Descarga la aplicación para disfrutar aún más
Vista previa del material en texto
Universidad de Guayaquil Facultad de Ciencias Naturales Escuela de Biología I TEXTO GUIA DE GENÉTICA PREFACIO Este trabajo se ha elaborado en torno a la diligencia académica sobre la cátedra de Genética, la misma que se imparte en la Facultad de Ciencias Naturales, Escuela de Biología. Cada capítulo de este contenido pretende ser un blanco sobre los avances de la genética en las presentes y futuras generaciones. El claro entendimiento y la magna comprensión de lo que esta ciencia verdaderamente puede ofrecernos, será fundamental para las decisiones que debamos tomar y los valores que pretendamos defender. En este camino, la ciencia y la filosofía deben trabajar juntas: el tremendo impacto que tendrán los avances de las ciencias a fines a la genética en el mundo venidero, hace hoy imprescindible derribar el muro que las separa. Solo así será posible dar a las nuevas generaciones nuevas razones para creer en la dignidad. GENÉTICA INTRODUCCIÓN. Se considera que la historia de la genética comienza con el trabajo del monje agustino Gregor Mendel. Su investigación sobre hibridación en guisantes, publicada en 1866, describe lo que más tarde se conocería como las leyes de Mendel. El año 1900 marcó el "redescubrimiento de Mendel" por parte de Hugo de Vries, Carl Correns y Erich von Tschermak, y para 1915 los principios básicos de la genética mendeliana habían sido aplicados a una amplia variedad de organismos, donde destaca notablemente el caso de la mosca de la fruta (Drosophila melanogaster). Bajo el liderazgo de Thomas Hunt Morgan y sus compañeros "drosofilistas", los especialistas en genética desarrollaron la teoría mendeliana-cromosómica de la herencia, la cual fue ampliamente aceptada para 1925. Paralelamente al trabajo experimental, los matemáticos desarrollaron el marco estadístico de la genética de poblaciones, y llevaron la interpretación genética al estudio de la evolución. Con los patrones básicos de la herencia genética establecidos, muchos biólogos se volvieron hacia investigaciones sobre la naturaleza física de los genes. En los años cuarenta y a principios de los cincuenta, los experimentos señalaron al ADN como la parte de los cromosomas (y quizás otras nucleproteínas) que contenía genes. El enfoque sobre nuevos organismos modelo tales como virus y bacterias, junto con el descubrimiento en 1953 de la estructura en doble hélice del ADN, marcaron la transición a la era de la genética molecular. En los años siguientes, algunos químicos desarrollaron técnicas para secuenciar tanto a ácidos nucleicos como a proteínas, mientras otros solventaban la relación entre estos dos tipos de biomoléculas: el código genético. La regulación de la expresión génica se volvió un tema central en los años sesenta, y para los años setenta dicha expresión génica podía ser controlada y manipulada utilizando ingeniería genética. Durante lás últimas décadas del siglo XX muchos biólogos se enfocaron a proyectos genéticos a gran escala, secuenciando genomas enteros. HERENCIA GENÉTICA La herencia genética es la transmisión a través del material genético contenido en el núcleo celular, de las características anatómicas, fisiológicas o de otro tipo, de un ser vivo a sus descendientes. El ser vivo resultante tendrá características de uno o de los dos padres. La herencia consiste en la transmisión a su descendencia de los caracteres de los ascendentes. El conjunto de todos los caracteres transmisibles, que vienen fijados en los genes, recibe el nombre de genotipo y su manifestación exterior en el aspecto del individuo el de fenotipo. Se llama idiotipo al conjunto de posibilidades de manifestar un carácter que presenta un individuo. Para que los genes se transmitan a los descendientes es necesaria una reproducción idéntica que dé lugar a una réplica de cada uno de ellos; este fenómeno tiene lugar en la meiosis. Las variaciones que se producen en el genotipo de un individuo de una determinada especie se denominan variaciones genotípicas. Estas variaciones genotípicas surgen por cambios o mutaciones (espontáneas o inducidas por agentes mutagénicos) que pueden ocurrir en el ADN. Las mutaciones que se producen en los genes de las células sexuales pueden transmitirse de una generación a otra. Las variaciones genotípicas entre los individuos de una misma especie tienen como consecuencia la existencia de fenotipos diferentes. Algunas mutaciones producen enfermedades, tales como la fenilcetonuria, galactosemia, anemia http://es.wikipedia.org/wiki/Biomol%C3%A9cula http://es.wikipedia.org/wiki/Genotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Fenotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Meiosis http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/ADN http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/Fenilcetonuria http://es.wikipedia.org/wiki/Fenilcetonuria http://es.wikipedia.org/wiki/Anemia_falciforme falciforme, síndrome de Down, síndrome de Turner, entre otras. Hasta el momento no se ha podido curar una enfermedad genética, pero para algunas patologías se está investigando esta posibilidad mediante la terapia génica. Lo esencial de la herencia queda establecido en la denominada teoría cromosómica de la herencia, también conocida como teoría cromosómica de Sutton y Boveri: Los genes están situados en los cromosomas. Los genes están dispuestos linealmente en los cromosomas. La recombinación de los genes se corresponde con el intercambio de segmentos cromosómicos (Crossing over). La transferencia genética horizontal es factor de confusión potencial cuando se infiere un árbol filogenético basado en la secuencia de un gen. Por ejemplo, dadas dos bacterias lejanamente relacionadas que han intercambiado un gen, un árbol filogenético que incluya a ambas especies mostraría que están estrechamente relacionadas puesto que el gen es el mismo, incluso si muchos de otros genes tuvieran una divergencia substancial. Por este motivo, a veces es ideal usar otras informaciones para inferir filogenias más robustas, como la presencia o ausencia de genes o su ordenación, o, más frecuentemente, incluir el abanico de genes más amplio posible. HEREDABILIDAD En la genética, la heredabilidad es la proporción de la variación fenotípica en una población, atribuible a la variación genotípica entre individuos. La variación entre individuos se puede deber a factores genéticos y/o ambientales. Los análisis de heredabilidad estiman las contribuciones relativas de las diferencias en factores genéticos y no-genéticos a la varianza fenotípica total en una población. Considérese un modelo estadístico para describir algún genotipo particular: Fenotipo (‘’P’’) = Genotipo (‘’G’’) + Ambiente (‘’E’’) TEORÍAS DE MENDEL Las Leyes de Mendel son un conjunto de reglas básicas sobre la transmisión por herencia de las características de los organismos padres a sus hijos. Estas reglas básicas de herencia constituyen el fundamento de la genética. Las leyes se derivan del trabajo realizado por Gregor Mendel publicado en el año 1865 y el 1866, aunque fue ignorado por largo tiempo hasta su redescubrimiento en 1900. La historia de la ciencia encuentra en la herencia mendeliana un hito en la evolución de la biología sólo comparable con las Leyes de Newton en el desarrollo de la Física. Tal valoración se basa en el hecho de que Mendel fue el primero en formular con total precisión una nueva teoría de la herencia, expresada en lo que luego se llamaría "Leyes de Mendel", que se enfrentaba a la poco rigurosa teoría de la herencia por mezcla de sangre. Esta teoría aportó a los estudios biológicos las nociones básicas de la genética moderna. No obstante, no fue sólo su trabajo teórico lo que brindó a Mendel su envergadura científica a los ojos de la posteridad; no menos notables han sido los aspectos epistemológicos y metodológicosde su investigación. El reconocimiento de la importancia de una experimentación rigurosa y sistemática, y la expresión de los resultados observacionales en forma cuantitativa mediante el recurso a la estadística ponían de manifiesto una postura epistemológica totalmente novedosa para la biología de la época. Por esta razón, la figura de Mendel suele ser concebida como el ejemplo paradigmático del científico que, a partir de la meticulosa observación libre de prejuicios, logra inferir inductivamente sus leyes, que en el futuro constituirían los fundamentos de la genética. De este modo se ha integrado el trabajo de Mendel a la enseñanza de la biología: en los textos, la teoría mendeliana aparece constituida por las famosas dos leyes, concebidas como generalizaciones inductivas a partir de los datos recogidos a través de la experimentación. 1ª LEY DE MENDEL: LEY DE LA UNIFORMIDAD. - Establece que si se cruzan dos razas puras para un determinado carácter, los descendientes de la primera generación serán todos iguales entre sí fenotípica y genotípicamente e iguales fenotípicamente a uno de los progenitores. 2ª LEY DE MENDEL: LEY DE LA SEGREGACIÓN.