Descarga la aplicación para disfrutar aún más
Vista previa del material en texto
UNIVERSIDAD NACIONAL AUTONOMA DE MÉXICO TÉSIS: Caracterización Molecular de Nuevas Proteínas Antigénicas de Leishmania major Seleccionadas por Bioinformática. QUE PARA OBTENER EL TÍTULO DE: QUÍMICA FARMACEÚTICA BIÓLOGA. PRESENTA: LAGUNA DEL CARMEN CADENA CARRIÓN MÉXICO, D.F. 2008 UNAM – Dirección General de Bibliotecas Tesis Digitales Restricciones de uso DERECHOS RESERVADOS © PROHIBIDA SU REPRODUCCIÓN TOTAL O PARCIAL Todo el material contenido en esta tesis esta protegido por la Ley Federal del Derecho de Autor (LFDA) de los Estados Unidos Mexicanos (México). El uso de imágenes, fragmentos de videos, y demás material que sea objeto de protección de los derechos de autor, será exclusivamente para fines educativos e informativos y deberá citar la fuente donde la obtuvo mencionando el autor o autores. Cualquier uso distinto como el lucro, reproducción, edición o modificación, será perseguido y sancionado por el respectivo titular de los Derechos de Autor. Agradecimientos A la M. en C. Alicia B. Cervantes Peredo por sus sugerencias para el termino de éste trabajo. A la M. en C. Roxana Isela Noriega Navarro por la ayuda que recibí en algún momento para mejorar ésta tesis. A todas las personas que me apoyaron y entusiasmaron para seguir en este trabajo hasta el final. Gracias al jurado conformado por: Presidente Abel Gutiérrez Ramos Vocal Alicia Beatriz Cervantes Peredo Secretario José Alejandro Padilla Trejo 1er Suplente Norma Angélica Castellanos Chávez 2do Suplente José Ignacio Páramo Ramírez DEDICATORIAS A mi mamá por su gran paciencia, sus oraciones y sus buenos deseos en todos estos años. Gracias mamá porque de ti me proviene la vida. A Orlando, porque ha sido hermano y amigo. A mis compañeras del grupo de danza ZARAH, Vero, Terpsicore, Mayra, María Paulina, Atzin y Natalia, que siempre me han motivado para continuar. A todos los compañeros que convivieron conmigo en la Facultad, y a los que todavía aún conservo su amistad. A Oscar Tejeda por escucharme y leerme pacientemente, gracias por tu apoyo y compañía. ÍNDICE ABREVIATURAS 1 RESUMEN 3 1 INTRODUCCIÓN 5 1.2 Variedades de Leishmaniasis 5 1.3 Epidemiología 8 1.4 Características del parásito 12 1.4.1 Ciclo de vida 13 1.4.2 Vacuola parasitófora 14 1.4.3 Transmisor o vector 15 1.4.4 Efecto de la saliva de la mosca 16 1.5 Respuesta inmune 16 1.5.1 Respuesta inmune en ratón 19 1.6 Proteínas de superficie 20 1.7 Desarrollo de vacunas 22 2 JUSTIFICACIÓN 24 3 HIPÓTESIS 24 4 OBJETIVOS 26 4.1.1 Objetivo general 26 4.1.2 Objetivos particulares 26 5 MATERIALES Y MÉTODOS 27 5.1 Análisis bioinformático 28 5.2 Extracción de ADN genómico (ADNg) de L. major. 29 5.3 Amplificación del ADNc con oligonucleótidos específicos 30 5.4 Ligación 31 5.5 Transformación y tamizaje de colonias 32 5.6 Purificación del plásmido (mini-prep) 34 5.7 Secuenciación del fragmento clonado 34 5.8 Subclonación en un vector de expresión 35 5.9 Transformación en una célula de expresión 36 5.10 Obtención y purificación de la proteína 37 6 RESULTADOS 39 6.1 Análisis Bioinformático 39 6.2 Extracción de ADN genómico (ADNg) 40 6.3 Oligonucleótidos utilizados 41 6.4 Amplificación del ADNc con oligonucleótidos específicos 41 6.5 Identificación de clonas con fragmentos amplificados por PCR 42 6.6 Secuenciación del fragmento clonado 44 6.7 Subclonación de G1-5 46 7 DISCUSIÓN 51 8 CONCLUSIONES 56 9 REFERENCIAS 57 10 ANEXO 62 ÍNDICE DE FIGURAS Figura 1 Leishmaniasis Visceral Página 6 Figura 2 Úlcera de Leishmaniasis Cutánea 6 Figura 3 Leishmaniasis Cutánea Diseminada 7 Figura 4 Leishmaniasis Mucocutánea 8 Figura 5 Distribución mundial de la Leishmanisis 9 Figura 6 Distribución geográfica en México 11 Figura 7 Casos de Leishmaniasis de 1990 al 2005 11 Figura 8 Promastigote 12 Figura 9 Amastigote 13 Figura 10 Ciclo de vida 14 Figura 11 Phlebotomus 15 Figura 12 Macrófago infectado de amastigote 18 Figura 13 Gráfica de hidrofobicidad Saf1 28 Figura 14 Gráfica de hidrofibicidad G1-5 29 Figura 15 Vector pcRII-TOPO 32 Figura 16 Transformación y tamizaje 33 Figura 17 Vector pQE16 36 Figura 18 Secuencia de nucleótidos y aminoácidos Saf1 de L.major. 36 Figura 19 Secuencia de nucleótidos y aminoácidos G1-5 de L.major. 40 Figura 20 Secuencia de oligonucleótidos empleados para PCR 41 Figura 21 Fragmentos obtenidos del PCR de Saf1 42 Figura 22 Fragmentos obtenidos del PCR de G1-5 42 Figura 23 Electroforesis de las clonas de Saf1 amplificadas por PCR 43 Figura 24 Electroforesis de las clonas de G1-5 amplificadas por PCR 44 Figura 25 Secuencia de Saf1 45 Figura 26 Secuencia de G1-5 45 Figura 27 Digestión del vector pcRII-TOPO Saf1 46 Figura 28 Digestión del vector pcRII-TOPO G1-5 46 Figura 29 Electroforesis en gel de poliacrilamida 47 Figura 30 Digestión de las clonas con BamH1 y BglII 49 Figura 31 Digestión con BamH1 y BglII (2) 50 Figura 32 Digestión de las clonas G1-5 y el vector pQE16 50 1 LISTA DE ABREVIATURAS aa Aminoácidos ADN Ácido desoxirribonucleico ADNg Ácido desoxirribonucleico genómico ADNp Ácido desoxirribonucleico plasmídico Cat. Catálogo CD4+,CD8+ Linfocitos T colaboradores C3 Molécula precursora de la vía clasica del complemento CR1,CR3 Receptores del MHC °C Grados centígrados dATP 2’-Deoxiadenosina 5’-trifosfato dCTP 2’-Deoxicitidina 5’-trifosfato ddNTP 2´,3´Dideoxinucleótido dGTP 2’-Deoxiguanosina 5’-trifosfato DHFR Dihidrofolato reductasa dNTP Dinucleótido trifosfato dTTP 2’-Deoxitimidina 5’-trifosfato g gramos hr hora HAT Tripanosomiasis africana humana HLA Antígenos leucocitarios humanos IFN-γ Interferón gama o inmune IL Interleucina IPTG Isopropil-β-D-tiogalactósido kb Kilobase kD Kilo Dalton LB Luria –Bertani LC Leishmaniasis cutánea LCM Leishmaniasis mucocutánea LPG Lipofosfoglicano LV Leishmaniasis visceral M Molar mg miligramo MHC Complejo Mayor de Histocompatibilidad min minuto ml mililitro mM milimolar μg microgramo μl microlitro 2 NCBI National Center Biotechnology Information No. Número NO Óxido nítrico pb pares de bases PCR Reacción en cadena de la Polimerasa PM marcador de peso molecular PKDL Leishmaniasis Post Kala-azar p38MAPK cinasa rpm revoluciones por minuto RT Transcriptasa reversa s segundo SDS Dodecil sulfato de sodio TB7-1 Moléculas coestimuladores de linfocitos T 3 RESUMEN. Leishmania major es un protozoario de la familia Tripanosomatidae, este protozoario es un parásito intracelular que provoca una de las Leishmaniasis, la cutánea. La Leishmaniasis en nuestro país afecta a más de 16 estados y los más afectados son los del sureste del país, también se encuentra distribuida en Medio Oriente, Sur de Europa, Centro y Norte de África, así como en algunos países de América Latina. Hasta la fecha no se ha encontrado un medicamento eficiente que no tenga efectos secundarios severos o vacuna alguna para el control de esta enfermedad. Este trabajo es parte de una investigación en la que se pretende analizar la totalidad de los genes y proteínas disponibles en el proyecto del genoma de L. major, con la finalidad de identificar proteínas altamente antigénicaspara utilizarlos como nuevos blancos en el desarrollo de vacunas que protejan contra la infección de este parásito. Primero se analizaron algunas de las secuencias del genoma de L. major y el uso de técnicas bioinformáticas se seleccionaron genes que codificaron para proteínas membranales o secretoras altamente antigénicas que no han sido estudiadas y que además contienen epítopes para células T. A las secuencias también se les realizó un perfil de hidrofobicidad para estudiar la ubicación de la región del antígeno y su accesibilidad para interaccionar con las células T. Posteriormente se extrajo el ADNg de L. major a partir de parásitos de un ratón infectado, el cual se tomó como templado para amplificar las secuencias de Saf1 y G1-5 utilizando la técnica de PCR, seguido de este paso se clonaron los productos empleando el plásmido pcRII-TOPO, transformando células químicamente competentes: DH5α-T1. A las colonias positivas se les extrajo el plásmido y se secuenciaron los fragmentos clonados. Una vez que se verificaron íntegramente las secuencias, se llevó a cabo la elaboración de las construcciones genéticas 4 para producir las proteínas recombinantes para lo cual se clonaron en los vector es pQE16, pQE60 y pQE70 y se transformaron para su expresión de E. coli cepa M15. Desafortunadamente la secuencia de ADN que codifica para G1-5, presenta un comportamiento extraño dificultando la producción de la proteína recombinante en el sistema empleado, la dificultad para producir la proteína recombinante pudiera explicarse por la formación de estructuras secundarias de este gene. 5 1 INTRODUCCIÓN. La Leishmaniasis es una parasitósis intracelular del ser humano, esta enfermdad se encuentra distribuida en muchas regiones tropicales y subtropicales. Hay 21 especies y subespecies de Leishmania que han sido aisladas de humanos infectados. Estas especies son responsables de un amplio espectro de enfermedades de síntomas clínicos que van desde simples úlceras cutáneas hasta formas fatales de Leishmaniasis diseminada y visceral con efectos sobre los datos de morbilidad, sin embargo otras subespecies no son mortales (Bensoussan E. y cols, 2006). La Leishmania, pertenece a la familia Tripanosomatidae y es trasmitida por la mosca Phlebotomus en el Viejo Mundo y Lutzomya en el Nuevo Mundo. Como otras enfermedades tropicales, la Leishmaniasis se relaciona con los cambios ambientales y el desarrollo económico, lo que deriva en una mayor exposición a la mosca de la arena (St. George S y cols, 2006). Además la coinfección Leishmania-VIH ha surgido como un binomio en países como: India, Bangladesh, Nepal, Etiopia, Sudán, Brasil, aumentando la aparición de nuevos y convirtiendose en una enfermedad emergente mientras que en España, Italia, Francia y Portugal ha sido controlada (Cruz, I. y cols, 2006). 