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RESPUESTAS - Año 12 No. 1 - Julio 2007 ISSN 0122820X
IDENTIFICACIÓN DE HONGOS FITOPATÓGENOS Y PRESENCIA DE 
SALMONELLA SP EN COMPOST DE PLANTAS DE TRATAMIENTO 
DE AGUAS RESIDUALES
Por:
Ing. Jorge Antonio Silva Leal1 ,Ph.D Patricia Torres Lozada2, 
Ph.D Juan Escobar Rivera3
RESUMEN
Este estudio presenta las metodologías adaptadas 
para identificación de hongos fitopatógenos (Botrytis 
sp, Fusarium sp., Phytophthora sp., Rhizoctonia sp) y 
Salmonella sp. Se evaluó la presencia de fitopatóge-
nos y Salmonella sp en compost producido a partir de 
lodo primario espesado y deshidratado-LED genera-
do en la Planta de Tratamiento de Aguas Residuales 
de Cañaveralejo-PTAR-C- Cali. La adaptación de las 
metodologías mostró que las diluciones adecuadas 
para el aislamiento de hongos fitopatógenos en las 
muestras de compost son 10-3, 10-4, 10-5 y el medio 
de cultivo selectivo más apropiado para la identifi-
cación de Salmonella sp fue el agar Salmonella-Shi-
gella. El único fitopatógeno presente en el compost 
fue Fusarium sp, también se encontró presencia de 
Salmonella sp. Por lo tanto, se recomienda realizar 
su cuantificación para definir en qué concentraciones 
puede llegar a convertirse en un problema de salud 
pública; adicionalmente, se debe realizar la higieniza-
ción del compost para su aplicación agrícola princi-
palmente en cultivos industrializados.
Palabras Claves: Compost, Fitopátogenos, Salmonella sp.
ABSTRACT
This study shows adapted methodologies to identify 
of phytopathogens fungi (Botrytis spp, Fusarium sp., 
Phytophthora sp., Rhizoctonia sp) and bacteria as Sal-
monella sp. Presence of mentioned microorganism 
was evaluated in compost samples produced from 
dewatering primary sludge, generated in Cañaverale-
1Ingeniero de Producción Biotecnológica. Universidad Francisco de Paula Santander. jorgesilvaleal@hotmail.com
2Doctora Universidad de Sao Paulo Brasil, Profesora Asociada Universidad del Valle. patoloz@univalle.edu.co
3Doctor Universidad de Sao Paulo Brasil. Jefe de Operación Planta Puerto Mallarino. EMCALI. jcescobar@emcali.com.co
jo Wastewater Treatment Plant -WWTPC. The adapted 
methodologies shown that the appropriate dilutions for 
isolation of phytopathogens fungi in compost are 10-3, 
10-4and 10-5 and the most appropriated selective cul-
ture medium for the salmonella sp identification is the 
Salmonella-Shigella agar. Fusarium sp was the only 
phytopathogens fungi founded in compost; Salmone-
lla sp was also founded. Therefore, it is recommended 
the quantification in order to define the concentrations 
that can cause health problems; additionally, it is ne-
cessary sanitization of compost for use in agriculture, 
mainly in industrial crops. 
Keywords: Compost, Phytopatogens, Salmonella sp.
INTRODUCCIÓN
La composición y concentración de los componen-
tes de las aguas residuales domésticas dependen en 
gran medida de las condiciones socioeconómicas de 
la población, así como de la presencia del vertimiento 
de efluentes industriales en la red de alcantarillado; 
en regiones industrializadas, la fracción de residuos 
industriales presente en el agua residual doméstica 
puede ser significativa, alterando las características 
de los mismos [6]. 
