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Visión integrada flujo de información genética Esquema de la Replicación (Síntesis del ADN) Esquema de la Transcripción (Síntesis del ARN) Traducción (Síntesis de Proteínas) Enfermedades causadas por alteraciones en la síntesis de proteínas En eucariotas Bibliografía: 1. Bioquímica de Harper. Autores: Murray et al. Capítulos: 34-37. 2. Bioqúimica. Autores: McKee y McKee. Capítulos: 17, 18 y 19. OBJETIVO 3. SINTESIS PROTEICA 3 SESIONES DE CLASES TEORICAS ADN ARN PROTEINAS Replicación Transcripción Traducción DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGIA MOLECULAR El ADN, a través de la secuencia de nucleótidos que lo conforman, contiene la información que especifica la síntesis de proteínas ¿ Dónde está contenida la información genética...? ...En el núcleo 1. La REPLICACIÓN exacta del ADN permite que esa información sea copiada desde una célula parental a dos células hijas ¿ Cómo es transmitida la información genética? 2. Parte de ésta información es copiada durante la síntesis del ARN nuclear a través de un proceso que se conoce como TRANSCRIPCION 3. El ARN formado en el núcleo se TRADUCE en el citosol por medio de la síntesis de cadenas polipeptídicas que constituyen a las proteínas El ADN: ESTRUCTURA Puentes de hidrógeno Extremo 3’ Extremo 5’ Extremo 5’ Extremo 3’ 1 2 3 4 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 1 2 3 4 5 5 Enlace fosfodiéster Cada cadena polinucleotídica posee “individualidad” determinada por la secuencia de sus bases, es decir, la secuencia de nucleótidos. Cada cadena polinucleotídica posee un “sentido” o direccionalidad”: Un extremo lleva un fosfato 5’ sin reaccionar y el otro extremo lleva un grupo hidroxilo 3’ sin reaccionar. Dos cadenas de polinucleótidos giran alrededor de un eje común formando un plegado regular conocido como “doble hélice dextrógira”. Características estructurales del ADN Las bases de purinas y pirimidinas están ubicadas en el interior de la hélice, mientras que las unidades de fosfato y de desoxirribosa lo están en el exterior La doble hélice se estabiliza mediante puentes de hidrógeno entre las bases de las hebras: Adenina --- Timina Guanina --- Citosina Las dos hebras de la molécula son antiparalelas, es decir, una corre en dirección 5’ a 3’ y la otra tiene dirección 3’ a 5’ Características estructurales del ADN Características estructurales del ADN En algunos organismos, como bacterias y virus, las moléculas de ADN en forma natural son “circulares” No tienen extremos libres 5’ ó 3’ FUNCIONES DEL ADN: La información genética almacenada en la secuencia de nucleótidos del ADN tiene dos funciones: Provee la información heredada por las células hijas o la progenie (replicación) Como fuente de información para la síntesis de todas las moléculas de proteínas en la célula (transcripción) Replicación del ADN (síntesis de ADN) En eucariotas Replicación: Es un proceso en el cual el ADN actúa como molde para su propia síntesis Hebra molde Hebra hija 2011Pearson Education, Inc 1. Topoisomerasas 2. Helicasa 3. ARN polimerasa 4. PUBS 5. ADN polimerasa 6. ADN ligasa REPLICACIÓN Hebra guía Hebra retrasada Fragmento de Okazaki Características de la replicación: Es semiconservativa Es ordenada y secuencial Utiliza sustratos activados Es discontinua y bidireccional Es exacta Tipos de daños del ADN I. Alteración de base única a. Despurinación b. Desaminación de citosina a uracilo c. Desaminación de adenina a hipoxantina d. Alquilación de base e. Inserción o deleción de nucleótido f. Incorporación de análogo de base II. Alteración de dos bases a. Dímero de timina-timina (pirimidina) inducido por luz UV b. Entrecruzamiento por agente alquilante bifuncional III. Roturas de cadena a. Radiación ionizante b. Desintegración radiactiva de elemento de esqueleto c. Formación de radical libre oxidativo