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“DIAGNÓSTICO GENÉTICO EN PACIENTES 46,XY CON HIPOSPADIAS MEDIANTE ANÁLISIS DEL GEN AKR1C4.” QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE P R E S E N T A: DIRECTOR DE TESIS: FRIDA MARIELA SÁNCHEZ LÓPEZ Dr. Luis Ramos Tavera B I Ó L O G A LOS REYES IZTACALA, EDO. DE MÉX. 2019 UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO FACULTAD DE ESTUDIOS SUPERIORES IZTACALA T E S I S UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. 1 El presente trabajo se desarrolló en el Instituto Nacional de Ciencias Médicas y Nutrición Salvador Zubirán, en el departamento de Biología de la Reproducción, laboratorio de Bioquímica Hormonal. 2 DEDICATORIA A mis padres José Manuel y Guadalupe. Por ser tan inefables seres humanos y por uno de los más primorosos obsequios otorgados: su confianza y esperanzas en mi persona, la motivación que precisaba cada día y todo el amor, respeto y admiración que me han brindado a lo largo de mi carrera y vida. No dejaré de sentirme agradecida con ustedes por tan destacado aprendizaje que me concedieron desde siempre, a pesar de todo lo que se ha interpuesto, su ejemplo y palabra me ha formado como una mujer con una percepción distinta, pero maravillosa de lo que es la vida. El esfuerzo que me supuso llegar a esta meta no tiene comparación alguna con el que ustedes hacen cada día por mi bienestar, por ello quiero hacerlos parte de este logro, decirles que son mi mayor fuente de inspiración y tranquilidad. Los amo infinitamente. 3 AGRADECIMIENTOS A mi querido hermano Manuel. A ti que me apoyaste en mi elección de esta carrera desde el momento en que te lo mencioné, por todos los diálogos que intercambiamos constantemente, los cuales han contribuido a formar la persona que hoy represento, por ser el mejor ejemplo a seguir, por ser tan brillante y ayudarme con cada cuestionamiento. Te amo. A mis hermanas Elizabeth y Diana. Hermanas, gracias por el esfuerzo que me otorgaron sin demandar algo a cambio, por darme el mayor signo de empatía, por esforzarse junto a mí para sacarme adelante y ser de las primeras en ayudarme emocional y económicamente cuando lo necesitaba, quiero que sepan que esto es una parte del resultado de todo lo que me dieron. Las admiro y amo. A mi hermana Gloria. Gracias por tanto cariño y apoyo, por atender mis anécdotas y creer en mí, por el tiempo que has invertido y por todo lo que me has dado, eres de las escasas personas que me han visto crecer, quiero que sea de tu entendimiento que no he de olvidarlo y siempre atesoraré en mi pensar todo lo que has compartido a mi lado, gracias por la mayor enseñanza de valentía y constancia. Te amo. A mi prima Cinthia. Por tu inmenso apoyo y tan franco cariño, eres como una hermana para mí, gracias por tantos momentos y estar siempre ahí cuando me sentía sola. A mis abuelos Clementina y Vicente. Por su cariño y sincera demostración de amor, por aceptarme en su casa y cuidarme todo el tiempo desde que tengo memoria. Por darme un lugar seguro, son una maravilla y tan bellas personas, los amo con todo mi corazón. A mi director de tesis y amigo, el Dr. Luis Ramos. A su loable mentalidad es a quien debo la mayor parte de mi experiencia profesional y conocimiento. Infinitas gracias por la paciencia que me tuvo este tiempo, por guiarme, creer en mí y motivarme cada día para seguir creciendo y consiguiendo oportunidades, siempre mostrando profesionalismo para con sus estudiantes. Por la continuidad y tiempo que le ha dedicado a mi trabajo, en un ambiente agradable. Así mismo, gracias por escucharme y aconsejarme oportunamente en diversos aspectos. A mis sinodales: el Dr. Martín Martínez, la Dra. Juana Alba Luis, el Dr. Luis Arturo Baiza y el M. en C. Mario Cárdenas. Por dedicarle tiempo a mi trabajo y por los comentarios que ayudaron a la realización de este mismo. 4 A mis mentores, la M. en C. Lizzette Mares y el Biólogo Armando Martínez. Por todo el conocimiento que me otorgaron, por su confianza en mi persona, por darme la seguridad que necesitaba cada día para lograr muchas cosas. Por darme un gran ejemplo de sabiduría y constancia, pero sobre todo por su amistad. A mis compañeros de laboratorio: Fernanda, Melina, Octavio, Jordan y Arturo. Por hacer de mi estancia en el laboratorio una de las experiencias más gratas, representan una familia para mi persona, agradezco su apoyo constante, así como las enseñanzas que me dieron pacientemente y por lograr que cada mañana fuera un poco menos pesada. Los admiro y aprecio en demasía. A Isaac. Por el constante apoyo que me concediste el tiempo que estuve en el laboratorio, en el aspecto técnico, administrativo, y profesional. Además de tu gran muestra de amistad e inmenso apoyo moral, también eres parte de esto, infinitas gracias. A mi mejor amigo Edwin. Sabiendo que tenerme como amiga conlleva una gran responsabilidad y paciencia infinita, quiero hacerte parte de mis logros, porque eres la primera persona que no me ha abandonado y que puedo asegurar se enorgullece de mí, gracias por todo tu apoyo incondicional a lo largo de este tiempo, gracias por escucharme cada noche que quería darme por vencida y me levantaste para continuar trabajando. Te quiero. A mis compañeros de la carrera: Octavio Trejo, Enrique Suarez y José Agustín. A ustedes que me dieron el verdadero significado de la amistad, que me escucharon y regalaron consejo, sabiduría y momentos divertidos durante toda la carrera, no quiero que olviden lo que representan en mi vida. Los quiero. A mis amigos, compañeros y familia: Christian, Mariana, Oscar, Karina y Lomelí. Por adoptarme en su equipo y regalarme los momentos más divertidos que pude tener en tan solo unos meses, por confiar ciegamente en mí, una completa desconocida para algunos. Porque me tomaron en cuenta en sus planes, gracias por rescatarme de los momentos difíciles, extenderme su mano en tantas ocasiones, les aprecio como no tienen idea. Siempre me encontraré orgullosa de cada uno de ustedes, porque sé que van a ser los mejores en lo que se propongan. A mis viejos y grandes amigos: Emilio, Coco, Jacqueline, Atzin y Perla. No hay más que decir, ustedes saben de sobra cuanto significa su compañía para mí, por tantos años de amistad y apoyo, cada uno me ha enseñado muchísimas cosas, da gusto ser amiga de profesionistas tan exitosos como ustedes. 5 INDICE RESUMEN ..................................................................................................................... 6 1. INTRODUCCIÓN ....................................................................................................... 7 1.1 Determinación y diferenciación sexual .............................................................. 7 1.2 Efecto genómico de los andrógenos ............................................................... 11 1.3 Esteroidogénesis............................................................................................. 15 1.4 AKR1C4 ..........................................................................................................18 1.5 Desorden de desarrollo sexual ....................................................................... 21 2. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA .................................................................. 24 Hipótesis ................................................................................................................... 25 Objetivo general ........................................................................................................ 26 Objetivos particulares ............................................................................................... 27 3. MATERIALES Y METODOS ................................................................................. 28 Extracción de DNA genómico ................................................................................... 28 Reacción en la cadena de la polimerasa PCR .......................................................... 