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IR • VARIOS GENES DESCARTADOS COMO CAUSANTES DE RETINOSIS PIGMENTARIA AUTOSoMICA RECESIVA EN DOS FAMILIAS COSTARRICENSES Alejandro Leal, Gustavo GutiOrrez-Espeleta, Ramiro Barrantes RESU MEN Se estudiaron dos families costarricenses con Retinosis Pigmentaria (RP) de herencia auto- somica recesiva, con el fin de descartar genes relacionados con la enfermedad. Para esto se efectuo un analisis de ligamiento con marcadores polimorficos por repetitions en tandem (STRPs). En una familia (C1) Ion afectados presentan una degeneracion de aparicien temprana y severe. En Ia otra familia (P1) la aparicion es temprana pero con una degeneracion mss lenta que en C1. Las diferencias fenotfpicas sugieren que se trate de mutaciones diferentes en ambas families. En Cl los siguientes genes quedan descar- tados (Z (0,0) = ) : el de herencia autosomica recesiva (RPAR) de la region 1q31-32.1, R PAR por mutation en la fosfodiesterasa B en 4p16.3, RPAR de 6p a 20 cM del gen de la periferina, el de Ia distrofia macular del cromosoma 6, y del proto- oncogen myc. Por Su parte, el puntaje Lod con el marcador RDS no permite descartar con certeza al gen RDS (Z (0,0) = — 0,0083) y se observan puntajes Lod positives en el caso de los marcadores myc en 8q24.12-q24.13 (Z (0,2) = 0,3050) y periferina/RDS en 6p12 (Z (0,1) = 0,2063), pero no son signilicativos. En P1 se descarta el gen que codifies la rodop- sina, el de la fosfodesterasa S, el de RPAR cercano ale periferina, el de la periferina, RPAD del cromo- soma 7 y el proto-oncogen myc. Por otra parte, se encontraron valores positivos en marcadores cercanos al gen de la rodopsina (RHO, Z (0.1). 0.3991), periferina (ADS, Z (0.2) =0.3390) y Usher 1A del cromosoma 14q (P1, Z (0,09) = 0.7647). En lo sucesivo deberan descartarse por com- plete las regiones correspondientes a genes que participan en la transmisiOn de la serial visual o que forman parte de alguna estructura en is retina. La metodologfa aqui seguida es Citil y factible en Costa Rica pare descartar genes implicados en enfermedades hereditarias humanas, y se puede utilizer pare conocer los origenes de otras pato- logfas, realizar un diagnostic° preciso, ofrecer asesorfa genetica y apoyar el disefio de terapias. (Rev. Cost. de C. Med. 1998-19 (3-4): 194-205) Palabras claves: Genetica humane, Enfermedades hereditarias, Diagnostic° mole- cular, Analisis de ligamiento genetic°, Retinosis Pigmentaria, Marcadores polimOrf ices. ABSTRACT In order to discard some candidate genes for autosomal recessive Retinitis Pigmentosa (RP), two families with this dis- ease were studied. Linkage analysis was done, using polymorphic markers (STRPs). In one family (C1) affected members present an early onset and severe degeneration of the retina. In the other family (P1) the onset is earlier but the degeneration is slower than in Cl. Phenotypic differences indicate that there are different mutations in both families. The following genes are not responsible for the disease in family Cl (Z autosomal recessive RP (arRP) on 1q31 32.1, arRP by mutation in the PDEB gene on I nstituto de Investigaciones en Salud y Escuela de Biologie. Universidad de Costa Rica, San Jose, Costa Rica. E-mail: aleal humgenet.uni-eriangen.de Rev. Cost. de Ciencias Medium Vol, 19 / No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pag. 194 4p16.3, arRP on 6p at 20 cM of peripherin gene, macular dystrophy on chromosome 6 and proto-oncogene myc. On the other hand, the marker ADS' lod score certainly does not allow discard in a the peripherin gene as responsible (Z(0.1)= - 0.0083), and there are positive lod scores for myc on 8q (Z (0.2)= 0.3050) and peripherin/RDS on 6p12 (Z(0.1)= 0,2063), but they are not significant. In the case of P1, results suggest that the following genes could be discarded: rodopsin, PDEB, arRP close to peripherhin, peripherin/RDS, adRP on chromosome 7 and myc. Nevertheless positive values were found near regions of rodopsin (RHO, Z(0.1)= 0.3991), peripherin (RDS, Z(0.2)= 0.3390) and Usher 1A on 14q (P1, Z(0,09)= 0.7647). The next step is to discard the regions with genes implicated in the visual transmis- sion system or in the structure of the retina. This methodology can be used in Costa Rica for discarding genes implicated in other human hereditary diseases, for ascertaining information on the origen of certain patholo- gies, in order to get a precise diagnosis, to offer genetic counseling, and to support the design of therapies. INTRODUCCION La clasificaciOn precise de enferme- dades hereditarias requiere del diagnOstico molecular, esto es, identificar el gen gue causa Ia patologfa, y preferiblemente, determiner Ia mutaciOn especffica involu- crada. De este modo se obtiene informaciOn que pod rfa. favorecer un major pronOstico, un mejor conocimiento del desarrollo de la enfermedad o sIndrome y eventualmente, dar lutes pare Ia formulaciOn o mejorfa del tratamiento. El presente estudio constituye el primer paso en la busqueda de un diag- nostic° molecular de la Retinosis Pigmen- taria (RP) en families costarricenses. La RP es un grupo de enfermedades que se caracterizan por la degeneraciOn progre- siva de la retina, ceguera nocturne, perdida de campo visual y una pigmentation ottal- molOgica particular(1). La prevalencia de la RP oscila entre 1:3700 y 1:7000 segEm las poblaciones estudiadas(2-4): en los Estados Unidos los casos se distribuyen en 31% de RP de herencia autosomica recesiva (APAR), 17% autosornica dominante (RPAD), 10% recesiva ligada al X (RPLX) y 42% a casos aislados(5). El diagnOstico clinic° de la RP es sumamente heterogeneo (6), al igual que la genotica (Cuadro 1). Por ejemplo, en el caso de la RPAR se han en- contrado como responsables de la patologfa mutaciones en el gen de Ia rodopsina, tam- bien implicada en la RPAD, en 3q21-q24(7), yen el gen de la subunidad B de la fosfodies- terasa en 4p16.3(8).Adernas hay loci que se han relacionado por ligamiento con algOn tipo de RPAR, como son el del gen del canal catiOnico dependiente de GMPc en 4p14- cen, asf como el localized° en 14q11, posi- blemente debido a una mutaciOn en el gen NRL(9). Tambien se ha encontrado liga- miento entre un tipo de RPAR y el marcador D6S291 en 6p, distinto al gen de la periferina, implicada en la RPAD(10), asf como con el marcador F13B en 1q31-q32.1(11). No obs- tante, en Ia mayorfa de las families con RP todavfa se desconoce relaciOn con alguna region del genoma (75-80%)(12). Es evidente la gran heterogeneidad de la RP, pero se aprecia mejor la complejidad del estudio de este grupo de patologfas te- niendo en cuenta el hallazgo de una RP provocada por