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Biotecnología I Unidad IV Carrera: LICENCIATURA EN BIOTECNOLOGIA Trayecto curricular: Ciclo de Formación Inicial Período: 2º Cuatrimestre – 2019 Microbiología Industrial APLICACIONES DE LOS MICROORGANISMOS Y SISTEMAS O PROCESOS BIOLOGICOS EN LA INDUSTRIA DNA RECOMBINANTE INGENIERIA GENETICA Manipulación de organismos para la obtención de productos biológicos deseados: • Sustancias químicas • Enzimas • Vacunas • Hormonas, anticuerpos, factores sanguíneos ENZIMAS Y BIOCATALIZADORES • Elaboración de alimentos • Equipos de diagnóstico • Biosensores • Quimioterapia • Sustancias químicas TRATAMIENTO Y UTILIZACIÓN DE RESIDUOS • Detoxificación • Uso de subproductos • Aguas residuales INGENIERÍA DE PROCESOS • Recolección, pretratamieto, filtración • Reactores nuevos • Recuperación de catalizadores/microorganismos • Extracción de productos • Reciclado de aguas • Efluentes INTERFERONES Y ANTICUERPOS MONOCLONALES • Diagnóstico • Tratamiento COMBUSTIBLES • Alcohol (azucr de caña) • Metano (digestores de biomasa) • Hidrógeno (fotolisis) FIJACIÓN DE NITRÓGENO • Reducción de uso de fertilizantes • N atmosférico a amoníaco FERMENTADORES TRADICIONALES • Alcohol • Antibióticos • Sustancias químicas CULTIVOS DE CÉLULAS VEGETALES Y PROTEÍNAS UNICELULARES • Producción de Biomasa • Sustancias químicas: esteroide, alcaloides • Proteínas Origen de las cepas industriales 1. Cultivo axénico 2. Estable 3. Fácil de inocular (esporas) 4. Crecimiento Rápido 5. Rápida producción del compuesto deseado 6. Capaz de crecer en cultivo líquido y barato • Licor de maceración de maíz, suero 7. No tóxico ni patógeno 8. Fácil eliminación de las células del medio: • Tamaño de célula grande o formadores de agregados celulares 9. Susceptibles de manipulación genética Propiedades de los Microorganismos Productos de la microbiología Industrial Bioconversión Producto (bioconversión de esteroides) Sustrato Productos de las Células Enzimas (Glucosa Isomerasa) Antibióticos (Penicilina) Aditivos Alimenticios (aminoácidos) Alcohol Productos Químicos (ácido cítrico) Células Levadura La Levadura como producto industrial BIOCONVERSIÓN Producción de cortisona utilizando un microorganismo Metabolitos Primarios y Secundarios Sustrato de crecimiento Metabolito Primario Células Las células y el metabolito se producen más o menos simultáneamente Sustrato de crecimiento Metabolito Primario Células Metabolito Secundario Después de producidas las células y el metabolito primario, las células convierten el metabolito primario en uno secundario Sustrato de crecimiento Metabolito Primario Células Metabolito Secundario Después de producidas las células el sustrato se convierte en un metabolito secundario durante un posterior crecimiento Metabolitos primarios -Moléculas generalmente sencillas, que participan de los caminos metabólicos esenciales. Son casi idénticos en todos los organismos. -Son más baratos y sencillos de producir, tienen bajo contenido de “actividad biológica” y frecuentemente son “commodities” 1. Componentes esenciales de las células/microorganismos: proteínas, ácidos nucléicos, polisacáridos (gelanos, xantanos) y poliésteres, ácidos grasos (insaturados), esteroles. 2. Derivados del metabolismo intermedio: azúcares (fructosa, ribosa, sorbosa), ácidos orgánicos (gluconato, ácido láctico, cítrico, acético, propiónico, succínico, fumárico), alcoholes (xilitol, etanol, glicerol, sorbitol, butanol), aminoácidos (Lys, Thr, Glu, Trp, Phe), vitaminas (B2, B12), nucleótidos saborizantes (ácidos inocínico y guanílico), polisacáridos y poliésteres de reserva. Microorganismos productores: bacterias, levaduras y hongos Metabolitos secundarios -Moléculas mas complejas, que participan de caminos metabólicos no-esenciales, pero confieren capacidades de supervivencia en situaciones de stress. -Son muy variados y su estructura es fuertemente dependiente de la especie y variedad utilizada para su producción. Se generan en condiciones particulares y son más valiosos y complicados de producir alto contenido de “actividad biológica” -Generalmente son productos especiales (alto precio). Funcionan en los organismos que los producen como: 1. Armas contra otros microorganismos (antibióticos, toxinas, inhibidores enzimáticos, pesticidas) 2. Factores de crecimiento (hormonas) 3. Ionóforos 4. Agentes de interacción microbiana 5. Efectores externos Diferencias entre metabolismo primario y secundario Azúcar Células Alcohol Formación de alcohol a partir de azucar por la levadura Azúcar Células Penicilina Trofofase Idiofase Formación de penicilina por el hongo Penicillium chrysogenum Vía metabólica primaria para la síntesis de aminoácidos aromáticos y metabolitos