clasificacion de baltimore listop

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CLASIFICACION DEBALTIMORE
Sistema de Clasificacion de Baltimore
• Grupo I: virus ADN doble cadena
• Grupo II: virus ADN simple cadena
• Grupo III: virus de ARN doble cadena 
• Grupo IV: virus ARN simple cadena de polaridad positiva
• Grupo V: virus ARN simple cadena de polaridad negativa
• Grupo VI: virus ARN simple cadena con ADN intermediario
• Grupo VII: virus ADN doble cadena con ARN intermediario
Material genetico presente en el Virion
Todos los virus tiene un paso en 
común, y es la formación de 
ARNm para ser traducido a 
proteina por la misma maquinaria 
celualr
CLASE I
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Volviendo a este esquema, vemos que las prot del tegumento estan representadas por las pelotitas verdes
que entran, se liberan en el citoplasma, y la capside desnuda asociadas a las proteínas del tegumento, van
a ser transportadas por el citoesqueleto hacia la membranna nuclear.eso que vemos en violeta, los dos
puntitos en la membrana, hace referencia al poro del nucleo, y si le hacemos un zoom (imagen derecha), el
citoplasma arriba, nucleo abajo, la capside del virus, por su tamaño no atraviesa al nucleo, entonces, la
capside va a permanecer vacia en el citoplasma deespues dee infectar el material genetico en el nucleo,
una vez que el mat genetico esta en el nucleo, puede hacer uso de la maquinaria de replicacion y
traduccion porque se trata de un ADN doble cadena. El genoma viral lo primero que va a hacer es
transcribir unas proteínas de transcripsion inmediatas que van a tener dos funciones importantes.
1 frenar la respuesta inmune dde la célula hacia la inf viral. Y por otro lado una serie de estas prot van a a 
ingresar al nucleo para participar de la replicacion del virus, y la transc de otra serie de gen
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----------------
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Una vex que se transcribio
una primera serie de genes
inmediatos, y despues en
una seguna etapa una serie
de genes que llamamos
genes tempranos que dan
lugar a prot tempranas,
estas ingresan al nucleo para
participar en la transc de
genes tarios, dando lugar a
prot tardias que son
estructurale y funcionan en
el ensamblado. Estas
también van a migrar al
nucleo, porque en el nucleo
de la célula se conforma lo
que llamamos fabrica viral
que depende de donde se
esten sintetisando las
macromoleculas asociadas a
los virus y donde se vana ir
ensamblando, puede ocurrir
en varios lugares de la
célula, en este tipo de virus ocurre en el nucleo.
Las prot se sintetizan en el
citoplasma, y estas ingresan
por el poro al nucleo celular,
en verde las prot que van a
formar las capsides y vemos
que estan asociadas a este
complejo que son proteínas
de ensamblaje o andamiaje,
que interacionan entre ellas
y forman una procapside
que sufre un proceso de
maduracion en la que se
disuelven las prot de
andamiaje y quedando la
capside vacia ya disponible
para que el material
genetico que se fue
replicando ingrese por esta
puerta por el pequeño porito forada por protenias del portal. Se inyecta y empaqueta el material genetico dentro de
la nueva capside.
Bueno aca vemos lo sucedido,
las prot tardias LATE PROTEINS,
entran al nucleo, vemos una
procapside vacia que se
ensamblo mediante las prot, las
nuevas copias deel genoma
lineal que se formo en la
segunda etapa de la replicacion,
van a ser empaquetados en
estas nuevas partículas.
Luego para salir de la célula hay 
que primero salir del nucleo al 
citoplasma. Esto ocurre primero
por una translocacion o pasaje 
del nucleo al citoplasma.
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Si miramos en mas
detalle la siguiente
etapa etapa,
habiamos dicho que
la capside no puede
pasar por el poro, la
membrana nuclear
interna (bicapa
lipidica), va a
interactuar con
proteínas de la
capside generando
una envoltura
alrededor de la
capside, pero no es la
enboltura final, sino
que le va a permitir
fusionarce y salir del
nucleo primero
trasbasando una
amembrana y luego la
otra. De esa manera
la capside y las prot
asociadas al tegumento van a ser liberadas al citoplasma, y alli van a sr sujetas a una nueva etapa de 
emvoltura en la cual van a ser incorporadas por autofagosomas, esta incomporacion, hace una especie de 
doble envoltura, estos autofagosoma ya cuentan con una seriee de proteínas virales que provienen del sist
de endomembranas y del A de golgi e incluyen prot de membranas del viruss, ya las glicoproteinas 
iniciales que vimos en las etapas de infeccion ya estan asocciadas a estas membranas entonces en el 
momento que el autofagosoma abarca la capside del virus, la envuelv y ahi le genera una doble capa por 
un lado la memb viral, y por el otro la memb del autofag que va a quedar expuesta al citoplasma, esta va a 
ser capas de fusionarce a la membrana plasmatica liberando al virus
Si lo vemos aca, vemos 
como la particula de la 
capside es capas de 
atravesar la doblemembrana
en un paso intermedio en el 
cual adquiere una 
membrana que despues se 
fusiona en la segunda se 
librea, y esta cpaside libre 
con prot del tegumento van 
a ser incorporadas al 
autofagosoma que proviene 
del golgi y que ya tiene 
incorporadas glicoprot del 
virus, entonces, este autofag
tiene esta doble membrana 
que va a fusionars a la 
membrana celular, de esta 
manera s queda solamente 
la capside envuelta de su 
propia membrana viral, asi 
la particula madura es capas
de salir de la célula.
