Deshidratación en la interacción biomolecular - Dariel Isai Soria Cordova

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Deshidratación en la interacción biomolecular
Por: Yadira Abigail Aguilar Hernández
SÍNTESIS POR DESHIDRATACIÓN
Creación de moléculas grandes a partir de monómeros pequeños donde se libera una molécula de agua.
01
Adenosin trifosfato
Fosforilación oxidativa
Fosforilación oxidativa
Formación de agua
COMPLEJO IV
Acumulación de electrones que conducen a la reducción de Oxígeno.
La reducción de Oxígeno se da gracias a la formación de agua.
Fosforilación oxidativa
Triglicéridos
Esterificación.
03
Esterificación de triglicéridos
Formación
Liberación de agua
Se da al formar un enlace éster, por lo que se produce una liberación de moléculas de agua.
Unión de tres moléculas de ácidos grasos a una molécula de glicerol.
Reacción
Interacción de ác. grasos con grupos –OH del glicerol.
01
03
02
Esterificación de triglicérdos
Carbohidratos
Polimerización por enlace 
O-glucosídico.
02
Enlace O-Glucosídico
Glucósidos
Agregaión de carbohidratos a otras moléculas.
TIPOS
Son 4: enlace C-, S-, N- y O-. El O- es el más frecuente.
Enlace
La adición se da por medio de un enlace glucosídico.
O-Glucosídico
Mediante un grupo OH de un azúcar se forma un enlace con otro O como puente.
Ácido Desoxirribonucleico
04
Forma tipo A del ADN
Forma tipo A del DNA
Surco menor
La hidratación se interrumpe por el grupo N-2 en G y C, lo que le hace más susceptible a la deshidratación.
Medio deshidratado
Un medio deshidratado desfavorece la forma B, y su transición a A es fácil en secuencias ricas en G+C.
Grupos fosfato
Son sitios primarios de hidratación, pues se acomodan hasta 6 moléculas de agua por puentes de hidrógeno.
Forma tipo A del DNA
Posición de estos grupos
Depende del nivel de hidratación, se mueve de 1250 a 1230 cm^-1 yendo de deshidratado a muy hidratado.
Forma tipo A del DNA
Alternativa a TA
La mayoría emplea la estrategia de anhidrobiosis, pero también es perturbante por su inestabilidad en ausencia de agua.
Almacenamiento de DNA
A temperaturas ultrabajas, pero la descongelación y congelación daña el DNA.
Líquidos iónicos
Transición de DNA tipo A hacia al tipo B sin ayuda de hidratación (obtener DNA deshidratado en forma B).
Medio utilizado
Etanol
La muestra se pone en un medio deshidratado por etanol.
Líquidos iónicos
Adición de una concentración máxima de 1.5 mM.
Concentración
78% de etanol/agua, es decir, mayor concentración de etanol que agua.
Electroforesis
Geles de agarosa al 2%.
Puntos destacables
Transición a B-DNA
Contraiones
Forman puentes entre los oxígenos de los fosfatos, estabilizando electrostáticamente al DNA.
Se logró, a pesar del medio deshidratado, gracias a los IL.
A-DNA
Tiene una carga negativa densa, lo que le hace un centro para gran condensación de contraiones (Na).
01
03
02
Puntos destacables
Columna vertebral
Esta llamada “columna vertebral” se da en la forma B-DNA, y se compone de moléculas de agua.
Sin agua
No hay columna vertebral, los IL imitan esta columna, dándole estabilidad al DNA.
04
Referencias bibliográficas
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Drew, H. y Dickerson, R. (1981). Structure of a B-DNA Dodecamer – Geometry of hydration, Recuperado 5 de febrero de 2022, de: https://sci-hub.se/https://doi.org/10.1016/0022-2836(81)90009-7
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Laage, D., Elsaesser, T. y Hynes, J. (2017). Water dynamics in the Hydration shells of biomolecules, ACS Publications, Recuperado 5 de febrero de 2022, de: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.chemrev.6b00765# 
Yokoyama, M. (2020). What is dehydration synthesis?, News Medical Life Sciences, Recuperado 5 de febrero de 2022, de: https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Dehydration-Synthesis.aspx#:~:text=Dehydration%20synthesis%20is%20the%20creation,as%20carbohydrate%20polymers%20and%20triglycerides
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