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Articulación Básico Clínico Comunitaria 1 2021 Módulo N° 1. Estructura y propiedades de las principales biomoléculas Pag.1 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Estructura y propiedades de las principales biomoléculas Objetivos del módulo Describir la estructura de las principales biomoléculas y las principales características fisicoquímicas que les permiten realizar sus funciones. Comprender de mandera básica e integrada de las propiedades del agua. Conocer la estructura química, propiedades y clasificación de los carbohidratos. Estudiar las características del enlace glucosídico y las variaciones estructurales de los monosacáridos. Definir y conocer la función biológica de los glúcidos. Conocer la conformación, variabilidad estructural y clasificación de los lípidos de importancia biológica. Estudiar las características bioquímicas de cada grupo de lípidos y relacionarlas con su rol biológico. Estudiar las características bioquímicas de las proteínas y relacionarlas con su rol biológico. Estudiar las características del enlace peptídico y otras interacciones entre aminoácidos Estudiar los niveles de organización estructural y la importante relación estructura-función. Contenidos Bases químicas de la vida. Bioelementos. Tipos de enlaces que forman las biomoléculas. El agua como solvente. Propiedades químicas del agua y sus características. El agua en las soluciones (iones). pH. Principales biomoléculas: aminoácidos, carbohidratos, lípidos, ácidos nucleicos. Carbohidratos: estructura, formas de representación, principales funciones. Clasificación de los carbohidratos. El enlace Glucosídico. Derivados de monosacáridos. El rol biológico de los carbohidratos. Lípidos: variabilidad estructural. Funciones. Clasificación de los lípidos. Proteínas: estructura y función. Bibliografía Albert L. Lehninger. Principios de Bioquímica (2014). 6ta edición. Alberts, B., Bray, D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., Watson, J.D. (2002). Biología Molecular de la Célula (3° ed.). Ediciones Omega, Barcelona. Barrett, K.E., Barman, S.M., Boitano, S., Brooks, H. (2015). Ganong's Review of Medical Physiology (25° ed.). McGraw-Hill, New York. Blanco, A., Blanco, G. (2016). Química biológica (10° ed.). El Ateneo, Buenos Aires Curtis H., S. Barnes, A. Schnek y A. Massarini (2008). Curtis Biología. Séptima edición en español. Editorial Médica Panamericana. Buenos Aires. Pag.2 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 González Corbellao, M.J. (2006). El agua: Hidratación y salud. Ámbito Farmaceutico. OFFARM, 25:8. Noriega Borge MJ., Pérez JM. (2011). Fisiología General Open Course Ware, Universidad de Cantabria. Disponible en https://ocw.unican.es/course/view.php?id=94 Nelson D.L., Cox, M.M. (2014). Lehninger: Principios de Bioquímica (6° ed.). Ediciones Omega, Barcelona. Tortora, G. J., Derrickson, B. (2013). Principios de Anatomía y Fisiología (13° ed.). Editorial Medica Panamericana, Buenos Aires. Trudy Mckee. Bioquímica. Las bases moleculares de la vida. Editorial. (5ta edición) Mcgraw-Hill Interamericana Pag.3 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Estructura y propiedades de las principales biomoléculas En este módulo analizaremos la estructura y propiedades de las principales biomoléculas. Compartirán como objetivo general proporcionar la información necesaria acerca de la química de la vida y la naturaleza de las moléculas biológicas (biomoléculas) para comprender las bases de la vida. Primero se analizan los bioelementos, los tipos de enlaces que pueden formarse entre los átomos, el rol del agua, y desarrollaremos carbohidratos, lípidos, proteínas y nucleótidos. En un nivel ascendente de complejidad, es imposible comenzar a comprender la fisiología celular sin un conocimiento razonable de la estructura y propiedades de los tipos principales de moléculas biológicas. Inicio de un continuo que los llevará a comprender los niveles de organización, sus propiedades emergentes, la homeostasis, el metabolismo, la comunicación celular, la regulación neuroendócrina, desde una perspectiva integral/sistémica. Saberes que le permitirán develar las bases para comprender las dimensiones anatomo fisiológicas y fisiopatológicas de sistemas más complejos (tejidos, órganos, aparatos, sistemas, individuos, comunidades y ecosistemas). Tenemos el desafío de superar las limitaciones que tiene la enseñanza de la bioquímica como conocimiento aislado, descontextualizado, que favorece la formación de un médico con mirada reduccionista y mecanisista. Otro desafío es la utilización de TICs, consolidando las nuevas tecnologías y métodos educativos con énfasis en el constructivismo del proceso enseñanza aprendizaje. ¿Qué es un ser vivo? Una de las definiciones más simples que hay es la siguiente: “Los seres vivos son aquellos organismos que nacen, crecen, se desarrollan, se reproducen, envejecen y mueren”. Pag.4 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Los seres vivos son sistemas altamente organizados y complejos que obedecen a las leyes de la física y la química, pero presentan propiedades que no pueden ser anticipadas a partir de sus componentes individuales (átomos y moléculas). Los seres vivos funcionan como un sistema abierto que intercambia sustancias y energía con el medio externo. Las sustancias que ingresan en un organismo se incorporan a una red de reacciones químicas en las que son degradadas o usadas como unidades para la construcción de compuestos más complejos. El conjunto de reacciones químicas y de transformaciones de energía, incluidas la síntesis y la degradación de moléculas, constituyen el metabolismo. La capacidad para mantener un medio interno estable es la propiedad crucial para la vida. Los seres vivos también intercambian información y responden a condiciones ambientales. Una de las características más notables de los seres vivos es su capacidad de reproducirse. Los organismos atraviesan un ciclo vital en el cual crecen, se desarrollan y se reproducen. Durante este ciclo, los organismos se transforman. La reproducción ocurre con una fidelidad sorprendente, pero produce variaciones que suministran la materia prima sobre la que ocurre la evolución. de Curtis H., S. Barnes, A. Schnek y A. Massarini (2008). Curtis Biología. 7ma Ed. "…la vida consiste en la habilidad de un sistema para mantenerse lejos del equilibrio, crecer y multiplicarse, con la ayuda de un continuo flujo de energía y de materia provistos por el medio ambiente" de Christian de Duve, premio Nobel de Medicina (1996). Pag.5 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Niveles de organización de los seres vivos Composición del ser Humano Intentaremos evitar caer en la descripción escalonada, atendiendo al carácter sistémico de los niveles, y como tales, compuestos por determinados elementos, con determinadas interacciones, con una organización particular y una serie de atributos emergentes que les son propios (propiedades emergentes). Las estructuras que forman parte de cada uno de estos niveles se organizan dando lugar a estructuras más complejas que forman parte del nivel inmediatamente superior, las cuales desempeñan funciones y presentan propiedades que pueden no aparecer en los niveles inferiores; estas funciones y propiedades "nuevas" emergen como fruto del mayor grado de organización y complejidad que presentan los niveles superiores, de la interacción mutua entre las estructuras constituyentes de cada nivel, como una expresión más, en definitiva, de la vieja frase: "el todo es más que la suma de las partes". Subatómico Primarios 99,3% C-H-N-O Atómico Bioelementos Secundarios 0,07% K-Na-Cl-Ca- P-S-Fe-Mg OligoelementosMn-I-Zn- 0,01% Cu-F Abióticos Carbohidratos Inorgánicas Agua Molecular Lípidos Orgánicas Biomoléculas Proteínas Niveles de organización de la vida Complejos Macromole- culares Membranas Nucleótidos Organelas Celular Tejidos Pluricelular Órganos Individuo Sistemas Bióticos Población Comunidad Ecosistema Biosfera Pag.6 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 El cuerpo humano, como otros seres vivos, está organizado en su forma y función a diferentes niveles desde el químico o molecular hasta el de la célula que es la unidad funcional de los seres vivos. Las