Parentesco y consanguinidad 2

Vista previa del material en texto

Parentesco y consanguinidad 2. Ejercicios.
Otra denominación de lo que son los abuelos hasta la generación número 10 es “decabos” decabuelos.
Repaso: se calcula el coeficiente de parentesco que es lo fundamental para luego obtener la consanguinidad. La fórmula del coeficiente de parentesco tiene un elemento fijo que es n+n y una parte asociada que el o los ancestros comunes tengan consanguinidad, si el ancestro común no tiene consanguinidad esa parte no va. La sumatoria se refiere a que en un pedigrí o apareamiento tiene más de un ancestro, por ejemplo, Z aporta algo entre A y B (padres), W también aporta y P es otro ancestro común y aporta, a eso se refiere la sumatoria que deben sumarse todos los aportes de los ancestros comunes. Hay otras fórmulas para calcular Fx (dividir entre 2 o multiplicar por 0.5), normalmente se usa Fx= RA-B / 2. En el primer ejemplo se explica la sumatoria, se tienen dos ancestros comunes lo que aporta A y lo que aporta C se suma para llegar al RA-B correcto. En el último hubo un error que se calculó la consanguinidad de C, se puso formula general donde ya se conoce la consanguinidad de C que es 0,125, quiere decir que los padres de C tiene parentesco; el ½1+1 viene de C es el único ancestro común en el pedigrí, pero se llega a la conclusión que es consanguíneo por lo que se tiene que aplicar la otra parte de la formula, entonces si se tiene la consanguinidad de C ¿Cuál es el parentesco entre 1 y 2? 0,25 (medio hermanos).
En la parte de consanguinidad se vio una de las clasificaciones que es cría consanguínea o alta consanguinidad y la otra era cría de líneas cuyo fin es concretar en un individuo un alto número de genes de un ancestro bueno pero que él tenga baja consanguinidad, en el caso del ejemplo, se consigue a través de I (individuo bueno) por lo que se va a calcular el parentesco entre A y B para después saber cuál es la consanguinidad de X y también cuantos genes de I tiene X, en el cálculo se ve que A y B son familia, tienen parentesco porque los enlaza como parientes 2 veces arriba y una vez abajo (en el pedigrí). Los padres siempre llevan 0 abajo por la generación y así sucesivamente hasta el final, la primera parte de la formula viene de 1/2 2+2 y la otra ½3+2 estos son los aportes de I para ellos dos según la generación en la que esté ubicada, entonces se tiene 1/24=1/16=0,0625 y ½5= 1/32= 0,03125, se suma y se tiene le parentesco entre A-B es 9,37% (el cálculo de probabilidad de parentesco siempre se pone en porcentaje, aunque en teoría se calcula en base a 1 luego se convierte a porcentaje para entenderlo mejor), es decir tienen 9,37% de genes comunes que vinieron de I. Ya para la consanguinidad de X se debe dividir RA-B entre 2 (o multiplicarlo por 0,5) y da 0,0493, redondeado da 5% de consanguinidad. No es una consanguinidad alta, él tiene de I 0,3125 de genes comunes ¿de dónde vino esto? Se redondea a 31%, viene del primero ½4, después del que está en rojito 1/23 matemáticamente se suma eso, da 5/16= 0,3125, es decir tiene esos genes comunes es su parentesco.
Ejemplo de cría de líneas: este individuo tiene consanguinidad baja, pero tiene bastantes genes del animal genéticamente superior y en teoría solamente para este concepto de cría de líneas tiene que haber un ancestro común, uno solo. Como se dijo anteriormente es muy difícil encontrar esto en la práctica, donde siempre va a estar I como está aquí. Aquí hay otro ejemplo que es Z, ya se sale de la parte teórica, pero no quiere decir que aquellos no sirvan, porque se están aportando genes de I muy buenos y también genes de Z buenos.