- Conocida también, en ocasiones como la primera Ley de Mendel, de la segregación equitativa o disyunción de los alelos. Esta ley establece que durante la formación de los gametos y cada alelo de un par se separa del otro miembro para determinar la constitución genética del gameto filial. Es muy habitual representar las posibilidades de hibridación mediante un cuadro de Punnett. http://es.wikipedia.org/wiki/S%C3%ADndrome_de_Down http://es.wikipedia.org/wiki/S%C3%ADndrome_de_Down http://es.wikipedia.org/wiki/Terapia_g%C3%A9nica http://es.wikipedia.org/wiki/Teor%C3%ADa_cromos%C3%B3mica_de_Sutton_y_Boveri http://es.wikipedia.org/wiki/Teor%C3%ADa_cromos%C3%B3mica_de_Sutton_y_Boveri http://es.wikipedia.org/wiki/Crossing_over http://es.wikipedia.org/wiki/Transferencia_gen%C3%A9tica_horizontal http://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81rbol_filogen%C3%A9tico http://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81cido_desoxirribonucleico http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/Herencia_gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Gregor_Mendel http://es.wikipedia.org/wiki/1865 http://es.wikipedia.org/wiki/1866 http://es.wikipedia.org/wiki/Tiempo http://es.wikipedia.org/wiki/1900 http://es.wikipedia.org/wiki/Historia_de_la_ciencia http://es.wikipedia.org/wiki/Leyes_de_Newton http://es.wikipedia.org/wiki/Leyes_de_Newton http://es.wikipedia.org/wiki/F%C3%ADsica http://es.wikipedia.org/wiki/Herencia_gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Epistemolog%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Metodolog%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Estad%C3%ADstica http://es.wikipedia.org/wiki/Razonamiento_inductivo http://es.wikipedia.org/wiki/H%C3%ADbrido_%28biolog%C3%ADa%29 http://es.wikipedia.org/wiki/Cuadro_de_Punnett Mendel obtuvo esta ley al cruzar diferentes variedades de individuos heterocigotos (diploides con dos variantes alélicas del mismo gen: Aa), y pudo observar en sus experimentos que obtenía muchos guisantes con características de piel amarilla y otros (menos) con características de piel verde, comprobó que la proporción era de 3:4 de color amarilla y 1:4 de color verde (3:1) . Según la interpretación actual, los dos alelos, que codifican para cada característica, son segregados durante la producción de gametos mediante una división celular meiótica. Esto significa que cada gameto va a contener un solo alelo para cada gen. Lo cual permite que los alelos materno y paterno se combinen en el descendiente, asegurando la variación. Para cada característica, un organismo hereda dos alelos, uno de cada pariente. Esto significa que en las células somáticas, un alelo proviene de la madre y otro del padre. Éstos pueden ser homocigotos o heterocigotos. 3ª LEY DE MENDEL: LEY DE LA RECOMBINACIÓN INDEPENDIENTE DE LOS FACTORES.- En ocasiones es descrita como la 2ª Ley. Mendel concluyó que diferentes rasgos son heredados independientemente unos de otros, no existe relación entre ellos, por lo tanto el patrón de herencia de un rasgo no afectará al patrón de herencia de otro. Sólo se cumple en aquellos genes que no están ligados (en diferentes cromosomas) o que están en regiones muy separadas del mismo cromosoma. Es decir, siguen las proporciones 9:3:3:1. PATRONES DE HERENCIA MENDELIANA.- Mendel describió dos tipos de "factores" (genes) de acuerdo a su expresión fenotípica en la descendencia, los dominantes y los recesivos, pero existe otro factor a tener en cuenta en organismos dioicos y es el hecho de que los individuos de sexo femenino tienen dos cromosomas X (XX) mientras los masculinos tienen un cromosoma X y uno Y (XY), con lo cual quedan conformados cuatro modos o "patrones" según los cuales se puede trasmitir una mutación simple: Gen dominante ubicado en un autosoma (herencia autosómica dominante). Gen recesivo ubicado en un autosoma (herencia autosómica recesiva). Gen dominante situado en el cromosoma X (herencia dominante ligada al cromosoma X). Gen recesivo situado en el cromosoma X (herencia recesiva ligada al cromosoma X). En experimentos de cruza realizados entre 1856 y 1863, Gregor Mendel trazó por primera vez los patrones hereditarios de ciertos rasgos en plantas de guisante y mostró que obedecían a reglas estadísticas sencillas. A pesar de que no todas las características muestran los patrones de la herencia mendeliana, su trabajo sirvió como prueba de que la aplicación de estadística a la herencia podía ser sumamente útil. A partir de esa época muchas formas más complejas de herencia han sido demostradas. A partir de su análisis estadístico, Mendel definió un concepto al que llamó alelo, al cual concibió como la unidad fundamental de la herencia. Esta utilización del término alelo es casi un sinónimo del contemporáneo término gen. Sin embargo, en la actualidad alelo indica a una variante específica de un gen en particular. El trabajo de Mendel se publicó en 1866 bajo el título Experimentos sobre hibridación de plantas (en alemán: "Versucheüber Pflanzenhybriden") en las Actas de la Sociedad de Historia Natural de Brno (en alemán: Verhandlungen des Naturforschendenzu Brünn), después de haberlo dado a conocer en dos conferencias de la misma sociedad a principios de 1865. ACCIÓN GENÉTICA Las Leyes de Mendel han demostrado ser válidas a lo largo del espectro eucariota y constituyen la base para predecir los resultados de apareamientos simples. Pero el mundo real de los genes y de los cromosomas es mucho más complejo de lo que sugieren las Leyes de Mendel y las extensiones y excepciones son abundantes. Estas diferencias no invalidan las leyes, sino que demuestran que existen otras situaciones debidas a la complejidad génica. Como regla general, a partir de las leyes de la Segregación y de la Distribución Independiente, las proporciones fenotípicas esperadas a partir de un apareamiento entre monohíbridos y dihíbridos son respectivamente 3:1 y 9:3:3:1 así como también la proporción fenotípica esperada de la cruza de prueba a un heterocigota es 1:1 y la proporción fenotípica esperada de la cruza de prueba a un dihíbrido es 1:1:1:1. Estas proporciones provienen de la segregación de dos alelos distintos para cada uno de los pares de genes, existiendo entre ellos dominancia y recesividad. Sin embargo, además de estas proporciones, otros experimentos han puesto de manifiesto la aparición de fenotipos en proporciones nuevas que no se pueden explicar basándose en la dominancia completa. La causa de variación de http://es.wikipedia.org/wiki/Heterocigotos http://es.wikipedia.org/wiki/Gameto http://es.wikipedia.org/wiki/Descendencia http://es.wikipedia.org/wiki/Dioico http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n las proporciones clásicas que se tratan en esta sección es la debida a las distintasformas en que pueden interactuar los genes, alelos o no alelos, influidos por los distintos tipos de acción génica: no aditiva o aditiva. ALELO.- Un alelo (del griego: αλλήλων, allélon: uno a otro, unos a otras) es cada una de las formas alternativas que puede tener un gen que se diferencian en su secuencia y que se puede manifestar en modificaciones concretas de la función de ese gen. Al ser la mayoría de los mamíferos diploides estos poseen dos cromosomas, uno de ellos procedente del padre y el otro de la madre. Cada par de alelos se ubica en igual locus o lugar del cromosoma. Por alelo debe entenderse el valor de dominio que se otorga a un gen cuando rivaliza contra otro gen por la ocupación de posición final en los cromosomas durante la separación que se produce durante la meiosis celular. De ese valor de dominación del alelo procreador resultará la trasmisión, idéntica o distinta, de la copia o serie de copias del gen procreado. De acuerdo con esa potencia, un alelo puede ser dominante y expresarse en consecuencia en el hijo solamente con una de las copias procreadoras, por lo tanto si el padre o la madre lo poseen el cromosoma del hijo lo expresará siempre; o bien puede ser un alelo recesivo, por lo tanto se necesitarán dos copias del mismo gen, dos alelos, para que se exprese en el cromosoma procreado, esto es, deberá ser provisto al momento de la procreación por ambos progenitores. El concepto de alelo se entiende a partir de la palabra alelomorfo (en formas alelas) es decir, algo que se presenta de diversas formas dentro de una población de individuos ACCIÓN GÉNICA NO ADITIVA.- Cuando un cierto efecto fenotípico resulta de la interacción de los alelos de un gen o de dos o más pares de genes pertenecientes a distintos loci se denomina Acción Génica no Aditiva. Este tipo de acción génica es responsable de los caracteres o rasgos cualitativos, es decir, aquéllos que no pueden ser medidos y presentan una variación discontinua (se clasifican en categorías o clases); y que además son poco influenciados por el ambiente. a) INTRALOCUS o INTRAGÉNICA Son las interacciones que ocurren entre los alelos de un locus. a.1.- DOMINANCIA COMPLETA: En este tipo de acción el heterocigota, si bien distinto genéticamente que uno de los homocigotas tiene el mismo fenotipo y la presencia del gen recesivo queda enmascarado, expresándose únicamente en estado homocigota. · Las proporciones clásicas en caso del apareamiento de dos heterocigotas son: Fenotípica : 3:1 Genotípica : 1:2:1 En el caso de una cruza de prueba a un heterocigota las proporciones son: Fenotípica: 1:1 Genotípica: 1:1 a.2.- DOMINANCIA INCOMPLETA.- El individuo heterocigota o descendiente de dos líneas puras presenta para el carácter en estudio una intensidad intermedia. Es decir, el heterocigota presenta un fenotipo diferente al de los homocigotas. Para simbolizar los alelos con este tipo de acción génica se utiliza una letra base que será igual para ambos alelos, representándose el alelo dominante incompleto con una letra mayúscula como exponente de la letra base y la misma letra en minúscula como exponente de la letra base el alelo recesivo incompleto. Las proporciones clásicas en caso del apareamiento de dos heterocigotas son: Fenotípica : 1:2:1 Genotípica : 1:2:1 En el caso de una cruza de prueba a un heterocigota las proporciones son: Fenotípica: 1:1 http://es.wikipedia.org/wiki/Idioma_griego http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/Diploide http://es.wikipedia.org/wiki/Locus http://es.wikipedia.org/wiki/Cromosoma http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/Cromosomas http://es.wikipedia.org/wiki/Meiosis http://es.wikipedia.org/wiki/Cromosoma Genotípica: 1:1 a.3.- CODOMINANCIA.