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UNIVERSIDAD DE GUAYAQUIL FACULTAD DE CIENCIAS MÉDICAS CARRERA DE MEDICINA CÁTEDRA DE BIOQUÍMICA I TAREA AUTÓNOMA #2 TEMA OXIDACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS (DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS PROVENIENTES DE APORTES EXÓGENOS Y DEL RECAMBIO PROTEICO DENTRO DEL ORGANISMO) PRODUCCIÓN DE UREA BIOSINTESIS DE AMINOÁCIDOS PERTENECIENTE A: SCARLET VIVIANA LAVID SANDOVAL CATEDRÁTICO ING. MARIELA VERA SALTOS, PHD MED-S-CO-3-4 2022-2023 CII CONTENIDO OXIDACIÓN DE AMINOÁCIDOS ................................................................................ 3 REACCIONES GENERALES DE LOS AMINOÁCIDOS ......................................... 4 DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS ............................................................................ 6 DEGRADACIÓN Y ABSORCIÓN DIGESTIVA DE LAS PROTEÍNAS ............. 6 DIGESTIÓN GÁSTRICA......................................................................................... 7 DIGESTIÓN INTESTINAL ..................................................................................... 8 ABSORCIÓN DIGESTIVA DE AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS .......................... 9 DEGRADACIÓN LISOSOMAL ............................................................................ 10 RECAMBIO INTERÓRGANO DE AMINOÁCIDOS .............................................. 11 PRODUCCIÓN DE UREA ............................................................................................ 14 CICLO DE LA UREA ................................................................................................ 14 REACCIONES QUE TRANSCURREN EN LA MATRIZ MITOCONDRIAL ....... 14 REACCIONES QUE TRANSCURREN EN EL CITOSOL ...................................... 15 ELIMINACIÓN DE LA UREA ................................................................................. 16 REGULACIÓN DEL CICLO DE LA UREA ............................................................ 16 ESTEQUIOMETRÍA GLOBAL DEL CICLO DE LA UREA .................................. 17 BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS ............................................................................ 18 BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS NO ESENCIALES ......................................... 19 GLUTAMATO, GLUTAMINA, ASPARTATO, ASPARRAGINA Y PROLINA 20 SERINA, GLICINA Y ALANINA ......................................................................... 20 TIROSINA Y CISTEÍNA ....................................................................................... 21 BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS ESENCIALES ................................................ 22 GRUPO DEL ASPARTATO .................................................................................. 22 GRUPO DEL PIRUVATO ..................................................................................... 22 GRUPO DEL GLUTAMATO ................................................................................ 23 GRUPO DE LOS AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS............................................ 23 HISTIDINA ............................................................................................................. 24 BIBLIOGRAFÍA ............................................................................................................ 25 OXIDACIÓN DE AMINOÁCIDOS La fracción de la energía metabólica generada a partir de los aminoácidos, ya sean procedentes de proteínas de la dieta o de proteínas de los tejidos, varía mucho según el tipo de organismo y de las condiciones metabólicas. Los carnívoros pueden obtener (inmediatamente después de una comida) hasta el 90% de sus necesidades de energía a partir de la oxidación de aminoácidos, mientras que los herbívoros sólo pueden cubrir una pequeña parte de sus necesidades energéticas a través de esta ruta. La mayoría de los microorganismos pueden nutrirse de aminoácidos del entorno y utilizarlos como combustible si las condiciones metabólicas lo requieren. Las plantas, sin embargo, raramente oxidan aminoácidos, si es que lo llegan a hacer, para obtener energía; los glúcidos producidos a partir de CO2 y H2O en la fotosíntesis son utilizados como fuente casi exclusiva de energía. Las concentraciones de los aminoácidos en los tejidos vegetales están reguladas cuidadosamente con la finalidad exclusiva de cubrir las necesidades para la biosíntesis de proteínas, ácidos nucleicos y otras moléculas necesarias para el crecimiento. En las plantas se produce catabolismo de aminoácidos, pero su finalidad es la producción de metabolitos para otras rutas biosintéticas. En los animales, los aminoácidos experimentan degradación oxidativa en tres situaciones metabólicas diferentes. 1. Durante la síntesis y degradación normales de proteínas celulares algunos de los aminoácidos liberados durante la degradación de las proteínas se degradan oxidativamente si no se necesitan para la síntesis de nuevas proteínas. 2. Cuando una dieta es rica en proteínas y los aminoácidos ingeridos exceden las necesidades corporales para la síntesis de proteínas, el excedente se cataboliza; los aminoácidos no se pueden almacenar. 