29 Polimorfismo conformacional de cadena sencilla (SSCP) ........................................ 30 Purificación de DNA .................................................................................................. 31 Secuenciación........................................................................................................... 32 Análisis in sillico ........................................................................................................ 33 4. RESULTADOS ...................................................................................................... 34 5. DISCUSIÓN ........................................................................................................... 45 6. CONCLUSIÓN ...................................................................................................... 49 7. PERSPECTIVAS ................................................................................................... 50 8. REFERENCIAS ..................................................................................................... 51 6 RESUMEN Durante la diferenciación sexual la dihidrotestosterona (DHT) es esencial para la formación de la uretra masculina. Este andrógeno es sintetizado por la vía clásica de esteroidogénesis. Mutaciones en las enzimas de esta vía son causantes de desórdenes en el desarrollo sexual (Disorders of Sex Development; DSD) 46,XY; sin embargo estas malformaciones congénitas no siempre pueden ser asociadas a la vía clásica. Recientemente, se ha reportado una vía alterna o “Backdoor” la cual se ha sugerido como participante para la síntesis de DHT y podría ser también causante de DSD-46,XY. En el presente estudio se realizó un análisis mutacional del gen AKR1C4 en pacientes 46,XY con malformación uretral (hipospadias) mediante el análisis de PCR-SSCP y secuenciación a partir de DNA genómico (gDNA). Los ensayos mediante SSCP indicaron dos variantes en la movilidad electroforética en los exones 4 y 9 tanto en pacientes como en individuos normales. La secuenciación de DNA indicó dos substituciones nucleotídicas en la región codante c.434C>G y c.931C>G lo que originó un cambio de serina a cisteína en la posición 145 y un cambio de leucina a serina en la posición 311, respectivamente. Los análisis in sillico determinaron polimorfismos y excluyeron patogenicidad génica. Los análisis del genotipo y haplotipo mostraron ausencia de diferencias significativas. Los datos sugieren que las mutaciones inactivantes en el gen AKR1C4 son una causa infrecuente de hipospadias, lo que debilita la contribución de la vía “Backdoor” en la masculinización embrionaria de la uretra y una baja asociación en la formación de DHT por esta vía durante el desarrollo sexual, específicamente en la diferenciación de los genitales externos. Palabras clave: AKR1C4; hipospadias; DHT; andrógenos; vía “Backdoor”. 7 1. INTRODUCCIÓN 1.1 Determinación y diferenciación sexual La determinación del sexo embrionario es definida desde el momento de la fecundación y es establecida a partir de la quinta semana, anterior a este último periodo de tiempo es imposible distinguir el sexo del embrión, etapa denominada periodo de indiferenciación. A partir de la sexta y séptima semana del desarrollo se iniciará la formación hacia ovario o testículo y mediante la biosíntesis de hormonas en la octava semana se llevará a cabo la diferenciación sexual masculina (Hughes, 2001; Rey, 2001; Baetens et al, 2017). La determinación sexual es un proceso biológico fundamental en el cual numerosos genes se encuentran involucrados. Esta etapa queda definida en el momento de la unión del ovocito (que aporta un cromosoma X) con el espermatozoide (que puede aportar un cromosoma X o un Y). En este sentido, el cromosoma Y desencadena la diferenciación de los testículos a partir de una gónada indiferenciada. Este mecanismo es regulado a través del gen SRY (Swain y Lovell-Badge, 1999; Hughes, 2001). El gen SRY localizado en el brazo p del cromosoma Y codifica para un factor de transcripción; en gónadas indiferenciadas es el principal iniciador de la cascada de interacciones génicas que determina el desarrollo de los testículos. El SRY conjuntamente con los factores transcripcionales SF1 y SOX9 inician la diferenciación de las células pre-Sertoli a células de Sertoli (Hughes, 2001; Rey, 2001; Swain y Lovell-Badge, 1999). En el desarrollo sexual femenino, SOX9 es reprimido transcripcionalmente y por lo tanto no se formarán gónadas masculinas. Sin embargo existen algunos genes candidatos que son parte de este mecanismo de diferenciación sexual femenina, siendo el más aceptado el DAX1 del cual existen pruebas genéticas que lo mencionan como parte de la determinación sexual y diferencia gonadal (Ludbrook y Harley, 2004). El gen DAX1 es expresado en la cresta genital de ambos sexos. En testículo el gen es inhibido, mientras que en el ovario permanece activo. A pesar de los estudios que sugieren que el 8 factor DAX1 previene la transcripción de los genes SOX9 y SF1, se ha reportado la participación de otros genes como WNT4, WNT7, FOXL2 y RSPO1, los cuales actúan específicamente en la gónada femenina. Estos genes se encuentran altamente expresados en los ductos de Müller y desempeñan un papel importante para el desarrollo ovárico (Yu et al, 1998; Swain y Lovell-Badge, 1999; Hiort y Holterhus, 2000; Jordan et al, 2001; Chassol et al, 2008). La etapa de indiferenciación tendrá lugar en el mesonefros, estructura que se desarrollará a ambos lados de la línea media, en el que se diferenciarán las llamadas crestas genitales hacia un engrosamiento del epitelio celómico. Existen otros factores implicados en la determinación sexual para la formación y estabilización de la cresta genital, estos son WT1, SF1, LIM1 y EMX2. Las crestas genitales son bipotenciales y se diferencian gonadalmente dependiendo de su determinación genética (XX o XY). Por otro lado, dentro del saco vitelino se encuentran las células germinales primordiales, las cuales no influyen en la determinación sexual, sin embargo, si desarrollarán los futuros gametos masculinos o femeninos y alrededor de la semana 6-7 llegarán a colonizar las crestas genitales (Hughes, 2001). En el mesonefros se presenta una estructura tubular localizada en sentido longitudinal al eje principal del gononefrotomo y es denomina conducto de Wolff. Asimismo, como invaginación del epitelio celómico se han reportado estructuras tubulares llamadas conductos de Müller; las cuales son unipotenciales y constituirán los genitales internos dependiendo la carga genética. Mientras que los genitales externos serán originados de la membrana cloacal y su diferenciación dependerá de la presencia o ausencia de hormonas testiculares (Hughes, 2001; Rey, 2001; Voutilainen, 1992; Rey y Josso, 1997). Bajo la acción de los andrógenos los conductos mesonéfricos de Wolff danorigen a las estructuras internas masculinas: epidídimos, conductos deferentes, y vesículas seminales, mientras que los conductos de Müller formarán las estructuras internas femeninas: trompas de Falopio, útero y el tercio superior de la vagina. Como se 9 ha mencionado previamente, SOX9 y SRY son genes necesarios para la determinación sexual de la gónada indiferenciada, su expresión en células precursoras de Sertoli desencadena eventos que contribuirán a la formación de los túbulos seminíferos. Este mecanismo es precedido por la diferenciación estructural de las células de Sertoli. Las células de Sertoli junto con las células germinales se unirán para envolver los cordones seminíferos que secretan una lámina basal y que separará las células germinales primordiales del cordón testicular. Los vasos sanguíneos se desplazan por debajo del epitelio celómico y se localizan a lo largo del testículo en la región opuesta al mesonefros, marcando la diferencia morfológica del testículo (Díaz-Hernández y Merchant-Larios, 2017). El dogma del desarrollo sexual de los mamíferos aún carece de reportes que asocien a genes específicos en la determinación