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Video recomendado sobre la replicacion viral del herpes simplex:
https://youtu.be/fH1zS7hlW54 
https://youtu.be/fH1zS7hlW54
CLASE II
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La particula viral al
establecer contacto
con la
membranacelular,
reconoce primero de
manera poco con
baja afinidad ciertos
azucares de la
membrana cel
llevando a una
reconformacion de
prot virales sobre
todo vp1.
Que vana adoptar
una conformacion dif
y reconocer ciertos
recept especifics en
la membrana de la
célula
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-la
interaccion
con
receptores
especificos
son
procesos en
los que
intervienen
las prot
virales vp1 y
vp2 y que
llevan a una
asociacion
mas intima
entre la
membrana y
el virus.
Pero en vez
de entrar por endocitosis entre por fusion de las membrans. Aquí ocurre un mecanismo alternativo
El mecanismo alternativo, esta
desencadenado por el reconocimiento
de las prot viralesa la membrana quie
desencadena la interaccion con
proteínas mas clatrinas que van a
rodear la membrana en el sitio de
interaccion con el virus, generando una
vesicula que va a ser esttrangulada por
proteínas especificas y estas vesiculas
van a ser liberadas al citoplasma. Esta
vesicula se va a acomportar como un
endosoma.
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Estos endosomas van a sufrir una maduracion
mientras el endosoma va migrando por el
citoplasma, y en este proceso va cambiando el
ph generando una impermeabilizacion en el
endosoma, en el cual existe una interaccion de
la membrana del virus con el endosoma
generando una liberacion de la particula al
medio citoplasmatico.
Aca viene el tamaño del virus, recordar que el
herpes no podia pasar por el poro del nucleo,
pero el parvovirus es tan pequeño que la
capside puede ingresar entera, y recien dento
del nucleo va a libeerar el material genetico
Entonces, retomando,
vemos que vp1 cambia
su conformacion en
respuesta a los
primeros contactos con
azucares de la
membrana celular,
estos vp1 van a
interactuar de manera
directa con los
receptores especificos
de la membrana
generando la
dosposicion de
claterinas y formando
vesiculas que incluyan
al virus uy que vana
formar endosomas que
van a ir madurando
hasta que losendosomas tardios van
a liberar la particula
viral, esta va a ingresar
al nucleo por difusion a
través de los poros
nucleares y dentro de
este va a liberar el
material genetico.
El genoma de los 
parvovirus es simple cadena pol positiva, aca esta representado con negativa pero es positiva. Y esto va a 
sufrir una serie de pasos que van a llevar a la replicacion y a la transcripsion viral.
→ 
Este genoma viral simple hebra presenta una complementariedad de secueencia de extremos, va a ser
abierto, su estr scun va a sr relajada y adquirir una estructura lineal con estr secundaria en sus extremos, y
genera una especie de sebador, que va a ser reconocido por la maquinaria celular y para replicar una
segunda hebra de adn por la maquinaria celular. Cuando llega al extremo va a generar un mich, va a estar
como roto la hebra nueva con la molde. Y la misma maq cel va a reparar ese daño generando un adn
cercular, y ahi es donde interviene una proteina del virus en si mismo que es ns1. No es una prot
estructural, tiene un monton de funciones a lo largo del ciclo, una de ellas es de endonucleasa que va a
romper donde la maquinaria reparo, funcion de helicasa que va a abrir la estructura secundaria liberandola
y permitiendo la continuidad de la replicacion del adn viral. De la misma manera rompe el final de la otra
hebra generando el desplazamiento de las hebras, generando dos copias completas del genoma viral una
setido y otra antisentido.
Esta estructura va a proceder a generar nuevamente en ambos extreemos o uno o el otro una estruc secundaria que 
de vuelta va a generar un sebador disponible para la repli, lo va a hacer de un lado y del otro osea que va 
amplificando las hebras (como una PCR digamos) ambas hebras pueden ser replicadas en dos hebras adicionales, 
esas dos adicionales cuando se repliqun van a dar una simpple hebra y una doble hebra. Esa doble hebra puede ser 
incluida en este proceso de manera circular amplificando la replicacion. La simple hebra tiene dos destinos posibles. 
Uno que también integre el ciclo de amplificacion pero mas arriba del proceso. Pero también eesta simple hebra 
estaria disponible si se quiere para ser empaquetado en nuevas capsulas. Dependieendo el tipo de genoma puede ser
negativo o positivo. Lo otro que vale la pena menciar es que la estructura del genoma doble cadena ya estaria 
disponible para ser transcripto por la maq celular.
Video recomendado:
https://youtu.be/PzLjXy0XaJ4 
https://youtu.be/PzLjXy0XaJ4
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-ahora veamos un poco el genoma mas en
detalle del parvovirus19 que infecta humanos. 
Es un genoma muy pequeño de 11 kb es
simple hebra que tiene las estructuras
necesarias para la replicacion y que cuenta con
un open rinneng . Un marco abierto de lectura
para la prot ns1 que tiene act endonuc y
helicasa y otra orf de prot estructurales. Esto
podrian ser dos prot pero lo notable de este
virus es como fue capas a lo largo de la
evolucion servire de la maquinaria celular para
magnificar el potencial codificante del virus.
