E C P á g i n a | 38 Manuel Mallol Simmonds I Medio De haber algo característico en el mundo biológico son las reacciones químicas, que permiten llevar a cabo la transformación de diferentes moléculas, lo cual consiste en la dinámica de la vida. Todas las reacciones celulares son posible gracias a la presencia de ayudantes moleculares que regulan el transcurso de una reacción química: Las enzimas. C p . I I – L a s b io m o lé cu la s M an u el M al lo l S im m o n d s I M e d io C p . I II – L a s e n zi m a s M an u el M al lo l S im m o n d s I M e d io Manuel Mallol Simmonds Módulo común y electivo http://www.pretch.cl http://moodle.pretch.cl http://www.pretch.cl/ http://moodle.pretch.cl/ 39 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Capítulo III - Las enzimas En el capítulo anterior se abordaron, entre otros puntos, las proteínas. Dentro de ese punto no se incorporó un tema fundamental en la comprensión de la dinámica y fisiología celular: Las enzimas. A lo largo de esta guía describiremos qué son las enzimas, cómo y dónde actúan, y los factores que afectan su actividad. Descripción general Las enzimas son catalizadores positivos de las reacciones químicas que ocurren en la célula. Casi en su totalidad son de origen proteico, sin embargo existen moléculas de RNA con actividad similar a las enzimas llamadas ribozimas. Para poder comprender la importancia de la existencia de las enzimas, debemos describir las etapas de una reacción química. ▪ La reacción química Se define como reacción química un evento dinámico en el cual dos o más reactantes se combinan de una manera diferente para formar uno o más productos. En base a lo anterior es fácil hacer el enlace con biología: constantemente la célula está realizando cambios y procesos, sin parar. Las etapas simples de una reacción química son: 1. Contacto entre reactantes 2. Acumulación de energía de activación 3. Formación del complejo activado 4. Liberación de productos ¿Para qué existen las enzimas? Resulta que una reacción química normal, como mezclar hidróxido de sodio con ácido clorhídrico, no requiere una gran energía de activación, que se define como la energía necesaria para que los reactantes reaccionen y formen productos. Debido a eso si propiciamos la reacción (mezclamos los reactantes) espontáneamente reaccionarán. Sin embargo, las reacciones químicas que se llevan a cabo en la célula (p. ej. Glucosa + O2 H2O + CO2 + ATP) requieren una energía de activación tan alta, que esperar a que esta reacción ocurra espontáneamente requeriría millones de años. Las enzimas al ser catalizadores positivos hacen “más” posible una reacción bioquímica, bajando la cantidad de energía de activación que los reactantes necesitan. Además, la célula dispone de una batería enzimática tan grande, que prácticamente toda reacción que ocurre en la célula esta mediada por una enzima. De esa manera, la célula se asegura que todas sus reacciones necesarias puedan ocurrir. P á g i n a | 40 Manuel Mallol Simmonds Comparación de una reacción química con (azul) y sin (rojo) la intervención de enzimas Cada célula en un organismo pluricelular tiene asignada una batería enzimática característica, y es en base a eso que existen células capaces desde alimentarse de bacterias (macrófagos y neutrófilos) hasta capaces de producir impulsos eléctricos (neuronas). Estructura de una enzima La estructura básica de las enzimas corresponde a una estructura protéica terciaria, con una cavidad o superficie especial llamada sitio activo. El sitio activo es el lugar donde los reactantes encajan y pueden reaccionar. Cabe señalar que el sitio activo de una enzima en particular solo sirve para un reactante en especial, llamado sustrato. Así, podemos decir que cada enzima sirve solo con un sustrato. Existen dos teorías para la unión enzima sustrato: - El modelo llave cerradura: El sustrato que calce perfecto con el sitio activo de una enzima será sólo para dicha enzima - El modelo de encaje inducido: El sustrato puede modificar el sitio activo de una enzima, para poder ser de dicha enzima. Se sabe que en general todos los sustratos tienen un nivel de inducción a su enzima en conjunto a su especificidad. Así podemos decir que ambos modelos son válidos. Una enzima también tiene otros sitios aparte del sitio activo, que sirven como “interruptores”. Muchas enzimas necesitan que una molécula las encienda para poder funcionar. 