- En este tipo de acción génica el heterocigota muestra los efectos fenotípicos de ambos alelos. Para simbolizarlo se utiliza una letra base que será igual para ambos alelos con una letra mayúscula diferente como exponente de la letra base. · Las proporciones clásicas en caso del apareamiento de dos heterocigotas son: Fenotípica : 1:2:1 Genotípica : 1:2:1 En el caso de una cruza de prueba a un heterocigota ( en este caso será con cualquiera de los dos genotipos homocigóticos) las proporciones son: Genotípica: 1:1 Fenotípica: 1:1 a.4.- SOBREDOMINANCIA.- En los casos en que existe esta interacción, la manifestación fenotípica del individuo heterocigota medido cuantitativamente no es igual o intermedia a las homocigotas. En ocasiones el heterocigota es superior al promedio fenotípico entre ambas líneas homocigotas progenitoras. Esta superioridad se manifiesta fundamentalmente en caracteres cuantificables: la sobredominancia es una de las bases del denominado “vigor híbrido”. b) INTERLOCI O INTERGÉNICA.- Este tipo de interacciones son las que ocurren entre genes no alelos(de distintos loci), que pueden estar situados en un mismo o en distintos grupos de ligamiento. b.1) INTERACCIONES EPISTÁTICAS: Es la interacción que se produce entre dos o más pares de genes que no son alelos y en la cual los alelos de un locus o gen enmascaran o inhiben la acción de los alelos de otro locus o gen. Se denomina “epistático” al gen que modifica la expresión del gen del otro locus y se denomina “hipostático” al gen que es modificado. La proporción clásica de 9:3:3:1 observada en la descendencia de progenitores dihíbridos se modifica cuando opera la epístasis, el número de fenotipos que aparecen en la descendencia a partir de progenitores dihíbridos será menor de cuatro y puede presentar tres o dos fenotipos. POLIMORFISMO GENÉTICO El polimorfismo genético hace referencia a la existencia en una población de múltiples alelos de un gen. Es decir, un polimorfismo es una variación en la secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos de una población. Aquellos polimorfismos que afectan a la secuencia codificante o reguladora y que producen cambios importantes en la estructura de la proteína o en el mecanismo de regulación de la expresión, pueden traducirse en diferentes fenotipos (por ejemplo, el color de los ojos). Un polimorfismo puede consistir en la sustitución de una simple base nitrogenada (por ejemplo, la sustitución de una A (adenina) por una C (citosina) o puede ser más complicado (por ejemplo, la repetición de una secuencia determinada de ADN, donde un porcentaje de individuos tenga un determinado número de copias de una determinada secuencia). Los cambios poco frecuentes en la secuencia de bases en el ADN no se llaman polimorfismos, sino más bien mutaciones. Para que verdaderamente pueda considerarse un polimorfismo, la variación debe aparecer en al menos el 1% de la población. http://es.wikipedia.org/wiki/Poblaci%C3%B3n_biol%C3%B3gica http://es.wikipedia.org/wiki/Alelo http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/ADN http://es.wikipedia.org/wiki/Fenotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Base_nitrogenada http://es.wikipedia.org/wiki/Adenina http://es.wikipedia.org/wiki/Citosina http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n ALELOS MÚLTIPLES Muchos genes tienen más de dos alelos (si bien un individuo diploide solo puede tener dos alelos por cada gen). Los alelos múltiples se originan de diferentes mutaciones sobre un mismo gen. El sistema ABO para tipificar la sangre humana es un ejemplo de alelos múltiples. El tipo de sangre humana está determinado por los alelos A, B y O. A y B son codominantes sobre el O. El único genotipo posible para una persona de tipo O es OO. Los de tipo A pueden tener un genotipo AA o AO. El tipo B, genotipo BB o BO. El tipo AB tiene solo el genotipo (heterocigoto). Los alelos A y B del gen producen diferentes glicoproteínas (antígenos) en la superficie de cada célula. Los homocigotas para A producenel antígeno A, los de B solo los del B, los del AB ambos y los homocigotas para él O, ninguno. GENES LETALES Los genes, los cuales están sometidos a procesos de mutación y otros procesos de reorganización que provocan un cambio en la expresión fenotípica de éstos, se presentan en diferentes formas con unas variaciones en su secuencia denominadas alelos. Cada alelo codifica un fenotipo concreto, es decir, es el resultado de la expresión del alelo del gen. Cuando la expresión de un alelo concreto provoca un cambio en el individuo, tal que induce su muerte, se denomina alelo letal, y el gen involucrado se denomina gen esencial. Se define entonces gen esencial como aquel gen que al mutar puede provocar un fenotipo letal. Un gen letal es por tanto un gen cuya expresión produce la muerte del individuo antes de que este llegue a la edad reproductora. Si la expresión de un gen en vez de causar la muerte del individuo causa un acortamiento de su ciclo biológico, un empeoramiento de su calidad de vida o algún daño en su organismo, se denomina gen deletéreo. Al igual que el resto de los genes, los alelos de los genes letales así como los de los deletéreos, sus variables, pueden tener un carácter recesivo o dominante. GEN PLEIOTRÓPICO: Al gen que afecta más de un fenotipo se le llama pleiotrópico. En general muchos genes presentan plagiotropismo. HERENCIA LIGADA AL SEXO Es la herencia con el par sexual. El cromosoma X porta numerosos genes en tanto el cromosoma Y tan solo unos pocos y la mayoría en relación con la masculinidad. El cromosoma X es común para ambos sexos, pero solo el hombre posee cromosoma Y. CUADRO DE PUNNETT El cuadro de Punnett es un diagrama diseñado por Reginald Punnett y es usado por los biólogos para determinar la probabilidad de que un producto tenga un genotipo particular. El cuadro de Punnett permite observar cada combinación posible de un alelo materno con otro alelo paterno por cada gen estudiado. http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/genet2.htm#mutaciones http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/genet2.htm#genotipo http://www.efn.uncor.edu/dep/biologia/intrbiol/genet2.htm#Ant%C3%ADgenos http://es.wikipedia.org/wiki/Genes http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n http://es.wikipedia.org/wiki/Alelos http://es.wikipedia.org/wiki/Alelo http://es.wikipedia.org/wiki/Fenotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Alelo http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/Reginald_Punnett http://es.wikipedia.org/wiki/Biolog%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Probabilidad http://es.wikipedia.org/wiki/Genotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Alelo http://es.wikipedia.org/wiki/Gen Cabe señalar que el cuadro de Punnett solo muestra las posibilidades para genotipos, no para fenotipos. La forma en que los alelos B y b interactúan uno con el otro afectando la apariencia del producto depende de cómo interactúen los productos de los genes (véanse las leyes de Mendel). Para los genes clásicos dominantes/recesivos, como los que determinan el color del pelo de una rata, siendo B el pelo negro y b el pelo blanco, el alelo dominante eclipsará al recesivo. GENES INFLUENCIADOS POR EL SEXO En este caso los genes se expresan de manera diferente en machos y hembras probablemente por la influencia de las hormonas en su expresión. Uno de los ejemplos clásicos son los genes que determina el plumaje en algunas aves, donde el color es mucho más llamativo en los machos que en las hembras. Otro ejemplo muy conocido es el de los Cuernos en las Ovejas. El gen que codifica para la presencia de cuernos es Dominante en Machos pero recesivo en hembras. Por ello solo las hembras homocigotas podrás ser astadas (con cuernos) en cambio los machos tendrán cuernos sean Homocigotas o heterocigotas. MUTACIÓN La mutación en genética y biología, es una alteración o cambio en la información genética (genotipo) de un ser vivo y que, por lo tanto, va a producir un cambio de características, que se presenta súbita y espontáneamente, y que se puede transmitir o heredar a la descendencia. La unidad genética capaz de mutar es el gen que es la unidad de información hereditaria que forma parte del ADN. En los seres multicelulares, las mutaciones sólo pueden ser heredadas cuando afectan a las células reproductivas. Una consecuencia de las mutaciones puede ser una enfermedad genética, sin embargo, aunque en el corto plazo puede parecer perjudicial, a largo plazo las mutaciones son esenciales para nuestra existencia. Sin mutación no habría cambio y sin cambio la vida no podría evolucionar. MUTACIONES CROMOSÓMICAS Las mutaciones cromosómicas son modificaciones en el número total de cromosomas, la duplicación o supresión de genes o de segmentos de un cromosoma y la reordenación del material genético dentro o entre cromosomas. Pueden ser vistas al microscopio, sometiendo a los cromosomas a la “técnica de bandas”. De esta manera se podrá confeccionar el cariotipo. TIPOS DE MUTACIÓN Mutación somática: es la que afecta a las células somáticas del individuo. Como consecuencia aparecen individuos mosaico que poseen dos líneas celulares diferentes con distinto genotipo. Una vez que una célula sufre una mutación, todas las células que derivan de ella por divisiones mitóticas heredarán la mutación (herencia celular). Un individuo mosaico originado por una mutación somática posee un grupo de células con un genotipo diferente al resto, cuanto antes se haya dado la mutación en el desarrollo del individuo mayor será la proporción de células con distinto genotipo. En el supuesto de que la mutación se hubiera dado después de la primera división del cigoto (en estado de dos células), la mitad de las células del individuo adulto tendrían un genotipo y la otra mitad otro distinto. Las mutaciones que afectan solamente a las células de la línea somática no se transmiten a la