Porque en realidad el virus es procesado por
spacing alternativos en dif eisoformas dando
lugar a dos isof que pueden codificar a la prot
estuctural vp2 y una isofor que incluye uuun 5’
alternativo qu da lugar a la prot mas larga vp1.
Es decir que un pequeño genoma magnifica su
pot codificante gracias a la maquinaria de proc
port transcrip de la cel hospedera.
CLASE III
https://www.youtube.com/watch?v=h5YjB_Kpabw&feature=youtu.be 
Los virus de clase 3
poseen genomas
doblecadena. En el
corte se puede ver que
el genoma es
fragmentado, no es
una unica molécula,
sino que varias
independientes, y que
ade,as de algunas pro
virales que vana
participar en dif
etapas de la
replicacion, vale
mostrar esta proteina
la RdRp que es una
polimerasa de ARN
dependiendte de ARN,
es decirsi la pol2 en eucariotas es capas de transc arn a partir de una hebra molde de adn estas prot virales que
también existen en plantas por ej son capaces de sintetizar arn usando como molde otra molécula de arn
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https://www.youtube.com/watch?v=h5YjB_Kpabw&feature=youtu.be
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A diferencia de la interaccion del virus con la memb ceular que intervenia vp4, en estas interacciones entre
el virus y la cara int del endosoma participa la vp5 y vp8.
Bien cuando se liberaestas partículas al citoplasma va a comenzar una transcripsion del los arn que 
presentan caracteristicas que lo hacen protegerse drespecto a la maquinaria de degradacion celular, nunca
van a estar desnudos, es decir, asociados a las partículas y van a esta cambiads por ej y van a estar listos 
para la trad, la primer trad de prot va a llevar a la sintesis de prot que van a contrarestar el efecto de la 
reaccion antiviral, en este caso, antagonista del interferon. Y van a aplacar la trad de prot celulares, es 
decir tomam l vcontrol de la célula para ponerla a disposicion de la maquinaria viral para la repli viral.
También ademas de este tipo de prot efeectoras, se van a trad una serie de prot que se van a asociar a las
nuevas hebras de adn que se van transc para llevarla a una region citoplasmat que lo llamamos viroplasma
y actua como una fabrica de nuevas part virales.este arn en particular va a ser de polaridad positiva, 
recordemo que son virus de arn doble cadena. Y estos complejos riboproteicos donde aparecen prot y arn 
van a ensamblars con nueva proteínas provenientes de la trad, prot estruc y recien cuando esten dentro de
la procapside va a trasncrobirse la segunda hebra de arn para formar
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El genoma de este virus cuenta con 11 fragmentos, recordar que al principio se notaba que el genoma
estaba fragmentado .a pesar de ser
11 fragmentos no se codifican
solamente 11 proteínas sino que
uno de estos puede dar lugar a 2 y
mas notablemente ver que aca dice
site… se refiere a dttos sitios para
el comienzo de la trad. El ribosoma
va a leer el arnm y va a encontrar
lugares alternativos para el inicio,
dando lugar a diferentes
pproteinas. Como en el caso de
bp7 1 y 2 . es decir que por otro
mecanismo en este caso por modulacion de la trad se amplifica el potencial codificante del compacto
genoma viral.
-entonces, el virus entra, comienza la transc y la tranc
da lugar a dos eventos, la trad de todas las prot
nesesarias que van a venir al viroplasma y a las nuevas
copias del genoma. A dif de los virus que habiamos analizado
clasi 1 y 2 en este caso el genoma son ARN, entonces la
replicacion viral tiene que ver con la trasncripcion no con la
replicacion.
Lamoleculas nuevas de ARN asociadas a prot en complejos
ribonucleoproteicos se van a asociar a las prot de la capside
formarn do las nuevas partículas, dentro de estas es donde
se va a sentetizar las nuevas hebras de arns 
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Comparamos el tema de las fabricas virales:
hablamos ya de las fabricas virales
nucleares como las del herpes, pero hay
otros virus que se ensamblan en el nucleo.
También estan los que tienen lugar en el
citoplasma, por eso lo llamamos
viroplassma. Pero también puede pasar
que suceda en otras organellas. Como los
plasmidos que son organellas de las plantas
por ejemplo.
 Entonces, este viroplasma como lo vemos 
aquí va a dar lugar a estas nuevas partículas
que se asocian con recept especificos al sist
endo menmbrana de las células
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 Entonces, este
viroplasma
como lo vemos
aquí va a dar
lugar a estas
nuevas
partículas que
se asocian con
recept
especificos al
sist endo
menmbrana de
las células
ademas en el
rer van a
traducirse prot
virales que van
a sufris mod
post trad y van
a sufrir una
maduracion las
partículas hasta
que finalmente
van a poder
salir delsist
endomenb y
salir de la célula
por la lisis células o por exositocis.
