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UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE CIENCIAS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo T E S I S QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE: BIÓLOGA P R E S E N T A : TANIA VALDIVIA CARRILLO DIRECTOR DE TESIS: DRA. BRIGITTA INE VAN TUSSENBROEK RIBINNK 2011 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. HOJA DE DATOS DEL JURADO 1.Datos del alumno Valdivia Carrillo Tania Universidad Nacional Autónoma de México Facultad de Ciencias Biología 30150124-8 2.Datos del tutor Dra. Brigitta Ine van Tussenbroek Ribinnk 3.Datos del sinodal 1 Dr. Daniel Piñero Dalmau 4.Datos del sinodal 2 Dr. Manuel Uribe Alcocer 5.Satos del sinodal 3 Dr. Judith Márquez Guzmán 6.Datos del sinodal 4 Dra. Irene Teresa Rodríguez Virgen 7. Datos del trabajo escrito Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 101 pp. 2011 La presente investigación se realizó en el Laboratorio de Botánica Marina del Instituto de Ciencias del Mar y Limnología del la Universidad Nacional Autónoma de México Un agradecimiento especial a: Dra. Brigitta I. van Tussenbroek Dr. Kor Jent van Dijk Dra. Irene Teresa Rodríguez Virgen M en C. Guadalupe Barba Santos M en C. Manuela Muhlia Montero Por su colaboración en la realización de este trabajo. II A mis papás Lulú y Rafael A mi hermanita Eréndira III Agradecimientos A la Dra. Brigitta Ine van Tussenbroek por sus enseñanzas acerca del mundo de los pastos marinos, por apoyarme durante mi estancia en el laboratorio y por ser un ejemplo de una gran mujer. Al Dr. Kor Jent van Dijk y a la Dra. Irene Teresa Rodríguez por asesorarme en el proceso de continuo aprendizaje y por su paciencia, mil gracias por compartir su conocimiento. Al Dr. Píndaro Díaz Jaimes por los comentarios y apoyo durante el desarrollo de esta tesis. A la M. en C. Guadalupe Barba y al M. en C. Edgar Escalante por el apoyo técnico brindado durante el desarrollo del trabajo y por su amistad. A mi compañera de laboratorio y amiga, la M. en C. Manuela Muhlia Montero, y a mis demás compañeros del laboratorio y de la UASA. A mis familiares Valdivia y Carrillo, en especial a mis abuelos y a mis primas(o) los amo muchísimo, gracias por tantas risas, locuras y por su apoyo incondicional... A mis compañeros de siempre Andrea, Etna, Viridiana, Tzairí, Anaíd, Marel, Beto, David, Daniela, Plinio, Humber, Max, Alvar, Ainara, Elis, Kathia, Ania, Luis Castor (te quiero mucho, gracias por todo), Beto Vázquez, Ponchito, Paquito, Charly, a la banda de Puerto…y a los que se me olvidan también A Arturo, por compartir y enseñarme las cosas más hermosas y por aguantarme en mis malos ratos… Gracias a todos, los quiero mucho. IV ÍNDICE ÍNDICE ................................................................................................................................................ IV FIGURAS ............................................................................................................................................. VI TABLAS ............................................................................................................................................... IX INTRODUCCIÓN ................................................................................................................................. 1 TAXONOMÍA Y DISTRIBUCIÓN DE LOS PASTOS MARINOS ........................................................................ 1 IMPORTANCIA ECOLÓGICA Y SERVICIOS AMBIENTALES ......................................................................... 4 REPRODUCCIÓN SEXUAL ....................................................................................................................... 8 ORGANISMOS MODULARES Y CRECIMIENTO CLONAL .......................................................................... 11 MARCADORES MOLECULARES ............................................................................................................. 17 DIVERSIDAD Y ESTRUCTURA GENÉTICA ESPACIAL .............................................................................. 20 ANÁLISIS DE AUTOCORRELACIÓN ESPACIAL ....................................................................................... 25 OBJETIVOS ........................................................................................................................................ 28 OBJETIVO GENERAL ............................................................................................................................ 28 OBJETIVOS PARTICULARES ................................................................................................................. 29 MATERIAL Y MÉTODOS ................................................................................................................. 30 THALASSIA TESTUDINUM (BANKS EX KÖNING 1805) ............................................................................. 30 ÁREA DE ESTUDIO .............................................................................................................................. 38 RECOLECTA DEL MATERIAL BIOLÓGICO .............................................................................................. 40 TRABAJO DE LABORATORIO ................................................................................................................ 42 1. Extracción de ADN genómico .................................................................................................. 42 2. Amplificación de microsatélites y genotipificación en geles de poliacrilamida y secuenciador automático ...................................................................................................................................... 43 3. Análisis de datos ...................................................................................................................... 49 Discriminación de clones............................................................................................................. 50 Diversidad genética ..................................................................................................................... 51 Flujo génico y conectividad poblacional ...................................................................................... 51 Estructura genética espacial ........................................................................................................ 52 Clonalidad .................................................................................................................................. 53 i. Riqueza y diversidad clonal .................................................................................................. 53 ii. Arquitectura clonal ...............................................................................................................53 iii. Agregación clonal ................................................................................................................ 54 Análisis de autocorrelación ......................................................................................................... 54 i. Intervalo clonal .................................................................................................................... 55 RESULTADOS .................................................................................................................................... 56 DISCRIMINACIÓN DE CLONES .............................................................................................................. 58 V DIVERSIDAD GENÉTICA ...................................................................................................................... 61 FLUJO GÉNICO Y CONECTIVIDAD POBLACIONAL .................................................................................. 62 ESTRUCTURA GENÉTICA ESPACIAL ..................................................................................................... 62 CLONALIDAD...................................................................................................................................... 63 ANÁLISIS DE AUTOCORRELACIÓN ....................................................................................................... 67 DISCUSIÓN ......................................................................................................................................... 72 CONCLUSIONES ............................................................................................................................... 89 REFERENCIAS ................................................................................................................................... 91 VI FIGURAS FIGURA 1 Abajo se muestran algunos eventos importantes ocurridos en los últimos 100 m.a., como los cambios en estructura oceánica y continental global (modificado de Orth et al. 2006). Der. Filograma de la subclase Alismatidae basado en el gen de cloroplasto rbcL, se muestran el bootstrap y el grupo externo, actualmente el complejo Najadaceae pertenece a la Familia Hydrocharitaceae (modificado de Les et al. 1997). ................................................................................................................................. 