siguiente generación. Mutaciones en la línea germinal: son las que afectan a las células productoras de gametos apareciendo, de este modo, gametos con mutaciones. Estas mutaciones se transmiten a la siguiente generación y tienen una mayor importancia desde el punto de vista evolutivo. MUTACIONES GÉNICAS O MOLECULARES Son las mutaciones que alteran la secuencia de nucleótidos del ADN. Estas mutaciones pueden llevar a la sustitución de aminoácidos en las proteínas resultantes (se denominan mutaciones no sinónimas). Un cambio en un solo aminoácido puede no ser importante si es conservativo y ocurre fuera del sitio activo de la proteína. Así, existen las denominadas mutaciones sinónimas o "mutaciones silenciosas" en las que la mutación altera la base situada en la tercera posición del codón pero no causa sustitución aminoacídica debido a la redundancia del código genético. El aminoácido insertado será el mismo que antes de la mutación. http://es.wikipedia.org/wiki/Fenotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Leyes_de_Mendel http://es.wikipedia.org/wiki/Gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Biolog%C3%ADa http://es.wikipedia.org/wiki/Genotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Ser_vivo http://es.wikipedia.org/wiki/Gen http://es.wikipedia.org/wiki/ADN http://es.wikipedia.org/wiki/Enfermedad_gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Cariotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n_som%C3%A1tica http://es.wikipedia.org/wiki/Gameto http://es.wikipedia.org/wiki/Mutaci%C3%B3n_g%C3%A9nica http://es.wikipedia.org/wiki/Nucle%C3%B3tido http://es.wikipedia.org/wiki/Cod%C3%B3n También, en el caso de las mutaciones neutras, el aminoácido insertado es distinto pero con unas propiedades fisicoquímicas similares, por ejemplo la sustitución de glutámico por aspártico puede no tener efectos funcionales en la proteína debido a que los dos son ácidos y similares en tamaño. También podrían considerarse neutras aquellas mutaciones que afecten a zonas del genoma sin función aparente, como las repeticiones en tándemo dispersas, las zonas intergénicas y los intrones. De lo contrario, la mutación génica o también llamada puntual, puede tener consecuencias severas, como por ejemplo: La sustitución de valina por ácido glutámico en la posición 6 de la cadena polipéptidica de la beta-globina da lugar a la enfermedad anemia falciforme en individuos homocigóticos debido a que la cadena modificada tiene tendencia a cristalizar a bajas concentraciones de oxígeno. Las proteínas del colágeno constituyen una familia de moléculas estructuralmente relacionadas que son vitales para la integridad de muchos tejidos incluidos la piel y los huesos. La molécula madura del colágeno está compuesta por 3 cadenas Polipeptídicas unidas en una triple hélice. Las cadenas se asocian primero por su extremo C-terminal y luego se enroscan hacia el extremo N-terminal. Para lograr este plegado, las cadenas de colágeno tienen una estructura repetitiva de 3 aminoácidos: glicina - X - Y (X es generalmente prolina y Y puede ser cualquiera de un gran rango de aminoácidos). Una mutación puntual que cambie un solo aminoácido puede distorsionar la asociación de las cadenas por su extremo C-terminal evitando la formación de la triple hélice, lo que puede tener consecuencias severas. Una cadena mutante puede evitar la formación de la triple hélice, aun cuando haya 2 monómeros de tipo salvaje. Al no tratarse de una enzima, la pequeña cantidad de colágeno funcional producido no puede ser regulada. La consecuencia puede ser la condición dominante letal osteogénesis imperfecta. APLICACIÓN AL MEJORAMIENTO GENÉTICO El mejoramiento genético es el arte y la ciencia de incrementar el rendimiento o la productividad, la resistencia a agentes abióticos y bióticos adversos, la belleza, la calidad o el rango de adaptación de las especies animales y vegetales domésticas por medio de los cambios en el genotipo (la constitución genética) de los individuos. Como disciplina científica está basada en las leyes de la herencia, la genética cuantitativa y la genética de poblaciones. El rendimiento y la productividad hacen referencia al peso por unidad de superficie de un determinado bien para consumo humano que sea producido por una planta o un animal. Así, la cantidad de toneladas de grano de maíz producido por una hectárea de ese cultivo es el rendimiento del maíz. La cantidad de leche que una vaca provee diariamente es la productividad de ese animal. Los agentes bióticos adversos a los que hace referencia la definición son todas las plagas o enfermedades (insectos dañinos, hongos, bacterias y virus perjudiciales) que tienden a deprimir, a disminuir el rendimiento o la productividad de cultivos y animales domésticos. Los agentes abióticos adversos son todas las variables del tiempo, del clima y del suelo que tienden también a reducir el rendimiento o productividad, como por ejemplo el exceso de sales en los suelos o en el agua para beber, el calor o frío extremo, las deficiencias hídricas. La calidad hace referencia a las cualidades del producto final que se consume. Pueden ser organolépticas como en el caso de frutas y verduras; cuantitativas como el porcentaje de proteína en trigo o el contenido de grasa butirométrica en el ganado lechero o, incluso puede estar relacionada con la vida media del producto luego de la cosecha (como por ejemplo, la vida media de las flores en una variedad de tulipán). GENÓMICA La genómica es el campo de la genética que intenta comprender el contenido, la organización, la función y la evolución de la información genética contenidos en el genoma completo. Su principal objetivo de estudio es la caracterización molecular de los genomas completos. La genómica integra las disciplinas tradicionales: citología, genética mendeliana, cuantitativa, molecular, de poblaciones y nuevas disciplinas como la bioinformática. Para identificar y cartografiar de manera sistemática todos los genes del genoma de un organismo se procedió a: Identificar mutaciones espontáneas o generar colecciones de mutantes usando agentes químicos o físicos. Generar mapas genéticos mediante análisis de ligamiento utilizando las cepas mutantes. Genómica incluye diversos campos: Genómica Estructural, Genómica Funcional, Genómica Comparativa La Genómica Estructural incluye la construcción de los datos de la secuencia del genoma, el descubrimiento de los genes y su localización y la construcción de mapas genéticos. La Genómica Funcional estudia la función biológica de los genes, su regulación y sus productos. La Genómica Comparativa compara secuencias de genes y proteínas de diferentes genomas para elucidar las relaciones funcionales y evolutivas. http://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81cido_glut%C3%A1mico http://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81cido_asp%C3%A1rtico http://es.wikipedia.org/wiki/Valina http://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81cido_glut%C3%A1mico http://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Beta-globina&action=edit&redlink=1 http://es.wikipedia.org/wiki/Anemia_falciforme http://es.wikipedia.org/wiki/Col%C3%A1geno http://es.wikipedia.org/wiki/Prolina http://es.wikipedia.org/wiki/Rendimiento http://es.wikipedia.org/wiki/Productividad http://es.wikipedia.org/wiki/Genotipo http://es.wikipedia.org/wiki/Herencia_gen%C3%A9tica http://es.wikipedia.org/wiki/Gen%C3%A9tica_cuantitativa http://es.wikipedia.org/wiki/Gen%C3%A9tica_de_poblaciones http://es.wikipedia.org/wiki/Hongos http://es.wikipedia.org/wiki/Hongos http://es.wikipedia.org/wiki/Virus http://es.wikipedia.org/wiki/Tulip%C3%A1n GENÓMICA ESTRUCTURAL La Genómica estructural se ocupa de la secuenciación y la comprensión del contenido del genoma. A menudo, uno de los primeros pasos en la caracterización de un genoma es preparar mapas genéticos y físicos de sus cromosomas. Estos mapas proporcionan información sobre las localizaciones relativas de genes, los marcadores moleculares y los segmentos cromosómicos, que suelen ser esenciales para posicionar los segmentos cromosómicos y alinear tramos del ADN secuenciado en una secuencia del genoma completo. GENÉTICA MOLECULAR Las funciones sustantivas de los ácidos nucleicos consisten en el almacenamiento, transmisión y expresión de la información genética, estos tres procesos se resumen en un principio que se conoce como el Dogma Central, propuesto por Francis Crick en 1957. Este principio establece que en los seres vivos la información genética siempre fluye del DNA al RNA a las PROTEÍNAS. Este flujo de información, se puede dividir en tres pasos, primero la Replicación que consiste en la síntesis de DNA, copiando la información de si mismo, después la Transcripción que consiste en transferir la información del DNA sintetizando RNA, y por último la Traducción en la que la información del mRNA se usa para sintetizar proteínas. Posteriormente se añadió al esquema un cuarto proceso, la Transcripción Inversa o Retrotranscripción, en la cual la información genética, que se encuentra como RNA en los retrovirus, se utiliza para sintetizar DNA, antes de que pueda expresarse en las células infectadas. Replicación El primer paso del flujo de información genética, consiste en la síntesis de DNA copiando la información de DNA, este proceso lo llevan a cabo un conjunto de enzimas conocidas como polimerasas de DNA (DNApol), dependientes de DNA. En procariotes existen tres variedades conocidas como DNApol I, II y III, en eucariotes se han descrito al menos cinco tipos, conocidos como DNApol A ó , B ó , C ó , D ó y E o . Todas esta enzimas requieren un molde de DNA para copiar, desoxinucleótidos trifosfato de Timina, Adenina, Guanina y Citosina, y un oligonucleótido iniciador con un extremo 3’ libre, ya que no pueden iniciar la síntesis. Todas