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MICROBIOLOGIA
Clasificación de los seres vivos: Para poder optimizar su estudio, los microorganismos se han clasificado en reinos, y posteriormente en dominios. La clasificación, nomenclatura e identificación, son las tres áreas interrelacionadas de la taxonomía. Los seres vivos pueden reproducirse sexualmente entres si, formando las especies; un conjunto de especies semejantes forma un género, varios géneros forman una familia, luego el orden, la clase, reino y por último el dominio. 
Microbios: todos los seres vivos invisibles a simple vista, por lo que son un conjunto heterogéneo de organismos.
REINOS
· Monera: formado por seres unicelulares microscópicos (bacterias)
· Protoctista: Seres unicelulares eucariotas (protozoos-heterótrofos y algas unicelulares-fotosintetizadoras)
· Plantae: Seres unicelulares eucariotas fotosintetizadorsas (plantas)
· Fungi: Seres unicelulares(levaduras) y pluricelulares(mohos y setas) eucariotas con una pared estructural característica con quitina
· Animalia: Seres pluricelulares cuyas células eucariotas carecen de pared rígida con celulosa y son heterotrófas. 
· Virus: no son incluidos en ninguno de los reinos. Para multiplicase dependen de la célula huésped ya que utilizan su energía. 
DOMINIOS
A partir del descubrimiento de los ribosomas, que no son iguales en todas las células, a partir de las secuencias de ARN ribosómico (por una evolución distinta) se distinguieron tres grupos celulares con características diferentes:
1) Eucarya: animales, vegetales hongos y protistas. Son todos los organismos compuestos por células eucariotas
2) Bacteria: todos los procariotas patógenos, no patógenos del suelo y el agua y los fotoautótrofos.
3) Archea: procariontes que no tienen peptidoglucano en su pared celular, que a menudo viven en ambientes extremos y llevan a cabo procesos metabólicos no habituales.
Se cree que un antepasado universal común se dividió en tres linajes (los que componen hoy los dominios). Este antepasado común era un procarionte que, según la teoría endosimbiótica las células eucariotas evolucionaron a partir de células procariotas que vivian una dentro de otra (endosimbiontes), y de esto se evidencia en el ADN mitocondrial y cromoplástico. Se cree que los plegamientos internos de la membrana citoplasmática dieron lugar a la membrana nuclear. 
Según el tipo celular los organismos pueden clasificarse en células procariotas (bacterias) o eucariotas
CÉLULAS PROCARIOTAS: BACTERIAS
Son organismos unicelulares procariotas con una organización simple: no contienen nucléolo delimitado por membranas ni estructuras membranosas. Las c procariotas son muy parecidas entre ellas, mostrando una uniformidad de forma y tamaño aunque tienen diferencias en las vías metabólicas para la obtención de energía -> les permite ocupar los hábitats más diversos de la tierra.
Estructura:
· ENVOLTURAS
1. Membrana celular: actúa como barrera física entre el citoplasma y el medio ambiente y ejerce un control selectivo del movimiento de diversas sustancias desde y hacia la célula. Las moléculas ingresan por tres procesos: difusión simple(H2O, N2, NH3, O2)
2. Pared celular glucoproteica por fuera. Está en todas las bacterias excepto en los Mycoplasmas. Le da forma y protege a la bacteria aunque su presencia hace a las bacterias vulnerables a los antibióticos (inhiben la síntesis de la pared y sus materiales como peptidoglucano, muereina, mucopeptido, glicopeptido y muropeptido el más importante)
3. Cápsula: polisacáridos y complejos de polisacáridos y polipéptidos. Es importante para la patogenia y virulencia de la bacteria.
· CITOPLASMA: contiene gránulos citoplasmáticos con glucógeno (función de almacenamiento), ribosomas libres (células en crecimiento forma polisomas), enzimas, involucradas en reacciones anabólicas y catabólicas necesarias para el crecimiento celular y la reproducción.