heterogeneidad compuesta. Kajiwara y colaboradores(13) encontraron una familia con un patron de herencia apa- rentemente autosOmico recesivo, en la quo los afectados presentan una mutaciOn en uno de los genes de la periferina/RDS y otra en uno de los genes de la ROM-1 (proteinas que forman un complejo), mientras que los genes correspondientes en los cromosomas hornOlogos eran normales. Por otra parte, van Soest y colaboradores(11) encontraron Rev. Cost. de Ciencias Medicas Vol. 19/ No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Fag. 195 CUADRO I REGIONES CROMOSOMICAS LIGADAS A RP Y GENES IDENTIFICADOS Cromosoma y gen Clasificacion ClinIca Patron de herencia 1q31-q32.1 1q 3q21-q24 (RHO) 3q21-q25 3q 6p 3 4p14-q13 (CNGC) 4p16.3 (PDEB) 5q31.2-q34 (PDEA) 6p (RDS) 6q14-q16,2 (MCDR1) 7q31-35 7p15 8p 11q13 (ROM1) 11q (miosina VITA) liq 11p15.1-p14 14q32 15q22-23 16q21 17p13 19q13.4 Xp11.23 Xp21.1 Mitocondria RP Sindrome de Usher II RP Sfndrome de Usher III RP RP Sindrome Bardet-Biedl RP RP RP Variable Distrofia macular RP. RP RP RP Sindrome de Usher I Sindrome Bardet-Biedl Sindrome de Usher ! Sindrome de Usher I Sindrome Bardet Bled! Sindrome Bardet Biedl RP RP RP RP Sindrome Kearns-Sayre AR AR AD, AR ADAD AR AR AR AR AR AD, AR AD AD AD AD AD AR AR AR AR AR AR AD AD XL XL Materna Basado en Dryja y Li, 1995 (13). una familia con RPAR que, aunque sus miembros tienen ancestros comunes, el origen de la enfermedad se debe aparen- temente a dos genes distintos en Ia misma familia. Los afectados de una parte de la familia tienen el gen ligado a 1q31-32.1, mientras que los afectados de otra parte de Ia familia no. El objetivo de este estudio es descartar algunos loci implicados con algun tipo de RPAR, y otros genes relacionados con otros tipos de RP, como responsables de la enter- medad en estas families. Para esto, se aplica una metodologia sencilla con el fin de descartar el gen o los genes que ya han sido localizados en regiones cromosornicas y Rev. Cost. de Ciencias Medicos Vol. 191 No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pdg. 196 que podrian ser responsables de enferme- dades hereditarias, antes de proceder a un tamizaje genomico completo. MATERIAL Y METODOS CLASIFICACION DE LAS FAMILIAS De las 70 families identificadas par no- sotros con RP en Costa Rica (datos no publicados), dos con RPAR fueron estu- diadas. La familia "Cl" cuenta con 9 afecta- dos vivos y 13 portadores obligatorios vivos (Figura 1), y se analizaron 22 individuos. La familia "P1" tiene 9 afectados y 19 porta- dores obligatorios vivos (Figura 2), y de ella se analizaron 30 miembros. En esta familia, todos los afectados proceden de uniones consangufneas, mientras que en la familia C1, no todos los portadores han sido rela- cionados genealogicamente. Las families C1 y P1 se clasificaron en cuanto a su patr6n de herencia con Ia clave de tiaim(14). Las genealogies se iniciaron por entrevista y se corroboraron y ampliaron pot medio de registros eclesiasticos. Antes de efectuar las entrevistas y analisis se obtuvo el consentimiento informado de los partici-pantes en la investigacion. DIAGNOSTICO CLINICO A los pacientes y controles se les rea- lizaron estudios de agudeza visual, elec- trorretinog rat ia (ERG), angiograf fa y de campo visual en el Instituto de Cirugfa Ocular. El ERG se hizo en ambos ojos bajo