células se agrupan para constituir los tejidos, y los tejidos realizan, gracias a esa asociación de células similares, funciones características; por ejemplo, el tejido muscular, formado por células musculares, se contrae. Los tejidos a su vez se asocian y forman órganos, que podemos definir como la agrupación de diferentes tejidos para realizar una función concreta, por ejemplo, el corazón formado por tejido muscular, por tejido conjuntivo, epitelial, etc., se contrae para bombear la sangre. Finalmente, la agrupación de diferentes órganos, cada uno con sus funciones propias, da lugar a los sistemas o aparatos, que realizan funciones complejas y que desde el punto de vista funcional representan un grado superior al del órgano. Los niveles de organización son útiles para establecer un método de estudio, cuestión absolutamente necesaria habida cuenta del gran desarrollo alcanzado en el conocimiento de los seres vivos; lo cual obliga a fragmentar su estudio, pero sin obviar en ningún caso las profundas interrelaciones entre las diferentes materias que lo estudian. Nos enfocaremos en los bioelementos, sus interacciones, las biomoléculas y sus propiedades emergentes. Los átomos están compuestos por partículas más pequeñas (subatómicas). El núcleo del átomo contiene protones, que tienen carga positiva, y neutrones, que no poseen carga. El núcleo está rodeado por una nube de electrones con carga negativa. El número de electrones de un átomo es igual al número de protones de su núcleo. Las propiedades químicas de un átomo están determinadas por el número y la disposición de sus electrones. Un átomo alcanza estabilidad máxima cuando todos sus electrones están en un nivel energético más bajo posible y cuando cada orbital electrónico está completamente lleno. Pag.7 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Composición química del ser humano: bioelementos Los elementos químicos que forman parte de los seres vivos se denominan globalmente bioelementos, o elementos biogénicos, y son integrantes comunes de la corteza terrestre, si bien se encuentran en proporciones muy diferentes a las que se presentan en la materia orgánica. A la hora de su estudio y clasificación pueden adoptarse numerosos criterios, y uno de los más simples es la proporción con la que aparecen en los seres vivos. Así se distinguen: 1. Bioelementos primarios: Hidrógeno (H), Oxígeno (O), Carbono (C) y Nitrógeno (N). Constituyen globalmente, el 99,3 % del total, y de los cuatro mencionados el H en primer lugar y el O en segundo lugar, bajo la forma conjunta de la molécula de agua, son los que se presentan en mayor abundancia. 2. Bioelementos secundarios: Potasio (K), Sodio (Na), Cloro (Cl), Calcio (Ca), Fósforo (P), Azufre (S), Hierro (Fe) y Magnesio (Mg) que constituyen el 0,7 % del total. 3. Bioelementos traza u oligoelementos: Manganeso (Mn), Iodo (I), Zinc (Zn), Cobre (Cu), Flúor (F) y otros. En cantidades pequeñísimas, menos del 0,01%, pero de gran importancia funcional, ya que su presencia es absolutamente imprescindible para el normal desarrollo de los procesos vitales. En su mayor parte, los bioelementos se sitúan en la primera mitad del sistema periódico, es decir entre los elementos más ligeros, diferenciándose así de los elementos químicos que constituyen el mundo mineral. El hecho de que la materia orgánica se haya construido básicamente sobre estos cuatro elementos primarios, y no otros, radica en las ventajas que presentan sobre el resto de los elementos químicos de la Tabla Periódica, dentro de las cuales merecen apreciarse las siguientes: Pag.8 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 1. Son los elementos más ligeros capaces de establecer enlaces fuertes, sus estructuras electrónicas facilitan la formación de enlaces covalentes, que son enlaces firmes y estables para la construcción de moléculas. 2. Dentro de los mismos, el carbono presenta la particularidad de ser el elemento con la capacidad de formar el mayor número de enlaces fuertes, lo que le permite formar moléculas grandes, complejas y extraordinariamente variadas. 3. La capacidad de estos átomos de formar otros tipos de enlaces, posibilita la aparición de grupos ampliamente heterogéneos, que podrán desarrollar múltiples funciones. Los átomos de carbono desempeñan una función importante en la formación de las moléculas biológicas. Cada átomo de carbono tiene capacidad para establecer enlaces hasta con cuatro átomos, que pueden ser otros átomos de carbono. Esta propiedad le permite formar moléculas grandes cuyo esqueleto consiste en una cadena de átomos de carbono. Las moléculas que sólo contienen hidrógeno y carbono se denominan hidrocarburos. La mayor parte de las moléculas de importancia biológica posee grupos funcionales que incluyen uno o más átomos electronegativos que tornan a la molécula más polar, hidrosoluble y reactiva. Los bioelementos se unen para formar biomoléculas, también denominadas principios inmediatos. En los seres vivos las moléculas se caracterizan por presentar una gran diversidad, a diferencia del mundo inorgánico que es mucho más uniforme y monótono. Las biomoléculas desarrollan funciones muy variadas, desde un papel estructural o arquitectónico, consistente en el mantenimiento de la morfología del organismo; a una función energética, para sostener las funciones vitales, o bien una actividad reguladora o de control ajustando todos los requerimientos de materia, energía e información para el organismo. De Lehninger, Principios de Bioquímica. La versatilidad de enlace del carbono puede formar enlaces covalentes simples, doble y triples; en particular con otros átomos de carbono. Tipos de enlaces que forman las biomoléculas Los átomos se enlazan entre sí dando lugar a las moléculas mediante dos tipos de uniones o enlaces químicos: enlaces iónicos y enlaces covalentes. Pag.9 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 El enlace iónico resulta de la transferencia de electrones, como, por ejemplo, en el caso del cloruro de sodio (NaCl), que es la sal común de mesa. Si observamos la tabla periódica de los elementos, veremos que el Na (sodio) tiene un electrón en su capa más externa y 8 en la anterior. En el caso del Cl (cloro), veremos que tiene 7 electrones en su capa más externa. Si el Cl gana un electrón y el Na pierde un electrón, ambos quedan con su octeto completo en la capa externa. Esta es la transferencia electrónica a la que nos referimos cuando hablamos de enlace iónico. Los enlaces covalentes mantienen unidos los átomos para formar moléculas. Los enlaces covalentes son estructuras estables que se forman cuando los átomos comparten los electrones de su capa externa, de manera que cada uno completa dicha capa. Los enlaces covalentes pueden ser simples, dobles o triples, según sea el número de pares de electrones compartidos. El enlace covalente es el enlace característico de los compuestos del carbono, por lo tanto, el que estará presente en todas las biomoléculas, como el agua. Si los electrones que forman el enlace se comparten modo desigual, el átomo con mayor fuerza de atracción (el más electronegativo) posee carga parcial negativa, entanto que el otro átomo adquiere carga parcial positiva. Las moléculas sin enlaces polarizados son no polares o hidrófobas e insolubles en agua. Las moléculas con enlaces polarizados son polares o hidrófilas y solubles en agua. Las moléculas polares de importancia biológica contienen uno o más átomos electronegativos, por lo general O, N, S o P. Pero, ¿qué tipo de fuerzas mantienen unidas a las moléculas neutras? Son las llamadas fuerzas intermoleculares, que son de naturaleza electrostática, es decir que cargas positivas atraen a cargas negativas. No sólo se establecen entre moléculas individuales, sino que pueden generarse entre partes de una misma macromolécula (normalmente entre grupos funcionales) dando lugar a la estructura tridimensional o espacial característica del compuesto. Estas fuerzas tienen una función clave al mantener la estructura de las moléculas biológicas y mediar sus actividades dinámicas. La importancia de estos enlaces no radica en la fuerza de los mismos, que es pequeña, sino en el elevado número que puede establecerse, y que proporciona una gran fortaleza y estabilidad. H H O Pag.10 