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REPLICACIÓN DE ADN La primera pregunta: ¿semiconservativa o conservativa? Experimento de Meselson y Stahl Replicación semiconservativa La copia de DNA original fue marcada con N15 (isótopo pesado). Este DNA entró a una ronda de replicación con N14 y después la mezcla fue centrifugada de tal manera que el DNA pesado (2 hebras N15) formara una banda más baja en el tubo, el DNA intermedio(una hebra N15 y una hebra N14) una banda más ligera y más arriba en el tubo y el DNA ligero (N14) formara una banda más arriba de las dos anteriores). Los resultados esperados para cada modelo: Conservativa: Después de una generación una banda pesada y una banda ligera, el resultado no cambia después de varias generaciones. Semiconservativa: Después de una generación una sola banda intermedia, después de varais generaciones, una banda ligera y una banda intermedia. La replicación del ADN produce una copia de sí mismo por medio de enzimas. El mecanismo de replicación es esencialmente el mismo en todas las células. Es un proceso semiconservativo porque cada uno de los dos ADN hijos tiene una cadena del ADN anterior. Cada una de las dos moléculas hijas contiene la mitad de la molécula madre. Este tipo de duplicación semiconservativa se puede realizar porque la secuencia de las bases que la constituyen ha sido conservada, de forma que la secuencia de cada molécula madre sirve de molde para formar la secuencia de las dos moléculas hijas. El proceso tiene 3 fases bien diferenciadas: Iniciación, Elongación y Terminación. •EL DNA se replica desenrollando la hélice y rompiendo los puentes de hidrógeno entre las hebras complementarias. •La replicación comienza en sitios específicos u orígen de replicación •Procariontes: Un origen de replicación •Eucariontes: Múltiples orígenes de replicación. • La replicación es bidireccional a partir del origen de replicación Bidirectional Circular DNA Replication in Bacteria Sitios de origen de la replicación Genoma circular 1 sitio origen de la replicación Genoma lineal varios sitios origen de la replicación La iniciación de la replicación del ADN comienza siempre en una secuencia específica de nucleótidos conocida como origen de replicación, en el que hay un gran contenido de adenina y timina. Requiere una serie de proteínas iniciadoras especiales (proteínas desestabilizadoras de la hélice) y enzimas conocidas como helicasas, que rompen los puentes de hidrógeno abriendo la hélice, formándose las horquillas de replicación, una a cada lado de la burbuja a que da lugar la separación de las ramas del ADN. Iniciación • Para iniciar la replicación se requieren enzimas “desenrrolladoras” llamadas helicasas y así se forman las horquillas de replicación (replication forks) Una vez abierta la cadena de ADN se unen otras proteínas y enzimas adicionales: Proteínas SSB (proteínas de unión a cadena) No permiten que el ADN se vuelva a naturalizar o forme estructuras secundarias. Las enzimas topoisomerasa evitan que se retuerzan y formen superenrrollamientos cortando una o ambas hebras del ADN aliviándolos Replicación de ADN. Durante la Iniciación de la replicación, la doble hélice de ADN se abre por acción de una helicasa. A continuación, una molécula de ADN polimerasa se une a una de las hebras de ADN. Se mueve recorriendo la hebra usándola como molde para ir sintetizando la cadena líder (en rojo), añadiendo nucleótidos y recomponiendo la doble hélice Elongación En el siguiente paso, las enzimas llamadas ADN polimerasas catalizan la síntesis real de las nuevas cadenas añadiendo nucleótidos sobre el molde. La ADN polimerasa sintetiza las nuevas cadenas, complementarias a cada una de las cadenas primitivas, pero sólo es capaz de sintetizar nuevo ADN en sentido 5´ → 3´ partiendo de un ARN corto específico llamado ARN cebador -molécula formada por nucleótidos de ARN catalizados por ARN primasas. Durante la síntesis, en cada horquilla de replicación, se van formando dos copias nuevas, sobre cada una de las dos hebras de ADN que se separaron en la fase de iniciación. Cuando una ADN polimerasa hace contacto con el extremo de otro fragmento de Okazaki contiguo el ARN cebador de este es eliminado y otra enzima, la ADN ligasa, conecta los dos fragmentos de Okazaki de ADN recién sintetizado, catalizando las reacciones de condensación que unen los grupos fosfato y azúcar de los nucleótidos contiguos y así, una vez unidos todos los fragmentos de Okazaki se completa la doble hélice de ADN. Terminación Replicación AGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCT TCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGA I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I 5’ 5’ 3’ 3’ TCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGA 5’ 3’ AGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCT 5’3’ TCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGA 5’ 3’ AGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCT 5’3’ 5’3’ AGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCTAAGCTTAGCCU I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I UCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGATTCGAATCGGA 5’ 3’ I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I I DNA Separación de las cadenas Replicación DNA RNAm Polip Templado 1 Templado 2 DNA polimerasa III no puede empezar de cero, necesita un Extremo OH libre en donde unir el primer nucleótido, por Eso se requiere un primer de RNA (Primasa). Lectura 3´-5´ Síntesis 5´-3´ Adelaida Camitjana Entonces, hay una hebra líder y una hebra retrasada • Una vez terminada la copia del DNA, se deben remover los pedazos de RNA (DNA pol I) y unir toda la cadena (Ligasa). • En la copia puede haber errores (mutaciones) que en general son corregidas simultáneamente por la DNA pol III. A T C G A A C C G T T G C A C C G T T G C A C U A G C T T G G C A A C G T G Síntesis continua de la cadena 5’ -3’ Síntesis continua de la cadena en dirección 5'3'. La síntesis de esta cadena no plantea ningún problema. Así, una vez separadas ambas cadenas, se sintetiza el primer y la ADN pol. III (una de las enzimas que unen los nucleótidos) va a elongar la cadena en dirección 5'3'. A T C G A A C C G T T G C A C C G T T G C T A G C T U G G C A A C G T G Síntesis discontinua de la cadena 3’ -5’ AACCCGGT Síntesis discontinua. La cadena complementaria no se va a replicar en sentido 3'5' sino que se replica discontinuamente en dirección 5'3'. Primero se sintetiza el primer (ARN) y posteriormente este se elonga con ADN. El ARN es posteriormente eliminado y los diferentes fragmentos sintetizados, llamados fragmentos de Okazaki, son unidos entre sí. Enzima Acción Función en la célula DNA polimerasa I Añade nucleótidos a la molécula de DNA en formación. Remueve primers de RNA Llena huecos en el DNA, fundamentalmente para reparación. Remueve primers de RNA. DNA polimerasa III Añade nucleótidos a la molécula de DNA en formación. Revisa la seecuencia y corrige Replica DNA DNA girasa (topoisomerasa II) Promueve superenrrolamiento Mantiene la compactación del DNA DNA helicasa Se une al DNA cerca de la horquilla de replicación Promueve la separación de las hebras de DNA Topoisomerasa I Relaja el DNA super enrollado Mantiene el nivel adecuado de enrollamiento Primasa Hace cadenas pequeñas de RNA unsando DNA como molde Se necesita para que la DNA polimerasa replique la hebra “retrasada”
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