Las aguas residuales domésticas contienen seis clases 
principales de contaminantes: organismos patógenos, 
materia orgánica, sólidos suspendidos, nutrientes, 
olor, y metales pesados, siendo los organismos pató-
genos la clase de contaminantes más importante para 
la salud humana [18]. Para remover los contaminan-
tes presentes en el agua residual, existen Operaciones 
físicas, Procesos biológicos y Procesos químicos. En 
la mayoría de los casos es necesario utilizar una com-
binación de operaciones y procesos para alcanzar la 
eficiencia de remoción deseada [7]. 
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Gran parte de los contaminantes se remueven en 
forma de sólidos, lodos y biosólidos, los cuales in-
cluyen material grueso de las etapas preliminares y 
lodos orgánicos e inorgánicos, que deben ser trata-
dos, dispuestos y/o aprovechados. La aplicación de 
un tratamiento adecuado para los lodos de las Plan-
tas de Tratamiento de Aguas Residuales- PTAR busca 
resolver los problemas de contaminación, alteración 
de ecosistemas y desmejoramiento de la calidad de 
vida del ser humano, derivados de su producción. 
Adicionalmente, también se pretende generar ahorros 
significativos a nivel agrícola mediante el aprovecha-
miento de su potencial nutricional que depende del 
tipo de tratamiento que se les aplique [7]. 
La estabilización de la materia orgánica de los lodos 
de PTAR se puede lograr mediante tecnologías aero-
bias o anaerobias dentro de las cuales se destacan el 
compostaje y la lombricultura, que pueden ser viables 
debido a que este tipo de residuos contiene cantida-
des significativas de materia orgánica, nutrientes y oli-
goelementos (N, P, K, Ca, Fe, Mn). Es importante que 
el lodo presente ausencia o valores bajos de metales 
pesados para que no se inhiban los procesos biológi-
cos en los que se basan estas tecnologías [19].
El compostaje es el proceso de descomposición bio-
lógica de los constituyentes orgánicos de los residuos 
en el cual intervienen numerosos y variados microor-
ganismos que requieren de una humedad adecuada 
y sustratos orgánicos heterogéneos en estado sólido 
que son degradados para obtener al final una materia 
orgánica estabilizada, libre de fitotoxinas y dispuesta 
para su empleo en la agricultura sin provocar fenó-
menos adversos [3].
Desde el punto de vista químico, el compost ofrece 
grandes beneficios a los suelos debido a que tiene 
una capacidad de intercambio catiónico (CIC), sumi-
nistra nitrógeno, potasio y fósforo, aporta oligoele-
mentos como hierro, manganeso, zinc, boro, molib-
deno y cobre y contribuyendo a solubilizar algunos 
elementos minerales del suelo, facilitando su asimi-
lación por las plantas. Adicionalmente, la actividad 
biológica del suelo se ve favorecida por el aporte de 
bacterias que contribuyen a la descomposición de 
componentes minerales insolubles [12].
El proceso de compostaje es exotérmico, lo cual im-
plica que en la fermentación aerobia se produce mul-
tiplicación significativa de la población microbiana y 
un incremento acelerado de la temperatura que es 
importante para la destrucción de patógenos, cuya 
tasa de mortalidad esta en función de la misma y 
el tiempo; la mayoría de los patógenos son destrui-
dos rápidamente cuando todas las partes de la pila 
de compost están sometidas a una temperatura de 
aproximadamente 55°C [16]. 
Existen algunos hongos que pueden colonizar el com-
post y que son causantes de las mayores enferme-
dades en las plantas conocidos como fitopatógenos 
[5]. Botrytis sp es un hongo capaz de atacar semillas, 
plántulas, flor, tallo y residuos de cosechas; las con-
diciones ideales para su desarrollo son alta humedad 
relativa, agua libre sobre las plantas y temperatura 
menor a 25º C. Los síntomas se asemejan bastante a 
los causados por Rhizoctonia solani [11].
El género Fusarium sp se relaciona con enfermedades 
radiculares y de sistema vascular de muchas especies 
de plantas. Causan marchitez en varias especies de 
plantas y afectan algunas gramíneas. Algunas espe-
cies de este hongo tienen la capacidad de formar cla-
midosporas, además de las conidias a través de las 
cuales se diseminan [2].