ovárica y desarrollo de otros genitales internos femeninos; mientras que la diferenciación masculina puede ocurrir cuando el testículo fetal secreta dos tipos de hormonas en un periodo crítico durante la gestación temprana (Hughes, 2001). La siguiente fase denominada diferenciación sexual será exclusivamente dependiente de hormonas testiculares. El contenido hormonal en testículos fetales se encuentra elevado alrededor de la semana 12-14 de la gestación, en esta etapa las células de Sertoli producirán la hormona anti-Mülleriana (AMH) que cumple con la función de regresión de los ductos de Müller al unirse a un receptor transmembranal localizado en las células mesenquimales; este mecanismo induce la apoptosis de las células epiteliales. La secreción de la hormona luteinizante (LH) y la gonadotropina coriónica humana (hCG) en las células de Leydig estimularán la esteroidogénesis testicular fetal, vía anabólica importante para la formación de los andrógenos e indispensables para el desarrollo masculino normal (Fig. 1). Múltiples reportes han determinado que la diferenciación masculina es crucialmente dependiente de la biosíntesis y acción de andrógenos (Swain y Lovell-Badge, 1999; Voutilainen, 1992; Misrahi et al, 1998). 10 Fig. 1. Genes involucrados en la determinación y diferenciación sexual. La expresión de los factores WT1, Lim1 y Emx2 es importante para desarrollar la gónada bipotencial a partir de la cresta genital. Factores transcripcionales como SRY y DAX1 serán importantes para la diferenciación gonadal expresándose uno en ausencia del otro dependiendo de la gónada. 11 1.2 Efecto genómico de los andrógenos Los andrógenos son hormonas esteroides involucradas principalmente en la diferenciación sexual del fenotípico masculino durante la embriogénesis y desarrollo de caracteres sexuales secundarios en la pubertad. Los principales andrógenos testosterona (T) y dihidrotestosterona (DHT) ejercen su acción genómica clásica basándose en el control transcripcional mediado por el receptor de andrógenos (AR, NR3C4), una proteína de la superfamilia de receptores nucleares (Patrao, 2009). La síntesis de andrógenos es regulada por el eje hipotálamo-hipófisis-gónada. En el hipotálamo será sintetizada la hormona liberadora de la hormona luteinizante (LHRH). Esta hormona ejercerá su acción en la adenohipófisis e inducirá transcripcionalmente la síntesis de LH, que será la encargada de estimular la síntesis de T en las células de Leydig. Liberada la T se encontrará en concentraciones elevadas en sangre y estará unida a proteínas séricas transportadoras como la albúmina o la globulina fijadora de hormonas sexuales (SHBG) para llegar a sus células blanco. Una vez que la T ingresa a la célula blanco por difusión pasiva puede asociarse directamente con el AR o ser metabolizada por la enzima 5α-reductasa a DHT, un ligando de alta afinidad al AR (Hiipakka y Liao, 1998; Hiort et al, 1998; Rojas et al, 2011). El AR es un miembro de la superfamilia de receptores nucleares en donde se encuentran otros receptores como el de glucocorticoides, mineralocorticoides, progesteronas y estrógenos. El gen que codifica para el AR se encuentra localizado en el cromosoma X, ubicado en la posición Xq11-q12 y presenta un peso molecular aproximado de 98 kb. Estructuralmente está constituido por ocho exones que codifican para una proteína de 919 aminoácidos. La proteína se encuentra dividida en tres dominios funcionales: 1) Un dominio N-terminal el cual contiene 537 amino ácidos que representa más de la mitad de la proteína del AR y es codificado únicamente por el exón 1, contiene un dominio de transactivación independiente del ligando (AF1) y un dominio que regula la actividad constitutiva localizado entre el aminoácido 141 y 338. Otra de las características llamativas de este dominio es la presencia de múltiples repeticiones de 12 amino ácidos, en particular de poliglutamina (codificado por los trinucleótidos CAG/CAA) y poliglicina (por los trinucleótidos GGC/GGT), de las cuales no se conoce un papel fisiológico exacto, pero pueden ser importantes en la regulación transcripcional vía interacciones proteína-proteína con otros factores de transcripción incluidos SRC-3, CBP, TAFII130 y Sp1. 2) Un dominio de unión al DNA (DBD) que contiene 89 amino ácidos y presenta una región central rica en cisteínas. El DBD es codificado por los exones 2 y 3, este dominio está formado estructuralmente por dos dedos de zinc. El primero se encarga de regular las interacciones específicas receptor-DNA, en la base de este dedo aparecen particularmente tres aminoácidos los cuales interactúan con las secuencias de nucleótidos potenciadoras de la transcripción llamadas elementos de respuesta a hormonas (HRE). Los HREs están presentes en genes andrógeno- dependientes usualmente localizados en su región 5’, mientras que el segundo dedo está predominantemente involucrado en la dimerización del receptor y estabilización de la interacción por unión a la columna de fosfatos. 3) Una región bisagra codificada por la porción 5’ del exón 4 y que se encarga de regular la transferencia del AR del citoplasma a su sitio de acción nuclear y finalmente 4) un dominio de unión al ligando (LBD) que contiene alrededor de 290 amino ácidos, codificado por la parte 3’ del exón 4 y de los exones 5-8. Las funciones principales de este dominio son la unión a andrógenos y su participación en la activación transcripcional dependiente del ligando (AF2), dimerización del receptor; así como la interacción con proteínas de choque térmico (Fig. 2) (Hiort et al, 1998; Heinlein y Chang, 2002; Levalle y Lalosa, 2015; Quigley et al, 1995). 13 Fig. 2. Organización génica y funcional del AR o NR3C4. A) Se muestra la región q11-12 del cromosoma X en la cual se localiza el gen del AR. B) El gen se compone de 8 exones separados por unas regiones intrónicas (1-7). C) En el cDNA se observan los tamaños del exón por pares de bases siendo el exón 1 el más grande. D) La proteína del AR contiene tres dominios funcionales; N-terminal, dominio de unión al DNA, región bisagra y un dominio de unión al ligando. Una vez que la T entra por difusión pasiva al citoplasma celular puede ser 5α- reducida en DHT y unirse al AR, el cual se encuentra inactivado por proteínas de choque térmico (HSP) o chaperonas, como HSP90 y HSP70. Las HSP se liberarán del AR una vez que el ligando se ancla en el sitio de unión. La unión T-AR provoca la fosforilación de regiones específicas del factor transcripcional y la consecuente translocación al núcleo en donde puede ocurrir la dimerización para unirse a secuencias específicasdel DNA que son conocidas como ERA. Unido a estas secuencias el AR requiere de factores transcripcionales (TFII A, TFII B, TFIID, TFIIE, TFII F y TFIIH) como de la RNA polimerasa II para realizar la transcripción, las cuales tienen unión en las regiones AF1 y A B C D 14 AF2 de los dominios del receptor. Concluida la transcripción el mRNA (Fig. 3) saldrá al citoplasma para unirse a ribosomas y conformar la proteína (Gobinet et al, 2002; Lee y Chang, 2003; Mongan et al, 2015). Fig. 3. Mecanismo de acción de los andrógenos en la célula blanco. La T ingresa por difusión pasiva a la célula, se 5α-reduce en DHT y así se puede unir al AR liberándose de las HSP que lo mantienen inactivo. EL AR es activado mediante fosforilaciones, se dimeriza para translocarse al interior del núcleo en donde se une a los ERA localizados en el DNA. EL AR conjuntamente con los correguladores y la RNA Polimerasa II controlan la expresión de genes andrógeno- dependientes. DHT 15 1.3 Esteroidogénesis Las hormonas esteroides han sido clasificadas en cinco grupos de acuerdo a su función; mineralocorticoides, glucocorticoides, estrógenos, progestinas y andrógenos. Todas ellas son estructuralmente similares y son sintetizadas a partir del colesterol. La esteroidogénesis requiere de múltiples enzimas que están involucradas en la conversión del colesterol a esteroides activos. Estas enzimas consisten específicamente de