Resumidamente, esto es un
revio. A partir de la absorcion de
las partículas viralesa la memb
celular por reconocimiento de
algunas prot virales en
particular, se libera la primera
capa de la capside cuando entra
en contacto con el endosoma se
libera al citoplams y comienza
produccion de arm que va a
llegar a la trad de prot
estructurales y no y también que
van a llevar al comienzo del
ensamblado de las nuevas part
virales. Pero ademas,los nuevos
segmentos de arn simple hebra
ingresan al viroplasma y se
asocian a las otras prot para
comenzar el ensamblaje. Una
vez que el arn simple hebra esta dentro de las partículas inmadiura el arn es transcripto por estas rna pol
dep de arn en un arn doble hebra, y despues estas partículas uinmaduras sufren una maduracion a través
del sist de endomemb hasta que esten activas y maduras para la liberacion de la célula.
CLASE IV 
https://www.youtube.com/watch?v=unO79HTcc48&feature=youtu.be
Clase IV Virus
de ssRNA (+)
(ARN
monocatenario
positivo): Como
el genoma viral
ssRNA (+) tiene
la misma
polaridad que el
mRNA no
necesita ninguna
conversión para
generar las
proteínas virales.
Se generan
ssRNA (-) que regulan la expresión génica y que servirán de molde para replicar el ssRNA (+). Hay dos tipos de virus en
esta clase, los IVa y los IVb. 
Ej: Poliovirus, Coronavirus.
En est caso abordamo un ej de los virus de clase 4 que tienen un genoma de arn simple hebra pol positiva
y que presisan para la replicacion pasar por un intermediario de arn simple de pol negativa para hacer
multiples copias. Por ejemplo usamos el coronavirus sarccov2. El nombre es por la forma de corona que le
da las proteínas superficiales spike. La forma en la que esta esquematixado el genoma viral es importante
ya vamos a ver porque lo representan asi asociado de alguna manera a la emvoltura del virus
----------------------------------------
→ como siempre nos basamos en un
esquema amplio del ciclo completo y
vamos a ir haciendo zoom .
Tomo comienza por el reconocimiento
del virus aen la memb celular por
interacion de las prot spike con el
receptor celular ace 2 y esto induce la
endocitosis del virus al citoplasma cel
https://www.youtube.com/watch?v=unO79HTcc48&feature=youtu.be
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El cambio de ph incuce una invaginacion
que incluye al virus y esto genera la
formación de vesiculas que no nesecitan la
intervencion de prot adicionales como las
clatrinas. Las vesiculas se forman ppor
interaccion y cambio de ph y estas van a
adquirir la forma de endosomas que van a
madurar hasta liberar el contenido viral en
el citoplasma. Esta liberacion puede darse
por permeabilizacion, lisis o fusion de los
endosomas. En el caso de los coronavirus
funciona por fusion.
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-aca vemos como el contacto del virus con la cel esta
mediada por la interacicion de las proteínas en este caso
las spike con las ase 2 se induce esta invaginacion, la
formación de vesiculas que pueden terminar como
endosomas que van a madurar de temprano a tardio. 
Y aca vemos como se representa la fusion de la
envoltura del virus , esta se fusiona con la membrana del
endosoma y se libera el cont de la part viral al
citoplasma
Vemos como se libera el genoma viral,, y como
digimos es un virus de genoma arn polaridad
positiva eso significa que el arn puese ser
conocido por la maquinaria celular como un arnm.
Por lo tanto todo el ciclo de replicacion viral ocurre
en el citoplasma y no necesita pasar por el nucleo.
Entonces lo que necesita es traducir las prot
virales por un lado y generar mas copias de su
propio genoma
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→como sucede la replicacion: el genoma es
un arn polaridad positiva dispuesto para la
traduccion, y las prot virales sumados al
genoma viral va a ser alojado en unas
vesiculas membranosas asociadas al
citoplasma que se formam por dobleces deel
sist de endomemb del reticulo endoplas. Y en
esa cabidades la rna polimerasa propia del
virus es capas de sintetizar la hebra negativa
generando una especie de doble hebar qu va
a servir como molde de nuevos genomas
virales de pol positivos que vana sr liberados
nuevamente al citoplasma.
Cuando les dije que prestaramos atencion al
esquema del virus en la primera diado. Se
acuerdan que antes hablabamos de la sintesis
de una procapside que estaba vacia
disponible para introducir el genoma viral
para pla maduracion de las partículas virales.
En este caso no es asi, la capside se forma en
funcion de la disposicion al genoma como andamio se utiliza el genoma para construir la capside. Por eso este tipo de
representacion donde vemos que el genoma esta com asociado ala capside.
→ mirando en detalle el
genoma viral vemos que no lo
dice aca es un genoma de 30
kb de long y despues hay una
serie de arn subgnomico que
son iguales al genomico pero
mas cortos. La abundancia
relativa de estos arn
subgenomico en la célula es
variable dependiendo cual
miremos.
El por codificante de este
genoma esta aumentado o
potenciado por el lift claning
que es un mecanismo que
vimos cjunto al splicing alt.
Que en este caso a partir de
un mismo arnpor
reconocimiento del primer codon de la trad puede dar lugar a distintas proteínas n9v. Y vamos a aprovecar el caso del
sarcov2 para abordar un tema que es el rigoribosomal , el cambio del marco de lec del ribosoma que es otro 
mecanismo mediante el cual se amplifica el pot codificante de un genoma compacto.