las DNApol lee el DNA molde a partir del extremo 3’ y avanzando hacia 5’ (leen en dirección 3’- 5’) y sintetizanlas nuevas cadenas uniendo al extremo 3’-OH libre del iniciador, el fosfato en 5’ de un nuevo nucleótido mediante un enlace éster (sintetizan en dirección 5’-3’). La replicación se inicia con la separación de las dos hebras de DNA, mediada por la enzima DNA helicasa, que cataliza la reacción de desenrollamiento de las dos hebras de DNA consumiendo ATP. La tensión generada por el desenrrollamiento de la doble hélice se elimina con la DNA girasa, una enzima del grupo de topoisomerasas II, que actúa, cortando un enlace ester de una cadena y volviendo a formarlo, después de que se liberó la tensión. Las dos hebras simples del DNA abierto, se mantienen separadas por acción de “proteínas estabilizadoras del DNA de cadena simple” (single strand DNA bindig proteins, SSB).A las cadenas simples de DNA se une la RNA polimerasa iniciadora, en procariotes y la DNA-pol A ó , en eucariotes, que también es una RNApol. Ambas enzimas son capaces de iniciar la síntesis de novo de polinucleótidos. Estas enzimas copia la fibra sencilla de DNA, comenzando en el extremo 3’ y sintetiza un pequeño fragmento de RNA llamado primer, iniciador o cebador, que crece en dirección 5’ a 3’. En procariotes el RNA iniciador tiene entre 50 y 100 nucleótidos y en eucariotes alrededor de 10. Una vez sintetizado el RNA iniciador, entra en acción la polimerasa de DNA, en procariotes DNApol III y en eucariotes DNApol podría iniciar la síntesis de un fragmento de 10 a 15 desoxinucleótidos y pasado este punto, su lugar lo ocupa la DNApol D ó , que se encarga de la mayor parte de la síntesis. En form alterna, se ha propuesto que la DNApol γ sustituye a la DNApol α para sintetizar todo el DNA, después de que esta a sintetizado el RNA iniciador. Ambas enzimas copian el DNA molde en dirección 3’ a 5’ y nen al extremo 3’-OH libre de la cadena en crecimiento, el fosfato en 5’ de un nuevo desoxinucleótido mediante un enlace éster. Para iniciar la síntesis, la DNApol III de procariotes requiere de una proteína llamada copolimerasa III y ATP, pero una vez iniciada la síntesis se liberan ambas moléculas Las polimerasa activa está formada por un dímero, una de las enzimas producen una hebra continua, sobre el molde de DNA con dirección 3’ a 5’, y la otra sintetiza la hebra en forma discontínua sobre el molde con dirección 5’ a 3’; la hebra discontinua está formada por los llamados fragmentos de Okazaky, que son oligonucleótidos con RNA en el extremo 5’ y DNA en el 3’. Los fragmento de Okazaky en procariotes tienen alrededor de 50 nucleótidos de RNA y de 400 a 2000 de DNA mientras que en eucariotes tiene 10 de RNA y de 100 a 150 de DNA. Para eliminar el RNA de los fragmentos de Okazaky y completar la síntesis de la cadena de DNA se necesitan dos enzimas más, primero, la DNApol I de procariotes o la DNApol α de eucariotes, actuando como exonucleasas, eliminan el RNA iniciador a partir del extremo 5’, hidrolizando el enlace 3’-fosfato y liberando nucléosidos-5’-monofosfato para formar un oligonucleótido de DNA con fosfato en el exterme 5’, después, a partir del extremo 3’ libre más cercano, llenan el hueco en la cadena con desoxirribonucleótidos. Las polimerasas de DNA solo forman enlaces al copiar el molde, por lo que no pueden formar el enlace entre el extremo 5’ fosfato del oligonucleótido que ya estaba presente y el 3’ que están sintetizando, para ello se necesita la nzima DNA ligasa que toma el AMP del NAD en procariotes o del ATP en eucariotes, uniéndolo a un resto de Lisina y liberando un mononucleótido de nicotinamida en procariotes y pirofosfato en eucariotes. Depués, la enzima transfiere el ATP al fosfato del extremo 5’ del nick’, para activarlo. Finalmente, la eliminación del Adenilato promueve la formación del enlace ester con el OH del extremo 3’ (Adjunto). La acción continua de estas enzimas permite la síntesis de dos hélices de DNA idénticas a la original, cada una de ellas formada por una cadena del DNA original y otra recién sintetizada, por esta razón se dice que la replicación es “semiconservadora”o “semiconservativa”. Una vez terminada la doble hélice es necesario darle nuevamente su estructura terciaria mediante superenrollamiento, en procariotes existe otra enzima, la DNA girasa que se encarga del proceso utilzando ATP. En los eucariotes intervienen las histonas para formar los nucleosomas que son la base de la estructura de la cromatina y los cromosomas. Una diferencia más en la replicación entre procariotes y eucariotes, es que los primeros generalmente presentan un sólo sitio de iniciación para la replicación de su cromosoma único, mientras que los eucariotes tienen varios en cada uno de los suyos. Transcripción La síntesis de RNA dependiente de DNA, la llevan a cabo las polimerasas de RNA (RNApol). En procariotes existe solo una mientras que en eucariotes hay 3, la primera o RNApol 1, se encuentra en el nucleolo y se encarga de sintetizar rRNA y el RNA heterogéneo nuclear (nhRNA). Las otras dos se encuentran en el nucleoplasma, la RNApol 2, que sintetiza principalmente el mRNA y la RNApol 3, para sintetizar tRNA y la fracción 5s de rRNA. Debido a que todos los RNA de las células son cadenas sencillas, mientras que el DNA tiene doble cadena, resulta claro que solo una de las dos cadenas del DNA se transcribe, a esta cadena se le conoce como cadena molde y a la otra como cadena codificadora o codificante. En procariotes la RNApol requiere de el sitio de iniciación de la transcripción y una vez iniciada esta, se separa. Las RNApol de eucariotes no tienen este requerimiento, el reconocimiento de las secuencias de iniciación lo efectúan varias proteínas, una para cada tipo de secuencia (TATA, GC, CAT, GAG, etc.) Todas las RNApol requieren ribonucleótidos trifosfato y una cadena doble de DNA; todas copian la cadena de DNA leyendo en dirección 3’ a 5’ y sintetizan el RNA en dirección 5’ a 3’. La transcripción termina cuando se llega a una secuencia de terminación. En procariotes estas secuencias son para cada polimerasa, pero no requieren factores. Los activadores y posiblemente los represores se comunican con los factores basales a través de los coactivadores, los cuales se asocian formando un complejo con la proteína de unión a la caja TATA, que es el primero de los coactivadores que se une al gene regulador en el sitio promotor. Una vez terminada la síntesis, las cadenas de RNA pasan por un proceso de edición, para adquirir su forma activa. Los rRNA se cortan a sus tamaños correspondientes y se metilan algunas bases. En el proceso de recorte del rRNA se han descrito mecanismos de autohidrólisis, en los que las cadenas de RNA facilitan su propio rompimiento. Esta propiedad parece ser característica de algunas secuencias de nucleótidos. Los tRNA también son recortados al tamaño adecuado y sus bases modificadas en el núcleo, la terminación 3’-CCA, la añade una enzima en el citoplasma. Los mRNA de eucariotes están formados por dos o más secuencias codificadoras, que se traducen a proteínas, llamadas exones, separadas por secuencias insertadas no codificadoras o intrones, que deben ser eliminados antes de que se sinteticen las proteínas; no existen intrones en el genoma de procariotes. El proceso de eliminación de intrones se llama splicing, que a veces se traduce al español como edición del mRNA. En él participa un complejo macromolecular que recibe el nombre de splisosoma, compuesto por cinco RNA nucleares pequeños (snRNA), denominados U1, U2, U4, U5 y U6, y varias decenas de proteínas. Los intrones pueden tener cientos o miles de nucleótidos, pero todos contienen tres secuencias cortas, que son conservadas: el extremo de escisión 5’ con guanosina, el sitio de ramificación con adenosina, y el extremo de escisión 3’ con un dinucleótido de adenosina y guanosina. La formación del splisosoma se inicia cuando U1 se une al extremo de escisión 5’, después U2 seEl primer paso del rompimientoconsiste en el ataque del 2’ -OH de la ribosa de adenosina del sitio de ramificación, al enlace fosfodiester de la guanosina en el extremo de escisión 5’ del intrón, liberando el extremo 3’del exón. La unidad U6 podría servir para confirmar la identidad del extremo a romper y U2 permite la aproximación del 2’ -OH al extremo 5’. En el segundo paso del rompimiento, el extremo 3’ - OH libre del exón ataca el dinucleótido del extremo de escisión 3’ del intrón y se une al exón 5’, liberando el intrón. En este paso U5 reconoce el extremo 3’ del intrón. Ya que se eliminaron los intrones, los mRNA reciben en su extremo 3’ el segmento de poliadenilato y el Cap de 7-metilguanosina trifosfato en el extremo 5’ une al sitio de ramificación y U4 y U6 se unen entre si (Adjunto). SINTESIS DE PROTEINAS CÓDIGO GENÉTICO El código genético es el conjunto de normas por las que la información codificada en el material genético (secuencias de ADN o ARN) se traduce en proteínas (secuencias de aminoácidos) en las células vivas. El código define la relación entre secuencias de tres nucleótidos, llamadas codones, y aminoácidos. Un codón se corresponde con un aminoácido específico. El ARNm se basa en transportar un mensaje del ADN a la molécula correspondiente. La secuencia del material genético se compone de cuatro bases nitrogenadas distintas, que tienen una función equivalente a letras en el código genético: adenina (A), timina(T), guanina (G) y citosina (C) en el ADN y adenina (A), uracilo (U), guanina (G) y citosina (C) en el ARN. Debido a esto, el número de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminoácidos (siendo además uno de ellos el codón de inicio, AUG) y los tres restantes son sitios de parada (UAA, llamado ocre; UAG, llamado ámbar; UGA, llamado ópalo). La secuencia de codones determina la secuencia aminoacídica de una proteína en concreto, que tendrá una estructura y una función específicas. TABLA DEL CÓDIGO GENÉTICO ESTÁNDAR El código genético estándar se refleja en las siguientes tablas. La tabla 1 muestra qué aminoácido específica cada uno de los 64 codones. La tabla 2 muestra qué codones especifican cada uno de los 20 aminoácidos que intervienen en la traducción. Estas tablas se llaman tablas de avance y retroceso respectivamente. Por ejemplo, el codón AAU es el aminoácido asparagina, y UGU y UGC representan cisteína (en la denominación estándar por 3 letras, Asn y Cys, respectivamente). Nótese que el codón AUG codifica la metionina pero además sirve de sitio de iniciación; el primer AUG en un ARNm es la región que codifica el sitio donde la traducción de proteínas se inicia. La siguiente tabla inversa indica qué codones codifican cada uno de los aminoácidos. http://es.wikipedia.org/wiki/Bases_nitrogenadas http://es.wikipedia.org/wiki/Bases_nitrogenadas http://es.wikipedia.org/wiki/Adenina http://es.wikipedia.org/wiki/Timina http://es.wikipedia.org/wiki/Timina http://es.wikipedia.org/wiki/Citosina http://es.wikipedia.org/wiki/Uracilo http://es.wikipedia.org/wiki/ARNm AMINOÁCIDOS 21 Y 22.