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Los principales tipos de fuerzas intermoleculares son: Enlaces o puentes de hidrógeno: en el cual un átomo de hidrógeno sirve como puente entre dos átomos electronegativos, unido a uno de ellos por un enlace covalente, y al otro por fuerzas puramente electrostáticas. Son las interacciones más fuertes Interacción dipolo-dipolo: Es la atracción que ejerce el extremo positivo de una molécula polar por el negativo de otra. Fuerzas de van der Waals: Son interacciones débiles que aparecen a distancias cortas entre dos átomos debido a la fluctuación de las cargas eléctricas, aunque la distancia si se hace muy corta da lugar a una repulsión en vez de una atracción. En los procesos que determinan la estructura tridimensional de muchas macromoléculas, tales como las proteínas, que se mueven en medio acuoso, son importantes las interacciones hidrofóbicas (repelen el agua) o hidrofílicas. Interacciones hidrofóbicas: el agua intenta mantener su estructura lo más regular y organizada posible, las moléculas no polares o hidrófobas interrumpen esta red acuosa y la repulsión que ejerce el agua sobre las mismas, las obliga a agruparse. En nuestro cuerpo, formado mayoritariamente por agua, para que las biomoléculas puedan fluir, exponen sus grupos hidrofílicos al entorno acuoso y “esconden” sus grupos hidrofóbicos hacia el interior de la molécula. Ejemplos de los tipos de interacciones no covalentes incluyen la vinculación del DNA y proteínas mediante enlaces iónicos, la complementación de las cadenas del DNA a través de puentes de hidrógeno, y la formación del núcleo hidrófobo en las proteínas solubles como resultado de las interacciones hidrófobas y las fuerzas de van der Waals. Grupos funcionales Las moléculas más sencillas derivadas del carbono son las construidas con este elemento e hidrógeno, denominadas hidrocarburos. Estos compuestos son muy estables, y servirán como base de la que derivarán las biomoléculas. La capacidad de los átomos de carbono de formar enlaces entre ellos, Pag.11 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 permite la creación de cadenas lineales, ramificadas o cíclicas de hidrocarburos, que se diferenciarán además por poseer distintos grupos funcionales. Los grupos funcionales son átomos o conjuntos de átomos cuya posesión por parte de un hidrocarburo le confiere una serie de propiedades físico- químicas características. Los que se encuentran frecuentemente en las biomoléculas son los hidroxilos, que dan lugar a los alcoholes; los carbonilo, que dan aldehídos y cetonas; los carboxilo, que dan ácidos; los amino, que dan aminas; los esteres que dan lugar a un grupo de compuestos del mismo nombre, ésteres; los éteres, etc. Grupos funcionales de compuestos orgánicos Muchos de estos grupos pueden coincidir sobre la misma biomolécula, aportando cada uno de ellos sus propias características y enriqueciendo la heterogeneidad de las mismas. La molécula de agua Como hemos visto, las moléculas de agua se mantienen unidas por enlaces covalentes polares entre un oxígeno y dos átomos de hidrogeno. La polaridad de los enlaces covalentes de la molécula de agua resulta de la fuerte tendencia del oxígeno a adquirir electrones de otros átomos, en este caso, el hidrogeno. Esta alta electronegatividad provoca que los electrones de los dos átomos de hidrogeno en la molécula de agua ocupen posiciones estadísticamente más cercanas al átomo oxigeno que al átomo de hidrogeno. El enlace que se forma entre el O-H es en un 40% de carácter iónico, lo que deja a la molécula de agua con una distribución de carga distribuida de forma asimétrica. Pag.12 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Esto último produce la repulsión mutua de los núcleos de hidrogeno cargados positivamente, que tienden a apartarse generando un ángulo de 104.5° entre los dos enlaces O-H en la molécula de agua (como se muestra en la figura, donde representa la carga parcial de cada átomo), en lugar de lo 90° que se esperan para un enlace puramente covalente. Debido a la naturaleza semipolar de O-H enlaces, el agua difiere mucho, tanto química como físicamente, de otros hidruros relacionados, como por ejemplo el ácido sulfhídrico (H2S). ¿Por qué es esto? La distribución desigual de los electrones en la molécula de agua hace que actúe como un dipolo. Como hemos visto, la molécula de agua tiende a alinearse con un campo electrostático. Así, la característica química más importante del agua es su capacidad para formar puentes de hidrógeno entre los protones (H+) cargados positivamente de una molécula de agua y el átomo de oxígeno rico en electrones cargado negativamente de las moléculas de agua cercanas. Como también hemos visto, en cada molécula de agua, cuatro de los ocho electrones en la capa externa del átomo de oxígeno están unidos covalentemente con los dos átomos de hidrógeno. Esto deja dos pares de electrones libres para interactuar electrostáticamente (es decir, para formar puentes de hidrógeno) con los átomos de H pobres en electrones de las moléculas de agua cercanas. Dado que el ángulo entre los dos enlaces covalentes de agua es de aproximadamente 105°, los grupos de moléculas de agua unidas por hidrógeno forman disposiciones tetraédricas. Esta disposición es la base de la estructura cristalina de la forma más común de hielo. Pag.13 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Estructura tetraédrica del agua Propiedades del agua La estructura relacionada a los puentes de hidrogeno del agua es altamente lábil y transitoria, ya que el tiempo de relación entre enlaces de hidrógeno en el agua líquida es de aproximadamente 10-10 segundos, algo así como 0.0000000001 segundos. Esta transitoriedad se debe a la naturaleza relativamente débil del puente de hidrógeno. Sólo se necesitan 4.5 kcal de energía para romper los puentes de hidrogeno de un mol de agua, mientras que se requieren 110 Kcal romper los enlaces covalentes entre oxigeno e hidrogeno dentro de la molécula de agua. Como resultado de la debilidad de los puentes de hidrógeno, ningún grupo específico de moléculas de H2O permanece unido al hidrógeno por más de un breve instante. A pesar de la modesta fuerza entre los puentes de hidrogeno, se necesita una alta energía para separar las moléculas de agua individuales del resto de la población. Esta característica tiene una gran importancia en muchos procesos fisiológicos, como la termorregulación o en eventos mecánicos como en la respiración. El agua como solvente El agua tiene propiedades únicas que mantienen la vida. El carácter polar de las moléculas de agua condiciona las interacciones con las de otrassustancias que entren en relación con ellas. Evidentemente, estas interacciones dependen también de las características de las otras sustancias. Dentro de los sistemas vivos, muchas sustancias se encuentran en solución acuosa. Una solución es una mezcla uniforme de moléculas de dos o más sustancias. La sustancia presente en mayor cantidad, que es habitualmente líquida, se llama solvente, y las sustancias presentes en cantidades menores se llaman solutos. Por ejemplo, el sudor es una solución diluida de agua (el solvente) mas pequeñas cantidades de sales (los solutos). La versatilidad del agua como solvente de sustancias ionizadas o polares se debe a sus enlaces covalentes polares que permite que cada molécula de agua interactúe Pag.14 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 con varios iones o moléculas adyacentes. En otras palabras, la polaridad de las moléculas de agua es la responsable de la capacidad solvente del agua. Las moléculas polares de agua tienden a separar sustancias iónicas, como el cloruro de sodio (NaCl), en sus iones constituyentes. Las moléculas de agua se aglomeran alrededor de los iones con carga y los separan unos de otros. El agua disuelve muchas sales cristalinas hidratando los iones que la componen. La red cristalian del cloruro de sodio (NaCl) se destruye a medida que moléculas de agua se agrupan alrededor de los iones Cl y Na. Por otro lado, muchas de las moléculas importantes en los sistemas vivos que presentan uniones covalentes, como los azúcares, tienen regiones de carga parcial positiva o negativa. Estas moléculas, por lo tanto, atraen moléculas de agua y también se disuelven en agua. A riesgo