1.2 Variedades de Leishmaniasis. Existen cuatro importantes variedades de Leishmaniasis, 1) Leishmaniasis Visceral (LV, Figura.1), también llamada Kala-azar o fiebre Dumdum. Es provocada principalmente por L. donovani en el Viejo Mundo, en algunas ocasiones por L. tropica, L. infantum en la región Mediterránea y por L. chagasi en el Nuevo Mundo. La picadura es pequeña e inaparente, los síntomas que se presentan son: dos picos diarios de fiebre en el 10 % de los pacientes, 6 hepatoesplenomegalia, pancitopenia, hipergammaglobulinemia policlonal (Manual Merck, 1999). Fig 1. Leishmaniasis visceral, causada principalmente por L.donovani y L.chagasi, ésta infección tiende a invadir organos internos. (www.atlas.or.kr/.../DSCN05021023756671.jpg) 2) La Leishmaniasis Cutánea (LC. Figura 2), conocida con otros nombres como: botón de oriente, bulla, aleppo o Delhi, uta, úlcera de los chicleros, es la forma comunmente causada por L. major y L. tropica en el Viejo Mundo, por L. mexicana, L. braziliensis y L. panamensis en el Nuevo Mundo. Las manifestaciones clínicas son; en 1 a 4 semanas aparece una lesión cutánea bien demarcada, la cual es una pápula que se úlcera en el centro y muchas veces desarrolla un centro elevado hiperpigmentado, es indolora (Manual Merck, 1999). Fig 2. Úlcera característica de Leishmaniasis cutánea localizada, causada por L.major y L. mexicana. Modificado de Sánchez, S. L, y cols, 2004 7 3) La Leishmaniasis Cutánea Difusa (LCD. Figura. 3), es causada por L. aethiopica (Viejo Mundo), y el complejo de especies L. mexicana en América Latina (Herwaldt B.L.1999), representa la forma virulenta de la enfermedad, es crónica y progresiva. Sus manifestaciones son lesiones en la piel de tipo no ulcerativo diseminado, en las cuales, el parásito se difunde asociado a una severa anergia de células específicas. Se ha observado en pacientes del Estado de Tabasco, que presentan una propagación lenta en la linfa y los nódulos linfáticos, de una manera similar a la Leishmaniasis esporotricoide, los pacientes presentan una anergia específica y una respuesta muy pobre al tratamiento antimonial (Berzunza, C., y cols, 2000). Fig. 3 Leishmaniasis cutánea diseminada al cuello, causada por L.major, nótese 5 lesiones papulares y nodulares en el cuello. Modificado de Murray, H.W., 2005. 4) La Leishmaniasis Mucocutánea (LMC. Figura.4) o espundia, es principalmente causada por L .viannia braziliensis, la enfermedad comienza con una úlcera cutánea primaria en el sitio de la picadura de la mosca (2 a 3 meses), y en las etapas tempranas no se puede diferenciar clínicamente de modalidades cutáneas mas benignas de la enfermedad LC, puede hacer metástasis en la mucosa de nasofaringe y se desarrolla deformando la nariz y el paladar (Handman E, 2001). 8 Fig. 4 Leishmaniasis mucocutánea, el paciente muestra, la naríz y parte del labio superior dañado.Modificado de:http://www.colegiosaofrancisco.com.br/alfa/leishmania/leishmaniose.php/ Existe otro tipo de enfermedad denominado Leishmaniasis Post-Kala azar Dérmica (PKDL), es relativamente común, surge como consecuencia de la cura terapéutica de la LV, causada por L. donovani. Es una enfermedad variable comienza con la propagación de despigmentación progresiva de la piel o pápulas discretas en la superficie expuesta a la luz; puede progresar y producir una superficie extensa de nódulos discretos alargados que puede parecerse a la Leishmaniasis Cutánea diseminada o lepra lepromatosa (Bates, P.A., y Ashford, R.W., 2005). 1.3 Epidemiología. La Leishmaniasis es una parasitósis ampliamente distribuida en el mundo (Figura 5 y Anexo1), se puede encontrar en África Ecuatorial, Occidental y Norte, en Asia: Rusia Indostaní y Medio Oriente. La Leishmania major se encuentra distribuida en el Viejo Mundo, a lo largo del norte y sur de la franja del Sahara, extendiéndose hasta el Norte de Kenya, atravesando Arabia, sur de Irak, sur de Irán, en los estados de Asia Central: Turkmenistán, Uzbekistán, Norte de Afganistán y también en la cordillera que atraviesa Baal chistan Paquistaní y en el borde de Rajasthan (India). En estos 9 países, los parásitos son de zonas áridas y semiáridas, la distribución es determinada por los vectores y los hospederos mamíferos (roedores principalmente: Rhombomys opimus, Psammomys obesus). Fig. 5. Distribución mundial de las zonas más afectadas por los tres tipos de Leishmaniasis. Modificado de http://www.edu.au/.../handman/leishmaniasis.htlm En África, la infección se encuentra a lo largo de Sudán, Etiopía y Kenia, principalmente en los bosques poblados por Acacia seyal. La Leishmania infantum, es una de las especies más recurrentes en el Viejo Mundo, básicamente en el Mediterráneo, en Europa, Norte de África, que se extiende a través de Arabia, Turquía, Irán, las Repúblicas de Asia y el Noroeste de China. En América, se encuentra L. chagasi,desde el sureste de EUA hasta el norte de Argentina y Paraguay, excepto Chile y Uruguay, aunque se han hecho estudios moleculares que puede ser indistinguible de L. infantum (Bates, P.A y Ashfors R.W, 2005). 10 En nuestro país se ha encontrado que las zonas más afectadas por la Leihsmaniasis es en el estado de Chiapas y la cuenca del Río Balsas (Puebla, Guerrero y Morelos). En Chiapas entre el 2000 y el 2005 se detectaron 33 nuevos casos y apareció un foco adicional en Guerrero. En Chiapas, en los municipios de Tuxtla Gutiérrez y Chiapas de Corzo tienen una alta prevalencia de LV ya que en el 2000 se registraron 10 casos en edades de 2 meses a 13 años. En este estado la LCL muy abundante, sobre todo en lugares de la selva tropical perennifolia entre los años de 1990 al 2005 se reportaron 1310 casos de LCL. En Tabasco, se han reportado más pacientes con LCL y LCD, esta última es la forma progresiva del padecimiento. La alta prevalencia de los casos de Leishmaniasis en el estado de Tabasco se establece en los municipios de Cunduacán, Cárdenas y Comalcalco (la región de la “Chontalpa”), siendo una zona donde se cultiva cacao, representa una problemática para su control, ya que la Lutzomya transmisora de L. (L.) mexicana habita en el mismo nicho ecológico que los dípteros polinizadores del cacao una de las fuentes de ingresos económicos más importantes en la región. También se han reportado casos esporádicos de LMC en Tabasco y en Chiapas. Estos Estados no son los únicos (Figura 6, 7) en nuestro país donde se ha reportado la Lesihmaniasis, sino también Campeche, Quintana Roo, Nayarit que reportan casos de LC, Veracruz, Oaxaca que han reportado casos de LMC (Becker, I. 2005). 11 Fig. 6. Distribución geográfica de las diferentes Leishmaniasis en los Estados Unidos Mexicanos. Modificado de: http://www.panaftosa.org.br/inst/zoonosis/LEIHSMANIASIS/Inf.final_Leish_2005 Fig. 7. Casos de Leishmaniasis por entidad federativa. Estados Unidos Mexicanos 1990- 2005.Modificado de: http:// www.panaftosa.org.br/inst/zoonosis/LEIHSMANIASIS/Inf.final_Leish_2005 12 1.4 Características del parásito. En el género Leihsmania hay dos estadíos principales de desarrollo, el promastigote y el amastigote. El promastigote es alargado, mide entre 18 y 20μ, tiene su núcleo en un extremo y en el extremo contrario se localiza el blefaroblasto de donde nace un flagelo corto, éste no es completo como el de otras formas de otros géneros, por eso se llama promastigote o premastigote (Figura 8). Fig. 8. Promastigote y sus organelos más importantes. Modificado de http://www.leishmania.org/pagine/leishmaniosi_canina/eziologia-promastigote.asp El amastigote es ovalado (Figura 9), posee membrana y un gran núcleo localizado en un extremo, aunque en ocasiones también se encuentra central, tiene una estructura evidente en el frotis: que es el cinetoplasto, de este se forma el flagelo. El amastigote es inmóvil, mide aproximadamente de 6 a 7 micras (Romero CR., 1999). 13 Fig. 9. Amastigote y sus organelos más importante. Modificado de http://www.leishmania.org/pagine/leishmaniosi_canina/eziologia- amastigote.asp 1.4.1 Ciclo de vida. El ciclo de vida tiene dos estadíos (Figura 10), en el primer estadío es característico por los promastigotes procíclicos los cuales se dividen en el estómago medio de la mosca y subsecuentemente pasa a promastigote nectomonados. Estas formas son responsables de una migración interior y se transforman en promastigotes leptomonados que luego se diferencian a promastigotes metacíclicos en las glándulas salivales y estan preparados para la transmisión a un hospedero mamífero, en el momento en que la mosca se alimenta de sangre y trasmite los promastigotes (Gossage, S.M. y cols 2003), pasan al torrente sanguíneo e invaden los macrófagos y ahí es donde pasan al estadío de amastigote, se resguardan en una vacuola parasitófora donde sobreviven y se multiplican, posterormente estallan al macrófago para entrar en otras células (Naula C y cols, 2005). 