3 FIGURA 2 Distribución global de los pastos marinos (tomado de Short et al. 2011). ................................. 4 FIGURA 3 Ejemplo de cómo las unidades modulares pueden crecer vegetativamente y organizarse en los pastizales, siendo éstos la suma de varios genetos distintos. En este caso, el Geneto 1 contiene las unidades A-D las cuales están conformadas por uno o más rametos y el Geneto 2 es contínuo (modificado de Hämmerli 2002). ..................................................................................................... 13 FIGURA 4 Esquema de estructuras clonales de Thalassia testudinum. Izq. Ejemplo del crecimiento vegetativo en varios años, así como la pérdida de conexiones físicas entre rametos. Der. Dibujo de un pastizal marino en el que es imposible identificar los diferentes genetos que lo conforman. .............. 16 FIGURA 5 Thalassia testudinum. a) Dos haces unidos por el rizoma; b) Flor masculina; c) Flor femenina; d) Fruto (Orpurt y Boral 1964; Tomlinson 1974; van Dijk 2008; van Tussenbroek 2011; http://www.seabean.com/guide). ...................................................................................................... 31 FIGURA 6 Distribución actual de Thalassia testudinum (adaptado de Green y Short 2003). .................... 32 FIGURA 7 Hábitos generales de crecimiento de Thalassia testudinum. a) Rizoma horizontal con un haz que se ha ramificado y un haz en estado de latencia también ramificado; b) Esquema que representa la sección de rizoma presentado en A (van Tussenbroek et al. 2006). Abajo se muestra una ilustración de los brotes rastreros de la especie de estudio, flor masculina y femenina, botones y semillas (Ilustración de Elvia Esparza). ............................................................................................................................ 33 VII FIGURA 8 Flor masculina (izq.) y femenina (der.) de Thalassia testudinum, fotografiadas en Belice (Foto de B. van Tussenbroek). .................................................................................................................. 35 FIGURA 9 Grano de polen de Thalassia testidinum atrapado en una pluma de ave que fungió como trampa de polen (tomada del studio de Sanabria Alcaraz 2009). (izq). Polen aislado con un diámetro de 52 µm, barra 10 µm (der. foto de R. Wong, tomado del estudio de Muhlia Montero 2011). ................... 36 FIGURA 10 Fruto cerrado de Thalassia testudinum en una pradera (Izq). Fruto abierto conteniendo dos semillas (Der.) (van Tussenbroek et al. 2010). ................................................................................. 37 FIGURA 11 Ubicación de la laguna arrecifal de Puerto Morelos. ............................................................. 39 FIGURA 12 Gel de agarosa con productos de PCR. ................................................................................. 45 FIGURA 13 Gel de poliacrilamida en donde se muestran los fragmentos amplificados y la escalera, ambos se pueden visualizar por medio de la tinción con plata que es semejante al revelado de una fotografía. La imagen fue escaneada directamente del gel y editada con el programa Photoshop CS3 Versión 10.0.1 (Adobe). ............................................................................................................................... 47 FIGURA 14 Imagen de dos alelos visualizados con el analizador genético GeneMapper® v4.0 (Applied Biosystems, Inc.) ............................................................................................................................. 49 FIGURA 15 Gráfica de frecuencias de las distancias genéticas encontradas en todos los genotipos. ......... 57 FIGURA 16 Thalassia testudinum. Número de genotipos que se encontrarían con cada número de loci y las barras de error. 4 loci sería la combinación mínima de loci que se necesitan para obtener el mismo número de genotipos que los encontrados con 8 loci de microsatélites. A partir de 4 loci la curva se asintotiza. ........................................................................................................................................ 58 FIGURA 17 Muestra el agrupamiento de las muestras de Thalassia testudinum en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, tomando en cuenta la información geográfica de cada una. ..................................... 63 FIGURA 18 Thalassia testudinum. Distribución de los rametos en el sitio Arrecife de la laguna arrecifal de Puerto Morelos recolectados en el 2008. Los rametos unidos por líneas, contínuas o punteadas, VIII representan cada geneto con más de un rameto. Los puntos individuales con número reresentan los genetos con un solo rameto. ............................................................................................................. 64 FIGURA 19 Thalassia testudinum. Distribución de los rametos en el sitio Laguna de la laguna arrecifal de Puerto Morelos en el año 2008. Los rametos unidos por líneas, contínuas o punteadas, representan cada geneto con más de un rameto. Los puntos individuales con número reresentan los genetos con un solo rameto. ..................................................................................................................................... 65 FIGURA 20 Tamaño de los clones de Thalassia testudinum en la laguna arrecifal de Puerto Morelos. Cada geneto está formado por entre 1 y 9 rametos. ...................................................................................66 FIGURA 21 Thalassia testudinum en la laguna arrecifal de Puerto Morelos. Autocorrelación espacial del coeficiente de parentesco (Fij) contra la distancia geográfica. En A y B se incluyeron todos los individuos (nivel rameto). En C y D se incluyó únicamente una copia de cada geneto (nivel geneto). Las gráficas A y C pertenecen al sitio Arrecife, mientras que B y E a la Laguna. Se incluyen en las gráficas los intervalos de confianza de 95% obtenidos con el programa GenClone v2.0 (Arnaud- Haond y Belkhir 2007). ................................................................................................................... 68 FIGURA 22 Thalassia testudinum, laguna arrecifal de Puerto Morelos. Correlogramas de (Fij) en función del log de la distancia geográfica. A y B correlogramas producidos cuando se analizan todas las unidades de muestreo, C y D correlogramas cuando se analiza únicamente un rameto para cada genotipo. Se muestra la regresión lineal de la gráfica, así como la ecuación de la recta y el valor de R2. Se incluye en las gráficas los intervalos de confianza de 95% obtenidos con el programa GenClone v2.0 (Arnaud-Haond y Belkhir 2007). .............................................................................................. 70 FIGURA 23 Análisis de autocorrelación de los diferentes niveles de análisis con la probabilidad de identidad clonal. La distancia espacial en donde convergen las gráficas de coeficiente de parentesco a ambos niveles de análisis corresponde al radio del intervalo clonal. Se muestra que la probabilidad de identidad clonal, en esta distancia, decrece más y luego se aproxima a cero. A, Arrecife; B, Laguna. 71 IX TABLAS TABLA 1 Sitios de recolección de muestras, coordenadas geográficas y características particulares. ....... 40 TABLA 2 Condiciones de PCR optimizadas para microsatélites polimórficos de la especie Thalassia testudinum para visualización en geles de poliacrlamida. Ta, temperatura de alineación; t, touchdown de X °C – Y °C en 20 ciclos; ta, temperatura de alineación final con (n) ciclos. N, número de muestras amplificadas. A; Arrecife y L; Laguna. ............................................................................................ 59 TABLA 3 Condiciones de PCR optimizadas para microsatélites polimórficos de la especie Thalassia testudinum procesados en el analizador genético. Ta, temperatura de alineación; t, touchdown de X °C – Y °C en (n) ciclos; ta, temperatura de alineación final con (n) ciclos; e, tiempo de extensión en cada ciclo a 72°C. N, número de muestras amplificadas. A, Arrecife y L, Laguna. ................................... 60 TABLA 4 Diversidad genética de Thalassia testudinum por locus. Número de alelos por locus (Na), heterocigosidad observada (Ho) y esperada (HE). Coeficiente de endogamia (FIS, de Weir y Cockerham 1984) para cada sitio de muestreo después de remover las réplicas de genotipos. No se observó ninguna desviación significativa del equilibrio H-W, tampoco los coeficientes de endogamia resultaron significativos. .................................................................................................................. 61 TABLA 5 Características clonales de cada sitio en la especie Thalassia testudinum. N, Número de rametos; psex(FIS), probabilidad de identidad clonal. Los valores de crecimiento fueron derivados de van Tussenbroek (1998). ........................................................................................................................ 