Dentro de este también encontramos a la región nuclear (Única molécula de ADN de doble cadena circular muy plegado en el citoplasma, cuya región se llama nucleoide y al carecer de membrana nuclear no hay nucléolo) 
Plasmidos: Moléculas de ADN que no pertenecen al cromosoma bacteriano y se multiplican independientemente que tienen una pequeña parte de la información genética.
· APÉNDICES: flagelos, Pili. Son largos filamentos proteicos, no todas las bacterias son flageladas. Está compuesto por tres partes: filamento, gancho y cuerpo basal. Químicamente formado por flagelina. Son responsables de la motilidad de la bacteria, puede demostrarse en el medio líquido o semisólido. Fimbrias y pilus son apéndice no flagelares, relacionados con la transferencia de material genético (pili sexual), y aquellos que no estén relacionados con la transferencia se denominan fimbrias. 
· ESPORAS: o endosporas son una estructura latente dentro de la célula que puede sobrevivir períodos en condiciones adversas, una vez que terminan esas condiciones desaparece.
Se reproducen a través de fisión binaria a expensas de nutrientes inanimados (excepto chlamydias y rickettsias que necesitan células vivas para su replicación), en general son haploides, miden entre 0,5 y 5 um mayormente. No llevan a cabo endocitosis y son incapaces de ingerir partículas. Se nombran con dos palabras, la del género y la propia de la especie, ej Staphylococcus aureus. Algunas bacterias se denominan informalmente con coloquios. Ej neumococo
CLASIFICACIÓN DE BACTERIAS
· Esferas -> cocos: los cocos libres aparecen como células aisladas, pero luego de la división celular muchas no se separan totalmente originando distintos agrupamientos. Según el plano de división, se pueden distinguir en pares (diplococos), en cadenas, en tétradas y/o racimos.
· Cilíndricas -> bacilos: pueden ser muy cortos (cocobacilos) o tener una longitud de 2 a 10 veces su diámetro. Sus extremos pueden ser redondeados, cuadrados o agudizados. Pueden tener forma de coma o helicoidales en una sola curva
· Helicoidales o espiroquetas -> espirilos: longitud de 1 a 5 um. Varían según el estado del crecimiento y del medio de cultivo utilizado
· Vibrión -> forma de coma
COMPOSICION QUIMICA DE LAS BACTERIAS: agua (70-80 %), contenido proteico (40-60 %), hidratos de carbono (4-20 %) y lípidos, ADN, ARN y otros componentes de bajo peso molecular. 
TINCIÓN GRAM: La tinción diferencial de Gram, permite encasillar a las bacterias en dos grandes grupos y se basan en la composición química de las paredes celulares (según la mayor o menor cantidad de ácidos teicocos). Es importante porque además de facilitar la observación de las bacterias permite diferenciarlas en dos grupos: gram positivas y gram negativas.
1°: Los preparados se tiñen con violeta de genciana (violeta lugol), quedando todas las bacterias teñidas de color violeta intenso. Se cubre con alcohol y acetona y algunas bacterias se decoloran pero otras conservan el color violeta. Las que conservan la coloración son Gram positivas: Tienen varias capas de peptidoglucano, ácido teicoco y acido teicuronicos en su pared (permite la retención del complejo cristal violeta lugol). Las que se decoloran son Gram negativas que poseen una capa mucho más delgada (por eso no retiene el colorante porque los colorantes son hidrófilicos y el alcohol busca hidratarse, se lleva agua y con ella el colorante), y tienen una composición de ácidos teicocos mucho menor, con una bicapa lipídica externa que se disuelve con el decolorante alcohol 70% y acetona 30%; y por esto no retiene el complejo cristal violeta lugol y no se tiñen de violeta. En cambio se tiñen de rojo-rosado por medio de fuscina básica.
