De esta misma manera, la religión es un factor decisivo también en este tipo de conflictos. Por ejemplo, a pesar de no ser tan decisivo como las diferencias étnicas, las diferencias religiosas también fueron causantes del desmembramiento de Yugoslavia, siendo Eslovenia y Croacia principalmente cristianas romanas, mientras que Serbia y Montenegro pertenecen casi en su totalidad a las jurisdicciones autocéfalas del rito ortodoxo; y finalmente Bosnia-Herzegovina mitad musulmana y cristiana (Religious Tolerance, 2007).