secundarios con anillos aromáticos Glucosa Eritrosa Fosfoenol-piruvato 3-Desoli-7-fosfo D-arabinoheptulosonato Ácido shikímico Ácido corísmico Ácido prefénico Ácido antranílico Candicidina Nistatina Cloranfenicol Ansamicina Rifamicina Nocardicina FenilalaninaPolimixina Tirosina Novobiocina Triptófano Actinomicina Piocianina Metabolito primario Metabolito secundario Relaciones entre metabolitos primarios y secundarios Glucosa (C6) Triosa (C3) Piruvato (C3) Acetato (C2) Pentosa (C5) Citrato (C6) a-cetoglutarato (C5) Oxalacetato (C4) CO2 CO2 Tetrosa (C4) Ácido glutámico (C5N) Sikimato (C7) Metabolitos secundarios aromáticos Aminoaácidos aromáticos Alanina (C3N) Malonato (C3) CO2 CO2 Policétidos (nC2) Ácidos grasos (nC2) Metabolitos secundarios Metabolitos secundarios CO2 Mevalonato (C6) Pirofosfato de isopentenilo (C5) CO2 Terpenos/Esteroides (nC5) Valina (C5N) Serina (C3N) Ácido kójico Sacáridos Glucósidos Glicocola (C3N) C1-pool Penicilina Cefalosporina Tetraciclina Estreptomicina Griseofulvina Actinomicina Pepstatina ciclosporina A Krestina Bestatina Gibberelina Antibiótico Antibiótico Antibiótico Antibiótico Antibiótico (antifúngico) Antitumoral Tratamientos antiulcerosos Inmunosupresor Tratamiento del cáncer Tratamiento del cáncer Regulador del crecimiento vegetal Metabolito secundario Utilidad comercial Metabolitos microbianos secundarios comercializados Penicilina Actinomicina Neomicina Estroptomicina Candicidina Estreptomicina Tetraciclina Penicilina Glucosa Glucosa Glucosa Glucosa Fosfato Fosfato Fosfato Fuentes de nitrógeno Componente del medio Metabolito secudario reprimido Represión del metabolismo secundario por componentes del medio Selección (screening) En la selección del microorganismo/célula, se debe tener en cuenta: 1. La cepa a utilizar debe ser genéticamente estable. 2. La velocidad de crecimiento debe ser alta. 3. La cepa debe estar libre de contaminantes. 4. Sus requerimientos nutricionales deben cubrirse con medios de cultivo de costo reducido. 5. Deben ser de fácil conservación por largos períodos de tiempo sin pérdida de sus características. 6. Debe realizar el proceso fermentativo completo en tiempo corto. 7. Si el objetivo es un producto, este debe ser de alto rendimiento y de fácil recuperación a partir del medio de cultivo. Los nuevos métodos de “screening” incorporan técnicas de ingeniería genética para crear diversidad. Producción de proteínas recombinantes Biofármacos • Los biofármacos son producidos por Organismos Genéticamente Modificados (OGMs) • Aplicación: médica, veterinaria • El primer biofármaco fue producido en 1982: la insulina recombinante humana en bacterias • A diferencia de las proteínas de origen natural, las proteínas recombinantes pueden ser producidas en grandes cantidades para cubrir la creciente demanda actual • Las proteínas recombinantes son IDÉNTICAS (o difieren levemente) respecto de la proteína nativa de origen humano • Entre los sistemas utilizados para la producción de las proteínas recombinantes se encuentran: - Escherichia coli - Líneas celulares de ovario de hámster chino (CHO ) - Líneas celulares de riñón de hámster bebe (BHK) - Levaduras (Saccharomycescerevisiae, Picchia Pastoris, Hansenula polymorpha) • Existen también sistemas alternativos que abaratan los costos de producción: - Las plantas transgénicas - Los animales transgénicos - Las células de insecto Mercado farmacéutico mundial 2008: US$ 750 Billion Biotecnológicos: Mayor del 15%, US$ 125 Billion Crecimiento mayor al 10%. Argentina: Rol importante. Proteínas más vendidas: IFN/Anticuerpos monoclonales /Insulina /EPO/vacunas INDUSTRIA BIOTECNOLOGICA 46% de los productos biotenológicos son biofármacos Upstream: • Elección del sistema de expresión (procariota o eucariota) • Diseño del sistema de expresión Downstream: • Proceso de purificación • Control de la calidad y validación del producto Etapas del proceso de producción de biofármacos PRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES EN BACTERIAS Ventajas y desventajas de E. coli como sistema de producción GENERANDO UN CLON PRODUCTOR BACTERIANO - Alta calidad de la proteína recombinante - Altos rendimientos COMPONENTES Factores que influyen en la expresión de proteinas Modificando uno o más de estos factores influencia drásticamente los niveles de expresión Vector Elementos básicos en un plásmido de expresión 1) ORI (origen de replicación) 2) POLILINKER (MCS: sitio múltiple de clonado) 3) MARCADORES DE SELECCIÓN (Ampi) 4) PROMOTOR GRAN VARIEDAD DE PROMOTORES Industria: se utiliza comúnmente el promotor de triptofano (trp operon) que se induce con medios de cultivo carentes del aminoácido triptofano En presencia de triptofano no hay transcripción de genes pET Expression System • Sistema de expresion más usado. • Superior nivel de expresion. • Uso de no nativa T7 RNA polymerase • ~33 vectores para differentes aplicaciones • Doble induccion por IPTG lac Operon DE QUE MANERA PUEDO MEJORAR LA EXPRESIÓN PROTEICA? Mejorando la solubilidad Purificando en un solo paso Efficient His-tag removal. His-taged TNFα was expressed in E. coli and purified using Ni-NTA Superflow. The His tag was removed by initial incubation with DAPase for 30 min after which His-tagged DAPase was removed by subtractive IMAC. M: markers; CL: cell lysate; FT: flow-through; W: wash; E: eluate; DAPase: DAPase reaction; pG: pGAPase reaction. Vector de expresión típico para E. coli Direccionamiento de la proteína recombinante Cuerpos de inclusión (insoluble) Citoplasma (soluble) Espacio periplásmico (soluble or insoluble) Direccionamiento de las proteínas recombinantes en levaduras y E. coli y las técnicas correspondientes utilizadas para su liberación IB: Inclusion bodies. ER: endoplasmic reticulum. S: secretory vesicles E. coli: - Amplio conocimiento de su genética y fisiología. - Tiempo de duplicación corto, - Fácil manipulación, alta acumulación de proteínas (20% del total celular). HUÉSPED Uso de Codones Mejorando la conformación de la proteína NO SOLAMENTE E.coli PRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS RECOMBINATES EN LEVADURAS • Problemas que suelen aparecer cuando proteínas humanas se expresan en células procariotas: – Proteínas inestables – Sin actividad biológica – Con contaminantes procarióticos (LPS, endotoxinas bacterianas, etc) POR QUÉ USO OTROS SISTEMAS ? Para eliminar los problemas de expresión en procariotas, se utilizan Sistemas de expresión eucariotas Sistemas de expresión eucariotas • Cuál es la diferencia? – Células procariotas NO pueden realizar modificaciones post- traduccionales… Modificaciones post-traduccionales – Formación de uniones disulfuro correctas. – Clivaje proteolítico del precursor inactivo. – Agregado de residuos de azúcar – Alteración de aminoácidos en la proteína: fosforilación, acetilación, agregado de grupos sulfato, agregado de ácidos grasos • Sistema costo-efectivo: rápido crecimiento, bajo costo similar a E. coli con altos rendimientos • Bien caracterizadas genética y fisiológicamente • Eucariota: modificaciones post-traduccionales esenciales para la función proteica. • No hay posibilidad de contaminación con endotoxinas bacterianas • Secreta la proteína recombinante al medio extracelular. • Promotores fuertes disponibles • Es adaptable a fermentación gran escala. • Organismo no patógeno (GRAS: Generally Recognized As Safe, FDA) Ventajas de las levaduras Ventajas de las levaduras Disponibilidad de promotores muy fuertes y de regulación muy precisa Pichia y Hansenula: levaduras metilotrofas • Las levaduras metilotrofas, como Pichia o Hansenula tienen la capacidad de crecer en presencia de metanol (como fuente de carbono) Se eliminan virtualmente otros microorganismos competidores o contaminantes • Además, P. pastoris realiza mejores modificaciones postraduccionales que S. cerevisiae: procesamiento proteolítico, glicosilación y formación de puentes disulfuro. Secreción de Proteínas Rendimiento máximo (cuerpos inclusión) en E. coli: 1-3 g/L • Bajo número de copias (integrativos: una copia integrada al cromosoma para expresar en bajos niveles x prot tóxica o altera metabolismo) •Alto número de copias (episomales: ori 2m alto número de copias) Tipos de Vectores Vectores episomales Son ampliamente usados Pero….a menudo inestables en cultivos a gran escala (>10L) Estrategia alterar las condiciones de crecimiento para estabilizar el vector episomal • Usar cepas mutantes auxotróficas que requieren nutrientes específicos. (Por ej. Uracilo) Tipos de Vectores Una auxotrofía es la carencia de una ruta metabólica funcional. Esta carencia suele deberse a una mutación en la cepa de la levadura que debido a una carencia en una enzima requerida para la síntesis de uracilo, precisan de éste en el medio de cultivo para poder crecer. Marcadores de selección: Auxotrofia: URA3 (base nt), LEU2, TRP1 (aa) Tipos de Vectores Tipos de vectores para S. cerevisiae Vector pYES Vector pYC • Los vectores pYES están diseñados para la expresión de alto nivel de proteínas recombinantes en S. cerevisiae. Estos vectores llevan el origen de replicación de 2μ y se mantienen episómicamente en con alto número de copias. per cell). • Los vectores pYC llevan el origen CEN6/ARSH4 y mantienen el número de copias de su gen de interés similar a los genes de tipo salvaje. per cell - El metanol como inductor es mucho mas económico - Además, la presencia de metanol induce el promotor de la alcohol oxidasa, dde se ha