2°: Para acentuar esta diferencia se usa una coloración que contraste con el primero para teñir las gram negativas, que han quedado decoloradas y para eso se usa fucsina o sarafina (rosado)
Violeta intensa -> gram positiva (citoplasma que posee ribosoma y nucleoide, membrana citoplasmática, pared celular y capsula exopolisacarida)
Rosa suave -> gram negativas (citoplasma, membrana citoplasmática, pared celular, espacio perisplasmatico, membrana externa y matrizexopolisacarida) 
CRECIMIENTO BACTERIANO
I. Fase de adaptación (conlleva un lento crecimiento, donde las células se preparan para comenzar un rápido crecimiento, y una elevada tasa de biosíntesis de las proteínas necesarias para ello, como ribosomas, proteínas de membrana)
ADHERENCIA BACTERIANA: paso critico de todo proceso infeccioso y es de tipo específico ADHESINA-RECEPTOR.
· ESPECIFICIDAD DE TEJIDO: el microorganismo afectante se adhiere a la células del tejido que invade( depende de pH optimo, temperatura constante, biodisponibilidad de nutrientes)
· ESPECIFICIDAD DEL HUESPED: hay microorganismo que solo son infectantes para el humano. 
II. Fase exponencial (se caracteriza por el crecimiento exponencial de las bacterias) 
III. Fase estacionaria (se produce como consecuencia del agotamiento de nutrientes) 
Especie procarionte: población de células con características similares.
Cultivo: bacterias que crecen en un tiempo dado en los medios. Un cultivo puro puede ser un clon si toda la población celular deriva de única célula, por lo que deberían ser idéntios. Cuando no son idénticos, cada grupo celular es una cepa.
LAS BACTERIAS POSEES GRAN VARIABILIDAD, POR LO QUE LA INMUNIDAD ADQUIRIDA PARA UN CEPA NO BASTA PARA LUCHAR CONTRA OTRA.
CÉLULAS EUCARIOTAS
Estructuralmente más complejas que las procariotas. Evolutivamente adquirieron mitocondrias y cloroplastos que, como tienen su propio ADN, se cree que se dio a partir de una simbiosis de células procariotas; los que le permitió la respiración aerobia y la fotosíntesis. Según la fuente energética empleada:
· Organoheterótrofos: protozoos, hongos y animales que utilizan la materia orgánica como fuente de energía y carbono.
· Fotoauótrofas: Algas y plantas que utilizan la luz solar como fuente de energía y el Co2 atmosférico como fuente de C.
Las células eucariotas entonces tienen:
· Sistemas energéticos (mitocondrias o cloroplastos)
· ADN fragmentado en cromosomas rodeado por una membrana nuclear -> nucléolo. 
· Organelas membranosas: aparato de Golgi, REL y RER.
· Pared celular por fuera de la membrana en algas, vegetales y hongos. Animales protozoos no.
· Miden entre 5 y 30 micras.
Los eucariontes pueden ser hongos, algas, protozoos y helmintos.
HONGOS
Algunos pueden comportarse como agentes infecciosos. Son quimioheterótrofos con reservas nutritivas de glucógeno. Sus pared celulares contienen quitina, celulosa, glucanos y mananos, y pueden ser uni o pluricelulares presentando una gran variedad morfológica.
Morfología y crecimiento: los que producen micosis en el ser humano se encuentran en 2 estados morfológicos básicos: levaduras y hongos. 
· Las levaduras son hongos unicelulares, elipsoidales que se reproducen por fisión binaria o gemación. Una levadura también puede ser el estadio morfológico en el ciclo biológico de una especia filamentosa: a esto se le llama dimorfismo y al hongo “hongo dimorfico”. 
· Los mohos son multicelulares; el elemento tubular se denomina hifa que crece se ramifica firmando lo que se denomina micelio o thallus.
Los hongos suelen crecer mejor en ambientes con PH ácido alrededor de 5.
Estructura: Son células eucariotas por lo que poseen nucleo, RE, ribosomas, mitocondrias, etc. Rodeando el citoplasma existe: membrana (contiene diversos fosfolípidos y elevada cantidad de esteroles), pared (que da rigidez y protege y está compuesta de quitina celulosa glucanos mananos en los cuales se basa la producción de antifungicos), capsula (existe en algunos). 
