bioquimica(2)

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Fac. de Ciencias-ULA. La Hechicera, Mérida 5101. Mérida. Telf: 0274-2401307. Fax: 0274-2401286. 
E-mail: pbcigen@ula.ve; www.pbcigen.ciens.ula.ve 
POSTGRADO EN BIOLOGÍA CELULAR 
CENTRO DE INGENIERÍA GENÉTICA (CIGEN) 
FACULTAD DE CIENCIAS 
UNIVERSIDAD DE LOS ANDES 
 
 
 
Nombre de la Asignatura Módulo I: Bioquímica Avanzada 
Unidades crédito 3 
 
Horas teoría/práctica 
 
48 horas teóricas 
 
Horas por semana 
 
4 
 
Cuerpo docente 
 
Profs. Juan Luís Concepción, Wilfredo Quiñones y Héctor 
Acosta. 
 
Justificación 
 
El contenido del módulo pretende que los estudiantes 
adquieran conocimientos avanzados del metabolismo 
intermediario, cinética enzimática, importación de 
proteínas a diferentes organelas, estructura de proteínas, 
interacción proteína-proteína como un ejemplo del uso de 
técnicas para el análisis del funcionamiento de los 
organismos vivos. En este módulo se pretende no sólo 
impartir un conocimiento avanzado de la bioquímica de 
organismos parásitos de importancia médica sino hacer 
discusiones profundas sobre técnicas avanzadas, que 
preparen al estudiante para el empleo de las mismas en 
cualesquiera sean los campos de su investigación. 
Objetivo General Que el estudiante sea capaz de interpretar procesos y 
técnicas bioquímicas. 
Unidad 1 Objetivo Terminal 
Bioquímica metabólica Distinguir los diferentes procesos metabólicos; anabólicos y 
catabólicos, empleando a los kinetoplastides como organismos 
modelo de estudio. 
Contenido Objetivos específicos 
1.1 Repaso de metabolismo 
energético 
Repasar los conocimientos bioquímicos obtenidos en pregrado, 
mediante exposición de la información. 
1.2 Metodologías usadas en el 
estudio del metabolismo 
Conocer las distintas metodologías empleadas en estudios 
bioquímicos, a través de lecturas comentadas. 
1.3 Metabolismo de 
Trypanosomatidae, en particular de 
Trypanosoma brucei, T. cruzi y 
Leishmania spp. 
Conocer las distintas particularidades del metabolismo de estos 
parásitos y contrastarlo con el de otras células, a través de lecturas 
comentadas. 
1.4 El glicosoma y su metabolismo 
(en particular a nivel de los 
balances de energía y redox 
(NAD/NADH). Cadena 
respiratoria 
Conocer el metabolismo glicosomal como una particularidad de los 
kinetoplastides, a través de lecturas comentadas. 
 
 
1.5 Metabolismo energético en base Conocer el metabolismo del pirofosfato, a través de lecturas 
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a pirofosfato. comentadas. 
1.6 Repaso de síntesis de esterol Recordar los conocimientos de esta ruta metabólica usando como 
modelo los kinetoplastidos, mediante exposición de la información. 
1.7 Síntesis de esteroles en 
glicosoma y peroxisoma. 
Conocer los componentes de esta vía de síntesis que están presentes 
en estas organelas, a través de lecturas comentadas. 
 
Unidad 2 
 
Objetivo Terminal 
Cinética enzimática Describir los diferentes mecanismos de acción enzimática. 
Contenido Objetivos Específicos 
2.1 Michaelis-Menten: Km, Vmax, 
Kcat 
Explicar el significado de este mecanismo de acción enzimática y la 
manera de obtener las distintas constantes cinéticas, mediante 
discusión de trabajos relacionados con el tema. 
2.2 Inhibición: Competitiva, no 
competitiva, acompetitiva y mixta. 
Identificar los distintos mecanismos de acción enzimática, mediante 
discusión de trabajos relacionados con el tema. 
2.3 Enzimas con sitios múltiples y 
alosterismo: sitios no cooperativos, 
unión cooperativa, modelo sencillo 
de interacción secuencial, 
representación y ecuación de Hill y 
modelo de simetría o de transición 
concertada. 
Conocer este mecanismo de acción distinto al Michaelis-Menten, a 
través de exposición de este modelo. 
Unidad 3 Objetivo Terminal 
Estructura de proteínas. 
Esencialmente enfocado sobre 
proteínas de membrana. 
Distinguir las diferentes estructuras de proteínas de membrana y las 
particularidades de éstas con respecto a proteínas que no son de 
membrana. 
Contenido Objetivos Específicos 
3.1 Repaso de estructura y 
propiedades de los aminoácidos y 
reglas generales para entender la 
estructura de las proteínas. 
Hidrofobicidad e hidrofilicidad. 
Recordar las nociones de estructura a través de exposición de 
contenidos relacionados 
3.2 Estructuras secundarias, 
hélices, beta-configuraciones, beta-
barril. 
Identificar los distintos tipos de estructura proteicas a través de la 
discusión de trabajos relacionados. 
3.3 Clasificación de las proteínas 
de membrana 
Conocer los distintos criterios usados para la clasificación de estas 
proteínas a través de la discusión de trabajos relacionados. 
3.4 Proteínas involucradas en 
transporte de electrones: fumarato 
reductasa, citocromo b, centros 
hierro/azufre 
Identificar desde el punto de vista estructural y funcional estas 
proteínas a través de la discusión de trabajos relacionados. 
Unidad 4 Objetivo Terminal 
Importación de proteínas. Describir los diferentes mecanismos de importación de proteínas a 
diferentes organelas subcelulares. 
Contenido Objetivos Específicos 
4.1 Proteínas del retículo 
endoplasmático. 
Conocer el mecanismo de importación de proteínas al Retículo a 
través de la discusión de trabajos relacionados. 
4.2 Proteínas de la mitocondria, 
cloroplasto y sus membranas. 
Conocer el mecanismo de importación de proteínas a la mitocondria, 
cloroplasto a través de la discusión de trabajos relacionados. 
4.3 Proteínas del glicosoma Conocer el mecanismo de importación de proteínas al glicosoma, a 
través de la discusión de trabajos relacionados. 
Unidad 5 Objetivo Terminal 
Interacción proteína-proteína 
 