14 Fig. 10. Ciclo de vida de Leishmania spp.Modificado de: http://www.answers.com/topic/leishmaniasis 1.4.2 Vacuola parasitófora. La Leishmania en el huésped mamífero es localizada en el interior de macrófagos en un compartimiento celular que es limitado por una membrana, originada del plasma membranal del macrófago, el fagosoma pasa por una remodelación vía maduración y fusión con organelos endocíticos resultando la formación de una vacuola parasitófora. El tiempo de transformación de los promastigotes a amastigotes es de 2 a 5 días dependiendo de la especie de Leishmania. La presencia de algunas moléculas en la vacuola parasitófora muestra que su membrana puede ser una mezcla de organelos formados por la unión de una prolongación de endosoma y lisosoma (Antoine, J.C. y cols 1998). La formación de la vacuola parasitófora puede ser parcialmente regulada por el parásito, por ejemplo, el lipofofosglicano LPG, el mayor componente de la 15 membrana del promastigote interviene en el primer paso de la biogénesis de la vacuola y restringe la fusión del fagosoma recien formado que contiene al promastigote con la prolongación del compartimiento endocitado. En el estadío de amastigote, la vacuola parasitófora juega un papel importante en la respuesta de como parasitar al macrófago, que es un recurso esencial de antígenos ya que estimula a las células específicas CD4+ (Antoine, J.C. y cols 1998). 1.4.3 Transmisor o vector. La familia Psychodidae (Psicósidos), a la que pertenece los géneros Phlebotomus y Lutzomya (Nuevo Mundo), son insectos frágiles conocidos como moscas de la arena (Figura. 11), pueden encontrarse durante su etapa larvaria, en ambientes húmedos, oscuros o con sombra; en algunos casos son frecuentes sobre las ventanas, pues son atraídos hacia la luz en la noche. Las hembras de estos géneros, se alimentan de la sangre de vertebrados, incluidos el hombre y otros mamíferos (Richard O.W. y Davies R.G., 1983). Después de haber succionado sangre depositan de 40 a 70 huevos en suelos húmedos, ricos en residuos orgánicos de los que se alimentan las larvas al eclosionar (Velazco C.O, 1991). Fig. 11. Mosca pilosa Phlebotomus, transmisor del promastigote de Leishmania.Modificado de http://www.anaaweb.org/leishmania.html 16 1.4.4 Efecto de la saliva de la mosca de la arena. La saliva de la mosca contiene una actividad farmacológica potente, facilita que la mosca tome sangre inadvertidamente y ayude a la transmisión de la Leishmania (Hall, L.R, 1995), ya que contiene maxadilán, un potente vasodilatador que inhibe la producción de TNF-α y disminuye la producción de óxido nítrico por el macrófago infectado (Beker, I. 2006). Se han hecho estudios inyectando en el cojinete plantar de ratón, saliva con Leishmania; lo cual en una forma dramática incrementa el número de parásitos en la lesión, comparada con otra que fue provocada sin saliva. La explicación de esta observación, es que la saliva facilita la introducción de la Leishmania en el macrófago resultando una sobrecarga de parásitos (Hall L.R y Titus R.G, 1995). 1.5 Respuesta inmune. La Leishmaniasis es provocada por uno de los parásitos, que aun se desconocen muchos de los factores que participan en la determinación del tipo de respuesta inmune en personas que padecen las distintas formas clínicas de Leishmaniasis; tal vez porque estos protozoarios son altamente adaptables y escapan a la respuestas humorales y celulares montadas por el sistema inmune del huésped, quizá la solución más simple para evadir la respuesta de anticuerpos, sea la adopción de una forma de vida intracelular. Además es uno de los parásitos que inducen los dos tipos de respuesta,la TH1 y la TH2; se cree que este tipo de respuesta se debe a las siguientes hipótesis: la primera es la secuencia de citocinas en fase temprana, donde se ha observado que la presencia 17 de IL-12 favorece la diferenciación hacia una respuesta TH1 y la segunda es los factores de virulencia y el tamaño del inóculo. Cuando la Leishmania se introduce al macrófago ocurre, primeramente uniéndose a la superficie del mismo, vía glicolípido, la segunda unión involucra a los gp63, a los receptores del complemento, con el cual hacen un complejo y se unen a CR3, CR1 y C3B en el macrófago, otras uniones posibles son los receptores “Toll like” (TLR) que estarían facilitando la infección de la célula huésped. Estando el parásito dentro del macrófago (Figura. 12) ocurre un mecanismo para eliminar posiblemente al parásito de Leishmania, por metabolitos tóxicos de oxígeno, como el anión superóxido (O-2), peróxido de hidrógeno (H2O2) y óxido nítrico (NO). El macrófago activado produce diferentes citocinas como TNFα, IL-6, IL-18, IL-12 e IFN-γ. La IL-12 es un adyuvante efectivo y un prerrequisito para la respuesta inmune de tipo TH1, ya que produce la interacción CD40 y CD40L. Esta última unión activa la célula T para producir IFN-γ, que tiene una función leishmanicida. Se han hecho estudios que han revelado que da los dos tipos de respuesta la TH1 y la TH2, para el fenotipo TH1 la IL-12 y la IL-4 para el fenotipo TH2. Sin embargo la IL-6, participa hacia la polarización de TH2, es producida por un espectro de ondas de células como fibroblastos, células endoteliales, membranales, macrófagos, células madres, línea de células tumorales y células TH2 CD4+, pero el mayor proveedor de IL-6 son las APCs. Se ha observado que eventualmente en la ausencia de cualquier citosina polarizante, la IL-6 dirige la diferenciación de las células CD4+ hacia la expresión de TH2. La IL-6 no afecta en la expresión en las APCs de las moléculas estimuladoras como la B7-1 y B7-2, las cuales tienen y han sido involucradas en la diferenciación de las células TH1 y TH2. Otra citosina que produce la respuesta TH2 es la 1L-10, pero su mecanismo no ha 18 sido esclarecido (Rincón, M. y cols, 1997, Sacks. D, Sher, A. 2002, Awasthi. A, y cols. 2004, Becker. I, 2006). La eliminación del parásito parece depender de la activación de la célula hospedera, se ha observado que la producción de citocinas activadoras de macrófago se correlaciona con la curación y las citocinas que desactivan al macrófago se correlacionan con la afección. Tal vez por esa razon se piensa que el mecanismo por el cual se activa una respuesta TH1 o TH2 es de vital importancia para dirigir la reacción inmunitaria hacia la protección y curación o susceptibilidad y patogenia (Hernández, R.J y Becker, I. 2006) Fig. 12. Micrografía, mostrando un macrófago infectado con amastigotes de Leishmania spp, tomado de una lesión en humano, contiene núcleo y el cinetoplasto sombreado, teñido con Giemsa. Modificado de: http://www.med-chem.com/Para/Prob...htm Sin embargo la forma en que la Leishmania evade la respuesta inmune para sobrevivir dentro del macrófago, es utilizando algunos mecanismos que aquí se enlistan: ▪ Suprimen la funciones necesarias del macrófago para eliminar el parásito. ▪Baja la regulación de la expresión CD80 (o B7-1, presentes en macrófagos y células dendríticas). ▪Secuestran la presentación de antígenos por la molécula MHC de clase II, poniendo a la célula T en un estado de anergia. ▪Baja la regulación del IFN-γ y la respuesta inmune TH1, y se promueve la progresión de la enfermedad. 19 ▪Baja la regulación de las células T colaboradoras CD4+, inducidas por la fosforilación p38MAPKcinasa y la expresión de iNOS2 (Awasthi, A., y cols, 2004). ▪La proteasa de superficie gp63 y LPG (lipofosfoglicano), son moléculas que evaden la respuesta inmune y contribuyen a bloquear el estallido oxidativo a través de la proteín-cinasa C y la reducción de la translocación de la membrana, el parásito también promueve la supervivencia dentro del macrófago, previniendo la apoptosis (Zambrano-Villa y cols, 2002). La saliva de la mosca también juega un papel importante ya que contribuye inhibiendo substancialmente la producción de óxido nítrico (NO), dentro del macrófago en respuesta al IFN-γ o puede disminuir la producción de NO hasta un 50%, y con esto impide la actividad leishmanicida. Datos de laboratorio han demostrado que esta secreción también inhabilita la presentación de antígeno por el macrófago a las células T específicas, el mecanismo por el cual esto ocurre no ha sido aclarado, pero una de las hipótesis es que la saliva de la mosca inhibe la presentación de antígeno a través de la regulación de MHC II (Hall L.R y Titus R.G, 1995). 1.5.1 Respuesta inmune en ratón Ante la infección experimental en ratón, provocada por una dosis baja de parásitos de Leishmania la evolución de la lesión ocurre en tres fases distintas: En la fase inicial o de silencio, los macrófagos fagocitan los promastigotes de L. major la cual inactiva la célula infectada, seguida por una proliferación del parásito; en la segunda fase hay lesiones clínicamente evidentes, coincide con un flujo de células inflamatorias, incluyendo neutrófilos, macrófagos y eosinófilos. La 20 inmunidad se inicia por infiltración de células dendríticas como células T y B, y se da la lesión. Las células dendríticas llegan activadas, toman amastigotes de L. major presentes en la lesión de la piel y migran hacia los nódulos linfáticos, donde presentan los antígenos de Leishmania a las células T nuevas. Las diferencias entre las vías de macrófagos y las de células dendríticas al interaccionar con el parásito son: primero la célula dendrítica toma al amastigote de L. major, el parásito va a una forma de vida intracelular; segundo: el macrófago eficientemente fagocita ambas formas, la capacidad fagocítica de la célula dendrítica es limitada con respecto a la eficiencia y capacidad del macrófago; tercero: en el macrófago la IL-12 induce la diferenciación de nuevas células TH1/TC1; ambos tipos de células presentan antígeno de Leishmania vía MHC I, sólo las células dendríticas estimulan las células T CD8+ específicas contra L. major (Woelbing, F. y cols, 2006). En la repuesta inmune en el ratón, se ha encontrado que la edad puede influenciar en el curso de la infección con Leishmania spp, y las hormonas tanto de machos como de hembras pueden mediar la resistencia y susceptibilidad a la infección. Los machos de las cepas BALB/c y DBA/2 son más susceptibles que las hembras a la infección sistémica con L. major; pero se ha encontrado que la hembra es resistente a la infección por L. mexicana y ha sido demostrado mediante el control de un solo gene designado Scl-2, que ha sido mapeado en el cromosoma 4 del ratón. Esta región presenta una homología con una región del brazo corto del cromosoma 9 en el brazo del humano. Tanto el gene Scl-2 en el ratón y la región del brazo corto en el humano codifican a las cinasas Jak1 y Jak2 que tienen una función en la señalización del IFN-γ e IL-4, factores importantes en la repuesta del sistema inmune, incluyendo la activación de macrófagos para el control intracelular de los parásitos. Las bases moleculares que modulan la acción de Scl-2 no es clara, aún es un problema sin resolver, como la expresión de la 21 resistencia del alelo es influenciada por la presencia o ausencia de las hormonas sexuales (Craig, W.R. y cols, 2001). 