Viendo en detalle hay una serie de prot codificadas por el ORF 1a y si prestamos atencion hay un solapamiento con el 
orf1b. Y si prestamos atencion de la prot 110 pasa a la 11 y un poquito a la izq comienza a traducir la rna pol rna 
dependieente esencial para el ciclo viral. Como es posisible que codifique es posible que codifique la rns11 o la rnr . 
Sig diapo
--------------------------------------
Como es posisible que codifique es posible 
que codifique la rns11 o la rnr. Esto sucede 
por lo que se conoce rieg ribosolam qsy,,. 
Esto es un evento que tiene lugar por la est
secundaria que puede aduptar el arn 
simple hebra, recordar que es una 
macromolecula que va a adoptar una estr 
secundaria y interactuar con el genoma va 
a interactuar entre dist regiones del 
genoma y cuando se encuentran estas 
situaciones de apariamuento bueno y 
asociacion estable, cuando el 
ribosomavenga a traducirlo , lo que puedee
generar una estructura estable, puede 
frenar el ribosoma, lo que da como efecto 
es que vuelva para atrás y saltee un 
nucleotido cambiando el marco de lectura. 
Si no se lo salte al finalizas el n1a o prrot n 
11. o saltear cambiar el marco de lectura 
con el mismo arn se cambia el marco se 
continua la trad pero leyendo otra cosa, es 
decir hay dos prot codificada de manera 
solapada en esta region, que lo qu paso es 
l fue saltear un nucleotido y leer en este 
caso en el orf 2 la rnapol rna dependiente.
- entonces, todas estas etapas de trad se dan
en el citoplasma, como digimos también la
transc para dar lugar a nuevas copias del
genoma vural, ambas cosa stransc y trad
ocurren en el citoplasma, muy asociado al sist
endomemb. Si miramos aca los ARN sub
genomicos dan lugar a una serie de prot que
van a estar modificadas por el a de golgi y
incluuidas en la membrana que van a ser parte
de la envoltura del virus. Lo que sucede es que
los genomas que fueron generados pa partir
de la transc con un arn de pol neg
intermediarios, van a servir como plataforma
para qu la membrana genere la envoltura con
las proteínas mismas del virus incluidas.
Entonces, la particula va a ir madurando a
traves del sist de endomembrana hasta que el
virus envuelto en una membrana va a poder
migrar a través del citoplasma y permitir la
exocitosis delvirus
----------------------------------
https://youtu.be/W1k1sUoLPlA
CLASE V
https://www.youtube.com/watch?v=QejQUSXGzWs&feature=youtu.be
Clase V Virus de ssRNA (-) (ARN monocatenario negativo): El virus porta una enzima denominada
transcriptasa/replicasa (RNA polimerasa RNA dependiente) lo que permite la síntesis de mRNA (ssRNA +) y posterior
traducción a proteínas virales. Entre estas proteínas se encuentra la transcriptasa/replicasa que, a partir del ssRNA
(+), genera el ssRNA (-) que se ensambla en los viriones de la progenie. 
Ej: Rabdovirus, Influenza. 
-ciclo de rep de
un virus clase 5
genoma de arn
sc pol negativa.
Este tipo de
virus cuenta con
una prot viral
presente en el
viron que actua
transcliptasa y
replicasa. Es
una rnapol rna
dependiente
que va a transc
la hebra de pol
positiva que puede ser considerada por la maq celular como arnm. Ademas en ese pasaje va a actuar
como replicasa replicando el genoma viral. Aca vemos el virus de la influenza. En el esquema podemos ver
como tenemos las prot como la hemoglutinina que esta en la parte externa y participa con el
reconocimiento de la memb cel del hospedero, y vemos como el genoma de arn esta segmentado, no es
una unica molécula y esta asociada a proteínas
-la entrada del virus a
la célula esta dada por
reconocimiento de la
prot ha y otras a
receptores de la memb
cel y se da por
endocitosis por la
formación de vesiculas
que llevan a la
formación de
endosoma
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-en particular la endositocis se hace desencadenando
la union de clatrinas osea es una formación de
vesiculas mediadas por clatrinas, como ya vimos se
liberan cuando la vesicula ya esta formada en el
citoplasma dejandola desnuda, que son las que son
incorporadas al endosoma
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-una vez que el endosoma madura, el virus puede fusionarse a la membrana del endosoma liberando el
contenido viral. El
genoma viral que no
esta desnudo, sino
que esta asociado a
prot no se queda en el
citoplasma, sino que
las moleculas son
importadas al nucleo
donde se va a dar
tanto la transc como la
replic.
Como digimos el
complejo de la RDR
formado aca (zoom) por
multiples prot, estan
asociadas ya a cada una
de las moleculas que
forman oparte del
genoma viral. Este
complejo funciona tanto
como replicasa y
transcriptasa. En cuanto
a la transcripsion, la
hebra negativa va a ser
copiada en una positiva
que puede actuar como
arn m. pero hay un
detalle, el procesamiento
de los arn para sr
reconocido por la
maquinaria traduccional,
cuando es llevado por la
misma maquinaria de la
cel hospedera va a
permitir agregarle las
señales que lleven al
reconocimiento por los
ribosomas como es la
adiccion del cap y la cola poly AA, al generar moleculas de arn pol positiva transcripta por la maquinaria
viral, esto no ocurre de la manera canonica de una cel eucariota, entonce tiene que suceder una serie de
eventos originales que llevan a cabo los virus para agregarle el cap y la cola poli AA para que san
reconocidos por los ribosomas como si fueran arn m de la célula y asi traducir.