citocromos P450 (CYPs), hidroxiesteroide deshidrogenasas (HSDs) y esteroide reductasas. Principalmente existen tres órganos endocrinos especializados en la síntesis de novo de hormonas esteroides; las glándulas suprarrenales, testículos y ovarios, no obstante en el sistema nervioso central y transitoriamente en la placenta pueden sintetizarse esteroides (Miller, 1988; Sanderson, 2006). Los tejidos esteroidogénicos pueden sintetizar colesterol de novo a partir de acetato pero las células humanas obtienen colesterol generalmente de lipoproteínas de baja densidad del plasma (LDL). Los ésteres de colesterol son absorbidos por endocitosis mediada por receptores. Los ésteres LDL de colesterol pueden ser encontrados directamente o pueden ser convertidos a colesterol libre y usado para la síntesis de hormonas esteroides en gónadas y corteza suprarrenal debido a su transporte hacia la mitocondria. El mecanismo regulador de transporte hacia el interior mitocondrial es controlado por la proteína reguladora de la esteroidogénesis aguda o StAR (Gómez-Chang et al, 2012; Miller, 1988). La conversión de colesterol a pregnenolona en mitocondria es el primer paso en la síntesis de todas las hormonas esteroides, donde el citocromo (CYP11A) P450scc (side- chain cleavage) es la enzima responsable (Fig. 4). El citocromo es expresado en las tres zonas de la corteza suprarrenal, en células de Leydig y en la teca interna del ovario. Una vez que la pregnenolona es sintetizada puede ser 17α-hidroxilada para formar 17α- hidroxipregnenolona y dehidroepiandrosterona (DHEA) mediante el CYP17A1. La 3β- HSD tipo II (HSD3B2) puede utilizar como substrato DHEA y pregnenolona para formar 16 Δ4-androstendiona y progesterona, respectivamente (Hanukoglu, 1992; Miller, 1988; Payne y Hales, 2004). La biosíntesis de andrógenos se lleva a cabo en células de Leydig en caso del testículo y en la zona reticular en la glándula suprarrenal. En vertebrados, la síntesis de T ocurre mediante dos vías conocidas como Δ4 y Δ5. En humanos, la vía predominante es la Δ5 contrariamente a roedores (Schiffer, 2018). En la vía Δ5 la androstendiona es reducida a T mediante la aldo ceto reductasa familia 1 miembro C3 (AKR1C3) o la 17β-hidroxiesteroide deshidrogenasa tipo 3 (17β- HSD tipo 3 o HSD17B3) y puede ser reducida a 5α-androstandiona mediante la 5α- reductasa tipo 2. La mayoría de las conversiones de T a DHT se llevan a cabo mediante la 5α-reductasa tipo 2; mientras que la formación de DHT a partir de 5α-androstandiona requiere de AKR1C3 (Hanukoglu, 1992; Miller, 1988). En la vía alterna o “backdoor” la progesterona es el sustrato primordial y por acción de la 5α-reductasa tipo 1 forma 5α-pregnan-3,20-diona, que una vez sintetizado será reducida por la actividad de AKR1C2/4 para la formación de 3α-hidroxi-5α-pregnan- 20-one (alopregnenolona) y mediante el CYP17A1 la alopregnenolona será transformada a androsterona, que será reducida a 5α-androstano-3α, 17β-diol (androstandiol) mediante la enzima AKR1C3. Para la formación de la DHT el androstandiol requiere de la AKRC2/4 o HSD17B6 (Luu-The, 2013; Uribe, 2016; Schiffer et al, 2018). 17 Fig. 4. Esquema representativo de las vías de síntesis de andrógenos con las enzimas necesarias (flechas), en morado la ruta clásica Δ5 que utiliza T para sintetizar a DHT. En verde la ruta alterna, la cual no requiere de T y necesita de la 5α reducción de androstendiona a 5α- androstandiona para la síntesis de DHT. En azul se muestra la vía “backdoor”, la cual no utiliza T, androstendiona ni DHEA para la síntesis de DHT pero requiere de la familia de androstandiol y de las AKR1C. Androstendiona 18 1.4 AKR1C4 La AKR1C4 [también denominada dihidrodiol deshidrogenasa (DD4), clordecona reductasa (CDR), aldo-ceto reductasa, 3α-hidroxiesteroide deshidrogenasa (3α-HSD)]. Pertenece a la familia de las aldo ceto reductasas, isoenzimas que se caracterizan por la conversión de aldehídos y cetonas a sus respectivos alcoholes utilizando como cofactor NADH o NADPH. Su localización es principalmente identificada en el citoplasma celular. Se encuentra específicamente en hígado y es responsable de la inactivación de hormonas esteroides manteniendo el balance homeostático en circulación. Estudios sugieren que esta enzima se encuentra presente en humanos y tiene la capacidad de reducir y deshidrogenar compuestos como la conversión de 5α-dihidrotestosterona a 5α- androstano-3α,17β-diol (androstandiol) empleando NADPH como cofactor de la 3α- deshidrogenación de androsterona. Asimismo la enzima cataliza eficazmente la reducción de 5α-pregnane-3,20-diona (dihidroprogesterona) para producir 3α-hidroxi-5α- pregnan-20-ona (alopregnenolona) que es el precursor de androsterona (Khanna et al, 1995; Stayrook et al, 2007; Zeng et al, 2017). El gen AKR1C4 tiene una longitud de 20 kilobases y una región codificante de 969 nucleótidos dividida en 9 exones y 8 intrones. Se localiza en el cromosoma 10p14-15 y codifica para una proteína de 323 aminoácidos. Los intrones varían de tamaño desde 375 pares de bases hasta aproximadamente 6 kilobases (Fig. 5) (Qin et al1993; Khanna et al, 1994; 1995). 19 Fig. 5. Organización génica de AKR1C4 donde se observan los 9 exones y 8 intrones. La secuencia de aminoácidos de la AKR1C4 es muy similar a la de AKR1C2 y la mayoría de los residuos catalíticamente importantes (Asp50, Tir55, Lis84 e His117) son encontrados en posiciones similares en el exón 2 de ambas enzimas. La unión de NADPH y sustratos esteroideos requiere flexibilidad significativa en la estructura de la AKR1C4. En AKR1C4, Leu54 está potencialmente involucrado en la determinación de la especificidad del sustrato, mientras que Asp50 y Lis84 equilibran la fuerza de disociación del sitio activo, lo que es necesario para que los electrones del anillo de NADPH se transfieran al sustrato esteroide (Flück et al, 2011). AKR1C4 es predominantemente una 3-ceto esteroide reductasa con eficiencia catalítica en 3α-HSD y actúa como subsidiaria en 3β-HSD, un paso catabólico importante en la transformación de hormonas esteroides. Basados en sus eficiencias catalíticas, los trabajos han propuesto que esta es una isoforma del hígado que trabaja en conjunto con la 5β-reductasa en el catabolismo o inactivación de hormonas esteroides, asimismo se ha demostradosu relación en la biosíntesis intermediaria de los ácidos biliares. Uno de 20 los principales ejemplos de la actividad de las HSDs es la reducción del andrógeno DHT a androstandiol en el C-6 y androstandiona (Fig. 6). La formación de androstandiol por la HSD17B6 es irreversible, mientras que la DHT puede ser formada a través de la actividad de la AKR1C4. Asimismo, el androstandiol puede ser oxidado a androsterona en C-7 por la AKR1C4 (Penning et al, 2003; Steckelbroeck et al, 2004). Fig. 6. Papel bioquímico de la AKR1C4 en el metabolismo de andrógenos. La isoenzima cataliza in vitro la interconversión bidireccional de 3-cetosteroides con 3-hidroxiesteroides, así como 17- cetosteroides con 17-hidroxiesteroides. 