insertado el gen de la prot recombinante de interés A nivel industrial anticuerpos pequeños (scFV, Fab) Sistema de expresión en levaduras: desventajas • Inestabilidad de plásmidos en gran escala de los vectores episomales • Hiper-glicosilación de glicoproteínas >100 residuos manosa vs. 8-13 normal puede alterar la actividad de la proteína • Muchas proteínas secretadas quedan atrapadas en periplasma (entre la membrana y la pared celular) se usan señales peptídicas ...posibles soluciones a los problemas en sistemas de expresión en levaduras • Levaduras modificadas genéticamente para llevar a cabo glicosilación = humanos (Science Vol 301, p1244-1246 (29 Aug 2003)) • Deleción de genes de glicosilación de levaduras • Agregado de genes de glicosilación humanos • Usar otros eucariotas: células de mamíferos, de plantas o de insectos PRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES EN CÉLULAS DE MAMÍFEROS ¿ Por qué células de mamíferos y no bacterias o levaduras si presentan… …Menores cinéticas de crecimiento? …Menores productividades ? …Mayores costos? ...Altos riesgos de contaminación (x el uso de SFB)? •Modificaciones post-traduccionales : •Correcto proceso de plegado (est. 2ria, 3ria y 4ria) •Formación de S-S (disulfuro) •Proteólisis de péptidos señal •Glicosilación correcta acylation prenylation glycosylation, acetylation, myristoylation hydroxylation alkylation, farnesylation iodination methylation geranylgeranylation isoprenylation demethylation ADP-ribosylation lipoylation, amidation flavin attachment phosphorylation, biotinylation,oxidation pyroglutamate formation formylation pegylation racemization of proline by prolyl isomerase gamma-carboxylation phosphatidylinositol sulfation, glutamylation, phosphopantetheinylation, Sulfation Células de mamífero como sistemas de expresión Glicosilación en diferentes sistemas de expresión Existen en el “American Type Culture Collection” (ATCC) 3.600 líneas celulares comerciales de 80 especies diferentes de mamíferos, insectos, plantas, etc. cellline meaning Organism origin tissue morphology HEK-293 human embryonic kidney human kidney (embryonic) epithelium HeLa Henrietta Lacks human Cervical cancer epithelium CHO Chinese hamster ovary hamster Ovary epithelium Sf-9 Spodoptera frugiperda insect - Spodoptera frugiperda (moth) Ovary MTD-1A mouse epithelium CMT canine mammary tumor dog mammary gland epithelium COS-7 Cercopithecus aethiops, origin-defective SV-40 ape - Cercopithecus aethiops (Chlorocebus) kidney fibroblast HL-60 human leukemia human Myeloblast bloodcells Jurkat human T-Cell-Leukemia bloodcells Vero Monkey kidney epithelium sf21 spodeoptera frugiperda Insect BY-2 cells Tobacco Línea celular CHO (chinese hamster ovary) • CHO pueden glicosilar proteínas eficientemente, pero carecen de enzimas necesarias que permiten la glicosilación terminal de las proteínas • 50-60% de las proteínas humanas aprobadas para su comercialización se producen en células CHO (factor de coagulación, EPO, IFN, etc.) Generación de una línea celular productora Clonado, Transfección –Lípidos catiónicos, ClCa, electroporación. Selección – Antibiótico, Auxotrofía (GS, glutamina sintetasa; DHFR, enz. Dihidrofolato reductasa) Selección de clones alta productividad Adaptación a SFM (medio libre de suero)- La ausencia del suero fetal bovino puede alterar el crecimiento y la glicosilación de la PR) Hyclone: Invitrogen (medio de cultive libre de suero, disminuye la contaminación exógena) Evaluación de calidad de producto – Glicosilación (ausencia de “glicoformas”), secuencia Estrategia de producción y escalado •Requerimientos nutricionales complejos. •Cultivo en monocapa. •CO2 Se debe optimizar/mejorar : •Productividad y biomasa (diseño de cultivo y amplificación génica) •Estabilidad de producción El sistema de cultivo es más complejo… Desventajas de las células de mamíferos • Contaminaciones - si derivan de células tumorales pueden portar retrovirus - virus, priones y micoplasmas provenientes del SFB agregado • Inestabilidad de la línea celular (apoptosis) PRODUCCIÓN DE PROTEÍNAS RECOMBINANTES EN PLANTAS Molecular Farming: las plantas como sistemas de producción BIOFÁRMACOS Ventajas frente a otros sistemas de producción de biofármacos: • Gran producción de biomasa. • Modificacions post-traduccionales. Los mecanismos de síntesis y secreción de proteínas y otras modificaciones post-traduccionales son propias de las células eucariotas. • Gran capacidad de escalado. El escalado implica bajos costos y requiere la misma infraestructura pre-existente que se utiliza para el cultivo, cosecha, procesado y almacenamiento de cualquier planta a campo. • Bioseguras. No implican riesgos de contaminación con patógenos animales o