- Existen otros dos aminoácidos codificados por el código genético en algunas circunstancias y en algunos organismos. Son la seleniocisteína y la pirrolisina. La selenocisteína (Sec/U)3 es un aminoácido presente en multitud de enzimas (glutatión peroxidasas, tetraiodotironina 5' deiodinasas, tioredoxinareductasas, formiato deshidrogenasas, glicina reductasas y algunas hidrogenasas). Está codificado por el codón UGA (que normalmente es de parada) cuando están presentes en la secuencia los elementos SECIS (Secuencia de inserción de la seleniocisteína). El otro aminoácido, la pirrolisina (Pyl/O),45 es un aminoácido presente en enzimas metabólicas de arqueas metanógenas. Está codificado por el codón UAG (que normalmente es de parada) cuando están presentes en la secuencia los elementos PYLIS (Secuencia de inserción de la pirrolisina). Traducción El ARN mensajero es el que lleva la información para la síntesis de proteínas, es decir, determina el orden en que se unirán los aminoácidos. La síntesis de proteínas o traducción tiene lugar en los ribosomas del citoplasma celular. Los aminoácidos son transportados por el ARN de transferencia (ARNt), específico para cada uno de ellos, y son llevados hasta el ARN mensajero (ARNm), dónde se aparean el codón de éste y el anticodón del ARN de transferencia, por complementariedad de bases, y de ésta forma se sitúan en la posición que les corresponde. Una vez finalizada la síntesis de una proteína, el ARN mensajero queda libre y puede ser leído de nuevo. De hecho, es muy frecuente que antes de que finalice una proteína ya está comenzando otra, con lo cual, una misma molécula de ARN mensajero, está siendo utilizada por varios ribosomas simultáneamente. Los ARNt desempeñan un papel central en la síntesis de las proteínas. La síntesis proteica tiene lugar en el ribosoma, que se arma en el citosol a partir de dos subunidades riborrucleoproteicas provenientes del nucléolo. En el ribosoma el ARN mensajero (ARNm) se traduce en una proteína, para lo cual se requiere también la intervención de los ARN de transferencia (ARNt).El trabajo de los ARNt consiste en tomar del citosol a los aminoácidos y conducirlos al ribosoma en el orden marcado por los nucleótidos del ARNm, que son los moldes del sistema La síntesis de las proteínas comienza con la unión entre sí de dos aminoácidos y continúa por el agregado de nuevos aminoácidos -de a uno por vez- en uno extremos de la cadena. Como se sabe la clave de la traducción reside en el código genético, compuesto por combinaciones de tres nucleótidos consecutivos -o tripletes- en el ARNm. Los distintos tripletes se relacionan específicamente con tipos de aminoácidos usados en la síntesis de las proteínas. Cada triplete constituye un codón: existen en total 64 codones, 61 de los cuales sirven para cifrar aminoácidos y 3 para marcar el cese de la traducción. Tal cantidad deriva de una relación matemática simple: los cuatro nucleótidos (A, U, C y G) se combinan de a tres, por lo que pueden generarse. Dado que existen más codones, que tipos de aminoácidos, casi todos pueden ser reconocidos por más de un codón, por lo que algunos tripletes a como "sinónimos". Solamente el triptófano y la metionina -dos de los aminoácidos menos frecuentes en las proteínas - son codificados, cada uno, por un solo codón. http://es.wikipedia.org/wiki/Selenociste%C3%ADna http://es.wikipedia.org/wiki/Pirrolisina http://www.monografias.com/trabajos7/sisinf/sisinf.shtml http://www.monografias.com/trabajos7/sipro/sipro.shtml http://www.monografias.com/trabajos10/compo/compo.shtml http://www.monografias.com/trabajos/fintrabajo/fintrabajo.shtml http://www.monografias.com/Matematicas/index.shtml MAPAS GENÉTICOS Los mapas genéticos (mapas de ligamiento) proporcionan una aproximación a grandes rasgos de las localizaciones de los genes en relación con las de otros genes conocidos. Estos mapas se basan en la función genética de recombinación. Para la construcción de los mapas se cruzan individuos heterocigotos en dos o más loci genéticos y se determina la frecuencia de recombinación mediante el examen de la progenie. Si la frecuencia de recombinación entre dos loci es del 50%, entonces los loci están ubicados en cromosomas diferentes o están muy separados en el mismo cromosoma. Si la frecuencia de recombinación es menos del 50%, los loci están localizados muy próximos en el mismo cromosoma (pertenecen al mismo grupo de ligamiento). Para los genes ligados, la frecuencia de recombinación es proporcional a la distancia física entre los loci. Variación Variación morfológica y variación molecular Hoy en día los biólogos evolutivos usan tanto datos morfológicos como moleculares para establecer hipótesis de relaciones filogenéticasentre organismos, para estimar la variación dentro de las poblaciones y para probar hipótesis de adaptaciones ecológicas. Sin embargo, es común observar incongruencias entre los análisis basados en datos morfológicos y los basados en datos moleculares (Hillis y Wiens, 2000), lo que ha originado polémicas respecto a qué tipo de datos pueden proveer de información adecuada para sustentar y probar hipótesis evolutivas. El principal argumento en favor de la utilización de caracteres moleculares es que son universales. En muchos casos, principalmente cuando se requiere comparar linajes con divergencia temprana, es imposible establecer hipótesis de homología morfológica; en cambio, existen genes presentes en todos los genomas celulares −como los ribosomales−, que pueden proveer de información para reconstrucciones filogenéticas, donde los caracteres morfológicos son inaplicables (Avise, 1994). Además, estudios teóricos y empíricos han mostrado que en la reconstrucción de filogenias es crucial contar con numerosos caracteres informativos (Hillis et al., 1994) y los estudios típicos de secuencias nucleotídicas implican varios cientos o miles de caracteres en contraste con los estudios morfológicos, en los que un análisis incluye raramente más de cien caracteres (Sanderson y Donoghue, 1989). Los datos moleculares también tienen la ventaja de trabajar directamente con la base genética de la variación, mientras que la base genética de la mayoría de los caracteres morfológicos se asume. Asimismo, en el acercamiento molecular los caracteres se pueden seleccionar y definir de una manera relativamente objetiva (Hillis y Wiens, 2000). En los estudios morfológicos, en cambio, los caracteres deben ser descubiertos y delimitados generalmente sin ningún criterio explícito para la selección o la codificación del carácter, por lo que tienen el potencial de ser arbitrarios. Por ejemplo, los morfologistas no divulgan generalmente sus criterios para incluir o excluir caracteres y cuando se dan los criterios, varían considerablemente entre estudios (Hillis y Wiens, 2000). Sin embargo, tienen la ventaja de permitir un muestreo taxonómico mucho más cuidadoso que el que se realiza con análisis moleculares, lo que es importante para las revisiones sistemáticas, los estudios de la evolución del carácter y la valoración filogenética. Asimismo, los especímenes de museo ofrecen muchos caracteres morfológicos para una gran cantidad de taxa, mientras que un muestreo de este tipo para un estudio molecular puede ser difícil por el alto costo de la secuenciación, la necesidad de material relativamente fresco y la inaccesibilidad de las áreas donde se distribuyen algunos de ellos (Hillis y Wiens, 2000). La morfología es también la única manera en que la mayoría de los taxa fósiles pueden analizarse filogenéticamente y las especies extintas no sólo representan una gran proporción de la biodiversidad de la tierra, sino que también pueden ser cruciales para el entendimiento de las relaciones entre los taxas vivos (Smith, 1998). De lo anterior se puede apreciar que tanto los acercamientos moleculares como morfológicos tienen ventajas y desventajas; que ambos enfoques siguen desempeñando un papel crucial en casi todos los grupos de organismos y que hasta nuestros días las especies se describen y se identifican con base en ambas clases de datos SEGUNDO PARCIAL Marcadores Moleculares Los marcadores moleculares son una herramienta necesaria en muchos campos de la biología como evolución, ecología, bio-medicina, ciencias forenses y estudios de diversidad. Además se utilizan para localizar y aislar genes de interés. En la actualidad existen varias técnicas moleculares que nos permiten conocer cómo se encuentran las proporciones de genes en las poblaciones naturales de manera indirecta, como con los análisis de proteínas, o de manera directa con estudios de ADN. Los diferentes tipos de marcadores