Existen varias especies de Phytophthora sp que pueden 
matar a muchas plantas; viven en el suelo y cuando se 
dan las condiciones ideales colonizan las raíces y la 
zona del cuello de las plantas. La causa principal que 
activa al patógeno es el exceso de agua en el cultivo; 
su aislamiento se realiza en medio agar avena con 
una solución stock de antibiótico [9]; [15].
Rhizoctonia sp produce la pudrición de la raíz prin-
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cipalmente en plántulas jóvenes, con su posterior 
muerte. En plantas más maduras se observan lesiones 
acuosas grises en los pecíolos de la hoja y en las ve-
nas centrales cerca del suelo. [11]; [14]. 
El aislamiento de los hongos Botrytis sp, Fusarium sp, 
y Rhizoctonia sp se realiza en agar PDA, y la identi-
ficación con tinción de las esporas de reproducción y 
microoscopía.
Otro microorganismo patógeno tanto para los huma-
nos como para los animales es Salmonella sp impor-
tante desde el punto de vista de salud pública ya que 
es el agente causal de varias enfermedades infeccio-
sas como: fiebres entéricas, gastroenteritis, y fiebre ti-
foidea [1]. La presencia de este patógeno en el com-
post constituye un riesgo por la supervivencia después 
de su aplicación en el suelo y la contaminación de los 
cultivos que entran en contacto directo con él [1].
En el presente estudio se realizó la identificación de 
los hongos fitopatógenos Botrytis spp, Fusarium sp, 
Phytophthora sp y Rhizoctonia sp y Salmonella sp 
en el compost producido con lodo de la Planta de 
Tratamiento de Aguas Residuales de Cañaveralejo - 
PTAR-C. 
MATERIALES Y METODOS
La investigación se realizó en las instalaciones de la 
Planta de Tratamiento de Aguas Residuales de Ca-
ñaveralejo de la ciudad de Cali; el material evaluado 
fue obtenido a partir del compostaje aerobio del lodo 
proveniente de la sedimentación primaria de la PTAR-
C previamente espesado y deshidratado-LED. El estu-
dio se desarrolló en dos etapas, un ensayo preliminar 
que tuvo como objetivo la adaptación de las técnicas 
de aislamiento e identificación de hongos fitopatóge-
nos y Salmonella sp y un ensayo final que permitió la 
identificación de los microorganismos patógenos.
ENSAYO PRELIMINAR 
Análisis de fitopatogenicidad
El análisis de fitopatogenicidad consistió en el aisla-
miento microbiológico e identificación de especies 
relevantes que se encuentran contempladas en la nor-
ma ICONTEC NTC 5167 2003, para productos de la 
industria agrícola y materiales usados como fertilizan-
tes [10] y que establece que los productos orgánicos 
obtenidos a partir de materiales vegetales deberán 
garantizar la ausencia de los géneros de hongos fito-
patógenos Botrytis spp, Fusarium spp., Phytophthora 
spp., Rhizoctonia spp 
Para la identificación de estos microorganismos se 
preparó una muestra de compost macerado y se 
sembró en un medio de cultivo papa dextrosa agar 
(PDA) para los géneros Fusarium sp [2], Botrytis sp, [8] 
y Rhizoctonia sp [14] y en agar avena (AA) con una 
solución stock de antibiótico (penicilina 10 gr/20ml)) 
para Phytophthora sp [15]. 
Las diluciones empleadas fueron 10-6,10-7, 10-8 usan-
do siembra en superficie. La identificación se realizó 
después de un periodo de 8 días de incubación a 28 
°C. Posterior a la identificación se realizó la identifi-
cación macróscopica de las colonias crecidas, para 
purificarlas y llegar a la identificación microscópica. 
La Figura 1 muestra la metodología utilizada para el 
aislamiento de hongos fitopatógenos [13].
