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Tecnología ADN y genómica 335 La información de la secuencia de ADN se guarda en grandes bases de datos de computadoras, muchas de las cuales son accesibles en Inter- net. Ejemplos son las bases de datos del Centro Nacional de Información Biotecnológica y de la Organización del Genoma Humano (HUGO). Los genetistas utilizan esas bases de datos para comparar secuencias recién descubiertas con aquellas ya conocidas para identifi car genes y acceder a muchos otros tipos de información. Al investigar secuencias de ADN o de aminoácidos en una base de datos, los investigadores pue- den ganar mucha visión en la función y estructura del producto génico, las relaciones evolutivas entre genes, y la variabilidad entre secuencias de genes dentro de una población. La secuenciación de ADN en las es- pecies ha proporcionado una gran cantidad de información nueva que sustentan la evolución (vea el capítulo 18). Repaso ■ ¿Qué es la transferencia e hibridación de Southern? ■ ¿Qué técnica hace funcional la secuenciación de ADN automatizada? Describa las etapas básicas de este método. 15.3 GENÓMICA OBJETIVOS DE APRENDIZAJE 7 Describir tres importantes áreas de investigación en genómica. 8 Explicar cómo funciona un microarreglo de ADN y dar un ejemplo de su investigación y potencial médico. 9 Defi nir farmacogenética y proteómica. Ahora que se han secuenciado los genomas humanos y de varios cien- tos de otras especies, ¿qué puede hacerse con esa información? La ge- nómica es el campo emergente de biología que estudia la secuencia de ADN completa del genoma de un organismo para identifi car todos sus genes, determinar su ARN o productos proteínicos, e indagar cómo los genes son regulados. Como se verá, la genómica tiene importantes aplicaciones prácticas además de ayudar a contestar preguntas científi cas. La ciencia de la genómica tiene varias áreas de investigación, incluyendo genómica estructural, ge- nómica funcional, genómica comparativa, y meta- genómica. La genómica estructural se ocupa del mapeo y secuenciación de genomas. La genómica funcional estudia las funciones de los genes y secuencias no gé- nicas en genomas. La genómica comparativa implica la comparación de genomas de diferentes especies para determinar qué cambios de ADN han ocurrido du- rante el curso evolutivo. Este conocimiento aumenta nuestra comprensión de relaciones evolutivas porque los genes con poca o ninguna variación entre espe- cies son funcionalmente importantes en las especies en donde son encontrados. La metagenómica utiliza técnicas genómicas para analizar comunidades de organismos en lugar de organismos individuales. La metagenómica permite que los investigadores identi- fi quen y estudien todos los genes en una comunidad, al mismo tiempo. de reacción que incluye ddCTP, cada fragmento que contiene ddCTP marca la posición de una citosina en la cadena recién sintetizada, y así sucesivamente. Los fragmentos radiactivos de cada reacción se desnaturalizan y des- pués se separan en un gel por electroforesis, con cada mezcla de reacción, correspondientes a A, T, G, o C, ocupando su propio carril en el gel. Así, las posiciones de los fragmentos recién sintetizados en el gel se pueden determinar mediante autorradiografía. La alta resolución del gel hace posible distinguir entre fragmentos que difi eran en longitud por sólo un nucleótido, entonces el investigador puede leer la secuencia en el ADN recién sintetizado, una base a la vez. El método de terminación de la cadena continúa empleándose en muchas máquinas de secuenciación de ADN automáticas. Sin em- bargo, el método de detección ha cambiado en que la secuencia de nucléotidos ya no se visualiza mediante radiactividad. En su lugar, los investigadores marcan al cebador o a cada uno de los cuatro ddNTP con colorantes fl uorescentes diferentes. La computadora utiliza un lá- ser para leer la fl uorescencia de los marcadores de colorante conforme las bases emergen del extremo de un carril del medio de electroforesis (FIGURA 15-11). Los genomas completos se han secuenciado empleando secuenciación automatizada de ADN Actualmente, las máquinas secuenciadoras son muy poderosas y pueden decodifi car cerca de 1.5 millones de bases en un período de 24 horas. Esos avances en la tecnología de secuenciación han hecho posible que los investigadores estudien secuencias de nucleótidos de genomas comple- tos en una amplia variedad de bacterias, arqueas, y organismos eucariotas. Gran parte de esta investigación recibió su ímpetu inicial gracias al Proyecto Genoma Humano, que empezó en 1990. La secuenciación de los 3 mil millones de pares de bases del genoma humano fue esen- cialmente terminada en 2001. Ahora los genomas de unos 800 orga- nismos han sido secuenciados, y varios cientos más están en etapas de planeación o fi nalización. Hay una extraordinaria explosión de datos de secuencias de genes, principalmente debido a los métodos de secuen- ciación automatizados. FIGURA 15-11 Animada Un pequeño segmento del impreso de los resultados de secuenciación de ADN automatizada La computadora produce la serie de picos que se muestran conforme lee las bandas fl uores- centes en la electroforesis en gel. El nucleótido base adenina se muestra en verde, la guanina en negro, la citosina en azul, y la timina en rojo. La secuencia de ADN asignada por la compu- tadora aparece en la parte superior del impreso. © M ar k H ar m el /A la m y 15_Cap_15_SOLOMON.indd 33515_Cap_15_SOLOMON.indd 335 17/12/12 18:2717/12/12 18:27 Parte 3 La continuidad de la vida: Genética 15 Tecnología ADN y genómica 15.2 Análisis del ADN Métodos que se han creado para secuenciar rápidamente el ADN Los genomas completos se han secuenciado empleando secuenciación automatizada de ADN Repaso 15.3 Genómica
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