1.6 Proteínas de superficie del parásito. La proteína de superficie de la membrana de Leishmania, se subdivide en 2 grupos, el primero tiene un alto número de copias por célula y la mayoría son componentes estructurales, el segundo presenta un bajo número de copias de enzimas, transportadoresy bombas iónicas. Los componentes de la superficie del estado de promastigote son 3: 1) El lipofosfoglicano (LPG), contiene componentes estructurales unidos covalentemente, le confiere protección al parásito contra enzimas hidrolíticas en el intestino de la mosca como del fagolisosoma del macrófago, inhibe vías de transducción que disparan respuestas microbicidas y es un eficiente captador de radicales tóxicos de oxígeno. 2) El glicosilfosfatidilinositol (GPIs), se encuentra en ambos estadíos, forma el glicocalix y da protección a los amastigotes. 3) gp63 o proteasa de superficie de promastigote (PSP), es una metaloproteasa, potencia el ciclo de vida, y ayuda en la introducción del parásito en la membrana peritrófica del macrófago (Bates, P.A y Ashford, R.W. 2005). Además de que gp63 se encuentra distribuida en la membrana y en el flagelo del promastigote. En el paquete flagelar del amastigote, que es el sitio de endocitosis y exocitosis de Leishmania (Hsiao CH y cols. 2008). Existen otras proteínas que son parecidas a las glicoproteínas denominadas amastinas que se asocian con el estado de amastigote; son altamente conservadas en los residuos de treonina junto con el dominio que posiblemente puede ser ortoglicosilado; y tienen la característica de aceptar la adición de una molécula de azúcar que puede prevenir, por ejemplo, la degradación de la amastina por abundantes proteasas del fagolisosoma o mejor presentar la señal del dominio funcional o incrementar la solubilidad (Rochette, A, y cols 2005). Se ha 22 predicho que todos los miembros de los genes de la familia de amastinas poseen dominios extracelulares, con secuencias de aminoácidos altamente conservadas que están presentes en toda la Leishmania y amastinas homólogas de Tripanosoma (Rafati, S. y cols, 2006). El gene que codifica para la proteína altamente antigénica, con un peso molecular de 29.3 kD, compuesta por cuatro segmentos transmembranales, está formada principalmente por regiones de aminoácidos hidrofóbicos, presenta una señal de anclaje en el extremo amino, está ubicada en la superficie de la membrana celular del parásito, presenta varios nanómeros y decámeros distribuidos a lo largo de la secuencia, los cuales se dedujo que activan las células T con alta, mediana y baja afinidad, por lo que se identificó como una proteína altamente antigénica. Estas secuencias de aa. pueden ser procesadas por el proteosoma de las células presentadoras de antígeno y presentadas en su superficie unida a las moléculas MHC-I humanas, estos epítopes se encuentran flanqueados por regiones de aminoácidos hidrofílicos facilitando el acceso de los linfocitos T. 1.7 Desarrollo de vacunas. Históricamente la Leishmaniasis, principalmente la cutánea ha sido centro de experimentación de vacunas tentativas, probablemente por que se sabe que desde la antigüedad, individuos que han padecido infecciones en la piel por la picadura de la mosca y han sanado, lo que les ha conferido una protección para infecciones futuras, por ejemplo los beduinos y algunas sociedades tribales Kurdistanis tradicionalmente exponen los glúteos de sus bebés a picaduras de la mosca para protegerlos de lesiones faciales. Otra antigua técnica practicada en el 23 Medio Oriente ha sido el uso de una espina para transferir el material infectado de las lesiones a individuos no infectados. El uso de vacunas ha tenido muchos problemas, incluyendo el desarrollo de grandes lesiones de piel incontroladas, exacerbación de soriasis y otras enfermedades de la piel y aún inmunosupresión como lo determinado por respuesta bajas a la vacuna triple de difteria, pertusis y tétanos. Se han formulado vacunas comunes, vacunas mortales, atenuadas, sintéticas y recombinantes, vacunas con expresión de inmunógenos de bacterias y virus, vacunas de péptidos sintéticos, antígenos no proteícos, vacunas de ADN desnudos; pero todos estos intentos han tenido dificultades para dar protección, incluso algunos hasta podrían dar una respuesta de exacerbar la enfermedad. En las vacunas mortales dieron una respuesta tipo TH1, con la producción del IFN-γ y la ausencia de IL-4, pero solo tuvo una eficacia del 35 por ciento, en el caso de organismos atenuados dan una mejor protección pero tienen la desventaja en la producción a gran escala y distribución. Un antígeno que se ha utilizado desde el inicio de estos intentos es el gp63, es un receptor del parásito para el macrófago, pero al parecer da más protección contra L. amazonensis que para L. major y desafortunadamente en los modelos animales la respuesta celular T para gp63 ha sido muy variable. Otro ejemplo son los péptidos sintéticos, como el PSA-2 induce una fuerte respuesta de tipo TH1/TH2 y no da protección. En algunos casos se ha utilizado adyuvantes para potenciar la respuesta inmune, sin embargo el adyuvante más efectivo causa una fuerte inflamación. De todos los preparados antes mencionados que están en investigación no han dado un resultado favorable de protección contra la Leishmaniasis (Handman, E. y cols, 2001), por lo que en esta tesis se analizó una pequeña parte del genoma de L. major para buscar nuevas proteínas antigénicas que eventualmente puedan utilizarse en ensayos de protección contra este parásito. 24 2. JUSTIFICACIÓN. La Leihsmaniasis es considerada una de las parasitósis más importantes en el mundo, en nuestro país es una enfermedad emergente que en los últimos años se ha convertido en un problema que trasciende a nivel económico y social; no se ha encontrado vacuna alguna para su control o algún tratamiento que elimine al parásito sin ocasionar efectos secundarios. El genoma de L. major permite investigar las proteínas antigénicas, las cuales tienen secuencias de aminoácidos capaces de generar una respuesta inmune de tipo TH1. En este proyecto identificamos dos nuevas proteínas antigénicas transmembranales secretoras de L. major denominadas Saf 1 y G1-5, las cuales contienen epítopes para células T citotóxicas aumentando las posibilidades de inducir protección inmunológica contra la Leihsmaniasis. 25 3 HIPÓTESIS. El conocer completamente la secuenciación del genoma de L. major y el análisis con herramientas bioinformáticas de las mismas, nos permitirá identificar nuevas proteínas antigénicas, las cuales pueden ser utilizadas como nuevos blancos terapéuticos para la elaboración de vacunas experimentales que eliminen a la Leishmania. 26 4 OBJETIVOS. 4.1 Objetivo general: Identificar con el uso de herramientas bioinformáticas nuevas proteínas antigénicas de L. major que contengan epítopos para las células T (que induzcan una respuesta celular citotóxica de tipo TH1). Así como también realizar su clonación y caracterización molecular. 4.2 Objetivos particulares: * Analizar genes que no han sido estudiados de Leishmania major que codifiquen proteínas antigénicas transmembranales secretoras que aún no han sido identificados, por medio de análisis bioinformáticos. * Clonar los genes seleccionados de proteínas transmembranales y secretoras. * Secuenciar los fragmentos clonados. * Realizar las construcciones genéticas para producir las proteínas recombinantes en bacterias. * Obtención de la (s) proteína (s) recombinante (s). 27 5 MATERIALES Y MÉTODOS. El proceso de esta investigación bioinformática y experimental se hizo siguiendo el diagrama de flujo siguiente: 28 5.1 Análisis bioinformático. Para el análisis bioinformático se analizaron varios cientos de genes y proteínas del genoma de L. major con la finalidad de encontrar genes que codifiquen para proteínas de la membrana y secretoras, basándose en secuencias altamente antigénicas que contengan epítopespara células T, capaces de inducir una respuesta inmune citotóxica; por lo que se empleó el programa HLA Peptide Binding Predictions (Figuras 13 y 14) en el sitio http://us.expasy.org/tools/protscales.html. De las secuencias nucleotídicas seleccionadas, que pudieran codificar para este tipo de proteínas, además se analizó su hidropatía empleando el programa Kyte and Dolittle, que se encuentra en el sitio antes mencionado. Fig. 13. Gráfica de hidrofobicidad de la proteína Saf1, en los aminoácidos de 40 y 60, y (a escala de -2 y 2) se encuentra la secuencia epítope de interés. 