21 1.5 Desorden de desarrollo sexual El término desorden de desarrollo sexual (DSD) es definido como aquellas condiciones congénitas en las cuales el desarrollo cromosómico, gonadal o anatómico del sexo es atípico. Esta terminología se ha propuesto ya que anteriormente para referirse a pacientes con estos padecimientos se utilizaban diversos términos confusos y que a su vez no eran del tanto específicos para definir el desorden sexual, ya que se necesitaba una especificidad clínica para aportar una nomenclatura adecuada a los pacientes y familiares (Lee et al., 2006). Estudios han sugerido clasificaciones que abarcan los tipos de desórdenes de desarrollo sexual como son: DSD en cromosomas sexuales; 45, X (síndrome de Turner), 47, XXY (síndrome de Klinefelter y variantes, 45, X/46XY (MGD, ovotesticular DSD) y 46, XX/46, XY (quimera, ovotesticular DSD) (Lee et al., 2006; Cools et al., 2018). DSD 46,XY; desordenes del desarrollo gonadal (testicular), disgenesia gonadal completa (síndrome de Swyer), disgenesia gonadal parcial, DSD con regresión gonadal y ovotesticular. Desordenes en la síntesis (por ejemplo; deficiencias en 17β- hidroxiesteroide deshidrogenasa tipo 3 y deficiencia de 5α-reductasa tipo 2, mutaciones en StAR) o acción de andrógenos (CAIS, PAIS), defectos en el receptor de la hormona luteinizante (hipoplasia y aplasia en células de Leydig) y desordenes en el receptor de la AMH (Cools et al., 2018). DSD 46, XX; desordenes del desarrollo gonadal (ovario) como DSD ovotesticular, DSD testicular (ejemplo, SRY o SOX9 duplicado) y disgenesia gonadal. Exceso de andrógenos fetales (deficiencia de 21-hidroxilasa), fetoplacental (deficiencia de aromatasa, p450 oxidoreductasa) y maternal (luteoma) (Lee et al., 2006). Existen criterios que sugieren que los DSD incluyen manifiesto de genitales ambiguos (por ejemplo extrofia cloacal), genitales aparentemente femeninos (con alargamiento de clítoris, posterior fusión labial o una masa inguinal), genitales 22 aparentemente masculinos con testículos no descendidos, micropene, hipospadias (defecto congenito de la uretra) perineales aisladas o hipospadias ligeras con testículos no descendidos, una historia familiar de DSD como CAIS y una discordancia entre apariencia genital y un cariotipo prenatal (Alhomaidah et al., 2017). Muchos de los casos de DSD son reconocidos en el periodo neonatal, en jóvenes o adultos y en estos casos se pueden presentar hernias inguinales, pubertad incompleta, virilización en mujeres y ocasionales ciclos de hematuria en hombres. A pesar de los diversos métodos de diagnóstico en estos pacientes, gracias a la accesibilidad o problemas una diagnosis molecular especifica es identificada en solo aproximadamente 20% de los casos con DSD y solo el 50% de niños 46,XY con DSD reciben un diagnóstico definitivo (Alhomaidah et al., 2017). Una de las problemáticas en estos pacientes es la asignación del género para lo cual se toman en cuenta factores como el cariotipo o la apariencia genital. Más del 90% de pacientes con 46,XX con hiperplasia congénita y todos los pacientes con 46,XY CAIS son asignados con sexo femenino, por otro lado aproximadamente 60% de pacientes con deficiencias en 5α reductasa son asignados masculinos. En pacientes con síndrome de insensibilidad a andrógenos parcial (PAIS), con defectos en la biosíntesis de andrógenos y disgenesia gonadal incompleta hay inconformidad en el sexo asignado en el 25% de pacientes sea masculino o femenino (Alhomaidah et al., 2017). Los estudios han recopilado mejor la información acerca de los DSD y los genes involucrados en estos padecimientos, como se describe a continuación: 46,XY DSD, desordenes del desarrollo gonadal testicular: WT1, SF1, SRY, SOX9, DHH, ATRX, ARX. Desordenes del desarrollo gonadal testicular (cambios cromosómicos involucrados en genes): DMRT1, DAX1 y WNT4. Desordenes en la síntesis o acción de hormonas: LHGCR, DHCR7, StAR, CYP11A1, HSD3B2, CYP17, POR, HSD17B3, SRD5A2, AMH, AR. 46,XX DSD, desordenes del desarrollo gonadal ovárico: SRY, 23 SOX9, HSD3B2, CYP21A2, CYP11B1, POR, CYP19, receptor de glucocorticoides (Mouriquand et al., 2016). Las hipospadias comprenden una malformación al nacimiento en varones 46,XY y se definen clínicamente como una malformación congénita en la que existe una apertura anormal de la uretra. La anormalidad uretral puede localizarse en el falo, escroto o perineo. Los agentes etiológicos que se han propuesto para el desarrollo de hipospadias son factores endocrinológicos, genéticos, maternos y en raras ocasiones ambientales. Las causas fundamentales para la formación de hipospadias pueden ser debidas a defectos en la estimulación androgénica de la uretra o la deficiencia de 5α-reductasa tipo 2 (Pacheco-Mendoza y Rendón-Macías, 2016). 24 2. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA Evidencias recientes han mostrado que la vía “backdoor” en la biosíntesis de andrógenos podría ser importante o estar implicada en la diferenciación sexual masculina de individuos 46,XY, esto indica una posible participación de la vía “backdoor” en la formación de DHT. Por lo tanto, en esta investigación se realizarán ensayos moleculares para determinar mutaciones en el gen AKR1C4 en pacientes de origen mexicano con cariotipo 46,XY y fenotipificados clínicamente y únicamente con hipospadias aisladas. 25 Hipótesis Si la vía “backdoor” es una de las principales fuentes de esteroides C19-5α- reducidos durante la embriogénesis, las deficiencias de la actividad enzimática de la 3α- HSD (oxidativa-reductiva) podría ser una causa de DSD 46,XY debido a la incapacidad de formar 3α-diol o convertir 3α-diol a DHT. En consecuencia, estos individuos tendrían un cuadro clínico similar al de los sujetos con síndrome de insensibilidad a andrógenos parcial (PAIS) o deficiencia de 5α-reductasa tipo 2. 26 Objetivo general Determinar la contribución del gen AKR1C4 como causa molecular de DSD 46,XY asociado a hipospadias. 27 Objetivos particulares 1. Identificar mutaciones en el gen AKR1C4 mediante PCR-SSCP en individuos 46,XY con DSD-hipospadias. 2. Analizar mediante secuenciación la región codante del gen AKR1C4 en individuos 46,XY con DSD-hipospadias. 3. Realizar un análisis in silico mediante el uso de programas para predecir la patogenicidad de las variantes génicas identificadas. 28 3. MATERIALES Y METODOS Sujetos Se utilizó DNA genómico de 25 pacientes 46,XY de origen mexicano diagnosticados al nacimiento única y exclusivamente con hipospadias aisladas. Como estudios iniciales se incluyeron los genes NR3C4, SRD5A2, AKR1C2, AKR1C3, HSD17B6 y HSD17B3 como causa de hipospadias aisladas en estos pacientes. Para el grupo controlse incluyeron 100 individuos masculinos sanos (sin presencia de DSD ni afectación en el aparato urogenital) de origen mexicano. Extracción de DNA genómico Se tomaron 10 mL de sangre periférica de pacientes (25) y controles (100) los cuales fueron colocados en tubos cónicos con 200 μL de EDTA 0.5 M pH 8 y mezclados por inversión. Las muestras se colocaron en hielo y se llevaron a 35 mL con sacarosa Tritón 2X (sacarosa 0.64 M, Tris-base 0.02 M, MgCl2 0.01 M, Tritón X100 2%), la mezcla se llevó a 50 mL con agua estéril, desionizada-destilada y se mezcló por inversión. Las muestras se dejaron en hielo por 10 minutos con agitación suave. Para obtener el precipitado celular se centrifugó a 1000 x g a 4°C por 15 minutos decantando el sobrenadante para lavar el precipitado con 5 mL de solución sacarosa Tritón 1X con posterior centrifugación a 1000 xg por 15 minutos a 4°C. El precipitado se resuspendió en 3 mL de Solución de Lisis Nuclear (Tris-base 10 mM, NaCl 400 mM y Na2EDTA 2 mM), 108 μL de Dodecil Sulfato de Sodio (SDS) al 20% y 100 μL de Proteinasa K (5 mg/ml). La muestra fue incubada con agitación a 50°C durante un mínimo de 2 horas. El contenido fue transferido a tubos cónicos estériles de 15 mL, se agregó 1 mL de NaCl saturado y se agitó vigorosamente 15 segundos. Se centrifugó a 1000 xg durante 15 minutos a temperatura ambiente. El sobrenadante se recuperó, se agregaron 2 volúmenes de etanol absoluto frío y se mezcló por inversión hasta que el DNA precipitó. El DNA fue extraído con una pipeta Pasteur sellada y se lavó con etanol al 70% por 30 segundos. Se dejó secar durante 30 segundos y el DNA fue colocado en tubos para microcentrífuga de 500 μL que contenían 400 μL de Tris-EDTA (TE, 1 ml de Tris 1 M, 29 0.02 ml de EDTA 0.5 M). Se dejó disolver a 37°C durante 24 horas. El DNA se cuantificó en un espectrofotómetro “Beckman DU 650”. Reacción en la cadena de la polimerasa PCR Se amplificaron los 9 exones del gen AKR1C4 de manera individual mediante PCR usando oligonucleótidos sintetizados como indicadores para la síntesis de DNA en la región intrónica adyacente a la zona de corte y empalme diseñados de acuerdo a las secuencias nucleotídicas ya reportadas en el GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/) utilizando el programa PrimerQuest (http://www.idtdna.com/primerquest/Home/Index). Para el PCR