67 TABLA 6 Análisis de autocorrelación a nivel rameto y geneto, en los sitios de estudio para la especie Thalassia testudinum. F(3.6m), Coeficiente de parentesco (Fij) para la primera clase de distancia; Sp, tasa de decrecimineto del parentesco con la distancia; Nb, número de individuos que componen el vecindario genético; σg y 20 σg índice de dispersión genética. ........................................................... 69 INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 1 INTRODUCCIÓN TAXONOMÍA Y DISTRIBUCIÓN DE LOS PASTOS MARINOS Los pastos marinos son las únicas plantas con flores que habitan en el mar. Comprenden menos del 0.02 % de las angiospermas actuales y están representados por aproximadamente 72 especies de monocotiledóneas que invadieron el mar desde la tierra (Short et al. 2011). Aunque hay controversia acerca del número de géneros y especies, se considera que su baja diversidad puede estar relacionada con la invasión del ambiente marino (Hemminga y Duarte 2000; den Hartog y Kuo 2006; Orth et al. 2006). Las familias de pastos marinos no están necesariamente relacionadas de manera filogenética, ya que estas plantas forman un grupo ecológico (funcional) y no uno taxonómico (Hemminga y Duarte 2000; den Hartog y Kuo 2006). En efecto, utilizando datos del gen de rbcL (Rubisco) del cloroplasto se comprobó la polifilia de las angiospermas marinas con tres o cuatro orígenes evolutivos distintos (Figura 1; Les et al. 1997). A su vez, la evidencia indica que los pastos marinos evolucionaron a partir de organismos que pudieron habitar agua dulce o tener una vida en agua dulce con alta tolerancia a la salinidad, hace 70-100 millones de años (den Hartog 1970, Les et al. 1997), temprano en la evolución de las angiospermas, las cuales se originaron hace aproximadamente 130-90 millones de años (Davies et al. 2004). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 2 La carencia de un ancestro común para los pastos marinos ha traído como consecuencia cierta dificultad para delimitar las características que definen a los miembros de este grupo. Arber (1920) propuso 4 criterios como diagnóstico general: 1) tolerancia al medio salino; 2) crecimiento subacuático; 3) desarrollo de raíces y rizomas para anclarse y contrarrestar la acción de olas y mareas; y 4) polinización acuática. Recientemente den Hartog (2000) incluyó: 5) necesidad de dispersarse en el medio acuático. Los taxa considerados como pastos marinos pertenecen al superorden Alismatiflorae, subclase Alismatidae. Tres familias: Zosteraceae, Cymodoceaceae y Posidoniaceae, son exclusivamente de pastos marinos; mientras que una cuarta familia: Hydrocharitaceae, contiene tres géneros que son considerados marinos y otros 14 de agua dulce (den Hartog y Kuo 2006). Además de las familias antes mencionadas, las cuales contienen en total 12 géneros marinos: Enhalus, Thalassia, Halophila, Amphibolis, Cymodocea, Halodule, Syringodium, Thalassodendron, Posidonia, Heterozostera, Phyllospadix y Zostera, no existe otro género que sea totalmente marino. En otras familias de plantas acuáticas se conocen únicamente dos especies que habitan exclusivamente el medio marino, Ruppia tuberosa de la familia Ruppiaceae, y Lepilaena marina de la familia Zannichelliaceae. La inclusión de estas dos especies dentro de la clasificación de los pastos marinos es un tema de debate (den Hartog y Kuo 2006). FIGURA 1 Abajo se muestran algunos eventos importantes ocurridos en los últimos 100 m.a., como los cambios en estructura oceánica y continental global (modificado de Orth et al. 2006). Der. Filograma de la subclase Alismatidae basado en el gen de cloroplasto rbcL, se muestran el bootstrap y el grupo externo, actualmente el complejo Najadaceae pertenece a la Familia Hydrocharitaceae (modificado de Les et al. 1997). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo4 Los pastos marinos se distribuyen en aguas costeras someras y estuarios de todos los continentes, con excepción de la Antártica (Figura 2), en profundidades que van desde cero hasta más de 50 m (Hemminga y Duarte 2000; Touchette 2007). En comparación con los pastizales marinos, otros hábitats como manglares, arrecifes de coral y bosques de kelp, presentan limitaciones geográficas mucho mayores ya que están restringidos a rangos latitudinales menores (Orth et al. 2006). FIGURA 2 Distribución global de los pastos marinos (tomado de Short et al. 2011). IMPORTANCIA ECOLÓGICA Y SERVICIOS AMBIENTALES Los pastos marinos son un grupo muy exitoso ecológicamente ya que actúan como especies fundadoras, las cuales definen la estructura de la comunidad al crear condiciones estables para otras especies, y a su vez modulan y estabilizan los procesos dentro de un ecosistema extraordinariamente productivo y valioso a nivel mundial (Dayton 1972; Costanza et al. 1997; Green y Short 2003; Duarte et al. 2005; Ellison et al. 2005; Orth et al. 2006; Waycott et al. 2006). Así mismo, son un grupo clave en muchos ecosistemas costeros marinos donde determinan la estructura de la comunidad (den Hartog 1970), al ejercer una importante influencia INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 5 en los ambientes físicos, químicos y biológicos del mar, actuando como ingenieros ecológicos (causan cambios físicos y modulan la cantidad de recursos para otras especies, Jones et al. 1994) y proveyendo de numerosos servicios al ambiente marino (Costanza et al. 1997). Por otro lado, estas plantas son sensibles a la degradación ambiental local que afecta por ejemplo, los flujos del agua, su claridad, salinidad y temperatura (Procaccini et al. 2007). Es importante decir que todos estos disturbios impactan colectivamente la estabilidad y resiliencia de los ecosistemas, los cuales también son una función de la biodiversidad (Reusch et al. 2006). Los pastizales marinos que se encuentran en las zonas templadas están típicamente dominados por una sola especie y, por lo tanto, su biodiversidad se refleja por debajo de este rango taxonómico, es decir, a nivel poblacional (Procaccini et al. 2007). Los pastos marinos han desarrollado adaptaciones ecológicas, fisiológicas y morfológicas únicas para una existencia sumergida (Orth et al. 2006). Los tejidos que se encuentran afuera del sedimento sirven como sustrato para organismos epífitos (e.g. hidrozoarios, serpúlidos, algas, esponjas, balanos y caracoles) y la estructura física de las praderas provee de refugio y funciona como criadero de numerosas especies de peces y moluscos con importancia ecológica y comercial (Heck et al. 2003). Estos pastos tienen hojas delgadas conectadas a un sistema de raíz-rizoma que puede llegar a ser muy extenso, lo que facilita su supervivencia en los ambientes costeros, en donde se presentan variantes en la velocidad de las corrientes, en la energía del oleaje y en la estabilidad de los sedimentos. Las hojas están adaptadas para optimizar la absorbancia de luz, el intercambio INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 6 gaseoso y la flotabilidad, así como la toma y asimilación de nutrimentos; además funcionan como estabilizadores y retenes de arena y actúan como agentes atenuantes del movimiento de agua (Touchette 2007; Short et al. 2007). Bajo condiciones óptimas los pastos marinos son altamente productivos, con tasas de acumulación de biomasa comparables a la de muchas especies importantes para la agricultura. Esta productividad es transferida a los consumidores secundarios incluyendo herbívoros, detritívoros y microorganismos (Touchette 2007). Además, estas plantas son elementos críticos para un gran número de especies amenazadas como los sirenios (dugongo y manatí), las tortugas marinas y los caballitos de mar (Short et al. 2007). Para proveer de oxígeno a sus raíces y rizomas y para mantener grandes cantidades de tejido no fotosintético, los pastos marinos requieren de niveles muy altos de radiación solar. Estos altos requerimientos de luz tienen como consecuencia que los pastos que sean muy sensibles a los cambios ambientales que alteren la claridad del agua (Orth et al. 2006). Asimismo, los pastos marinos tienen un papel muy importante en la fijación de carbono, removiendo dióxido de carbono de la atmósfera y almacenándolo como materia orgánica. Cualquier retraimiento de carbono, ya sea a través de la producción de biomasa o por la exportación a la plataforma continental, representa el retiro efectivo de dióxido de carbono de la interfase océano-atmósfera, lo cual influye en la disminución de los impactos que tienen los gases de invernadero en el cambio climático (Short et al. 2007; Procaccini et al. 2007). Mucho del carbono orgánico producido es almacenado en los sedimentos, actuando como hot spots de INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 7 secuestro de carbono en la biósfera (Duarte et al. 2005). Los pastos marinos también proveen grandes cantidades de carbono en forma de detritos, muchos de los cuales son exportados a ambientes muy limitados en recursos como por ejemplo, el mar profundo (Suchanek et al. 1985). La proximidad de los pastizales marinos a otros hábitats críticos como los manglares y los arrecifes coralinos, facilita la transferencia trófica entre estos hábitats. Todos estos sistemas necesitan estabilizadores del ambiente y este papel lo juegan los pastos al proporcionar un