41 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Etapas de una reacción mediada por enzimas Las etapas en una reacción mediada por enzimas son las siguientes: 1. Formación del complejo enzima-sustrato 2. Reacción química 3. Formación del complejo enzima-producto 4. Liberación de los productos En la siguiente imagen se ven representadas dichas etapas anteriores Y como reacción química se puede escribir de la siguiente manera: Factores que afectan la actividad enzimática Este es un punto importante para la PSU y para lograr comprender los contextos en los que las enzimas se desenvuelven. Existen muchos factores, moleculares, biológicos o químicos, que pueden afectar la actividad de una enzima, ya sea disminuyéndola o potenciándola. P á g i n a | 42 Manuel Mallol Simmonds La temperatura La temperatura es uno de los factores físicos que más puede afectar la actividad enzimática. Las enzimas al ser proteínas, vienen establecidas para un rango de temperatura en la que son estables (generalmente bajo 45 °C). Cuando se supera dicho límite, la estructura terciaria de las enzimas se pierde, proceso llamado desnaturalización. Con la pérdida de la estructura terciaria, la actividad enzimática se pierde. Se aprecia el “punto óptimo” para una enzima en particular, a la cual ella funciona en su máximo punto. El pH Bajo el mismo concepto de desnaturalización, el pH puede ejercer efectos parecidos. Las proteínas vienen fabricadas para rangos de pHbastante estrechos. Un claro ejemplo es la enzima gástrica pepsina, cuyo tengo de pH óptimo es entre 1 y 2. Si esa enzima se mezcla con el jugo pancreático, cuyo pH se encuentra entre 7 y 8, su actividad cesa debido a su desnaturalización. Se aprecian tres enzimas con rangos de pH diferentes (Pepsina, Peptidil transferasa y Amilasa pancreática). Se puede apreciar como en el rango de máxima actividad de una, la de otras es mínimo. 43 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Inhibidores enzimáticos Un inhibidor enzimático es una molécula que limita la actividad de la enzima. Existen dos familias de inhibidores: o Reversibles: Son moléculas parecidas al sustrato. Ocupan el sitio activo de la enzima sin permitir la reacción. Si se eleva la concentración del sustrato, éste desplaza al inhibidor. o Irreversibles: Son moléculas que se unen a otra región de la enzima, alterando su conformación tridimensional. La enzima queda limitada sin poder liberarse del inhibidor. Representación de la inhibición reversible. Ayudantes ó estimulantes Son moléculas que algunas enzimas necesitan para poder ejercer su actividad. Se conocen como coenzimas (de origen orgánico; p. ej. Coenzima A) o cofactores (de origen inorgánico; p. ej. Magnesio). Su unión a la enzima potencia la actividad enzimática y/o permite su funcionamiento. También las propiedades que pueden afectar son la presencia de inhibidores artificiales, como medicamentos específicos, la concentración del sustrato y de la enzima, etc. P á g i n a | 44 Manuel Mallol Simmonds Curiosidades… Ejemplo de ejercicio PSU: MC De las enzimas podemos afirmar con certeza: a) Pueden ser de naturaleza proteica o lipídica b) Son catalizadores, por lo tanto alteran el equilibrio de una reacción c) Algunas requieren un componente químico adicional llamado coenzima o cofactor d) Aumentan la velocidad de reacción aumentando la energía de activación e) Su función no requiere condiciones de pH especiales. La respuesta correcta en este caso es la alternativa c). La alternativa a) no es correcta porque actualmente no se conocen enzimas lipídicas. La alternativa b) tampoco es correcta porque los catalizadores afectan la velocidad de reacción, no u equilibrio (que depende de las leyes de conservación de matera). La alternativa c) es correcta porque efectivamente algunas enzimas requieren coenzimas o cofactores. La alternativa d) no es correcta porquesi se aumentase la energía de activación, la reacción tendería a no ocurrir; las enzimas hacen lo contrario. Finalmente la alternativa e) no es correcta, porque las enzimas, al ser proteínas, dependen íntimamente de las condiciones de pH del medio. ¿Sabías que existe una enzima llamada telomerasa que previene el avance brusco del envejecimiento? 