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Enzimas Introduccion: Conocemos como catalizador a cualquier sustancia que acelera la velocidad de una reacción, pero sin participar químicamente en ella. Ej: la descomposición del peróxido de hidrógeno a agua y oxígeno es extremadamente lenta, pero la adición de ión férrico acelera la reacción, con la formación observable de burbujas de oxígeno Definición: -Las reacciones de los sistemas biológicos suceden en tiempos apreciables debido a que están catalizadas por agentes, en su gran mayoría de naturaleza proteica, llamados enzimas. Las ENZIMAS son los catalizadores de los sistemas biológicos. Una ribozima es una enzima de naturaleza ribonucleica, es decir, está formada por una o varias cadenas de ARN. Son necesarias para la expresión correcta de los genes. Propiedades de las enzimas: No se modifican : aceleran las reacciones químicas de los sistemas biológicos, par�cipan en una reacción y experimentan cambios �sicos durante ella, pero regresan a su estado original cuando la reacción termina. No se consumen ni se alteran durante el proceso químico que están catalizando, pudiendo actuar una y otra vez. Son altamente especificas: Sustrato y Reacción Poseen un elevado grado de especificidad de sustrato. La acción se una enzima se limita a un determinado �po de compuesto que debe reunir ciertas caracterís�cas para que pueda ser utilizado como sustrato. En concreto esto significa que las células generalmente producen diferentes enzimas para cada compuesto que metabolizan. Además, cada enzima interviene en un solo paso o cambio del sustrato Glucoquinasa Glucosa ✖ Fructosa ➢ Son altamente especificas: Sustrato y Reacción No cambian la constante de equilibrio de las reacciones quimicas, cambian la velocidad. Una reacción reversible puede proceder tanto hacia productos como hacia reactivos. El equilibrio se da cuando la velocidad de la reacción hacia adelante es igual a la velocidad de la reacción en sentido inverso. Las concentraciones de reactivos y productos se mantienen constantes en el equilibrio. Dada la reacción aA + bB ⇋ cC + dD, la constante de equilibrio Kc, también llamada K o Keq, se define como sigue : Keq = [C]c[D]d [A]a [B]b N2O4(g) ⇋2NO2(g) Reacciones rev tienden al estado de equilíbrio químico, el punto en el cual tanto el proceso hacia adelante como el proceso inverso suceden a la misma velocidad. Dado que las velocidades hacia adelante y hacia atrás son iguales, las concentraciones de los reactivos y productos son constantes en el equilibrio. Cofactores: Un cofactor es una molécula químicamente diferente a la enzima, que estáunida a esta y es necesaria para que ésta pueda tener una ac�vidad catalí�ca. Existen tres tipos: coenzimas, iones metálicos. Una coenzima es una molécula pequeña, de naturaleza organica, que estáquímicamente unida a la enzima y es necesaria para su función catalí�ca, ya que forma parte de su sitio activo, el lugar de la enzima que realiza la reacción. Un ejemplo son las vitaminas del complejo B . Iones metálicos como hierro (Fe++), cobre (Cu++),magnesio (Mg++), manganeso (Mn++) y zinc (Zn++), son algunos de los cofactores inorganicos No todas las enzimas necesitan coenzimas, pero aquellas que lo hacen no pueden trabajar sin. A la parte proteica de la enzima se le llama apoenzima, y a la unión de apoenzima y coenzima se le conoce como holoenzima, que ya es activa. Cofactores metálicos: Podemos resaltar los de mayor importancia: Magnesio: Cofactor de enzimas que transfieren grupos fosfatos desde el ATP., Cofactor de la enzima acetilcolinesterasa. Cobre : Cofactor de enzimas Cu-dependientes que intervienen en la formación de: hemoglobina, colágeno, lecitina, mielina. Zinc : Cofactor de metalo-enzimas (anhidrasa carbónica, fosfatasa alcalina, carboxipeptidasa, ARN polimerasa, ADN polimerasa, etc.). Hierro: Cons�tución como cofactor de enzimas oxidasas (peroxidasa, catalasas, citocromo C, etc.) Manganeso: Cofactor de enzimas como la arginasa y la ribonucleotidoreductasa Coenzima: Oxidoreductasas y tranferasas: SON LAS ENZIMAS QUE SIEMPRE PRECISAN DE COENZIMAS. implican la transferencia