sedaciOn con hidrato declare', con un equipo TOMEY PE-400; se hizo un ERG flash con midriasis y adaptado a la oscuridad par 45 minutos, y se midi° Ia amplitud y tiempo im- plicito para las ondas A y B (vision esco- tOpica). Tambien se efectu6 un ERG flash adaptado a la luz por 5 minutos, y luego se hizo con flash intermitente con frecuencia de 2 Hz's y se midieron la amplitud (P100) y la latencia (P100 y P70). La angiograf fa en ambos ojos se realize) con un equip° Top- Con (FD-32 y TRC-50 FT) anadiendo fluo- resceina intravenosa, y el estudio de campo visual se realize) con la presentacion auto- matica de senales en todo el perimetro y con indicacian subjetiva en el momenta en que se observaba Ia serial (Equipo Tomey auto- ma.tico, prueba central 30-2). AISLAMIENTO, CONDICIdNES DE PCR, INICIADORES UTILIZADOS Se aislOADN de sangre periferica por el metodo de fenol-cloroformo (15), se prepa- raron soluciones de ADN en agua a 0.008 ug/uL y se realize) la Reaccion en Cadena de Ia Polimerasa (PCR). Para esto se utilizaron iniciadores para marcadores polimorficos microsateliticos(16), reportados en la litera- ture como ligados a los genes de interes o en regiones cercanas a genes candidatos. Uno de los iniciadores se marco con 32P (gamma-GTP). Luego se realize) Ia PCR con las siguientes concentraciones finales: 1X de buffer de reacciOn (10 mM Tris-HCI, 50 mM KCI), MgCl2 1 mM, cada dNTP a 200 µM, ambos iniciadores a 0.3 jtM, 0.33 L1 de Taq Polimerasa y 28 ng de ADN. El perfil de amplificaciOn fue el siguiente: 94°C (3:00), nueve ciclos de 94°C (0:45), 55°C (1:20) y 72°C (0:45), dieciseis ciclos de 90°C (0.45), 55°C (1:20) y 72°C (0:45), y a 72°C (3:00) pare finalizar. El producto de kas PCR se corri6 en gales de poliacrilamida al 6%, a 55 watts (poder constante), durante 3 a 5 horas. La deteccion del producto de amplificacian se realiz6 par exposiciOn del gel a una pelicula de Rayos X (Agfa Curix, 100 NIF) por 24 horas. ANALISIS DE LIGAMIENTO Los marcadores utilizados, su locali- zaciOn y el gen al que estan ligados se muestran en el Cuadro II. Rev. Cost. de Ciencias Medicas Vol. 19 / No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pag. 197 101 102 106 105 108 107 103 I 104' • iii 24 20 21 33 30 Normal V 32 41 39 110 44 109 I v OIE 28 27 35 36 • 112 42 43 40 117 Awl*, Pedeaw 8 6 I. '6 1P d '8 66 1. a lq w €1 0 0 3 - 0 8 nr 17 -8 '0 N / 81 . ' 10 A P 9 1 1 se lo uG IO o p 1 9 0 0 'A el d Figura 1. Genealogia de la familia Cl, con Retinosis Pigmentaria autosdmica recesiva 21 0 219 VI 01 E-4 3 di 0 29 30 32 23S 16 221 14 220' 1 11 12 13 24 3 Namm AdmW00 El Ell El VII a1 207 208 202 201 27 Portadot 204 203 211 212 234 IV 15 2 23 Figura 2. Genealogia de la familia Pl, con Retinosis Pigmentaria autosomica recesiva 232 233 25 1 7 a 9 *0 26 221 227 216 217 R ev. C ost. de C iencias M ed icas V ol. 191 N o . 3-4 Ju lio -D icie m bre 1998. P eg . 199 224 201 210 (%5 106 205 230 131 221 218 CUADRO II INICIADORES PROBADOS EN LA BUSOUEDA DE LIGAMIENTO CON RPAR, REGION CROMOSOMICA, CODIGO EN LA BASE DE DATOS GENETICA OMIM Y REFERENCIA BIBLIOGRAFICA Tipo de RP Cddigo OMIM Herencla Locus Marcadores (STRPs) Distancia STRP-gen (cM) RP12 600105 A. Recesiva 1q31-q32.1 F133 USH2 276901 A. Recesiva 1q32 C4BPA/B RHO 180380 A. Dominante 3q21-q24 RHO 0 268000 A. Recesiva D3S1292 2 D3S1309 7 D3S1589 7 RP4 &N.