29 Fig. 14. Gráfica de hidrofobicidad de la proteína G1-5, en la posición entre 150 y 200, y la escala de 2 y 3 se encuentra la secuencia epítope de interés. 5.2 Extracción de ADN genómico (ADNg) de L. major. El ADNg de L. major que se utilizó como templado para la amplificación de los genes se obtuvo de promastigotes de L. major, los cuales fueron inoculados con anterioridad en ratones BALB/c. Se extrajo el ADNg empleando el equipo de extracción de ADNt (QIAGEN, Cat. No. 69504), siguiendo las indicaciones del fabricante. El ADN fue eluido en un amortiguador de alta concentración de sal que es eliminada por una precipitación con isopropanol. El procedimiento de extracción se basa en optimizar el sistema de amortiguador para una lisis cuidadosa de células y de ácidos nucleicos, seguida de la unión del ADNg a una resina de intercambio aniónico en condiciones apropiadas de baja concentración de sal y de pH. El ARN, proteínas y las impurezas de bajo peso molecular son retiradas mediante un lavado salino. 30 5.3 Amplificación del ADNc con oligonucleotidos específicos por la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). La Reacción en Cadena de la Polimerasa conocida como PCR por sus siglas en inglés, es una técnica de biología molecular (Mullis K., 1987) cuyo objetivo es obtener un gran número de copias de un fragmento de ADN particular. Esta técnica se fundamenta en la propiedad natural de las ADN polimerasas para replicar hebras de ADN, y usa ciclos de varias temperaturas para separar las hebras de ADN recién formadas entre sí después de cada fase de replicación y a continuación, deja que vuelvan a unirse a polimerasas para que vuelvan a duplicarlas. Las hebras iniciales del ADNc que codifica para las proteínas antigénicas se obtuvieron siguiendo el método de PCR, empleando el equipo para la reacción (Invitrogen, Cat.No.46-0100). El método utiliza como templado el ADNg de la secuencia correspondiente. Como iniciadores para este PCR se sintetizaron los oligonucleótidos específicos de los extremos 5´ (sentido) o amino terminal y 3´ (antisentido) o carboxilo terminal; diseñados a partir de las secuencias nucleotídicas correspondientes de cada secuencia. La mezcla de reacción para la amplificación de la PCR fue: amortiguador 10X 5μl, oligonucleótido 2μl de cada uno, dNTP 0.5μl, templado 2μl, MgSO4 1μl, Taq polimerasa (Invitrogene, Cat. No. 986022T) 1μl agua estéril 36.5μl, se obtuvo un volumen final de 50μl. Se utilizó un termociclador gene Amp PCR System modelo 9700 (Appliedm Byosystem), la temperatura para la desnaturalización fue de 94oC por 4min y 94oC por 30s, los oligonucleótidos sintéticos hibridaron al ADN a 60oC por 30s, la extensión de la Taq polimerasa a 72oC por 30s y 72oC en 1min. 31 Los productos de PCR se analizaron por medio de electroforesis en gel de agarosa al 2%, teñido con bromuro de etidio, iluminados con luz UV para observar la presencia de las bandas correspondientes a los ADN amplificados. El equipo empleado para todos los análisis electroforéticos fue una cámara de electroforesis (Owl Scientific Inc; B1A), un transluminador de UV (UVP, Inc) y una cámara fotográfica acoplados al programa computacional KDSID 2.0 (Kodak Digital Science Electrophoresis Documentation and Análisis System 120). 5.4 Ligación. Los fragmentos amplificados por PCR, se ligaron al vector de clonación pcRII-TOPO (Invitrogen, Cat. No.K4510-20), el cual es altamente eficiente en la inserción directa de los productos de PCR dentro del plásmido, obteniendo de esta manera un ADN recombinante. En el último paso de la reacción de PCR (extensión final), la polimerasa tiene una actividad terminal de transferasa que agrega una cola de deoxiadenosina (dATP) a los extremos 3´ de los productos de PCR. El vector linearizado tiene residuos sobresalientes de deoxitimidina (dTTP) en el extremo 3´. Esto permite que los rellenos de PCR se liguen eficientemente con el vector. Este vector cuenta con el operón lac Z y confiere resistencia a ampicilina y kanamicina, secuencias empleadas en pasos posteriores (Figura 15). 32 Fig. 15. Vector pCRII-TOPO. Modificada de http//www.invitrogene.com/content/sfs/manuals/topota_man.pdf La reacción de ligación se llevó a cabo siguiendo las indicaciones del protocolo enunciado en el equipo empleando 1µl del producto de PCR. 5.5 Transformación y tamizaje de colonias. La transformación es el proceso por el cual las células introducen moléculas de ADN de sus alrededores, (Figura. 16). Existen diferentes métodos para la introducción de plásmidos en bacterias. El método utilizado en este trabajo fue la introducción del ADN recombinante en células químicamente competentes. E. coli DH5α-T1, por choque térmico, acondicionadas en el laboratorio (Anexo II). Para la transformación, de las células competentes se tomó un vial con 50μl de las células DH5α-T1, al cual se le adicionaron 2μl de la reacción de ligación, mezclando cuidadosamente con la yema del dedo. Se incubó en hielo por 30min; 33 posteriormente se le dió un choque térmico por 30s a 42°C (Thermolyne Type 17600) y rápidamente se colocó en hielo. En un ambiente estéril, se adicionaron 250μL del medio enriquecido SOC (Anexo II). Se incubó el vial a 37°C en agitación constante por 1hr (Heidolph Instruments, UNIMAX 1010). En una caja petri, con medio LB sólido (Anexo II) y ampicilina (Sigma, R.A.) a una concentración de 100μg/m, se le adicionó una mezcla de IPTG, Xgal (Anexo II) y agua estéril a un volumen de 50µl bajo un ambiente estéril, una vez absorbida la mezcla, se plaquearon las células transformadas. Las cajas fueron invertidas e incubadas a 37°C toda la noche. Las colonias que lograron crecer en el medio de cultivo, resistentes a ampicilina y que conservaron su coloración blanca, son posibles candidatas a tener el inserto deseado, se eligieron algunas y se inocularon en 5ml de medio líquido LB (Anexo II) y con ampicilina a una concentración de 100μg/ml. Se incubaron a 37°C en agitación constante durante toda la noche, para la purificación posterior de los plásmidos. Fig. 16. Transformación y tamizaje de colonias. Modificada de: boneslab.bio.ntnu.no/bi211_kap8.htm 34 5.6 Purificación del plásmido (por el método de miniprep). Para el aislamiento de pequeñas cantidades de ADN plasmídico a partir de bacterias (Purificación de ADN plasmídico: miniprep), se utilizó el equipo plasmid Mini (MARLIGEN BIOSCENCEINC, Cat. No.11453-024), el cual se basa en una modificación al procedimiento de lisis alcalina. El método utiliza dodecil sulfato de sodio (SDS) en presencia de NaOH para desnaturalizar las proteínas bacterianas y el ADN cromosómico y del plásmido. La mezcla se neutraliza con acetato de potasio con lo cual precipitan las proteínas y el ADN cromosómico, mientras que el ADN del plásmido se realinea y es adsorbido selectivamente en una resina de intercambio iónico bajo condiciones adecuadas de pH y baja concentración salina. El ARN, proteínas e impurezas de bajo peso molecular son eliminados por lavado pasando a través de la columna un medio salino que contiene isopropanol. Finalmente el ADN plasmídico se eluyecon un amortiguador Tris, EDTA; se concentra y desala por precipitación con isopropanol. La purificación de los plásmidos se llevó a cabo siguiendo los pasos del protocolo enunciados en el instructivo del equipo. Las colonias fueron identificadas con fragmentos amplificados del ADNp por PCR, bajo las mismas condiciones térmicas y con los oligonucleótidos específicos antes mencionados y fueron analizados por electroforesis en gel de agarosa al 2% con bromuro de etidio. 5.7 Secuenciación del fragmento clonado. Para la secuenciación de los fragmentos clonados de ADN, se siguió el método automático de secuenciación que se basa en la síntesis enzimática de ADN, terminando la cadena específicamente con 2´,3´dideoxinucleótidos (ddNTPs) como análogos de los nucleótidos trifosfato (dNTP). 35 El fragmento clonado se llevó a secuenciar a la unidad de Biología Molecular del Instituto de Fisiología Celular de la UNAM, donde se empleó un secuenciador automático ABI PRISM 310 (Applied Biosystems, Genetic Analyzer de Pekín-Elmer), acoplado a una computadora Macintosh que colectó y analizó los datos. Los iniciadores empleados para la extensión del ADN fue el oligonucleótido del promotor del plásmido M13, los cuales flaquean los fragmentos de los ADN insertados en los vectores. Las secuencias obtenidas se compararon con la reportada en la literatura, empleando un programa especializado de simulación software llamado Biology Workbench. http://worbench.sdsc.edu/ 5.8 Subclonación en un vector de expresión. Una vez verificada la secuencia de la proteína G1-5, se realizó la digestión con Eco R1 con el fin de aislar el inserto para subclonarlo en el vector de expresión pQE16 (QIAGEN Cat.No.33903). Posteriormente el inserto se purificó empleando las indicaciones del equipo (Roche Cat.No.1696505). Las características de los vectores pQE QIAexpress, entre otras, es que contiene un sitio promotor operador del fago T5 reconocido por la RNA polimerasa de E. coli y dos secuencias del operador lac las cuales incrementan la unión del represor lac y le confieren una eficiente regulación del promotor T5, múltiples sitios de clonación y codones de término y marcos de lectura abiertos para las construcciones de expresión de proteínas, un gene β-lactamasa (bla) que le confiere resistencia a ampicilina que es necesaria para la expresión de la proteína (Figura 17). 