toxinas microbianas. • Almacenamiento estable y económico. Permiten almacenar la proteína recombinante en semillas y tubérculos, facilitando su conservación, transporte y distribución. • Gozan de una mayor aceptación pública respecto de la manipulación de animales. Los costos de producción de proteínas recombinantes en plantas son potencialmente menores que en otros sistemas Tomado de: Daniell et. al. Trends in Plant Sci., 2001. % Aseguramiento de la calidad del producto y consistencia 1) Caracterización de la línea celular 2) Caracterización de la proteína recombinante 3) Control del proceso 4) Control de calidad de la proteína producida Expression Construct and Cell Clone Used to Develop the Master Cell Bank (MCB) The manufacturer should describe the origin of the nucleotide sequence coding for the protein. This should include identification and source of the cell from which the nucleotide sequence was originally obtained. 1) Caracterización de la línea celular productora MCB – WCB (master cell bank- working cell banks) http://www.fda.gov/downloads/Drugs/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Guidances /ucm073459.pdf Pureza: Esterilidad (bacterias y hongos) Micoplasma (cultivo) Virus, retrovirus (PCR reverse transcriptase) Estabilidad génica: Secuenciación DNA Southern hibridizacion Real time PCR 1) Caracterización de la línea celular productora MCB – WCB (master cell bank- working cell banks) Propiedades físico-químicas: a) Estructura Primaria. (Secuencia nucleotídica, grupos SH, PM, PI, perfil electroforético, perfil HPLC), etc. b) Conformación de la proteína. Puentes SS Modif. post-Traducc. 2) Caracterización de la proteína recombinante obtenida Conformacional Oligomerización Hidratos de Carbono c) Heterogeneidad -> Análisis de las glicosilaciones d) Actividad biológica: Animales Cultivos celulares Ensayos bioquímicos e) Propiedades Inmunoquímicas: WB/ELISA Afinidad f) Pureza y contaminantes: HPLC / WB / SDS PAGE Proteína relacionada c/act biol Proteína relacionada s/act biol Impureza Huésped / Medio Contaminación. Estabilidad Proteínas de interés farmacológico producidas industrialmente INSULINA Diabetes e insulina • 336 millones padecen Diabetes mellitus • Esto representa un 30% mas de lo que se estimó • En el 2030 la padecerán aprox. 370 millones • Gasto sanitario alcanza los U$S 465 mil millones • Esto significa una demanda de 4,6 Ton anuales • Dosis: 1.4-2.1 mg/día/paciente Requerimiento anual de 4.600 kg insulina/año Tipos de Diabetes mellitus En personas que no padecen diabetes, con cada comida, las células Beta liberan insulina con el fin de metabolizar el azúcar o la glucosa obtenida de los alimentos • Tipo I: Déficit absoluto de insulina. No se observa producción de insulina debido a una enfermedad autoinmune que destruye las células β de los islotes de Langerhans del páncreas. Por lo tanto, necesitan disparos de insulina para metabolizar la glucosa de los alimentos. • Tipo II: El organismo produce insuficiente insulina o bien, los receptores de insulina de las células están dañados. Las personas que padecen diabetes tipo 2 necesitan medicación oral y a veces disparos de insulina. • Diabetes Gestacional: Resistencia temporal a la insulina durante el embarazo La terapia con INSULINA es esencial para la supervivencia de los diabéticos Tipo I (insulino-dependientes) y se utiliza para controlar la progresión y los síntomas de la enfermedad en diabéticos Tipo II (junto con otros medicamentos). Tipos de Diabetes mellitus Comercialización • Existen en el mercado 180 insulinas comercialmente disponibles: - Sanofi (487 mill Euros) - Eli Lilly (2.500 mill U$D) - Novonordisk (2.300 mill Euros en ventas) La insulina es uno de los fármacos que mayor impacto genera en el mercado - Hormona proteica . - Regula la concentración de glucosa en sangre: sin insulina la glucosa se acumula en la sangre hasta alcanzar niveles elevados, con complicaciones para la salud. - Cuando la producción es escasa o nula se puede regular el nivel de glucosa por administración exógena de Insulina. Estructura y función Estructura y función Péptido C Cadena B, 30 aa Cadena A, 21 aa INSULINA - 51 aa - 2 puentes disulfuro intercatenarios -1 puente disulfuro intra-catenario (A) La síntesis de Insulina tiene 3 etapas: - Se fabrica como preproinsulina -Se cortan sus extremos y se obtiene proinsulina -La proinsulina se separa en el Péptido C (conector) y la insulina Vías de obtención de Insulina Hoy en día existen 4 rutas de obtención de insulina: • 1. Extracción de páncreas (cerdos, bovinos) • 2. Síntesis a partir de los aminoácidos individuales • 3. Conversión de insulina porcina en humana • 4. Fermentación de microorganismosUn paso adelante…… • Se