apoyo físico y biológico importante para las comunidades, y contribuyendo con los procesos de sedimentación y toma de nutrimentos y contaminantes de la columna de agua. Una vez removidos, estos nutrientes pueden ser devueltos lentamente a través de procesos de descomposición y consumo reduciendo los problemas de eutrofización y de contaminación orgánica del agua (Orth et al. 2006; Touchette 2007; Short et al. 2007). La distribución global de los pastos marinos ha variado a través del tiempo en respuesta a los cambios en el nivel del mar, la modificación física de las costas, los cambios globales en la concentración de dióxido de carbono atmosférico y la temperatura del agua, entre otras causas. Sin embargo, estos cambios graduales de las condiciones ambientales durante la historia evolutiva de los pastos marinos se han visto minimizados por los cambios actuales en las zonas costeras de todo el mundo, que son consecuencia de las actividades humanas como el incremento en el aporte de sedimentos y materia orgánica, la introducción de especies invasoras, las alteraciones hidrológicas y las prácticas de pesca comercial. Como resultado de estas actividades, los reportes de pérdidas mundiales de pastos marinos se han ido incrementando (Waycott et al. 2000; Short et al. 2011). Estas presiones han resultado en la degradación de estuarios y otros INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 8 ecosistemas costeros, produciendo cambios adversos en las especies y los hábitats (Orth et al. 2006). Además de su importancia ecológica, los pastos marinos tienen un valor económico indirecto debido a que contribuyen a la subsistencia de las pesquerías, deportivas y comerciales, y poseen también valores culturales y estéticos para muchas poblaciones humanas costeras del mundo (Touchette 2007). REPRODUCCIÓN SEXUAL La hidrofilia, sistema exclusivo de las plantas acuáticas y presente en los pastos marinos (Barrett et al.1993), es un mecanismo abiótico de polinización que se caracteriza por una reducción en las estructuras florales y por una tendencia a la separación de sexos, tanto en espacio como en tiempo. Las anteras y los estigmas tienden a encontrarse expuestos al agua y la producción de polen es usualmente alta (en Thalassia testudinum en el orden de 105 granos de polen por flor), resultando en elevadas proporciones polen : óvulo (Ackerman 2006; Muhlia Montero 2011). En contraste con el polen terrestre que es esférico y con el de las plantas anemófilas que es bastante pequeño, las unidades de transporte del polen hidrofílico son filiformes, con excepción de los géneros de la Familia Hydrocharitaceae. Las especies de esta Familia tienen polen esférico, el cual es transportado en tiras mucilaginosas, como es el caso de Thalassia testudinum (van Tussenbroek et al. 2009). Los granos de polen de los pastos marinos son cerrados y tienen una pared de exina reducida. La exina previene la pérdida de agua en plantas terrestres, por lo que se INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 9 piensa que su reducción o ausencia puede ayudar a la rápida germinación del polen en condiciones saturadas de agua (van Tussenbroek et al. 2009). Debido a que el follaje de los pastos modifica los regímenes hidrodinámicos, la localización espacial y orientación de las estructuras florales también son críticos para el éxito de la polinización acuática. Resulta ventajoso elevar las anteras del sedimento para facilitar la dispersión en el fluido en movimiento, mientras que los estigmas cerca de la base de la planta o en las axilas de las brácteas o material vegetativo facilitan la reducción y redirección del flujo de agua para la captura del polen (Ackerman 2006). Éste es el caso de Thalassia, Halophila y Cymodocea (Jiménez Durán 2004; van Tussenbroek et al. 2009). De manera general se puede decir que la dispersión de polen hidrófilo tiende a ser limitada (en el orden de metros) a través de las praderas y se conoce poco acerca de la captura de polen por las flores femeninas (van Tussenbroek et al. 2009). La ocupación del mar por parte de las plantas con flores no sólo implicó las adaptaciones fisiológicas y morfológicas individuales, sino también la adaptación a un ciclo de vida marino, incluyendo el transporte pasivo de polen y la posible dilución del mismo en el agua, lo cual disminuye la posibilidad de encuentro entre macho y hembra, por lo que se piensa que los pastos marinos también desarrollaron mecanismos para reducir la limitación de polen. Uno de estos mecanismos es la sincronización de la floración de manera temporal (van Tussenbroek et al. 2009; 2010). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 10 La reproducción sexual juega un papel importante en la dispersión espacial y temporal de las especies. La dispersión de propágulos es un proceso dinámico de transporte que permite a las plantas mantenerse separadas espacialmente de sus descendientes (van del Pijl 1972). La dispersión de propágulos se presenta en dos estadios del ciclo de vida: durante la polinización, y por medio de frutos y semillas (Harwell y Orth 2002). En el mar, estos propágulos son transportados por el agua (Cox 1988; Philbrick y Les 1996, van Tussenbroek et al. 2009). La dispersión espacial permite colonizar áreas nuevas, y la dispersión temporal consiste en la formación de bancos de semillas como consecuencia de la producción de frutos con semillas con pericarpio duro, lo cual permite que tengan un período de latencia. Estos modos de dispersión se presentan en la mayoría de las especies de pastos marinos (42 especies) (Orth et al. 2000). Los bancos de semillas son de suma importancia pues en el caso de que se presente una perturbación, son las primeras en brotar y recolonizar el área devastada (Inglis 2000). Otra característica importante de las semillas es la que se presenta en Thalassia testudinum, donde las semillas germinan dentro del fruto, es decir, son semillas vivíparas o criptovivíparas (Tomlinson 1986; Elmqvist y Cox 1996). Esta característica también se ha reportado en Posidonia y Amphibolis, los cuales junto con Thalassia, son Géneros longevos y muy clonales. Las semillas de estos Géneros carecen de periodo de latencia y no forman banco de semillas (Orpurt y Boral 1964; van Tussenbroek et al. 2006). Las semillas de los pastos marinos típicamente no flotan por lo que cuando son liberadas del fruto, éstas únicamente logran desplazarse uno cuantos metros (Jiménez Durán 2004). Por otro lado, los frutos de los pastos marinos pueden contener aire en el citoplasma o por degradación del endocarpio, esta característica contribuye a la flotabilidad y dispersión de los mismos en algunas especies, como es el caso de la especie del presente estudio. En pastos marinos los rangos de dispersión de frutos y semillas no son muy conocidos pero en INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 11 algunos casos como Zostera marina ha sido observado que las distancias de dispersión pueden llegar a ser de cientos de kilómetros (Phillips y Meñez 1988; Kuo y den Hartog 2006). En el caso de Halophila decipiens el periodo de flotación es muy corto y los frutos permanecen enterrados en el sedimento donde se desarrollan (Birch 1981; McMillan 1988). El papel que juega la reproducción sexual en la sobrevivencia y mantenimiento de las poblaciones de pastos marinos fue considerado por mucho tiempo como de poca importancia en comparación con la reproducción clonal. La dinámica poblacional y de comunidades en cortos periodos de tiempo, puede ser explicada por la reproducción asexual (van Tussenbroek et al. 2009). Sin embargo, la importancia que se da a la reproducción sexual en las angiospermas marinas ha cambiado en la última década. Marcadores genéticos altamente polimórficos han revelado que las poblaciones de pastos marinos pueden ser genéticamente variables (Reusch 2001; Arnaud-Haond et al. 2007). La reproducción sexual puede jugar un papel importante para la estabilidad de las poblaciones a largo plazo, por ejemplo durante la recolonización, recuperación y establecimiento de poblaciones durante disturbios, así como en el mantenimiento del flujo genético entre poblaciones (Balestri y Cinelli 2003; Randall y Stachowicz 2004; Rasheed 2004; Ehlers et al. 2008). ORGANISMOS MODULARES Y CRECIMIENTO CLONAL El módulo es la unidad de construcción básica que se repite o itera a medida que un individuo crece y es el nivel más sencillo de organización en organismos modulares (Figura 3). El módulo o una agrupación de ellos pueden originar una unidad, individuo u organismo potencialmente INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 12 independiente (unidad denominada rameto de una planta clonal, Harper 1977). Todos los organismos que se formen (juntos o separados por cualquier mecanismo) a partir de un solo cigoto forman un geneto, que es un individuo con la misma composición genética (de cualquier tamaño y ocupando cualquier extensión, Mandujano 2007). En otras palabras, el proceso de crecimiento clonal es definido como el crecimiento vegetativo que incrementa el número de unidades modulares llamadas rametos, a partir de un solo geneto sin recurrir a la reproducción sexual (Begon et al. 2006; Touchette 2007). En la literatura existe mucha variación en la terminología de plantas clonales, por lo que resulta importante aclarar los conceptos correspondientes.La confusión tiene un origen filosófico, ya que algunos autores consideran que la clonalidad es una forma de crecimiento, mientras que otros consideran que es una forma de producir progenie. Dado que las especies clonales funcionan en diferentes etapas de su vida como conjuntos que potencialmente pueden independizarse física o fisiológicamente, los organismos modulares que son clonales, pueden estudiarse a distintos niveles de organización (Mandujano 2007). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 13 FIGURA 3 Ejemplo de cómo las unidades modulares pueden crecer vegetativamente y organizarse en los pastizales, siendo éstos la suma de varios genetos distintos. En este caso, el Geneto 1 contiene las unidades A-D las cuales están conformadas por uno o más rametos y el Geneto 2 es contínuo (modificado de Hämmerli 2002). En los pastos marinos, el rameto, primer nivel de organización, es el haz de hojas y una sección de rizoma con raíz (Waycott et al. 2006). Los rametos se encuentran conectados entre sí a través de rizomas. En muchas ocasiones estas conexiones se pierden con el tiempo. Al perderse las conexiones, los nuevos rametos se vuelven físicamente independientes (Pitelka y Ashmun 1985; Begon et al. 2006). Dependiendo de la longevidad de las conexiones rizomales entre rametos, y si hay trasclocación entre ellos, un agregado de los mismos puede formar conjuntos fisiológicamente integrados, el segundo nivel de organización. El tamaño de estos agregados varía entre especies (Waycott et al. 2006). Estos hábitos de crecimiento permiten que un solo individuo genético sobreviva en espacio y tiempo a través de la clonalidad. Algunos pastos marinos crecen clonalmente por miles de años formando parches clonales, vedas y eventualmente INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 14 pastizales, pudiendo ocupar varias hectáreas (Reusch et al. 1999; Bjork et al. 2008; van Dijk y van Tussenbroek 2010). El geneto es la unidad de selección genética y por lo tanto es evolutivamente relevante, ya que transmitirá los genes a la siguiente generación. Los genetos pueden ser sumamente grandes (Figura 4), por lo que la determinación de su adecuación, éxito reproductivo y longevidad, puede traer consigo muchos problemas prácticos. Debido a que las conexiones físicas entre los rametos persisten durante un intervalo de tiempo limitado, la identificación de la organización rameto/geneto en poblaciones naturales es posible únicamente utilizando marcadores moleculares (Waycott et al. 2006). Como se mencionó anteriormente, los pastos marinos no dependen de la reproducción sexual para mantener sus poblaciones (den Hartog 1970). Existen al menos cuatro aspectos que caracterizan esta situación: i) los organismos clonales tienen la capacidad de fragmentarse en piezas más pequeñas, lo que hace que las estimaciones demográficas sean muy difíciles de medir y analizar; ii) conforme los clones se desarrollan y crecen, se puede especular que la diversidad genética disminuye dentro de estas poblaciones; iii) la forma en la que los organismos clonales ocupan el espacio dificulta explicar su integración funcional y su sobrevivencia, dependiendo de si colonizan el espacio como “falange” (forma regular radial de rametos agrupados) o “guerrilla” (forma y dispersión irregular de los rametos) y si están conectados o desconectados; y iv) por su demografía fragmentada y la acumulación de mutaciones somáticas es difícil establecer claramente cuál es la unidad de selección en estos organismos (Mandujano 2007). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 15 Se piensa que la forma de crecimiento clonal es muy exitosa en ambientes acuáticos por tratarse de hábitats relativamente uniformes y estables (Philibrick y Les 1996). Por otra parte, la frecuencia con la que se lleva a cabo la reproducción sexual y el éxito reproductivo varían considerablemente entre especies y áreas geográficas (den Hartog 1970). Una frecuencia baja en la reproducción sexual puede tener como consecuencia una baja diversidad genética y, por lo tanto, un bajo potencial evolutivo (Les 1988; Waycott 2000). Las ventajas de la clonalidad desde el punto de vista evolutivo habían estado casi inexploradas hasta muy recientemente y son el producto de una visión más novedosa, en donde se considera que la clonalidad es una adaptación. Ésto se debe a que puede aparecer como una opción ecológica que permite alterar diversos atributos de la historia de vida del organismo en favor de la dispersión de un geneto (genotipo) en el tiempo y en el espacio (Mandujano 2007). El desconocimiento de la biología de poblaciones de especies clonales radica en que las teorías ecológicas y evolutivas se han desarrollado para entender organismos unitarios, mientras que las especies clonales forman más de un organismo con la misma composición genética, lo que dificulta la definición de individuo. En sus inicios los trabajos genéticos y demográficos utilizaron como sistemas de estudio especies que no tuvieran “complicaciones”, es decir: plantas de ciclo de vida corto (generalmente anuales), sin propagación vegetativa (aclonales) y hermafroditas. De manera general los modelos poblacionales y los genéticos se han desarrollado para especies unitarias, primordialmente animales (incluído el hombre) (Mandujano 2007). FIGURA 4 Esquema de estructuras clonales de Thalassia testudinum. Izq. Ejemplo del crecimiento vegetativo en varios años, así como la pérdida de conexiones físicas entre rametos. Der. Dibujo de un pastizal marino en el que es imposible identificar los diferentes genetos que lo conforman. ,/ I I .. _ ... - ..... ,,- ) hIc:.I "'CIOI'bIo" ""- ~,dlun"- / /' GENETO ~ .. _f.' ,4; ... ,.,., .... ' .... don I \ I ........... _ ..... cIIII ..... ~'$I"".S ,--..- • / ""NETO ~ .. _,. ,4; ta' ' ,lis 1 dafI \ \ I / / INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 17 En cuanto a los estudios genéticos de plantas clonales, gran parte de los trabajos parten de muestreos dirigidos con el objetivo de evitar en lo posible recolectar individuos que presenten el mismo genotipo (i.e. rametos de un geneto). En este sentido, existe un rezago en cómo modelar la biología de las poblaciones clonales, ya que inicialmente se consideró la clonalidad como un “ruído” que complicaba considerablemente esta modelación. Por ejemplo, la clonalidad puede llevar a sobrestimar el número de individuos (genetos), y además, los patrones de distribución espacial que se generan por la clonalidad afectan los supuestos de la reproducción aleatoria, ya sea aumentando la endogamia o disminuyendo la adecuación por depresión endogámica (Mandujano 2007). MARCADORES MOLECULARES Un marcador molecular es un fragmento de ADN (ácido desoxirribonucléico) que dependiendo de su ubicación en el genoma, su función y su tasa de mutación, sirve como herramienta para contestar preguntas a diversas acerca de la biología de los organismos a diversas escalas espacio- temporales, es decir, nos abren diferentes ventanas para el estudio de la evolución de las especies. La utilidad de éstos se basa en la probabilidad de detectar el polimorfismo de las secuencias de ADN o de las proteínas generadas. La presencia de polimorfismos permite realizar comparaciones a nivel molecular y hacer interpretaciones sobre la filogenia, la taxonomía y la genética poblacional de los organismos de interés.Un marcador molecular adecuado para el análisis de la variabilidad genética en las poblaciones debe tener las siguientes características: 1) ser moderada a altamente polimórfico; 2) ser codominante; 3) tener alelos únicos, no ambiguos; INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 18 4) tener una alta frecuencia en el genoma; 5) tener una distribución homogénea en el genoma; 6) ser neutral; 7) ser de fácil acceso y reproducción; 8) contar con un protocolo sencillo de visualización, 9) ser transferible entre laboratorios y 10) tener bajo costo de diseño y reproducción (Weissing et al. 2005). En la práctica, no existe ningún marcador que cumpla con todas estas características y la selección del marcador a utilizar en cada caso dependerá de la especie o grupo taxonómico de interés, el objetivo del estudio y el presupuesto que se tenga (Ouborg et al. 1999; van Dijk 2008). Entre los primeros marcadores moleculares utilizados en los estudios de pastos marinos se encuentran los polimorfismos de productos del ADN (i.e. proteínas), siendo las aloenzimas los más conocidos (McMillan 1980; Williams y Davis 1996). Por otro lado, los microsatélites, también conocidos como SSRs, VNTEs y STR (Simple Sequence Repeats, Variable Number Tandem Repeats y Short Tandem Repeats, por sus siglas en inglés respectivamente), son iteraciones de 1 a 6 pares de bases, presentes en los genomas de todos los organismos. Las regiones de microsatélites son extremadamente polimórficas y varían a una tasa de entre 10-2 y 10-6 mutaciones/locus/generación, con un promedio de 5 x 10-4 (Selkoe y Toonen 