3. Durante la inanición o en la diabetes mellitus, en las que no hay glúcidos disponibles o éstos no son utilizados adecuadamente, se recurre a las proteínas celulares como combustible. En todas estas circunstancias metabólicas, los aminoácidos pierden sus grupos amino para formar α - cetoácidos, los “esqueletos carbonados" de los aminoácidos. Los α-cetoácidos experimentan oxidación a CO2 y H2O y, a menudo y más importante, proporcionan unidades de tres y cuatro carbonos que pueden convertirse a través de la gluconeogénesis en glucosa, el combustible para el cerebro, el músculo esquelético y otros tejidos. Las rutas del catabolismo de los aminoácidos son muy semejantes en la mayoría de los organismos. Al igual que en el caso del catabolismo de los glúcidos y ácidos grasos, los procesos de la degradación de aminoácidos convergen en las rutas catabólicas centrales. Los esqueletos carbonados de la mayoría de los aminoácidos van a parar al ciclo del ácido cítrico. En algunos casos, las rutas de reacción de la degradación de los aminoácidos siguen un estrecho paralelismo con el catabolismo de los ácidos grasos. Existe una característica importante que distingue la degradación de aminoácidos de los otros procesos catabólicos descritos hasta este momento: cada aminoácido contiene un grupo amino. Por tanto, las rutas de degradación de los aminoácidos incluyen un paso clave en el que se separa el grupo a-amino del esqueleto carbonado desviándolo hacia rutas de metabolismo del grupo amino. REACCIONES GENERALES DE LOS AMINOÁCIDOS 1. Transaminación: Entre las reacciones de transferencia de grupos amino, las transaminaciones son especialmente importantes. Ellas son catalizadas por las transaminasas (que están implicadas tanto en las rutas catabólicas y anabólicas del metabolismo de aminoácidos). Durante la transaminación, el grupo amino de un aminoácido se transfiere a un 2-oxoácido (α-cetoácido). Se forma un 2-oxoácido (α- cetoácido) del aminoácido original y un aminoácido del 2-oxoácido original. Con pocas excepciones, el primer paso de la degradación de los L-aminoácidos consiste en la eliminación del grupo α-amino para producir el correspondiente α-cetoácido. Esta modificación, conocida por transaminación, está catalizada por las enzimas denominadas aminotransferasas o transaminasas. En estas reacciones de transaminación el grupo α-amino de un aminoácido es transferido al átomo de carbono α del α -cetoglutarato. No hay desaminación neta sino una transferencia del grupo α- amino desde un aminoácido hasta un α-cetoácido. El objetivo de las reacciones de transaminación es recoger los grupos aminos de muchos aminoácidos diferentes en forma de uno solo, el glutamato, que los canalizará hacia rutas biosintéticas o hacia vías que generan productos nitrogenadosde excreción. Las células contienen varias aminotransferasas, muchas de ellas específicas para el α -cetoglutarato como aceptor de grupos aminos. Sin embargo, difieren en su especificidad para el otro sustrato, el aminoácido que cede el grupo amino, y en función del cual se denominan. Las reacciones catalizadas por las aminotransferasas son reversibles. Las más importantes son el aspartato aminotransferasa y la alanina aminotransferasa. La determinación de la actividad de ciertos enzimas en suero se utiliza habitualmente como parámetro para el diagnóstico de determinadas patologías. La alanina aminotransferasa (también denominada glutamato-piruvato transaminasa o GPT) y la aspartato aminotransferasa (denominada también glutamato-oxalacetato transaminasa o GOT) son muy abundantes en corazón e hígado por lo que después de un infarto de miocardio o una hepatitis infecciosa (u otras lesiones de cualquier órgano) las aminotransferasas de las células lesionadas pasan al torrente circulatorio pudiéndose determinar su concentración en el suero (S). Los valores de SGPT y SGOT proporcionan información sobre la gravedad y el estado de la lesión. En el caso de infarto de miocardio, los valores del enzima creatina quinasa (SCK) son también muy importantes ya que es específico del músculo cardíaco. 2. Desaminación oxidativa: Cuando el grupo amino de un aminoácido se libera como amoníaco, recibe el nombre de desaminación. De particular importancia es la desaminación oxidativa. En esta reacción, el grupo amino es liberado en forma de amoníaco y se genera un 2-oxoácido. Un ejemplo de desaminación oxidativa es la catalizada por el enzima glutamato deshidrogenasa. El glutamato generado en el citosol de las células hepáticas por las reacciones de transaminación es transportado hasta la matriz mitocondrial donde por acción del glutamato deshidrogenasa sufre desaminación oxidativa, liberándose iones amonio. Este enzima únicamente se encuentra en la matriz mitocondrial y es capaz de utilizar como aceptores de los equivalentes de reducción NAD+ y NADP+. Sus activadores alostéricos son el GDP y el ADP y los efectores alostéricos negativos son el GTP (generado en el ciclo de Krebs) y el ATP. Si un hepatocito necesita combustible para el ciclo de Krebs aumenta la actividad del