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UNIDAD 2; Nutrición • Tipos Nutricionales • Sistemas de Transporte – Transporte primario – Transporte secundario • Secreción de proteínas Tipos Nutricionales • Fuente de Carbono – Autótrofos CO2 – Heterótrofos Moléculas orgánicas • Fuente de energía – Fotótrofos Luz – Quimiótrofos Oxidación de compuestos orgánicos o inorgánicos • Fuente de electrones – Litótrofos Moléculas inorgánicas reducidas – Organótrofos Moléculas orgánicas https://microbenotes.com/classification-of-bacteria-on-the-basis-of-nutrition/ Tipos nutricionales principales en microorganismos • FOTOLITOTROFO AUTOTROFO – Bacterias púrpuras y verdes del azufre, cianobacterias • FOTOORGANOTROFO HETEROTROFO – Bacterias púrpuras y verdes no sulfúreas • QUIMIOLITOTROFO AUTOTROFO – Bacterias del Hidrógeno, del Azufre, del Hierro, del Nitrógeno y muchas archaeas • QUIMIORGANOTROFO HETEROTROFO – Hongos , la mayoría de bacterias no fotosintetizadoras, y algunas archaeas Nutrientes requeridos por los microorganismos Walker &White . 2017.Introduction to Fungal Physiology. In: Kavanagh, K.(Ed.) Fungi: Biology and Applications. 3rd.Edition. Fuentes de Carbono utilizadas por los hongos Los hongos son muy versátiles para el uso de diferentes fuentes de carbono Transporte de Nutrientes Aquaporinas: En bacterias son estructuras que favorecen la osmoregulación y pueden ser canales de difusión de glicerol. En hongos se les asocia con el proceso de esporulación y/o germinación Volume 90, Issue 7, 1 April 2006, Pages 2270-2284 Transporte de solutos en Microorganismos • Transporte Primario – Transporte mediado por ATP (en arqueas, eubacterias y eucariotas) – Sistema Fosfotransferasa ( en eubacterias) – Sistema de transporte • Transporte Secundario – Simporte – Antiporte Transporte primario o secundario? Transportadores tipo ABC • El transporte activo mediado por ATP (transporte primario) utiliza transportadores tipo ABC (ATP-Binding Cassette) y se conocen muchos ejemplos en bacterias, arqueas y eucariotas. En todos ellos existe una o dos proteínas periféricas de membrana citoplásmica que poseen un dominio (de unos 200 aminoácidos) conservado evolutivamente, denominado "cassette de unión a ATP“. • En este dominio con función ATPasa, la hidrólisis del ATP suministra la energía necesaria para hacer efectivo el transporte del soluto. • Los sistemas ABC de bacterias Gram-positivas están menos estudiados, pero en general se parecen a los de Gram-negativas, salvo que carecen del transportador libre periplásmico. En su lugar existe una proteína con funciones equivalentes (captar el nutriente del exterior), pero que está anclada al lado externo de la membrana citoplásmica. • Existen muchos ejemplos de transportadores procarióticos de tipo ABC, y cada uno de ellos está especializado en transportar un sustrato específico o varios sustratos parecidos. Ejemplo de sustratos transportados de esta forma: – Monosacáridos como arabinosa, galactosa, maltosa, ribosa, xilosa, etc. – Oligosacáridos – Iones orgánicos e inorgánicos – Aminoácidos como histidina, glicina, leucina, etc. – Oligopéptidos – Algunas vitaminas y metales. – Sideróforos con hierro Los transportadores tipo ABC son diversos y de mucha utilidad Mecanismos de transporte y sensores kinasa en bacterias M. Saidijam et al. Biochm. Soc. Trans. 2005;33:867-872 Transporte activo Secundario Transporte activo primario Transporte primario mediado por ATP: Ejm. Sistema Kdp para la toma de potasio en condiciones limitantes Escherichia coli contiene 3 sistemas para la toma de potasio los cuales difieren en energética, cinética y regulación: TrkG/TrkH, Kup, y KdpFABC. Los dos primeros son constitutivos y el tercero es inducible en condiciones de limitación de potasio o alta osmolaridad. Sistema Kdp para la toma de K+ en condiciones limitantes Complejo kdpFABC Transporte primario mediado por ATP: Ejm. Sistema de transporte dependiente de una proteína de enlace o también conocido como Transporte Sensible al Choque osmótico de las bacterias Gram (-) • Mecanismo – El soluto ingresa al periplasma a través de una porina – En el periplasma el soluto se une a una proteína de enlace que sufre un cambio conformacional cuando se une al soluto – La proteína de enlace conduce al soluto hasta un transportador proteico ubicado en la membrana plasmática – El transportador permite el paso del soluto mientras ocurre hidrólisis de ATP Elementos que utiliza el Transporte sensible al choque osmótico • Requiere: Porina de Membrana Externa Proteína periplasmática específica Proteína de membrana plasmática ATPasa para la hidrólisis de ATP • Las bacterias Gram (-) lo utilizan para la toma de una amplia variedad de azúcares, amino ácidos, vitamina B12, toma de sideróforos, sulfato, fosfato, molibdato, poliaminas, etc