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UNIVERSIDAD DE CARABOBO FACULTAD DE CIENCIAS DE LA SALUD ESCUELA DE MEDICINA DEPARTAMENTO DE BIOQUIMICA ENZIMASENZIMAS Área de la química que tiene relación con la rapidez o velocidad con que ocurre una reacción química.química. Energía cinética VELOCIDAD DE REACCIÓN VELOCIDAD DE REACCIÓNVELOCIDAD DE REACCIÓN Cambio en la concentración de reactante o producto por unidad de tiempo. Viene expresada como M.s -1 (M/s)” V = - Δ[R] V = Δ[P]o Reactivos o Reactante V = - Δ[R] Δt V = Δ[P] Δt o Producto [Producto][Reactivos] A medida que se consumen las moléculas de reactantes, disminuye la velocidad. Matemáticamente se puede expresar: V = - d[R] dt V = d[P] dt o Matemáticamente se puede expresar: K (Constante de velocidad). Proporciona una medida directa de la rapidez con la que se produce la reacción V α [R] → V = k[R] Tipos De Reacciones QuímicasTipos De Reacciones Químicas 1. Reacciones De Orden Cero.Cero. V = k [R]0 → V = k La velocidad de reacción es independiente de la [R] v e lo c id a d concentración Tipos De Reacciones QuímicasTipos De Reacciones Químicas 2. Reacciones De Primer 2. Reacciones De Primer Orden.Orden. La velocidad de la reacción es proporcional a la primera potencia del reactante. ve lo c id a d concentración V α [R] 1 → V = k [R] 1 TEORÍA DE LAS COLISIONES:TEORÍA DE LAS COLISIONES: La teoría cinética molecular establece que las moléculas de los gases chocan frecuentemente unas con otras. V α nº colisiones s Dependencia de la reacción con la [R] Las reacciones químicas ocurren Las reacciones químicas ocurren como resultado de los como resultado de los choques entre entre moléculas de los reactivosmoléculas de los reactivos “Para que haya una reacción química, las moléculas que chocan deben tener una energía cinética total de gran magnitud que las conlleve a superar la barrera Teoría De Colisiones Energía cinética > ENERGÍA ACTIVACIÓN gran magnitud que las conlleve a superar la barrera energética que les impida fraccionarse” Energía De Activación:Energía De Activación: Mínima cantidad de energía que Estado De Transición Y Velocidad De La Estado De Transición Y Velocidad De La ReacciónReacción S P Mínima cantidad de energía que deben adquirir las moléculas para alcanzar el estado de transición. Estado de Transición:Estado de Transición: Momento molecular fugaz. Reordenamiento de cargas, uniones inestables, etc. �� Compuesto químico que REDUCE la energía CATALIZADORCATALIZADOR que REDUCE la energía de activación, ACELERANDO la velocidad de la reacción.NOTA: NOTA: NONO tienen efecto alguno tienen efecto alguno sobre la constante de equilibriosobre la constante de equilibrio Los catalizadores reducen la energía de activación forzando a las moléculas de reactantes a un estado intermediario que se parezca al estado de transición pero de MENOR ENERGÍA Los catalizadores pueden unir dos moléculas de reactantes en la orientación mutua adecuada aumentando su reactividad. MENOR ENERGÍA ORGÁNICO INORGÁNICO Proteínas Globulares. Se desnaturalizan Ácidos, bases o metales estables Alta especificidad de sustrato y de reacción Baja especificidad sustrato y de reacción Alta velocidad de catálisis Baja velocidad de Catálisis Sujetas a Inhibición No se inhiben Son regulables No son regulables EnzimasEnzimas Son proteínas que aceleran la velocidad de las reaccione biológicas. (CTALIZADORES) Concepto. f(CTALIZADORES) � Mantienen su configuración una vez realizada la reacción. � Pueden ser regulables. � Actúan en secuencias organizadas : Sistemas multienzimáticos. f f � Disminuyen la energía de activación. � Poseen alta especificidad. � No alteran el equilibrio de la reacción Características Generales EEnzimasnzimas Intracelulares LOCALIZACIÓNLOCALIZACIÓN Extracelulares � Enzimas digestivas. � Enzimas que participan en la coagulación (plasma). � Otras enzimas presentes en diferentes fluidos y secreciones. EEnzimasnzimas Sitio activo � .- Lugar de unión de la enzima al sustrato. � .- Puede poseen mas de un sitio activo. � .- Determina la especificidad enzimática. 