secuencia la estructura primaria de la insulina humana (1960). • Se establece que la Insulina humana difiere de la Insulina bovina en 3 aa y de la porcina en 1 aa • El aa 30 del terminal C de la cadena B es una treonina en la Insulina humana mientras que la insulina porcina tiene una alanina en esta posición • Explica problemas inmunológicos en algunos diabéticos. • Del páncreas de un cerdo se obtiene insulina para un paciente por 3 días. • S! qca muy costosa. Insulina semisintética • Insulina “humanizada”: transformación de la insulina de cerdo en una molécula igual a la humana, cambiando el aminoácido diferente mediante transpeptidación enzimática. Cadena B, 30 aa Cadena A, 21 aa Ejemplo: producen Insulina Semisintética: - Orgasuline y análogos (Organon, Holanda/ Merck & Co.) - Insuman (Hoechst) Insulina Recombinante (ó Biosintética) Nueva y mejor alternativa para lograr insulina humana Se obtienen mediante fermentación de microorganismos Independencia de la provisión de páncreas (que no alcanzan para satisfacer la demanda). La primera insulina recombinante se produjo en 1978 Hoy: las insulinas de tipo recombinante abastecen el 93% de la demanda mundial. Qué alternativa de microorganismos elegir? Insulina Recombinante (ó Biosintética) • E. coli • S. cerevisiae Si bien estos son los pasos a seguir en la obtención de insulina recombinante, si se inserta en el plásmido de E. coli el gen entero, el MO produciría preproinsulina. http://www.madehow.com/Volume-7/Insulin.html E. coli : Estrategia de producción de insulina 1 Expresión de cadenas A y B por separado La primera insulina recombinante se produjo de esta forma (1978). • Expresión de cadena A • Expresión de cadena B • Purificación independiente de ambas cadenas • Co- incubación de las dos cadenas purificadas en condiciones favorables para la unión vía SS • Purificación para obtener la insulina Actualmente, esta técnica no se utiliza Vía de la proinsulina Insulina producida por Eli Lilly (disponible comercialmente desde 1986) llamada “Humulin/Umuline”. • Expresión de una única secuencia nucleotídica sintetizada químicamente que codifica para la proinsulina humana nativa • Purificación del polipéptido • Clivaje proteolítico del péptido C in vitro • Purificación (intercambio iónico, cristalización, RP-HPLC, tamiz molecular). Insulina purificada E. coli : Estrategia de producción de insulina 2 Insulinas recombinantes (biosintéticas) Producen Insulina Biosintética: Umuline, Lilly Estrategias moleculares de producción de proinsulina en E. coli : - EXTRACELULAR: Secreción de proinsulina - INTRACELULAR: Cuerpos de inclusión Insulina soluble en citoplasma - PERIPLÁSMICO: Secreción al periplasma: no requiere refolding in vitro, xo bajos niveles x secreción limitada La producción de Insulina en cuerpo de inclusión ha sido la tecnología empleada por default Bajos niveles de expresión por: - Dificultad en solubilizar CI - Corta vida media en la bacteria - Proteólisis - Ineficiente traducción Utilización de péptidos de fusión (leader peptides) S. cerevisiae: estrategia de producción de insulina 3 • Vía proinsulina: se vio que la proinsulina humana no era secretada eficientemente por las levaduras (incluyendo a S. cerevisiae) • Se diseñó el “Insulin Precursor” (IP): - cadena A completa - cadena B con 29 aa (la cadena B carece de la treonina C-terminal) • Ambas cadenas se producen directamente unidas o bien unidas con un un tripeptido sintético (ala, ala, lys- AAK) • FUSIÓN: La secuencia nucleotídica se fusiona con una secuencia señal líder (-mating factor prepro-peptide signal leader seq)que guía la secreción extracelular y es removido enzimáticamente por la levadura (80 mg /l) • RECUPERACIÓN: El polipéptido de insulina se recupera por cromatografía de intercambio iónico. • TRANSPEPTIDACIÓN: La “humanización” de la insulina se hace por transpeptidación mediada por tripsina en presencia de exceso de ester de treonina. • El producto se purifica por cristalización y cromatografía. Precursor de insulina expresado en levaduras Proceso de purificación de Insulina recombinante expresada en levaduras y secretada al medio de cultivo 0.- Obtención del precursor de insulina PI en LEVADURAS 1.-Se realiza la transpeptidación: ester de insulina humana 2.- RP-HPLC 1 para eliminar tripsina 3.- Intercambio iónico: elimina insulina con aa29, no activa 4.- Hidrólisis: para eliminar la función ester de la treonina, obtengo insulina 5.- RP-HPLC 2: elimina residuos de la desesterificación 6.- RP-HPLC 3: elimina subproductos de insulina 7.- Cristalización 8.