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Aislamiento de salmonella sp
Se realizó un preenriquecimiento en caldo de lactosa 
a 37 ºC por 48 horas y un posterior enriquecimiento. 
En la primera fase se evaluaron dos caldos, selenito 
cistina y tetrationato, adicionando 25 gr de muestra 
de compost a 225 ml de caldo lactosa y transfiriendo 
1 ml de está solución a 10 ml de cada uno de los cal-
dos seleccionados (tres tubos por muestra) y se incubó 
por un período de 48 horas a 37ºC. (etapa de 
enriquecimiento) [13].
La siembra en medio selectivos se realizó en 
superficie por agotamiento en un agar selec-
tivo; para esta fase se utilizaron dos medios 
de cultivo selectivos: bismuto sulfito (BS) y agar 
salmonella - shigella (SS) incubándose a 37ºC 
por 48 horas con el objetivo de obtener la me-
jor identificación de Salmonella sp [13].
La identificación de salmonella en el agar BS 
se logra al observar colonias pardas con el 
centro negro, borde claro y precipitado ne-
gro con brillo metálico. Este medio no permite 
identificar Salmonella paratyphi A y Salmonella 
pollorum [8]. 
La mayoría de Salmonellas no muestran coloración 
en el agar SS, las colonias transparentes con el centro 
negro corresponden a proteus y algunas salmonellas 
[8]. La Figura 2 muestra la metodología empleada 
para la identificación de Salmonella sp [13].
Figura 2. Metodología de aislamiento de Salmonella 
sp en el ensayo preliminar [13]
Figura 1. Metodología utilizada para el aislamiento de hongos fitopatógenos en el ensayo preliminar [13]
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Se realizó una identificación macroscópica por ca-
racterísticas de crecimiento y color; posteriormente se 
realizó una identificación microscópica de las esporas 
de reproducción mediante una tinción simple con azul 
de lactofenol. 
Aislamiento de salmonella sp 
Según los resultados del ensayo preliminar, se decidió 
emplear para el enriquecimiento el caldo tetrationato 
que fue el que mejor resultado presentó. La siembra en 
medio selectivo se realizó en superficie por agotamiento 
en agar Salmonella-Shigella (SS) ya que permitió una 
mejor identificación de las colonias. 
Se incubó a 37 ºC por 48 horas y la lectura de los re-
sultados se realizó de igual forma que en el ensayo pre-
liminar. La Figura 7 muestra la metodología usada en el 
aislamiento de Salmonella sp para el ensayo final [13].
ENSAYO FINAL
Aislamiento e identificación de hongos fitopató-
genos 
Los hongos patógenos se aislaron con base en los 
resultados obtenidos en el ensayo preliminar durante 
la estandarización del método de aislamiento, en el 
cual se definió emplear las diluciones 10-3, 10-4 y 
10-5. La Figura 6 muestra la metodología empleada 
en esta etapa del estudio para el aislamiento de hon-
gos fitopatógenos [13].
Figura 6. Metodología utilizada para el aislamiento 
de hongos fitopatógenos en el ensayo final [13]
Dado que en este ensayo se utilizaron diluciones ba-
jas, se pudieron aislar algunas colonias para reali-
zarles una purificación del cultivo para su posterior 
identificación. Una vez aisladas las colonias en los 
distintos medios, se procedió a la purificación de las 
mismas realizando tres pases a sus respectivos me-
dios, para la identificación microscópica de las espo-
ras de reproducción. 
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RESULTADOS Y DISCUSIÓN
ENSAYO PRELIMINAR
Hongos fitopatógenos 
Las diluciones seleccionadas para el ensayo (10-6,10-7 
y 10-8) fueron muy altas y por tal razón el aislamiento 
para identificación de hongos fitopatógenos no fue 
posible; sin embargo, este análisis preliminar permitió 
determinar que el rango de diluciones adecuado para 
el ensayo final debía ser de 10-3, 10-4 y 10-5. Paralelo 
al estudio de identificación se realizó la evaluación 
del potencial agrícola de este compost en un cultivo 
de rábano, y no se presentó ninguna sintomatología 
de las enfermedades causadas por la presencia de 
hongos fitopatógenos [17].
