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PROTEÍNAS AMINOÁCIDOS Aminoácidos estereoisómeros Todos los aminoácidos, excepto la glicina, son quirales porque el carbono α está unido a cuatro átomos diferenentes. Pueden existir como enantiómeros D y L. En los sistemas biológicos, los únicos aminoácidos incorporados en las proteínas son los L. Hay aminoácidos D que se encuentran en la naturaleza, pero no en las proteínas. Aminoácidos esenciales De los 20 aminoácidos que se utilizan para construir proteínas en el organismo, sólo 11 pueden sintetizarse en el cuerpo. Los otros 9 aminoácidos, se llaman aminoácidos esenciales porque deben obtenerse de la alimentación. Además los bebés y niños en crecimiento también necesitan arginina, cisteína y tirosina. Según timberlake. 9+3 = 12 Según Blanco, los aminoácidos esenciales son: fenilalanina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, treonina, triptófano y valina. Arginina e histidina en el embarazo y lactancia. 8+2 = 10 1.Tres Treonina 2.Histólogos Histidina 3.Argentinos Arginina 4.Metieron en sus Metionina 5.Valijas Valina 6.Leucocitos Leucina 7.Fenicios Fenilalanina 8.Y solo Isoleucina 9.limitáronse a Lisina 10.Triturarlos Triptófano Las proteínas completas: tienen todos los aminoácidos esenciales huevos, leche, carne, pescado y pollo Proteínas incompletas: tienen deficiencia en uno o mas aminoácidos esenciales. gelatina, proteínas vegetales como granos, frijoles y nueces. Dietas sólo de proteínas vegetales deben contener varias fuentes proteínicas para obtener todos los aminoácidos esenciales. Ejemplo, una dieta de arroz contiene metionina y triptófano que faltan en los porotos, en tanto que éstos contienen lisina que falta en el arroz. Propiedades de los aminoácidos Las propiedades de la cadena de cada aminoácido permiten predecir su comportamiento Propiedades ácido-base La existencia, en una misma molécula de grupos ácidos y básico, da a los aminoácidos propiedades eléctricas particulares. En solución alcalina, el protón de la función NH3 + reacciona con iones hidróxido para formar agua y el aminoácido queda cargado negativamente. En solución ácidas fuertes, capta un ión hidrógeno o protón a nivel de su carboxilo. El aminoácido se convierte entonces en un catión con carga positiva. La carga eléctrica del aminoácido depende del pH del medio en el cual está disuelto. Punto isoeléctrico Hay un valor de pH característico para cada aminoácido, en el cual la ionización de cargas positivas y negativas se iguala y, por lo tanto, la carga total del aminoácido es nula. A este valor de pH se lo denomina punto isoeléctrico, pI. Mezcla de valina (pI de 6.0), ácido aspártico (pI de 2.8) y lisina (pI de 9.7) en un tampón de pH de 6.0 Ácido aspártico tiene carga negativa a pH 6.0. Se mueve al electrodo positivo (ánodo) Lisina tiene carga positiva a pH 6.0. Se mueve al electrodo negativo (cátodo) La valina está a us Pi. En el punto isoeléctrico la solubilidad es nula. Formación de péptidos Un enlace peptídico es un enlace amida que se forma cuando el grupo –COO- de un aminoácido reacciona con el grupo –NH3 + del siguiente aminoácido. La unión de dos o mas aminoácidos mediante enlaces peptídicos forma un péptido. Un átomo de O se elimina del extremo carboxilato del primer aminoácido, y dos átomos de H se eliminan del extremo amonio del segundo aminoácido, lo que produce agua. Dos aminoácidos dipéptido Tres aminoácidos tripéptido……………………….. muchos aminoácidospolipéptidos Nomenclatura Estructura primaria: Esta estructura es la secuencia de aminoácidos de la proteína. Nos indica los aminoácidos que componen la cadena polipeptídica y el orden en que se encuentran. La secuencia de la proteína se escribe enumerando los aminoácidos desde el extremo -N terminal hasta el extremo -C terminal. Estructura secundaria: Se trata de la disposición de la cadena polipeptídica en el espacio. Existe una conformación más estable que ninguna otra que es la que se mantiene. Los tipos básicos de la estructura secundaria son: · α-hélice: plegamiento en espiral de la cadena polipeptídica sobre sí misma. Se mantiene estable por medio de puentes de hidrógeno que entre los grupos -NH- y –C=O. Si estos enlaces se rompen, la estructura secundaria se pierde. (Ej: α-queratina de las plumas) Lámina plegada: el plegamiento no origina una estructura helicoidal sino una lámina plegada en zig- zag. La estabilidad de esta estructura también se consigue mediante puentes de hidrógeno, pero en este caso son transversales. (Ej: β-queratina de la seda) Grupos R pueden tener Interacciones no covalentes Uniones covalentes ANTES DE SEGUIR CON LAS ESTRUCTURAS TERCIARIAS Y CUATERNARIAS VAMOS A REALIZAR UN PARÉNTESIS PARA VER INTERACCIONES Y UNIONES QUE PODEMOS ENCONTRAR ENTRE LOS GRUPOS R. Interacciones no covalentes Hidrofobicidad Muchos aminoácidos