glutamato deshidrogenasa, suministrando α-cetoglutarato para el ciclo de Krebs y liberando NH4+ para la excreción. Por el contrario, es inhibida si se acumula GTP como consecuencia de una alta actividad del ciclo de Krebs. Por lo tanto, la disminución de la carga energética (disminución de GTP y ATP) acelera la oxidación de los aminoácidos. DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS Las proteínas se degradan a sus aminoácidos constituyentes, bien sean las procedentes de la dieta o las proteínas intracelulares. Consideraremos aquí cuatro mecanismos de degradación proteica: 1) La degradación digestiva de proteínas 2) La degradación lisosómica 3) La degradación mediada por ubicuitina/proteasoma 4) La degradación apoptótica. DEGRADACIÓN Y ABSORCIÓN DIGESTIVA DE LAS PROTEÍNAS El ser humano, al iniciar su evolución desde los primeros homínidos como Australopithecus, no era en principio un animal carnívoro, lo cual puede fácilmente apreciarse en su dentición, muy alejada morfológicamente de la de los mamíferos depredadores. Con el tiempo, los humanos comenzaron sin embargo a incorporar la carne a su dieta. Se piensa por parte de algunos paleoantropólogos que esta tendencia comenzó como carroñero, pero poco a poco, y simultáneamente a la evolución cultural, los seres humanos incorporaron la caza como medio indispensable para su alimentación. Ello fue posible gracias al desarrollo de pautas culturales como la actividad coordinada en grupo y sobre todo la comunicación verbal. Ahora bien: no sólo es la dentición lo que separa en principio al hombre de una dieta cárnica (y por tanto, rica en proteína) sino también la potencia proteolítica de su aparato digestivo. Por esa razón, la incorporación de la carne a la dieta humana (y por tanto, la adquisición del carácter omnívoro por la especie) fue posible en gran parte gracias al dominio del fuego, que al desnaturalizar la proteína de la dieta facilita enormemente su digestión. Aun así, todavía nos resultan “pesadas” las dietas ricas en proteína, a lo que se añade la llamada Acción Dinámico Específica, consistente en un incremento del consumo calórico (y por tanto, de oxígeno) que se observa en el momento de la digestión de las proteínas. En la degradación digestiva de las proteínas, consideraremos dos fases: (1) la digestión gástrica y (2) la digestión intestinal. DIGESTIÓN GÁSTRICA El contenido gástrico se caracteriza por ser muy ácido (pH 1-2) debido a la secreción, por parte de las células oxínticas de la mucosa, de ácido clorhídrico. Existe en estas células una bomba protónica que transporta hacia la luz gástrica contra gradiente iones H+ procedentes de la reacción de hidratación del CO2. Catalizada por la anhidrasa carbónica. De esta manera, por cada protón bombeado, ingresa un anión bicarbonato HCO3 - en el medio orgánico, que es responsable de la llamada alcalosis postprandial. Por su parte, las células principales de la mucosa gástrica son productoras del zimógeno pepsinógeno (pepsinógeno A) que es activado precisamente por el pH ácido del interior gástrico. Esta activación tiene lugar gracias a que la proteína se despliega en parte ante el pH ácido, dejando expuesto el centro activo que entonces elimina de su propia molécula unos 40 aminoácidos N-terminales, dando lugar a la enzima pepsina (EC 3.4.23.1). La pepsina tiene un pH óptimo de 2, y deja de actuar por encima de pH 6.5. Tiene preferencia por enlaces peptídicos constituidos entre aminoácidos hidrofóbicos, preferentemente aromáticos. Su centro activo consiste en dos residuos de ácido aspártico, por lo que pertenece a las llamadas aspartil-proteasas. Las células principales de la mucosa gástrica producen asimismo otras enzimas proteolíticas. Una de ellas es la gastricsina (pepsinógeno C, EC 3.4.23.3), de gran similitud secuencial y enzimática con la pepsina, de la que se diferencia por tener una mayor especificidad hacia enlaces peptídicos que impliquen aminoácidos aromáticos. Es asimismo una aspartil-proteasa. En el cuarto estómago de los rumiantes (lactantes) se produce otra aspartil-proteasa, la quimosina (EC 3.4.23.4) que es el componente activo del cuajo. En el hombre existe el gen, pero no se expresa. Esta enzima hidroliza de una forma altamente específica el enlace entre Phe 105 y Met 106 de la κ-caseína de la leche. De esta manera se separan la porción hidrofóbica (para-caseína) del glicopéptido ácido hidrofílico de la misma, permitiendo la precipitación de la primera y dando lugar a la leche cuajada, que es la materia prima en la elaboración de quesos. DIGESTIÓN INTESTINAL Los oligopéptidos y proteínas parcialmente digeridas en el estómago pasan a la luz intestinal siguiendo el tránsito digestivo. Aquí el pH se acerca a la neutralidad y las proteínas van a ser degradadas por una serie de enzimas que en su mayor parte proceden del páncreas exocrino y que, al igual que la pepsina, son segregadas en forma de zimógenos. La tripsina (EC 3.4.21.4) es producida como tripsinógeno por las células acinares del páncreas desde donde es segregado a la luz intestinal a nivel del duodeno. Atacado por la enzima enteropeptidasa (EC 3.4.21.9) produce la enzima activa. La tripsina