Clasificación de las bacterias Taxonomía

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Temario 3
Clasificación de las bacterias. Taxonomía
Introducción
Taxonomía bacteriana (del griego taxon = organización).
Para la taxonomía, se consideran conceptos como: 
1.- Identificación 
Es útil para: 
1) Aislar y diferenciar microorganismos específicos entre una mezcla de flora microbiana compleja.
2) Verificar la autenticidad o propiedades especiales de un cultivo en un entorno clínico.
3) Aislar al microorganismo causal de una enfermedad. 
2.- Clasificación 
Es la categorización de microorganismos en grupos taxonómicos. 
Se consideran las propiedades bioquímicas, fisiológicas, genéticas y morfológicas para establecer una categoría taxonómica. 
3.- Nomenclatura
Se refiere a la denominación de un microorganismo.
La taxonomía linneana utiliza las categorías taxonómicas formales como dominio, reino, tipo, clase, orden, familia, género y especie. 
Las categorías inferiores son aprobadas por un consenso de expertos en la comunidad científica. 
CRITERIOS PARA CLASIFICAR LAS BACTERIAS
1.- Crecimiento en medios de cultivo
Estos medios por lo general contienen agar, una fuente de carbono, y un hidrolizado ácido o una fuente de material biológico sometida a degradación enzimática 
Los medios de cultivo pueden clasificarse en no selectivos o selectivos.
A. Medios no selectivo
El propósito de estos medios es cultivar tantas especies como sea posible y generar, de esta manera, numerosos tipos de colonias bacterianas. Ej: El agar sangre y el agar chocolate
B. Medios selectivos
Incorporan una sustancia que inhibe de manera selectiva el crecimiento de las bacterias irrelevantes. Ej:
Agar MacConkey (que contiene bilis), que selecciona Enterobacteriaceae.
Agar sangre CNA (que contiene colistina y ácido nalidíxico) que selecciona los estafilococos y estreptococos. 
C. Medios diferenciales
Algunas bacterias producen pigmentos característicos y otras se distinguen con base en la producción de enzimas extracelulares.
La actividad de estas enzimas puede identificarse como zonas claras alrededor de las colonias cultivadas en presencia de sustratos insolubles (p. ej., zonas de hemólisis en un agar que contiene eritrocitos). 
Ej:
Las cepas patógenas de Salmonella y Shigella no fermentan lactosa y en el agar MacConkey forman colonias transparentes.
Las cepas de E. coli agar MacConkey forman colonias rojas o rosas. 
2.- Microscopia
La tinción de Gram sumada a la visualización con microscopio de luz, es uno de los métodos que más información ofrece para clasificar bacterias. 
Esta técnica de tinción divide a las bacterias con base en las diferencias en la estructura de sus paredes celulares en:
Gram positivas
Gram negativas
Por microscopia también se puede diferenciar la forma de la bacteria.
3.- Pruebas bioquímicas
Permiten establecer la presencia de funciones metabólicas características y que sirven para agrupar las bacterias en un taxón específico.
Prueba de la oxidasa, sirven para diferenciar a los microorganismos con base en la presencia o ausencia del citocromo C. Su ausencia permite distinguir entre las Enterobacteriaceae y otros bacilos gramnegativos.
Actividad de la catalasa, sirve para diferenciar entre los cocos grampositivos:
Estafilococos son catalasas positivas.
Estreptococos son catalasas negativas. 
Prueba de la coagulasa, cuando se demuestra que un microorganismo es catalasa positivo, la especie se subdivide por medio de esta prueba en:
Coagulasa positiva (Staphylococcus aureus) 
Coagulasa negativa (Staphylococcus epidermidis)
Pruebas bioquímicas convencionales
Pruebas bioquímicas comerciales (galería)
4.- Pruebas inmunológicas
 Permiten identificar serotipos, serogrupos y serovariedades (subtipificación)
La designación “sero” indica el uso de anticuerpos (policlonales o monoclonales) que reaccionan con estructuras específicas de la superficie celular bacteriana (lipopolisacáridos, flagelos, antígenos capsulares). 
Los términos “serotipo”, “serogrupo” y “serovariedad” utilizan la especificidad de estos anticuerpos para subdividir a las cepas de una especie bacteriana. 
Ej:
Vibrio cholerae, se han identificado más de 130 serogrupos por sus diferencias antigénicas en el polisacárido O de sus lipopolisacáridos; sin embargo, sólo los serogrupos O1 y O139 se asocian a cólera epidémica y pandémica.
5.- Diversidad genética
Con el uso de técnicas moleculares como la PCR, campos pulsados, secuenciación núcleotídica es posible identificar la variabilidad genética bacteriana. 
Se analiza:
Perfil de plásmidos.
Análisis de restricción de fragmentos de endonucleasa. 
Análisis de secuencias repetitivas (DNA satélite).
Ribotipificación (RNA ribosómico)
Secuenciación genómica. 
DESCRIPCIÓN DE LAS PRINCIPALES CATEGORÍAS Y GRUPOS DE BACTERIAS
La obra definitiva sobre la organización taxonómica de las bacterias es la última edición del Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology.