DNA/REPLICACIÓN/TRANSDUCCION/TRADUCCION

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Estructura y replicación del ADN
Envoltura Nuclear: 
bicapa lipídica con poros formados por proteínas (selectivo)
Se continua con el Retículo endoplasmático liso 
Filamentos intermedios - lámina nuclear; función mecánica para sostener la estructura de la envoltura nuclear y función de anclaje, pues ayuda en el posicionamiento del ADN que está dentro del núcleo
Hay que salir el ARN, pues se traduce en el citosol 
Colas polipeptídicas que ayudan a bloquear: selectividad
Cromatina: ADN compacto, pues está asociado a proteínas (histonas) 
 ↳ ADN + PTN
Nuclear import receptor: ayuda a pasar de un lado al otro 
Nucléolo: zona donde en general se agrupan ADN/fragmentos que están transcribiendo activamente ARN ribosomales 
Progeria: envejecimiento acelerado; síndrome de Hutchinson-Gilford 
Estructura del ADN
Cromosomas: información genética; cromatina (ácidos nucleicos) 
ADN: 4 bases diferentes
ADN: doble cadena polarizadas (toda molécula tiene una dirección) = en el caso 5 prima 3 prima
Las cadenas:
· antiparalelas: polaridad en sentido contrario y que no se cruzan
· complementarias: porque en cada lado hay uno A-T y siempre se combinan de igual manera
Aminoácidos: 22 tipos, cuatro tipos de bases diferentes
 
Pentosa
Puentes de hidrogeno: no covalentes, son débiles 
C-G: 3
A-T: 2
Genes:
Alrededor de 30.000; porción/segmento de ADN, pero con que codifican para proteínas o ARN (ribosomales o trasferencia)
→ Tipos:
· Codificantes para cadenas polipeptídicas (ARNs m) 
· Codificantes para otros ARNs
→ Por la actividad:
· actualmente activos
· actualmente inactivos pero activables
· inactivados irreversivelmente
→ Por la función:
· de mantenimiento
· especializados de determinadas células 
ARN ribosomales y de transferencia no se transcriben, sólo el mensajero
Condensación del ADN:
El ADN está repartido en 23 cromosomas (cadena larga) 
Si se mistura tudo dentro del núcleo: errores 
La prueba de cariotipo: examina el tamaño, la forma y el número de los cromosomas. Utilizado para buscar números o estructuras anormales de los cromosomas
Cromosoma: contiene genes
Cariotipo: colección de cromosomas de un individuo
Genoma: secuencia completa de ADN. Contiene toda la información necesaria para que una persona pueda crecer y desarrollarse.
Cromatina: ADN + histonas 
H1: histona que ayuda a formar las estructuras terciarias 
Complejo remodelador: regula la condensación del ADN; permite que deslicen el ADN sobre los nucleosomas 
modificación covalente = modificación química--- ejemplo: fosforilación 
Grupo metilo: CH3, se agrega se metila las Histonas, las histonas metiladas tienden a condensar más : heterocromatina
Epigenética: modificación de ADN que se hereda, que no tiene relación con la secuencia. permite la diferenciación celular 
Telómeros: puntas de los cromosomas
hay zonas que siempre están 
histonas acetilasas: acetilan el ADN = descompacta y activa la transcripción
 Corpúsculo de Barr: representa el cromosoma X inactivo. Determinó 4 principios para la cromatina sexual: la cromatina sexual es genéticamente inactiva--->inactivación puede ser en el cromosoma paterno o materno
Mosaico: no tiene el mismo material genético 
Eucromatina: cromatina descondensada durante la interfase. 
Heterocromatina: forma condensada de cromatina que no altera su nivel de compactación durante el ciclo celular
Replicación del ADN
nucleosoma: se compone de alrededor de 150 pares de bases de ADN enrolladas alrededor de un núcleo de histonas. Se organizan como cuentas de un collar las cuales, a su vez, son plegadas sobre sí mismas repetidas veces para formar un cromosoma
silenciar: heterocromatinización constitutiva --- telómeros y centrómeros
ADN: función estructural también 
 
lámina de nuclear: sitio de anclaje de la cromatina 
interfase: fuera de la división; La célula pasa la mayor parte de su tiempo, y durante este tiempo crece, duplica sus cromosomas y se prepara para una división celular.Una vez terminada la etapa de interfase, la célula entra en la mitosis y completa su división. 
Replicación:
· Semiconservativa
· Bidireccional
· Asincrónica
· Asimétrica 
Origen de replicación: comienzo, vay hacia los dos lados de la doble cadena = bidireccional; ADN helicasa 
Siempre crece 5' a 3', lo que significa que el nucleótido del extremo 5' es el primero y el nucleótido del extremo 3' es el último
TTP y CTP: nucleótidos para la replicación
 