es una serin- proteinasa que específicamente ataca los enlaces peptídicos establecidos entre Arg o Lys y cualquier otro aminoácido (excepto Pro). La enteropeptidasa es producida por las glándulas duodenales. La quimotripsina (EC 3.4.21.1) es también una enzima pancreática del grupo de las serinproteinasas. El zimógeno (quimotripsinógeno) es activado por latripsina, dando lugar a la enzima activa, en un proceso que termina con la molécula primitiva dividida en tres cadenas polipeptídicas unidas por disulfuros (γ-quimotripsina). Esta enzima ataca preferentemente los enlaces peptídicos constituidos por un aminoácido aromático (Phe, Tyr, Trp), Leu o Met y cualquier otro aminoácido. Otras enzimas proteolíticas producidas por el páncreas como zimógenos son la elastasa pancreática (EC 3.4.21.36, producida como proelastasa) y la carboxipeptidasa pancreática (EC 3.4.17.3), producida como procarboxipeptidasa). La primera hidroliza preferentemente enlaces Ala- X, y tiene relativamente poca actividad elastolítica; es una serin-proteinasa. La segunda elimina aminoácidos del extremo carboxiterminal de las proteínas, particularmente cuando se trata de aminoácidos dibásicos como Lys o Arg; es una metaloproteinasa que contiene Zn. ABSORCIÓN DIGESTIVA DE AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS Por regla general las proteínas no son nunca absorbidas como tales por el aparato digestivo; deben en primer lugar ser degradadas por las enzimas digestivas mencionadas en el apartado anterior. La absorción de aminoácidos por parte del intestino delgado sigue un patrón similar a la absorción de glucosa (transporte sodio- dependiente). El gradiente electroquímico creado por la bomba de sodio de la membrana luminal del enterocito permite la absorción de aminoácidos por la membrana apical al menos por cuatro sistemas distintos selectivos para las diferentes clases de aminoácidos (ácidos, básicos, aromáticos, neutros). Por el contrario, en la membrana basolateral del enterocito se encuentran sistemas que transportan aminoácidos hacia el medio interno sin necesidad de gradiente de sodio. El enterocito es asimismo capaz de absorber oligopéptidos de menos de cuatro aminoácidos, gracias a un cotransporte con protones H+. Las proteínas solamente pueden ser absorbidas como tales en el neonato (y solamente durante unos pocos días). Sin embargo, esta actividad tiene gran importancia dado que es la manera que tienen los anticuerpos del calostro o de la leche (inmunoglobulina A en su mayor parte) de entrar en el organismo del recién nacido, confiriendo así una inmunidad pasiva al mismo. DEGRADACIÓN LISOSOMAL Los lisosomas son organelas celulares rodeadas de membrana en bicapa, que hasta cierto punto pueden ser consideradas como el aparato digestivo de la célula. El interior del lisosoma es ácido (pH 4 – 5) gracias a una bomba protónica dependiente de ATP que transporta iones H+ hacia el interior de la partícula. En el interior del mismo se han descrito más de 50 enzimas hidrolíticas que afectan a todo tipo de biomoléculas: carbohidratos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos. Las mutaciones que afectan a estas enzimas pueden dar lugar a enfermedades de almacenamiento o tesaurismosis, en las que se acumula una molécula que no ha podido ser degradada; un ejemplo es la enfermedad de Gaucher, en la que se acumula un cerebrósido por falta de una glicosidasa específica. Los lisosomas ejercen su función a través de fusión con partículas ingresadas por fagocitosis (fagosomas), endocitosis (endosomas) o bien autofagia, proceso mediante el cual la célula elimina sus propias organelas. Las enzimas proteolíticas de los lisosomas pertenecen en su mayor parte a las conocidas como catepsinas, que actúan a pH ácido y de las que se han descrito al menos quince tipos distintos, aunque algunas de ellas (como la catepsina K) ejercen su acción fuera del lisosoma (en este caso particular, actúan en la reabsorción del hueso). Se distinguen catepsinas A, B, C, D, etc. La mayor parte de las catepsinas son tiol-proteinasas de muy poca especificidad, actuando principalmente como endopeptidasas; aunque también pueden actuar como carboxipeptidasas (la catepsina B es una carboxipeptidasa que elimina los dos últimos aminoácidos de las proteínas). Hay asimismo serin-proteinasas y aspartil-proteinasas, pero todas ellas se caracterizan por actuar a pH ácido y con poca especificidad. Se sintetizan en forma de zimógenos que son exportados al lisosoma donde el pH induce un cambio conformacional que favorece la autocatálisis. El citoplasma celular está protegido de las enzimas lisosómicas gracias a mantener un pH en torno a 7.2, al cual dejan de ser activas. Algunas catepsinas lisosómicas parecen estar implicadas en la patogenia de enfermedades neurodegenerativas como la enfermedad de Alzheimer. La catepsina B previene, al parecer, la formación de la placa amiloide característica de esta enfermedad. RECAMBIO INTERÓRGANO DE AMINOÁCIDOS La principal reserva de nitrógeno del cuerpo está en forma de aminoácidos. El músculo es el reservorio más grande tanto de péptidos como de aminoácidos. Una proporción de aminoácidos libres se