Calcular el R entre X e I (X hembra e I macho) para eso hay que hacer un pedigrí que da origen a W, se completa lo demás que tiene X y de I no se conoce nada, a ver cuánto da el parentesco.
¿Cómo evitar la consanguinidad? Primero identificando todos los animales del rebaño, no puede haber animales repetidos, números sencillos para no confundir, se usa el último digito del año en que nació, en el caso de ganado de carne no solo el año también la TN (cosecha), los colores ayudan. Actualmente existen programas donde esta digitalizada la matriz de parentesco (individuo, padre y madre como las 3 columnas principales, no es necesario poner abuelos, bisabuelos, etc.) puede tener 120mil animales o incluso 250mil, sirven para calcular valor genético y también para calcular consanguinidad, por lo que se puede inventar becerros ficticios que no hayan nacido de 100 vacas apareadas con 5 toros, si a cada una de esas vacas se le ponen 5 toros se tendrían 500 becerros ficticios para ver la consanguinidad y ver cual vaca va mejor con cual toro y cuáles son las mejores opciones a distribuir entre las 100, en ese programa se usa hasta lo último que se tenga en matriz de parentesco. Se le proporciona esa lista de apareamientos al productor o ganadero para que la cumpla. En monta natural hay una parte llamada “servicio natural directo” que indica que la vaca no va a inseminación sino directamente al toro, dura 90 días. Después de salir del programa de IA (Inseminación artificial, dura 45 días) van a toro de “repaso” que dura 45 días, en total 90 días. Se debe evitar a consanguinidad 6% o más, pero es subjetivo, se puede trabajar con un máximo de 3 o 4% y según las posibilidades de la finca de aparear si no hay más toro o semen disponible si da 6.25% es preferible aparear que no utilizar la vaca.
En este ejemplo, número 15 de la guía, ¿es consanguíneo? Sí, porque son parientes ¿Por qué A y B son parientes? Porque C y N lo hace parientes. ¿Qué viene por C y por N? C es consanguíneo 1+F del común y N también es consanguíneo. C= ½1+1…
Ejercicios/ejemplos generales
1. Fx = ? Primos. ¿A y B son parientes? Sí, ¿de dónde viene el parentesco? De H. RA-B tiene un solo componente que es H = ½2+2= ½4= 1/16= 0,0625 es el parentesco. Fx= ½ (RA-B) = ½ (0,0625)= 0,03125, entender esto es lo sencillo y elemental no cambia el procedimiento, en los complejos solo vienen más pasos. 3,125% es una consanguinidad baja, se puede aceptar.
2. Acá se ve la continuación y la explicación en la diapositiva. El ancestro común es H, son un tipo de primos hermanos (con menos parentesco), después viene otro tipo de primos hermanos (no es importante identificar o clasificar, solo importa el cálculo). Entonces se calcula el RA-B y Fx. Los comunes son H e I, se suma y obtenemos el parentesco de A-B, por H viene ½2+2 y por I, lo mismo ½2+2 eso da 0,0625 (cada uno), se suma y da 0,125 el parentesco. La consanguinidad Fx= ½ (0,125)= 0,0625 = 6,25% consanguinidad.
3. Primos hermanos dobles. H, I, J, K son los abuelos, lo hacen parientes como primos hermanos, pero aquí hay 2 hermanos se casaron con 2 hermanas haciéndolos más parientes aun y con más consanguinidad. RA-B se deben sumar varios: H: ½2+2 = ½4= 1/16 = 0,0625; I: ½2+2 = ½4= 1/16 = 0,0625; J: ½2+2 = ½4= 1/16 = 0,0625; K: ½2+2 = ½4= 1/16 = 0,0625, la suma da 0,25 ó 25%. La consanguinidad Fx = 0,125 ó 12,5%, esto significa que los locis en el 12,5% de ellos hay alelos idénticos, no se sabe si son malos o buenos, solo que la homocigosis es alta y no es bueno en ningún individuo.