2006; Procaccini et al. 2007). Al ADN que se encuentra contiguo al locus del microsatélite se le llama región flanqueante (o “flanking región”), la cual es usualmente es una región conservada en todos los individuos de la misma especie y, en algunas ocasiones, en individuos de especies diferentes. Los oligonucleótidos o “primers” son secuencias cortas de ADN que están diseñadas para unirse específicamente a las regiones flanqueantes de los microsatélites, y así guiar la amplificación del mismo durante la reacción conocida como PCR (reacción en cadena de la polimerasa, o Polymerase Chain Reaction, por sus siglas en inglés). INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 19 Cada par específico de primers está diseñado para producir el aislamiento de un microsatélite en particular. A diferencia de las regiones flanqueantes, las repeticiones en las secuencias de los microsatélites ocurren como consecuencia de errores durante la replicación de ADN, a lo largo de su historia evolutiva. El número de repeticiones determina el tamaño de las secuencias, produciendo múltiples alelos para cada locus de microsatélite. Debido a que los alelos difieren en tamaño, pueden ser distinguidos mediante la electroforesis en geles de alta resolución (Selkoe y Toonen 2006). La disponibilidad de varios loci con múltiples alelos cada uno permite distinguir inequívocamente entre un individuo y otro (identificación de cada geneto). Una de las desventajas de los microsatélites es el poco conocimiento que se tiene sobre su modelo de mutación, lo que puede ser causa de homoplasia (alelos del mismo tamaño pero pertenecientes a linajes diferentes, lo cual opacaría la diversidad alélica de las poblaciones y podría aumentar las estimaciones de flujo génico si la tasa mutacional es alta; Selkoe y Toonen, 2006) o de estimaciones erróneas de divergencia. A pesar de esto, los microsatélites siguen siendo los marcadores más variables y son relativamente fáciles de desarrollar. Diversos loci de microsatélites nucleares se han utilizado en estudios para Zostera marina (Reusch et al. 1998), Z. noltii (Coyer et al. 2004), Posidonia oceanica (Procaccini y Waycott 1998), Cymodocea nodosa (Alberto et al. 2003) y T. testudinum, la especie de este estudio (van Dijk et al. 2007). Actualmente los microsatélites han superado en número a los loci de aloenzimas, debido a su naturaleza codominante, ubicuidad y altos niveles de polimorfismo. Los INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 20 análisis típicos utilizan entre 8 y 20 loci, con un número de alelos variable entre 4 y 100 alelos por locus, dependiendo de la aplicación específica (Selkoe y Toonen 2006). DIVERSIDAD Y ESTRUCTURA GENÉTICA ESPACIAL La distribución y cuantificación de la diversidad genética en los seres vivos ha sido de gran interés en la biología. La genética de poblaciones por su parte, estudia los procesos y mecanismos que determinan esta variación en poblaciones naturales en función de la estructura genética (Hartl y Clark 1997). Entender la estructura genética espacial en las poblaciones de especies no modelo con poco conocimiento de la cantidad y modo de dispersión de propágulos sexuales, promueve la comprensión de los patrones reproductivos y por lo tanto de su ecología. Además, la estructura genética espacial nos permite comprender también el papel que juega la clonalidad en el mantenimiento de las poblaciones. La variación genética debe cuantificarse de manera estandarizada para poder realizar comparaciones. La heterocigosidad esperada (HE) es la medida de variación genética más utilizada (Hedrick 2005). Los marcadores codominantes, como los microsatélites, nos permiten distinguir entre individuos heterocigotos u homogicotos para un locus determinado, por lo tanto nos permiten realizar cálculos de las frecuencias alélicas. Al nivel más fundamental, la respuesta de los pastos marinos a los cambios ambientales depende de su composición genética y de la interacción de los genes con el ambiente. Los efectos del flujo y deriva génica, las mutaciones, la demografía y el aislamiento, determinan la diversidad genética y su estructura. Al mismo tiempo, la selección natural actúa sobre los diversos genotipos determinando las adaptaciones ecológicas a través de cambios en los genes. Durante los últimos INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 21 15 años, los ecólogos moleculares (cuyo estudio se basa en la utilización de marcadores moleculares en campos como la ecología y evolución) han logrado un gran progreso en el entendimiento de la estructura genética poblacional y su dinámica, a través de la aplicación de marcadores genéticos neutrales y polimórficos (Procaccini et al. 2007). Hasta hace pocos años, se pensaba que los pastos marinos tenían un bajo nivel de diversidad genética (Les 1988; Waycott 1995; Procaccini y Mazzella 1996; Procaccini et al. 1996; Waycott y Barnes 2001), lo cual se atribuía al crecimiento clonal y al reducido establecimiento de las plántulas resultantes de la reproducción sexual. Estas conclusiones, derivadas de la utilización de ciertos marcadores moleculares (aloenzimas, DNA polimórfico amplificado al azar o RAPD y polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción o RFLP) han sido revisadas a la luz de los recientes resultados obtenidos utilizando marcadores nuevos, como los microsatélites (Arnaud-Haond et al. 2005) con los cuales se ha profundizado más en los estudios de diversidad genética de pastos marinos mostrando que esta diversidad no es tan baja como se pensaba (Coyer et al. 2004; Olsen et al. 2004; Alberto et al. 2005; Muñiz-Salazar et al. 2005). Los primeros estudios de diversidad genética en pastos marinos en los que utilizaron microsatélites, datan de 1998 (Procaccini y Waycott 1998), cuando se estudiaron praderas del pastomarino Posidonia oceanica registrando un bajo nivel de diversidad clonal. Un año después, Reusch et al. (1999), utilizando también microsatélites, reveló una alta diversidad genética en Zostera marina. Debido a que los estudios genéticos anteriores revelaban casi una completa INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 22 monoclonalidad en estas praderas, estos nuevos descubrimientos fueron muy importantes y abrieron las puertas al estudio de la variabilidad genética en poblaciones de pastos marinos. La estructura genética espacial (spatial genetic structure o SGS, por sus siglas en inglés) puede definirse como la distribución no aleatoria de alelos a una determinada escala espacial, la cual puede ser el resultado de dispersión limitada, selección, deriva génica e historia poblacional, esto provocado a su vez por distintos factores geográficos, ecológicos o conductuales (Hedrick 2005). A una escala espacial fina, la causa más probable de la estructura genética es probablemente la formación de estructuras locales de pedigrí, provocadas por una dispersión limitada de genes. En este contexto, la similitud genética es mayor dentro de un vecindario determinado, y menor si consideramos una distancia mayor entre los individuos (Alberto et al. 2005). La estructura poblacional de las especies se ha estudiado mediante los valores de frecuencias alélicas y su desviación de los valores esperados bajo el equilibrio de Hardy-Weinberg (Excoffier et al. 1992). Esta ley describe que en una población en la que no actúan las fuerzas evolutivas (mutación, selección natural, deriva génica y flujo genético) las frecuencias alélicas no cambiarán a través de las generaciones, pudiéndose calcular mediante fórmulas matemáticas. Esta población constituye un modelo nulo, por lo que nos permite comparar con la población de estudio y posteriormente realizar inferencias en cuanto a las fuerzas que pueden estar teniendo un efecto sobre la misma (Hedrick 2005). Sewall Wright (1951) introdujo los estadísticos F para analizar las frecuencias alélicas en las poblaciones. FST mide la diferenciación genética entre las poblaciones mediante la correlación de las frecuencias alélicas de los individuos dentro de una subpoblación con respecto a toda la población. Otro parámetro es el índice FIS el cual mide la INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 23 reducción de la heterocigosidad de un individuo debido al apareamiento no aleatorio dentro de su subpoblación (Hartl y Clark 1997). Una pregunta clave para los organismos clonales es el efecto de este modo de reproducción en la estructura genética espacial. A pesar de esto, muchos estudios han incrementado la porosidad de sus muestreos con la finalidad de evitar los efectos de la clonalidad en la estructura genética espacial (por ejemplo, se selecciona la distancia mínima de muestreo de manera que sea mayor que el tamaño esperado del clon). Ésto da como resultado la pérdida de información, tanto del papel de la clonalidad en la SGS, como del papel de la SGS a escala fina (Alberto et al. 2005). La estructura genética espacial en plantas, también es el resultado de la dispersión de polen y semillas, afectados a su vez por la clonalidad. Se espera que ésta influya en los patrones de estructuración genética por dos razones: 1) la distribución agregada de los clones