------------------
Por un lado
para agregarle
el cap a los arn
virales, aca
vemos a la
hebra molde
en color verde,
lo que hace el
complejo
polimerasa es
secuestrar arn
nucleares que
ya ah sido
capeados y
robarle el cap,
osea hay una
etapa de corte
y ligacion al
extremo 5’ del
arn naciente
que genera un
hibrido (en
verde el arn
viral donde el extremo5’ pertenece a un arn pertenece a un arn m celular el cual (arn de la celula) va a ir a
degradacion sin el cap, y de esta manera el arn viral mensajero ya cuenta con un cap que lo va a proteger
sino que lo va a dotar de las señales para migrar al ribosoma. Esto no explica el porque tiene la cola poli a
que no la roba. Sino que lleva adeelante un proceso polyadin en el cual los transcriptos finalezan, la hebra
negativa finaliza con una U y la transcriptasa va y viene agrega una A copiando la U, vuelve y asi hasta
generar una cola ppoly A,
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Entonces, si miramos el genoma del virus d la influenza vemos que es un genoma mas segmentado como
digimos, cuyo potencial
ccodificante esta
amplificado por splicing
alternativo dando lugar a
dtas prot a partir de varios
de estos segmentos, incluso
extendiendo las zonas por
ej en el segmento 7 la
region codificante m1 esta
practicamente no solapada
com m², es decir m1 y m²
pueden ser muy diferente
porque no es que son
combinaciones de la misma
region codificante, sino que salteo, m1 es practicamente un iintron de m².tambien el proc alternativo no
solo incluye este caso también en euc el plicing alternativo. Sino la iniciacion alternativa de la iniciacion. El
procesamiento hace que se pueda retirar el codo de iniciacion y se inicie mas atrás, si eso sucede va a
depender del nuevo marco de lectura la proteina que se va a codificar. Y ademas como si fuera poco el
viruz de influenza también sufre de ribosomal frish en el segmento 3 dando lugar a dos prot dif a partir del
mismo arn inicial.
.-------------------------------------
Entonces como digimos, el genoma viral fue inyectado al nucleo y alli ocurre la trransc y los arn con todas
las caracteristica de un
arnm celular con cap,
cola polia va a ser
exportado del nucleo al
citoplasma para ser
sujjeto a la traduccion.
La bateria de prot
virales van a incluir
prot de memb
estructurales que vana
permanecer en el
citoplasma y una serie
de prot asociadas al
genoma del virus
incluidas la ppol que
van a volver a ser
incorporadas al nucleo
para asociarce a los
nuevos genomas que
resulten de la
replicacion
La replicacion ocurre usando el mismo
complejo polimerasa que acabamos de ver
para la transc, simplemente en lugar de
pensar la copia de la hebra negativa a la
positiva, ahora la pensamos como un nuevo
molde para copiar reiteradas veces esta
molécula en nuevos genomas de arn de
simplecadena polaridad negativa. Es decir
este paso intermedio puede ir al citoplasma
a traducirse o ser el molde para la copia de
nuevos genomas viral. El genoma viral va a
estar asociado a esas proteínas que
ingresaron al nucleo, que fueron traducidas
en el citoplasma e ingresaron al nucleo
como el complejo de la rna pol y otras prot
formando complejos ribonucleoprot que
vana proteger al adn d ella degradacion
celular van a ser exportados del nucleo al
citoplasma 
Entonces, estos
genoma (el chotito
azul que sale para
arriba) protegidos
llegan al citopplasma
se ditigen hacia la
memb celular, y el
ensamblado del
nuevo virion ocurre
en la membrana
celular
---------------------------------------------
 
https://youtu.be/tB5FQZi4HKY
CLASE VI
youtube.com/watch?v=4_l9kJMEfnM&feature=youtu.be 
Clase VI Virus de ssRNA-RT (ARN monocatenario con retrotranscriptasa): El virus aporta una retrotranscriptasa
inversa (o transcriptasa reversa) que convierte el ssRNA (+) en dsDNA, que se integra al genoma celular y del que
luego se generan tanto el RNAm de las proteínas virales como el ssRNA (+) genómico que junto a la retrotranscriptasa
conformarán las nuevas partículas virales. 