punto final se realizó la reacción colocando 4 μL de solución amortiguadora 5X, 0.5 μL de dNTP’s (20 μM), 0.5 μL Oligo 5’ (20 μM), 0.5 μL de Oligo 3’ (20 μM), 5 μCi de dCTP marcado en α con 32P, GoTaq Polimerasa (1 u/μL), 2 μL de MgCl2 25 mM, DMSO (1%), 10 ng de gDNA y se llevó a un volumen final de 20 μL con H2O. Las reacciones fueron colocadas en un termociclador Veriti 96 well thermal cycler por 1 ciclo a 94°C 3 min, 30 ciclos a 94°C por 30 seg, 60°C por 30 seg, 72°C por 30 seg y 1 ciclo a 72°C por 3 min. Los productos amplificados mediante PCR fueron analizados en geles de agarosa al 1% [pesar 1 g de agarosa en 100 mL de TBE 0.5X (TBE 5X, 27.5 g de ácido bórico, 54 g de Tris base y 20 mL de EDTA 0.5 M)] y teñidos con Midori Green. Los productos (5 μL) fueron depositados en geles de agarosa utilizando 3 μL solución de carga para DNA (azul de bromofenol 0.25% p/v, cianol xileno 0.25% p/v, ficoll 400 5% p/v) y comparados con un marcador de peso molecular (MPM) de 100 pares de bases. La electroforesis se dejó correr a 100 volts y se observó en un transiluminador. http://www.idtdna.com/primerquest/Home/Index 30 Polimorfismo conformacional de cadena sencilla (SSCP) Los ensayos mediante la técnica de SSCP se realizaron posterior a la amplificación de los nueve exones, de los cuales se tomaron 2 μL de la muestra los cuales fueron mezclados con 13 μL de solución de carga para SSCP [formamida 95%, EDTA 20 mM y azul de bromo fenol (0.05%)], los amplicones se desnaturalizaron por 5 minutos a 94°C y fueron colocados en geles de poliacrilamida de 30x40 cm a diferentes concentraciones de acrilamida (5.4% y 8% con y sin glicerol) (Tabla 1) los cuales se sometieron a electroforesis con solución de corrida TBE 0.5X a 200-250 volts por un periodo de 18 horas. Terminada la electroforesis, los geles se desmontaron y se transfirieron a papel Whatman 3MM y fueron secados (Slab Gel Dryer, Savant) durante una hora a 70°C, pasado este proceso se expuso en una pantalla “Molecular Imager FX, Imaging screen- K, BioRad” en un cartucho con pantallas intensificadoras durante 3 horas, la cual finalmente fue analizada en un escáner PMI con el programa QuantityOne. Tabla 1. Reactivos necesarios para geles de poliacrilamida de 70 mL. Reactivo Gel de Poliacrilamida al 8% Gel de Poliacrilamida al 5.4% Con glicerol Sin glicerol Con glicerol Sin glicerol H2O 29.85 mL 36.89 mL 35.91 mL 42.91 mL Glicerol 7.0 mL -------- 7.0 mL -------- TBE 5X 14.0 mL 14.0 mL 14.0 mL 14.0 mL Ac/Bis (29:1) 18.66 mL 18.66 mL 12.6 mL 12.6 mL PSA 10% 0.49 mL 0.49 mL 0.49 mL 0.49 mL Temed 25 µL 25 µL 24.5 µL 24.5 µL 31 Purificación de DNA Los exones identificados con alteraciones mediante SSCP se amplificaron nuevamente en las mismas condiciones pero con la ausencia de dCTP-32P. Se agregaron 20 μL de solución de carga para DNA, estos fueron colocados en geles de agarosa al 1% teñidos con bromuro de etidio para ser purificados, el gel se dejó correr a 100 volts por aproximadamente 45 minutos para posteriormente cortar el sitio donde se encontraba la muestra. Los fragmentos fueron colocados en membranas de diálisis (las cuales fueron previamente lavadas con agua estéril, desionizada y destilada y colocadas en TBE 0.5X) y se les agregó 300 μL de TBE 0.5X para después realizar la electroelución a 100 volts durante 15 minutos, pasado el periodo de tiempo, la muestra se transfirió a columnas Amicon Ultra-4, 30 K con 1.5 mL aproximadamente de agua estéril, desionizada y destilada. Las columnas fueron centrifugadas a 1500 x g durante 20 minutos, finalmente se colectó el DNA purificado y se colocó en tubos Eppendorf de 0.5 μL del amplicón obtenido, se observaron en geles de agarosa al 1% para verificar su concentración/pureza y posteriormente se cuantificó espectrofotométricamente para secuenciación. 32 Secuenciación Las muestras que fueron purificadas se prepararon para secuenciar utilizando el estuche BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems, Austin, TX). Las reacciones se realizaron de la siguiente manera: 2 μL de la mezcla de reacción, 1 μL de solución amortiguadora, 5 μL de H2O, 2 pmol de oligonucleótido y 10 ng del DNA. Las muestras se colocaron en un termociclador Veriti “96 well thermal cycler” durante un tiempo de corrida de aproximadamente tres horas. Las condiciones de secuenciación fueron las siguientes: un ciclo a 96°C por 1 minuto, treinta y cinco ciclos a 95°C por 10 segundos, 50°C por 5 segundos y 60°C por 4 minutos, con una extensión final a 4°C. Terminada la reacción se purificaron las muestras utilizando 45 μL de solución SAM y 10 μL de solución XTerminator. Las muestras se colocaron en agitación durante 30 minutos y se centrifugaron durante 2 minutos a 500 xg. El sobrenadante se colectó en tubos estériles. Finalmente las muestras se colocaron en un equipo “ABI PRISM 310 Genetic Analyzer” para la secuenciación en ambos sentidos. Los experimentos fueron realizados en 3 ensayos independientes. 33 Análisis in sillico Se realizó un análisis de las variaciones encontradas en las secuencias realizadas y fueron comparadas en bases de datos MutationTaster2 (http://www.mutationtaster.org/), PolyPhen 2 (http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/), Provean (http://provean.jcvi.org/seq_submit.php) y SIFT (https://sift.bii.a-star.edu.sg/) para predecir la patogenicidad de lassubstituciones identificadas. http://www.mutationtaster.org/ http://genetics.bwh.harvard.edu/pph2/ http://provean.jcvi.org/seq_submit.php 34 4. RESULTADOS Como paso inicial se amplificaron mediante PCR los 9 exones (del exón 1 al 9) del gen AKR1C4 en individuos 46,XY-DSD. Los amplicones fueron colocados en geles de agarosa al 1% teñidos con bromuro de etidio y sometidos a electroforesis con un marcador de peso molecular (MPM). Los resultados mostraron que los exones si habían amplificado y presentaban el tamaño esperado de 100 a 250 pares de bases (pb) similar al de los sujetos sanos control (Fig. 7). Asimismo, presentaban patrones de bandeo único lo cual índica la especificidad de la reacción de PCR. Fig. 7. Imagen representativa de un gel de agarosa observado bajo luz UV. En este caso se muestra únicamente el exón 7 del gen AKR1C4. En la figura se muestran los controles (C) y los pacientes (1-12) comparados con el MPM de 100 pb. Una vez comprobado que los exones fueron amplificados correctamente se realizó el estudio de cada uno de los exones mediante SSCP en geles de poliacrilamida de 35x43 cm a diferentes concentraciones de acrilamida [(5.4% y 8% con glicerol (c/g) y 5.4% y 8% sin glicerol (s/g)]. Un total de 36 sistemas para el gen AKR1C4 fueron realizados. Los geles fueron secados utilizando un desecador (Slab Gel Dyer) y expuestos en una pantalla sensible a radiactividad (Molecular Imager FX Imaging scree- k). Los resultados mostraron variaciones en el exón 4 y en el exón 9 observando tres distintos tipos de patrón de migración (Fig. 8 y 9). Los exones 1, 2, 3, 5, 6, 7 y 8 del gen AKR1C4 no presentaron variaciones o cambios en su secuencia nucleotídica (Fig. 10). 