1. Modelo llave cerradura Modelo de interacción enzima- sustrato � propuesto por Emil Fisher en 1894. � Rigidez del sitio catalítico; Sustrato se adapta de manera exacta. Modelo de interacción enzima- sustrato 1. Modelo Ajuste Inducido � Propuesto por Daniel Koshland. � El sustrato induce un cambio conformacional en la enzima y viceversa. � La enzima y el sustrato sufren una distorsión al unirse. Enzimas. Enzimas. “ son moléculas que contribuyen con la actividad catalítica de la enzima” FUNCIONES DE LOS COFACTORES � Estabilizan la estructura tridimensional de la enzima. � Facilitan la interacción E-S. � Participa como segundo sustrato. � Pueden ser de 2 tipos: Orgánicos e Inorgánicos Cofactores OrgánicosCofactores Orgánicos Se denominan Coenzimas. Son derivados de las vitaminas. Se unen de manera covalente a la Enzimas. Enzimas. Apoenzima + Grupo Prostético = Holoenzima Apoenzima: Parte proteica de la holoenzima Grupo Prostético: molécula unida covalentemente a la enzima unen de manera covalente a la enzima. Cofactores InorgánicosCofactores Inorgánicos Suelen ser algunos metales: hierro, magnesio, manganeso, etc. Se unen de Enzimas. Enzimas. magnesio, manganeso, etc. Se unen de manera no covalente a la enzima. Las enzimas que los presentan Se denominan metaloproteinas. Estudia la velocidad de las reacciones químicas que son catalizadas por las enzimas. [Sustrato]Factor clave que afecta la velocidad de la Rx Para evaluar la catálisis se mide velocidad inicial (Vo) cuando la [sustrato] > [enzima] Hipérbola Rectangular Característica • A [sustrato], muy bajas, la • A [sustrato], muy bajas, la Rx es de primer orden, Vo= K[S] • A [sustrato], muy altas, Vo tiene una Vmáx, y la Rx es de orden cero, Vo= K Expresión matemática de la hipérbola rectangular: ECUACIÓN DE MICHAELIS- MENTENMENTEN Vo = Vmáx[S] Km + [S] Nota: esta ecuación no hace NINGUNA consideración sobre el mecanismo de la Rx enzimática Ecuación De Michaelis- Menten Vo = Vmáx[S] Km + [S] Vmáx Velocidad inicial máxima de la reacción catalizada por una enzima y es el valor límite al que se aproxima Vo cuando la [S] → ∞ Km Constante de Michaelis. Es igual al valor de [S] en que Vo = ½ V máx. Se suele asociar con la AFINIDAD de la enzima por el sustrato. A menor Km mayor afinidad. • [sustrato] < Km, la Vo depende de la [S] Ecuación De Michaelis- Menten depende de la [S] • [sustrato] > Km, la Vo se hace máxima (Vmáx) • [sustrato] = Km, la Vo = ½ Vmáx Linealización de la Ecuación de Michaelis - Menten Ecuación De Lineweaver-Burk 1 = Km . 1 + 1 _ Vo Vmáx[S] Vmáx Y = mx + b Ecuación de una línea recta Inhibición Reversible Competitiva: � El inhibidor se une al sitio activo de la enzima. � Inhibidor molecularmente similar al sustrato. � Se forma el complejo EI � El efecto inhibitorio se revierte aumentando la [sustrato] Inhibición Reversible Competitiva: El valor de El valor de Km Km aumenta pero la aumenta pero la VmáxVmáx es la mismaes la misma � El inhibidor NO se une al sitio activo de la enzima, sino a un sitio diferente. Inhibición Reversible NO Competitiva: sino a un sitio diferente. � Inhibidor molecularmente diferente al sustrato. � Se forma el complejo EI y EIS Inhibición Reversible NO Competitiva: El valor de Km no se modifica, mientras que la El valor de Km no se modifica, mientras que la VmaxVmax disminuye.disminuye. � El inhibidor se combina de forma covalente con la enzimas y la inactiva. Inhibición Ireversible � Se combinan con grupos funcionales del sitio activo produciendo inactividad. Iones metales pesados (Pb, Hg)Iones metales pesados (Pb, Hg) YodactamidaYodactamida InsecticidasInsecticidas REDUCEN LAACTIVIDAD REDUCEN LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICAENZIMÁTICA “Conjunto de enzimas que actúan en secuencia catalizando Reacciones consecutivas de una ruta metabólica” Tipos: 2) No disociados o complejos:1) Disociados o simples: 2) No disociados o complejos: Enzimas asociadas físicamente 1) Disociados o simples: Enzimas separadas físicamente. 