encuentra en pequeñas cantidades dentro de todas las células y en los compartimentos extracelulares como lo es el plasma. Para medir el recambio interórgano de aminoácidos se han estudiado las diferencias entre sus concentraciones arteriales y venosas por segmentos (femoral, yugular, sistema porta, etc). Estas diferencias en las concentraciones permiten diferenciar la contribución específica de los diferentes órganos en condiciones fisiológicas y patológicas particulares. Durante el ayuno nocturno de 10 a 14 horas hay un flujo de aminoácidos que proviene del músculo. La L-alanina y la L-glutamina son los principales aminoácidos liberados por los tejidos periféricos y entre ambos conforman del 30 al 40% de los aminoácidos liberados del músculo e incorporados a la circulación esplácnica, que incluye al bazo, hígado, e intestino. En ayuno y bajo estrés, el intestino libera L-alanina y consume L-glutamina. Felig en 1973 reportó que en humanos sometidos a colecistectomía electiva, la L-alanina representaba entre el 35% a 40% del total de los aminoácidos producidos por el tejido intestinal. Mientras que la depuración de la L-glutamina por el intestino representaba más del 50% de los aminoácidos incorporados. Windmueller en 1978 demostró, en segmentos de yeyuno perfundido de rata, que cerca de la mitad de L-glutamina incorporada es convertida en CO2 y esta proporción constituye el 35% del total del CO2 producido por el intestino. En contraparte, el 80% del carbono que proviene de L-alanina y es liberado por el intestino está destinado a sustratos glucogénicos en el lecho esplácnico. El riñón es el cuarto órgano involucrado en el recambio de aminoácidos, una de sus funciones es la depuración de L-glutamina, de la cual proviene tanto la glucosa como el nitrógeno del amonio urinario. El riñón libera además L-serina a la circulación para ser depurada por el músculo y el hígado, así como pequeñas cantidades de L-alanina.45 En insuficiencia renal crónica, por disminuir la actividad de la fenilalanina hidroxilasa renal, se encuentran reducidas las concentraciones de L-tirosina. Otros órganos implicados son el cerebro y los eritrocitos. Midiendo las diferentes concentraciones del contenido arteriovenoso yugular, ha sido demostrado que el cerebro incorpora L-valina y L-prolina. Los eritrocitos juegan un peculiar papel por transportar los aminoácidos; entre el 20% y 30% del transporte de L-alanina del músculo al lecho esplácnico es realizado por los eritrocitos. En el caso de L-glutamina, su incorporación esplácnica puede resultar sobrestimada cuando no se toma en cuenta la cantidad de este aminoácido liberado por los eritrocitos al plasma. El papel más importante de L-alanina en el intercambio interórgano es durante el período postabsortivo, dada su rápida conversión a glucosa en el hígado, por el ciclo llamado alanina glucosa. La L-alanina es liberada por el músculo y tomada por el hígado para reconvertirla a glucosa. De acuerdo a los estudios de Chang y Golberg el 60% de los carbones del esqueleto de la L-alaninason utilizados en la gluconeogénesis hepática. Entre el 66% y el 72% del total de la L-alanina liberada por el músculo no es producto de la pura hidrólisis proteínica, más bien es resultado de transaminaciones in situ, el grupo amino para síntesis de L-alanina, es principalmente obtenido de la deaminación de los aminoácidos de cadena ramificada: L-valina, L-leucina y L-isoleucina. Esto se debe a que una alta proporción de aminoácidos de cadena ramificada se escapan a la incorporación en hígado después de la alimentación normal y son tomados por el músculo en cantidades superiores en relación a otros aminoácidos. En sujetos sanos, la realización de ejercicio de cualquier intensidad incrementa la concentración de L-alanina arterial, misma que correlaciona con la elevación del piruvato en plasma, mientras mayor sea la intensidad del ejercicio, mayor será la concentración de la L-alanina del aminograma. La relación entre la producción de L-alanina y la utilización de glucosa es particularmente evidente en el ejercicio. Cuando el ejercicio es llevado a cabo en ayuno, incrementa aún más el flujo de aminoácidos de cadena ramificada del lecho esplácnico al músculo y su oxidación. En el ayuno, los cambios en el flujo de aminoácidos desde músculo a hígado se incrementan conforme aumenta la duración de éste. Cuando el ayuno es de 2 a 3 días hay un incremento de la liberación de L-alanina muscular y de su incorporación al lecho esplácnico asociada a una elevada extracción fraccional hepática de este aminoácido. En contraparte, cuando el ayuno dura de 3 a 6 semanas la producción de L-alanina por el músculo se reduce. La hipercetonemia parece ser el mecanismo responsable de inhibir la liberación de L-alanina por el músculo. Al inicio del ayuno hay un incremento plasmático de los aminoácidos de cadena ramificada, posterior a unas semanas de ayuno estas concentraciones disminuyen, y su oxidación también disminuye. Una vez que se reinicia la alimentación, se observa una inversión del flujo de los aminoácidos de cadena ramificada; aunque persista el flujo de L-alanina y L-glutamina del músculo al lecho esplácnico