se distinguen por su capacidad de detectar polimorfismos en loci únicos o múltiples y son de tipo dominante o co-dominante (Simpson, 1997) Los polimorfismos detectados en el ADN se deben a diferencias al número de determinadas regiones no codificantes dispersas en el genoma (regiones repetidas) o a mutaciones puntuales. En función de estas características se pueden clasificar los diferentes métodos de detección de polimorfismos: A- lLs marcadores asociados a variaciones debidas al número de repeticiones en su secuencia (microsatélites y minisatélites) y B- los marcadores que detectan cambios puntuales en el genoma (RFLP, AFLP, RADP, SNP, etc.), que pueden ser detectables o no, por enzimas de restricción. A- Marcadores asociados a variaciones debidas al número de repeticiones en su secuencia ADN repetitivo dentro de un genoma Se conoce que una gran proporción variable del genoma eucariota está compuesto por secuencias repetitivas de ADN, las cuales difieren en el número y la composición de nucleótidos. Detección de la introgresión genética. Con este término se entiende la inclusión de genes en una población de otra diferente. El problema es detectar la presencia de genomas foráneos en el genomio de una especie autóctona que por ejemplo va a ser liberada en la naturaleza. Estas actuaciones afectan a la integridad genética de las especies autóctonas dando lugar a un deterioro genético de la biodiversidad. Los marcadores constituyen una buena herramienta para analizar la diversidad genética como control de las poblaciones, introducción de genotipos, limites a la selección y medidas de la pérdida de variabilidad genética. ADN nuclear (nADN) En eucariontes, la mayor parte de la información genética se encuentra contenida en el núcleo de la célula. El nADN se encuentra empaquetado y asociado a proteínas histonas, conformando los cromosomas. El nADN contiene regiones únicas −de una sola copia− y no únicas −duplicadas o regiones repetitivas (Stansfield, 1992). Se considera que los organismos diploides tienen dos copias de cada región genética (locus) en los pares homólogos de los cromosomas, llamadas alelos, sin tener en cuenta si contienen regiones codificantes (exones) o no codificantes (intrones o regiones intergénicas). Criterios para seleccionar el tipo de técnica. La selección de la técnica depende del objetivo trazado. Las técnicas moleculares brindan información a diferentes niveles taxonómicos. Todas tienen sus limitaciones y su aplicación estará determinada en gran medida, por la información que estamos buscando con la utilización de un sistema de marcadores moleculares, así como la disponibilidad de recursos necesarios para el desarrollo de este tipo de técnicas. Entre los factores más importantes a considerar se encuentran el contenido de información y el radio múltiple que cada técnica puede brindar. El contenido de información refleja el número de alelos que pueden ser detectados por el marcador en un número e individuos. El radio múltiple lo constituyen el número de marcadores que pueden ser generados por una reacción simple La selección del método depende de la aplicación específica que se desea. Si el objetivo es identificar el genoma o evaluar la diversidad genética, los métodos con radio múltiple (ej. AFLP), son apropiados debido a que pueden ser detectados muchos loci distribuidos al azar por el genoma. Este tipo de marcadores también son muy útiles en análisis genotípicos y taxonómicos para construir mapas genéticos y para identificar marcadores unidos a un carácter en particular. Para varios aspectos de la biología poblacional (análisis de paternidad, flujo de genes, etc.) y mejoramiento genético, los métodos con alto contenido de información son más útiles. Algunas aplicaciones de los Marcadores Moleculares en Mamíferos ADN de cloroplasto (clADN) En los organismos fotosintéticos con cloroplastos existe un ADN típicamente bacteriano circular,de 120 a 200 kb (Brown et al. 1979), con intrones y exones que se considera muy conservado, ya que se trata fundamentalmente del mismo genoma desde las hepáticas hasta las plantas superiores. Cada cloroplasto contiene varias regiones nucleotídicas, cada una con 8 a 10 moléculas de ADN. Un organismo unicelular como Euglena puede contener de 40 a 50 cloroplastos, por lo que la celula entera puede contener más de 500 copias del genoma del cloroplasto (Stansfield, 1992). ADN mitocondrial (mtADN) El genoma mitocondrial (mtADN) tiene un tamaño de 15 a 17 kb (Brown et al. 1979) y su longitud varía considerablemente entre especies: 20 micrómetros en Neurospora; 25 micrómetros en levaduras; 30 micrómetros en plantas superiores; 5 micrómetros en algunos animales metazoarios (multicelulares). Se considera que la mayoría del mtADN de hongos y plantas no codifica, ya que el mtARN contiene intrones. El mtARN de animales carece de intrones y se transcribe como ARN policistrónico que se parte en ARN monocistrónico antes de la traducción (Stansfield, 1992). Las moléculas de cloroplasto y mitocondria son especialmente importantes para trazar historias filogeográficas y de estructura poblacional genética estrechamente relacionada al linaje, porque son de herencia uniparental y no recombinan. También nos permiten inferir cambios demográficos y de dispersión entre especies (Dirienzo y Wilson, 1991). ADN ribosomal (RADN) El rADN puede encontrarse en mitocondrias, cloroplasto y núcleo. Contiene la información para el ARN que conforma los ribosomas, por lo que es información que se transcribe pero no se traduce. El rADN se presenta en repeticiones tándem y está formado por tres subunidades altamente conservadas (18 rADN, 5.8 rADN y 28 rADN), separadas por dos espaciadores con elevadas tasas de sustitución (ITS1 e ITS2). Estas repeticiones en tandém se encuentran conservadas a lo largo de todo un genoma y evolucionan concertadamente, lo que se atribuye a eventos recombinatorios como entrecruzamiento desigual y conversión génica. Estas secuencias, por la baja tasa de sustitución que presentan, son extremadamente útiles en el planteamiento de hipótesis de relaciones filogenéticas de taxa con tiempos de divergencia muy antiguos (Hills et al., 1991). Isoenzimas/aloenzimas Las isoenzimas fueron originalmente definidas como formas moleculares múltiples de las enzimas que tienen funciones idénticas o similares y están presentes en el mismo individuo (Market y Moller, 1959). Las isoenzimas pueden presentar varias formas alélicas, conocidas como aloenzimas (Prakash et al., 1969). En su mayoría son selectivamente neutras y se utilizan como marcadores hereditarios para cuantificar las frecuencias alélicas y genotípicas de los individuos, que son los estimadores básicos de la composición genética de una población. En estudios de genética las isoenzimas fueron usadas desde 1966, cuantificando la variación genética en poblaciones humanas y de Drosophila y un poco más tarde en estudios de plantas superiores (Harris, 1966; Johnson et al., 1966; Hubby y Lewontin, 1966; figura 1). La aplicación de las isoenzimas está dirigida a la cuantificación de heterocigosis, diversidad genética, diferenciación genética y otras medidas de variación genética intra e interpoblacional. También han sido aplicadas exitosamente para evaluar y entender aspectos de biología evolutiva como los sistemas de reproducción y patrones de fecundación cruzada, relaciones entre fenotipo y ambiente, filogenias, endemismo, diversidad en plantas clonales y apomícticas e interacciones planta-animal (Pérez-Nasser y Piñero, 1997. RAPDs Los RAPDs (polimorfismos de ADN amplificados al azar) son marcadores que amplifican aleatoriamente segmentos de ADN en una gran variedad de especies. Los RAPDs se basan en la probabilidad estadística de que se presenten sitios complementarios al oligonucleótido de 10 pares de bases (pb) a lo largo del genoma. El polimorfismo de las bandas entre los individuos se debe a cambios en la secuencia de los nucleótidos en los sitios de acoplamiento del oligonucleótido y por inserción o deleción de los fragmentos en estos sitios (Williams et al., 1990; figura 2). Estos marcadores son dominantes, es decir, no pueden discernir los homó- cigos dominantes de los heterócigos para un segmento particular (Whitkus et al., 1994; Backeljau et al., 1995), por lo que la estimación de las frecuencias alélicas se debe hacer de manera indirecta, asumiendo equilibrio de HardyWeinberg (Aagaard et al., 1998). Los RAPDs son útiles en la elaboración de mapas genéticos, en el estudio de parentesco y en el análisis de la estructura poblacional, ya que ayudan a estimar tamaño efectivo, aislamiento reproductivo y niveles de fecundación cruzada (Otero et al., 1997; Parker et al., 1998; véanse también los capítulos 2, 3 y 6 de este libro). Dado el gran polimorfismo que detectan una de sus mejores aplicaciones es la identificación genética de individuos, que incluye casos de clones, híbridos somáticos y mutantes. Otra aplicación paralela es la detección de uniformidad genética con un marcador eficiente y rápido, lo cual puede ser útil en la determinación de estabilidad en programas de reforestación (Otero et al., 1997). Entre las principales ventajas de los RAPDs esta que amplifican regiones tanto codificantes del ADN como las no codificantes y revelan niveles de variación más altos que los RFLPs e isoenzimas (Williams et al., 1990; Lynch y Milligan, 1994; Otero et al., 1997; Russell et al., 1997; Parker et al., 1998); es una técnica relativamente fácil que no necesita conocimiento previo de la secuencia de ADN, no requiere la construcción o el mantenimiento de una librería genómica, el número de loci que puede ser examinado es ilimitado y no requiere pruebas radiactivas (Reiter et al., 1992; Whitkus et al. 1994). Sin embargo los problemas prácticos detectados con los RAPDs son la presencia