de ser repetitivos, las moléculas polares que se disuelven rápidamente en agua son llamadas hidrofílicas. Estas moléculas se disuelven fácilmente en agua porque sus regiones parcialmente cargadas atraen moléculas de agua tanto o más que lo que se atraen entre sí. Moléculas tales como las grasas, que carecen de regiones polares, tienden a ser muy insolubles en el agua. Los puentes de hidrógeno entre las moléculas de agua actúan como una fuerza que excluye a las moléculas no polares. Como resultado de esta exclusión, las moléculas no polares tienden a agruparse en el agua. Dichas moléculas son llamadas hidrofóbicas y los agrupamientos se producen por interacciones hidrofóbicas. Pag.15 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 La capacidad del agua para formar soluciones es esencial para la salud y la supervivencia. Como el agua puede disolver tantas sustancias diferentes, es un medio ideal para las reacciones metabólicas. El agua también disuelve los productos de desecho, lo que permite su eliminación por orina. Muchos de estos mecanismos los veremos mucho más adelante en la carrera, así que no entraremos en detalle aquí. El agua como electrolito En el agua líquida hay una leve tendencia a que un átomo de hidrógeno salte del átomo de oxígeno al que está unido covalentemente, al otro átomo de oxígeno al que se encuentra unido por un puente de hidrógeno. En esta reacción se producen dos iones, el ion hidrogeno o protón (H+) y el ion hidróxido (OH-). Cuya reacción es la siguiente: Aquí les dejamos una aclaración muy importante, la existencia del protón como tal no es correcta porque el protón reacciona rápidamente con moléculas de agua formando el ion hidronio (H3O+). A fines prácticos, siempre nos vamos a referir al protón como entidad correcta en este tipo de reacciones. En cualquier volumen dado de agua pura se encuentra ionizado de esta forma un número pequeño, pero constante, de moléculas de agua. El número es constante porque la tendencia del agua a ionizarse se contrapesa con la tendencia de los iones a reunirse. Así, aunque algunas moléculas están ionizándose, un número igual de otras moléculas está formándose; este estado se conoce como equilibrio dinámico. Es decir, que las moléculas que se ionizan a un tiempo determinado son las mismas que se reunifican. El concepto de pH Pag.16 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Sin entrar mucho en detalle de como el agua actúa como solvente de diferentes sustancias como los ácidos, las bases y las sales inorgánicos; los cuales se disuelven en agua, es decir, se disocian en iones que son rodeados por moléculas de agua; analizaremos una medida de la cantidad de iones de agua que pueden existir en una solución. Tal vez, ya nombrado y conocido, una variable comúnmente utilizada para referir a la concentración de H+ es el pH. ¿Por qué H+ y no OH-?. Simplemente, como el producto iónico del agua (H+ y OH-) tiene una magnitud constante a determinada temperatura, basta con conocer la concentración de uno de los iones pada deducir la del otro. Propuesto en 1909, se propuso utiliza la concentración de H+ como estimador del grado de ionización del agua, estableciendo el pH como indicador de la concentración de H+. Ahora, ¿por qué no referirnos directamente a la concentración de H+ ([H+]) en lugar de pH?. Básicamente, las concentraciones de H+ son tan pequeñas que se necesitó una transformación matemática para hacerlo menos engorroso. En el agua pura a 25°C tenemos una [H+] igual a la de [OH-] siendo 10-7 molar, es decir un numero con muchos ceros después de la coma. Para facilitar el análisis se aplica una regla que el pH es igual a: Así, acomodando un poco los términos matemáticos obtenemos que el pH de esa solución de agua pura es 7 (el pH neutro). Este es un estado neutro. Cualquier pH por debajo de 7 es ácido y cualquier pH por encima de 7 es básico. Cuanto menor sea el valor del pH, mayor será la concentración de iones hidrógeno. Dado que la escala de pH es logarítmica, una diferencia en una unidad de pH implica una diferencia de 10 veces en la concentración de iones hidrógeno. Por ejemplo, una solución de pH 3 tiene 1.000 veces más iones H+ que una solución de pH 6. Pag.17 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Casi toda la química de los seres vivos tiene lugar a pH entre 6 y 8. Como excepciones notables podemos mencionar los procesos químicos en el estómago de los humanos y otros animales, que tienen lugar a pH de aproximadamente 2. La sangre humana, por ejemplo, mantiene un pH casi constante de 7,4, a pesar del hecho de que es el vehículo de gran número y variedad de nutrientes y otros compuestos químicos que reparte entre las células, así como de la eliminación de desechos, muchos de los cuales son ácidos y bases. La mayor parte de los procesos biológicos son muy sensibles al pH porque los cambios en la concentración del ion hidrógeno alteran el estado iónico de las moléculas biológicas. Las células mantienen un pH citosólico cercano a 7. Para ello disponen de tampones fisiológicos (llamados también amortiguadores o buffers), sistemas acuosos que mantienen el pH cuando se agregan pequeñas cantidades de ácidos o bases. Agua en las reacciones químicas El agua sirve como medio para la mayoría de las reacciones químicas del cuerpo y participa como reactivo o producto en ciertas reacciones. En las reacciones en las cuales se agrega agua se denominan hidrolisis. Este tipo de reacciones son comunes en reacciones de descomposición, donde se rompen grandes moléculas, en moléculas más pequeñas por el agregado de moléculas de agua. En la digestión, es común observar reacciones de hidrólisis. Por otro lado, las reacciones de síntesis por deshidratación se dan cuando dos moléculas pequeñas se unen para formar una molécula más compleja y que uno de los productos formados es una molécula de agua. Ya hemos visto reacciones en las cuales se forman proteínas. Este tipo de reacción es un ejemplo de síntesis por deshidratación. Propiedades térmicas del agua Pag.18 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 En comparación con la mayoría de las sustancias,el agua puede absorber o liberar una cantidad relativamente grande de calor con solo un cambio modesto de su propia temperatura. Por este motivo, se dice que el agua tiene una alta capacidad térmica. Esta propiedad se debe a la gran cantidad de enlaces de hidrogeno del agua. A medida que el agua absorbe energía térmica, parte de la energía se utiliza para romper enlaces de hidrogeno. Esta particularidad es muy importante cuando queremos disminuir la temperatura del cuerpo, por ejemplo, cuando hacemos ejercicio. El agua requiere una gran cantidad de calor para cambiar de estado líquido a gaseoso. Su calor de vaporización es alto. A medida que el agua se evapora de la superficie de la piel, elimina una gran cantidad de calor, lo que representa un mecanismo de enfriamiento importante. Por otro lado, la gran cantidad de agua del cuerpo, reduce la repercusión de los cambios de temperatura ambiental, lo que ayuda a mantener la homeostasis de la temperatura corporal. Grupos funcionales en las biomoléculas Las moléculas más sencillas derivadas del carbono son las construidas con este elemento e hidrógeno, denominadas hidrocarburos. Estos compuestos son muy estables, y servirán como base de la que derivarán las biomoléculas. La capacidad de los átomos de carbono de formar enlaces entre ellos, permite la creación de cadenas lineales, ramificadas o cíclicas de hidrocarburos, que se diferenciarán además por poseer distintos grupos funcionales. Los grupos funcionales son átomos o conjuntos de átomos cuya posesión por parte de un hidrocarburo le confiere una serie de propiedades físico- químicas características. Los que se encuentran frecuentemente en las biomoléculas son los hidroxilos, que dan lugar a los alcoholes; los carbonilo, que dan aldehídos y cetonas; los carboxilo, que dan ácidos; los amino, que dan aminas; los esteres que dan lugar a un grupo de compuestos del mismo nombre, ésteres; los éteres, etc. Muchos de estos grupos pueden coincidir sobre la misma biomolécula, aportando cada uno de ellos sus propias características y enriqueciendo la heterogeneidad de las mismas. Pag.19 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Grupos