Clasificación: según el tipo de infección:
· Superficial: estrato queratinizado de la piel y o del pelo, sin que exista ningún tipo de reacción inflamatoria y muy poca evidencia clínica de enfermedad. ej pitiriasis versicolor
· Cutánea: piel y a las mucosas; la infección puede alcanzar los estratos profundos, pero sin llegar al tejido celular subcutáneo y sin que exista invasión linfática. Ej: dermatofitosis, candidiasis
· Subcutánea: alcanzan el tejido celular subcutáneo por inoculación traumática. Son procesos habitualmente limitados a la piel y al tejido celular subcutáneo, que evolucionan muy lentamente formando granulomas o queloides, sin que suela existir diseminación sistémica. Ej micetoma
Sistemica fungemia y/o la invasión de algún órgano profundo
Pueden ser primarias: coccidioidomicosis, histoplasmosis
oportunistas: candidiasis sistemica, aspergilosis, criptococosis
Las micosis (infección por hongos) suelen ser infecciones de larga duración porque crecen con lentitud y como los fármacos afectan las células residentes hace que estas infecciones sean difíciles de tratar. 
PARÁSITOS
Seres eucariontes que viven a expensas de otro de distinta especie y le produce daño. La parasitosis de hecho es la asociación entre dos organismos donde uno se beneficia y otro se perjudica. Se caracterizan por desarrollar ciclos evolutivos simples o complejos que pueden pasar por tierra, agua u otro ser vivo. La parasitología tiene relevancia social: magnitud epidemiológica (prevalencia, letalidad), impacto económico, aspectos éticos. Un chico parasitado no crece como debe, y eso es un costo para la sociedad, y genera muchas enfermedades.
Tiene una complejidad biológica: reproducción intra y extrahuesped, patogenicidad, adaptación evolutiva y NO HAY VACUNAS en contra de parásito. Su estructura celular es la de una célula eucariota, se destaca el alto contenido de glucógeno utilizado como fuente de energía cuando no hay presencia de O2. Poseen proteínas funcionales que son agrupadas en grupos enzimáticos denominado Zimodemas que permiten caracterizar a los parásitos.
Reproducción:
· Protozoos
· Asexuada: mediante fisión binaria (se divide el núcleo y luego el citoplasma dando dos células hijas), fisión múltiple( división múltiple del núcleo con migración a la periferia del citoplasma) y endodiogenia (proceso de brotacion interna que da dos células hijas que ocupan todo el citoplasma de la célula madre, que termina de desaparecer)
· Sexuada: singamia (unión de dos células sexuales haploides para formar huevo o cigoto) o conjugación (intercambio de material nuclear de las células progenitoras (solo en ciliados).
· METAZOOS: puede ocurrir que sean de sexos separados y luego e la fecundación de la hembra, esta elimine huevos o embriones; que sean hermafroditas y eliminen huevos; que desarrollen huevos no fecundados que originan larvas, que evolucionaran a adultos sexualmente diferenciados
HUÉSPED: Organismo simple o complejo, incluyendo al hombre, que en circunstancias naturales permite la sobrevivencia o alojamiento de un agente infeccioso. Estos tienen uno o varios huéspedes en los que se desarrollan naturalmente (huéspedes normales). Según la forma de evolución, los hospedadores reciben distintos nombres:
· HUESPED DEFINITIVO: el parásito alcanza su madurez sexual o la fase de actividad sexual. Forma adulta
· HUESPED INTERMEDIARIO: en el cual el parásito desarrolla solo su fase evolutiva de su ciclo(larva) y luego sale para parasitar el huésped definitivo.
· HUESPED ACCIDENTAL: circunstancial para el parásito
· HUESPED PARATENICO O DE TRANSPORTE: huésped accidental donde no logra desarrollarse, no continua su ciclo pero puede sobrevivir alojado en los tejidos
PARASITOS Y HUESPED: INTERRELACIONES
· De acuerdo con el grado de parasitismo
· Permanentes: si la necesidad dura toda la vida del parasito
· Periódicos: cuando se comportan como parásitos que deben vivir necesariamente gran parte de su desarrollo en su huésped.