prevalece la depuración muscular neta, de la cual los aminoácidos de cadena ramificada (AACR) representan más del 50%. Posterior a una carga oral de aminoácidos, entre el 80 al 90% de los AACR, aparecen en la vena porta y sólo del 15 al 20% son extraídos por el hígado quedando el resto disponible para el músculo. PRODUCCIÓN DE UREA Si no se reutilizan para la síntesis de nuevos aminoácidos u otros productos nitrogenados, los grupos amino se canalizan a un único producto final de excreción. La mayoría de las especies acuáticas, tales como los peces óseos, excretan el nitrógeno amínico en forma de amoníaco, por lo que se les llama animales amonotélicos. El amoníaco tóxico simplemente se diluye en el agua circundante. Los animales terrestres necesitan vías para la excreción del nitrógeno que minimicen tanto la toxicidad como la pérdida de agua. La mayoría de los animales terrestres son ureotélicos: excretan el nitrógeno amínico en forma de urea; las aves y los reptiles son uricotélicos; excretan el nitrógeno amínico en forma de ácido úrico. Las plantas reciclan virtualmente todos los grupos amino, por lo que la excreción de nitrógeno sólo tiene lugar en circunstancias muy poco comunes. CICLO DE LA UREA En los organismos ureotélicos, como los seres humanos, aproximadamente el 80% del nitrógeno total excretado está presente en forma de urea. La síntesis de urea se realiza en el denominado ciclo de la urea, mediante un conjunto de enzimas que actúan coordinadamente. Aunque muchas de esas enzimas suelen estar presentes en la mayor parte de los tejidos de los mamíferos, el ciclo funciona únicamente en el hígado. En la producción de urea a partir de NH4 + intervienen cinco reacciones enzimáticas, dos en la matriz mitocondrial y tres en el citosol. REACCIONES QUE TRANSCURREN EN LA MATRIZ MITOCONDRIAL a) Síntesis de carbamilfosfato. El primer grupo amino que entra en el ciclo de la urea proviene del NH4 + presente en el interior de las mitocondrias. Este a su vez procede de las rutas ya descritas, así como de la oxidación de aminoácidos por las bacterias del tracto intestinal y que llega al hígado a través de la vena porta. El NH4 + se combina con CO2 (en forma de HCO3 -) procedente de la respiración mitocondrial, produciendo carbamil fosfato. La reacción está catalizada por la carbamil fosfato sintetasa I. La hidrólisis de dos moléculas de ATP asegura que el proceso de síntesis sea irreversible. El carbamil fosfato es un dador activado de grupos carbamilo. b) Síntesis de citrulina. El carbamil fosfato cede su grupo carbamilo a la ornitina para formar citrulina, reacción catalizada por la ornitina transcarbamilasa. La citrulina, mediante un transportador específico presente en la membrana mitocondrial interna, es enviada al citosol. REACCIONES QUE TRANSCURREN EN EL CITOSOL a) Síntesis de argininosuccinato. La citrulina y el aspartato (procedente de la matriz mitocondrial y generado por transaminación) se condensan para formar argininosuccinato, proceso favorecido por la hidrólisis del ATP en AMP y PPi, y posterior hidrólisis del pirofosfato. Está catalizado por el enzima argininosuccinato sintetasa. El segundo grupo amino que se introduce en el ciclo de la urea lo hace en forma de aspartato. b) Rotura de argininosuccinato. Por acción del enzima argininosuccinato liasa el argininosuccinato es escindido en arginina, que es el aminoácido precursor de la urea, y fumarato que entra a formar parte de los intermediarios del ciclo de Krebs. c) Hidrólisis de arginina. Se genera ornitina y urea, proceso catalizado por el enzima arginasa. Este enzima es el responsable de la naturaleza cíclica de la ruta de la bisosíntesis de la urea. Prácticamente todos los organismos sintetizan arginina a partir de ornitina, mediante las reacciones mostradas. Sin embargo, únicamente los organismos ureotélicos contienen arginasa. El destino de la ornitina es volver otra vez a la matriz mitocondrial para su utilización en un nuevo ciclo. La urea difunde desde el hígado a la sangre, que la transporta hasta los riñones, donde es filtrada y excretada con la orina. Una parte de la urea difunde desde la sangre al intestino y se disocia en CO2 y NH3 por acción de la ureasa bacteriana. Este amoníaco se pierde en parte con las heces y en parte se reabsorbe hacia la sangre. En los pacientes con insuficiencia renal, los niveles plasmáticos de urea están elevados, lo que provoca una mayor transferencia de urea desde la sangre al intestino. La acción intestinal de la ureasa sobre esta urea se convierte en una fuente de amoníaco clínicamente importante, que contribuye a la hiperamoniemia observada con frecuencia en estos pacientes. La administración oral de antibióticos reduce el número de bacterias intestinales responsables de esta producción de NH3. ELIMINACIÓN DE LA UREA La urea abandona el hígado y pasa al sistema circulatorio a través del cual llega a los riñones donde es filtrada para su excreción. La determinación de la concentración de urea en sangre es un indicador clínico de la función renal ya que la filtración y eliminación de urea se ven afectados cuando hay una actividad renal deficiente. Existen excepciones en el