Sistema de transporte sensible al choque osmótico Transporte Primario - Sistema de transporte por translocación de grupos : Sistema Fosfotransferasa Elementos y mecanismo: Proteína EI citoplasmática no específica. PEP: Fosfoenolpiruvato , cede el fosfato de alta energía a EI. Proteína Hpr que se fosforila por acción de la EI-P Proteína EII transmembrana muy específica. Recibe el P de Hpr-P y lo transloca al sustrato que ingresa. Existen varios Sistemas Fosfotransferasa. Son altamente específicos. El Sistema Fosfotransferasa (PTS) es un Sistema específico de translocación de grupos fosfato, por lo tanto el sustrato siempre ingresará fosforilado a través de este transporte. Transporte Secundario: Utiliza la energía proporcionada por un Sistema de transporte previo Generalmente le proporciona energía el transporte previo de electrones a través de la membrana y quimiósmosis que genera el llamado gradiente electroquímico o fuerza protón motora (PMF) Sistemas Protón-Simporte, Na+-Simporte Protón-Antiporte, Anión-Antiporte Fuerza Protón motora Fuerza Sodio motora Fuerza Magnesio motora Fuerza anión motora Etc. ¿Cuál es el sistema de transporte para maltosa que observa? Las bacterias lácticas tienen un Sistema de Transporte muy particular Las Bacterias Acido Lacticas (BAL) • No pueden sintetizar algunos aminoácidos • Deben utilizar fuentes exógenas de nitrógeno • Poseen sistemas de transporte para la toma de amino ácidos, di, tri-péptidos y oligopéptidos, utilizando di-, tri-peptidasas y oligopeptidasas • Contienen al menos una proteinasa asociada a pared celular y membrana Pared Celular Membrana celular Citoplasma Amino Acidos Di/Tri Péptidos Oligopéptidos Peptidasas Leche Proteinasa Caseina Oligopéptidos grandes Oligopéptidos más pequeños Di/Tri péptidos Amino Acidos Di- and Tri- Peptidasas Sistema de transporte de oligopeptidos Sistema de transporte de Di/Tri Peptidos Sistema de Transporte de Aminoacidos Algunos patógenos desarrollan numerosos sistemas de transporte de acuerdo a sus necesidades. Helicobacter pylori: Physiology and Genetics. Mobley HLT, Mendz GL, Hazell SL, editors. Washington (DC): ASM Press. 2001. Sistema de transporte de iones en Helicobacter pylori http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/n/hp/ Toma de Hierro • Se realiza mayormente a través de sideróforos • Se producen sideróforos tanto en bacterias como en hongos. • El sideróforo producido por una especie puede ser tomado por una población bacteriana diferente Braun & Killmann (1999) Diversas estrategias para la toma de Hierro Los Sideróforos • Son moléculas de bajo peso molecular producidas y liberadas al exterior por los microorganismos para obtener hierro del medio • Su naturaleza química es de hidroxamatos y catecolatos principalmente, existen tambien fenolatos, carboxilatos y tipos mixtos. • Estas moléculas forman complejos con el ión férrico en el medio y reingresan a la célula • Se han identificado numerosos sideróforos en bacterias : Ferricromo, Enterobactin, Enteroquelin, y otros MICROBIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY REVIEWS, Sept. 2007, p. 413–451 Vol. 71, No. 3 1.Proteína Receptora em membrane externa , Fe-quelato en el medio y Proteína TonB (proteína de membrana) 2.Enlace del quelato induce cambio conformacional en la proteína receptora 3.TonB contacta a la proteína receptora 4.TonB transduce energía derivada de la fuerza protón motora. La superficie de la proteína receptora se altera, pierde afinidad con el ligando dando lugar a su paso hacia el interior de la célula. 5.Ton B se disocia de la proteína receptora. Moeck & Coulton (1998) Mecanismo para la toma de Hierro por sideróforos Modelo esquemático de la Toma de sideróforos en las bacterias Gram negativas OMR: receptor proteico de membrana externa; PBP: proteína ligante en periplasma; Complejo TonB; Transportadores tipo ABC en membrana citoplasmática; Reductasa de Fe citoplasmática para su asimilación; Producción y salida del sideróforo libre de hierro hacia el exterior. Tomando un ejemplo de la toma de Hierro por un sideróforo Enteroquelín a través de la proteína receptora FepA de la Membrana externa También las bacterias gram positivas pueden utilizar sideróforos para la toma de hierro..