· Temporarios: aquellos que son parásitos solo en el momento de procurarse alimento, haciendo vida libre.
· Según la mayor o menor exigencia de la vida parasitaria:
· Facultativos: Se pueden adaptar con facilidad a la vida libre y viven sobre la materia orgánica en descomposición.
· Obligados: Deben vivir toda su vida en el interior o superficie del huésped. No deben prescindir de la vida parasitaria.
· Accidentales: se implantan transitoriamente, en condiciones fortuitas, en diferentes huéspedes, con mayor frecuencia en animales. En el parasito hay una relación de proximidadentre el parasito y el huésped que es poco íntima, pero capaz de producir efectos nocivos en el organismo. 
· En relación a la especificidad parasito-huésped
· Estenoxenos: tienen una elevada selectividad del huésped
· Eurixenos: pueden infectar a diversas especies animales.
· Oligoxenos: presentan un grado intermedio de especificidad parasito- huésped, en encuentra entre los etenoxenos y eurixenos.
· Según las especificidades alimentarias
· Estenotroficos: aquellos que tiene exigencias para un único alimento, pudiendo se estenoxenos o eurixenos y eurixenos.
· Euritroficos: se alimentan de las diferentes sustancias que se encuentran en contacto con el organismo hospedador.
· Según el numero de huésped necesarios en el ciclo evolutivo
· Monoxenos o directos: aquellos que completan su ciclo evolutivo parasitando un único hospedador. 
· Autoxenos: son parasitos para los que un mismo organismo desempeña el papel de huésped definitvo intermediario, ocupando los adultos una ocalizacion y las larvas otra.
· Heteroexogenos o indirectos: necesitan dos o más hospedadores para que su evolución se complete.
· Según anormalidades de localización
· Antrópicos o erráticos: parásitos en localizaciones diferentes a las que son características.
· Transviados o desviados: parásitos habituales de un hospedador que se implantan en otros.
· Según localización habitual
· Cavitarios: encontrados en el interior de las cavidades del organismo y en la luz de los órganos como el intestino.
· Tisulares: son parásitos de la sangre, linfa y líquido intersticial de los diferentes tejidos, desde el conjuntivo hasta el SNC.
· Posición en el organismo
· Ectoparásitos: viven sobre la superficie del cuerpo de los hospedadores, parasitan piel, faneras y mucosas de las cavidades naturales abiertas hacia el medio externo. Ej: piojos, garrapatas
· Endoparásitos: aquellos que viven dentro del cuerpo del hospedador.
· Citoparasitos: obligatoriamente endocelulares
· Histoparasitos: parásitos de los tejidos, no obligatoriamente endocelulares. Ej: tripanosoma cruzi 
· Hemoparasitos: aquellos que transitoriamente son observados en la sangre. 
Ciclo biológico: conjunto de procesos que cumplen los parásitos para llegar al huésped, desarrollarse en él y producir formas infectante. Es simple en aquellos que permiten a los parásitos dividirse en el interior del huésped, aumentar su número y al mismo tiempo producir formas que salen al exterior para infectar nuevos huéspedes. Otros tipos requieren la salida al exterior de los huevos o larvas que en ciertas circunstancias llegan a ser infectantes; en ciclos más complejos existen huéspedes intermediarios en los cuales las formas larvarias crecen o se multiplican antes de pasar al huésped definitivo. 
¿Por qué son patógenos?
· Tienen acción sustractora de nutrientes. Por eso muchas veces el individuo parasitado sufre malnutrición, no crece lo que tiene que crecer ni pesar porque los nutrientes no le llegan.
· Tienen una acción tóxica.
· Acción alérgica, por lo que los pacientes tienen eosinofilia
· Generan una ruptura mecánica de las microvellosidades por lo cual generan un síndrome de mala absorción.
Trasmisión: Vectorial, transfusional, transplacentario, transplante de órganos, carnivorismo. Ej consumo de carne de cerdo mal cocida, contaminación fecal-oral (amebas), contaminación ambiental (tenia solium).