Salmonella sp
En el análisis de presencia de Salmonella sp utilizan-
do el medio selectivo agar Salmonella-Shigella (SS) 
se encontró que las colonias positivas fueron de fácil 
identificación en comparación con el medio agar bis-
muto sulfito, por lo tanto, se recomienda la utilización 
de agar SS para la siembra en agar selectivo. La pre-
sencia de Salmonella sp en el compost fue positiva, 
los resultados mostraron el crecimiento de colonias 
transparentes con el centro negro y las coloniasinco-
loras en medio Agar SS.
ENSAYO FINAL
Hongos fitopatógenos 
Los resultados mostraron que el único genero de 
patógenos detectado en el compost fue Fusarium sp, 
relacionado con enfermedades radiculares de mu-
chas especies de plantas. En un estudio simultáneo 
de evaluación del potencial agrícola de este compost 
en rábano y acelga, se encontró que este hongo hace 
parte de los microorganismos nativos del suelo, por 
lo tanto, se recomienda realizar tanto la identificación 
como la cuantificación de estos microorganismos 
para lograr determinar el verdadero impacto en los 
cultivos [17]. 
Aunque el análisis de fitopatógenos mostró la presen-
cia de Fusarium sp. en el compost y en el suelo no se 
observaron síntomas de enfermedad en las especies 
Figura 7. Metodología de aislamiento de Salmonella sp para el ensayo final [13]
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vegetales evaluadas lo que puede deberse a que las 
concentraciones del hongo presente en los tratamien-
tos no son suficientes para presentar sintomatología 
[17].
Salmonella sp.
Del mismo modo que para el analisis de hongos fito-
pátogenos, las muestras de compost y suelo mostraron 
la presencia de Salmonella sp, indicando una posible 
contaminación. La presencia de este patógeno en el 
suelo indica que puede hacer parte de los microorga-
nismos del mismo; sin embargo, sería recomendable 
realizar su cuantificación para definir en qué concen-
traciones puede llegar a convertirse en un problema 
de salud pública. El tiempo de sobrevivencia de Sal-
monella sp en el suelo puede variar entre 15 a 280 
días [4], este periodo debe tenerse en cuenta para la 
aplicación de un compost al suelo. 
CONCLUSIONES Y RECOMENDACIONES
Las metodologías usadas para la determinación de 
hongos fitopatógenos y Salmonella sp. mostraron que 
las diluciones más adecuadas para el aislamiento de 
hongos fitopatógenos en las muestras de compost 
evaluadas fueron 10-3, 10-4, 10-5 y el medio más 
apropiado para la identificación de Salmonella sp fue 
el agar Salmonella-Shigella.
La identificación de hongos fitopatógenos mostró que 
de los cuatro géneros evaluados, el único presente 
fue el Fusarium sp; sin embargo, su presencia no cau-
só enfermedades en la evaluación agrícola.
Se recomienda realizar la cuantificación de los hon-
gos fitopatógenos presentes en un compost para de-
finir en qué concentración el hongo pueden causar 
enfermedades que afecten los cultivos.
Se recomienda realizar estudios de fitopatogenicidad 
usando especies vegetales susceptibles a las enferme-
dades causadas por hongos fitopatógenos.
Se recomienda realizar tanto análisis de presencia 
como la cuantificación del patógeno Salmonella sp 
en el suelo para definir el tiempo de permanencia y la 
concentración en la que pueda llegar a convertirse en 
un problema de salud pública.
Se recomienda la higienización del compost produ-
cido con lodos de plantas de tratamientos de aguas 
residuales con el objetivo de reducir los potenciales 
riesgos a los cultivos y a la salud pública por el con-
sumo de alimentos contaminados por este tipo de mi-
croorganismos.
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