funcionales de compuestos orgánicos Las moléculas biológicas Son miembros de cuatro grupos importantes: carbohidratos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. Los carbohidratos incluyen a los azúcares simples y grandes moléculas (polisacáridos) elaboradas con monómeros de azúcar. Los carbohidratos funcionan de manera primaria como almacén de energía química y como material durable para la construcción biológica. Los azúcares simples de importancia biológica se integran con esqueletos de tres a siete átomos de carbono, con cada carbono unido a dos grupos hidroxilo menos uno, que posee un grupo carbonilo. Los azúcares con cinco o más átomos de carbono reaccionan de modo espontáneo para crear moléculas en forma de anillo. Los azúcares se unen entre sí mediante enlaces glucosídicos para formar disacáridos, oligosacáridos y polisacáridos. En animales el azúcar se almacena sobre todo como glucógeno, un polisacárido ramificado que constituye una fuente de energía rápidamente disponible. En las plantas, las reservas de glucosa se almacenan como almidón, una mezcla de amilosa no ramificada y amilopectina ramificada. La mayor parte de los azúcares, tanto glucógeno como almidón, se unen por medio de enlaces α (1 → 4). Pag.20 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Los lípidos son un ordenamiento diverso de moléculas hidrófobas que tienen diferente estructura y funciones. Las grasas se conforman con moléculas de glicerol esterificado a tres ácidos grasos. Los ácidos grasos difieren en la longitud de su cadena, número y posición de sus enlaces dobles (sitios de insaturación). Las grasas son muy ricas en energía química; un gramo de grasa contiene más de dos veces la energía que posee un gramo de carbohidrato. Los esteroides son un grupo de lípidos que contienen un esqueleto hidrocarbonado característico de cuatro anillos. Entre los esteroides se incluye al colesterol así como a diferentes hormonas (p. ej., testosterona, estrógeno y progesterona), que se sintetizan a partir del colesterol. Los fosfolípidos son moléculas lipídicas que contienen fosfato, poseen extremos hidrófilos e hidrófobos y desempeñan un papel importante en la estructura y función de las membranas celulares. Las proteínas son macromoléculas con funciones diversas constituidas por aminoácidos unidos por enlaces peptídicos que forman cadenas polipeptídicas. Los diferentes ordenamientos de las proteínas incluyen enzimas, materiales estructurales, receptores membranosos, factores que regulan genes, hormonas, agentes transportadores y anticuerpos. El orden en el que se incorporan los 20 aminoácidos en una proteína está codificado en la secuencia nucleotídica del DNA. Los 20 aminoácidos muestran una organización estructural común consistente en un carbono alfa unido a un grupo amino, un grupo carboxilo y una cadena lateral de estructura variable (R). La unión de aminoácidos entre sí mediante la reacción entre el grupo carboxilo y el amino, da lugar al enlace peptídico. Pag.21 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 La estructura de las proteínas puede describirse en cuatro niveles de complejidad incrementada de forma gradual. La estructura primaria se describe por medio de la secuencia aminoacídica de un polipéptido; la estructura secundaria a través de la estructura tridimensional (conformación) de secciones del esqueleto polipeptídico; la estructura terciaria por la conformación del polipéptido entero, y la estructura cuaternaria por la disposición de las subunidades si la proteína tiene más de una cadena polipeptídica. La hélice alfa y la hoja beta plegada son estables, en particular las estructuras secundarias vinculadas por puentes de hidrógeno que son comunes en muchas proteínas. La estructura terciaria de una proteína es muy compleja y única para cada tipo individual de proteína. La gran mayoría de las proteínas posee una estructura globular en la que la cadena polipeptídica se pliega para formar una molécula compacta en donde los residuos específicos están situados de manera conveniente, lo cual posibilita que la proteína realice una función específica. La mayor parte de las proteínas muestra dos o más dominios que mantienen una independencia de estructura y función. La información que se requiere para que una cadena polipeptídica adquiera su conformación nativa está codificada en su estructura primaria. Algunas proteínas se pliegan en su estructura terminal de manera espontánea; otras necesitan la ayuda de chaperonas inespecíficas, que evitan la agregación de los intermediarios del plegamiento. Pag.22 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Los ácidos nucleicos son sobre todo moléculas informacionales que consisten en cadenas integradas por monómeros de nucleótidos. Cada nucleótido es una cadena que posee un azúcar, un fosfato y una base nitrogenada. Los nucleótidos se unen mediante enlaces entre el grupo hidroxilo 3′ del azúcar de un nucleótido y el grupo 5′ fosfato del nucleótido adyacente. El RNA y el DNA se ensamblan a partir de los cuatro nucleótidos diferentes que se distinguen por sus bases que pueden ser pirimidinas (citosina o uracilo/timina) o purinas (adenina o guanina). El DNA es una doble cadena de ácidos nucleicos y el RNA es por lo regular una cadena sencilla y plegada sobre sí misma con secciones de doble cadena. Existen otras diferencias entre RNA y DNA: el azúcar que lo compone es diferente. En el ADN es la desoxirribosa y en el ARN la ribosa (la desoxirribosa no tiene el OH en el 2´). También difieren en las bases nitrogenadas: en el ARN la Timina se sustituyepor Uracilo, siendo entonces Adenina, Guanina, Citosina y Uracilo las bases nitrogenadas correspondientes al RNA. La información en los ácidos nucleicos está codificada en la secuencia específica de nucleótidos que forman la cadena. Pag.23 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 de Lenhinger, Principios de Bioquímica. Enlaces fosfodiéster del esqueleto covalente del DNA y ARN. Estos enlaces unen los nucleótidos sucesivos. Las cadenas azúcar-fosfato alternantes son muy polares en ambos tipos de ácido nucleico. GLÚCIDOS: Estructura y Función Los carbohidratos o glúcidos son sustancias naturales compuestas de carbono, hidrógeno y oxígeno, que nos son muy familiares, ya que son los “azúcares” que todos conocemos. Antiguamente se les conocía como “hidratos de carbono”, pero después se supo que esta denominación no era correcta, ya que no contienen moléculas de agua intactas en su composición. Químicamente, son aldehídos o cetonas polihidroxilados. Los carbohidratos en la naturaleza se encuentran por ejemplo en la pared de las células vegetales y la madera de los árboles. La glucosa es el carbohidrato más abundante. Pag.24 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Los animales obtienen glucosa al comer alimentos que la contienen. Las plantas obtienen glucosa por medio de la fotosíntesis y convierten el exceso de glucosa en un polímero llamado almidón (polímero de reserva) o en celulosa (el principal polímero estructural). En el caso de los mamíferos, pueden convertir la sacarosa (azúcar de mesa), lactosa (azúcar de la leche), almidón y demás azúcares, en glucosa, la cual es oxidada para obtener energía, o bien la almacenan como glucógeno. Cuando el organismo necesita energía, el glucógeno es convertido de nuevo a glucosa. Clasificación Los carbohidratos se clasifican en: 1. Monosacáridos: son aquellos que no son hidrolizables en fragmentos más pequeños. Ejemplos: glucosa, fructosa 2. Disacáridos: están constituidos por dos monosacáridos unidos por un enlace glucosídico. Ejemplos: maltosa, lactosa. 