Ej: Retrovirus como el VIH
Son virus que tiene un genoma de arn simplecadena, pero a dif de los otros estos precisan de
una molécula intermediaria de adn doble cadena para poder replicarse, se logra mediante una
transcriptasa reversa codificada por el genoma viral. Como ejemplo abordamos el ciclo de
infeccion del virus de inmunodeficiencia humana que puede encontrarse como virion en dos
estadios uno inmaduro que como cuando sale de la célula infectada como nueva particula
viral, y a partir de un proceso proteolitico y de reorganizacion de su macromolecula va a
adquirir un perfil maduroque es infeccioso y capas de infectar nuevas celulas
-----------------------------------------
------------------------------------------------------
- una vez que se libera el contenido viral en el citoplasma, se va a ir desnudadno el genoma viral hasta que
comienza una
etapa de
retrotranscripsion,
la transcriptasa
reversa viral
preexiste en el
virion y es capas
de transf (aca
vemos la hebra en
rojo, seria el
genoma viral
simple hbra arn
pol posit), que va
a ser
transformada en
una hebra
representada en
negro de adn
copia. Despues se
elimina en un
segundo paso la hebra de arn por accion de una rnasa H, estas degradan expesificamente el arn asociado
a una hebra de adn, (es doble hebra entre adn y arn), especificamente la rnasa cliba este tipo de
moleculas, entonces queda libre el adn copia simple hebra que va a ser transf en un adn doble hebra, estr
provirus va a ingresar al nucleo…
Ingresa al nucleo ya de manera desnuda dejando afueera en el citoplasma las prot de la capside. Y este provirus, lo
que hace es integrarse al genoma humano (por eso dice provirus integrado) gracias a la accion de enzimas integrasa,
una vez integrado al genoma humano, que lo hace de manera covalente y azarosa, no se inserta en sitios especificos,
sino que lo hace en diferentes zonas. El virus puede entrar en una etapa de latencia, sin embargo en algún momento
en la vida del hospedero, el virus comienza a transcrib utilizzando completamente la maquina del hospedero,
entonces vanza el ciclo de replicacion.
La transcripsion que es una normal con toda la maq humana, va a dar lugar a una variedad un conjunto de arn m que 
han sufrido un splicing alt que codifican para toda la maquinaria proteica del virus
Si miramos el genoma en detalle, nos
encontramos de que en realida es un
genoma que sufre una gran variedad
de splicing alt amplificando la
capacidad codificante de un genoma
hipercompacto y dando lugar a prot
totalmente dif a partir de un pre RNA,
ademas del splicing alt que es el
evento de diversidad genetica mas
importante en este virus, nos
encontramos con eventos de
ribosomal frameshift tambin como
podemos ver aca, estan estos dos
genes solapados, y el cambio del
marco de lectura del ribosoma hace
que se tradusca un polipeptido mas
corto o mas largo, en particular este
mensajero va a necesitar luego de ser
traducido de proteasas especificas que
liven y liberen las prot independientes.
De todo esto llamamos la atencion a las proteínas red que van a volver al nucleo 
Las proteínas red que van a volver al nucleo, y juegan un rol fundamental , porque si pensamos el splicing
alt que es un proceso que ourre en el nucleo. Si no existienran las red todo el arn que se valla
transcribiendo va a ser spliciado, procesado en los arnm que va a conducir a proteina. Sin embargo, esto
no nos daria lugar a generar arn genomico del virus hiv, entonces la proteina red se asocia a los pre arn
antes de ser spliciados y guiarlos a esta translocacion del nucleo al citoplasma sin ser sujetos a splicing.
Entonces estos arn genomicos a dif de los spliciados que vana ser traducidos, que vana ser traducidos,
pueden ser ensamblados a nuevos viriones. Entonces estos arn genomicos van a estar asociados a
proteínas del complejo de transcriptasa reversa y a prot asociadas al genoma y de esta manera protegida
van a migrar hasta la membrana celular donde va a ocurrir el ensamblado del nuuevo virion que va a salir
de la cel hospedera al medio por gemacion.
La nueva particula que acaba de salir es al principio inadura,y esta particula no es infecciosa tal como es, 
sino que tiene que sufrir una serie de eventos proteoliticos que despegan la capside de la envoltura y dar 
prot funcionales nesesarias para el reconocimiento de los receptores cel. Es decir ue recien cuando el 
virion maduro es infeccioso para atacar nuevas células del hospedero
-por eso este pasaje
que deciamos de
maduro a inmaduro
que se da de manera
extra celular despues
de la gemacion
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-si miramos el genoma en detalle, nos encontramos de que en realida es un genoma que sufre una gran
variedad de splicing alt amplificando la capacidad codificante de un genoma hipercompacto y dando lugar
a prot totalmente dif a partir de un pre RNA, ademas del splicing alt que es el evento de diversidad
genetica mas importante en
este virus, nos
encontramos con eventos
de ribosomal frameshift
tambin como podemos ver
aca, estan estos dos genes
solapados, y el cambio del
marco de lectura del
ribosoma hace que se
tradusca un polipeptido
mas corto o mas largo, en
particular este mensajero
va a necesitar luego de ser
traducido de proteasas
especificas que liven y
liberen las prot
independientes.
De todo esto llamamos la
atencion a las proteínas red
que van a volver al nucleo.
Las proteínas red 
que van a volver 
al nucleo, y 
juegan un rol 
fundamental , 
porque si 
pensamos el 
splicing alt que es
un proceso que 
ourre en el 
nucleo. Si no 
existienran las 
red todo el arn 
que se valla 
transcribiendo va 
a ser spliciado, 
procesado en los 
arnm que va a 
conducir a 
proteina. Sin 
embargo, esto no 
nos daria lugar a 
generar arn 
genomico del 
virus hiv, 
entonces la 
proteina red se 
asocia a los pre 
arn antes de ser 
spliciados y 
guiarlos a esta 
translocacion del nucleo al citoplasma sin ser sujetos a splicing. Entonces estos arn genomicos a dif de los 
spliciados que vana ser traducidos, que vana ser traducidos, pueden ser ensamblados a nuevos viriones. 
Entonces estos arn genomicos van a estar asociados a proteínas del complejo de transcriptasa reversa y a
prot asociadas al genoma y de esta manera protegida van a migrar hasta la membrana celular donde va a 
ocurrir el ensamblado del nuuevo virion que va a salir de la cel hospedera al medio por gemacion.