*** A.Dominante 3q D3S621 12 PDEB 180072 A.Recesiva 4p16.3 PDEB 0 D4S412 D4S431 It. PDEA 180071 A. Recesiva 5q31.2-34 D5S373 RP S.N.*** A. Recesiva 6p D6S105 5 ADS 179605 A.Dominante 6p12 RDS 0 MCDR1 136550 A.Dominante 6q14-q16.2 D6S251 RP9 180104 A.Dominante 7p15.1 D7S435 4.6 RP1 180100 A.Dominante 8p12 D8S87 14 myc* 190080 Proto-oncogen 8q24 MYC 0 USI-11 C 276004 A. Recesiva 11p16 D11S876 10 USH1B 276903 A. Recesiva 11q14-q21 D115876 USH1A 276900 A. Recesiva 14q32.1 P1 " No se ha relacionado con RP Marcador en Ia misma region pero no se cuenta con la distancia exacta entre el marcador y el gen *** Sin nUmero en OMIM por ser loci sujetos a confirmaciOn. Se leyeron las radiograffas y se verificO la herencia mendeliana con el programa LINKAGE INTERFASE(17). Luego se utilizO el programa LINKAGE(18) y se observO si habfa ligamiento entre dos puntos ("Two point analysis") con MLINK y se obtuvo el puntaje Lod como medida de ligamiento(19). El puntaje Lodes una medida de la probabilidad de que dos sitios del genoma (el corres- pondiente a un marcador y el del gen busca- do) estdn cerca, contra la probabilidad de que no lo esten. Si dos loci estan cerca, la fre- cuencia de recombinaciOn en meiosis va a ser baja (menor a 0.5), mientras que si dos loci estan lejos, la frecuencia de recombinantes sera muy cercana a 0.5 (50% de probabili- dades de clue segreguen juntos, porazar). El puntaje Lodes igual al logaritmo base 10de la probabilidad de la ocurrencia de los resul- tados observados en una familia a una frac- cion de recombinaciOn dada, entre la proba- bilidad de Ia ocurrencia de estos resultados por simple azar. Se utiliza el logaritmo porque esto facilita Ia adiciOn de puntajes Lod encontrados en distintas familias. A saber, Puntaje Lod (Z) = log10 P(0)/P(0.5) , donde P(0) es la probabilidad de ocurrencia de los resultados observados considerando Rev. Cost. de Ciencias Medium Vol. 191 No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pag. 200 una fracciOn de recombinacion , y P(0.5), la probabilidad de que ocurran por segre- gaciOn azarosa (todo esto en una familia). Por convencion se acepta que dos loci ester' ligados si el puntaje Lod es igual o superior a +3 (probabilidad de 1000:1 de que esten ligados)y se descarta ligamiento si el puntaje es igual o menor a —2. Ademas, se determin6 la capacidad que tienen las familias estudiadas de permitir que se encuentre ligamiento en alias, para lo cual se crearon segregaciones de cuatro alelos en las familias, uno de los cuales ligado con recombinaciOn de 0.0. Por desconocerse las frecuencias alelicas en Costa Rica de los marcadores utilizados, se asumi6 quo todas eran iguales para los diferentes alelos, como se suele realizar en estos casos(20). La frecuencia del alelo mutado del gen causante de Ia RP en cada familia se calcul6 asumiendo una incidencia de 1:3500 debido a ese gen(21), en cuyo caso la frecuencia genica serfa de q = 0.016903. RESULTADOS PATRON DE HERENC1A Y DIAGNOSTICO CLINICO En ambas familias la herencia es clara- mente autosornica recesiva de expresiOn temprana, aunque la degeneration tiene distintas caracteristicas en C1 y P1. El fenotipo de la RP en la familia C1 se caracteriza por una respuesta electro-fisio- lOgica nula de bastones, con degeneration variable a nivel de conos (temprana o tardia). Los individuos