35 Fig. 8. Ensayos de SSCP al 8% s/g del exón 4 del gen AKR1C4. Los grupos controles (C) se encuentran en los extremos y se muestran los 25 pacientes estudiados, con flechas se señalan los patrones de migración electroforética diferentes. C C Se r C is Se r/ C is 36 Fig. 9. Ensayos de SSCP al 8% c/g del exón 9 del gen AKR1C4. Los grupos controles se localizan en los extremos y se muestran en comparación los 25 pacientes. Las flechas señalan las variaciones que se presentan. Le u /V al V al C C Le u 37 Fig. 10. Ensayos de SSCP del exón 8 como imagen representativa en la que se muestra que el patrón de migración electroforética es similar en todas las muestras de individuos control y pacientes con hipospadias. C C 38 Identificadas las substituciones o alteraciones moleculares del gen AKR1C4 a partir de pacientes 46,XY-hipospadias, se procedió a secuenciar los exones 4 y 9 que presentaban alteraciones en la movilidad electroforética (Tabla 2). Los resultados detectaron una variante polimórfica en el nucleótido 434 de la región codante del exón 4 y que consistió en la identificación en diferentes pacientes de un alelo homocigoto para citosina (C), un alelo homocigoto para guanina (G) y un alelo heterocigoto para C/G (Tabla 2). La variante puntual originó en el codón 145 (Fig. 11) la localización de una serina (TCT; p.S145), una cisteína (TGT; p.C145) y un heterocigoto para serina y cisteína (p.S145/ p.C145). Tabla 2. Alelos identificados en el exón 4 del gen AKR1C4 asociados a pacientes con DSD 46,XY-hipospadias. Paciente Exon 4 P1 TGT P2 TGT P3 TCT/TGT P4 TCT/TGT P5 TCT/TGT P6 TCT/TGT P7 TCT P8 TCT/TGT P9 TCT P10 TCT P11 TGT P12 TCT P13 TCT P14 TCT P15 TCT/TGT P16 TCT/TGT P17 TCT/TGT P18 TCT/TGT P19 TCT P20 TCT/TGT P21 TCT P22 TCT/TGT P23 TCT/TGT P24 TCT/TGT P25 TCT 39 Fig. 11. Secuencia parcial del exón 4 del gen AKR1C4. La secuencia muestra las variantes alélicas identificadas en la posición 434 (c.434C>G). p.Ser145Cys GTG GAT CTC TCT GCC ACA TGG TGT Exón 4 40 Los resultados obtenidos mediante secuenciación del exón 9 del gen AKR1C4 identificaron una variante polimórfica en el nucleótido 931. La variante fue localizada en el codón 311 y mostró como resultado un alelo homocigoto para C, un alelo homocigoto para G y un alelo heterocigoto para C/G (Tabla 3). La variante nucleotídica del alelo 311 (Fig. 12) codifica para una leucina (CTT; p.L311), una valina (GTT; p.V311) y un heterocigoto para L y V (p.L311; p.V311). Tabla 3. Alelos identificados en el exón 9 del gen AKR1C4 asociados a pacientes con DSD 46,XY-hipospadias. Paciente Exon 9 P1 CTT P2 CTT P3 CTT/GTT P4 CTT/GTT P5 CTT/GTT P6 CTT/GTT P7 GTT P8 CTT/GTT P9 GTT P10 GTT P11 CTT P12 GTT P13 GTT P14 GTT P15 CTT/GTT P16 CTT/GTT P17 CTT/GTT P18 CTT/GTT P19 GTT P20 CTT/GTT P21 GTT P22 CTT/GTT P23 CTT/GTT P24 CTT/GTT P25 GTT 41 Fig. 12. Secuencia parcial del exón 9 del gen AKR1C4. La secuencia muestra las variantes alélicas identificadas en la posición 931 (c.931C>G). ctt ttc agt CTT ATG GAC CAT GTT p.Leu311Val Exón 9 42 A partir de los resultados obtenidos mediante PCR-SSCP y secuenciación para los pacientes 46,XY con DSD se procedió a analizar mediante PCR-SSCP las variantes polimórficas del codón 145 (exón 4, c.434C>G) y 311 (exón 9, c.931C>G) del gen AKR1C4 en 100 individuos controles sanos (Tabla 4). Tabla 4. Alelos identificados en el exón 4 y 9 del gen AKR1C4 en 100 individuos controles sanos. Gen Variante nucleotídica Alelo Número de individuos AKR1C4 c.434C>G C/C 74 G/G 2 C/G 24 c.931C>G G/G 74 C/C 2 C/G 24 43 Se realizó un análisis de equilibrio Hardy-Weinberg para determinar si los genotipos encontrados se encuentran en equilibrio utilizando las frecuencias genotípicas y alélicas (Tabla 5) y por medio de la prueba Chi-cuadrada (X2) con 1 grado de libertad (gl). Los resultados indicaron que no existe diferencia significativa (NS) y podemos sugerir que la población se encuentra en equilibrio (Tabla 6 y 7). Las frecuencias se presentaron en igual proporción en ambos exones, mostrándose los homocigotos G/G en el exón 4 y C/C en el exón 9 los de menor frecuencia y los homocigotos C/C para el exón 4 y G/G en el exón 9 los de mayor frecuencia para el caso de los controles. Por el lado de los pacientes en el exón 4 y 9 los de menor frecuencia fueron el homocigoto G/G y el C/C respectivamente, así como los heterocigotos C/G los de mayor frecuencia. Tabla 5. Frecuencias genotípicas y alélicas de las variaciones encontradas para los exones 4 y 9 del gen AKR1C4. Gen AKR1C4 Frecuencias genotípicas Frecuencias alélicas Controles Exón 4 c.434C>G G/G C/C C/G 0.02 0.74 0.24 p= 0.17 q= 0.83 Pacientes Exón 4 c.434C>G G/G C/C C/G 0.12 0.36 0.52 p= 0.38 q= 0.62 Controles Exón 9 c.931C>G C/C G/G C/G 0.02 0.74 0.24 p= 0.17 q= 0.83 Pacientes Exón 9 c.931C>G C/C G/G C/G 0.12 0.36 0.52 p= 0.38 q= 0.62 44 Tabla 6. Probabilidad determinada para el exón 4 (c.434C>G) y la significancia según los grados de libertad de acuerdo a Hardy-Weinberg. Población Muestras gl X2 Probabilidad Significancia Controles 100 1 1.28 0.72 NS Pacientes 25 1 0.2673 0.34 NS Tabla 7. Probabilidad determinada para el exón 9 (c.931C>G) y la significancia según los grados de libertad de acuerdo a Hardy-Weinberg. Población Muestras gl X2 Probabilidad SignificanciaControles 100 1 1.28 0.72 NS Pacientes 25 1 0.2673 0.34 NS Ambas substituciones fueron analizadas in sillico mediante los programas previamente mencionados en la metodología para la predicción de variantes patogénicas. Las predicciones encontradas señalan que se trata de una variación benigna o polimorfismo por lo cual no son las causantes de la patogenicidad en los individuos en el caso de ambos exones (Tabla 8). Tabla 8. Predicciones de ambas variaciones en el gen AKR1C4 según diferentes bases de datos. Variantes Provean Polyphen-2 MutationTaster SIFT p.Ser145Cys Neutral Benigna Polimorfismo Tolerada p.Leu311Val Neutral Benigna Polimorfismo Tolerada 45 5. DISCUSIÓN Los andrógenos son esteroides sexuales considerados como responsables de la diferenciación sexual masculina y del mantenimiento de los caracteres sexuales secundarios. La acción de los andrógenos es regulada mediante la unión a su receptor nuclear denominado AR. Los principales andrógenos T y DHT son sintetizados mediante la vía clásica Δ5 o Δ4 a partir del colesterol; en esta ruta metabólica intervienen enzimas específicas que incluyen citocromos P450 (CYP450), hidroxiesteroide deshidrogenasas (HSDs) y esteroide reductasas. En estas vías metabólicas, la DHT es obtenida mediante la 5α-reducción de T en tejidos periféricos; sin embargo se ha reportado la existencia de otras vías para la síntesis de DHT y son llamadas vía “alterna” (donde DHT es sintetizada a partir de 5α-androstandiona por acción de la AKR1C3) y vía “backdoor” (la cual no requiere de T, DHE ni androstandiona para sintetizar DHT y en la que intervienen las enzimas AKR1C2-4). Asimismo, múltiples investigaciones han reportado que individuos 46,XY con deficiencias o alteraciones en la esteroidogénesis pueden presentan DSD, una malformación congénita caracterizada por presentar ambigüedad de genitales y en algunas ocasiones hipospadias (anormalidades en el desarrollo de la uretra masculina). A pesar de toda la información reportada a la fecha, no todas las alteraciones en el desarrollo masculino han sido explicadas totalmente por lo cual se sugiere que existen otros factores génicos aún no identificados (Zachmann et al, 1972; Miller, 1988; Vilchis., et al 2003; Sanderson, 2006; Vilchis et al., 2008; 2010; Chávez et al., 2014; Ramos et al., 2018; Schiffer et al, 2018). Al respecto, un único estudio de Flück et al en 2011 sugiere que la vía “backdoor” podría estar involucrada en el desarrollo masculino en humanos y han asociado sus alteraciones como posibles causantes de DSD en pacientes donde se han descartado mutaciones en enzimas de la vía clásica. El objetivo de este proyecto se enfocó en realizar ensayos de tamizaje molecular y secuenciación en el gen AKR1C4 y que codifica para una enzima que actúa en la vía “backdoor”, esto con el propósito de corroborar si 46 las alteraciones génicas son causantes de la ambigüedad genital en pacientes con DSD 46,XY-asociados a hipospadias. La amplificación mediante PCR de los 9 exones del gen AKR1C4 excluyó la presencia de inserciones o deleciones de un número amplio de pares de bases. Esto se pudo observar debido a que todos los exones amplificados presentaban el tamaño esperado (aproximadamente 200 pares de bases) y presentaban una talla similar a la de los controles sanos. Posterior a la amplificación por PCR, los resultados mediante SSCP indicaron tres variaciones en la migración electroforética en dos de los exones analizados individualmente (exones 4 y 9). Los primeros resultados que se obtuvieron en la secuenciación del exón 4 mostraron una variación polimórfica en el nucleótido 434 donde se presentó un homocigoto para C, uno para G y un heterocigoto para C/G, los cuales codifican para una serina o una