La nueva particula que acaba de salir es al principio inadura,y esta particula no es infecciosa tal como es, 
sino que tiene que sufrir 
una serie de eventos 
proteoliticos que 
despegan la capside de 
la envoltura y dar prot 
funcionales nesesarias 
para el reconocimiento 
de los receptores cel. Es 
decir ue recien cuando el
virion maduro es 
infeccioso para atacar 
nuevas células del 
hospedero
-por eso este pasaje que 
deciamos de maduro a 
inmaduro que se da de 
manera extra celular 
despues de la gemacion
https://youtu.be/8sipX86JfUw 
https://youtu.be/8sipX86JfUw
CLASE VII
https://www.youtube.com/watch?v=h2qUKP0G8WQ&feature=youtu.be
Clase VII Virus de dsDNA (ADN bicatenario): Estos virus liberan el genoma viral en el interior de la célula. La
peculiaridad de estos virus es que forman un microcromosoma circular que se aloja en el núcleo, a partir del cual se
transcriben los mRNA de las proteínas virales, entre ellas la enzima RT. La forma de actuar es similar a los de la clase
VI. 
Ej: Hepadnavirus (hepatitis B, genoma parcialmente circular)
Se caracterizan por tener un genoma doble hebra de adn que necesitan de un intermediario de arn y de
una transcriptasa reversa .
Podemos ver como el genoma de adn bicatenarrio cuenta ademas con una molécula de adn3 genomico es
apartir del cual se va a retrotranscribir hasta genoma viral
El virus circulante de la hepatitis B va a ser
reconocido por el hepitelio del higado, va a
reconocer receptores especificos y ser
incorporados al citoplasma por endositocis
-La endocirosis son mediadas por proteínas
diferentes a la clatrinas denominadas cadeolinas?.
Es decir la interaccion del virus y la membrana
plasma desencadena el reclutamiento de prot
citoplasma que vana aguiar la formación de
vesiculas que vana migrar por el citoplasma, y se
fusionadas a endosomas, el endosoma va a
madurar, cambiar su ph, finalmente el materia lviral
va a ser liberado al citoplasma por fusion con la
membrada del endosoma-----------------------------------------------------------------------------------
Una vez que las partículas virales, el core del virus sea liberado en el citoplasma, va a ingresar al nucleo a
través de los poros nucleares
Asi es como ingresa al
nucleo a través de los poros
nucleares, los virus de dole
cadena de adn que
necesitan de una RT como
el virus de la hepatitis.
Comparando con otros
casos, hemos vismo como
virus de genoma de arn son
capaces de ingresar
directamete su material
genetico, aquellos virus arn
que presicsan una etapa
uclear, otros incorporan
directamente al nucleo su
material genetico. Los
parvoviros habiamos visto
que son tan pequeños que
y son capaces de pasar a través del porros y los virus como el herpes que no pasan el poro y inyectan su
mat genetico en el nucleo dejando la capside en el citoplasma. Estos virus son capaces de entrar a través
del poro y asi liberar su material genetico
-------------------
Este material
genetico liberado
en el nucleo es adn
doble hebra, que lo
que va a hacer en
la célula uusando
la maq celular va a
ser reparado en
una molécula de
adn circular que es
una especie de
microcromosoma
que eventualmente
puede ser
integrado al
genoma, pero sino
es capas de seer
reconocido por la
maq transcripcional
celular para dar
lugar a los arn
mens j para ser exportados al citoplasma para la traduccion.
Si miramos el genoma viral, podemos
reconocer diferentes promotores
dentro del microcromosoma que van
a ser reconocidos por la maquinaria
trancs y la poll 2 para transcribir de
manera inependientemente ciertos
rna que vana sr procesados también
por splicing alt. Como se trata de la
maquinaria celular, van a ser
capeados y adenilados de manera
normal para ser exportados del
nucleo al citoplasma y reconocidos
por los ribosomas estos arn tambieen
pueden ser loky scanning dando lugar
a distintas prot a partir de pre rna
mensajeros, y todas esta serie de
arnm procesados van a ser
exportados del nucleo al citoplasma
incluyendo los arn pregenomico (PG)
que van a estar despues incluidos en
la particula viral
------------------------------------------------------------
Cuando estos
transcriptos salen del
nucleo al citoplasma,
van a ser
incorporadoooss y
empaquetados en
nuevas partículas
inmaduras que una vez
que estan dentro de las
partículas, las prot
traducidas vana
interactuar con el arn
pregenomico que va a
ser empaquetado, uy
una vez empaquetado,
ese adn pregenomico va
a sufris
retrotranscripcion dando
lugar al genoma viral de
adn, esa particula
inmadura puede tener
dos destinos posibles,
una es reciclarse volver
a entrar al nucleo y
amplificar este ciclo
dando multiples
partículas virales
maduras o poder tomar
la via de abandono de la
célula hospedera.
La particula
inmadura,
desnuda va a
ingresar al sist
de
endomembrans
del a de golgi y
al reticulo
endoplasma,
dotandoce aquí
de la envoltura
y de la vesicula
que va a migrar
por el
citoplasma y
fusionarce a la
membrana
celular y ser
expulsado de la
célula y llegar a
una célula diferente.