PROTOZOOS (en inflamación predominan los eosinófilos)
Son organismos eucariontes unicelulares con mucha variación estructural unos de otros. De las casi 20.000 especies conocidas son pocas las que causan enfermedad en los seres humanos. Son heterótrofos aéreos aunque los intestinales pueden crecer en anaerobiosis. Todos necesitan un gran aporte acuático. Pueden enquistarse ante situaciones extremas (falta de alimento, oxígeno, humedad o sustancias químicas) formando QUISTES en el organismo (ej: quiste hidatidico).
· Amebas: se mueven mediante seupódos. La única ameba patógena que se halla en el intestino es la Entamoeba hystolitica que se cree que está resente en el 10% de la población humana
· Ciliados (con cilios cortos)
· Flagelados: (2 o más flagelo como Tripanosomas y Tricomonas vaginalis (en vagina y tracto urinario masc que se trasmite por contacto sexual, baños o toallas)
· Apicomplexa que son parásitos intracelulares obligados que son inmóviles cuando maduran. Ej: Toxoplasama gondii (cuyo ciclo vital incluye a los gatos doméstocps -> toxoplasmosis! Peligroso en las embarazas por poder producir infecciones congénitas en el feto). Plasmodium (agente causal del paludismo)y 
· Microspora: intracel obligados, causan diarrea crónic o queratoconjutivis entre otras enfermedades.
HELMINTOS: gusanos (Reino animalia – Dominio eucarya – Celulas pluricelulares)
Según su forma (planos o redondos):
· Nemetelmintos: gusanos redondos al corte. Ascaris lumbricoides, Enterobius vermicularis, Trichuris trichiura, Trichinella spiralis, Toxocara spp 
· Patelmintos: gusanos planos al corte.
· Cestodes: gusanos en forma ce cinta que desarrollan estadios intermediarios “larvas” Taenia solium , Taenia saginata, Hymenolepis nana, D. Latum, Equinococcus granulosus 
· Trematodes: forma de hoja Fasciola hepatica (Distoma hepatico)
ARTROPODOS (Reino animalia – Dominio eucarya – Células pluricelulares) 
Seres de patas articuladas, simetría bilateral. Constituyen cientos de especies, metamorfosis (completa, incompleta). Son insectos, arácnidos, crustáceos: Pediculus spp (piojos), Sarcoptes scabiei (sarna se pronuncia scabie), Loxosceles laeta, Latrodectus mactans -> Enfermedades de la piel
VIRUS (en inflamación predominan los linfocitos)
Es una entidad biológica capaz de auto replicarse utilizando la maquinaria de una célula viva (parasitismo intracelular obligado).carecen de vida ya que no tiene metabolismo propio, no se dividen por fisión binaria y no realizan desplazamientos autónomos. Son macromoléculas inertes del medio externo y agentes activos dentro de la célula, donde comandan al genoma del huésped en su beneficio. En esto reside la individualidad. Se denomina virión a la partícula vírica morfológicamente completa e infecciosa compuesta por:
· Ácido nucleico, que puede ser ADN o ARN y mono o bicatenario, lineal o circular.
· Cápside de proteínas que envuelve al ácido nucleico y representa la mayor parte de la masa viral. Cada cápside está compuesta por subunidades proteicas: capsómeros. Según la disposición de estos capsómeros, la forma de la cápside será: icosaédrica o helicoidal. algunos poseen una estructura membranosa(virus envueltos) y otros no( virus desnudos)
La relación que se establece entre un virus y la célula huésped es variable:
· Virus citocídicos: son los que como resultado de su multiplicación producen muerte celular.
· Virus moderados: establecen con el huésped un estado de equilibrio en el cual la producción de partículas virales es compatible con la vida celular.
· Virus oncogénicos: desencadena en las células que infecta cambios irreversibles por los cuales la misma pierde la capacidad de regular su ciclo de división.