atectados presentan un moteado difuso temprano en la macula, que en algunos se presenta muy alterada, con atrofia geografica. Presentan atenua- ciOn vascular, proliferaciOn de pigment° tar- dia, nistagmus temprano, epitelio pig- mentario atrofiado y perdida de la vision periferica tipica de RP. Por su parte, Ia familia P1 presenta una respuesta electrofisiolOgica escotOpica nula, pero la respuesta fotopica se agrava tar- diamente. Se presenta atrofia en Ia macula, atenuaciOn vascular, proliferaciOn de pig- mento, pero no nistagmus. El epitelio pig- mentario se encuentra atrafiado y se da perdida de la vision periferica. ANALISIS DE LIGAMIENTO En el Cuadro III se rnuestra el puntaje Lod de un marcador teorico ligado con el alelo afectado, mientras que en los Cuadros IV y V se presentan los puntajes Lod obte- nidos en cada una de las familias. Como puede observarse, ambas familias tienen poder suficiente para que un marcador ligado a la RPAR que las afecta demuestre Ia existencia de ligamiento (C1, Z (0.0) = 4.59; P1, Z (0.0) = 5.25). Un puntaje Lod de Z (0.0) = oo, al tratarse de marcadores poli- CUADRO Ill PUNTAJES LOD DE UN MARCADOR IDEAL DE4 ALELOS QUE SEGREGA CON LA RP, E INDICA EL PODER DE LAS FAMILIAS C1 Y P1 PARA QUE EN ELLAS SE ENCUENTRE LIGAMIENTO CON EL GEN QUE PROVOCA SU TIPO DE RPAR Familia 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 C1 4.5850 3.5936 2.5616 1.5154 0.5428 P1 5.2460 3.9549 2,6848 1.5234 0.5615 Rev. Cost. de Ciencias Medicas Vol. 191 No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Peg. 201 CUADRO IV PUNTAJES LOD (Z) OBTENIDOS ENTRE MARCADORES POLIMORFICOS Y EL GEN DE LA RETINOSIS PIGMENTARIA AUTOSoMICA RECESIVA EN LA FAMILIA C1, SEGON LA DISTANCIA ENTRE LOS LOCI Marcador 0.0 0.1 0.2 Fl 3B C4BPA/B D3S1292 00 - 0.4899 - 1.0426 - 0.2488 - 0.1611 - 0.4216 - 0.0035 D3S1589 - 0.7116 - 0.1868 PDEB 00 - 0.2183 0.0092 D4S412 0.3845 0.4341 D4S431 • 00 - 1.0882 - 0.3627 D5S373 0.3073 0.3670 0.2845 D6S105 00 - 0.7161 - 0.1399 RDS - 0.0083 0.2063 0.2239 D6S251 00 - 1.1975 - 0.4637 D8S87 - 0.7260 - 0.1496 myc 00 0.0233 0.3050 D11S875 - 0.5789 - 0.1503 morificos ligados, permite considerar muy improbable que sea el causante de Ia pato- log fa, al es el caso en Ia familia C1, con los genes de la RPAR de Ia region 1q31-32.1 (F1313), RPAR por mutaciOn en la fosfo- diesterasa B en 4p16.3 (PDEB), RPAR de 6p a 20 cM del gen de Ia periferina (D6S105), distrofia macular MCDR1 (D6S251) y del proto-oncogen myc. Por su parte, el puntaje Lod con el marcador RDS no permite descartar con certeza al gen ADS (Z (0.0) = - 0.0083), y se observan pun- tajes Lod positivos en el caso de los marca- dores myc en 8q24.12-q24.13 (Z (0,2) = 0.3050) y periferina/RDS en 6p12 (Z (0.1) = 0.2063), pero estos no son significativos. En cuanto a Ia familia P1, se descartan los siguientes genes como causantes de la RPAR, al obtenerse valores de Z (0.0) =0.: CUADRO V PUNTAJES LOD (Z) OBTENIDOS ENTRE MARCADORES POLIMORFICOS Y EL GEN DE LA RETINOSIS PIGMENTARIA AUTOSoMICA RECESIVA EN LA FAMILIA P1, SEGUN LA DISTANCIA ENTRE LOS LOCI Marcador 0.0 0.1 0.2 F13B - 1.0099 - 1.1001 0.0597 C4BPA/B - 1.0716 - 0.2211 - 0.0752 RHO - 0.3485 0.3991 0.3154 03S1292 - 1.5505 - 0.6513 D3S1309 - 1.3915 - 0.5357 D3S1589 - 0.6610 - 0.2376 D3S621 - 0.4256 - 0.0832 - 0.0501 PDEB - 1.1956 - 0.3996 D5S373 - 1.0700 - 