de electrones y grupos funcionales. Cada clase de reacción de transferencia se lleva a cabo por una coenzima particular. Las coenzimas más importantes son: NAD, NADP, FAD Vitaminas hidrosolubres y su función como coenzimas: principal papel de las vitaminas es actuar como coenzimas en el organismo, aunque las vitaminas tienen otras funciones en el cuerpo. Las coenzimas también se fabrican a par�r de nucleó�dos, como la adenosina trifosfato (que es el transportador bioquímico de los grupos fosfato), o la coenzima A (que transporta grupos acilo) Grupo prostetico: Un grupo prosté�co es una molécula con caracterís�cas químicas diferentes a la enzima (como una coenzima), que estáunida a ella, pero que no participa como parte del sitio activo. Por ejemplo, algunas enzimas están glucosiladas o �enen residuos de lípidos Mecanismo de acción enzimático -Aceleran la velocidad de la reacción al disminuir la energía de activación. -E de ac�vación: Para que una reacción química tenga lugar, los reactivos deben de alcanzar un estado de energía, de modo que se puedan activar y transformarse en productos. • Cuando es necesario agregar energía a los sustratos (calor, por ejemplo), y por lo tanto los productos �enen más energía que los sustratos, se dice que la reacción es endergónica. • Cuando durante la reacción, los sustratos liberan energía al transformarse en productos, la reacción se conoce como exerergónica La energía de ac�vación es un paso limitante en la velocidad de las reacciones. Las enzimas aceleran las reacciones al disminuir la energía de ac�vación necesaria para llevar a cabo la reacción. Esto no quiere decir que los sustratos pierden o ganan energía, sólo se necesita menos para realizar su transformación. El sitio activo de la enzima (una depresión o hendidura) es la región que está directamente involucrada en la reacción que se cataliza. La activación de la molécula de sustrato se produce debido a la gran afinidad química (electrónica) del sustrato por ciertas áreas de la superficie de la enzima, sitios activos. El sitio activo posee la geometría (estereoespecificidad)entre el sitio activo y su sustrato y distribución de cargas (positivas y negativas) para unirse específicamente y en forma complementaria a un determinado sustrato. a) Modelo de llave-cerradura. b) Modelo de ajuste inducido. El sustrato se une al si�o ac�vo de la enzima por medio interacciones hidrofóbicas y electrostá�cas, puentes de hidrógeno y fuerzas de van der Waals. Los residuos de aminoácidos de la enzima que participan en la interacción con el sustrato, se encuentran alejados unos de otros en la secuencia lineal de aminoácidos de la proteína: pero como resultado del plegamiento de ésta, se agrupan para formar el sitio activo de la enzima. Algunos de estos residuos par�cipan solamente en la unión de sustrato y definen una región del si�o ac�vo que se llama si�o de fijación o de unión del sustrato. Otros residuos del si�o ac�vo, los catalí�cos, se encargan directamente de la transformación del sustrato en producto y forman el sitio catalí�co. Sitio activo de la ribulosa 1,5 difosfato carboxilasa- oxigenasa, con su sustrato, la ribulosa 1, 5 difosfato Factores que afectan la actividad enzimática: Efecto de la temperatura: Temp Velocidad de reacción, debido en la energia ciné�ca de las moléculas reactantes, pero esto ocurre sólo en el intervalo de temperatura, cuando se incremente mucho, se favorece la desnaturalización y consecuentementeesta proteína pierde su capacidad catalizadora. Cada enzima tiene un intervalo óptimo de temperatura de acción, la mayoría tiene su temperatura óp�ma entre 30°C y 40°C, y se inac�va a más de 55oC. La desnaturalización puede ser reversible o irreversible, por lo que la enzima en ciertas condiciones, llega a recuperar su función. Efecto del pH: La actividad de las enzimas depende mucho de la concentración de iones de hidrógeno del medio, ya que esto afecta el grado de ionización de los aminoácidos del si�o ac�vo, del sustrato, o del complejo enzima-sustrato; todo eso llega a influir en la afinidad que tenga la enzima por el sustrato. Concentración de la enzima: Siempre y cuando haya sustrato disponible, un aumento en la concentración de la enzima aumenta la velocidad enzimá�ca hacia cierto límite Concentración del sustrato: A mayor concentración del sustrato, a una concentración fija de la enzima se ob�ene la velocidad máxima. Después de que se alcanza esta velocidad, un aumento en la concentración del sustrato no �ene efecto en la velocidad de la reacción. Algunas enzimas permanecen libres en concentraciones bajas de sustrato y no se alcanza la máxima velocidad. Cuando el sustrato se encuentra en exceso, toda la enzima se transforma en ES y la reacción se realiza a su máxima velocidad. Km: constante, concentración del sustrato a la cual la velocidad= Vmax 2 Cada enzima tiene su Km especifica Inhibidores irreversibles: Inhibiciones reversibles: Inhibición competitiva: Inhibición no competitiva: Inhibición acompetitiva: Regulación enzimática: El control del metabolismo celular implica esencialmente la regulación de la ac�vidad enzimá�ca. La regulación de la ac�vidad enzimá�ca contribuye en gran parte a preservar la homeostasia que, man�ene un entorno intracelular e intraorgánico rela�vamente constante en presencia de fluctuaciones amplias en el medio ambiente externo, como cambios de temperatura, presencia o ausencia de agua, �pos específicos de alimentos, o necesidades puntuales del la célula. Objetivos de la regulación: Producir los metabolismos necesarios y en la cantidad adecuada cuando son requeridos. (máx. economía). Aprovechar la energía disponible en forma eficiente. Mantener un control de las fuentes energé�cas. Mantener un nivel adecuado de ATP. Regulación enzimática: Las reacciones enzimá�cas están organizadas en rutas bioquímicas o metabólicas Procesos o comjuneto de reacciones para llegar a un producto final). Las vias metabolicas estan interconectadas entre si. En cada ruta el producto de una reacción es el sustrato de la siguiente Las rutas deben estar reguladas para: Conservar la energía Mantener un estado celular ordenado Responder a variaciones ambientales Las enzimas reguladoras catalizan las reacciones más lentas y fijan la velocidad de la ruta. ( velocidad limitante, enzima limitante, reacción limitante) Tipos de regulación: REGULACION A NIVEL SUSTRATO A mayor can�dad de sustrato o enzima, mas grande es la elaboración de producto ( reacción se desplaza hacia la formación de productos) Aumenta la cantidad de producto (P) y P inhibe la reacción ( inhibe a la enzima) Regulación por retroalimentción/feed back Inhibición de la enzima reguladora por el producto final. Se impide: Utilización innecesaria del primer sustrato Acumulación del producto final Acumulación de intermediarios Regulación cruzada Un producto de una vía activa o inhibe un enzima de los primeros pasos de otra ruta Regulación alosterica: Control alostérico: ENZIMAS ALOSTÉRICAS Regulador o modulador alostérico: pequeños metabolitos o cofactores que se unen a sitios distintos del centro activo y modifican la actividad enzimática Modulador propio sustrato: homoalosterismo. Enzimas homotrópicos el sitio modulador y el sitio activo son el mismo. Modulador molécula dis�nta a sustrato: heteroalosterismo. Enzimas heterotrópicos el si�o modulador y el sitio activo distintos. Enzimas alostéricas: Proteínas con estructura 4aria Más de un centro activo y catalítico Ac�vidad regulada por moduladores alostéricos, unión no covalente Ciné�cas sigmoidea Cooperatividad Modulador alosterico positivo o negativo No todas las enzimas cumplen con esta ciné�ca michaeliana. Existen otras cuya velocidad de reacción describe una curva sigmoidea que indica que: La unión de una molécula moduladora en un si�o ac�vo influye en la unión de otra molécula de sustrato en un segundo sitio activo y asi sucesivamente. Alosterismo: Cooperatividad Regulación covalente: Unión covalente de ligandos Ligando aporta grupo funcional que modifica las propiedades de la enzima Modificación reversible Me�lación ADP-ribosilación Ace�lación. Fosforilacion/desfosforilacion. Unión covalente de ligandos Por ruptura proteoliticas: Zimogenos
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