con un genotipo idéntico (genetos), y 2) porque este tipo de crecimiento también es un componente de la dispersión en el espacio. Las plantas clonales generan individuos a través de propagación vegetativa, la cual es más frecuente que la reproducción sexual, de forma anual, y generalmente produce patrones de distribución agregada. La distribución no aleatoria de los rametos y genetos en un área particular, provoca que se violen los principales supuestos de los modelos poblacionales y los genéticos, en particular la panmixia (entrecruzamientos al azar). La expansión de clones puede interferir con los patrones de dispersión de polen, afectando las oportunidades de apareamiento de los genetos (Mandujano 2007). La fuerza con la que la clonalidad afecte la estructura genética dependerá del tipo y cantidad de crecimiento clonal (Marbà y Duarte 1998), la INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 24 distribución de los clones, así como la fragmentación y el tiempo de vida de los genetos. Por ejemplo, si un clon se fragmenta y se presenta a gran distancia del brote original, entonces la reproducción clonal incrementa la dispersión del geneto. En las especies que presentan crecimiento clonal de tipo “guerrilla”, se espera que haya una mayor intercalación de clones y una mayor dispersión. Por lo contrario, si se presenta la estrategia de tipo “falange”, ésta traerá consigo que los clones se aglomeren y, por lo tanto, que la estructura genética se incremente (Alberto et al. 2005). Los modos de reproducción sexual, clonal, o una combinación de ambos, no son los únicos factores que determinan la cantidad y distribución de la diversidad genética en las poblaciones, otros factores importantes son el tamaño poblacional, la selección natural y las tasas de mutación (Hartl y Clark 1997). Por lo tanto, la estructura genética en especies clonales puede estar influenciada por el modo de reproducción y por el tamaño de los clones, particularmente por los individuos más largos y viejos, cuya contribución al número de descendencia puede ser grande, reduciendo así el tamaño efectivo poblacional (Richards 1986; Hartl y Clark 1997; Alfonso- Corrado et al. 2004). En pastos marinos, para realizar interpretaciones sobre la estructura genética de una población es muy importante identificar a los individuos genéticos o genetos. Al conocer la diversidad y la distribución de los genetos se puede estimar la edad de los clones. Un ejemplo de este tipo de estudio es el de Zostera marina en el Mar Báltico, donde se usaron microsatélites y se encontró que la población estaba conformada por pocos genetos grandes y muchos pequeños (Reusch et al. INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 25 1998). Otro estudio con un resultado totalmente diferente fue el de McMahon (2005), quien analizó la diversidad clonal de la especie Halophila ovalis en la Bahía de Moreton, Australia. En este estudio genético se utilizaron ISSRs (Inter Sample Sequence Repeats, por sus siglas en inglés) como marcadores genéticos y todas las muestras resultaron tener un genotipo diferente (McMahon 2005). ANÁLISIS DE AUTOCORRELACIÓN ESPACIAL Los análisis de autocorrelación espacial prueban la dependencia de una variable en una localidad con respecto a otra. En caso de encontrar dependencia, se dirá que la variable exhibe autocorrelación espacial, también se puede conocer si esta autocorrelación es positiva o negativa así como su intensidad. La autocorrelación será positiva si los valores relacionados muestran un patrón de asociación geográfica, y negativa si este patrón está ausente (Sokal y Oden 1978). En los estudios genéticos los análisis de autocorrelación espacial examinan la relación genética entre pares de individuos de acuerdo con su posición en el espacio (Epperson 2003; Vekemans y Hardy 2004), y se presenta cuando las frecuencias alélicas de los individuos se correlacionan con la presencia o ausencia de los mismos alelos en individuos cercanos (Sokal y Oden 1978). Para los marcadores genéticos neutrales, la autocorrelación puede servisualizada en un correlograma (Sokal y Oden 1978) en cual se utilizan coeficientes de autocorrelación espacial que indican si los valores de una variable tienen relación y en que magnitud. En este estudio de utilizará el coeficiente de parentesco o coancestría (Fij, Loiselle et al. 1995) contra la distancia geográfica entre dos poblaciones. El correlograma obtenido se observará como una gráfica en donde la INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 26 pendiente de la ecuación de la regresión lineal de la gráfica puede ser utilizada como estimador de patrones de la estructura genética espacial como por ejemplo, de la dispersión y del tamaño del vecindario genético de Wright (Fenster et al. 2003). En plantas clonales probablemente la estructura genética se verá caracterizada por una autocorrelación espacial positiva en las clases de distancia menores, y se hará negativa en las más grandes (Peakall et al. 2003). Anteriormente, en estudios de Thalassia testudinum se han utilizado diversos marcadores genéticos incluyendo aloenzimas (McMillan 1980; Schlueter y Guttman 1998), RAPDs (Kirsten et al. 1998; Larkin et al. 2006), ISSRs (Davis et al. 1999), AFLPs (Amplified Fragment Lenght Polimorphism (Waycott y Barnes 2001) y más recientemente microsatélites (van Dijk et al. 2007, 2009; van Dijk y van Tussenbroek 2010; Bricker et al. 2011). En general, se ha encontrado una diversidad genotípica alta a nivel poblacional, con una baja diferenciación entre poblaciones y una distribución homogénea de la diversidad a larga distancia (van Dijk 2008; van Dijk et al. 2009; Bricker et al. 2011). En el presente estudio se llevó a cabo un muestreo intensivo de Thalassia testudinum en un pastizal del Caribe mexicano, con el objetivo de estudiar a una escala fina el vecindario genético de las poblaciones. Para tal fin se determinó la estructura genética por medio de análisis de autocorrelaciónen dos sitios, uno cercano al arrecife y otro a media laguna arrecifal, así como la diferenciación genética entre ellos. También se estableció la relación entre la identidad de los genotipos y la distancia que existe entre ellos. Con base en los resultados, las preguntas que se abordaron corresponden a algunas de las incertidumbres más grandes para la especie: ¿Cuánto INTRODUCCIÓN Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 27 espacio ocupa un geneto?, ¿Cómo es la dinámica reproductiva de las poblaciones?, y ¿Qué importancia tiene la reproducción sexual (recombinación genética), tomando en cuenta su alto nivel de clonalidad? OBJETIVOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 28 OBJETIVOS OBJETIVO GENERAL Estudiar la estructura genética a pequeña escala del pasto marino Thalassia testudinum en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, con el uso de marcadores moleculares microsatélites para comprender mejor la función e importancia de la reproducción sexual y asexual en el mantenimiento de las poblaciones en la zona de estudio. OBJETIVOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 29 OBJETIVOS PARTICULARES Reconocer los diversos genotipos en cada sitio muestreado y compararlos. Evaluar el nivel de variación genética de Thalassia testudinum en los dos sitios estudiados. Determinar si Thalassia testudinum presenta una estructura genética poblacional. Conocer la arquitectura clonal de los sitios de estudio por medio de representaciones gráficas o mapas. Estimar la edad de los genetos por medio de la reconstrucción de sus tamaños. Calcular la riqueza, diversidad y intervalo clonal, así como los índices de agregación, para conocer las características clonales de cada sitio. Determinar si existe algún tipo de autocorrelación significativa entre el parentesco de los individuos y la distancia geográfica. Conocer el tamaño del vecindario genético así como la dispersión genética en ambos sitios muestreados mediante la elaboración de autocorrelogramas. MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 30 MATERIAL Y MÉTODOS THALASSIA TESTUDINUM (BANKS EX KÖNING 1805) La especie Thalassia testudinum Banks ex Köning (Familia: Hydrocharitaceae), conocida comúnmente como pasto tortuga (Figura 5), se distribuye en la región biogeográfica del Atlántico tropical, que incluye el mar Caribe, el Golfo de México, Bermuda, las Bahamas y las costas del Atlántico Occidental desde Venezuela hasta Florida, entre los 9°S y 32°N (Figura 6). En México, esta especie se localiza en Tamaulipas, Veracruz, Campeche, Yucatán y Quintana Roo (Green y Short 2003; Short et al. 2007), desde áreas expuestas durante mareas bajas, hasta profundidades de 10 m y crece en sitios con sustratos lodosos o arenosos (Phillips y Meñez 1988). Las praderas de esta especie generalmente no son monoespecíficas, comúnmente se encuentra acompañada de los pastos marinos Syringodium filiforme o Halodule wrightii, algas rizofiticas calcáreas como Halimeda spp. y Udotea spp. y algas no calcáreas como Caulerpa spp (Cruz-Palacios y van Tussenbroek 2005; van Tussenbroek et al. 2006). MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 31 FIGURA 5 Thalassia