45 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Tip PSU Las preguntas que puedan aparecer respecto a las enzimas se enfocan fundamentalmente a los factores que afectan su actividad. Así, pueden aparecer análisis de gráficos de actividad vs. pH, en donde el postulante debe saber qué rol tiene el pH en la actividad enzimática. Ejercicios Capítulo III “Las enzimas” El siguiente gráfico representa la actividad de la enzima E (% de capacidad) y concentración (M) de la sustancia S versus el tiempo, con respecto a este gráfico: 1. ¿Qué podría deducirse entre los 3 y 6 segundos? a) A medida que la sustancia S decrece en concentración, también lo hace la enzima b) A medida que la sustancia S aumenta su concentración, la actividad enzimática disminuye. c) A medida que la enzima disminuye su actividad, la sustancia S aumenta. d) Tanto A como C son válidas con la información proporcionada e) Tanto B y C son válidas con la información proporcionada. 2. Si se agrega el detalle que la sustancia S es un producto inoculado a la célula (no es producida por ella) ¿Qué podría afirmar al respecto? a) Mientras más sustancia S agrego al cultivo celular, menos actividad posee la enzima E b) Mientras más sustancia S agrego al proceso, menos actividad posee la enzima E entre los 3 y 6 segundos. c) Mientras más sustancia S agrego al proceso, más potencia tiene la enzima E de aumentar su actividad en un futuro d) La sustancia S es un inhibidor alostérico e) Ninguna de las anteriores. 3. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es correcta con respecto a lo sucedido entre los 7 y 13 segundos? 0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 Actividad (%) Concentración (M) P á g i n a | 46 Manuel Mallol Simmonds a) La sustancia S es capaz de estimular la transcripción de los genes codificantes de la enzima E, por lo cual mejora su actividad al haber una mayor disponibilidad b) La sustancia S es capaz de quelar elementos citoplasmáticos y transformarse en un cofactor que estimula (luego de un tiempo) a la enzima para que sea más productiva. c) La enzima inactiva en el tiempo anterior es ubiquitinizada (Marca para degradar proteínas) y es reemplazada por una enzima más eficiente para producir producto, la cual no es sensible a la sustancia S d) Al estar disminuida la cantidad de producto de E, la célula estimula la expresión de los genes responsables de la enzima E (feedback), con lo cual aumenta exponencialmente la actividad enzimática (que es censado por la concentración de producto), indiferentemente de la concentración de la sustancia S e) Al agregar temperatura, la sustancia S (un inhibidor termolábil) es inhabilitado, por lo tanto no importa la cantidad que agregue; la enzima E no se verá afectada. 4. Un estudiante de IV medio busca inducir la apoptosis (muerte celular programada) en un cultivo de fibroblastos a través de la ruptura de lisosomas (organelos de pH ácido, con enzimas degradativas en su interior). Al realizar la lisis, se da cuenta que la célula no se autodegrada. ¿Por qué pudo haber fallado? a) Las enzimas de los lisosomas están diseñadas para actuar a pH ácido, y el citoplasma tiene pH neutro. b) Las enzimas de los lisosomas están ancladas a su membrana plasmática, por lo que al romper los organelos, también se degradan las enzimas. c) Los sustratos existentes en el citoplasma no son reconocidos por las enzimas lisosomales. d) La concentración de sustrato citoplasmático supera con creces la concentración de enzimas lisosomales, por lo que no ocurre la degradación e) La tasa de recuperación interna de una célula es tan alta que las enzimas lisosomales no alcanzan a degradar a la célula. 5. ¿Cuál de las siguientes afirmaciones es falsa? a) En muchas reacciones procariotas, sus enzimas son más simples que las eucariotas. Un ejemplo es la transcripción. b) Las enzimas procariotas no utilizan el sistema de sitio activo para sus reacciones. c) Tanto los eucariotas como procariotas poseen complejas maquinarias enzimáticas para la reparación del DNA. d) La fiebre es un potente inhibidor de las enzimas termolábiles de las células procariotas. e) Gran cantidad de antibióticos son inhibidores enzimáticos para células procariotas. 