¿Cómo lo logran? Una lipoproteína anclada a la membrana se une al sideróforo y es importado utilizando una permeasa de sideróforo y ATPasa. Estrategia “Caballo de Troya” Se producen actualmente antibióticos conjugados con sideróforos como la albomicina, carboximicobactina desferrioxamina , ferrimicina y otros . Su uso contra gérmenes gram positivos o gram negativos utiliza el mecanismo de transporte de sideróforos. Sideróforo tris catecolato y sus conjugados ampicilina y amoxicilina. Inhibe el crecimiento de bacterias gram negativas incluyendo Pseudomonas aeruginosa Funciones no clásicas propuestas para los sideróforos Secreción de proteínas • T1SS: Utiliza transportadores tipo ABC (ATP Binding Cassette) • Es el sistema mas simple, consiste básicamente de tres componentes proteicos: – Una proteína canal en membrana externa – Un transportador proteico de membrana plasmática (Tipo ABC) – Una proteína periplasmática relacionada con la membrana interna • Este tipo de proteínas de secreción se encuentran en un gran número de bacterias gram negativas incluyendo patógenos de plantas y animales. Es muy frecuente la presencia de Tol C (una proteína formadora de poro) para la salida de toxinas. Ejm. la toxina MARTX de V.cholerae; el hemóforo HasA de Serratia marcescens; la hemolisina HlyA de E. coli uropatogénica. Secreción de proteínas a través de la membrana externa: Tipo I (T1SS) T1SS: Familia de proteínas Tol C en membrana externa TolC de E.coli es una proteína canal muy versátil que puede interactuar con un amplio rango de proteínas de exportación de la membrana citoplasmática, observándosele tanto en la eliminación de pequeňas moléculas de antibióticos como en la de grandes toxinas proteicas. El transporte requiere energía. Tol C y sus componentes asociados a la membrana celular le confieren virulencia y resistencia a drogas a las bacterias patógenas gram negativas. Sin embargo, Tol C también es una fuente de vulnerabilidad porque puede constituir una vía de entrada para proteínas bactericidas como las colicinas. Proteína Tol C Secreción de proteínas Tipo II (T2SS) • T2SS: Presenta aproximadamente 12 o más componentes que ocupan el espacio periplasmático. Los sustratos son proteínas plegadas o semi plegadas con secuencias señal en el extremo N-terminal que les permite atravesar la membrana. Removida la señal, la proteína es liberada por un movimiento tipo pistón, accionada por una estructura tipo pseudopili y con energía mediada por una ATPasa. • Ejemplos de toxinas que son secretadas por el T2SS son: la toxina del cólera de V. cholerae , la exotoxina A de P. aeruginosa . Algunos patógenos secretan enzimas que utilizan para adaptarse a sus hospederos Ejm. Legionella pneumophila, E. coli enterotoxigénica y enterohemorrágica; K. pneumoniae , Aeromonas hydrophila. Sistemas de Secreción Tipo I y Tipo II Secreción de proteínas Tipo III (T3SS) • T3SS: Es un sistema estructurado a manera de jeringa designado para inyectar proteínas desde el citoplasma de una célula bacteriana directamente a una célula eucariota. Tienen asociada la enzima ATPasa para proveer energía • Es comúnmente usado por patógenos para liberar toxinas en el hospedero (Yersinia, Salmonella enterica serovariedad typhimurium, Shigella flexneri, Chlamydia trachomatis Secreción de proteínas Tipo IV (T4SS) • T4SS: Está constituido por varios elementos que se ubican desde la membrana plasmática hasta la membrana externa. • Varios patógenos usan estos sistemas de secreción para liberar proteínas efectoras en células eucariotas. Muchos de estos sistemas median la transferencia de macromoléculas DNA, proteínas o complejos DNA-proteínas intracelularmente, utilizando una ATPasa que otorgue energía. Ejm. Helicobacter pylori libera la proteína Cag A (145kDa). Bordetella pertussis libera algunas de sus toxinas por este mecanismo. Agrobacterium tumefasciens traslada un Ti-DNA oncogénico hacia una planta por este mecanismo. Sistemas de Secreción Tipo III y Tipo IV Estrategias nutricionales en Hongos patógenos • Infección: Biotrófica, hemibiotrófica, necrotrófica. • Estrés oxidativo • Inducción de sustancias de defensa • Producción de toxinas • Producción de enzimas degradadoras de pared Hongos patógenos vegetales • Biotróficos: establecen una relación de nutrición a largo plazo con su hospedero. • Necrotróficos:invaden las células vegetales de manera agresiva, matando las células vegetales mediante toxinas o enzimas. • Hemibiotróficos: se comportan como parásitos biotróficos durante los primeros estadios de la infección, pero luego necrosan los tejidos de la planta y continúan su ciclo como necrotróficos. Existen señales celulares involucradas en la movilización del glucógeno y lípidos de reserva en la espora. Se genera presión de turgencia en el apresorio mediante la compartamentalización y degradación rápida de las reservas de la espora . Durante el establecimiento de la presión de turgencia, interviene el ciclo del glioxilato y además actúa reponiendo intermediarios del ciclo TCA a partir del acetil CoA generado en la oxidación de los ácidos grasos. Se requiere de un factor de transcripción (Nir1), para la expresión de la nitrato reductasa (NR), necesaria para la asimilación de nitrato (Ejm. en Colletotrichum acutatum),. Procesos nutricionales durante la penetración del apresorio
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