testudinum. a) Dos haces unidos por el rizoma; b) Flor masculina; c) Flor femenina; d) Fruto (Orpurt y Boral 1964; Tomlinson 1974; van Dijk 2008; van Tussenbroek 2011; http://www.seabean.com/guide). Además de T. testudinum, el género Thalassia también incluye a la especie T. hemprichii (Ehrenb) Aschers, que se considera su especie gemela y se distribuye en los Océanos Pacífico e Índico (Green y Short 2003; Kuo y den Hartog 2006; van Tussenbroek et al. 2006). Ambas especies son subtropicales y se piensa que las dos se originaron en el Mar de Thetis y que se separaron hace más de 24 millones de años, debido a los movimientos de deriva continental que formaron los actuales Océanos Atlántico Occidental y Pacífico Occidental (van Tussenbroek et al. 2006). http://www.seabean.com/guide MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 32 FIGURA 6 Distribución actual de Thalassia testudinum (adaptado de Green y Short 2003). Un haz consiste en un rizoma vertical y sus hojas e inflorescencias correspondientes. Thalassia testudinum exhibe una clara diferenciación entre sus haces, con un rizoma rastrero horizontal del cual emergen rizomas verticales a intervalos regulares (Figura 7). El rizoma vertical produce hojas, y las inflorescencias se encuentran en las axilas del follaje. El follaje consiste en láminas sin color y láminas verdes; éstas últimas son la única parte de la planta visible sobre el sustrato. Los haces foliares generalmente tienen entre dos y seis hojas, cada una con una longitud de entre 10 y 60 cm (den Hartog 1970; Green y Short 2003). MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 33 FIGURA 7 Hábitos generales de crecimiento de Thalassia testudinum. a) Rizoma horizontal con un haz que se ha ramificado y un haz en estado de latenciatambién ramificado; b) Esquema que representa la sección de rizoma presentado en A (van Tussenbroek et al. 2006). Abajo se muestra una ilustración de los brotes rastreros de la especie de estudio, flor masculina y femenina, botones y semillas (Ilustración de Elvia Esparza). MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 34 La producción de nuevos rizomas horizontales (propagación vegetativa) ocurre a través de la ramificación lateral del rizoma vertical. T. testudinum es una planta clonal, pues está compuesta de módulos que potencialmente pueden vivir independientemente (Figura 7). Experimentos de trasplante han demostrado que son necesarios por lo menos dos haces unidos para que el rameto sobreviva (Tomasko et al. 1991). Thalassia testudinum es una especie dioica y los clones masculinos y femeninos (Figuras 7 y 8) generalmente coexisten, aunque hay excepciones (Durako y Moffler 1985; Short et al. 2007). Las flores femeninas de T. testudinum crecen en las axilas de las hojas sobre los rizomas verticales (Figuras 5 y 8), los estigmas del pistilo son largos, con grandes células papilares para atrapar el polen y se encuentran encima del substrato (Tomlinson 1969). Estas flores tienen un pedúnculo de 3-4 cm de largo y presentan 7-8 estilos largos (den Hartog 1970; Phillips y Meñez 1988). El ovario contiene usualmente 4 óvulos en lóculos individuales (van Tussenbroek et al. 2010). Las flores masculinas comúnmente forman conjuntos de 2 a 3 flores que se desarrollan en secuencia (Figura 8). La altura de las flores masculinas sobre el sustrato varía de 1 - 3 cm, tienen un pedicelo de 1.25 - 2.5 cm de largo y poseen 9 estambres (den Hartog 1970; Phillips y Meñez 1988). Los tépalos son incoloros pero poseen motas de tonalidad violeta (den Hartog 1970). Según Cox y Tomlinson (1988) y van Tussenbroek et al. (2008), la antesis de las flores masculinas es durante la noche y la dehiscencia de las anteras ocurre a través de aperturas longitudinales. MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 35 FIGURA 8 Flor masculina (izq.) y femenina (der.) de Thalassia testudinum, fotografiadas en Belice (Foto de B. van Tussenbroek). En Thalassia testudinum la proporción polen:óvulo varía de 4 a 7 x 104 : 1 en el área de estudio (van Tussenbroek et al. 2010). Los granos de polen tienen un diámetro aproximado de 56 μm (Figura 9) y se dispersan embebidos en una matriz mucosa de flotabilidad negativa de más o menos 1 cm de largo (van Tussenbroek et al. 2009). Estas masas mucilaginosas, al ser transportadas por las corrientes, aumentan la eficacia del polen para llegar a una flor femenina (Cox 1983). La distancia de dispersión del polen es relativamente corta, según el estudio realizado por Sanabria Alcaraz (2009) en el que se calcula que el desplazamiento máximo del polen en esta especie es de 8 m. MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 36 FIGURA 9 Grano de polen de Thalassia testidinum atrapado en una pluma de ave que fungió como trampa de polen (tomada del studio de Sanabria Alcaraz 2009). (izq). Polen aislado con un diámetro de 52 µm, barra 10 µm (der. foto de R. Wong, tomado del estudio de Muhlia Montero 2011). Después de la fecundación, el ovario de la flor femenina se desarrolla en un fruto con carnoso. El fruto es una cápsula dehiscente de forma globosa con un diámetro de aproximadamente 20 a 25 mm y llega a su madurez entre julio y octubre (Figura 10). El fruto maduro es suave y cambia de verde brillante a verde amarillento y ocasionalmente a rojo y contienen usualmente 2 o 3 semillas (Orpurt y Boral 1964; Jiménez Durán 2004). El fruto maduro puede permanecer pegado a la planta parental, en donde se abre y libera las semillas, o se puede liberar por medio de la acción de las olas y abrir cuando está flotando. Las semillas de T. testudinum desarrollan sus hojas primordiales dentro del fruto y, por lo tanto, se pueden considerar como criptovivíparas. La viviparidad (o criptoviviparidad) es muy rara en el reino vegetal y se ha registrado en pocas especies de manglares y pastos marinos (Elmqvist y Cox 1996). El fruto, alternativamente puede desprenderse del pedúnculo, flotar en la superficie del agua y desplazarse a largas distancias. Más del 90% de los frutos se abren mientras todavía están adheridos a la planta madre liberando las semillas dentro de la pradera madre (Jiménez Durán 2004). La distancia recorrida es muy poca, 1 MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 37 a 2 metros, debido a que las semillas son negativamente boyantes. A veces, las semillas logran flotar durante unas pocas horas (Kaldy y Dunton 1999). Los frutos flotantes son propágulos de dispersión a larga distancia, y pueden flotar hasta por 10 días. La distancia máxima de transporte del fruto es de 15 a ~100 km (Jiménez Durán 2004; Kaldy y Dunton 1999; van Dijk et al. 2009). FIGURA 10 Fruto cerrado de Thalassia testudinum en una pradera (Izq). Fruto abierto conteniendo dos semillas (Der.) (van Tussenbroek et al. 2010). En el Caribe mexicano, la reproducción sexual es estacional, iniciando de enero a marzo con los primordios de las flores, las cuales se desarrollan como flores en antesis de abril hasta septiembre y los frutos se presentan desde julio hasta octubre (van Tussenbroek 1994). Hasta el momento, no se ha definido con claridad cuál es la función de la reproducción sexual de esta especie; van Tussenbroek et al. (2006) plantearon que la reproducción sexual en T. testudinum debe ser de gran importancia para el mantenimiento de la diversidad genética local de las praderas y que la dispersión de los frutos flotantes es una estrategia para la colonización de áreas lejanas. MATERIAL Y MÉTODOS Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum (Banks ex Köning) en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo 38 Por otro lado, Thalassia testudinum, como todos los pastos marinos, presenta un gran crecimiento vegetativo. El crecimiento horizontal por medio de la extensión de los rizomas es de 19-35 cm/año-1 dependiendo del sitio estudiado (Gallegos et al. 1993; van Tussenbroek et al. 2006). La edad del geneto más grande que se ha genotipificado para esta especie es de 1050 a 1950 años y fue encontrado en Bermuda en el estudio realizado por van Dijk (2008). El presente estudio tiene lugar en dos sitios contrastantes de la laguna arrecifal de Puerto Morelos. El primero, estación Arrecife, en donde la densidad de los rametos es de 661 haces por m2, la frecuencia de floración la frecuencia de floración es alta (van Tussenbroek 1994; Muhlia Montero 2011). El segundo sitio se localiza en la laguna media, estación Laguna, y es un área más profunda, en donde la frecuencia de floración es baja en comparación con el otro sitio, y se ubica más cercano a la costa. ÁREA DE ESTUDIO La laguna arrecifal de Puerto Morelos se encuentra en la costa noreste de la Península de Yucatán, en el Caribe mexicano (20°85´N; 86°85´O; Figura 11); está limitada por un arrecife coralino situado entre 350 m y 1600 m de la costa y tiene una profundidad promedio de 3-4 m. El arrecife es de tipo barrera bordeante y corre de norte a sur paralelo a la línea de costa (Jordán et al. 1981). El fondo de la laguna arrecifal está cubierto por arena calcárea estabilizada por comunidades de pastos marinos en las cuales se pueden encontrar especies como Thalassia
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