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También se pueden analizar simultáneamente en una matriz dos muestras diferentes, si en cada una de ellas, se ha marcado la población de ácido nucleico a analizar con un grupo fluorescente diferente, lo que permite estimar la abun- dancia relativa de cada ARN, en función de la proporción de las moléculas de cada muestra que se une a las moléculas de ácido nucleico inmovilizadas en las diferentes posiciones de la matriz (Fig. 24-2). Este tipo de análisis tiene gran interés en oncología, ya que la determinación del patrón de expresión de genes característicos en un determinado tipo de cáncer puede ser importante en el pronóstico y tratamiento del enfermo. También resulta interesante el estudio del conjunto de proteínas que se expresan en un determinado grupo de célu- las o tejidos, ya que el proteoma suministra una aproxima- ción más real a la funcionalidad de un organismo vivo que el de la expresión de ARNm, pues es sabido que la abundancia de un determinado ARNm no está necesariamente relaciona- da con la cantidad de proteína expresada. Desde el punto de vista de la Medicina resulta importante determinar qué pro- teínas cambian su expresión en un determinado proceso patológico, o cuáles pueden ser específicas en un determina- do tipo de cáncer, ya que el estudio detallado de las mismas puede suministrar una información muy valiosa para el desa- rrollo de medicamentos más específicos y con menos efectos indeseables. Entre las diferentes técnicas utilizadas por la proteómica para el análisis de proteínas se encuentran la electroforesis bidimensional, basada en la separación de las proteínas de una muestra en función de su carga eléctrica y de su tamaño, lo que da lugar a la obtención de la «huella proteica» de una determinada muestra procedente de un líquido o tejido y per- mite compararla con la obtenida bajo diferentes condiciones fisiológicas o patológicas (Fig. 24-3). A partir de una de las manchas del gel se puede determinar las características de la proteína en cuestión, sometiéndola a un proceso de fragmen- tación y análisis mediante espectrometría de masas, lo que suministrará un espectro que sirve a modo de huella dactilar para identificar la proteína original. Otras técnicas proteómi- cas emplean sistemas combinados de alto rendimiento, que incluyen la digestión de la muestra con proteasas específicas para generar fragmentos peptídicos que, tras su separación por técnicas de cromatografía de alta resolución, pueden ser analizados mediante sofisticados equipos de espectrometría de masas (MALDI, MALDI-TOF, etc.), que generan, con ayuda de la información existente en bancos de datos ade- cuados, la composición proteica de la muestra analizada. 424 | Genoma, patología molecular y terapia génica Figura 24-2. Análisis de la expresión de genes mediante micromatrices de ADN. Cada cuadrícula de la matriz lleva unida una cade- na pequeña de secuencia conocida. Muestras de ARNm o ADNc obtenidas a partir de dos situaciones diferentes, A y B, marcadas con un compuesto fluorescente distinto, se hibridan con la matriz, y se analiza el grado de fluorescencia en cada cuadrícula. Micromatriz de ADN Hibridación Lectura de micromatriz Marcador fluorescente A T T A GC GC CG A T T A CG Muestra A Muestra B 24 Capitulo 24 8/4/05 11:46 Página 424
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