IV. Entrecruzamiento a. Entre bases en la misma cadena o en cadenas opuestas b. Entre DNA y moléculas de proteína (p. ej., histonas) MECANISMO MULTIPLES PASOS PARA REPARACIÓN DEL DNA KU70/80 ATRIP DETECTORES TRANSDUCTORES ADN-PK ATM ATR 53BP1 ADN-PK p53 p21 CH-K1 PUMA BAX NOXA p16 p19 1. Reparación del ADN 2. Paro del ciclo celular 3. Apostosis 4. Senescencia ATR CH-K2 MEDIADORES EFECTORES Resultado Celular Fuente: Murray et al. Harper, Bioquímica Ilustrada 29ª ed Reparación por unión de extremo no homólogo (NHEJ) defectuosa Enfermedad de inmunodeficiencia combinada grave (SCID) Enfermedad de inmunodeficiencia combinada grave sensible a la radiación (RS-SCID) Reparación homóloga (HR) defectuosa Trastorno tipo AT (ATLD) Síndrome de rotura de Nijmegen (NBS) Síndrome de Bloom (BS) Síndrome de Werner (WS) Síndrome de Rothmund Thomson (RTS) Susceptibilidad a cáncer mamario 1 y 2 (BRCA1, BRCA2) Reparación por escisión de nucleótido (NER) de ADN defectuoso Xeroderma pigmentoso (XP) Síndrome de cockayne (CS) Tricotiodistrofia (TTD) Reparación por escisión de base (BER) de ADN defectuoso Poliposis asociada a MUTYH (MAP) Reparación de errores de emparejamiento (MMR) de ADN defectuoso Cáncer colorrectal hereditario sin poliposis (HNPCC) ENFERMEDADES POR DEFECTOS DE REPARACIÓN DEL DAÑO DEL ADN (HUMANOS) El ARN: ESTRUCTURA Y FUNCION Es un polímero de ribonucleótidos púricos y pirimidínicos enlazados por puentes 3’-5’ fosfodiéster Características estructurales del ARN Existen diferentes tipos de ARN: ARN mensajero (ARNm) ARN ribosómico (ARNr) ARN de transferencia. (ARNt) El ARN mensajero (ARNm) Se sintetiza en el núcleo a partir de una hebra molde de ADN. Transporta la información de un gen a la maquinaria que sintetiza las proteínas. El ARNm es el molde sobre el cual es polimerizada una molécula de proteínas específica. La secuencia de nucleótidos del ARNm consiste en una serie de codones que corresponden a cada aminoácido. El ARN de transferencia Se sintetiza en el núcleo. Actúa como adaptador para la traducción de la información contenida en la secuencia de nucleótidos del ARNm. ARN ribosómico (ARNr): Se sintetiza en el nucléolo. Está contenido en los ribosomas, cataliza la síntesis de proteínas. Son estructuras ribonucleo- proteícas complejas y altamente organizadas que permiten la interacción del ARNm con los ARNt Están compuestos por dos subunidades que se mantienen juntas mediante uniones NO covalentes Transcripción (Biosíntesis de ARN) en organismos eucariotas El ADN actúa como molde para la síntesis de ARN en un proceso conocido como Transcripción, en el cual las dos hebras del ADN se constituirán en: Hebra codificadora Hebra molde 3’) 5’) A partir de la hebra molde se formará el ARN cuyas bases y direccionalidad serán complementarios a ésta hebra molde. El ARN tendrá dirección 3’ Tendrá la misma dirección y secuencia de bases (excepto que Timina es reemplazada por Uracilo) de la hebra codificadora. Características de la transcripción (5’ (3’ 5’ 1. Unión de la enzima ARN polimerasa al molde de ADN 2. Iniciación 3. Elongación 4. Terminación y liberación de la cadena Etapas de la síntesis de ARN: TATA FT D FT B FT E FT F ARN polimerasa FT H FT J ARN polimerasa Movimiento de la polimerasa Rebobinado del ADN Desenrrollado del ADN Punto de elongación del ARN Hebra codificadora Hebra molde ARN Región hibrida ARN-ADN Nucleotidos trifosfatos 2012Pearson Education, Inc El extremo 5’ de la nueva cadena de ARN naciente es: pppG ó pppA Luego sufrirá modificaciones post-transcripcionales: • Adquieren casquetes metilados 5’. • Adición de una cola 3’ de ± 200AMP. • Eliminación de los “intrones” y empalme de los “exones” para dar lugar, finalmente, al ARNm maduro. Los ARN sintetizados en el núcleo son modificados después de su síntesis, para dar origen al ARNm AAAAA AAAAA Secuencia codificadora de ARN Promotor