presentan una cadena lateral totalmente apolar. Teniendo en cuenta que las proteínas suelen encontrarse en un entorno acuoso, las cadenas laterales apolares tienden a agruparse como consecuencia del fenómeno de repulsión definido como efecto hidrofóbico plegándose en una estructura tridimensional en la que suelen quedar formando un grupo hidrofóbico. Fuerzas de Van der Waals En las cadenas laterales de los aminoácidos apolares se pueden crear dipolos instantáneos que pueden crear fuerzas de atracción intermoleculares muy débiles pero que, en conjunto, pueden tener un efecto importante en la determinación de la estructura tridimensional de las proteínas. Formación de puentes de hidrógeno Algunas cadenas laterales pueden formar interacciones no covalentes de este tipo pudiendo actuar como donadoras o como aceptores de hidrógeno. En el primer caso se encuentran las cadenas laterales de los aminoácidos Ser, Tyr, Thr, Trp, Gln, Asn, His, y Cys. En todos los casos existe un átomo de hidrógeno unido a un átomo mas electronegativo que hace que se cree una densidad de carga positiva en el átomo de hidrógeno. A un pH bajo, las cadenas de Asp y Glu estarán protonadas y también pueden actuar como donadores de H. Las cadenas laterales que poseen grupos funcionales con átomos con densidad de carga negativa pueden actuar como aceptores en la formación de puentes de hidrógeno son: Tyr, Glu, Asp, Ser, Thr, Asn, Gln, His y, en ocasiones, la Cys. Unión de elementos metálicos La unión de elementos metálicos tiene una gran importancia en la función de la proteína, permitiendo, en algunas ocasiones, su participación directa en ciertas reacciones químicas o, simplemente, estabilizando su estructura tridimensional. Estos metales se unen formando entidades de coordinación, que están compuestas por un átomo central (en este caso el metal) que se encuentra unido a un conjunto de átomos denominados ligandos. Estos complejos se forman con las cadenas laterales de aminoácidos como His, Tyr, Cys, Met, Asp y Glu. La incorporación de estos elementos metálicos aumenta las posibilidades de las proteínas para participar en ciertas reacciones, como ocurre en las reacciones de transferencia de electrones. Los aminoácidos con cadenas laterales ionizables también pueden establecer interacciones con elementos metálicos pero, en este caso, mediante interacciones no covalentes iónicas. Un ejemplo sería la fijación de Ca2+ en las proteínas con residuos de Asp y Glu. Interacciones electrostáticas Las cadenas laterales de algunos aminoácidos presentan grupos funcionales con carácter ácido o básico que, como consecuencia, pueden estar ionizados a determinados valores de pH. Las cadenas laterales de Lys, Arg e His pueden presentar carga positiva y las de Glu y Asp carga negativa. Dado que cargas de signosopuestos se atraen, se pueden crear interacciones no covalentes entre las cadenas laterales de estos aminoácidos que, por su semejanza a las interacciones iónicas que se dan el las sales, se denominan con frecuencia puentes salinos. Estas interacciones también se dan entre proteínas. Estas interacciones pueden verse alteradas por modificaciones del pH y por la adición de sales. Las cadenas laterales pueden establecer enlaces covalentes Ciertos residuos tienen en su cadena lateral grupos funcionales que permiten la formación de enlaces covalentes que pueden establecerse entre dos aminoácidos o entre ciertos aminoácidos y grupos funcionales de otras moléculas. Formación puentes disulfuro Dos residuos de Cys pueden unirse covalentemente mediante la formación de un enlace disulfuro mediante un proceso de oxidación. Este tipo de entrecruzamiento se puede dar entre dos Cys de la misma proteína o entre dos Cys de cadenas diferentes. La reacción requiere un ambiente occidante, por lo que estos enlaces no son habituales en las proteínas intracelulares que se encuentran en el ambiente reductor del citosol. Sin embargo, estos enlaces son frecuentes en las proteínas extracelulares que son secretadas en las células. Estos enlaces estabilizan la estructura tridimensional de las proteínas, que se mantiene gracias a las interacciones no covalentes, haciéndolas menos susceptibles a la degradación. En algunas proteínas que están formadas por varias unidades existen puentes disulfuro intercatenarios que mantienen unidas las distintas cadenas. Estructura terciaria: La estructura terciaria, constituye un conjunto de plegamientos que se originan por la unión entre determinadas zonas de la cadena polipeptídica. Estas uniones se realizan por medio de enlaces entre las cadenas laterales de los aminoácidos, y pueden ser de los siguientes tipos: Estructura cuaternaria: Informa de la unión de varias cadenas polipeptídicas con estructura terciaria para formar un complejo proteico. Cada una de estas cadenas polipeptídicas recibe el nombre