6. La existencia de procesos enzimáticos encadenados (como en la glucólisis) se explica por un fenómeno relacionado con: a) Entalpia b) Energía libre de Gibbs c) Electrofilia d) Termofilia e) Inducción por producto 7. ¿Qué se entiende por zimógeno? a) Una enzima encargada de actuar en rangos de pH para los que no fue diseñada b) Una enzima que tiene capacidad de catalizar múltiples reacciones c) Una enzima inactiva, que requiere un estímulo físico-químico para activarse 47 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds d) Un análogo enzimático sintetizado in vitro, que puede inocularse a la actividad celular e) Ninguna de las anteriores 8. De las siguientes moléculas, ¿Cuál(es) no es(son)enzima(s)? I. Fibrinógeno II. Ureasa III. Trombina IV. DNA polimerasa V. Tripsina VI. Carboxipeptidasa a) Solo I b) I, II y IV c) II y V d) I, III y V e) I y V 9. La pepsina es una enzima que se encuentra en el jugo gástrico y se encarga de la digestión parcial de proteínas. ¿Qué fenómeno podría explicar que no digiera al mismo estómago? a) El estomago secreta factor intrínseco, que es un inhibidor selectivo de la pepsina. b) El estomago deja de producir pepsina cuando las fibras nerviosas detectan que dicha enzima está digiriendo las paredes estomacales c) El estómago tiene una capa de lípidos que recubren las superficies protéicas, protegiéndolo de la degradación enzimática d) El estomago produce mucus, que junto con contener glicoproteínas que protegen del HCl, contiene bicarbonato. e) Ninguna de las anteriores. 10. Una estudiante de IV medio trabaja junto a su compañero en un proyecto científico. Mientras su compañero experimenta con lisosomas, ella decide realizar un Knock Out al gen que codifica la enzima Manosidasa II. ¿Cuál(es) de las siguientes consecuencias esperaría observar? (Knock Out: Silenciar la expresión de un gen) a) Disminución radical de producción de N-Oligosacárido complejo b) Interrupción de la vía de maduración de proteínas en el Aparato de Golgi c) Falla multiorgánica al poco tiempo en el organismo d) Acumulación de oligopéptidos sin función e) Todas las anteriores 1 2 3 4 5 6 E B D A B B 7 8 9 10 C E D E P á g i n a | 48 Manuel Mallol Simmonds C p . I V – M ic ro sc o p ía y g e n e ra li d a d e s ce lu la re s M an u el M al lo l S im m o n d s I M e d io Manuel Mallol Simmonds Módulo común y electivo http://www.pretch.cl http://moodle.pretch.cl “La constatación de que la vida manifiesta un diseño inteligente es tan trascendental como la observación de que la Tierra gira en torno al Sol.” http://www.pretch.cl/ http://moodle.pretch.cl/ 49 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds Capítulo IV – Microscopía y generalidades celulares “La constatación de que la vida manifiesta un diseño inteligente es tan trascendental como la observación de que la Tierra gira en torno al Sol.” Michael J. Behe A partir de este capítulo comenzaremos el análisis de un misterio actual para la biología: El diseño de la vida, la célula. Si se piensa empíricamente el estudio de la biología celular está muy avanzado, resultando en datos bastante complejos y asombrosos. Sin embargo, la duda más trascendental acerca de la célula aún no ha podido ser resuelta: ¿Logró la naturaleza concebir una maquinaria tan compleja, aparentemente perfecta en términos termodinámicos, a través del azar? Definitivamente, la respuesta a esa pregunta debe crearse en la mente de cada uno de los científicos ya formados, y en formación, como ustedes. Historia celular En la actualidad se habla que la célula es la unidad de menor tamaño capaz de considerarse viva. Según los términos de la biología celular, la célula es la unidad encargada de llevar a cabo la reproducción, el funcionamiento y otorgar la forma a cada organismo. La historia de la célula está en relación a los avances tecnológicos que permitían su estudio. De esa manera, podemos destacar brevemente el aporte de los siguientes personajes (si deseas saber más de este tópico, recomendamos el libro Historia de la Célula, de JD Vial): o Hooke (1665), quien observo corcho en una lente con un aumento de 50 veces. Llamo a las estructuras en forma de panal “células”, derivado del latin “cella”, que significa “hueco”. o Anton Van Leeuwenhoek (1670), quien fue la primera persona en lograr ver células eucariontes vivas en su microscopio (construido por él mismo). Observaba protozoos y espermatozoides (pintura de la izquierda). o Schwann (1830), quien postula que la célula es la unidad mínima elemental de un ser vivo (animal o planta) y que es necesaria para su funcionamiento y reproducción. o Brown (1831) y Purkinje (1839), que logran observar respectivamente el núcleo celular y el citoplasma, otorgando las primeras caracterizaciones generales a la célula. P á g i n a | 50 Manuel Mallol Simmonds o Virchow (1850), quien postuló que todas las células provienen de otra célula. o Margulis (1981), quien postula la teoría de la endosimbiosis serial, teoría que explica el origen de los organelos eucariontes. ▪ La teoría celular En el año 1830, Schwann y Schleiden postulan la teoría que unifica los conceptos celulares obtenidos hasta esa fecha, bautizada como la teoría celular. Actualmente se estudia si incorporar la unidad genética de los seres vivos, debido a que son las células las que portan la información necesaria para constituir, tanto morfológica como fisiológicamente, un organismo. La importancia de esta teoría radica en la incorporación al estudio de los fenómenos biológicos en toda su diversidad el prisma celular. Todas las explicaciones del funcionamiento de los aparatos y sistemas de un organismo, así como su crecimiento y desarrollo están relacionadas con las células, de manera que la postulación de esta teoría cambió para siempre el enfoque de la biología. Generalidades de la célula Una célula es un compartimento “aislado” del medio externo que lo rodea, la cual puede compararse con una ciudad altamente dinámica rodeada por una muralla selectiva al paso. Existen organismos vivos que solo constan de una sola célula (organismos unicelulares) como protozoos, algunos hongos y bacterias, y existen organismos más complejos que están formados por muchas células (organismos pluricelulares) que abarcan desde organismos relativamente simples, como artrópodos o nematodos microscópicos, hasta los seres humanos y las plantas. La estructura básica de una célula consiste en tres elementos indispensables: o El núcleo celular: Un compartimento aislado de la célula, en el cual se almacena el material genético del organismo. o La membrana plasmática: Es una fina membrana constituida de lípidos y proteínas, la cual limita la región de una célula. También regula las sustancias que entran y salen de ella. o El citoplasma: Es un medio acuoso comprendido entre el núcleo y la membrana plasmática. En él se encuentran los organelos (compartimentos delimitados por La teoría celular establece que la célula es la unidad fisiológica, morfológica y reproductiva de todos los seres vivos. 51 | P á g i n a Manuel Mallol Simmonds membranas), el citoesqueleto (soporte celular), complejos supramoleculares y sustancias en solución. Continuaremos con la descripción de dichos componentes más adelante, en sus respectivas secciones. Para comprender mejor las diferencias evolutivas de las células, es fundamental destacar los dos grandes grupos de células existentes en la naturaleza: PROCARIOTAS (<pro> antes, <carion> núcleo; antes del núcleo), cuyos únicos constituyentes son las bacterias. Estas células se caracterizan por no tener un núcleo definido ni organelos. EUCARIOTAS (<Eu> verdadero, <carion> núcleo; núcleo verdadero) que componen a todos los organismos que no son bacterias (organismos eucariontes). Poseen un núcleo verdadero y múltiples organelos P á g i n a | 52 Manuel Mallol Simmonds Bases de la microscopía Un microscopio es un instrumento óptico que permite a un científico observar una imagen muy pequeña (invisible al ojo humano) para determinar su morfología y características. Existen diferentes clases de microscopio, las cuales serán descritas a continuación: ▪ Microscopio óptico La microscopía óptica se basa en el uso de combinaciones de lentes y espejos para lograr
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