cisteína en el codón 145, estos fueron comparados con los grupos control los cuales presentaban la misma variación. En las bases de datos, los resultados de predicción de patogenicidad concluyeron que esta variación es benigna, tolerada, neutral o se trata de un polimorfismo. Esta variación coincide con la reportada por Söderhäll et al en 2015, la cual es mencionada como un polimorfismo y que no es la causante de los DSD; por lo que de esta manera, no se puede asociar esta variación nucleotídica como la causante de las hipospadias en los individuos. Trabajos como el de Johansson et al en 2011 y 2012 han asociado este polimorfismo con la baja concentración de progesterona en hombres y un riesgo de manía, hipomanía e irritabilidad; además de que esta variación sin sentido reduce el riesgo de ideas de paranoia en un 60%. Para el exón 4 se logra apreciar una menor frecuencia en el alelo homocigoto G/G entre pacientes y grupos controles, así como una mayor frecuencia en el homocigoto C/C en los individuos control y el heterocigoto en los pacientes. A pesar de que se observa un cambio entre las frecuencias genotípicas y fenotípicas, las proporciones alélicas, así como el análisis de Hardy-Weinberg, muestran que la población está en 47 equilibrio, es decir, los alelos mantienen su frecuencia en la población y no existe selección entre estas variantes polimórficas. A pesar que los estudios de Flück et al en 2011 realizaron amplificación y secuenciación del gen AKR1C4, ellos no encuentran en la parte codificante mutaciones y se enfocan en una mutación intrónica que eliminaba por completo el exón dos el cual representa el sitio activo. En este trabajo no se presenta algún resultado considerable o similar a los reportados por este autor ya que las variaciones encontradas se limitan al exón 4 y al 9. De acuerdo con el estudio de Söderhäll et al realizado en 2015, ellos proponen como candidatos de hipospadias a AKR1C2-4 y señalan en AKR1C4 dos variaciones genéticas en la secuenciación del exón 4, los autores reportan como polimorfismo una variante encontrada en el codón 145 que origina el cambio de una serina por una cisteína, así mismo como una mutación en el nucleótido 447 en la región intrónica 4. Para analizar los resultados en este trabajo, las diferentes migraciones fueron sometidas a secuenciación para identificar el tipo de mutación. Los resultados para el exón 9 mostraron una variación polimórfica en el nucleótido 931 con un homocigoto para C, uno para G y un heterocigoto para C/G que codifican para una leucina o una valina en el codón 311. De igual manera que en el exón 4, estas variaciones se tratan de polimorfismos y no se pueden asociar como substituciones o mutaciones causantes de hipospadias en los pacientes, no se encuentran trabajos que la mencione o asocie con DSD. Sin embargo estudios como el de Lord et al en 2005 reportan que este polimorfismo se involucra en el metabolismo de estrógenos en mujeres con post menopausia que se someten a terapias de estrógenos. Tunali y Tiryakioglu en 2011 mencionan que este polimorfismo encontrado en la C terminal, afecta la unión de especificidad al sustrato en tejidos. En el exón 9 se aprecia un resultado similar a lo observado en el exón 4, una diferencia de frecuencias genotípicas en las cuales el alelo homocigoto C/C se presenta 48 en menor frecuencia en pacientes y grupos controles, los de mayor frecuencia para el homocigoto G/G en controles y el heterocigoto en pacientes, al igual no se presenta una desviación entre las frecuencias de estos alelos por lo que la población se encuentra en equilibrio en ambos casos, los factores que determinan esta variación son externos a la reproducción. Parte de los resultados muestran que los diferentes patrones de migración electroforética mediante SSCP y secuenciación en el exón 4 y el exón 9 se tratan de variaciones de un solo nucleótido, las cuales se presentan en igual proporción en ambos exones, como se aprecia en la tabla 5 los mismos pacientes que presentan lavariación homocigota para CTT en el exón 4, la presentan para TGT en el exón 9, de igual manera el mismo número de individuos que presentan la variación GTT la presentan en TCT y el mismo caso para el número de individuos con la variación del heterocigoto TCT/TGT, GTT/CTT para ambos exones respectivamente. Estos SNPs (polimorfismos de nucleótido simple) se han transmitido juntos y puede que se encuentren asociados por lo cual se puede tratar de un haplotipo, sin embargo este patrón difícilmente se puede relacionar con la causa de las hipospadias en los pacientes por lo cual se sugeriría un estudio para determinar la correlación que existe entre estas dos variaciones polimórficas en estos exones. 49 6. CONCLUSIÓN Se localizaron tres variaciones en el patrón de migración electroforética del gen AKR1C4 en cada uno de los exones 4 y 9. La secuenciación de la parte codificante mostró un cambio nucleotídico en el codón 145 del exón 4 (p.S145C) y 311 del exón 9 (p.L311V) en los pacientes. Se observan las mismas variaciones en cuanto al patrón de migración y la secuencia en los individuos control y los pacientes. El análisis poblacional no muestra una diferencia significativa en el comportamiento de estos alelos. El análisis in silico realizado mostró que estos cambios han sido reportados previamente como polimorfismos, por lo cual no se trata de mutaciones o variaciones patógenas que puedan ser las causantes de un desorden en el desarrollo. Las variantes localizadas en el gen que codifica a la enzima AKR1C4 perteneciente a la vía “backdoor” no presentan una participación considerable en la diferenciación sexual por lo tanto no puede ser asociado como la causa de hipospadias en los 25 pacientes estudiados. 50 7. PERSPECTIVAS Los resultados obtenidos en este trabajo descartan la participación de mutaciones del gen AKR1C4 asociadas a DSD-hipospadias de los sujetos 46,XY estudiados, sin embargo se sugiere un análisis mutacional de otros genes que pudieran estar asociados con este padecimiento y que estén involucrados en la diferenciación sexual masculina como es el caso del gen MAFB. Recientemente se ha demostrado que la expresión sexualmente dimórfica de MAFB podría regular la masculinización de la formación uretral embrionaria en ratones (Suzuki et al., 2014). El factor de transcripción MAFB (V-maf musculoaponeurotic fibrosarcoma oncogene homolog B) es una proteína caracterizada estructuralmente por presentar una región denominada zipper de leucinas localizada en el extremo carboxilo terminal y que afecta positiva o negativamente la transcripción, dependiendo de su(s) proteína(s) asociada(s) y la estructura del promotor génico. Estudios iniciales han mostrado que el MAFB es un regulador transcripcional de la neurogénesis y la hematopoyesis. En etapas tempranas del desarrollo, los genes Hox controlan la regionalización durante la segmentación del rombencéfalo en las rombomeras; sugiriendo que MAFB activa directamente la expresión de los genes HOXB3 y HOXA3, asociando al MAFB al proceso de regulación segmentaria. Durante muchos años, las investigaciones se han centrado en la identificación de genes masculinizantes bajo el control de las acciones androgénicas. Sin embargo, tales genes no han sido identificados. Por lo tanto, todavía no está claro completamente cómo estos procesos morfogenéticos están regulados por andrógenos. 51 REFERENCIAS Alhomaidah, D.; McGowan, R.; Ahmed, S.F. 2017. The current state of diagnostic genetics for conditions affecting sex development. Clin Genet 91: 157-162. Baetens, D.; Mendonca, H.; Cools, M. y De Baeere, E. 2017. Non coding variation in disorders of sex development. Clin Genet 91: 163-172. Chassot, A.; Rnac, F.; Gregoire, E.P.; RoepersGajadien, H. L.; Taketo, M. M.; Camerino, G.; Rooij, D. G.; Schedl, A. y Chaboissier, M. C. 2008. Activation of b-catenin signaling by Rspo1 controls differentiation of the mammalian ovary. Hum Mol Genet 17: 1264–1277. 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