caso de animales que hibernan ya que durante el período de hibernación no orinan y la urea, presente en la vejiga urinaria, se reabsorbe y vuelve a los tejidos donde aporta grupos aminos para la biosíntesis de aminoácidos. REGULACIÓN DEL CICLO DE LA UREA La actividad del ciclo de la urea va a estar condicionada por la composición de la dieta. Supongamos las dos situaciones metabólicas siguientes: por un lado, la de un individuo alimentado con una dieta constituidaesencialmente por proteínas y, por otro, la de un organismo sometido a inanición severa. En ambos casos los aminoácidos (esqueletos hidrocarbonados) serán utilizados como principal fuente de energía y se producirá abundante urea a partir de los grupos aminos excedentes. Los enzimas del ciclo y la carbamilfosfato sintetasa I van a estar regulados a dos niveles. Concentración de los enzimas: los enzimas del ciclo de la urea (incluido carbamilfosfato sintetasa I) son sintetizadas a una velocidad superior cuando se ingiere una dieta rica en proteínas que cuando se consume una dieta equilibrada (abundan glúcidos y lípidos). Lo mismo es aplicable cuando se trata de inanición ya que las proteínas musculares van a actuar como principal fuente de energía metabólica. Y, al contrario, cuando no se consumen proteínas la velocidad de síntesis disminuye. Se trata de un mecanismo de regulación que funciona a largo plazo. Regulación alostérica: es ejercida sobre el enzima carbamilfostato sintetasa I. Su activador alostérico es el N-acetil glutamato que, a su vez, se sintetiza a partir de acetil- CoA y glutamato por acción del enzima N-acetil glutamato sintetasa mitocondrial. El enzima N-acetil glutamato sintetasa es activada por arginina, intermediario del ciclo de la urea, que se acumula cuando la síntesis de urea va muy lenta en comparación con la producción de amonio a partir del catabolismo de aminoácidos. Este mecanismo de regulación es el primero que se ejerce para intentar controlar el flujo de nitrógeno a través del ciclo y por lo tanto se trata de una regulación a corto plazo. ESTEQUIOMETRÍA GLOBAL DEL CICLO DE LA UREA Debido a que en la síntesis de cada molécula de urea se consumen 4 fosfatos de alta energía, la síntesis de urea es irreversible, con un ΔG muy negativo. Uno de los nitrógenos de la molécula de urea proviene del NH3 libre y el otro, del aspartato. El glutamato es el precursor inmediato tanto del nitrógeno del amoníaco (a través de la desaminación oxidativa catalizada por el glutamato deshidrogenasa) como del de aspartato (a través de la transaminación del oxalacetato catalizada por la AST). De hecho, ambos átomos de nitrógeno de la urea provienen del glutamato que, a su vez, recoge nitrógeno de otros aminoácidos. BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS Todos los aminoácidos proceden de intermediarios de la glucólisis, del ciclo del ácido cítrico o de la ruta de las pentosas fosfato. El nitrógeno entra en estas vías a través del glutamato y la glutamina. Algunas rutas son sencillas, otras complejas. La síntesis de diez de los aminoácidos precisa tan sólo de uno o de pocos pasos desde el metabolito común del que proceden. Las vías biosintéticas de otros aminoácidos, tales como los aminoácidos aromáticos, son más complejas. Los distintos organismos presentan considerables diferencias en su capacidad para sintetizar los 20 aminoácidos estándar. Mientras que la mayor parte de bacterias y plantas pueden sintetizar los 20 aminoácidos, los mamíferos sólo pueden sintetizar la mitad, generalmente aquellos cuyas vías metabólicas son sencillas. Estos son los denominados aminoácidos no esenciales, que no son necesarios en la dieta. El resto, los aminoácidos esenciales, deben obtenerse de los alimentos. A menos que se indique lo contrario, las vías para los 20 aminoácidos estándar que se presentan a continuación pertenecen a las bacterias. Un procedimiento que resulta útil para ordenar estas vías biosintéticas consiste en agruparlos en seis familias, según sus precursores metabólicos. Hemos aplicado este criterio para organizar las descripciones detalladas que se presentan a continuación. Además de estos seis precursores hay un compuesto intermediario notable que aparece en varias vías de síntesis de aminoácidos y nucleótidos: el 5-fosforribosill-pirofosfato (PRPP): El PRPP se sintetiza a partir de la ribosa-5-fosfato, procedente de la ruta de las pentosas fosfato, en una reacción catalizada por la ribosa fosfato pirofosfoquinasa: Ribosa 5-fosfato + ATP 5-fosforribosil-l-pirofosfato + AMP Este enzima está regulado alostéricamentc por muchas de las biomoléculas que se forman a partir del PRPP. BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS NO ESENCIALES En general, los organismos animales son capaces de sintetizar 10 de los 20 aminoácidos proteicos (Gly, Ala, Tyr, Ser, Cys, Pro, Glu, Gln, Asp, Asn). Plantea dudas la esencialidad de arginina. Hemos visto que en el ciclo de la urea se produce arginina como intermediario a partir de la rotura enzimática de la molécula de arginosuccinato. Pero la actividad siguiente de la arginasa para producir urea y ornitina es muy grande en los tejidos ureogénicos como el