de bandas “erróneas” (artefactos), la reproducibilidad de los resultados y la comigración de bandas. Asimismo, muchos de los alelos raros presentes en las poblaciones estudiadas con RAPDs no son detectados o pueden ser mal interpretados (Zhivotovsky, 1999). Por otro lado, como los loci son dominantes, los RAPDs dan menos información genética por locus que los marcadores codominantes. Al analizar los datos obtenidos con RAPDs se deben tener en cuenta dos supuestos: 1) cada uno de los marcadores representa un locus mendeliano en el cual el marcador visible, el alelo dominante, está en equilibrio de HardyWeinberg con un alelo recesivo y 2) los alelos marcados para diferentes loci no migran a la misma posición en el gel (Lynch y Milligan, 1994). Microsatélites Los microsatélites o secuencias simples repetidas (SSRs; Litt y Luty, 1989) son secuencias de ADN formadas de 1 a 4 pares de bases, por ejemplo mononucleótidos (TT)n , dinucleótidos (AT)n , o tetranucleótidos (AAGG)n . Estos loci se encuentran en regiones codificantes y no codificantes del ADN y es probable que se formen por eventos de rompimiento que generan polimorfismos con valores superiores al 90% (Armour et al., 1994; Coltman et al., 1996; Gupta et al., 1996; figura 3). Los microsatélites de ADN nuclear han sido detectados en múltiples grupos de plantas y animales, y han sido utilizados fundamentalmente para estudios de variación genética intra e interespecífica (Edwars et al., 1991; Armour et al., 1993; Devey et al., 1996; Queller et al., 1993; Weight y Bentzen, 1994), análisis de linajes (Queller et al., 1993) y de sistemas reproductivos (Awadalla y Ritland, 1997). Recientemente se han encontrado microsatélites en algunos organelos citoplasmáticos, como el cloroplasto (SSRc; Powell et al., 1995a, b; Vendramín et al., 1996; figura 3 ) y la mitocondria (SSRm; Soranzo et al., 1998) lo que ha enriquecido la fuente de estudios evolutivos, ya que estos organelos son heredadosuniparentalmente y no están sujetos a recombinación, por lo que los cambios acumulados que observamos en las poblaciones se deben sólo a los procesos de mutación y demográficos (Echt et al., 1998). Esto permite contestar preguntas evolutivas muy puntuales relacionadas con el monitoreo del flujo genético, introgresión (Vendramin et al., 1998), análisis de paternidad (McCracken et al., 1999), para hacer inferencias de parámetros demográficos y para determinar patrones evolutivos de los procesos históricos del origen de especies, formas o razas (Golstein et al., 1996). Los microsatélites han tomado ventaja sobre otros marcadores genéticos como los AFLPs, RAPDs, RFLPs, debido a que: i) tienen el más alto grado de polimorfismo; ii) segregan de manera mendeliana y son codominantes; iii) la presencia de un solo locus genético por microsatélite hace que la lectura de las bandas sea clara y fácil de interpretar y iv) son selectivamente neutros (Golstein y Pollock, 1994; Vendramin et al., 1996). Además, para trabajar con SRR es necesario conocer la secuencia de la región a analizar para contar con primers específicos que amplifiquen la región repetitiva (el microsatélite) responsable de la variación observada, que además es homóloga para diferentes especies o incluso géneros (Golstein et al., 1996). Esto es, los microsatélites son específicos para ciertos grupos de especies y homólogos entre sí (Vendramin et al., 1996), lo que permite hacer estudios comparativos entre especies o géneros de un mismo grupo. Por otra parte, se han realizado estimaciones de las tasas de mutación de estas regiones y se ha llegado a la conclusión de que los microsatélite del ADN nuclear tienen tasas de mutación de 1x 10 -3 a 1x 10 -6 (Wiessenbach et al., 1992; Weber y Wong, 1993), más altas que las que se presentan en el ADN de cloroplasto las cuales según Provan et al. (1999) son de 3.2-7.9 x 10-5. Conocer las tasas de mutación nos brinda una base importante para realizar análisis robustos de la genealogía de las poblaciones que nos hablen acerca de la historia evolutiva de las especies, ventaja muy importante sobre otros marcadores genéticos. Otra ventaja que presenta el uso de microsatélites con relación al uso de secuencias, es que la mutación es homogénea: en la mayoría de los SSR las mutaciones son de un paso (una unidad repetitiva) siguiendo el modelo mutacional SSM de Ohta y Kimura (1973). Sin embargo el número de mutaciones varía si se trata de diferentes tipos de microsatélites, por ejemplo, Golstein et al. (1995b) mencionan que las mutaciones de repeticiones formadas por dinucleótidos o trinucleótidos son de dos pasos o incluso de múltiples pasos, lo que ha sido confirmado por estudios en trinucleótidos. Por ejemplo, en el humano el microsatélite formado por las repeticiones CAG − asociado con un desorden neurológico−, puede mutar de pocos a cientos de alelos (Ashley y Warren 1995). Sin embargo este comportamiento asimétrico del tamaño de las mutaciones de SSR ha sido raramente reportado. Al ser los microsatélites altamente polimórficos, pueden ser ventajosos con relación al uso de secuencias, aunque la variación del ADN nuclear debe analizarse con precaución, ya que pudo haberse generado por duplicaciones o por la presencia de familias multigénicas (Rieseberg,1991), que generan un alto grado de homogeneidad dentro y entre especies, proceso conocido como evolución concertada. Estos fenómenos pueden distorsionar la historia evolutiva de los organismos en estudio y confundir las relaciones filogenéticas (Rieseberg et al., 1991b). Es decir, se pueden presentar aparentes reticulaciones o escenarios de hibridización introgresiva. Finalmente, los microsatélites han sido utilizados para hacer reconstrucciones de árboles de genes con base en la teoría de coalescencia (véase el capítulo 4 de este libro). Los fragmentos son separados en geles de acrilamida y son visualizados con nitrato de plata o radioactividad. ISSRs Es un marcador molecular conocido como secuencias repetidas intersimples. Esta es una técnica relativamente nueva y es similar a los RAPDs, excepto que en los ISSRs el primer es un di ó trinucleotido repetido (Culler y Wolfe, 2001 véase el capítulo 19 de este libro). Los dos métodos que se utilizan en la electroforesis de ISSRs son: a) gel de agarosa visualizado con bromuro de etidio, y b) geles de acrilamida teñidos con nitrato de plata. Las bandas que se obtienen con este marcador van de 100 a 2000 pb. La variación alélica en los ISSRs consiste de la presencia o ausencia de los productos amplificados. Comparada con los primers de los RAPDs las secuencias de los ISSRs es usualmente larga lo que resulta en una mayor reproductibilidad de las bandas. Los ISSRs han sido utilizado en especies cultivadas desde 1994, pero sólo recientemente se han utilizado en estudios de la variación poblacional en especies silvestres (Wolfe y Liston, 1998; Wolfe et al. 1998 a,b). Hasta la fecha sólo existen algunos estudios donde se ha comparado directamente la variación genética, incluyendo estimaciones de la tasa de fecundación cruzada (que tradicionalmente se estima con marcadores codominantes) y se ha utilizado esta técnica en especies donde la variación poblacional con enzimas es pequeña o no existe. Dada la alta variación genética entre individuos de una misma población, sería recomendable utilizar estos marcadores para análisis de paternidad. Entre las ventajas principales de los ISSRs es que tienen un gran número de bandas polimorficas. En un estudio realizado en Viola pubescens una planta cleistogamica se reportó una gran variación genética. A nivel de especie, el 100% de los loci fueron polimorficos aún cuando los primers (se utilizaron tres) fueron seleccionados al azar. Dentro de cada población cerca del 71% de 83 loci fueron polimorficos (Culley y Wolfe 2001). Además es una técnica relativamente fácil de montar, altamente repetible y ya existen primers universales para plantas. Por otro lado las limitaciones de los ISSRs son: que las bandas son leídas como marcadores dominantes, es decir cuando tenemos la presencia de la banda no se sabe si el individuo es homócigo dominante o herócigo, que la diversidad genética está basada considerando que cada banda representa un locus con dos alelos y que el alelo dominante esta en equilibrio de HardyWeinberg con un alelo recesivo y por último que es una técnica relativamente cara, ya que involucra el uso de geles de poliacrilamida y para su visualización nitrato de plata. RFLPs El análisis de polimorfismos de la longitud de los fragmentos de restricción (RFLPs) fue el primer marcador de ADN utilizado por biólogos poblacionales (Parker et al., 1998). Este método expresa diferencias específicas del ADN que fueron reconocidas por enzimas de restricción particulares (endonucleasas). Cada una de las endonucleasas (de origen bacteriano), reconoce y corta solamente una secuencia específica de bases nitrogenadas en el ADN, siempre y cuando éstas no estén protegidas (metiladas). Por consiguiente cualquier ADN que no esté metilado puede ser reconocido y cortado en fragmentos de longitud definida; y cualquier mutación dentro de esos sitios, podría cambiar el patrón del fragmento y permitir que se detecte un RFLP al comparar dos o más genomas (Valadez y Kahl, 2000). Para detectar RFLPs hay dos técnicas: southern blots e hibridización, y PCR. Southern blots e hibridización Es necesario en primer lugar aislar el ADN del organismo de interés (véase el capítulo 15 de este libro, purificarlo y cortarlo con una o más endonucleasas de restricción. Los fragmentos resultantes se separan en geles de agarosa por electroforesis y se transfieren a una membrana que puede ser de nylon o de nitrocelulosa (southern blotting). La subsecuente hibridación con una sonda marcada y detección con autorradiografía, luminografía o quimioluminiscencia hará
Compartir