- Liofilización Estrategia de producción de insulina en Picchia pastoris • Picchia pastoris (crece mejor a alta densidad que S. cerevisiae) • Se produjo el IP (insulin precursor) (29 aa B y 21 aa A) conectados por el dipéptido Ala-Lys) • Utilización de -mating factor prepor-leader sequence • Se utilizaron fermentadores (cultivos alta densidad) de 16 L utilizando levaduras transformantes multi-copia • Luego transpeptidación con tripsina en presencia de treonina y purificación. Insulinas recombinantes actualmente aprobadas para su uso médico en US y EU Análogos de insulina: producción de Insulina de 2da generación • En condiciones normales: - Tras la ingesta se da un pico de insulina 1 hs después y se alcanza el nivel basal nuevamente en 2 hs. - La insulina activa es monomérica. - La terapia con insulina comercial no puede reproducir estos patrones de secreción endógenos. • La insulina comercial es de forma cristalina y hexamérica y viene en dosis mas elevadas que la fisiológica (10-3 vs. 10-10 ). Para ser activa debe disociarse en monómeros. • A partir de 1990: el objetivo fue mimetizar la acción normal de la insulina con perfiles fisiológicos similares en tiempo y acción: - Alterando su formulación. - Insulina por ingeniería genética (insulina recombinante de 2da generación). Análogos de insulina: producción de Insulina de 2da generación Análogos de insulina: producción de Insulina de 2da generación Disminución del tiempo de acción: Insulinas Rápidas (Lispro, Aspart) Obtención de insulina de acción basal o sostenida (Glargina, Detemir) Insulinas de acción lenta Insulina modificada por ingeniería genética: insulina de acción rápida • Obtenidas por Bioingeniería: cambio selectivo de la secuencia de aa La insulina modificada tiene menor tendencia que la natural a formar agregados moleculares (hexámeros). Estos agregados hexaméricos tienen que ser disociados para que la insulina sea absorbida desde el punto de inyección, con el resultado práctico de que la insulina de acción rápida tiene un comienzo más rápido y duración de acción más corta que la insulina soluble normal 2) Insulinas de acción prolongada obtenidas por cambio en su formulación: Formulación: Adición de Zn para promover cristales de Zn-insulina (se forman tres dímeros coordinados con Zn) que deben disociarse en monómeros para actuar luego de su inyección Resultado: más lenta disociación en monómeros post inyección. Insulina de acción prolongada Insulina nativa y análogos Insulina: situación de Argentina y el mundo • Laboratorios Beta • Laboratorio BioSidus S.A • Denver Farma Laboratorios Beta Patentes: insulina en P. pastoris Denver Farma: primera insulina recombinante formulada en Argentina Denver Farma, que es el encargado de producir en el país insulina humana, denominada Densulin, constituyéndose en el primer establecimiento de América Latina en fabricar ese medicamento. Denver Farma es una empresa farmacéutica argentina de capitales y técnicos argentinos, con sólida formación científica y demostrables recursos tecnológicos Biosidus: tambo farmacéutico • Vacas transgénicas capaces de dar leche para producir insulina humana, en un hecho que se registra por primera vez en el mundo. • La producción local de la insulinaa partir de la leche vacuna permitirá reducir un 30% su costo en el mercado. • La insulina producida en la leche de las vacas transgénicas necesitará luego un proceso de aislamiento y purificación a escala industrial. • El volumen de producción de leche de unas 25 vacas será suficiente para cubrir la totalidad de insulina humana que demanda Argentina y que debe importar (1,5 millón de enfermos de diabetes de los cuales 300.000 son insulinodependientes) • Se están realizando las pruebas de seguridad para cumplir con los requisitos regulatorios indispensables para la aprobación del producto. • La UE aprobó el año pasado la producción de insulina en base a la leche de cabras transgénicas, pero ésta es la primera obtención a partir de leche vacuna. • En la actualidad, el mercado de insulina en la Argentina continúa constituyendo un oligopolio liderado principalmente por: - Eli Lilly (Estados Unidos) - Novo Nordisk (Dinamarca) - Laboratorios Beta SA - Denver Farma. Estas empresas representan un 90% de las ventas de insulina de la Argentina. Participa en menor medida Aventis. Producción de Interferón recombinante Interferón Tipos de interferón Interferones alfa beta gama leucocitos fibroblastos linfocitos Células CHO / BHK bacterias 1b1a NATURAL BIOTEC Generalidades • El interferón es una proteína producida naturalmente por el sistema inmunitario como respuesta a agentes externos, tales como virus, ARN doble cadena y células cancerígenas. • Es una glicoproteína • y β son isoformas • β : producido por fibroblastros • Terapia IFN β : esclerosis múltiple, antiviral, antiproliferativo e inmunomodulador • Acción: IFN β inicia una