3) Asociados a estructuras supramoleculares: Enzimas no unidas entre sí físicamente pero localizadas en la misma estructura ej. Cadena transportadora de electrones Características Generales: � La velocidad de cada reaccion viene determinada por la [S] y [E] individual � Cada enzima tiene su propio Km y su propia Vmáx � La velocidad de cada reaccion viene determinada por la [S] y [E] individual � Existe por lo menos una enzima reguladora o alostérica � Presentan alto grado de organización � Los intermediarios deben difundir distancias cortas entre una enzima y otra. � La velocidad de cada secuencia es ajustada minuto a minuto Regulación de la actividad enzimática (a corto Regulación de la actividad enzimática (a corto plazo):plazo): enzima Grupo Fosfato 1) Disponibilidad De Sustrato. sustrato enzima Grupo Fosfato Interconversión reversible entre sus formas activas e inactivas: a) a) FosforilaciónFosforilación y y desfosforilacióndesfosforilación de de residuos.residuos. b) Metilación, acetilación y la b) Metilación, acetilación y la nucleotidilaciónnucleotidilación FosforilaciónFosforilación y y desfosforilacióndesfosforilación de de residuos.residuos. Regulación de la actividad enzimática (a corto Regulación de la actividad enzimática (a corto plazo):plazo): 2) Modificación Covalente. Interconversión Irreversible entre sus formas activas e inactivas: a) Ruptura proteolítica de a) Ruptura proteolítica de zimogenoszimogenos o o proenzimasproenzimasformas activas e inactivas: zimogenoszimogenos o o proenzimasproenzimas 3) Regulación Alostérica: Regulación producida por efectores Regulación de la actividad enzimática (a corto Regulación de la actividad enzimática (a corto plazo):plazo): Regulación producida por efectores alostéricos de PM bajo 1) Control Genético: Regulación de la actividad enzimática (a Largo Regulación de la actividad enzimática (a Largo plazo):plazo): Procesos genéticos y moleculares de Procesos genéticos y moleculares de Inducción Inducción ↔↔ RepresiónRepresión ALOSTERISMO. Cambios conformacionales y funcionales de la enzima por fijación de una molécula en un sitio de la superficie de la enzima ENZIMAS ALOSTERICAS. Son proteínas que funcionan a través de la unión reversible, no covalente, de compuestos reguladores denominados reguladores alostéricos. superficie de la enzima � Poseen múltiples subunidades y varios sitios reguladores � Controlan la velocidad de una ruta metabólica Los moduladores alostéricos pueden ser: Activadores o Inhibidores. Cuando el propio sustrato es un modulador, éste se denomina modulador HOMOtrópico Cuando una molécula diferente del sustrato es un modulador, éste se denomina modulador HETEROtrópico Propiedades SITIO ALOSTÉRICO Mecanismo de RETROINHIBICIÓN Cinética Enzimática En Reacciones Catalizadas Por Enzimas Alostéricas Enzimas Homotrópicas Curva de saturación sigmoidea No siguen la relación hiperbólica de la Ecuación de Michaelis-Menten Pequeños cambios en la [Modulador] se pueden asociar a grandes rasgos en la actividad Enzimas Heterotrópicas Es difícil generalizar sobre una forma característica Cinética Enzimática En Reacciones Catalizadas Por Enzimas Alostéricas forma característica Un activador puede hacer que la curva sea más próxima a un hipérbola Un inhibidor puede producir una curva de saturación sigmoidea “Enzimas que difieren estructuralmente entre sí pero posen la misma actividad catalítica” Características Generales: � Son codificadas por genes distintos pero estructuralmente relacionados. � Tiene valores de pH y punto isoeléctrico distintos � Poseen diferencias en la composición y secuenciación de Aminoácidos. � Sus valores de Km y Vmáx son distintos. 