3. Oligosacáridos: hasta 10 monosacáridos unidos por un enlace glucosídicos 4. Polisacáridos: contienen muchos monosacáridos unidos en forma lineal o ramificada. Los disacáridos y los polisacáridos se pueden hidrolizar en medio ácido para producir monosacáridos. A su vez, los monosacáridos con un grupo aldehído se les denomina aldosas y a los que tienen un grupo cetona, cetosas. Un monosacárido generalmente tiene entre tres y siete átomos de carbono, denominándose triosa (tres carbonos), tetrosa (cuatro carbonos), pentosa (cinco carbonos), hexosa Pag.25 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 (seis carbonos) y heptosa (siete carbonos). La mayor parte de las cetosas tienen el grupo cetona en el C dos, segundo átomo de carbono de la cadena. Las estructuras de los carbohidratos se suelen representar utilizando proyecciones de Fischer. En la figura vemos que la glucosa y la fructosa son monosacáridos. La glucosa es una aldosa (azúcar con un grupo aldehído) y la fructosa es una cetosa (azúcar con un grupo cetona). Más específicamente diremos que la glucosa es una aldohexosa y la fructosa una cetohexosa. Los monosacáridos tienden a formar hemiacetales cíclicos por reacción de un OH y el carbonilo. Los hemiacetales cíclicos son estables si se forman anillos de cinco o seis miembros. Las proyecciones de Haworth se usan para representar en el plano la configuración tridimensional de los monosacáridos en su forma cíclica. Los átomos de C y enlace situados en la parte inferior del anillo están delante, los de la parte superior están atrás. Una vez dispuesta la estructura de este modo, se comparan en la proyección de Fischer las posiciones de los –OH: los que están a la derecha, en Haworth se ubican hacia abajo. La proyección de Haworth se utiliza mucho para representar los hemiacetales, aunque puede dar la impresión de que el anillo es plano. La conformación de silla es más real. Pag.26 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Formas de representación de la glucosa El enlace glicosídico Veremos ahora cómo se forman los disacáridos, para comprender cómo es la formación de todos los restantes azúcares. Los disacáridos producen dos moléculas de monosacáridos cuando se hidrolizan. Pueden existir como tales en la naturaleza, como la sacarosa o azúcar de mesa; o bien, obtenerse por hidrólisis parcial de algún polímero más complejo. Por lo general, el enlace glicosídico puede ser del tipo alfa o beta en el azúcar del que deriva el glicósido, el cual se une al OH en C4´ o C6´ de la otra unidad de azúcar. En el caso del enlace glicosídico 1-4´, se une el OH del C1 del primer monosacárido, con el OH del C4 del segundo monosacárido, con la consecuente pérdida de una molécula de agua. Pag.27 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Polisacáridos Los polisacáridos son polímeros ampliamente distribuidos en la naturaleza. Los principales son: Celulosa: Es un homopolímero de la D-glucosa sumamente insoluble. Sus enlaces glicosídicos son β- 1-4´. Forma parte de la madera y del algodón. La madera es 30-40% de celulosa, el algodón más del 90%. La fotosíntesis en las plantas es responsable de la formación de 109 toneladas por año de celulosa. Estructuralmente, la celulosa es un polisacárido compuesto de varios miles de unidades de D-glucosa unidas por enlaces glucosídicos (β1,4). Almidón: El almidón es una mezcla de una fracción dispersable en agua llamada amilosa y un segundo componente, la amilopectina. La amilosa es un polisacárido compuesto de aproximadamente 100 a varios miles de unidades de D-glucosa unidas por enlaces glucosídicos (1,4). Al igual que la amilosa, la amilopectina es un polisacárido de unidades de D-glucosa unidas α (1,4). Pero la amilopectina es ramificada. Adjunto a C-6 en varios puntos de la cadena principal hay ramificaciones cortas de polisacáridos de 24-30 unidades de glucosa unidas por enlaces α (1,4) glicosídicos. Pag.28 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Glucógeno: Cuando hay más glucosa disponible de la que se necesita como combustible, los animales lo almacenan como glucógeno. El glucógeno es similar a la amilopectina, porque es un polisacárido de unidades de D-glucosa enlazadas α (1,4) con subunidades conectadas a C-6 de la cadena principal, pero es más ramificado. Derivados de los monosacáridos En la naturaleza se encuentran varios derivados de los monosacáridos. Estas variaciones estructurales surgen del reemplazo de grupos hidroxilo por otros. Por ejemplo, un grupo amino para dar un aminoazúcar. El aminoazúcar más abundante es uno de los compuestos orgánicos más antiguos y abundantes en la tierra: N-acetil-D-glucosamina. Constituye el componente principal de la quitina, el polisacárido que compone el esqueleto externo de artrópodos e insectos. La quitina se ha aislado hace 25 millones de años a partir de un fósil de escarabajo. Rol biológico de los carbohidratos Además de las funciones que ya han sido mencionadas en el texto (elementos estructurales y de reserva), los carbohidratos desempeñan un papel informativo en las interacciones biológicas. Las glicoproteínas, moléculas de proteínas unidas covalentemente a carbohidratos, son las protagonistas. Cuando una célula es atacada por un virus o bacteria o cuando interactúa con otra célula, es necesario Pag.29 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 que haya un reconocimiento. En este reconocimiento están involucradas las glicoproteínas, más específicamente se reconocen secuencias de carbohidratos específicas, ubicadas al final de la glicoproteína. Por ejemplo, el receptor en la superficie de la célula humana a la que se une el virus influenza se ha identificado como una glicoproteínaque termina en un disacárido de N- acetilgalactosamina y ácido N-acetilneuramínico. Como la unión del invasor a la superficie de la célula huésped es el primer paso en la infección, un enfoque para el diseño de fármacos consiste en inhibir selectivamente esta unión. Las sustancias del grupo sanguíneo humano ofrecen otro ejemplo del papel informativo jugado por carbohidratos. Las estructuras de las glicoproteínas unidas a la superficie de las células sanguíneas determinan si la sangre es de tipo A, B, AB o O. Unidades terminales de carbohidratos de glucoproteínas del grupo sanguíneo humano. La diferencia estructural entre las glucoproteínas tipo A, tipo B y tipo O, reside en el grupo designado como R. LÍPIDOS: Estructura y Función Los lípidos constituyen el grupo de biomoléculas menos caracterizables desde el punto de vista químico, ya que la única propiedad que comparten es su insolubilidad en agua y su capacidad de disolverse en solventes orgánicos (alcohol, acetona, éter, cloroformo, etc.). Las funciones que desarrollan en los seres vivos son muy diversas aprovechando la amplia heterogeneidad que presentan sus moléculas, de forma abreviada serían las siguientes: Función de reserva energética: Constituyen un almacén energético a largo plazo, utilizable por el organismo durante largos periodos de tiempo. Debido a la baja tendencia a relacionarse con el agua constituyen un tipo de molécula que puede almacenarse de forma anhidra, sin moléculas de agua acompañantes como en el glucógeno, por lo tanto de manera muy compacta. Función estructural: Es un componente mayoritario de las membranas celulares, tanto de la membrana plasmática como de la membrana de los orgánulos intracelulares. Sirve también como elemento aislante térmico al disponer de una baja conductividad térmica, protector y lubricante. Pag.30 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Función reguladora: Diversos tipos de lípidos desarrollan acciones de control hormonal, o bien de reguladores del metabolismo y de mediadores informativos tanto en el exterior como en el interior de las células. Clasificación: Ácidos grasos Generalmente no se encuentran libres si no que se obtienen por la hidrólisis de otros lípidos. Están formados por una larga cadena hidrocarbonada y un grupo carboxilo (-COOH). Tienen un número par de átomos de carbono, generalmente entre 12 y 24. Pueden ser saturados (donde todos los enlaces son simples) o insaturados (donde aparecen enlaces dobles o triples) y suelen adoptar formas de zig- zag: Ácidos grasos Lípidos saponificables Lípidos simples Acilglicéridos o glicéridos Ceras Lípidos complejos Fosfolípidos Glicerofosfolípidos Esfingofosfolípidos Glucolípidos Gliceroglucolípidos esfingoglucolípidos Lípidos insaponificables Esteroides Terpenos Prostaglandinas Pag.31 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 En general, los ácidos grasos son bipolares o anfipáticos: La larga cadena hidrocarbonada es hidrófoba y el grupo carboxilo es hidrófilo. El punto de fusión, es decir la cantidad de energía necesaria para romper los enlaces entre las moléculas, de los ácidos grasos insaturados es menor que el de los saturados y asciende cuando aumenta el número de carbonos que posee la molécula. Sin entrar en detalles