de protómero o subunidad proteica. Según el número de subunidades que se asocian, las proteínas que tienen estructura cuaternaria se denominan: · Dímeros: ej. enzima hexoquinasa · Tetrámeros: ej. hemoglobina · Pentámeros: ej. enzima ARN-polimerasa · Polímeros: ej. actina, miosina y cápsida del virus de la polio (este posee 60 subunidades proteicas). Masa molecular de una proteína Las proteínas difieren considerablemente entre sí en forma, tamaño y masa molecular. Las proteínas más pequeñas tienen alrededor de 6.000 Da, mientras las de mayor tamaño alcanzan varios millones. Conociendo la masa molecular de una proteína se puede establecer aproximadamente el número de aminoácidos que la integran. Basta dividir su masa por 120, valor promedio para los restos de aminoácidos. Fosforilación Las cadenas laterales de los aminoácidos Ser, Thr, y Tyr pueden sufrir un proceso de fosforilación por la unión a su grupo hidroxilo (-OH) de una molécula de fosfato inorgánco (P). La introducción de un grupo fosfato con carga negativa hace que se produzcan cambios conformacionales en la proteína, que tienen como consecuencia una modificación en su actividad. Glucosilación En las células eucariotas los azúcares se pueden unir de forma covalente a las proteínas mediante la formación de un enlace O-glucosídico, si el carbono anómerico del azúcar reacciona con el grupo hidroxilo de una Ser o una Thr. También se puede formar un enlace N-glucosídico si la unión se realiza con el grupo amino de la cadena lateral de la Asn. Solubilidad de las proteínas Capa de hidratación o solvatación A bajas concentraciones de sal, aumenta la solubilidad. Si la concentración de sal aumenta disminuye la solubilidad. Solventes menos polares que el agua tienen menor constante dieléctrica. Se pierde la capa de solvatación. Precipita la proteína. Desnaturalización de proteínas Ocurre cuando hay una alteración entre los grupos R que estabilizan la estructura secundaria, terciaria o cuaternaria, sin embargo, los enlaces amida covalentes de la estructura primaria no son afectados. Hidrólisis Los enlaces peptídicos pueden hidrolizarse para producir aminoácidos individuales. Este proceso tiene lugar en el estómago, cuando enzimas como la pepsina o tripsina catalizan la hidrólisis de proteínas para producir aminoácidos. Se rompe la estructura primaria al romper los enlaces amida covalentes que unen los aminoácidos. En la digestión de proteínas, los aminoácidos se absorben a través de las paredes intestinales y se transportan a las células, donde pueden utilizarse para sintetizar nuevas proteínas. Clasificación de proteínas Globulares: • La molécula se pliega sobre si misma para formar un conjunto compacto semejante a una esfera u ovoide. • Tres ejes de similar longitud. • Solubles en medios acuosos. Fibrosas • Las cadenas polipeptídicas se ordenan paralelamente formando fibras o láminas. • Participan en la construcción de estructuras de sostén como fibras del tejido conjuntivo y formaciones tisulares de gran resistencia física. • Eje longitudinal predomina sobre el transversal. • Poco solubles o insolubles en agua. Proteínas simples: su hidrólisis total sólo produce aminoácidos Proteínas conjugadas: proteína simple + otro tipo de compuesto Apoproteína grupo prostético Proteínas simples Albúminas: Proteínas solubles en agua. Precipitan por adición de sales a alta concentración Se encuentran en tejidos animales y vegetales. Su nombre indica procedencia (ovoalbúmina, lactoalbúmina, legumelina Globulinas: Son insolubles en agua pura Solubles en soluciones salinas diluidas. Menos hidrófilas que las albúminas, precipitan más fácilmente por la adición de sales. Tienen forma ovoide, son globulares. Se encuentran en el plasma sanguíneo, clara de huevo (ovoglobulina), leche (lactoglobulina), tejidos animales y vegetales. Histonas: fuertemente básicas, contienen alta proporción de lisina, arginina e histidina. Se asocian al ADN. Gluteninas y gliadinas: Granos de cereales. No poseen todos los aminoácidos esenciales. Escleroproteínas: albuminoides Insolubles en agua Tejidos animales Tejidos de sostén y estructuras de gran resistencia física Protaminas: Básicas, pequeñas, asociadas a ácidos nucleicos en esperma de peces Nucleoproteínas: proteínas simple básica + ácidos nucleicos (grupo prostético) Cromoproteínas: proteína simple + grupo prostético coloreado. Ejemplo, hemoglobina, citocromos y flavoproteínas. Glicoproteínas: proteína unida a un hidrato de carbono Fosfoproteínas: reservorios de fosfatos. Caseína de la leche y vetelina de la yema de huevo. Lipoproteína. Proteína simple + lípido (grupo prostético) En la sangre las lipoproteínas cumplen la función de transportar lípidos insolubles en el medio acuoso. Metaloproteínas: proteína + metal Proteínas conjugadas
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