Conocer los diferentes mecanismos de interacción proteína – 
proteínas y los efectos de estas interacciones en la regulación de 
diferentes procesos metabólicos. 
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5.1 Interacciones homólogas y 
heterólogas 
Recordar en que consisten este tipo de interacciones a través de 
ejemplos discutidos en trabajos relacionados. 
5.2 Interacciones: hidrofóbicas, 
iónicas y Van der Walls. 
Recordar en que consisten este tipo de interacciones a través de 
ejemplos discutidos en trabajos relacionados. 
5.3 Histéresis 
 
Conocer la Histéresis como un mecanismo que se origina de la 
interacción entre sub-unidades de la misma proteína a través de la 
discusión de trabajos relacionados. 
5.4 Cambios de actividad 
enzimática debido a las 
interacciones de proteínas con 
diferentes ligandos y otras 
proteínas. 
Conocer como la actividad de una enzima puede ser afectada por 
estas interacciones a través de la discusión de trabajos relacionados. 
 
5.5 Control del flujo metabólico por 
interacciones de proteínas con 
ligandos y otras proteínas. 
Conocer el concepto de flujo metabólico y como este se puede ver 
afectado por las interacciones proteína – proteína, a través de la 
discusión de trabajos relacionados. 
 
Estrategias de enseñanza 
 
Se dictarán clases magistrales de los principales temas 
donde el objetivo específico implique recordar contenido; 
se realizarán además discusiones de trabajos asignados 
semanalmente, relacionados con el tema a discutir. 
Recursos didácticos En las clases se emplean marcadores y pizarrón acrílico y 
eventualmente de ser necesario video beam o proyector de 
transparencia. 
Se recomiendan artículos actualizados de las siguientes 
revistas: 
Molecular and Biochemical Parasitology 
Nature 
Science 
Biochemistry 
FEBS Journal 
The Journal of Biological Chemistry 
Experimental parasitology 
Parasitology Research 
Archives Biochemical and Biophysical 
Analytical Biochemistry 
Biochemical Journal 
Estos artículos serán aportados antes de la clase para su 
discusión. 
Estrategias de evaluación La evaluación se basa en la discusiónde los trabajos 
asignados semanalmente; se consideran las intervenciones 
durante la discusión, se realizan exámenes que abarcan el 
contenido programático de la asignatura, generalmente al 
final del curso. 
Referencias Bibliográficas - Libros texto: 
- Voet, Donald - Voet, Judith. 2005. Fundamentos de 
Bioquímica. La vida a nivel molecular. Editorial 
PANAMERICANA 
- Berg, Jeremy M.; Tymoczko, John L.; y Stryer, Lubert. 
Biochemistry. 2005. New York: W. H. Freeman and Co. 
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- David, L. Nelson; Michael, M. Cox. 2006. Lehninger. 
Principios de Bioquímica. 4ªEd. Editorial: Omega. 
Edición. 
- Lodish, Harvey; Berk, Arnold; Zipursky, S. Lawrence; 
Matsudaira, Paul; Baltimore, David; Darnell, James E. 
2000. Molecular Cell Biology. New York: W. H. Freeman 
& Co. 
- Alberts, Bruce; Johnson, Alexander; Lewis, Julian; Raff, 
Martin; Roberts, Keith; Walter, Peter. 2002. Molecular 
Biology of the Cell. New York and London: Garland 
Science. 
- Segel, Irwin H. 1976. Biochemical Calculations: How to 
Solve Mathematical Problems in General Biochemistry. 
Publisher: John Wiley & Sons, Inc. Second edition.