0.3489 - 0.1457 D6S105 00 - 2.2524 - 0.9870 RDS - 00 - 0.1009 0.3390 D7S435 - 1.6914 - 0.6926 D8S87 00 - 1.0923 - 0.4046 myc 00 - 0.9240 - 0.3007 D11S875 -00 - 1.3461 - 0.5778 P1 0.4845 0.7632 0.6385 el que codifica por la rodopsina (RHO, D3S1292, D3S1309 y D3S1589), el de Ia fosfodesterasa B (PDEB), el de RPAR cercano a Ia periferina (D6S105), el de Ia periferina (RDS), RPAD del cromosoma 7 (D7S435) y el proto-oncogen myc. Por otra parte, se encontraron valores positivos en loci cercanos al gen de la rodopsina (RHO, Z (0.1) = 0.3991), periferina (RDS, Z (0.2) = 0.3390) y Usher 1 A del cromosoma 14q (P1, Z (0.09) = 0.7647). Ahora bien, hay que toner en cuenta que todos los resultados anteriores correspon- den a puntajes Lod obtenidos asumiendo igualdad en la frecuencia de los alelos del marcador, lo cual introduce la probabilidad de error. Sin dejar esto de lado, se puede Rev. Cost. de Ciencias Medicas Vol. 19 / No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pig. 202 afirmar que el analisis de los marcadores polimerficos no ha encontrado ninguno liga- do a la RPAR en las familias C1 y P1, sino que al contrario, en la mayoria de los casos se han descartado los genes probados. DISCUSIoN La reconstrucciOn genealOgica de la familia P1 que permiti6 el establecimiento de nexos consangulneos como responsables de Ia enfermedad en todos los afectados, hace pensar que en esta familia una sole mutacion es la causante de Ia patologia en todos los afectados. Esto podria facilitar el analisis de ligamiento genetico.ACin asi no se debe descartar a priori que el problema se deba a la interacciOn de dos genes en las familias (heterogeneidad compuesta) come ha pasado en otros casos en RP(12). Por su parte, la familia C1 presenta el inconve- niente de que no se establecie relaciOn ge- nealOgica entre el tronco familiar y algunos portadores obligatorios, por to qua queda una mayor probabilidad de que la hetero- geneidad compuesta sea responsable del padecimiento. Los marcadores utilizados (STRPs) tienen la ventaja de ser muy polimerficos y de permitir un analisis mas rapid° que si se analizara cada uno de los exones de cada gen, en el caso de contarse con familias que permitan este tipo de analisis, Los puntajes Lod obtenidos para los diversos marcadores ligados a los genes en estudio dan evidencia de que en la familia C1 no hay ligamiento con los genes RP12 (1q31-32.1), PDEB (4p16.3), RP en 6p (a 20 cM de RDS), MCDR1 (6q14-q16.2) y myc (8q24), y quedan por descartarse el gen RDS y regiones cercanas a myc. Por su parte, en Ia familia P1 se encontr6 evidencia de que los siguientes genes no causan la RP: RHO, PDEB, RP a 20 cM de RDS, RDS, RP9 y myc. En los casos restantes, en ambas fa- milies se deben prober mas marcadores ligados para obtener resultados conclu- yentes. En ninguna de las dos familias fue posible descartar los genes RP1 y USH1C porque los marcadores ligados (D8S87 y D11S875 respectivamente) no presentaron los puntajes Lod requeridos, si se tome en cuenta la distancia de estos marcadores con respecto al gen (Cuadro II). Se probe el proto-oncogen myc coma posible gen candidate debido a que la pro- telna cod ificada per el gen myc participa tanto en el desarrollo del cancer, como en la apoptosis, mecanismo par el que mueren las celulas de Ia retina cuando hay RR Es predecible que de