Hay microorganismos llamados patógenos o parásitos que al colonizar y multiplicarse produce enfermedades infecciosas. Estos microorganismos se trasmiten a las personas sanas -> enfermedades transmisibles o contagiosas y esta trasmisión se da por distintas vías. Los microorganismos invasores penetran por una vía y establecen e ella una infección ocal que puede quedar circunscrita a ese lugar o difundir a otras áreas -> metástasis infecciosas o diseminación por vía hemática o vía linfática.
I. Contacto directo (ej sexual)
II. Vía aérea: se inhalan ciertos microorganismos
III. Vía digestiva (por ingesta)
IV. Por trasmisión parenteral (transfusiones, inyecciones o picadura de mosquitos)
V. Por la placenta madre-> feto
RELACION HUESPED- MICROORGANISMO:
· INFECCION: capacidad de un microorganismo de invadir y multiplicarse en los tejidos del huésped, provocando una reacción defensiva en el mismo, no siempre es sinónimo de enfermedad, por lo que no siempre conduce a daño en el huésped.Se denomina así a la entrada, desarrollo y multiplicación de un agente infeccioso. Si las defensas del huésped no actúan o si el número de microorganismos que ingresa es elevado y vencen las mismas, se produce el fenómeno enfermedad.
FISIOPATOGENIA INFECCIOSA
1) Exposición al patógeno. 
2) Adherencia y colonización del tejido o mucosa
3) Vencer los mecanismos de defensa del huésped. Pueden optar por colonizar solo una superficie, lo que produce toxinas llevando al daño tisular, produciendo la enfermedad. En cambio si invade al tejido mediante heridas o fistulas, se produce el desarrollo bacteriano y producción de factores de virulencia, estos pueden ser a distancia(toxina bacteriana) o asociadas a la invasión local de los tejidos(capsula-inhibe la fagocitosis y acción del sistema del complemento, ALT Y PG- induce inflamación y adherencia, enzimas extracelulares citosolicas, invasinas)
· ENFERMEDAD: proceso infeccioso que lleva a injuria o daño en el huésped. 
Las enfermedades infectocontagiosas son de fácil y rápida trasmisión, provocadas por agentes patógenos. El agente patógeno que las produce recibe el nombre de agente etiológico o injuriante. En algunas ocasiones es necesaria la intervención de otro organismo viviente llamado vector o trasmisor, o no viviente llamado fómites. 
DESARROLLO DE ENFERMEDAD
I. INFECCION: el microorganismo se multiplica en el huésped
II. PERIODO DE INCUBACION: tiempo que transcurre desde la infección hasta los síntomas(tamaño del inoculo, virulencia del patógeno, estado inmune del huésped)
III. FASE AGUDA: la enfermedad se manifiesta con síntomas y signos
IV. PERIODO DE DECLIVE
V. PERIODO DE CONVALESCENCIA: el paciente vuelve a la normalidad, luego de la curación hasta la recuperación total. 
· PATOGENICIDAD: capacidad de un microorganismo de provocar enfermedad, la medida cuantitativa de la misma es la virulencia. A estos microorganismos los clasificamos en patógenos verdadero(pueden provocar enfermedad en pacientes normoinmunes, ejemplo treponema pallidum) y patógenos oportunistas (generalmente no provocan enfermedad en pacientes normoinmunes, necesitan una alteración de las defensas del huésped para provocar la enfermad, ejemplo pseudomonas aeruginosa)
· ISLAS DE PATOGENICIDAD: son regiones genómicas de microorganismos patógenos que codifican genes para la síntesis y expresión de factores de virulencia, los cuales serían adquiridos mediante mecanismos de transferencia horizontal entre géneros y especies. 
· CONTAGIO: trasmisión de la enfermedad de la persona enferma a una sana. Este puede ser directo o indirecto. 
· PORTADOR: persona o animal que alberga microorganismo infeccioso sin presentar síntomas de la enfermedad
· INCUBACION: periodo que transcurre desde el contagio hasta la manifestación de la enfermedad.
CONCEPTOS DE EPIDEMIOLOGIA, EPIDEMIA, ENDEMIA, PANDEMIA Y ZOONOSIS
· EPIDEMIOLOGIA: ciencia que estudia la forma en que se presentan, se trasmiten y se previenen las enfermedades.