36 Fig. 17. Vector de expresión pQE16, se observa con sus sitios de inserción y las enzimas que pueden ser utilizadas (Tomado de QIAexpresessionist TM August 2002). Se utilizó la enzima de restricción BamHI (Invitrogen Cat.No. 15213-010) para linealizar el vector de expresión. La ligación de G1-5 con el vector de expresión pQE16 se hizo con la enzima T4 ADN ligasa (Invitrogen. Cat.No.15628-019), siguiendo las especificaciones que el protocolo indica. 5.9 Transformación en una célula de expresión (E. coli). El nuevo ADN plasmídico de la proteína G1-5, se introdujo en células de expresión. E. coli M15, acondicionadas en el laboratorio (Anexo II). Para la transformación de las células de expresión se tomó un vial con 50μl de las células M15, al cual se le adicionaron 2μl de la reacción de ligación, mezclando cuidadosamente con la yema del dedo. Se incubó en hielo por 30min; posteriormente se le dio un choque térmico por 30s a 42°C (Thermolyne Type 17600) y rápidamente se colocó en hielo. En un ambiente estéril, se adicionaron 250μl del medio rico SOC (Anexo II). Se incubó el vial a 37°C en agitación constante por 1hr (Incubadora con agitación: Heidolph Instruments, UNIMAX 1010). En una caja petri con medio LB sólido (Anexo II), kanamicina y ampicilina 37 (Sigma, R.A.) a una concentración de 50 y 100μg/ml respectivamente; se le adicionó una mezcla de IPTG, Xgal (Anexo II) y agua estéril a un volumen de 50ml bajo un ambiente estéril, una vez absorbida la mezcla, se plaquearon las células transformadas. Las cajas fueron invertidas e incubadas a 37°C toda la noche. Las colonias que lograron crecer en el medio de cultivo, resistentes a kanamicina, ampicilina y conservaron su coloración blanca, son posibles candidatas a tener el inserto deseado, se eligieron algunas y se inocularon en 5ml de medio LB líquido con los mismos antibióticos y a la misma concentración. Se incubaron a 37°C en agitación constante durante toda la noche, para la obtención de la proteína. 5.10 Obtención y purificación de la proteína. Del proceso de transformación se seleccionaron colonias y se cultivaron en minipreps, a 1ml de cultivo de cada colonia seleccionada se le indujo con IPTG 1mM, se incubó por 2hrs y se colectó, centrifugó, se añadieron 200μl de amortiguador B (Anexo II) y resuspendió en vórtex suavemente hasta que la solución fue translúcida. Se centrifugó el lisado por 10min a 13 000rpm, se removió el detrito celular, se transfirió el sobrenadante a un tubo nuevo. A éste sobrenadante se añadió una resina a base de níquel (Ni-NTA Agarosa QIAGEN. Cat.No.D-40724), al 50%, cada tubo se mezcló por 30min a temperatura ambiente de forma suave. Se centrifugó por 30s a 13 000rpm y se transfirieron 10μl a un tubo nuevo, para utilizarlo como control de la proteína que no se unió a la resina, y se descartó el resto del sobrenadante. Se lavó la resina 2 veces con 2500μl de amortiguador C (Anexo II), se centrifugó por 10s a 13 000rpm y se removió el sobrenadante. 38 Se eluyó la proteína contenida en la resina con 25μl de amortiguador E (Anexo II) se centrifugó 10s a 13 000rpm, se repitió dos veces más obteniendo un volumen final de 75μl. A esta elusión se añadió amortiguador de carga 2X, se desnaturalizó por 6min en el termoblock a 100oC, se fraccionó en un gel de poliacrilamida al 12% (The QIAexpressionistTM, Protocolo19, 2003). 39 6 RESULTADOS. 6.1 Análisis bioinformática. El genoma de L. major contiene aproximadamente 8 500 genes, después del análisis de varios genes por medio del análisis bioinformático se encontraron aproximadamente 15 genes del genoma de L. major, con secuencias altamente antigénicas de los cuales únicamente dos Saf1 y G1-5 fueron seleccionadas por su análisis de hidropatía y su histocompatibilidad y cuyas secuencias se usaron en el desarrollo de esta tesis. La primera secuencia encontrada se denominó Saf 1 por Cell wall Surface anchor family protein, la cual contiene 307 pb y las secuencias epítopes en GFLMLVGHFI y VMGEILFCV, que se encuentran fuera de la membrana y dan una respuesta inmune de tipo TH1 (Figura 18). Fig. 18. Secuencia de nucleótidos y aminoácidos de la secuencia Saf 1 de L. major. Se muestran las secuencias epítopes en negritas. La segunda secuencia encontrada se denominó G1-5 (Figura. 19), que contiene 781 pares de bases (pb). 40 Fig. 19. Secuencia de nucleótidos y aminoácidos de la secuencia G 1-5 de L. major. Se muestra el epítope en negritas. Esta secuencia contiene el epítope (FVLGVLLLC) que se utilizó para clonar. 6.2 Extracción de ADN genómico (ADNg). A partir de cultivos in vitro del estadío de promastigotes de L. major se extrajo el ADN total, el cual se utilizó como templado para la amplificación por PCR. Adicionalmente se extrajo ARN total de los promastigotes. 41 6.3 Oligonucleótidos utilizados. Para la realización de la amplificación se diseñaron los oligonucleótidos específicos para Saf1 y G1-5 en sentido y antisentido, respectivamente (Figura 20). Fig. 20. Secuencia de los oligonucleótidos empleados en el PCR. 6.4 Amplificación de los ADNc con oligonucleótidos específicos (PCR). La amplificación del ADNc con oligonucleótidos específicos, se verificó por electroforesis en gel de agarosa al 2%, observándose las bandascorrespondientes a la secuencia de Saf1 de aproximadamente 312pb y la de G1-5 de aproximadamente 865pb (Figura 21 y 22). 42 Fig. 21. Fragmentos obtenidos del PCR con oligonucleótidos específicos. En el carril PM: marcador de peso molecular de ADN (Invitrogen, Cat.No.15628-019), carril 2 secuencia amplificada Saf1. Fig. 22. Fragmento obtenido del PCR con oligonucleótidos específicos. En el carril PM: marcador de peso molecular de ADN, carril 1 y 2 ADNc amplificado de G1-5. 6.5 Identificación de clonas con fragmentos amplificados por PCR. Los fragmentos de ADN amplificado mediante el PCR se introdujeron para su clonación en el vector pCRII-TOPO, y luego se utilizó para la transformación de células químicamente competentes. Algunas colonias obtenidas en la transformación se seleccionaron y posteriormente se purificó el ADN plasmídico. 43 Al fin de comprobar que los plásmidos contienen los insertos esperados para las proteínas Saf1 y G1-5, se amplificaron por PCR empleando los oligonucleótidos específicos a los fragmentos deseados. En la figura 23, se muestra la electroforesis de los fragmentos amplificados en el PCR de las colonias tamizadas para Saf1, en un gel de agarosa al 2% con bromuro de etidio. Como se observa en el gel, cinco muestras contienen el fragmento deseado, pero sólo una de ellas se envió a secuenciar (carril 2). Fig. 23. Electroforesis de las clonas amplificadas por PCR de la secuencia Saf1 se puede observar que contienen el fragmento deseado y se secuenció el número 2. En la figura 24, se muestra la electroforesis de los fragmentos amplificados en el PCR de las colonias tamizadas para G1-5, en un gel de agarosa al 2% con bromuro de etidio. Como se observa en el gel, cuatro muestras contienen el fragmento deseado y en sólo dos de ellas (carriles 5 y 6) no se encuentra; por lo que la clona seleccionada para la secuenciación fue la número 3. 44 Fig. 24. Electroforesis para identificar las clonas amplificadas por PCR de la secuencia G1-5. Se puede observar que la número 3 es la que se encuentra aproximadamente entre 600pb y 700pb. 6.6 Secuenciación del fragmento clonado. Los plásmidos purificados, de las clonas seleccionadas, se utilizaron para preparar las reacciones de secuenciación. Se prepararon las reacciones, los iniciadores empleados para la extensión del ADN fueron los cebadores del promotor del plásmido M13, los cuales flanquean los fragmentos del ADN insertado en el vector (Figura 15), secuencias que delimitan a Saf1 y a G1-5. Las secuencias nucleotídicas de las clonas seleccionadas resultaron complementarias a las secuencias encontradas en el análisis bioinformático tanto para Saf1 como para G1-5 del ADNc (Figuras 25 y 26). 45 Fig. 25. Secuencia de Saf1, se observa subrayados los oligonucleótidos y en negritas las secuencias epítopes de los aminoácidos FLMLVGH y VMGFILFC. Fig. 26. Secuencia de G1-5, se observa subrayado los oligonucleótidos y en negritas las secuencias epítopes de los aminoácidos FVLGVLLLC. De acuerdo al análisis de las secuencias obtenidas a partir de los fragmentos clonados de Saf1 y G1-5, pudimos estar seguros que se trataba de los 46 segmentos deseados; por lo cual, se llevó a cabo la subclonación de estas secuencias en vectores de expresión pQE16 y transformados en células de expresión (E.coli M15). 6.7 Subclonación de G1-5. En las figuras 27 y 28, podemos observar el corte de los segmentos de Saf1 y G1-5 respectivamente, con la finalidad de aislar dichas secuencias del vector pCRII TOPO y subclonarlas en el vector de expresión pQE16. Fig. 27. Digestión del primer vector pCRII-TOPO, para extraer la secuencia Saf1. Carril 3, fraccionamiento del vector y del inserto. Fig. 28. Digestión del primer vector pCRII-TOPO, para extraer la secuencia G1-5. Carril 1, fraccionamiento del vector y del inserto. 