haberse heredado ese gen con una mutaciOn que predisponga a la apoptosis la muerte celularse (Jerre en estadios tempranos y en diversos tejidos, no sOlo en la retina. Sin embargo, se probe porque podria darse el caso de que por los niveles de sintesis proteica en la retina fue- ran diferentes, y quo por tanto, las conse- cuencias negatives de is mutacien se pu- dieran dar particularmente en ese tejido. Para continuer con la btisqueda del gen o genes responsables de la RPAR en estas familias y antes de continuer con el mapeo del genoma, deben descartarse los restan- tes loci que se han relacionado con RPAR y RPAD, asi come a otros sfndromes con RP. Luego se deben investigar otros genes que codifican proteinas que participan en la transducciOn de la serial visual o que juegan un papel estructural en celulas de la retina. Al analizarse los dates se debera tener en cuenta la posibilidad de que existan dos loci que esten involucrados en Ia RP en Ia mis- ma familia. Si estos estudios culminan con el hallazgo de los genes responsables, se estard avanzando en la comprensien de la fisiopatologia y se establecera la posibilidad de un diagnestico molecular. En el caso de la RP de estas familias, se ha seguido la metodologia habitual de descartar los loci anteriormente relacio- nados con Ia patologia, para luego continuer Rev. Cost. de Ciencias Medicas Vol. 19 / No. 3-4 Julio-Diciembre 1998. Pag. 203 con el tamizaje genennico. Cuando se cono- cen los genes candidates, se pueden utilizer tecnicas directas de bilsqueda de muta- ciones (p.e. polimorfismos en la confor- macion de ADN banda simple, SSCP). No obstante, si se cuenta con families grandes, con un buen numero de afectados, la utili- zacion de marcadores polimOrfices y el ana- lisis de ligamiento permite un estudio relati- vamente barato y rapid°. Los pasos segui- dos en este yen multiples estudios de enter- medades hereditarias, se siritetizan a continuaciOn: 1. Construir la genealogia de la familia afectada. 2. Realizar el diagnostic° clfnico mas pre- cise posible de los afectados, porta- dores obligatorios y controles sanos; de esta manera se escogeran en primer lugar los marcadores mas probables. 3. Extraer ADN de los individuos. 4. Realizar pruebas con PCR y los marca- dores candidatos, y observer los resui- tedus por medic) de electroforesis. 5. Se realiza un analisis de ligamiento, y se descarta o se muestra evidencia del gen como responsable de la patologfa de Ia familia. Despues de estos pasos, en case de no encontrarse ligamiento, se deberd continuar con mapeo genetico en sitios del genoma ad n no descritos come responsables de Ia enfermedad. AGRADECIMIENTOS Este estudio es resultado del proyecto # 742-93-324 financiado por is Vicerrectoria de Investigacien de la Universidad de Costa Rica. Agradecemos a Pedro LeOn y a Sandra Silva del Centro de Investigacion en Biologic Celular y Molecular de la Universidad de Costa Rica, por sus valiosos aportes. A Jorge Azofeifa por sus comentarios. Al senor Alvaro Mendieta y a la FundaciOn Costa- rricense de Retinosis Pigmentaria, y al senor Carlos Gamboa y familia, por el importante apoyo econOmice, necesario por el costo de los estudios clinicos. Tambien agradecemos a Gerardo Jimenez por la ayuda en el tra- bajo de campo. REFERENCIAS 1. 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