· EPIDEMIA: aparición repentina de una enfermedad infectocontagiosa que se propaga rápidamente entre sus componentes. Son limitadas en el tiempo e ilimitadas en el espacio. Ej: gripe, sarampión, hepatitis A, escarlatina
· ENDEMIA: son enfermedades locales o permanentes de una región determinada, son limitadas en espacio pero no en tiempo. Ej: mal de Chagas. 
· PANDEMIA: son enfermedades que se inician en un lugar, pero se trasponen sus fronteras extendiéndose a otras naciones
POSTULADOS DE KOCH: fueron formulados por Robert Koch, a partir de experimentos con el Mycobacterium tuberculosis. Fueron aplicados para establecer la etiología de la tuberculosis, pero ha sido generalizado para el resto de las enfermedades infecciosas con objeto de saber cuál es el agente participante.
1) El microorganismo o factor de virulencia debe estar siempre presente en el huésped enfermo y ausente en los sanos.
2) El microorganismo debe poder ser aislado y cultivado fuera de los tejidos del huésped 
3) Al inocular e microorganismo en un huésped susceptible a partir de un cultivo puro, este deberá manifestar síntomas y signos tipos de la enfermedad
4) El microorganismo debe poder ser aislado y cultivado fuera de los tejidos del huésped.
Infecciones oportunistas: En las personas con alteraciones en sus defensas los organismos propios de la flora normal pueden producir enfermedades -> infecciones oportunistas. Esto puede ser por factores locales que afecten la integridad de la barrera cutaneomucosa (quemadoras, úlceras, heridas, incisiones quirúrgicas) o generales que afecten a la 2° y 3° barrera. Estas enfermedades causadas por microorganismos no patógenos del medio ambiente o de la flora normal -> microorganismos oportunistas.
TAXONOMÍA: es la ciencia que estudia la identificación de los microorganismos, los ordena de forma jerárquica dándoles una clasificación en grupos o taxones en función a su semejanza o a su cercanía evolutiva. También le asigna un nombre, un género, una especie a los microorganismos. Se hace a través de dos maneras: taxonomía de base numérica y taxonomía de base genética:
1. Taxonomía de base numérica: según un grupo de características fenotípicas se los reúne en grupos:
Características fenotípicas: Capacidad de fermenta azucares (realizado por enzimas), síntesis de productos intermedios del metabolismo y capacidad de ejercer en presencia o ausencia de oxígeno, nitrógeno.
Es de fácil interpretación, simple, útil para la clínica y rápida. Para hacer un trabajo profundo es muy pobre.
2. Taxonomía de base genética: Estudio genético. Con electroforesis, se separan fracciones de ADN según pH, los más pesados se mueven más lento con las cargas. Se logra identificar individuos que provienen del mismo clon. Es importante para saber si es el mismo individuo, voy a saber si se trata de una recaída o reinfección y tomare medidas terapéuticas y profilácticas distintas. Se está imponiendo actualmente este método.
TÉCNICAS APLICADAS AL DIAGNÓSTICO MICROBIOLÓGICO CLÍNICO
· Indirectos: usan la detección de anticuerpos en el suero o plasma del paciente. Tiempo en generar anticuerpos, no menos de 14 días. No sirve para aquellas patologías que necesitan diagnóstico rápido. Los resultados negativos son 100% confiables y sin embargo el paciente puede estar infectado ya que se encuentra en el periodo ventana (tiempo desde primoinfeccion hasta que se detecta anticuerpo). Ej: par HIV sirve
· Directo: Consisten en detectar en la muestra clínica del paciente (tejido, secreción, liquido sinovial, esputo, LCR, orina, sangre) según la patología, la presencia de microorganismos si puede ser aislado, por observación directa (microscopio) o de antígeno de superficie específicos de ese organismo o la toxina del microorganismo. Detecta la consecuencia de la entrada del mismo. Ej: meningitis – LCR – presencia de germen