secuencia compleja de eventos intracelulares como inducción de enzimas, inhibición de la proliferación celular, y actividades inmunomodulatorias, incluyendo la inhibición de la replicación de los virus en células infectadas. IFN β 1a y 1b • IFN β 1a es un interferón glicosilado, producido por tecnología de DNA recombinante por células CHO. La secuencia aminoacídica es idéntica a la del interferón B natural. • IFN β 1b es un interferón no glicosilado producido por tecnología de DNA recombinante por una cepa de E. coli. Posee sutiles diferencias estructurales con el interferón. Interferón ß • El interferón ß (IFN ß) es una molécula con 166 aa y su PM teórico de 20kDa. • El IFN ß nativo es: -glicosilado -Posee un SS -Es altamente hidrofóbico. • Estructura secundaria con 5 hélices α. • Es un proteína que ha sido expresada en células de mamíferos, levaduras, insectos, plantas y bacterias • Expresado en bacterias no se glicosila Expresión en E.coli Debemos considerar que: • El medio citoplasmático en E. coli es reductor. • La proteína se sobre expresa y se forman cuerpos de inclusión en el citoplasma Entonces el INF ß estará: • Desnaturalizado. Las cisteínas reducidas y no se formaron las uniones disulfuro. Expresión en E.coli • Que problemas se presentan en el proceso de refolding y purificación?? Al re-oxidarse las cisteínas y formarse los puentes disulfuro nos podemos encontrar con: Formación de tres posibles monómeros (puentes disulfuro intracatenario). Formación de oligómeros (puentes disulfuro intercatenario). O sea especies moleculares contaminantes e inactivas. Como se solucionó el problema de la formación de puentes disulfuro incorrectos? • Se reemplazó la Cys17 (no involucrada en el SS) por una Ser. La proteína se denomina: r-INF ß (Ser 17) ó Betaferón (Bayer) Betaferón (Bayer): tratamiento de la esclerosis múltiple Expresión en E.coli • El r-INF ß (Ser 17) es muy hidrofóbico. Como encarar este problema? Durante todo el proceso de purificación las soluciones tienen incorporado: - SDS (sodio dodecil sulfato). - El proceso de purificación se hace en un medio reductor (ditiotreitol, DTT) • En la etapa final de purificación, para renaturalizar el INF ß se diluye la muestra y se saca el reductor MUY LENTAMENTE IFN recombinantes Interferón : INTRON A (Merck) • INTRON® (Interferon alfa-2b) Interferón recombinante producido por Merck en E. coli • “The fermentation is carried out in a defined nutrient medium containing the antibiotic tetracycline hydrochloride at a concentration of 5 to 10 mg/L; the presence of this antibiotic is not detectable in the final product. The specific activity of interferon alfa-2b, recombinant is approximately 2.6 x 108 IU/mg protein as measured by the HPLC assay” Biosidus • Interferón β1a (Blastoferon®) El Interferón beta 1a es un interferón humano recombinante producido por la tecnología de cultivo celular masivo. El Interferón beta 1a está indicado para el tratamiento de la esclerosis múltiple recurrente recidivante. El producto Interferón beta 1a Bio Sidus se encuentra disponible como solución en jeringas prellenadas listas para su uso para inyección subcutánea, en dos potencias, 6 M U.I. y 12 M U.I.. • Interferón 2b (Bioferon®/ Inter 2B®/ Citopheron®/ Zavinex®/ Ganapar®) Nuestro producto Interferón alfa 2b se obtiene por fermentación bacteriana. El interferón alfa 2b se utiliza para tratar numerosas enfermedades, incluyendo hepatitis B y C, el sarcoma de Kaposi, enfermedad caracterizada por lesiones en la piel y mucosa oral, asociada al SIDA, y ciertos tipos de cáncer. El Interferón alfa 2b de Bio Sidus se encuentra disponible como polvo liofilizado en las potencias de 3 M U.I., 5 M U.I. y 10 M U.I.. • Interferón 2a (Inter 2A®/ Inmutag®/Inferon®) El interferón alfa 2a es un subtipo de interferón producido por fermentación bacteriana y comparte las indicaciones con el subtipo alfa 2b. El Interferón alfa 2a Bio Sidus se encuentra disponible como polvo liofilizado en las potencias 3 M U.I., 4,5 M U.I. y 9 M U.I. GEMA Biotech y PC Gen • GEMA Biotech Compañía biotecnológica privada. Algunos de sus productos son: - interleuquina 2 (IL-2) proteína recombinante humana producida en E. coli, indicada para carcinoma renal y melanoma. – Eritropoyetina proteína recombinante producida en células de mamífero, indicada para tratar la anemia. – Interferon alfa 2ª producido en E. coli e indicado para tratar sarcoma de Kaposi, leucemia y hepatitis C crónica. • PC Gen El laboratorio PC gen una empresa incubada y pertenece al sector productivo salud humana y medicamentos. PC-Gen ha desarrollado productos como: - Interferón alfa, - Interleuquina 2 - GM-CSF y eritropoyetina.
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