Hacer selección es fundamental, así se esté haciendo cruzamiento o cría pura y aparte de eso minimizar la consanguinidad. Aunque un solo individuo con consanguinidad de 8% no afecta a todo el rebaño, muchos individuos con alta consanguinidad sí. 
Hacer un pedigrí normal con colores.
Ejercicios de problemario 1 al 16.
1) Tiene un error, H esta como macho y hembra.
2) ¿Qué parientes son A y B? son tío-sobrina, A y E son hermanos. Tarea: calcular el parentesco entre A-B.
3) Tiene un error, los padres de A son distintos.
4) (A,B) = 0, (C, D, A, E) = 2 y (F, G, H, I, C, D, K, M) = 3, el único ancestro común es A, se calcula por A que se está apareando con su hija. RA-B: A= 1/20+1= ½ = 0,50 ó 50%. Fx = 0,25 ó 25% de los genes de los locis son idénticos. Puede ser incluso más alta si A se repite en otra parte del pedigrí.
5) Fz. R11-7. Aquí como no es solo hijo con madre, es un poco más, se debe incluiren la sumatoria: el común es 7, uno solo, pero aporta dos veces no una sola vez a diferencia del ejercicio anterior. Se combina generación con generación: 7 = ½0+1= 0,50 y luego 7= ½0+2 = ½2 = 0,25, la sumatoria de ambos da 0,75. Fz = ½ (0,75)= 0,375 ó 35,7%. Para que esto ocurra en animales es que se tenga semen guardado (aunque en este caso es la madre, pero es poco probable por los años y la edad).
6) ¿Cuáles son los ancestros que generan parentesco entre A y B? es H, no hay otro. H aporta dos veces, en la generación 2 dos veces y una en la generación 3. H = ½2+2= 0,0625 y H = ½2+3= 0,03125, se deben colocar ambos porque es un cálculo probabilístico, se debe “repetir” el de arriba en este caso porque esa vía es la que nos da parentesco, es decir si se eliminara esa vía colocando solo el 3 estaría incorrecto -si no lo entienden lo debatimos, el profesor es medio enredado aquí-, el 2 no se anula al ya haberlo puesto con el 2, sigue activo y debe ponerse con el 3. La suma da 0,09375 ó 9,375%. Fx= 0,046875 ó 4,6875%
7) En este, H está presente en las generaciones 0, 1, 2 y en 3. H = ½2+2= 0,0625; H = ½2+3= 0,03125; H = ½3+2= 0,03125; H = ½3+3= 0,015625, no se pueden hacer parejas de solo 2+2 o 3+3, se tiene que hacer tipo calculo probabilístico. La suma da RA-B = 0,140625. Fx= 0,0703125.
8) Otro error que se puede presentar en el pedigrí: D es hijo de I y viceversa.
9) Este se vio como ejemplo de cría consanguínea.
10) Este es simple y ya se calculó anteriormente.
11) Ya se calculó.
12) Fx=?. En este se debe calcular la consanguinidad del individuo común, porque C es consanguíneo por 3 y se debe utilizar la formula completa. Los padres de C (1 y 2) son parientes porque tienen un ancestro que es el mismo.
Calcular RA-B: Fc=?
Calcular R1-2= ½1+1= 0,25
Fc= 0,25/2 = 0,125 ó 12,5%
Se hace el pedigrí separado para no confundirse desde C, es decir 1 y 2 (padres de C) vienen a ser generación 0 y 3, 4, 5 generación 1, así sucesivamente si hubiera más.
C= ½1+1 * [1 + (Fc)] 
C= ½2 * [1+0,125] 
C = ¼ * (1,125) = 0.28125 ó 28.125%, aquí se ve que iba a dar 0.25, pero como el común es consanguíneo, el parentesco subió 0,125.
Fx= ½ (0,28125) = 0,140625 ó 14,625
13) Este caso aparece T tres veces, además T es consanguíneo, analizarlo primero luego aplicar las formulas, queda como tarea…