1) Efecto de la temperatura 2) Efecto del pH 3) Efecto de la [E] 4) Efecto de la [S] 2) Efecto del pH 1)1) Efecto De La Concentración De Efecto De La Concentración De Enzima [E] Enzima [E] v e lo c id a d Concentración [E] La velocidad inicial de una Reacción enzimática siempre es proporcional a la [E] 2) Efecto De La Concentración De Sustrato [S] La Vo es proporcional a laLa Vo es proporcional a la concentración de sustrato, hasta llegar a una Vmax (enzima saturada) 3) Efecto De La Temperatura Temperatura óptima La La VoVo se incrementa con el se incrementa con el aumento de temperatura.aumento de temperatura. v e lo c id a d temperatura óptima Coeficiente de temperatura o Q10: es el factor mediante el que se aumenta la velocidad de un proceso biológico para un incremento de temperatura de 10ºC 4) Efecto Del Ph pH óptimo v e lo c id a d pH pH óptimo El pH afecta el estado iónico del sitio activo. Igualmente puede conducir a la desnaturalización de la enzima � Variación de entropía ENZIMAS. FACTORES FÍSICOS Y TERMODINÁMICOS ENZIMAS. FACTORES FÍSICOS Y TERMODINÁMICOS QUE DESFAVORECEN UNA REACCION:QUE DESFAVORECEN UNA REACCION: � Capa de solvatación � Distorsión de los sustratos. � Alineamiento inadecuado de los grupos funcionales. Barreras superadas por la ENERGÍA DE FIJACIÓN ENERGIAENERGIA DEDE FIJACIONFIJACION:: Interacciones no covalentes en el estado de transición que liberan cierta cantidad de energía libre, la cual es importante para disminuir la energía de activación ENZIMAS. Factores Que Contribuyen A La ENZIMAS. Factores Que Contribuyen A La Actividad Catalítica:Actividad Catalítica: 1. Proximidad, Orientación Y Tensión Del Sustrato En Relación Al Grupo Catalítico: La tensión generada ayuda a llevar al complejo ES al estado de transición ORIENTACION Desfavorable Desfavorable Favorable PROXIMIDAD Desfavorable Favorable Favorable 2. Distorsión Del Enlace Susceptible Del Sustrato Por Ajuste Inducido De La Enzima. ENZIMAS. Factores Que Contribuyen A La ENZIMAS. Factores Que Contribuyen A La Actividad Catalítica:Actividad Catalítica: Enzimas Líticas: Las enzimas unen al sustrato en una conformación desfavorable para el enlace, debilitándolo y haciéndolo mas vulnerable a la ruptura. Según Su Composición Química:Según Su Composición Química: • SIMPLES • CONJUGADAS Por si solas tienen efecto catalítico Requieren de un componente químico adicional llamado COFACTOR Según La Según La RxRx Que Catalizan:Que Catalizan: 1. Oxidorreductasas. Catalizan reacciones de oxido reducción de todo tipode todo tipo 1. Oxidasas. 2. Deshidrogenasas 3. Oxigenasas 4. Peroxidasas 5. Catalasas Tipos de Tipos de oxidoreductsasoxidoreductsas OxidorreductasasOxidorreductasas:: 1.- Oxidasas. Transfieren electrones de la molécula donadora al O2 AH2 + ½O2 → A(ox) + H2OAH2 + ½O2 → A(ox) + H2O 2.- Deshidrogenasas. Transfieren electrones de un sustrato a otro AH2 + NAD+ → A (ox) + NADH + H+ 3.- Oxigenasas. Catalizan la incorporación de 2 átomos de oxígeno a un sustrato libre OxidorreductasasOxidorreductasas:: 4.- Peroxidasas. Reducen los peróxidos, usando varios aceptores de electrones H2O2 + AH2 → 2H2O + A A + O2 AO2→ 5.- Catalasas: Utilizan el peróxido de hidrógeno como donador y aceptor de electrones H2O2 + H2O2 → 2H2O + O2 OxidorreductasasOxidorreductasas:: H2O2 + H2O2 → 2H2O + O2 2.- Transferasas. Catalizan la transferencia de un grupo de átomos intacto de una molécula donadora a un aceptor •Transaldolasas • Transcetolasas • Aciltransferasas • Metiltransferasas •Fosfomutasas •Kinasas • Aminotransferasas 3.- Hidrolasas: Catalizan el rompimiento hidrolítico de enlaces mediante la adición de agua • Esterasas • Glucosidasas• Peptidasas • Fosfatasas •Thiolasas •Fosfolipasas Desaminasas: Catalizan la desaminación de un sustrato con la participación del agua H2N – C – NH2 + H2O → 2NH3 + CO2 = O Urea Ureasa 4.- Liasas: Catalizan reacciones en las que se eliminan grupos para formar un doble enlace o se añaden a un doble enlace • Descarboxilasas. • Aldolasas • cetolasas • Hidratasa Deshidratasas: Catalizan la deshidratación de un sustrato 5.- Isomerasas: Catalizan varios tipos de reordenamientos intramoleculares Epimerasas o racemasas: Catalizan cambios de localización de grupos alrededor de un carbono asimétrico Mutasas: Catalizan transferencias intramoleculares de grupos 2- fosfoglicerato ↔ 3-fosfoglicerato ↔ 6.- Ligasas. Catalizan la formación de un enlace entre dos moléculas de sustrato • Sintetasas • Carboxilasas: Catalizan la síntesis de un• Sintetasas • Carboxilasas: Catalizan la síntesis de un compuesto a partir de la condensación de un sustrato con CO2 + ATP + CO2 → + ADP + Pi Citrato Oxaloacetato
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