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Cara
- Al final de la 4ª semana las prominencias faciales constan de un mesénquima proveniente de la cresta neural; están formadas por el primer par de arcos faríngeos.
- Las prominencias maxilares se distinguen a un lado del estomodeo; también se distinguen las prominencias mandibulares en posición caudal con esta estructura.
- La prominencia frontonasal, formada por la proliferación de mesénquima en posición ventral con las vesículas cerebrales, constituye el borde superior del estomodeo.
- A ambos lados de la prominencia frontonasal, se originan unos engrosamientos del ectodermo superficial, las placodas nasales (olfativas), bajo la influencia inductiva de la porción ventral del prosencéfalo.
- Durante la 5ª semana, las placodas nasales se invaginan para producir las fosas nasales, y crean una cresta de tejido que rodea las fosas, y dan origen a las prominencias nasales.
- Las prominencias sobre el borde externo de las fosas son las prominencias nasales laterales; las del borde interno son las prominencias nasales mediales.
- Al mismo tiempo crecen en sentido medial, comprimiendo las prominencias nasales mediales hacia la línea media.
 
- Desaparece la hendidura entre la prominencia nasal medial y la maxilar, fusionándose ambas. Entonces el labio superior se forma con dos prominencias nasales mediales y dos prominencias maxilares.
- Las prominencias nasales laterales participan en la creación del labio superior. Tanto el labio inferior como la mandíbula se desarrollan a partir de las prominencias mandibulares que convergen a través de la línea media.
En un principio las prominencias maxilares y las nasales laterales están separadas por un surco profundo: el surco nasolagrimal. El ectodermo en el suelo del surco produce un cordón epitelial sólido que tras la canalización, el cordón forma el conducto nasolagrimal; su extremo superior se ensancha para constituir el saco lagrimal.
Tras separarse del cordón, convergen las prominencias maxilares y las nasales laterales. Entonces el conducto nasolagrimal va desde la esquina medial del ojo hasta el conducto inferior de la cavidad nasal; las prominencias maxilares se agrandan para producir las mejillas y el maxilar superior e inferior.
La nariz se origina en cinco prominencias faciales: la prominencia frontal da origen al puente, la unión de las prominencias nasales producen la cresta y la punta, las prominencias laterales producen los lados (aletas).
Segmento intermaxilar 
A raíz del crecimiento medio de las prominencias maxilares, las dos nasales mediales se fusionan tanto en la superficie como en un nivel más profundo. La estructura así creada es el segmento intermaxilar.
Consta de 1) un componente labial que forma el surco subnasal del labio superior, 2) un componente del maxilar que sostiene 4 dientes incisivos y 3) un componente palatino que forma el paladar primario triangular.
El segmento intermaxilar se continúa con la porción rostral del tabique nasal, constituído por la prominencia frontal.
Paladar secundario 
Aunque el paladar primario se origina en el segmento intermaxilar, la parte principal del paladar definitivo consta de dos protuberancias en forma de cresta procedentes de las prominencias maxilares llamadas crestas palatinas, que aparecen en la 6ª semana del desarrollo y se dirigen oblicuamente hacia abajo a ambos lados de la lengua.
 
En la 7ª semana ascienden para ocupar una posición horizontal por arriba de la lengua y se fusionan, dando origen al paladar secundario.
En la parte anterior las crestas se fusionan con el paladar triangular primario, el agujero incisivo sirve de línea media entre los paladares primario y secundario.
Al mismo tiempo que se fusionan las crestas palatinas, el tabique nasal se extiende hacia abajo uniéndose a la cara cefálica del paladar recién formado.
Fosas nasales
Durante la 6ª semana aumenta la profundidad de las fosas nasales, en parte por el crecimiento de las prominencias nasales circundantes y en parte por su penetración en el mesénquima subyacente.
Al inicio la membrana oronasal separa las fosas de la cavidad oral primitiva mediante los forámenes recién formados: las coanas primitivas.
Estas coanas están situadas a ambos lados de la línea media y detrás del paladar primario. Más tarde al formarse el paladar secundario y proseguir el desarrollo de las fosas nasales primitivas, las coanas definitivas se localizan en la unión de la fosa nasal con la faringe.
Consideraciones clínicas
Fisuras faciales: el labio hendido y la fisura palatina (o hendidura del paladar) son anomalías que producen un aspecto facial anormal y defectos del habla.
Se considera que el agujero incisivo constituye la línea divisoria para las deformidades con fisura anterior y posterior.
Delante del agujero incisivo figuran fisura palatina lateral, fisura del maxilar y fisura entre los paladares primario y secundario.
Estos defectos se deben a una falta de fusión parcial o total de la prominencia maxilar superior con la prominencia nasal media en un lado o en ambos lados.
Las deformidades localizadas detrás del agujero incisivo son fisura del paladar (Secundaria) y fisura de la úvula.
La fisura se debe a la falta de fusión entre las crestas palatinas, que a su vez pueden deberse a la pequeñez de las crestas, a que éstas no se elevan, a la inhibición del proceso de fusión o a que por micrognatia la lengua no cae entre las crestas. 
La gravedad de las fisuras anteriores puede variar desde un defecto apenas visible en la coloración del labio hasta abarcar la nariz.
En los casos graves la fisura se extiende a un nivel más profundo, produce una fisura en el maxilar superior: éste se divide entre el diente incisivo y el canino. A menudo la fisura llega al agujero incisivo.
La gravedad de las fisuras posteriores fluctúa entre una fisura de todo el paladar secundario y una fisura de la úvula exclusivamente.
El síndrome de Van der Woude es el más común que se acompaña de labio hendido con fisura palatina o sin ella. Se hereda autosómica dominante. Un 88% de los niños afectados tendrá fosas en el labio inferior y en 64% de ellos esta será la única anomalía.
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Las fisuras faciales oblicuas son producidas al no fusionarse la prominencia maxilar superior con la correspondiente nasal lateral en la línea del surco nasolagrimal. Cuando eso sucede, el conducto nasolagrimal suele quedar expuesto a la superficie.
El labio hendido medial, poco frecuente, se debe a la fusión incompleta de las dos prominencias nasales mediales en la línea media. Los niños afectados a menudo sufren retraso mental e incluso anomalías cerebrales con diversos grados de pérdida de las estructuras de la línea media. La pérdida de tejido suele ser de tal magnitud que se fusionen los ventrículos laterales (holoprosencefalia).
Estos defectos se manifiestan muy temprano en el desarrollo, al comenzar la neurulación (dia 19 a 21) justo cuando la línea media del prosencéfalo está siendo establecida.
Por lo regular el labio hendido con fisura palatina o sin ella es multifactorial. Se clasifican en:
Labio hendido con fisura palatina o sin ella,
Fisura palatina.
El labio hendido con fisura palatina o sin ella (1/700 nacimientos) ocurre más en varones (65%) y varía entre grupos étnicos. Los asiáticos y los amerindios tienen tasas más altas (3,5/1.000); los afroamericanos (1/1.000).
La frecuencia de la fisura palatina es menor que la del labio hendido (1/1.500 nacimientos), ocurre más en mujeres (55%).
No se han precisado las causas del labio hendido con fisura palatina o sin ella. Algunos casos son sindrómicos, otros no lo son.
Otros casos se deben a la exposición a compuestos teratogénicos como los fármacos anticonvulsivos como el ácido valproico.
El tabaquismo durante el embarazo aumenta el riesgo de procrear un bebé con fisuras orofaciales.

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