5' a 3', lo que significa que el nucleótido del extremo 5' es el primero y el nucleótido del extremo 3' es el úlitmo
ADN polimerasas
enzimas que catalizan la síntesis de moléculas de ADN a partir de desoxirribonucleótidos
chequea: revisa la replicación 
solo puede agregar nucleótidos en una cadena que ya existe
ARN polimerasa (primasa)
no revisa 
 puede agregar de zero 
molde de ADN
 Fragmentos de Okazaki:cadenas cortas de ADN recién sintetizadas en la hebra discontinua. Estos se sintetizan en dirección 5'→3' a partir de cebadores de ARN que después son eliminados. Los fragmentos se unen entre sí mediante la ADN ligasa completando la nueva cadena.
Abrazadera deslizante (sliding clamp): envulta del ADN Polimerasa no se caiga de la hebra de adn verdadera y que pueda fabricar más nucleótidos ---- estabiliza
cortan la cadena de adn, dejan que eguen un par de vueltas para aliviar tenión y volver a unir exactamente donde estaba 
aflojan tensión
telomerasa tiene un primer; exyinede los telmomeros 
Transcripción
ADN polimerasa: función en la replicación 
Helicasa: horquilla de replicación
ADN primasa: inicia el proceso ---- forma los primers: punto de inicio, en el cual se conecta la ADN polimerasa. Esta adiciona las bases en una sola dirección (5’ → 3’). En la otra hebra que está en sentido contrario se forma los fragmentos de Okasaki
exonucleasa: remueve todos los primers de ARN de la cadena. Los huecos son rellenados con ADN por otra polimerasa 
ADN ligasa: fusiona los fragmentos de ADN en las dos hebras para formar una doble hebra continua 
Información genética: ADN contiene un código con cuatro pares de bases nitrogenadas y ese código se puede leer = las informaciones necesarias para la producción de una proteínas y ARN
Mitosis: máximo condensado 
Dogma Central de la biologia molecular: 
Falta la transcripción reversa
Replicación y transcripción: núcleo
Traducción: citoplasma
DNA: Desoxirribose
RNA: Ribose
Ribozimas: ARN con funciones enzimáticas/catalíticas
Proteínas + ARN: ribonucleoproteínas, ej: ribosomas
Enzimas: bajan la energía de activación 
Además de los ARN mensajero, ribosomales y de transferencia hay más
Transcripción:
Hebra codificante: es la que lee, posee la secuencia para la proteína 
Hebra molde 
Si quiere que el mensajero tenga la misma secuencia que la hebra codificante la que se copia es la opuesta 
ARN polimerasa I I: responsable por la transcripción de lo que va a ser los ARN mensajeros 
ARN polimerasa: no necesita primer, sin proofreading (tasa de error 1: 10 ⁴)
ADN polimerasa: necesita primer, con proofreading (tasa de error: 1: 10 ⁷)
Promotor: secuencia de ADN; Dije la maquinaria de transcripción cual él la hebra molde y cuál es la codificante, indicando la dirección 
Factores de transcripción basales: constitutivos, ayuda a empezar 
TATA box: rica en timina-adenina; es una zona que es reconocida por los factores de transcripción basales y que indica a la célula que hay un promotor 
PROCESAMIENTO: exclusivo para los ARN mensajeros 
 
El mensajero cuando se fabrica primero: pre-mRNA; una sola secuencia de nucleótidos
Mayor resistencia a mutaciones
Splicing alternativo: a partir de un mismo gen según como combine los exones puedo fabricar proteínas distintas
Splicing:
spliceosoma
snRNP
Mediado por ribozima
Adenina conservada dentro del intrón: ataca el extremo y permite la formación del lazo 
Los 3 procesos de maduración del pre mRNA:
capping, Splicing y poliadenilación (cortar y agregar AAA)
Maduro: puede traducirse 
TRADUCCIÓN
Ribozima: son moléculas de ARN capaces de catalizar reacciones bioquímicas concretasde manera similar a como lo hacen las enzimas proteicas
Splicing: snRNP U1 
Remueve los intrones
El inicio de la T y de la T no son los mismos
Promotor: región de ADN que controla la iniciación de la transcripción
Primer: permiten que la ADN polimerasa pueda engancharse y arrancar --- replicación
Replicación y Transcripción: núcleo
Traducción
Citoplasma
Aminoácidos/ptn: extremo amino terminal y un extremo carboxiterminal = ptn polares 
Estrutura del mensajero:
Marco de lectura: hay 3 marcos de lectura posibles para cada secuencia y son definidos por el primer codón
Es fundamental que la maquinaria de traducción sepa exactamente cuál es el primer codón, pues este va a decir cuál es el marco de lectura correcto 
Marco abierto de lectura es una porción de una molécula de ADN que cuando se traduce a los aminoácidos, no contiene codones de terminación. El código genético lee secuencias de ADN en grupos de tres pares de bases, esto significa que, en una molécula de ADN de doble hebra, hay 6 posibles sentidos en los que pueden abrirse marcos de lectura --tres en dirección hacia adelante y tres en reverso. Un marco abierto de lectura larga es probable que sea parte de un gen.
Hay 64 codones posibles: 4 x 4 x 4 
Existen varios codones para los mismos aminoácidos
Código genético: redundância
 
ARN de transferencia: sirve como adaptador; es el enlace clave entre la transcripción del ARN y la traducción del ARN; es el que lleva el aminoácido que codifica para el codón. Así que es un enlace clave entre los aminoácidos y el codón en el ARN
Anticodón: complementario al codón 
En el extremo 3’ que le va a permitir unir al aminoácido 
Enzima: trna aminoacil transferasa; en el extremo carboxilo
 
Estructura: ribosoma = no son proteínas, son complejos multiproteicos gigantes conformados de proteínas y ARN 
Los ribosomas poseen 3 espacios que se pueden acomodar los ARN de transferencia y un espacio donde se une el mensajero
Inicio de la traducción:
ribosoma reconozca el ARN mensajero y se una. Para eso, necesita de proteínas adaptadoras
Primer se unen las subunidades menores que va a venir con un ARN de transferencia = ARN de transferencia iniciador.
El de iniciación siempre va a estar unido a metionina.
El inicio no puede ocurrer sin ‘CAP’
Marco de lectura: primer codón = AUG
Región 5’ no codificante del mensajero: entre el CAP y el AUG
De stop: ocre (UAA), ámbar (UAG) y ópalo (UGA). Los de stop tienen que estar en el mismo marco de lectura que el AUG
3’ no codificante: después del stop
Plegamiento; para formar estructuras; chaperonas