47 La secuencia de Saf1 no pudo ser subclonada debido a que se tuvieron problemas en su conservación en glicerol a una temperatura de -70oC, después de un tiempo de preservada a esta temperatura se degradó y sólo se pudo identificar a G1-5. De G1-5 se obtuvieron 20 muestras de la transformación y se eligió sólo una para identificar a la proteína en el gel de poliacrilamida. En la figura 29 se muestra la expresión de la dihidrofolato reductasa (DHFR), que se utilizó como un control en la expresión. A esta muestra se le realizó dos ensayos, en el carril 1 sin inducir con IPTG y en el carril 2 inducida con 50μl de IPTG, donde se puede ver una mancha que corresponde al control DHFR, entre la anhidrasa carbónica y el inhibidor de tripsina. Los carriles 5,6, y 7 son las expresiones que se obtuvieron, como se puede ver tienen un grado de expresión muy baja. Fig. 29. PM marcador de peso molecular, carriles 1 y 2 son controles, el 1 es el ensayo con el control DHFR sin el inductor y en el 2 muestra al control DHFR con el inductor de IPTG mostrando la expresión de DHFR, los carriles 3,4,5,6,7 muestras de la proteína purificada. 48 Desafortunadamente todos los intentos para producir la proteína antigénica G1-5 de manera recombinante como subclona en diversos vectores como son pQE70, pQE60 y pQE16, fallaron. Basados en otros análisis de la secuencia del gene G1-5, podemos notar que esta secuencia tiende a mostrar un comportamiento extraño y que a veces es difícil de cortarse con las enzimas de restricción que se usaron, otras veces se realizaron los cortes y se obtuvieron los insertos esperados, y en posteriores ocasiones nuevamente no se pudieron cortar los plásmidos para liberar los insertos. Resultados adicionales de la secuenciación de este ADN sugieren que las secuencias pudieran adquirir estructuras secundarias. Lo cual nos explique el comportamiento errático para realizar los cortes con las enzimas de restricción y las dificultades encontradas y poder producir esta proteína G1-5 de manera recombinante en el sistema de E.coli usado, en donde la proteína control sí funcionó. En la figura 30 y siguientes son digestiones que se realizaron a clonas de G1-5, el carril 1 contiene al control DHFR, las clonas presentan dos patrones, se observan que en los pozos 5, 6, 7, 8, 13, 14 y 15, su desplazamiento es parecido al control. Los carriles 2, 4, 9, 12 y 16 se comportan de forma similar, existe un fraccionamiento de las bandas. Todas las clonas se digirieron con BamH1 y BglII, las cuales pertenecen a una misma transformación, sin embargo al hacerles doble digestión, unas fraccionan y otras no. Este ensayo se hizo para comprobar el procedimiento y en comparación con las clonas en estudio, el control DHFR sí se expresa y algunas clonas se tamizaron en varios fragmentos. 49 Fig. 30. En ésta figura se les hizo doble digestión a las clonas con BamH1 y BglII. Todas las clonas pertenecen a una misma transformación, se les hizo doble restricción unas fraccionan y otras no. En la figura 31, los carriles 2, 3, 4, 9, 10, 11 y 16 se observa que la banda es abundante, las clonas 11, 13 y 15, presentan una menor cantidad. Los números de estos pozos, correspondes a las clonas digeridas de la figura 31. 50 Fig. 31. En esta figura se observan un tamiz diferente al anterior, en los carriles 2, 3, 4, 9, 10, 12, 16 se digirieron bajo las mismas condiciones. En la figura 32 se hizo doble digestión con las enzimas BamH1 y HindIII, lo que se observa es la diferencia entre el vector y los insertos es mínima. Fig. 32. Digestión a las clonas de G1-5 con BamH1 y HindIII. M es marcador de peso molecular, en el carril 8 sólo es el vector pQE 16 y en los carriles 2, 3, 4, 9, 10,12, 15, 16 se ve los dos fragmentos de la incisión. 51 7 DISCUSIÓN. En esta tesis se utilizóla aplicación de herramientas bioinformáticas para la identificación de nuevas proteínas antigénicas del genoma de L. major, las cuales pueden ser utilizadas eventualmente como blancos terapéuticos nuevos para inducir respuesta inmune que proteja contra infecciones de Leishmania. En el análisis se identificaron alrededor de 15 secuencias de las cuales se seleccionaron dos, llamadas Saf1 y G1-5 por sus características antigénicas (Figuras 18 y 19), para ser investigadas en esta tesis. Por los análisis realizados a Saf1 y a G1-5 identificamos que estas proteínas contienen epítopes para células T, los cuales además se encuentran en regiones hidrofílicas de las moléculas, aumentando la posibilidad de interacción con el receptor de los linfocitos T. Estos epítopes de células T, son capaces de inducir una respuesta inmune celular citotóxica tipo TH1 (Figuras 13 y 14), la cual se considera que media la respuesta inmune más adecuada para eliminar a la Leishmania (Awasthi, A.y cols.2004). El método utilizado para la clonación de los genes que codifican para Saf1 y G1-5, fue a partir de ADN genómico y ARN total extraído del parásito en la etapa de promastigote, de los cuales se amplificó exclusivamente las secuencias esperadas, indicando que no hay otras secuencias relacionadas que se amplifiquen con estos oligonucleótidos en el genoma de L. major. Adicionalmente el análisis por BLAST, mostró que estas secuencias son específicas de Leishmania. Por lo que pueden utilizarse con mayor seguridad como inmunógenos, descartando la inducción de reacciones cruzadas o autoinmunidad por estas proteínas antigénicas, como ocurre en enfermedades 52 autoimnunes de diabetes mellitus tipo 1, esclerosis múltiple, encéfalomielitis autoimnune experimental, neuritis periférica (Abbas, K. A, 2000). En la extracción de ADN genómico no hubieron dificultades, se obtuvo empleando un equipo de extracción de ADN total siguiendo las indicaciones del fabricante (QIAGEN, Cat.No.69504) y se utilizó como templado para la amplificación por PCR (Figuras 21 y 22). En éste último paso hubieron dificultades en la amplificación y se hicieron varios ensayos con diferentes pares de oligonucleótidos hasta que se obtuvo la amplificación, para Saf1 y para G1-5 y el que logró amplificar es el mostrado en la figura 21 para Saf1 y 22 para G1-5. Los genes seleccionados se amplificaron con oligonucleótidos específicos por PCR y en la clonación se utilizó el vector pcRII-TOPO, porque este vector tiene residuos sobresalientes de dTTP en el extremo 3´, y permite que los rellenos de PCR se liguen eficientemente con el vector, el cual cuenta con el gen lacZ del operon LAC y confiere resistencia a ampicilina y a kanamicina. Este sistema nos permitió seleccionar las colonias que contienen el inserto diferenciándolas de las que tienen una coloración azul (Manual de instrucción Invitrogene, 2004). Éste método funcionó adecuadamente, permitiendo la clonación, amplificación y manipulación de las secuencias de ADN y realizar las construcciones genéticas para producir las proteínas recombinantes. Los fragmentos amplificados se pueden ver en la figura 23 para Saf1, en este gel no se utilizó marcador de peso molecular, las muestras de la figura pertenecen a una misma colonia transformada con el vector pcRII-TOPO. Se eligió el producto del carril 2. La amplificación de G1-5 corresponde a la figura 24, donde se obtuvieron 4 muestras, se eligió la número 3, cualquiera de ellas se aproximaba al peso entre 781 y 865pb. 53 La secuencia de Saf1 no pudo ser subclonada debido a que hubo dificultades en su conservación a una temperatura de -70° C por fallas del congelador. La célula transformada con el plásmido después de un tiempo ya no lo contenía y a partir de esta situación se continúo con G1-5. Debido a un problema durante la secuenciación de G1-5 se encontró que forma estructuras secundarias que ocultan los sitios de restricción, dificultando la expresión y producción de esta secuencia de manera recombinante. Tal vez estas formas caprichosas son las responsables de entorpecer la expresión de la proteína en los ensayos (Figura 29). Como se puede ver en las figuras de la 30 a la 32, las cuales son digestiones para verificar la presencia del inserto en el vector pQE16. En la figura 31 presenta el inserto, se muestra diferente, se observan dos manchas muy definidas y separadas, una corresponde al inserto y la otra al vector. En la figura 32 se observan las bandas de menor intensidad, y si hacemos una comparación de la figura 31 y la 32, hay una diferencia muy marcada, por ejemplo en el carril 4,5 y 11, se comportan diferentes. Tal vez seria conveniente seguir ensayando con las muestras 6 y 7 ya que parecen ser constantes en las tres figuras. Se ha hecho esta investigación para aportar un conocimiento que ayude a controlar esta parasitosis que afecta a nivel mundial, como se mencionó en el capitulo de epidemiología que existen varias zonas afectadas en nuestro país (Becker, I. 2005). Los resultados aquí expuestos es una forma de búsqueda de epítopes que solamente de la respuesta inmune de tipo TH1, que se ha investigado es la mejor respuesta en defensa a este padecimiento pero la dificultad es encontrar los antígenos apropiados. En la respuesta inmune se menciona, cómo la Leishmania es capaz de evadir esta respuesta de defensa en el humano (Zambrano-Villa y 54 cols, 2002). Cabe mencionar que se han hecho medicamentos, vacunas utilizando diversas modalidades de antígenos para dar protección en contra de este protozoario con diferentes antígenos y se ha estudiado el funcionamiento de las proteínas de membrana como son gp63, antígenos no proteícos, péptidos sintéticos, ADN desnudos, pero no han tenido resultado favorable de protección (Hadman, E. y cols, 2001). Además en la Leishmanisis, provocada en ratones BALB/c, al disminuir la IL-6, se activan ambas respuestas la TH1 y la TH2, esto se ha observado en vacunas contra la Leishmanisis administradas en ratones (Rogers, K, A. y cols, 2002). Ha habido interés en el estudio de proteínas transmembranales parecidas a las glicoproteínas, se cree que su función puede ser de transporte de iones específicos, metales, nutrientes, metabolitos que atraviesan la barrera membranal. Las amastinas de T. cruzi y de Leishmania sp tienen una organización estructural similar a las glicoproteínas, pero se caracterizan porque contienen 11 aa altamente conservados en un dominio extracelular, lo cual es único en este tipo de proteínas. (Rochette, A y cols. 2005). Cheng, J. y colaboradores en 1999, emplearon una secuencia codificante de una amastina de T. cruzi como referencia y a L. major como prueba. Buscaron en el banco de genes y en una base de datos (dbEST), hicieron un BLAST y tamizaron en una hibridación in situ de una colonia, la homología que obtuvieron fue de un 23.5% entre la secuencia de aa de L. major y la de T. cruzi, aunque sí pudieron clonar a todo el gene que codifica para la amastina. En los últimos Li, J. F y colaboradores, 2007 que han trabajado con secuencias similares a G1-5 en L. donovani, denominadas amastinas, utilizaron vectores de expresión pcDNA3.1 (+) y la línea de linfocitos T (NIH3T3), para poder producir exitosamente de manera recombinante esta proteína de la Leishmania que requiere de sistemas biológicos más complejos. 