sobre todos los tipos de ácidos grasos, vamos a ejemplificar algunos con relevancia biológica. Los acilglicéridos o grasas se denominan también glicéridos y son ésteres de un alcohol polivalente, la glicerina, con uno, dos o tres ácidos grasos. Se forma un monoglicérido si se une un único ácido graso, un diglicérido si se unen dos y un triglicérido si se unen tres. Las grasas constituyen la principal reserva energética de los seres vivos. En cuanto a los lípidos complejos, se consideran moléculas compuestas por componentes lipídicos y otros no lipídicos. Se encuentran formando la bicapa lipídica de las membranas celulares por lo que también se les llama lípidos de membrana, como los fosfolípidos. Por otro lado, tenemos ciertos lípidos insaponificables, que son derivados del ciclopentanoperhidrofenantreno o esterano. Son moléculas muy activas que intervienen en el metabolismo celular, como por ejemplo los esteriodes o las prostaglandinas. PROTEINAS: Estructura y Función Las proteínas son constituyentes esenciales de todos los organismos. la mayoría de las tareas que realizan las células requieren proteínas, las cuales tienen una asombrosa diversidad de funciones. Además de servir como materiales estructurales en todos los seres vivos (p. ej., como componentes estructurales en el músculo y en el tejido conjuntivo de animales o como componentes de la pared celular de las procariotas), las proteínas participan en funciones tan diversas como la regulación metabólica, el transporte, la defensa y la catálisis. La diversidad funcional que exhibe esta clase de biomoléculas está relacionada de forma directa con las posibilidades de combinación de las unidades monoméricas, los 20 aminoácidos. Pag.32 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Aminoácidos Los aminoácidos comunes tienen una estructura general similar para todos, formada por un átomo de carbono central o átomo de carbono alfa (α), unido de forma covalente a un grupo ácido o carboxílico (-COOH), un grupo básico o amino (-NH2) y un átomo de hidrógeno. Su cuarta valencia se encuentra saturada por una cadena lateral (R), que es el elemento que diferencia cada uno de los 20 aminoácidos. Clasificación El conocimiento de las propiedades químicas de los aminoácidos estándar es de vital importancia para la comprensión de la bioquímica de las proteínas. La clasificación de los mismos se realiza de acuerdo a las propiedades de los grupos R (cadena lateral), en especial a su polaridad, o tendencia a interaccionar con el agua a pH biológico (cercano a 7). La polaridad de los grupos R varía desde totalmente apolar o hidrofóbico (insoluble en agua) o altamente polar o hidrofílico (soluble en agua). El código de tres letras es la convención de abreviatura de los aminoácidos, utilizando tres letras del nombre completo y facilita la denominación de las secuencias peptídicas. Ej: Arginina – Arg / Metionina- Met Pag.33 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 El enlace peptídico Para construir un péptido o una proteína, los aminoácidos deben unirse a través de un enlace covalente que permita su estabilidad y, como se podrá observar, también su amplia versatilidad. Pag.34 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 El enlace se establece entre un grupo carboxilo de un aminoácido y un grupo amino de un segundo aminoácido mediante una condensación que provoca la liberación de una molécula de agua, quedando formado un enlace amida. La formación de un único enlace da lugar al péptido más pequeño, o dipéptido, constituido tan sólo por dos aminoácidos. Las uniones de sucesivos aminoácidos dan lugar a tripéptidos, tetrapéptidos, oligopéptidos, polipéptidos y en último extremo proteínas. Otras interacciones entre aminoácidos Puentes Disulfuro: El grupo sulfhidrilo de la cisteína es muy reactivo. La reacción más común de este grupo es una oxidación reversible que forma un disulfuro. La oxidación de dos moléculas de cisteína forma cistina, una molécula que contiene un enlace disulfuro (Fig. 5.13). Cuando dos residuos de cisteína forman uno de estos enlaces, éste se denomina puente disulfuro. Este enlace puede producirse en una cadena individual para formar un anillo o entre dos cadenas separadas para formar un puente intermolecular. Los puentes disulfuro ayudan a estabilizar muchos polipéptidos y proteínas. ¿Péptidos o proteínas? Los péptidos son las moléculas formadas por menos de 100 residuos de aminoácidos. Aunque sus estructurasson menos complejas que las de las moléculas proteínicas más grandes, los péptidos Pag.35 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 poseen actividades biológicas significativas, como por ejemplo tripéptido (γ-glutamil-cisteinil-glicina) que actúa como antioxidante y destoxificante en el interior celular por su capacidad de unirse entre sí formando dímeros a través de la cisteína o la oxitocina que, producida en la hipófisis, desarrolla diferentes acciones hormonales. En tanto que una proteína se define como todo polipéptido de más de 100 aminoácidos, que desarrolla una estructura característica y cumple una función orgánica. Las proteínas compuestas por una sola cadena polipeptídica se llaman proteínas monoméricas mientras las que asocian más de un polipéptido se conocen como proteínas multiméricas. Funciones de las proteínas De todas las moléculas que se encuentran en los seres vivos, las proteínas son las que tienen las funciones más diversas. Catálisis: Las enzimas son proteínas que dirigen y aceleran miles de reacciones bioquímicas en procesos como la digestión, la captura de energía y la biosíntesis. Estas moléculas tienen propiedades notables. Estructura. Algunas proteínas proporcionan soporte. Las proteínas estructurales suelen tener propiedades muy especializadas. Por ejemplo, el colágeno (el componente principal de los tejidos conjuntivos) y la elastina, una proteína semejante a la goma que se encuentra en las fibras elásticas, está presente en varios tejidos del organismo (p. ej., en los vasos sanguíneos y en la piel) Movimiento. Las proteínas participan en todos los movimientos celulares. Por ejemplo, la actina, la tubulina y otras proteínas forman el citoesqueleto. Las proteínas de esta estructura son activas en la división celular, en la endocitosis, en la exocitosis y en el desplazamiento ameboide de los leucocitos. Defensa. Una extensa variedad de proteínas son protectoras. En los vertebrados, por ejemplo, la queratina, una proteína que se encuentra en las células de la piel, ayuda a proteger al organismo contra los daños mecánicos y químicos. Las proteínas implicadas en la coagulación hemática, el fibrinógeno y la trombina, impiden la pérdida de sangre cuando los vasos sanguíneos se lesionan. Las inmunoglobulinas (o anticuerpos) producidas por linfocitos cuando organismos ajenos, como las bacterias, invaden a un organismo Regulación. La unión de una molécula hormonal o de un factor de crecimiento a los receptores en sus células diana modifica la función celular. Entre los ejemplos de hormonas peptídicas se encuentran la insulina y el glucagón: ambos regulan la concentración sanguínea de glucosa. La Pag.36 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 hormona del crecimiento estimula el desarrollo y la división celulares. Los factores de crecimiento son polipéptidos que controlan la división y la diferenciación de las células animales. Transporte. Muchas proteínas actúan como moléculas transportadoras de moléculas o de iones a través de las membranas o entre las células. Entre los ejemplos de proteínas de membrana están la bomba de Na+-K+ ATPasa y el transportador de glucosa. Otras proteínas transportadoras son la hemoglobina, que lleva el 0 2 a los tejidos desde los pulmones, y las lipoproteínas LDL y HDL, que transportan los Jípidos del hígado y del intestino a otros órganos. Almacenamiento. Determinadas proteínas actúan como reserva de nutrientes esenciales. Por ejemplo, la caseína de la leche de los mamíferos son fuentes abundantes de nitrógeno orgánico. Respuesta al estrés. La capacidad de los organismos para sobrevivir a diversos agresores abióticos está mediada por determinadas proteínas. Entre los ejemplos se encuentra el citocromo P450, un grupo diverso de enzimas que se encuentran en los animales y en las plantas que de forma