hígado, por lo que la concentración de arginina a disposición de la síntesis proteica tiene necesariamente que ser muy baja a través de esta vía. Por tanto, se cree que es más adecuado considerar la arginina como aminoácido esencial. Las figuras muestran un resumen de las fuentes de carbono necesarias para la síntesis de todos los aminoácidos. En azul aparecen las vías metabólicas presentes en animales, y en rojo, las que no lo son, y que corresponden a la síntesis de aminoácidos esenciales. GLUTAMATO, GLUTAMINA, ASPARTATO, ASPARRAGINA Y PROLINA En la figura se muestran las vías mediante las cuales se sintetizan en el organismo animal (y humano, por tanto) estos aminoácidos. Muchas de estas reacciones han sido mencionadas previamente. Glutamato se forma por (a) glutamato deshidrogenasa a partir de α-cetoglutarato y amoníaco, o bien (b) transaminación sobre α-cetoglutarato. Glutamina, a través de la reacción de la glutamina sintetasa. Aspartato es sintetizado por transaminación con glutamato sobre oxalacetato; asparragina, por la reacción de la asparragina sintetasa actuando sobre aspartato. Prolina se forma a partir de glutamato por reducción del carboxilo lateral a aldehído a expensas de NADPH, en una reacción que requiere ATP. El glutamato semialdehido se cicliza a pirrolina 2-carboxilato, que es nuevamente reducido a prolina. SERINA, GLICINA Y ALANINA Serina procede del intermediario glicolítico 3-fosfoglicerato. En una primera reacción es oxidado a 3-fosfohidroxipiruvato en una reacción dependiente de NAD+. La transaminación desde glutamato a este intermediario produce 3-fosfoserina, que pierde por hidrólisis el grupo fosfato rindiendo serina. Serina y glicina están relacionados por la serina hidroximetil transferasa, enzima que requiere una coenzima folínica, y que hemos visto a propósito del catabolismo de estos aminoácidos. Alanina procede de la transaminación directa de glutamato sobre piruvato. Estas reacciones aparecen esquematizadas. TIROSINA Y CISTEÍNA La síntesis de estos dos aminoácidos requiere la presencia de dos aminoácidos esenciales, fenilalanina y metionina respectivamente. Su producción sigue vías que ya hemos estudiado a propósito del catabolismo de estos aminoácidos. Tirosina se forma gracias a la acción de la fenilalanina hidroxilasa actuando sobre fenilalanina. Ésta es la enzima que falta o es defectiva en la fenilcetonuria. La cisteína se forma a partir de metionina, con intermediarios S-adenosil metionina, S-adenosil homocisteína, homocisteína y cistationina. BIOSÍNTESIS DE AMINOÁCIDOS ESENCIALES Veremos a continuación sucintamente algunos aspectos de la biosíntesis de aminoácidos esenciales, teniendo en cuenta que estas rutas metabólicas no aparecen en animales. La mayor parte de las que se describen son bacterianas. GRUPO DEL ASPARTATO Del aspartato derivan los aminoácidos esenciales metionina, treonina y lisina, siendo las dos primeras reacciones comunes. Aspartato es fosforilado a aspartil-fosfato y éste reducido a aspartatosemialdehido. Una ruta de otras 8 reacciones da lugar a lisina (se requiere también piruvato en esta ruta); por otra parte, la reducción ulterior del semialdehido da lugar a homoserina. Ésta, por una parte, rinde treonina y por otra es transformada en homocisteína, que dará lugar a metionina. GRUPO DEL PIRUVATO Este grupo está constituido por valina, leucina e isoleucina. La reacción de piruvato con 2- cetobutirato (producido en el metabolismo de treonina) da lugar a 2-ceto 3- metilvalerato, que por transaminación da lugar a isoleucina. Dos moléculas de piruvato se condensan a 2-cetoisovalerato, que por transaminación rinde valina. A partir del 2-cetoisovalerato, otras cuatro reacciones dan lugar a leucina GRUPO DEL GLUTAMATO Consideraremos en este grupo la síntesis bacteriana de arginina. El glutamato es reducido a semialdehido el cual da lugar a ornitina; mediante las enzimas del ciclo de la urea, ésta se transforma en arginina. GRUPO DE LOS AMINOÁCIDOS AROMÁTICOS La condensación de eritrosa-4-fosfato y fosfoenolpiruvato, en cuatro reacciones, produce shikimato; otras tres reacciones transforman a éste en corismato. Por una parte, el corismato producirá triptófano mediante el intermediario antranilato; por otra se transforma en prefenato, del cual derivan fenilalanina y tirosina. HISTIDINA La síntesis bacteriana de histidina tiene lugar a través de una ruta complicada que comienza con fosforribosil difosfato (PRPP) que se condensa con el anillo pirimidínico del nucleótido purínico ATP. Posteriormente este ciclo se rompe produciéndose imidazol glicerofosfato (más un intermediario de la biosíntesis de purinas), a partir del cual, en cinco reacciones, se obtiene histidina. BIBLIOGRAFÍA ➢ DEGRADACIÓN DE LAS PROTEÍNAS. [en línea]. Archivosdemedicinadeldeporte.com. 2022. Disponible en: https://archivosdemedicinadeldeporte.com/articulo/es/88/2001/1049/ [Consultado el 9 de marzo de 2023]. ➢ Ferrier, D. and Harvey, R. Lippincott's illustrated reviews: biochemistry. 6th ed. [libro]. 2014. Philadelphia: Wolters Kluwer Health, pp.502-508. [Consultado el 9 de marzo de 2023]. ➢ Bioquest.org. 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