55 La metodología empleada para la búsqueda de nuevas proteínas antigénicas usadas en este trabajo sugiere que pueden aplicarse a la totalidad de los genomas para encontrar proteínas que contengan epítopes reconocidos por las células T que nos permitan seleccionar el tipo de respuesta inmune más apropiada, como en este trabajo se seleccionaron proteínas antigénicas que contienen los epítopos para células TH1 las cualesson capaces de inducir una respuesta de tipo celular citotóxica, que es la respuesta más apropiado para eliminar a la Leishmania. Seria interesante probar con otros tipos de sistemas de expresiones como células de insectos, levaduras o células de mamíferos que pueden ser requeridos para obtener una alta producción de proteínas. Otros sistemas pueden ser las células de insectos en conjunción con vectores de baculovirus que han sido usados ampliamente, estos sistemas se basan en la capacidad del baculovirus para infectar y multiplicarse en células cultivadas de insecto. El virus más usado para esta metodología es el virus Polihedrosis nuclear autographa californica (AcNPV), es un virus lítico que infecta a lepidópteros. La forma en que se hace, es tomando un gene extraño, se clona dentro del vector de transferencia y luego es transfectado a lo largo del ADN del baculovirus de doble hebra dentro de las células del insecto. Este procedimiento puede expresar una amplia variedad de proteínas incluyendo proteínas plasmáticas y proteínas secretadas (Manual QIAGEN, 2003). 56 8. CONCLUSIONES. • Se analizaron genes que no han sido estudiados de L. major por medio de técnicas bioinformática. • Se identificaron dos secuencias codificantes para estas proteínas de superficie Saf1 y G1-5. Las cuales contienen epítopes para células T que son capaces de inducir una respuesta TH1. • Se clonaron las secuencias de Saf1 y G1-5 en pcRII-TOPO. • Se secuenciaron los fragmentos clonados y se verificaron mediante un BLAST. • Se subclonó la secuencia G1-5 en el vector de expresión pQE16, pQE60 y pQE70 para tratar de expresar la secuencia G1-5 recombinante en células E. coli M15. • El método utilizado para la identificación de nuevas proteínas antigénicas de L. major, a través del análisis de las secuencias de aminoácidos disponibles en el proyecto del genoma de L. major, sí funcionó ya que nos permitió identificar a la proteína antigénica, a la cual la denominamos G1-5. • La presencia de epítopes para las células de respuesta inmune tipo TH1 en estas proteínas antigénicas, las hace interesantes para probar su capacidad protectora contra la Leishmaniasis en un modelo experimental como puede ser el ratón. • Desafortunadamente no se pudo producir las proteínas Saf1 y G1-5 de manera recombinante; el empleo de otros sistemas para hacer proteínas recombinantes podría resolver los problemas que se tuvieron y producir los antígenos encontrados de manera recombínate. 57 9 REFERENCIAS. Abbas K. A, Lichtman H. A. (2000). Cellular and molecular immunology. Ed SAUNDERS, Philadelphia, 420 Antoine, J.C., Prina, E, Lang,T, Courret, N. (1998). The biogenesis and properties of the parasitophorous vacuoles that harbour Leishmania in murine macrophages.Trends Microbiol, 7:392-401 Arias, J, Beltran, F, Desjeux. P, Bryce.W. (1996).En: Epidemiología en el control de la Leishmaniasis en las Américas, por país o territorio. Cuaderno técnico No 44. Org Panamericana de la Salud. Awasthi, A, Kumar Mathur, y Saha, B.(2004). Immune response to Leishmania infection. Indian J Med Res 119:238-258. Bates, P.A, Ashford, R.W. (2005).Old Word Leishmaniasis. En: Topley & Wilson´s: Parasitology, Microbiology and infections. (Eds) Cox FEG, Wilson GS y Mohy BWJ.Hodder Arnold.10a.Ed F.E.G.Cox. Londres, 283-311. Beers, M.H M.D y Berkow, R. M.D. (1999).Infecciones Parasitarias.Leishmaniasis. En: Manual Merck de Diagnostico y Tratamiento. Edit Harcourt, Madrid. 1259. Bell, J. (1998). The polymerase reaction. Immunol Today, 10: 351-355. Bellatin, J.A, Murray, A.S, Zhao, M, y McMaster, W.R. (2002). Leishmania mexicana: Identification of genes that are preferentially expressed in amastigotes.Exp Parasitol, 100: 44-55 Beker, I. (2006). Leishmaniasis. En: Aprendizaje de la parasitologia basado en problemas (Eds) Flisser A, Pérez-Tamayo R. ETM.México, 394-409. Berzunza,C.M,Bricaire,C,Zuloaga,R.S,Pérez,B.R, Saavedra,L.E, Pérez,M.R, Crippa,R.M, Velasco,C.O, Becker, I.(2000). Leishmania mexicana mexicana: genetic heterogeneity of mexican isolates revealed by restriction length polymorphism analysis of kinetoplast DNA. Exp Parisitol, 95:277-284. Chen J, Zhong Y, Liu Y, Yang J, (1999). Cloning and sequence analysis of amastin coding gene from Leishmania major Abdou. Chin Med J, 112(8): 698-700. Chen J, Si CW, Wong OH, Zhong Y, Liu Y, Yang J,Hong WG. (2000). Cloning and sequence analysis of a gene encoding amastin from Leishmania major. Zhongguo Ji Sheng Chong Xue Yu Ji Sheng Chong Bing Za Zhi, 18(1): 30-2. 58 Craig, W.R, Walker, W, Alexander, J. (2001). Sex-associated hormones and immunity to protozoan parasites. Clin Microbiol, 14:476-488. Gossage, S.M, Rogers, M.E, Bates, P.A. (2003).Two separate growth phases during the development of Leishmania in sand flies: implications for understanding the life cycle. Int J Parasitol 33(10): 1027-34. Cruz, I, Nieto, J, Moreno, J, Cañabate, C, Desjaux.P, Alvar, J., Leishmania/HIV co- infecction in the second decade. Indian J Med Res 123: 357-388. Gopal. S, Awadalla. S, Gaasterland. T, and Croos George, A.M. (2005). A computational investigation of kinetoplastid trans-splicing. Genome Biol, 6: 1-11 Hall, L. R., Titus, R.G. (1995). Sand fly vector saliva selectively modulates macrophage functions that inhibit killing of Leishmania major and nitric oxide production. Am Assoc Immunol, 155:3501-3506. Handman, E. (2001). Leishmaniasis: Current Status of Vaccine Development. J Clin Microbiol, 14: 229-243. Hernández, R.J. y Becker, I.2006 (2006) Linfocitos T citotóxicos CD8+ en la leishmaniasis cutánea. Salud Pública de México, 48:430-439 Herwaldt, B. L. (1999). Leishmaniasis, Seminar.Lancet, 354:1191-1198. Hsiao, C.H, Yao, C., Storlie, P., Donelsen, J.E., Wilson, M.E (2008). The major surface protease (MSP or GP63) in the intracellular amastigote stage of Leishmania chagasi. Mol Biochem Parasitol, 157:148-59. Klug, S.W., Cummings, R.M. (2000). Conceptos de genética. Prentice HALL. Madrid, 475, 476. Li JF, Chen JP, Yang ZW, Tian Y, Ma Y, Hu XS. (2007). Construction and expresión of recombinant eukaryotic expression plasmid of amastin gene of Leishmania donovani. Xi Bao Yu Fen Zi Mian Yi Xue Za Zhi, 3: 217-9. Li JF, Chen JP, Tian Y, Yang ZW, Ma Y, Hu XS. (2007). Cloning of amastin gene of Leishmania donovani isolates from Sichuan Province and its expression in eukaryotic system. Zhongguo Ji Sheng Chong Xue Yu Ji Sheng Chong Bing Za Zhi, 25(2): 124-8. 59 Manual de Instrucción, Invitrogene Life Tegnologies TOPO TA Cloning® Versión R Abril 2004. Mentink, M., Mosser, D.M. (2000). The Role of IL –10 in Promoting disease progression in Leishmania. Am Assoc Immunol, 13:1141-1147. Monroy, O.A., Hernández, M.O., Barker, C.D.(2000). Aetiology of Visceral Leishmaniasis in Mexico. Acta Trop, 75:155 – 161. Mullis K; Faloona F. (1987). Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction. Meth Enzymology, 155, 335-50. Paredes. R, Muñoz, J., Díaz. I., Domingo, P., Gargui, M., Clotet. B. (2003) Leishmania in HIV infection. J Postgrad Med 49:39-49. Pérez, M.J., Braga, C. G., Sosa, C.T., Zavala, C. J. (1996). Identificación de antígenos específicos de Leishmania mexicana con sueros humanos inmunes de La Península de Yucatán, México. Rev Biomed, 7: 197-204 Rafati, S., Hassani, N., Taslimi, Y., Movassagh, H., Rochette, A., Papadopulou, B. (2006). Amastin peptide-binding antibodies as biomarkers of active human visceral Leishmaniasis. Clin Vacc Immunol, 13: 1104-1110 Rhea, E. G., Mendez, S., Shah, J. A., Chang-you, W., Kerman, J. R., Turin, T. N., Dove D.F., Davis, H., Klansman, D. M., Cooler, R.N., Sacks, D., and Seder, R.A.(2002) Vaccination with heat- killed Leishmania antigen or recombinant Leishmania protein and Cog oligodeosy nucleotides
Compartir