habitual transforman a un gran número de contaminantes orgánicos tóxicos en derivados menos tóxicos. Las temperaturas muy elevadas y otras agresiones dan lugar a la síntesis de una clase de proteínas denominadas proteínas de choque térmico (hsp) que promueven el plegamiento correcto de las proteínas perjudicadas. Si esas proteínas se dañan de forma grave, las hsp estimulan su degradación. Estructura de las proteínas Las proteínas son moléculas, en general, muy grandes pudiendo llegar a tener miles de aminoácidos, y por lo tanto sus miles de átomos pueden adoptar una variedad de posiciones en el espacio extremadamente amplia. Cada proteína presenta una estructura espacial característica y única, que se denomina estructura o conformación nativa, y que resulta absolutamente necesaria para que pueda desarrollar su función. Los bioquímicos han diferenciado varios niveles en la organización estructural de las proteínas. La estructura primaria, la secuencia de aminoácidos, es especificada por la información genética. Al plegarse la cadena polipeptídica se forman determinadas disposiciones localizadas de aminoácidos adyacentes que constituyen la estructura secundaria. La forma tridimensional global que asume un polipéptido se denomina estructura terciaria. Se dice que las proteínas que constan de dos o más cadenas polipeptídicas (o subunidades) tienen estructura cuaternaria. Pag.37 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Estructura primaria: Consiste en la determinación de la secuencia de aminoácidos de una proteína, es el nivel de conocimiento más básico y más importante. Las proteínas se diferencian entre sí porque cada una tiene un número de aminoácidos y una secuencia de los mismos distinta. Una serie determinada de aminoácidos dará lugar a una configuración espacial también única y determinada, lo que llevará en último extremo a una función específica y concreta. Estructura secundaria: Define las posiciones regulares y repetitivas de aminoácidos adyacentes en una cadena peptídica. Podría suponerse que las posibilidades de colocación en el espacio, que tiene un residuo aminoacídico con respecto a sus vecinos más próximos, son infinitas; sin embargo, la rigidez del plano del enlace peptídico y las limitadas posibilidades de giro alrededor del carbono α, reducen en gran medida las estructuras estables que pueden existir en la realidad. Por dicho motivo, las dos estructuras más importantes y abundantes en las proteínas son: La hélice α y la conformación β. Estas están estabilizadas por enlaces de hidrógeno entre los grupos carbonilo y N-H del esqueleto polipeptídico. La hélice α es una estructura rígida en forma de varilla que se origina cuando una cadena polipeptídica se enrolla en una conformación helicoidal dextrógira. La lámina plegada β se forma cuando se alinean dos o más segmentos de la cadena polipeptídica uno al lado del otro. En lugar de estar enrollada, cada cadena está extendida por completo. Pag.38 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 Estructura Terciaria: Describe las relaciones espaciales entre todos los aminoácidos de la cadena peptídica, proporciona una imagen tridimensional completa de la molécula. Una proteína grande normalmente contiene varios tipos de estructura secundaria. Los segmentos de la cadena peptídica plegada se mantienen en posición mediante una serie de enlaces, de naturaleza débil en su mayoría, que se establecen entre residuos aminoacídicos y entre éstos y el entorno. Los enlaces pueden ser puentes de hidrógeno, interacciones hidrofóbicas, fuerzas de Van der Waals, e incluso enlaces covalentes a través de puentes disulfuro. La frontera entre estructura secundaria y terciaria resulta a veces muy difuminada, dependiendo del tipo de molécula que se esté analizando. Existe una clasificación morfológica de las proteínas en dos grupos denominadas proteínas fibrosas y proteínas globulares. Dentro de las fibrosas se encontrarían el colágeno, la queratinao la elastina, proteínas todas ellas que aportan resistencia y/o elasticidad a los medios donde se encuentran. En estas proteínas la conformación queda descrita analizando los dos niveles iniciales de estructura, ya que sus cadenas polipeptídicas tienen una secuencia única y repetitiva de hélice alfa. En cambio las proteínas globulares, que son las más abundantes, disponen de nivel de estructuración terciaria donde se describe la posición y estructura de cada segmento con una estructura secundaria característica. En éstas se describen diferentes regiones denominadas Dominios, que son cadenas de 50 a 350 aminoácidos, formadas por una combinación de hélices alfa y láminas beta, que adoptando diversas posiciones en el espacio dan lugar a una unidad globular. Estructura Cuaternaria: Muchas proteínas, en particular las que tienen pesos moleculares elevados, están formadas por varias cadenas polipeptídicas. A cada componente polipeptídico se le denomina subunidad. Las subunidades en un complejo proteínico pueden ser idénticas o bastante diferentes. Las subunidades polipeptídicas se ensamblan y se mantienen unidas por interacciones no covalentes, como el efecto hidrófobo, las interacciones electrostáticas y los enlaces de hidrógeno, y por Pag.39 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 entrecruzamientos covalentes. Como en el plegamiento proteínico, el efecto hidrófobo es claramente el más importante debido a que las estructuras de las superficies de interconexión complementarias entre las subunidades son semejantes a las observadas en el interior de los dominios de las proteínas globulares. Aunque son menos numerosos, los entrecruzamientos covalentes estabilizan de forma significativa determinadas proteínas con múltiples subunidades. Entre los ejemplos más destacados se encuentran los puentes disulfuro de las inmunoglobulinas. Pérdida de la estructura proteínica Considerando las pequeñas diferencias de energía libre de las proteínas plegadas y desplegadas, no es sorprendente que la estructura proteínica sea muy sensible a los factores del entorno. Muchos agentes físicos y químicos pueden perturbar la conformación nativa de una proteína. El proceso de desorganización de la estructura se denomina desnaturalización. Ésta no incluye la rotura de los enlaces peptídicos (La desnaturalización nunca implica la pérdida de la estructura primaria, siempre de la secundaria, terciaria y/o cuaternaria). Dependiendo del grado de desnaturalización, la molécula puede perder de forma parcial o total su actividad biológica. Si las condiciones que provocan la desnaturalización duran poco o son poco intensas es reversible. Las dos consecuencias de la desnaturalización de una proteína son: la pérdida de actividad biológica y la pérdida de la solubilidad. La desnaturalización con frecuencia da lugar a cambios observables de las propiedades físicas de las proteínas. Por ejemplo, la albúmina de huevo (la clara) soluble y transparente se hace insoluble y opaca tras calentarla. Algunas condiciones desnaturalizantes son: los ácidos y bases fuertes, los solventes orgánicos, detergentes, agentes reductores (urea, mercaptoetanol), la concentración salina, los metales pesados, como el mercurio (Hg2+) y el plomo (Pb2+). Clasificación de las proteínas Además de su clasificación morfológica en proteínas fibrosas y globulares, existen otros criterios para su clasificación. Desde el punto de vista químico se las cataloga en dos grupos: 1. Proteínas simples: formadas únicamente por aminoácidos 2. Proteínas conjugadas: en las que además de los aminoácidos, contienen otro tipo de moléculas denominados grupos prostéticos, recibiendo la fracción peptídica el nombre de apoproteína. Dependiendo de la naturaleza del grupo prostético, las proteínas conjugadas se clasifican en: a) Glicoproteínas, si es de naturaleza glucídica. b) Lipoproteínas, si es de naturaleza lipídica. c) Nucleoproteínas, asociadas a los ácidos nucleicos. d) Cromoproteínas, el grupo prostético es una molécula orgánica, porfirina, asociada normalmente con un átomo metálico. e) Fosfoproteínas: Su grupo prostético es un éster fosfato. f) Otras, con grupos muy variados, Pag.40 Articulación Básico Clínico Comunitaria 1. Ciclo 2021 metales, vitaminas o derivados de las mismas, etc.
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