Terminador ADN Pre ARNm 5’ 3’ 5’ 3’ ARNm Cabeza Secuencia codificadora de proteína Cola Cola poli(A) Intrón Intrón Exón Exón Exón TRANSCRIPCIÓN MADURACIÓN DEL ARN El código genético UUU UUC UUA UUG CUA CUG CUU CUC UCU UCC UCA UCG CCU CCC CCA CCG UAU UAC UGU UGC UAA UAG UGA UGG CAU CAC CGU CGC CAA CAG CGA CGG AUU AUC ACU ACC AAU AAC AGU AGC AUA AUG ACA ACG AAA AAG AGA AGG GUU GUC GCU GCC GAU GAC GGU GGC GUA GUG GCA GCG GAA GAG GGA GGG Fen Leu Leu Val Ser Pro Arg Tre Ile Ala Met/inicio Tir Parada Cys Parada Trp His Gln Asn Lys Ser Arg Gly Asp Glu U U U C C C C C C A A A A A A G G G G G G U U U P ri m e ra b a s e Segunda base T e rc e ra b a s e Código genético ARNm AUG Adenina Uracilo Citosina Guanina CGU 5’ 3’ ACG UAC AGU AUC CAU MET/INICIO ARG TRE TIR ILE SER HIS Características del Código Genético: Inequívoco: La última letra de un codón nunca será la primera letra del siguiente. No traslapante: Sin puntuación: Degenerado: Universal: No se leen comas ni espacios vacíos. Varios codones codifican a un mismo aminoácido. Es igual en todos los seres vivos (excepto en las mitocondrias de eucariotas y en algunos protozoos) Cada codón corresponde sólo a un aminoácido. TRADUCCIÓN (SINTESIS DE PROTEÍNAS) ADN ARN PROTEINAS Replicación Transcripción Traducción Transcriptasa inversa Principales participantes ARNm ARNt Ribosomas Enzimas aminoacil ARNt sintetasas Formación de los aminoacil-ARNt + P P 1er Paso Glutamato 2do Paso Reconocimiento del codón por el anticodón Codón Anticodón Brazo aceptor Fenilalanil-ARNt MECANISMOS DE LA TRADUCCION (Síntesis de proteínas) La síntesis de proteínas se divide en tres fases: Iniciación: Elongación: Terminación La iniciación da lugar a la formación de un complejo de iniciación que está formado por un ribosoma unido al ARNm y a un aminoacil ARNt iniciador Es señalada, en el lugar A, por uno de los codones de terminación: UAA, UAG, UGA. Se requieren 9 factores de Iniciación (eIF) 40S eIF-3 40S + eIF-3 eIF-2 + GTP + ARNt met Complejo de Iniciación 40S 40S+ eIF-3+eIF-2+GTP+ ARNt met ARNm eIF-4 eIF-1 ATP Complejo de Iniciación 40S 40S+ eIF-3+eIF- 2+GTP+ ARNt met +ARNm+eIF-4+eIF-1 ADP + Pi 60S+ eIF-6 GTP Complejo de Iniciación 80S 40S + 60S + ARNm + ARNt met eIF-6 eIF-5 eIF-2 eIF-3 eIF-4 eIF-1 Complejo de Iniciación 40S 40S+ eIF-3+eIF-2+GTP+ ARNt met +ARNm+eIF-4+eIF-1 GDP + Pi Subunidad 40S Sitio de unión al ARNm Codón iniciador ARNm Subunidad 60S Iniciación: Complejo de inicio 80S Sitio E Sitio A Sitio P Elongación: 1. Adherencia del aminoacil ARNt al sitio A 2. Formación del enlace peptídico 3. Translocación del ribosoma Se requieren factores de Elongación (eEF) eEF-1α = Lleva el ARNt al lugar A. Une e hidroliza GTP eEF-2 = Une e hidroliza GTP Elongación: Enlace peptídico 1ercodón 2docodón 3ercodón Dipéptído ARNt liberado Terminación: La finalización de la síntesis proteica es señalada, en el lugar A, por uno de los codones de terminación: UAA, UAG, UGA Se requieren los siguientes factores de Liberación (eRF) eRF 1 = Identifica las secuencias UAA, UAG, UGA Une e hidroliza GTP eRF 3 = La actividad GTPasa impulsa la disociación del ribosoma de los eRF, se libera el ARNm y separan las dos subunidades ribosomales Terminación Codón de terminación Factor de liberación ARNt liberado Polipéptido Subunidad 60S Subunidad 40S ARNm ARNt liberado Factor de liberación Regulación de la traducción: Los eucariotas ejercen control a nivel del ARNm y Factores de Iniciación: ARNm específicos son secuestrados al combinarse con proteínas de unión al ARNm. Algunos ARNm se degradan rápidamente para que no persistan en el ciclo celular. Varios factores de inciación pueden ser fosforilados para regular la traducción. Enfermedades causadas por alteraciones en el plegamiento postraduccional de proteínas Alzheimer Enfermedad de las vacas locas
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